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5a9q

Human nuclear pore complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 747.3 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NUCLEOPORIN NUP43

物种未注明

UniProt Q8NFH3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 304 PDB 声明：304-meric（304） 与蛋白拷贝数一致 链 0； UniProt 1–380 链 9； UniProt 1–380 链 I； UniProt 1–380 链 R； UniProt 1–380 未记录 NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP160 × 32 （Q12769） NUCLEOPORIN NUP37 × 32 （Q8NFH4） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP133 × 32 （Q8WUM0） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP107 × 32 （P57740） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP96 × 32 （P52948） PROTEIN SEC13 HOMOLOG × 32 （P55735） NUCLEOPORIN SEH1 × 32 （Q96EE3） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP85 × 32 （Q9BW27） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP155 × 16 （O75694） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE；pH 7.5；20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, INSTRUMENT- HOMEMADE PLUNGER, 分辨率 23.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5A9Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4I79 Crystal structure of human NUP43 提交 2012-11-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–380（380 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；291 K；25% PEG-3350, 0.1 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
分辨率 1.75 Å R-free 0.212
4I79 Crystal structure of human NUP43 提交 2012-11-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–380（380 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 19 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；291 K；25% PEG-3350, 0.1 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
分辨率 1.75 Å R-free 0.212
7PEQ Model of the outer rings of the human nuclear pore complex 提交 2021-08-11 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 288 PDB 声明：288-meric
链 AI 1–380（380 aa）
链 BI 1–380（380 aa）
链 CI 1–380（380 aa）
链 DI 1–380（380 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Cells were grown on holey carbon, Au-mesh supports. Grids were rinsed briefly with PBS and manually blotted before plunging into liquid ethane.
分辨率 35.00 Å
7R5J Human nuclear pore complex (dilated) 提交 2022-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 808 PDB 声明：808-meric
链 Q0 1–380（380 aa）
链 Q1 1–380（380 aa）
链 Q2 1–380（380 aa）
链 Q3 1–380（380 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 50.00 Å
7R5K Human nuclear pore complex (constricted) 提交 2022-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 808 PDB 声明：808-meric
链 Q0 1–380（380 aa）
链 Q1 1–380（380 aa）
链 Q2 1–380（380 aa）
链 Q3 1–380（380 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 12.00 Å

共 4 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NUP43_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 0； PDB构建体 1–380； UniProt 1–380 作者链 9； PDB构建体 1–380； UniProt 1–380 作者链 I； PDB构建体 1–380； UniProt 1–380 作者链 R； PDB构建体 1–380； UniProt 1–380

NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP160

物种未注明

UniProt Q12769

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 304 PDB 声明：304-meric（304） 与蛋白拷贝数一致 链 1； UniProt 1–1436 链 J； UniProt 1–1436 链 S； UniProt 1–1436 链 a； UniProt 1–1436 未记录 NUCLEOPORIN NUP43 × 32 （Q8NFH3） NUCLEOPORIN NUP37 × 32 （Q8NFH4） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP133 × 32 （Q8WUM0） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP107 × 32 （P57740） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP96 × 32 （P52948） PROTEIN SEC13 HOMOLOG × 32 （P55735） NUCLEOPORIN SEH1 × 32 （Q96EE3） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP85 × 32 （Q9BW27） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP155 × 16 （O75694） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE；pH 7.5；20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, INSTRUMENT- HOMEMADE PLUNGER, 分辨率 23.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5A9Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7PEQ Model of the outer rings of the human nuclear pore complex 提交 2021-08-11 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 288 PDB 声明：288-meric
链 AJ 1–1436（1436 aa）
链 BJ 1–1436（1436 aa）
链 CJ 1–1436（1436 aa）
链 DJ 1–1436（1436 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Cells were grown on holey carbon, Au-mesh supports. Grids were rinsed briefly with PBS and manually blotted before plunging into liquid ethane.
分辨率 35.00 Å
7R5J Human nuclear pore complex (dilated) 提交 2022-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 808 PDB 声明：808-meric
链 R0 1–1436（1436 aa）
链 R1 1–1436（1436 aa）
链 R2 1–1436（1436 aa）
链 R3 1–1436（1436 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 50.00 Å
7R5K Human nuclear pore complex (constricted) 提交 2022-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 808 PDB 声明：808-meric
链 R0 1–1436（1436 aa）
链 R1 1–1436（1436 aa）
链 R2 1–1436（1436 aa）
链 R3 1–1436（1436 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 12.00 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NU160_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 1； PDB构建体 1–1436； UniProt 1–1436 作者链 J； PDB构建体 1–1436； UniProt 1–1436 作者链 S； PDB构建体 1–1436； UniProt 1–1436 作者链 a； PDB构建体 1–1436； UniProt 1–1436

NUCLEOPORIN NUP37

物种未注明

UniProt Q8NFH4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 304 PDB 声明：304-meric（304） 与蛋白拷贝数一致 链 2； UniProt 1–326 链 K； UniProt 1–326 链 T； UniProt 1–326 链 b； UniProt 1–326 未记录 NUCLEOPORIN NUP43 × 32 （Q8NFH3） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP160 × 32 （Q12769） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP133 × 32 （Q8WUM0） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP107 × 32 （P57740） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP96 × 32 （P52948） PROTEIN SEC13 HOMOLOG × 32 （P55735） NUCLEOPORIN SEH1 × 32 （Q96EE3） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP85 × 32 （Q9BW27） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP155 × 16 （O75694） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE；pH 7.5；20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, INSTRUMENT- HOMEMADE PLUNGER, 分辨率 23.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5A9Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7PEQ Model of the outer rings of the human nuclear pore complex 提交 2021-08-11 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 288 PDB 声明：288-meric
链 AK 1–326（326 aa）
链 BK 1–326（326 aa）
链 CK 1–326（326 aa）
链 DK 1–326（326 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Cells were grown on holey carbon, Au-mesh supports. Grids were rinsed briefly with PBS and manually blotted before plunging into liquid ethane.
分辨率 35.00 Å
7R5J Human nuclear pore complex (dilated) 提交 2022-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 808 PDB 声明：808-meric
链 S0 1–326（326 aa）
链 S1 1–326（326 aa）
链 S2 1–326（326 aa）
链 S3 1–326（326 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 50.00 Å
7R5K Human nuclear pore complex (constricted) 提交 2022-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 808 PDB 声明：808-meric
链 S0 1–326（326 aa）
链 S1 1–326（326 aa）
链 S2 1–326（326 aa）
链 S3 1–326（326 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 12.00 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NUP37_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 2； PDB构建体 1–326； UniProt 1–326 作者链 K； PDB构建体 1–326； UniProt 1–326 作者链 T； PDB构建体 1–326； UniProt 1–326 作者链 b； PDB构建体 1–326； UniProt 1–326

NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP133

物种未注明

UniProt Q8WUM0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 304 PDB 声明：304-meric（304） 与蛋白拷贝数一致 链 3； UniProt 1–1156 链 C； UniProt 1–1156 链 L； UniProt 1–1156 链 U； UniProt 1–1156 未记录 NUCLEOPORIN NUP43 × 32 （Q8NFH3） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP160 × 32 （Q12769） NUCLEOPORIN NUP37 × 32 （Q8NFH4） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP107 × 32 （P57740） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP96 × 32 （P52948） PROTEIN SEC13 HOMOLOG × 32 （P55735） NUCLEOPORIN SEH1 × 32 （Q96EE3） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP85 × 32 （Q9BW27） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP155 × 16 （O75694） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE；pH 7.5；20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, INSTRUMENT- HOMEMADE PLUNGER, 分辨率 23.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5A9Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1XKS The crystal structure of the N-terminal domain of Nup133 reveals a beta-propeller fold common to several nucleoporins 提交 2004-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 67–514（448 aa）
突变：F345L 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.7；277 K；PEG 3350, lithium sulfate, bis-tris, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K, pH 5.70
分辨率 2.35 Å R-free 0.236
3CQC Nucleoporin Nup107/Nup133 interaction complex 提交 2008-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 935–1156（222 aa） 片段：residues 935-1156
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；0.1M Hepes, 1.1M sodium malonate, 1-1.5% PEG MME 5000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.53 Å R-free 0.245
3CQG Nucleoporin Nup107/Nup133 interaction complex, delta finger mutant 提交 2008-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 934–1156（223 aa） 片段：residues 935-1156
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；289 K；25-27% PEG 2000 MME, 500mM KSCN, 0.1M Hepes, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 3.00 Å R-free 0.287
3I4R Nup107(aa658-925)/Nup133(aa517-1156) complex, H.sapiens 提交 2009-07-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 517–1156（640 aa） 片段：HELICAL DOMAIN (UNP residues 517-1156)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；0.8 M sodium/potassium phosphate, 15 % glycerol, 2% PEG 3350, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.53 Å R-free 0.370
7PEQ Model of the outer rings of the human nuclear pore complex 提交 2021-08-11 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 288 PDB 声明：288-meric
链 AC 1–1156（1156 aa）
链 BC 1–1156（1156 aa）
链 CC 1–1156（1156 aa）
链 DC 1–1156（1156 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Cells were grown on holey carbon, Au-mesh supports. Grids were rinsed briefly with PBS and manually blotted before plunging into liquid ethane.
分辨率 35.00 Å
7R5J Human nuclear pore complex (dilated) 提交 2022-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 808 PDB 声明：808-meric
链 K0 1–1156（1156 aa）
链 K1 1–1156（1156 aa）
链 K2 1–1156（1156 aa）
链 K3 1–1156（1156 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 50.00 Å
7R5K Human nuclear pore complex (constricted) 提交 2022-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 808 PDB 声明：808-meric
链 K0 1–1156（1156 aa）
链 K1 1–1156（1156 aa）
链 K2 1–1156（1156 aa）
链 K3 1–1156（1156 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 12.00 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NU133_HUMAN
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 3； PDB构建体 1–1156； UniProt 1–1156 作者链 C； PDB构建体 1–1156； UniProt 1–1156 作者链 L； PDB构建体 1–1156； UniProt 1–1156 作者链 U； PDB构建体 1–1156； UniProt 1–1156

NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP107

物种未注明

UniProt P57740

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 304 PDB 声明：304-meric（304） 与蛋白拷贝数一致 链 4； UniProt 1–925 链 D； UniProt 1–925 链 M； UniProt 1–925 链 V； UniProt 1–925 未记录 NUCLEOPORIN NUP43 × 32 （Q8NFH3） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP160 × 32 （Q12769） NUCLEOPORIN NUP37 × 32 （Q8NFH4） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP133 × 32 （Q8WUM0） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP96 × 32 （P52948） PROTEIN SEC13 HOMOLOG × 32 （P55735） NUCLEOPORIN SEH1 × 32 （Q96EE3） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP85 × 32 （Q9BW27） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP155 × 16 （O75694） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE；pH 7.5；20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, INSTRUMENT- HOMEMADE PLUNGER, 分辨率 23.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5A9Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3CQC Nucleoporin Nup107/Nup133 interaction complex 提交 2008-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 658–925（268 aa） 片段：residues 658-925
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；0.1M Hepes, 1.1M sodium malonate, 1-1.5% PEG MME 5000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.53 Å R-free 0.245
3CQG Nucleoporin Nup107/Nup133 interaction complex, delta finger mutant 提交 2008-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 658–771（114 aa） 片段：residues 658-771, 802-925, connected by linker GGSGGS
链 A 802–925（124 aa） 片段：residues 658-771, 802-925, connected by linker GGSGGS
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；289 K；25-27% PEG 2000 MME, 500mM KSCN, 0.1M Hepes, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 3.00 Å R-free 0.287
3I4R Nup107(aa658-925)/Nup133(aa517-1156) complex, H.sapiens 提交 2009-07-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 658–925（268 aa） 片段：C-TERMINAL FRAGMENT (UNP residues 658-925)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；0.8 M sodium/potassium phosphate, 15 % glycerol, 2% PEG 3350, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.53 Å R-free 0.370
7PEQ Model of the outer rings of the human nuclear pore complex 提交 2021-08-11 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 288 PDB 声明：288-meric
链 AD 1–925（925 aa）
链 BD 1–925（925 aa）
链 CD 1–925（925 aa）
链 DD 1–925（925 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Cells were grown on holey carbon, Au-mesh supports. Grids were rinsed briefly with PBS and manually blotted before plunging into liquid ethane.
分辨率 35.00 Å
7R5J Human nuclear pore complex (dilated) 提交 2022-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 808 PDB 声明：808-meric
链 L0 1–925（925 aa）
链 L1 1–925（925 aa）
链 L2 1–925（925 aa）
链 L3 1–925（925 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 50.00 Å
7R5K Human nuclear pore complex (constricted) 提交 2022-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 808 PDB 声明：808-meric
链 L0 1–925（925 aa）
链 L1 1–925（925 aa）
链 L2 1–925（925 aa）
链 L3 1–925（925 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 12.00 Å

共 6 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 NU107_HUMAN
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 4； PDB构建体 1–925； UniProt 1–925 作者链 D； PDB构建体 1–925； UniProt 1–925 作者链 M； PDB构建体 1–925； UniProt 1–925 作者链 V； PDB构建体 1–925； UniProt 1–925

NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP96

物种未注明

UniProt P52948

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 304 PDB 声明：304-meric（304） 与蛋白拷贝数一致 链 5； UniProt 881–1817 链 E； UniProt 881–1817 链 N； UniProt 881–1817 链 W； UniProt 881–1817 未记录 NUCLEOPORIN NUP43 × 32 （Q8NFH3） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP160 × 32 （Q12769） NUCLEOPORIN NUP37 × 32 （Q8NFH4） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP133 × 32 （Q8WUM0） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP107 × 32 （P57740） PROTEIN SEC13 HOMOLOG × 32 （P55735） NUCLEOPORIN SEH1 × 32 （Q96EE3） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP85 × 32 （Q9BW27） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP155 × 16 （O75694） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE；pH 7.5；20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, INSTRUMENT- HOMEMADE PLUNGER, 分辨率 23.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5A9Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1KO6 Crystal Structure of C-terminal Autoproteolytic Domain of Nucleoporin Nup98 提交 2001-12-20 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 678–863（186 aa） 片段：C-terminal Autoproteolytic Domain (Sequence database residues 677-863)
链 B 864–920（57 aa） 片段：C-terminal Autoproteolytic Domain (Sequence database residues 864-920)
链 C 678–863（186 aa） 片段：C-terminal Autoproteolytic Domain (Sequence database residues 677-863)
链 D 864–920（57 aa） 片段：C-terminal Autoproteolytic Domain (Sequence database residues 864-920)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.75；300 K；MgCl, PEG8000, Tris, pH 8.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 3.00 Å R-free 0.271
2Q5X Crystal Structure of the C-terminal domain of hNup98 提交 2007-06-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 733–887（155 aa） 片段：C-terminal domain, residues 733-887
突变：S881A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；296 K；4.5M sodium formate, pH 4.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 296K
分辨率 1.90 Å R-free 0.229
2Q5Y Crystal Structure of the C-terminal domain of hNup98 提交 2007-06-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 729–880（152 aa） 片段：C-terminal domain, residues 729-880
链 B 881–887（7 aa） 片段：residues 881-887
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；296 K；0.1M Tris, 0.2M MgAc2, 22% PEG8000, microseeding, pH 8.1, vapor diffusion, hanging drop, temperature 296K
分辨率 2.30 Å R-free 0.260
2Q5Y Crystal Structure of the C-terminal domain of hNup98 提交 2007-06-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 729–880（152 aa） 片段：C-terminal domain, residues 729-880
链 D 881–887（7 aa） 片段：residues 881-887
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；296 K；0.1M Tris, 0.2M MgAc2, 22% PEG8000, microseeding, pH 8.1, vapor diffusion, hanging drop, temperature 296K
分辨率 2.30 Å R-free 0.260
3MMY Structural and functional analysis of the interaction between the nucleoporin Nup98 and the mRNA export factor Rae1 提交 2010-04-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 158–213（56 aa） 片段：UNP residues 158-213
未记录 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 1.65 Å R-free 0.237
3MMY Structural and functional analysis of the interaction between the nucleoporin Nup98 and the mRNA export factor Rae1 提交 2010-04-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 158–213（56 aa） 片段：UNP residues 158-213
未记录 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 1.65 Å R-free 0.237
3MMY Structural and functional analysis of the interaction between the nucleoporin Nup98 and the mRNA export factor Rae1 提交 2010-04-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 158–213（56 aa） 片段：UNP residues 158-213
未记录 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 1.65 Å R-free 0.237
3MMY Structural and functional analysis of the interaction between the nucleoporin Nup98 and the mRNA export factor Rae1 提交 2010-04-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 158–213（56 aa） 片段：UNP residues 158-213
未记录 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 1.65 Å R-free 0.237
4OWR Vesiculoviral matrix (M) protein occupies nucleic acid binding site at nucleoporin pair Rae1-Nup98 提交 2014-02-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 157–213（57 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 11% PEG 10, 000, and 10% MPD
分辨率 3.15 Å R-free 0.289
6BZM GFGNFGTS from low-complexity/FG repeat domain of Nup98, residues 116-123 提交 2017-12-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 116–123（8 aa） 片段：UNP residues 116-123
链 B 116–123（8 aa） 片段：UNP residues 116-123
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY
cryo-EM缓冲液 pH 9.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；298 K；0.1 M CHES, pH 9.5, 10% ethanol
分辨率 0.90 Å R-free 0.264
7F60 Crystal structure of auxiliary protein in complex with human nuclear protein 提交 2021-06-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–1817（1817 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；296 K；0.1m Bis-tris ph5.5,45%PEG4000
分辨率 2.85 Å R-free 0.276
7F60 Crystal structure of auxiliary protein in complex with human nuclear protein 提交 2021-06-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–1817（1817 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；296 K；0.1m Bis-tris ph5.5,45%PEG4000
分辨率 2.85 Å R-free 0.276
7F90 Crystal structure of SARS auxiliary protein in complex with human nuclear protein 提交 2021-07-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–1817（1817 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；296 K；0.1m Bis-tris ph5.5,45%PEG4000
分辨率 2.39 Å R-free 0.258
7F90 Crystal structure of SARS auxiliary protein in complex with human nuclear protein 提交 2021-07-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–1817（1817 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；296 K；0.1m Bis-tris ph5.5,45%PEG4000
分辨率 2.39 Å R-free 0.258
7PEQ Model of the outer rings of the human nuclear pore complex 提交 2021-08-11 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 288 PDB 声明：288-meric
链 AE 881–1817（937 aa）
链 BE 881–1817（937 aa）
链 CE 881–1817（937 aa）
链 DE 881–1817（937 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Cells were grown on holey carbon, Au-mesh supports. Grids were rinsed briefly with PBS and manually blotted before plunging into liquid ethane.
分辨率 35.00 Å
7Q64 Cryo-em structure of the Nup98 fibril polymorph 1 提交 2021-11-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 A 85–124（40 aa）
链 B 85–124（40 aa）
链 C 85–124（40 aa）
链 D 85–124（40 aa）
链 E 85–124（40 aa）
链 F 85–124（40 aa）
链 G 85–124（40 aa）
链 H 85–124（40 aa）
链 I 85–124（40 aa）
链 J 85–124（40 aa）
链 K 85–124（40 aa）
链 L 85–124（40 aa）
链 M 85–124（40 aa）
链 N 85–124（40 aa）
链 O 85–124（40 aa）
链 P 85–124（40 aa）
链 Q 85–124（40 aa）
链 R 85–124（40 aa）
链 S 85–124（40 aa）
链 T 85–124（40 aa）
链 U 85–124（40 aa）
链 V 85–124（40 aa）
链 W 85–124（40 aa）
链 X 85–124（40 aa）
链 Y 85–124（40 aa）
链 Z 85–124（40 aa）
链 a 85–124（40 aa）
链 b 85–124（40 aa）
链 c 85–124（40 aa）
链 d 85–124（40 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.76 Å
7Q65 Cryo-em structure of the Nup98 fibril polymorph 2 提交 2021-11-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric
链 A 85–124（40 aa）
链 B 85–124（40 aa）
链 C 85–124（40 aa）
链 D 85–124（40 aa）
链 E 85–124（40 aa）
链 F 85–124（40 aa）
链 G 85–124（40 aa）
链 H 85–124（40 aa）
链 I 85–124（40 aa）
链 J 85–124（40 aa）
链 K 85–124（40 aa）
链 L 85–124（40 aa）
链 M 85–124（40 aa）
链 N 85–124（40 aa）
链 O 85–124（40 aa）
链 P 85–124（40 aa）
链 Q 85–124（40 aa）
链 R 85–124（40 aa）
链 S 85–124（40 aa）
链 T 85–124（40 aa）
链 U 85–124（40 aa）
链 V 85–124（40 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.32 Å
7Q66 Cryo-em structure of the Nup98 fibril polymorph 3 提交 2021-11-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric
链 A 85–124（40 aa）
链 B 85–124（40 aa）
链 C 85–124（40 aa）
链 D 85–124（40 aa）
链 E 85–124（40 aa）
链 F 85–124（40 aa）
链 G 85–124（40 aa）
链 H 85–124（40 aa）
链 I 85–124（40 aa）
链 J 85–124（40 aa）
链 K 85–124（40 aa）
链 L 85–124（40 aa）
链 M 85–124（40 aa）
链 N 85–124（40 aa）
链 O 85–124（40 aa）
链 P 85–124（40 aa）
链 Q 85–124（40 aa）
链 R 85–124（40 aa）
链 S 85–124（40 aa）
链 T 85–124（40 aa）
链 U 85–124（40 aa）
链 V 85–124（40 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
7Q67 Cryo-em structure of the Nup98 fibril polymorph 4 提交 2021-11-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 A 85–124（40 aa）
链 B 85–124（40 aa）
链 C 85–124（40 aa）
链 D 85–124（40 aa）
链 E 85–124（40 aa）
链 F 85–124（40 aa）
链 G 85–124（40 aa）
链 H 85–124（40 aa）
链 I 85–124（40 aa）
链 J 85–124（40 aa）
链 K 85–124（40 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.37 Å
7R5J Human nuclear pore complex (dilated) 提交 2022-02-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 808 PDB 声明：808-meric
链 M0 881–1817（937 aa）
链 M1 881–1817（937 aa）
链 M2 881–1817（937 aa）
链 M3 881–1817（937 aa）
链 U0 1–880（880 aa）
链 U1 1–880（880 aa）
链 U2 1–880（880 aa）
链 U3 1–880（880 aa）
链 U4 1–880（880 aa）
链 U5 1–880（880 aa）
链 U6 1–880（880 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 50.00 Å
7R5K Human nuclear pore complex (constricted) 提交 2022-02-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 808 PDB 声明：808-meric
链 M0 881–1817（937 aa）
链 M1 881–1817（937 aa）
链 M2 881–1817（937 aa）
链 M3 881–1817（937 aa）
链 U0 1–880（880 aa）
链 U1 1–880（880 aa）
链 U2 1–880（880 aa）
链 U3 1–880（880 aa）
链 U4 1–880（880 aa）
链 U5 1–880（880 aa）
链 U6 1–880（880 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 12.00 Å
7VPG Crystal structure of the C-terminal tail of SARS-CoV-1 Orf6 complex with human nucleoporin pair Rae1-Nup98 提交 2021-10-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 158–213（56 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；100 mM Sodium citrate pH 5.5, 20% PEG 3350
分辨率 2.49 Å R-free 0.231
7VPG Crystal structure of the C-terminal tail of SARS-CoV-1 Orf6 complex with human nucleoporin pair Rae1-Nup98 提交 2021-10-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 158–213（56 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；100 mM Sodium citrate pH 5.5, 20% PEG 3350
分辨率 2.49 Å R-free 0.231
7VPG Crystal structure of the C-terminal tail of SARS-CoV-1 Orf6 complex with human nucleoporin pair Rae1-Nup98 提交 2021-10-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 158–213（56 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；100 mM Sodium citrate pH 5.5, 20% PEG 3350
分辨率 2.49 Å R-free 0.231
7VPG Crystal structure of the C-terminal tail of SARS-CoV-1 Orf6 complex with human nucleoporin pair Rae1-Nup98 提交 2021-10-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 158–213（56 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；100 mM Sodium citrate pH 5.5, 20% PEG 3350
分辨率 2.49 Å R-free 0.231
7VPH Crystal structure of the C-terminal tail of SARS-CoV-2 Orf6 complex with human nucleoporin pair Rae1-Nup98 提交 2021-10-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 158–213（56 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Sodium citrate pH 5.5, 20% PEG 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.244
7VPH Crystal structure of the C-terminal tail of SARS-CoV-2 Orf6 complex with human nucleoporin pair Rae1-Nup98 提交 2021-10-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 158–213（56 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Sodium citrate pH 5.5, 20% PEG 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.244
7VPH Crystal structure of the C-terminal tail of SARS-CoV-2 Orf6 complex with human nucleoporin pair Rae1-Nup98 提交 2021-10-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 158–213（56 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Sodium citrate pH 5.5, 20% PEG 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.244
7VPH Crystal structure of the C-terminal tail of SARS-CoV-2 Orf6 complex with human nucleoporin pair Rae1-Nup98 提交 2021-10-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 158–213（56 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Sodium citrate pH 5.5, 20% PEG 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.244
8CI8 Cryo-EM structure of the Nup98(298-327) fibril 提交 2023-02-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric
链 A 298–327（30 aa）
链 B 298–327（30 aa）
链 C 298–327（30 aa）
链 D 298–327（30 aa）
链 E 298–327（30 aa）
链 F 298–327（30 aa）
链 G 298–327（30 aa）
链 H 298–327（30 aa）
链 I 298–327（30 aa）
链 J 298–327（30 aa）
链 K 298–327（30 aa）
链 L 298–327（30 aa）
链 M 298–327（30 aa）
链 N 298–327（30 aa）
链 O 298–327（30 aa）
链 P 298–327（30 aa）
链 Q 298–327（30 aa）
链 R 298–327（30 aa）
链 S 298–327（30 aa）
链 T 298–327（30 aa）
链 U 298–327（30 aa）
链 V 298–327（30 aa）
链 W 298–327（30 aa）
链 X 298–327（30 aa）
链 Y 298–327（30 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5；In water.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.67 Å
9PLL TRIM21-NUP98 Molecular Glue Complex (MAN-056) 提交 2025-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 712–863（152 aa）
未记录 A1BLD (3P)-3-(4-chloro-2-ethoxyphenyl)-6-fluoro-2-[(piperazin-1-yl)methyl]quinazolin-4(3H)-one × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；100 mM NaCl, 100 mM HEPES, pH 7.5, 12 % polyethylene glycol 20,000
分辨率 1.60 Å R-free 0.214
9PLM TRIM21-NUP98 Molecular Glue Complex (MAN-021) 提交 2025-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 712–863（152 aa）
未记录 A1CI1 (3P)-3-{4-chloro-2-[2-(dimethylamino)ethoxy]phenyl}-6-fluoro-2-[(piperazin-1-yl)methyl]quinazolin-4(3H)-one × 1 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；100 mM NaCl, 100 mM HEPES, pH 7.5, 12 % polyethylene glycol 20,000
分辨率 1.32 Å R-free 0.178

共 20 个其他 PDB 条目、32 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NUP98_HUMAN
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 5； PDB构建体 1–937； UniProt 881–1817 作者链 E； PDB构建体 1–937； UniProt 881–1817 作者链 N； PDB构建体 1–937； UniProt 881–1817 作者链 W； PDB构建体 1–937； UniProt 881–1817

PROTEIN SEC13 HOMOLOG

物种未注明

UniProt P55735

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 304 PDB 声明：304-meric（304） 与蛋白拷贝数一致 链 6； UniProt 1–322 链 F； UniProt 1–322 链 O； UniProt 1–322 链 X； UniProt 1–322 未记录 NUCLEOPORIN NUP43 × 32 （Q8NFH3） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP160 × 32 （Q12769） NUCLEOPORIN NUP37 × 32 （Q8NFH4） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP133 × 32 （Q8WUM0） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP107 × 32 （P57740） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP96 × 32 （P52948） NUCLEOPORIN SEH1 × 32 （Q96EE3） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP85 × 32 （Q9BW27） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP155 × 16 （O75694） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE；pH 7.5；20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, INSTRUMENT- HOMEMADE PLUNGER, 分辨率 23.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5A9Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–316（316 aa）
链 D 1–316（316 aa）
链 E 1–316（316 aa）
链 H 1–316（316 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.15 Å R-free 0.294
3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–316（316 aa）
链 D 1–316（316 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.15 Å R-free 0.294
3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–316（316 aa）
链 H 1–316（316 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.15 Å R-free 0.294
3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–316（316 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.15 Å R-free 0.294
3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–316（316 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.15 Å R-free 0.294
3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–316（316 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.15 Å R-free 0.294
3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 1–316（316 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.15 Å R-free 0.294
3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–316（316 aa）
链 D 1–316（316 aa）
链 E 1–316（316 aa）
链 H 1–316（316 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.00 Å R-free 0.294
3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–316（316 aa）
链 D 1–316（316 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.00 Å R-free 0.294
3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–316（316 aa）
链 H 1–316（316 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.00 Å R-free 0.294
3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–316（316 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.00 Å R-free 0.294
3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–316（316 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.00 Å R-free 0.294
3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–316（316 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.00 Å R-free 0.294
3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 1–316（316 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.00 Å R-free 0.294
7PEQ Model of the outer rings of the human nuclear pore complex 提交 2021-08-11 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 288 PDB 声明：288-meric
链 AF 1–322（322 aa）
链 BF 1–322（322 aa）
链 CF 1–322（322 aa）
链 DF 1–322（322 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Cells were grown on holey carbon, Au-mesh supports. Grids were rinsed briefly with PBS and manually blotted before plunging into liquid ethane.
分辨率 35.00 Å
7R5J Human nuclear pore complex (dilated) 提交 2022-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 808 PDB 声明：808-meric
链 N0 1–322（322 aa）
链 N1 1–322（322 aa）
链 N2 1–322（322 aa）
链 N3 1–322（322 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 50.00 Å
7R5K Human nuclear pore complex (constricted) 提交 2022-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 808 PDB 声明：808-meric
链 N0 1–322（322 aa）
链 N1 1–322（322 aa）
链 N2 1–322（322 aa）
链 N3 1–322（322 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 12.00 Å
7UHY Human GATOR2 complex 提交 2022-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–322（322 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 32 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
7UHY Human GATOR2 complex 提交 2022-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 H 1–322（322 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
7UHY Human GATOR2 complex 提交 2022-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 H 1–322（322 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
9LVJ Cryo-EM structure of Sestrin2 bound human GATOR2 complex 提交 2025-02-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 H 1–368（368 aa）
链 R 1–368（368 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 32 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.82 Å
9LVK Cryo-EM structure of CASTOR1 bound human GATOR2 complex 提交 2025-02-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 H 1–368（368 aa）
链 R 1–368（368 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 31 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9LWF Cryo-EM structure of dual sensor bound GATOR2 complex 提交 2025-02-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–368（368 aa）
链 R 1–368（368 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 32 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
9OTI GATOR2 complex bound to arginine sensor CASTOR1 提交 2025-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 H 1–322（322 aa）
链 R 1–322（322 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 29 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å

共 10 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SEC13_HUMAN
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 6； PDB构建体 1–322； UniProt 1–322 作者链 F； PDB构建体 1–322； UniProt 1–322 作者链 O； PDB构建体 1–322； UniProt 1–322 作者链 X； PDB构建体 1–322； UniProt 1–322

NUCLEOPORIN SEH1

物种未注明

UniProt Q96EE3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 304 PDB 声明：304-meric（304） 与蛋白拷贝数一致 链 7； UniProt 1–360 链 G； UniProt 1–360 链 P； UniProt 1–360 链 Y； UniProt 1–360 未记录 NUCLEOPORIN NUP43 × 32 （Q8NFH3） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP160 × 32 （Q12769） NUCLEOPORIN NUP37 × 32 （Q8NFH4） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP133 × 32 （Q8WUM0） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP107 × 32 （P57740） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP96 × 32 （P52948） PROTEIN SEC13 HOMOLOG × 32 （P55735） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP85 × 32 （Q9BW27） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP155 × 16 （O75694） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE；pH 7.5；20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, INSTRUMENT- HOMEMADE PLUNGER, 分辨率 23.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5A9Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7PEQ Model of the outer rings of the human nuclear pore complex 提交 2021-08-11 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 288 PDB 声明：288-meric
链 AG 1–360（360 aa）
链 BG 1–360（360 aa）
链 CG 1–360（360 aa）
链 DG 1–360（360 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Cells were grown on holey carbon, Au-mesh supports. Grids were rinsed briefly with PBS and manually blotted before plunging into liquid ethane.
分辨率 35.00 Å
7R5J Human nuclear pore complex (dilated) 提交 2022-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 808 PDB 声明：808-meric
链 O0 1–360（360 aa）
链 O1 1–360（360 aa）
链 O2 1–360（360 aa）
链 O3 1–360（360 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 50.00 Å
7R5K Human nuclear pore complex (constricted) 提交 2022-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 808 PDB 声明：808-meric
链 O0 1–360（360 aa）
链 O1 1–360（360 aa）
链 O2 1–360（360 aa）
链 O3 1–360（360 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 12.00 Å
7UHY Human GATOR2 complex 提交 2022-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–421（421 aa）
链 F 1–421（421 aa）
链 G 1–421（421 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 32 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
7UHY Human GATOR2 complex 提交 2022-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 E 1–421（421 aa）
链 F 1–421（421 aa）
链 G 1–421（421 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
7UHY Human GATOR2 complex 提交 2022-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 E 1–421（421 aa）
链 F 1–421（421 aa）
链 G 1–421（421 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
9LVJ Cryo-EM structure of Sestrin2 bound human GATOR2 complex 提交 2025-02-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 E 1–421（421 aa）
链 F 1–421（421 aa）
链 G 1–421（421 aa）
链 O 1–421（421 aa）
链 P 1–421（421 aa）
链 Q 1–421（421 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 32 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.82 Å
9LVK Cryo-EM structure of CASTOR1 bound human GATOR2 complex 提交 2025-02-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 E 1–421（421 aa）
链 F 1–421（421 aa）
链 G 1–421（421 aa）
链 O 1–421（421 aa）
链 P 1–421（421 aa）
链 Q 1–421（421 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 31 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9LWF Cryo-EM structure of dual sensor bound GATOR2 complex 提交 2025-02-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–421（421 aa）
链 F 1–421（421 aa）
链 G 1–421（421 aa）
链 O 1–421（421 aa）
链 P 1–421（421 aa）
链 Q 1–421（421 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 32 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
9OTI GATOR2 complex bound to arginine sensor CASTOR1 提交 2025-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 E 1–360（360 aa）
链 F 1–360（360 aa）
链 G 1–360（360 aa）
链 O 1–360（360 aa）
链 P 1–360（360 aa）
链 Q 1–360（360 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 29 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å

共 8 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SEH1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 7； PDB构建体 1–360； UniProt 1–360 作者链 G； PDB构建体 1–360； UniProt 1–360 作者链 P； PDB构建体 1–360； UniProt 1–360 作者链 Y； PDB构建体 1–360； UniProt 1–360

NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP85

物种未注明

UniProt Q9BW27

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 304 PDB 声明：304-meric（304） 与蛋白拷贝数一致 链 8； UniProt 1–656 链 H； UniProt 1–656 链 Q； UniProt 1–656 链 Z； UniProt 1–656 未记录 NUCLEOPORIN NUP43 × 32 （Q8NFH3） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP160 × 32 （Q12769） NUCLEOPORIN NUP37 × 32 （Q8NFH4） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP133 × 32 （Q8WUM0） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP107 × 32 （P57740） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP96 × 32 （P52948） PROTEIN SEC13 HOMOLOG × 32 （P55735） NUCLEOPORIN SEH1 × 32 （Q96EE3） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP155 × 16 （O75694） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE；pH 7.5；20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, INSTRUMENT- HOMEMADE PLUNGER, 分辨率 23.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5A9Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7PEQ Model of the outer rings of the human nuclear pore complex 提交 2021-08-11 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 288 PDB 声明：288-meric
链 AH 1–656（656 aa）
链 BH 1–656（656 aa）
链 CH 1–656（656 aa）
链 DH 1–656（656 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Cells were grown on holey carbon, Au-mesh supports. Grids were rinsed briefly with PBS and manually blotted before plunging into liquid ethane.
分辨率 35.00 Å
7R5J Human nuclear pore complex (dilated) 提交 2022-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 808 PDB 声明：808-meric
链 P0 1–656（656 aa）
链 P1 1–656（656 aa）
链 P2 1–656（656 aa）
链 P3 1–656（656 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 50.00 Å
7R5K Human nuclear pore complex (constricted) 提交 2022-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 808 PDB 声明：808-meric
链 P0 1–656（656 aa）
链 P1 1–656（656 aa）
链 P2 1–656（656 aa）
链 P3 1–656（656 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 12.00 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NUP85_HUMAN
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 8； PDB构建体 1–656； UniProt 1–656 作者链 H； PDB构建体 1–656； UniProt 1–656 作者链 Q； PDB构建体 1–656； UniProt 1–656 作者链 Z； PDB构建体 1–656； UniProt 1–656

NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP155

物种未注明

UniProt O75694

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 304 PDB 声明：304-meric（304） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–1391 链 B； UniProt 1–1391 未记录 NUCLEOPORIN NUP43 × 32 （Q8NFH3） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP160 × 32 （Q12769） NUCLEOPORIN NUP37 × 32 （Q8NFH4） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP133 × 32 （Q8WUM0） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP107 × 32 （P57740） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP96 × 32 （P52948） PROTEIN SEC13 HOMOLOG × 32 （P55735） NUCLEOPORIN SEH1 × 32 （Q96EE3） NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP85 × 32 （Q9BW27） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE；pH 7.5；20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, INSTRUMENT- HOMEMADE PLUNGER, 分辨率 23.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5A9Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5IJN Composite structure of the inner ring of the human nuclear pore complex (32 copies of Nup205) 提交 2016-03-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 208 PDB 声明：208-meric
链 A 1–1391（1391 aa）
链 B 1–1391（1391 aa）
链 E 1–1391（1391 aa）
链 K 1–1391（1391 aa）
链 Q 1–1391（1391 aa）
链 W 1–1391（1391 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 21.40 Å
5IJO Alternative composite structure of the inner ring of the human nuclear pore complex (16 copies of Nup188, 16 copies of Nup205) 提交 2016-03-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 208 PDB 声明：208-meric
链 A 1–1391（1391 aa）
链 B 1–1391（1391 aa）
链 E 1–1391（1391 aa）
链 K 1–1391（1391 aa）
链 Q 1–1391（1391 aa）
链 W 1–1391（1391 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 21.40 Å
7EYE Cryo-EM (SPA) structure of Nup155 N-terminus (19-863) at 5.1 Angstrom resolution 提交 2021-05-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–863（863 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Buffer was freshly made.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging
分辨率 5.10 Å
7EYF Cryo-EM (SPA) structure of human Nup155 C-terminus (864-1337) at 5.3 Angstroms resolution 提交 2021-05-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 864–1391（528 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Buffer was freshly made.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging
分辨率 5.30 Å
7EYQ Cryo-EM (SPA) structure of human Nup155 Longer N-terminus (19-1069) at 5.4 Angstrom resolution 提交 2021-05-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–1391（1391 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Buffer was freshly made.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging
分辨率 5.40 Å
7PER Model of the inner ring of the human nuclear pore complex 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 192 PDB 声明：192-meric
链 E 1–1391（1391 aa）
链 K 1–1391（1391 aa）
链 Q 1–1391（1391 aa）
链 W 1–1391（1391 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Cells were grown on holey carbon, Au-mesh supports. Grids were rinsed briefly with PBS and manually blotted before plunging into liquid ethane.
分辨率 35.00 Å
7R1Y cryoEM structure of human Nup155 (residues 19-981) 提交 2022-02-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–1391（1390 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7R5J Human nuclear pore complex (dilated) 提交 2022-02-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 808 PDB 声明：808-meric
链 D0 1–1391（1391 aa）
链 D1 1–1391（1391 aa）
链 D2 1–1391（1391 aa）
链 D3 1–1391（1391 aa）
链 D4 1–1391（1391 aa）
链 D5 1–1391（1391 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 50.00 Å
7R5K Human nuclear pore complex (constricted) 提交 2022-02-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 808 PDB 声明：808-meric
链 D0 1–1391（1391 aa）
链 D1 1–1391（1391 aa）
链 D2 1–1391（1391 aa）
链 D3 1–1391（1391 aa）
链 D4 1–1391（1391 aa）
链 D5 1–1391（1391 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 12.00 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NU155_HUMAN
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–1391； UniProt 1–1391 作者链 B； PDB构建体 1–1391； UniProt 1–1391

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 5a9q

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 5a9q
下载 Download
▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5a9q
沉积日期 deposition_date2015-07-22
结构标题 titleHuman nuclear pore complex
关键词 keywordsTRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier— Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron287.20 Å
零角强度 I(0) i036339400000.00
分子量 molecular_weight1341900.0 kDa
排除体积 excluded_volume1546800 ų
包络体积 envelope_volume11743000 ų
水化壳体积 shell_volume357540 ų
包络直径 envelope_diameter816.4 Å
壳层 Rg shell_rg259.70 Å
包络 Rg envelope_rg246.90 Å
形状 Rg shape_rg287.20 Å
总 Rg total_rg287.30 Å
总原子数 total_atoms95884
残基数 n_residues19350
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax747.3 Å
Rg (实空间) rg_real253.00 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error6.36 Å
I(0) (实空间) i0_real3.2170e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.1200e+09
Rg (倒空间) rg_reciprocal136.60 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal23680000000.0000
解质量估计 total_estimate0.7651
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary149.5 Å
偏度 Skewness skewness0.681
峰度 Kurtosis kurtosis-0.963
角度范围 angular_range— – 0.0250 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.6618
最高正则化参数 α highest_alpha1603000000.0000
实空间数据点数 n_real_points6
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 22.340; Oscil: 0.533; Stabil: 0.808; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.929; Smooth: 0.000
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (10)

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8. 引用文献 (1)

▶

9. 文件与曲线 (10)