Aequorea victoria
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 6 | (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 6 water × 6 | 待复核 |
| UniProt名称 | GFP_AEQVI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–236； UniProt 1–238 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
| 条目编号 entry_id | 5hge |
| 沉积日期 deposition_date | 2016-01-08 |
| 结构标题 title | Filamentous Assembly of Green Fluorescent Protein Supported by a C-terminal fusion of 18-residues, viewed in space group P212121 |
| 关键词 keywords | filament, 2 sub 1 screw symmetry, FLUORESCENT PROTEIN; FLUORESCENT PROTEIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 48.39 Å |
| Rg（电子密度） | 49.41 Å |
| 总 Rg | 49.31 Å |
| 原子数 | 11670 |
| 残基数 | 1452 |
| 排除体积 | 207220 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 5hge__assembly_1__model_1 |
The biological unit is a filament with 2 sub 1 screw symmetry. One filament is composed of chain A and the following symmetry operators 1/2+X,1/2-Y,-Z; -1+X,Y,Z; -1/2+X,1/2-Y,-Z; 1+X,Y,Z; 3/2+X,1/2-Y,-Z; 2+X,Y,Z; etc. （100） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 结构域编号 domain_id | d5hgea1 |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.22 — GFP-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.22.1 — GFP-like |
| 家族 Family family | d.22.1.1 — Fluorescent proteins |
| 结构域编号 domain_id | d5hgea2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | 5hgeA00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 155 — Green Fluorescent Protein |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Green fluorescent protein |