4bp7

Asymmetric structure of a virus-receptor complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 273.1 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

COAT PROTEIN

物种未注明

UniProt P03612

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 180 PDB 声明:180-meric(180) 与蛋白拷贝数一致 链 A0; UniProt 2–130 链 A1; UniProt 2–130 链 A2; UniProt 2–130 链 A3; UniProt 2–130 链 A4; UniProt 2–130 链 A5; UniProt 2–130 链 A6; UniProt 2–130 链 A7; UniProt 2–130 链 A8; UniProt 2–130 链 A9; UniProt 2–130 链 AA; UniProt 2–130 链 AB; UniProt 2–130 链 AC; UniProt 2–130 链 AD; UniProt 2–130 链 AE; UniProt 2–130 链 AF; UniProt 2–130 链 AG; UniProt 2–130 链 AH; UniProt 2–130 链 AI; UniProt 2–130 链 AJ; UniProt 2–130 链 AK; UniProt 2–130 链 AL; UniProt 2–130 链 AM; UniProt 2–130 链 AN; UniProt 2–130 链 AO; UniProt 2–130 链 AP; UniProt 2–130 链 AQ; UniProt 2–130 链 AR; UniProt 2–130 链 AS; UniProt 2–130 链 AT; UniProt 2–130 链 AU; UniProt 2–130 链 AV; UniProt 2–130 链 AW; UniProt 2–130 链 AX; UniProt 2–130 链 AY; UniProt 2–130 链 AZ; UniProt 2–130 链 Aa; UniProt 2–130 链 Ab; UniProt 2–130 链 Ac; UniProt 2–130 链 Ad; UniProt 2–130 链 Ae; UniProt 2–130 链 Af; UniProt 2–130 链 Ag; UniProt 2–130 链 Ah; UniProt 2–130 链 Ai; UniProt 2–130 链 Aj; UniProt 2–130 链 Ak; UniProt 2–130 链 Al; UniProt 2–130 链 Am; UniProt 2–130 链 An; UniProt 2–130 链 Ao; UniProt 2–130 链 Ap; UniProt 2–130 链 Aq; UniProt 2–130 链 Ar; UniProt 2–130 链 As; UniProt 2–130 链 At; UniProt 2–130 链 Au; UniProt 2–130 链 Av; UniProt 2–130 链 Aw; UniProt 2–130 链 Ax; UniProt 2–130 链 B0; UniProt 2–130 链 B1; UniProt 2–130 链 B2; UniProt 2–130 链 B3; UniProt 2–130 链 B4; UniProt 2–130 链 B5; UniProt 2–130 链 B6; UniProt 2–130 链 B7; UniProt 2–130 链 B8; UniProt 2–130 链 B9; UniProt 2–130 链 BA; UniProt 2–130 链 BB; UniProt 2–130 链 BC; UniProt 2–130 链 BD; UniProt 2–130 链 BE; UniProt 2–130 链 BF; UniProt 2–130 链 BG; UniProt 2–130 链 BH; UniProt 2–130 链 BI; UniProt 2–130 链 BJ; UniProt 2–130 链 BK; UniProt 2–130 链 BL; UniProt 2–130 链 BM; UniProt 2–130 链 BN; UniProt 2–130 链 BO; UniProt 2–130 链 BP; UniProt 2–130 链 BQ; UniProt 2–130 链 BR; UniProt 2–130 链 BS; UniProt 2–130 链 BT; UniProt 2–130 链 BU; UniProt 2–130 链 BV; UniProt 2–130 链 BW; UniProt 2–130 链 BX; UniProt 2–130 链 BY; UniProt 2–130 链 BZ; UniProt 2–130 链 Ba; UniProt 2–130 链 Bb; UniProt 2–130 链 Bc; UniProt 2–130 链 Bd; UniProt 2–130 链 Be; UniProt 2–130 链 Bf; UniProt 2–130 链 Bg; UniProt 2–130 链 Bh; UniProt 2–130 链 Bi; UniProt 2–130 链 Bj; UniProt 2–130 链 Bk; UniProt 2–130 链 Bl; UniProt 2–130 链 Bm; UniProt 2–130 链 Bn; UniProt 2–130 链 Bo; UniProt 2–130 链 Bp; UniProt 2–130 链 Bq; UniProt 2–130 链 Br; UniProt 2–130 链 Bs; UniProt 2–130 链 Bt; UniProt 2–130 链 Bu; UniProt 2–130 链 Bv; UniProt 2–130 链 Bw; UniProt 2–130 链 Bx; UniProt 2–130 链 C0; UniProt 2–130 链 C1; UniProt 2–130 链 C2; UniProt 2–130 链 C3; UniProt 2–130 链 C4; UniProt 2–130 链 C5; UniProt 2–130 链 C6; UniProt 2–130 链 C7; UniProt 2–130 链 C8; UniProt 2–130 链 C9; UniProt 2–130 链 CA; UniProt 2–130 链 CB; UniProt 2–130 链 CC; UniProt 2–130 链 CD; UniProt 2–130 链 CE; UniProt 2–130 链 CF; UniProt 2–130 链 CG; UniProt 2–130 链 CH; UniProt 2–130 链 CI; UniProt 2–130 链 CJ; UniProt 2–130 链 CK; UniProt 2–130 链 CL; UniProt 2–130 链 CM; UniProt 2–130 链 CN; UniProt 2–130 链 CO; UniProt 2–130 链 CP; UniProt 2–130 链 CQ; UniProt 2–130 链 CR; UniProt 2–130 链 CS; UniProt 2–130 链 CT; UniProt 2–130 链 CU; UniProt 2–130 链 CV; UniProt 2–130 链 CW; UniProt 2–130 链 CX; UniProt 2–130 链 CY; UniProt 2–130 链 CZ; UniProt 2–130 链 Ca; UniProt 2–130 链 Cb; UniProt 2–130 链 Cc; UniProt 2–130 链 Cd; UniProt 2–130 链 Ce; UniProt 2–130 链 Cf; UniProt 2–130 链 Cg; UniProt 2–130 链 Ch; UniProt 2–130 链 Ci; UniProt 2–130 链 Cj; UniProt 2–130 链 Ck; UniProt 2–130 链 Cl; UniProt 2–130 链 Cm; UniProt 2–130 链 Cn; UniProt 2–130 链 Co; UniProt 2–130 链 Cp; UniProt 2–130 链 Cq; UniProt 2–130 链 Cr; UniProt 2–130 链 Cs; UniProt 2–130 链 Ct; UniProt 2–130 链 Cu; UniProt 2–130 链 Cv; UniProt 2–130 链 Cw; UniProt 2–130 链 Cx; UniProt 2–130 未记录 无其他共同聚合物 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;LIQUID ETHANE HOME MADE FREEZING DEVICE 分辨率 39.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 43 个其他 PDB 条目、208 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 COAT_BPMS2
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A0; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 A1; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 A2; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 A3; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 A4; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 A5; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 A6; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 A7; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 A8; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 A9; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 AA; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 AB; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 AC; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 AD; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 AE; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 AF; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 AG; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 AH; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 AI; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 AJ; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 AK; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 AL; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 AM; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 AN; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 AO; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 AP; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 AQ; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 AR; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 AS; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 AT; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 AU; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 AV; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 AW; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 AX; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 AY; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 AZ; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Aa; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Ab; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Ac; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Ad; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Ae; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Af; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Ag; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Ah; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Ai; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Aj; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Ak; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Al; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Am; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 An; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Ao; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Ap; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Aq; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Ar; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 As; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 At; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Au; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Av; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Aw; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Ax; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 B0; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 B1; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 B2; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 B3; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 B4; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 B5; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 B6; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 B7; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 B8; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 B9; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 BA; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 BB; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 BC; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 BD; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 BE; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 BF; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 BG; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 BH; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 BI; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 BJ; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 BK; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 BL; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 BM; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 BN; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 BO; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 BP; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 BQ; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 BR; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 BS; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 BT; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 BU; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 BV; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 BW; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 BX; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 BY; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 BZ; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Ba; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Bb; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Bc; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Bd; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Be; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Bf; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Bg; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Bh; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Bi; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Bj; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Bk; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Bl; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Bm; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Bn; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Bo; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Bp; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Bq; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Br; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Bs; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Bt; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Bu; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Bv; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Bw; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Bx; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 C0; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 C1; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 C2; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 C3; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 C4; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 C5; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 C6; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 C7; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 C8; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 C9; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 CA; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 CB; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 CC; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 CD; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 CE; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 CF; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 CG; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 CH; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 CI; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 CJ; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 CK; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 CL; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 CM; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 CN; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 CO; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 CP; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 CQ; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 CR; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 CS; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 CT; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 CU; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 CV; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 CW; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 CX; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 CY; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 CZ; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Ca; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Cb; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Cc; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Cd; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Ce; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Cf; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Cg; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Ch; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Ci; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Cj; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Ck; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Cl; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Cm; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Cn; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Co; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Cp; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Cq; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Cr; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Cs; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Ct; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Cu; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Cv; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Cw; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 Cx; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 4bp7

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 4bp7
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4bp7
沉积日期 deposition_date2013-05-23
结构标题 titleAsymmetric structure of a virus-receptor complex
关键词 keywordsVIRUS, BACTERIOPHAGE; VIRUS
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier
回转半径 Rg (电子) rg_electron122.20
零角强度 I(0) i084108500000.00
分子量 molecular_weight2471300.0 kDa
排除体积 excluded_volume3090400 ų
包络体积 envelope_volume9182200 ų
水化壳体积 shell_volume645900 ų
包络直径 envelope_diameter290.2
壳层 Rg shell_rg133.10
包络 Rg envelope_rg101.70
形状 Rg shape_rg122.20
总 Rg total_rg122.20
总原子数 total_atoms173700
残基数 n_residues23220
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax273.1
Rg (实空间) rg_real123.00
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.16
I(0) (实空间) i0_real8.4450e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.1910e+09
Rg (倒空间) rg_reciprocal141.00
I(0) (倒空间) i0_reciprocal90520000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8040
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary210.1
偏度 Skewness skewness-0.500
峰度 Kurtosis kurtosis-0.609
角度范围 angular_range— – 0.0650 −1
当前正则化参数 α current_alpha1.0700
最高正则化参数 α highest_alpha119800000000.0000
实空间数据点数 n_real_points14
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.849; Stabil: 0.968; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.001; Smooth: 0.000

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)