5iv7

Cryo-electron microscopy structure of the star-shaped, hubless post-attachment T4 baseplate

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Baseplate wedge protein gp6

物种未注明

UniProt P19060

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 96 Baseplate wedge protein gp7 × 6 (P19061) Baseplate wedge protein gp8 × 12 (P19062) Baseplate wedge protein gp9 × 18 (P10927) Baseplate wedge protein gp10 × 18 (P10928) Baseplate wedge protein gp11 × 18 (P10929) Baseplate wedge protein gp25 × 6 (P09425) Baseplate wedge protein gp53 × 6 (P16011) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 BP06_BPT4
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–660; UniProt 1–660 作者链 B; PDB构建体 1–660; UniProt 1–660 作者链 BF; PDB构建体 1–660; UniProt 1–660 作者链 BG; PDB构建体 1–660; UniProt 1–660 作者链 EA; PDB构建体 1–660; UniProt 1–660 作者链 EB; PDB构建体 1–660; UniProt 1–660 作者链 Q; PDB构建体 1–660; UniProt 1–660 作者链 R; PDB构建体 1–660; UniProt 1–660 作者链 g; PDB构建体 1–660; UniProt 1–660 作者链 h; PDB构建体 1–660; UniProt 1–660 作者链 w; PDB构建体 1–660; UniProt 1–660 作者链 x; PDB构建体 1–660; UniProt 1–660

Baseplate wedge protein gp7

物种未注明

UniProt P19061

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 96 Baseplate wedge protein gp6 × 12 (P19060) Baseplate wedge protein gp8 × 12 (P19062) Baseplate wedge protein gp9 × 18 (P10927) Baseplate wedge protein gp10 × 18 (P10928) Baseplate wedge protein gp11 × 18 (P10929) Baseplate wedge protein gp25 × 6 (P09425) Baseplate wedge protein gp53 × 6 (P16011) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 BP07_BPT4
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–1032; UniProt 1–1032 作者链 CA; PDB构建体 1–1032; UniProt 1–1032 作者链 EC; PDB构建体 1–1032; UniProt 1–1032 作者链 S; PDB构建体 1–1032; UniProt 1–1032 作者链 i; PDB构建体 1–1032; UniProt 1–1032 作者链 y; PDB构建体 1–1032; UniProt 1–1032

Baseplate wedge protein gp8

物种未注明

UniProt P19062

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 96 Baseplate wedge protein gp6 × 12 (P19060) Baseplate wedge protein gp7 × 6 (P19061) Baseplate wedge protein gp9 × 18 (P10927) Baseplate wedge protein gp10 × 18 (P10928) Baseplate wedge protein gp11 × 18 (P10929) Baseplate wedge protein gp25 × 6 (P09425) Baseplate wedge protein gp53 × 6 (P16011) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BP08_BPT4
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 AA; PDB构建体 1–334; UniProt 1–334 作者链 CB; PDB构建体 1–334; UniProt 1–334 作者链 CC; PDB构建体 1–334; UniProt 1–334 作者链 D; PDB构建体 1–334; UniProt 1–334 作者链 E; PDB构建体 1–334; UniProt 1–334 作者链 ED; PDB构建体 1–334; UniProt 1–334 作者链 EE; PDB构建体 1–334; UniProt 1–334 作者链 T; PDB构建体 1–334; UniProt 1–334 作者链 U; PDB构建体 1–334; UniProt 1–334 作者链 j; PDB构建体 1–334; UniProt 1–334 作者链 k; PDB构建体 1–334; UniProt 1–334 作者链 z; PDB构建体 1–334; UniProt 1–334

Baseplate wedge protein gp9

物种未注明

UniProt P10927

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 96 Baseplate wedge protein gp6 × 12 (P19060) Baseplate wedge protein gp7 × 6 (P19061) Baseplate wedge protein gp8 × 12 (P19062) Baseplate wedge protein gp10 × 18 (P10928) Baseplate wedge protein gp11 × 18 (P10929) Baseplate wedge protein gp25 × 6 (P09425) Baseplate wedge protein gp53 × 6 (P16011) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BP09_BPT4
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 AB; PDB构建体 1–288; UniProt 1–288 作者链 AC; PDB构建体 1–288; UniProt 1–288 作者链 AD; PDB构建体 1–288; UniProt 1–288 作者链 CD; PDB构建体 1–288; UniProt 1–288 作者链 CE; PDB构建体 1–288; UniProt 1–288 作者链 CF; PDB构建体 1–288; UniProt 1–288 作者链 EF; PDB构建体 1–288; UniProt 1–288 作者链 EG; PDB构建体 1–288; UniProt 1–288 作者链 F; PDB构建体 1–288; UniProt 1–288 作者链 FA; PDB构建体 1–288; UniProt 1–288 作者链 G; PDB构建体 1–288; UniProt 1–288 作者链 H; PDB构建体 1–288; UniProt 1–288 作者链 V; PDB构建体 1–288; UniProt 1–288 作者链 W; PDB构建体 1–288; UniProt 1–288 作者链 X; PDB构建体 1–288; UniProt 1–288 作者链 l; PDB构建体 1–288; UniProt 1–288 作者链 m; PDB构建体 1–288; UniProt 1–288 作者链 n; PDB构建体 1–288; UniProt 1–288

Baseplate wedge protein gp10

物种未注明

UniProt P10928

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 96 Baseplate wedge protein gp6 × 12 (P19060) Baseplate wedge protein gp7 × 6 (P19061) Baseplate wedge protein gp8 × 12 (P19062) Baseplate wedge protein gp9 × 18 (P10927) Baseplate wedge protein gp11 × 18 (P10929) Baseplate wedge protein gp25 × 6 (P09425) Baseplate wedge protein gp53 × 6 (P16011) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 BP10_BPT4
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 AE; PDB构建体 1–602; UniProt 1–602 作者链 AF; PDB构建体 1–602; UniProt 1–602 作者链 AG; PDB构建体 1–602; UniProt 1–602 作者链 CG; PDB构建体 1–602; UniProt 1–602 作者链 DA; PDB构建体 1–602; UniProt 1–602 作者链 DB; PDB构建体 1–602; UniProt 1–602 作者链 FB; PDB构建体 1–602; UniProt 1–602 作者链 FC; PDB构建体 1–602; UniProt 1–602 作者链 FD; PDB构建体 1–602; UniProt 1–602 作者链 I; PDB构建体 1–602; UniProt 1–602 作者链 J; PDB构建体 1–602; UniProt 1–602 作者链 K; PDB构建体 1–602; UniProt 1–602 作者链 Y; PDB构建体 1–602; UniProt 1–602 作者链 Z; PDB构建体 1–602; UniProt 1–602 作者链 a; PDB构建体 1–602; UniProt 1–602 作者链 o; PDB构建体 1–602; UniProt 1–602 作者链 p; PDB构建体 1–602; UniProt 1–602 作者链 q; PDB构建体 1–602; UniProt 1–602

Baseplate wedge protein gp11

物种未注明

UniProt P10929

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 96 Baseplate wedge protein gp6 × 12 (P19060) Baseplate wedge protein gp7 × 6 (P19061) Baseplate wedge protein gp8 × 12 (P19062) Baseplate wedge protein gp9 × 18 (P10927) Baseplate wedge protein gp10 × 18 (P10928) Baseplate wedge protein gp25 × 6 (P09425) Baseplate wedge protein gp53 × 6 (P16011) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 BP11_BPT4
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 BA; PDB构建体 1–219; UniProt 1–219 作者链 BB; PDB构建体 1–219; UniProt 1–219 作者链 BC; PDB构建体 1–219; UniProt 1–219 作者链 DC; PDB构建体 1–219; UniProt 1–219 作者链 DD; PDB构建体 1–219; UniProt 1–219 作者链 DE; PDB构建体 1–219; UniProt 1–219 作者链 FE; PDB构建体 1–219; UniProt 1–219 作者链 FF; PDB构建体 1–219; UniProt 1–219 作者链 FG; PDB构建体 1–219; UniProt 1–219 作者链 L; PDB构建体 1–219; UniProt 1–219 作者链 M; PDB构建体 1–219; UniProt 1–219 作者链 N; PDB构建体 1–219; UniProt 1–219 作者链 b; PDB构建体 1–219; UniProt 1–219 作者链 c; PDB构建体 1–219; UniProt 1–219 作者链 d; PDB构建体 1–219; UniProt 1–219 作者链 r; PDB构建体 1–219; UniProt 1–219 作者链 s; PDB构建体 1–219; UniProt 1–219 作者链 t; PDB构建体 1–219; UniProt 1–219

Baseplate wedge protein gp25

物种未注明

UniProt P09425

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 96 Baseplate wedge protein gp6 × 12 (P19060) Baseplate wedge protein gp7 × 6 (P19061) Baseplate wedge protein gp8 × 12 (P19062) Baseplate wedge protein gp9 × 18 (P10927) Baseplate wedge protein gp10 × 18 (P10928) Baseplate wedge protein gp11 × 18 (P10929) Baseplate wedge protein gp53 × 6 (P16011) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BP25_BPT4
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 BD; PDB构建体 1–132; UniProt 1–132 作者链 DF; PDB构建体 1–132; UniProt 1–132 作者链 GA; PDB构建体 1–132; UniProt 1–132 作者链 O; PDB构建体 1–132; UniProt 1–132 作者链 e; PDB构建体 1–132; UniProt 1–132 作者链 u; PDB构建体 1–132; UniProt 1–132

Baseplate wedge protein gp53

物种未注明

UniProt P16011

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 96 Baseplate wedge protein gp6 × 12 (P19060) Baseplate wedge protein gp7 × 6 (P19061) Baseplate wedge protein gp8 × 12 (P19062) Baseplate wedge protein gp9 × 18 (P10927) Baseplate wedge protein gp10 × 18 (P10928) Baseplate wedge protein gp11 × 18 (P10929) Baseplate wedge protein gp25 × 6 (P09425) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 BP53_BPT4
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 BE; PDB构建体 1–196; UniProt 1–196 作者链 DG; PDB构建体 1–196; UniProt 1–196 作者链 GB; PDB构建体 1–196; UniProt 1–196 作者链 P; PDB构建体 1–196; UniProt 1–196 作者链 f; PDB构建体 1–196; UniProt 1–196 作者链 v; PDB构建体 1–196; UniProt 1–196

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5iv7
沉积日期 deposition_date2016-03-19
结构标题 titleCryo-electron microscopy structure of the star-shaped, hubless post-attachment T4 baseplate
关键词 keywords;T4, baseplate, post-attachment, bacteriophage, bacterial virus, star-shaped, hubless, membrane-piercing, cell attachment, infection, Viral protein ;; VIRAL PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5iv7__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5iv7__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 1011 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

5iv7__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)0.00 Å
Rg(电子密度)177.40 Å
总 Rg177.40 Å
原子数312210
残基数39678
排除体积5520700 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 5iv7__assembly_1__model_1 96-meric (96) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

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7. 引用文献 (1)