Simian virus 40
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 同源多聚体 | 蛋白 2 DNA 2 | Site I DNA × 1 Site I DNA × 1 water × 2 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | LT_SV40 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 3–132； UniProt 131–260 作者链 B； PDB构建体 3–132； UniProt 131–260 |
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| 条目编号 entry_id | 4fgn |
| 沉积日期 deposition_date | 2012-06-04 |
| 结构标题 title | Crystal structure of the SV40 large T-antigen origin bining domain bound to Site I DNA |
| 关键词 keywords | origin binding domain, DNA BINDING PROTEIN-DNA complex; DNA BINDING PROTEIN/DNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 26.09 Å |
| Rg（电子密度） | 25.54 Å |
| 总 Rg | 26.22 Å |
| 原子数 | 2964 |
| 残基数 | 296 |
| 排除体积 | 49935 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 4fgnA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 1310 — Replication Protein E1; Chain: A, |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 20 — |
| 结构域编号 domain_id | 4fgnB00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 1310 — Replication Protein E1; Chain: A, |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 20 — |