Streptavidin
Streptomyces avidinii
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白拷贝数一致 | 链 A； UniProt 1–183 链 K； UniProt 1–183 | 未记录 | GLU-TRP-VAL-HIS-PRO-GLN-PHE-GLU-GLN-LYS-ALA-LYS Peptide × 2 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Magnesium acetate 0.1M Sodium cacodylate pH 6.5 15% PEG6000 | 分辨率 1.12 Å R-free 0.186 |
| 2 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白拷贝数一致 | 链 B； UniProt 1–183 链 M； UniProt 1–183 | 未记录 | GLU-TRP-VAL-HIS-PRO-GLN-PHE-GLU-GLN-LYS-ALA-LYS Peptide × 2 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Magnesium acetate 0.1M Sodium cacodylate pH 6.5 15% PEG6000 | 分辨率 1.12 Å R-free 0.186 |
| 3 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白拷贝数一致 | 链 E； UniProt 1–183 链 O； UniProt 1–183 | 未记录 | GLU-TRP-VAL-HIS-PRO-GLN-PHE-GLU-GLN-LYS-ALA-LYS Peptide × 2 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Magnesium acetate 0.1M Sodium cacodylate pH 6.5 15% PEG6000 | 分辨率 1.12 Å R-free 0.186 |
| 4 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白拷贝数一致 | 链 F； UniProt 1–183 链 H； UniProt 1–183 | 未记录 | GLU-TRP-VAL-HIS-PRO-GLN-PHE-GLU-GLN-LYS-ALA-LYS Peptide × 2 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Magnesium acetate 0.1M Sodium cacodylate pH 6.5 15% PEG6000 | 分辨率 1.12 Å R-free 0.186 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 5N7X | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1DF8 S45A MUTANT OF STREPTAVIDIN IN COMPLEX WITH BIOTIN 提交 1999-11-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
3–129（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13-139
链 B
3–129（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13-139
|
突变：S45A 突变：S45A | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；294 K；40% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 0.1 M SODIUM ACETATE, pH 4.5, temperature 294.K
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.225 |
| 1DF8 S45A MUTANT OF STREPTAVIDIN IN COMPLEX WITH BIOTIN 提交 1999-11-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
3–129（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13-139
链 B
3–129（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13-139
|
突变：S45A 突变：S45A | BTN BIOTIN × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；294 K；40% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 0.1 M SODIUM ACETATE, pH 4.5, temperature 294.K
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.225 |
| 1HQQ MINIPROTEIN MP-2 (M9A) COMPLEX WITH STREPTAVIDIN 提交 2000-12-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–129（129 aa）
链 B
1–129（129 aa）
链 C
1–129（129 aa）
链 D
1–129（129 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；100 mM potassium acetate, ammonium sulfate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.249 |
| 1HXL MINIPROTEIN MP-2 (V10A) COMPLEX WITH STREPTAVIDIN 提交 2001-01-16 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–129（129 aa）
链 B
1–129（129 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；298 K；100 MM POTASSIUM ACETATE, AMMONIUM SULFATE, pH 4.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.236 |
| 1HXZ MINIPROTEIN MP-2 COMPLEX WITH STREPTAVIDIN 提交 2001-01-17 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–129（129 aa）
链 B
1–129（129 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；100mM potassium acetate, 32% AMMONIUM SULFATE , pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.230 |
| 1HY2 MINIPROTEIN MP-1 COMPLEX WITH STREPTAVIDIN 提交 2001-01-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–129（129 aa）
链 B
1–129（129 aa）
链 C
1–129（129 aa）
链 D
1–129（129 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；100mM potassium acetate, ammonium sulfate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.258 |
| 1I9H CORE STREPTAVIDIN-BNA COMPLEX 提交 2001-03-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
25–163（139 aa）
片段：RESIDUES 25-163
链 B
25–163（139 aa）
片段：RESIDUES 25-163
|
未记录 | BNI 5-(2-OXO-HEXAHYDRO-THIENO[3,4-D]IMIDAZOL-6-YL)-PENTANOIC ACID (4-NITRO-PHENYL)-AMIDE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；10% isopropanol, 0.1M NaCitrate, 0.05M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.250 |
| 1KFF An engineered streptavidin with improved affinity for the strep-tag II peptide: apo-SAM1 提交 2001-11-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–163（126 aa）
链 B
38–163（126 aa）
链 C
38–163（126 aa）
链 D
38–163（126 aa）
|
突变：E44V,S45T,V47R 突变：E44V,S45T,V47R 突变：E44V,S45T,V47R 突变：E44V,S45T,V47R | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；293 K；100 mM Na2HPO4, 1.2-M (NH4)2SO4, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.229 |
| 1KL3 an engineered streptavidin with improved affinity for the strep-tag II peptide : SAm1-StrepII 提交 2001-12-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
38–163（126 aa）
链 B
38–163（126 aa）
链 C
38–163（126 aa）
链 D
38–163（126 aa）
|
突变：E44V,S45T,V47R 突变：E44V,S45T,V47R 突变：E44V,S45T,V47R 突变：E44V,S45T,V47R | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；100 mM Na2HPO4, 1.3-M (NH4)2SO4, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.217 |
| 1KL4 AN ENGINEERED STREPTAVIDIN WITH IMPROVED AFFINITY FOR THE STREP-TAG II PEPTIDE : apo-SAM2 提交 2001-12-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–163（126 aa）
链 B
38–163（126 aa）
链 C
38–163（126 aa）
链 D
38–163（126 aa）
|
突变：E44I,S45G,V47R 突变：E44I,S45G,V47R 突变：E44I,S45G,V47R 突变：E44I,S45G,V47R | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；50 mM Na3PO4, 50 mM Na3-citrate, 30% PEG 600, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.228 |
| 1KL5 an engineered streptavidin with improved affinity for the strep-tag II peptide : SAm2-StrepII 提交 2001-12-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
38–163（126 aa）
链 B
38–163（126 aa）
链 C
38–163（126 aa）
链 D
38–163（126 aa）
|
突变：E44I,S45G,V47R 突变：E44I,S45G,V47R 突变：E44I,S45G,V47R 突变：E44I,S45G,V47R | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM Na2HPO4, 1.2-M (NH4)2SO4, pH 7.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.221 |
| 1LCV streptavidin-norbiotin complex 提交 2002-04-07 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–159（121 aa）
链 B
39–159（121 aa）
|
未记录 | SNR NORBIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；293 K；1.2 M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.233 |
| 1LCV streptavidin-norbiotin complex 提交 2002-04-07 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
39–159（121 aa）
链 B
39–159（121 aa）
|
未记录 | SNR NORBIOTIN × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；293 K；1.2 M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.233 |
| 1LCW streptavidin-homobiotin complex 提交 2002-04-07 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–159（121 aa）
链 B
39–159（121 aa）
|
未记录 | SHM HOMOBIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；293 K；ammonium sulfate, sodium acetate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.233 |
| 1LCZ streptavidin-BCAP complex 提交 2002-04-08 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
25–159（135 aa）
链 B
25–159（135 aa）
|
未记录 | BH7 E-AMINO BIOTINYL CAPROIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；293 K；1.2M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.237 |
| 1LCZ streptavidin-BCAP complex 提交 2002-04-08 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
25–159（135 aa）
链 B
25–159（135 aa）
|
未记录 | BH7 E-AMINO BIOTINYL CAPROIC ACID × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；293 K；1.2M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.237 |
| 1MEP Crystal Structure of Streptavidin Double Mutant S45A/D128A with Biotin: Cooperative Hydrogen-Bond Interactions in the Streptavidin-Biotin System. 提交 2002-08-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：Core streptavidin (residues 13-139)
链 B
37–163（127 aa）
片段：Core streptavidin (residues 13-139)
链 C
37–163（127 aa）
片段：Core streptavidin (residues 13-139)
链 D
37–163（127 aa）
片段：Core streptavidin (residues 13-139)
|
突变：S45A, D128A 突变：S45A, D128A 突变：S45A, D128A 突变：S45A, D128A | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；294 K；sodium citrate, cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.295 |
| 1MK5 Wildtype Core-Streptavidin with Biotin at 1.4A. 提交 2002-08-28 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：Core Streptavidin (residues 13-139)
链 B
37–163（127 aa）
片段：Core Streptavidin (residues 13-139)
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；ammonium sulphate, sodium acetate, sodium chloride, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.189 |
| 1MM9 Streptavidin Mutant with Insertion of Fibronectin Hexapeptide, including RGD 提交 2002-09-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：Core Streptavidin (residues 13-139)
|
未记录 | MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；MPD, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.195 |
| 1MM9 Streptavidin Mutant with Insertion of Fibronectin Hexapeptide, including RGD 提交 2002-09-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：Core Streptavidin (residues 13-139)
|
未记录 | MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；MPD, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.195 |
| 1MM9 Streptavidin Mutant with Insertion of Fibronectin Hexapeptide, including RGD 提交 2002-09-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：Core Streptavidin (residues 13-139)
|
未记录 | MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；MPD, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.195 |
| 1MOY Streptavidin Mutant with Osteopontin Hexapeptide Insertion Including RGD 提交 2002-09-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
|
未记录 | MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；MPD, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.185 |
| 1MOY Streptavidin Mutant with Osteopontin Hexapeptide Insertion Including RGD 提交 2002-09-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
|
未记录 | MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；MPD, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.185 |
| 1MOY Streptavidin Mutant with Osteopontin Hexapeptide Insertion Including RGD 提交 2002-09-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
|
未记录 | MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；MPD, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.185 |
| 1N43 Streptavidin Mutant N23A with biotin at 1.89A 提交 2002-10-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 B
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 C
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 D
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
|
突变：N23A 突变：N23A 突变：N23A 突变：N23A | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；MPD, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.301 |
| 1N4J STREPTAVIDIN MUTANT N23A AT 2.18A 提交 2002-10-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
|
突变：N23A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；293 K；PEG4000, phosphate buffer, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.253 |
| 1N7Y STREPTAVIDIN MUTANT N23E AT 1.96A 提交 2002-11-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 B
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 C
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 D
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
|
突变：N23E 突变：N23E 突变：N23E 突变：N23E | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；MPD, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.284 |
| 1N9M Streptavidin Mutant S27A with Biotin at 1.6A Resolution 提交 2002-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 B
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 C
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 D
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
|
突变：S27A 突变：S27A 突变：S27A 突变：S27A | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；MPD, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.207 |
| 1N9Y Streptavidin Mutant S27A at 1.5A Resolution 提交 2002-11-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 B
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 C
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 D
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
|
突变：S27A 突变：S27A 突变：S27A 突变：S27A | MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；MPD, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.243 |
| 1NBX Streptavidin Mutant Y43A at 1.70A Resolution 提交 2002-12-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 B
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 C
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 D
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
|
突变：Y43A 突变：Y43A 突变：Y43A 突变：Y43A | MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；MPD, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.273 |
| 1NC9 STREPTAVIDIN MUTANT Y43A WITH IMINOBIOTIN AT 1.8A RESOLUTION 提交 2002-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：core strepavidin, residues 13-139
链 B
37–163（127 aa）
片段：core strepavidin, residues 13-139
链 C
37–163（127 aa）
片段：core strepavidin, residues 13-139
链 D
37–163（127 aa）
片段：core strepavidin, residues 13-139
|
突变：Y43A 突变：Y43A 突变：Y43A 突变：Y43A | IMI 2-IMINOBIOTIN × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；MPD, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.266 |
| 1NDJ Streptavidin Mutant Y43F with Biotin at 1.81A Resolution 提交 2002-12-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 B
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 C
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 D
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
|
突变：Y43F 突变：Y43F 突变：Y43F 突变：Y43F | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；PEG4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.312 |
| 1NQM Structure of Savm-W120K, streptavidin mutant 提交 2003-01-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
24–159（136 aa）
链 B
24–159（136 aa）
链 C
24–159（136 aa）
链 D
24–159（136 aa）
|
突变：W120K 突变：W120K 突变：W120K 突变：W120K | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.45；293 K；25% PEG 6K, 0.3M sodium acetate, 0.1M cac. buffer, pH 6.45, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 20K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.240 |
| 1PTS CRYSTAL STRUCTURE AND LIGAND BINDING STUDIES OF A SCREENED PEPTIDE COMPLEXED WITH STREPTAVIDIN 提交 1992-07-23 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
37–157（121 aa）
链 B
37–157（121 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å |
| 1PTS CRYSTAL STRUCTURE AND LIGAND BINDING STUDIES OF A SCREENED PEPTIDE COMPLEXED WITH STREPTAVIDIN 提交 1992-07-23 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
37–157（121 aa）
链 B
37–157（121 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å |
| 1RST COMPLEX BETWEEN STREPTAVIDIN AND THE STREP-TAG PEPTIDE 提交 1995-10-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
38–163（126 aa）
片段：RESIDUES 13 - 139
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.70 Å R-free 0.227 |
| 1RSU COMPLEX BETWEEN STREPTAVIDIN AND THE STREP-TAG II PEPTIDE 提交 1995-10-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
38–163（126 aa）
片段：RESIDUES 13 - 139
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.70 Å R-free 0.213 |
| 1RXH Crystal structure of streptavidin mutant L124R (M1) complexed with biotinyl p-nitroanilide (BNI) 提交 2003-12-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
|
突变：L124R, L324R 突变：L124R, L324R | BNI 5-(2-OXO-HEXAHYDRO-THIENO[3,4-D]IMIDAZOL-6-YL)-PENTANOIC ACID (4-NITRO-PHENYL)-AMIDE × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.90 Å R-free 0.309 |
| 1RXJ Crystal structure of streptavidin mutant (M2) where the L3,4 loop was replace by that of avidin 提交 2003-12-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–159（121 aa）
链 B
39–159（121 aa）
链 C
39–159（121 aa）
链 D
39–159（121 aa）
|
未记录 | BNI 5-(2-OXO-HEXAHYDRO-THIENO[3,4-D]IMIDAZOL-6-YL)-PENTANOIC ACID (4-NITRO-PHENYL)-AMIDE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 4000, 0.1M NaAc, 0.1M NaCac, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.14 Å R-free 0.200 |
| 1RXK crystal structure of streptavidin mutant (M3) a combination of M1+M2 提交 2003-12-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–159（122 aa）
链 B
38–159（122 aa）
|
突变：L124R 突变：L124R | BNI 5-(2-OXO-HEXAHYDRO-THIENO[3,4-D]IMIDAZOL-6-YL)-PENTANOIC ACID (4-NITRO-PHENYL)-AMIDE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.6；293 K；1.5M AS, 0.1M Tris-HCl, pH 8.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.239 |
| 1SLD STREPTAVIDIN, PH 7.5, BOUND TO CYCLIC DISULFIDE-BONDED PEPTIDE LIGAND AC-CHPQFC-NH2 提交 1995-03-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
25–159（135 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.220 |
| 1SLE STREPTAVIDIN, PH 5.0, BOUND TO CYCLIC PEPTIDE AC-CHPQGPPC-NH2 提交 1995-03-10 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5；pH 5.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.233 |
| 1SLF APOSTREPTAVIDIN, PH 5.6, TWO MOLECULES OF (SO4)2 BOUND AT THE BIOTIN BINDING SITE 提交 1995-03-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.6；pH 5.6
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.202 |
| 1SLG STREPTAVIDIN, PH 5.6, BOUND TO PEPTIDE FCHPQNT 提交 1995-03-10 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.6；pH 5.6
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.222 |
| 1SRE CRYSTALLOGRAPHIC AND THERMODYNAMIC COMPARISON OF NATURAL AND SYNTHETIC LIGANDS BOUND TO STREPTAVIDIN 提交 1994-02-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–157（121 aa）
链 B
37–157（121 aa）
|
未记录 | HAB 2-((4'-HYDROXYPHENYL)-AZO)BENZOIC ACID × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.78 Å |
| 1SRE CRYSTALLOGRAPHIC AND THERMODYNAMIC COMPARISON OF NATURAL AND SYNTHETIC LIGANDS BOUND TO STREPTAVIDIN 提交 1994-02-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
37–157（121 aa）
链 B
37–157（121 aa）
|
未记录 | HAB 2-((4'-HYDROXYPHENYL)-AZO)BENZOIC ACID × 8 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.78 Å |
| 1SRF STRUCTURE-BASED DESIGN OF SYNTHETIC AZOBENZENE LIGANDS FOR STREPTAVIDIN 提交 1994-02-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–157（121 aa）
链 B
37–157（121 aa）
|
未记录 | MTB 2-((3'-TERTBUTYL-4'-HYDROXYPHENYL)AZO)BENZOIC ACID × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å |
| 1SRG STRUCTURE-BASED DESIGN OF SYNTHETIC AZOBENZENE LIGANDS FOR STREPTAVIDIN 提交 1994-02-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–157（121 aa）
链 B
37–157（121 aa）
|
未记录 | MHB 2-((3'-METHYL-4'-HYDROXYPHENYL)AZO)BENZOIC ACID × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å |
| 1SRG STRUCTURE-BASED DESIGN OF SYNTHETIC AZOBENZENE LIGANDS FOR STREPTAVIDIN 提交 1994-02-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
37–157（121 aa）
链 B
37–157（121 aa）
|
未记录 | MHB 2-((3'-METHYL-4'-HYDROXYPHENYL)AZO)BENZOIC ACID × 8 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å |
| 1SRH STRUCTURE-BASED DESIGN OF SYNTHETIC AZOBENZENE LIGANDS FOR STREPTAVIDIN 提交 1994-02-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–157（121 aa）
链 B
37–157（121 aa）
|
未记录 | MOB 2-((3',5'-DIMETHOXY-4'-HYDROXYPHENYL)AZO)BENZOIC ACID × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å |
| 1SRI STRUCTURE-BASED DESIGN OF SYNTHETIC AZOBENZENE LIGANDS FOR STREPTAVIDIN 提交 1994-02-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–157（121 aa）
链 B
37–157（121 aa）
|
未记录 | DMB 2-((3',5'-DIMETHYL-4'-HYDROXYPHENYL)AZO)BENZOIC ACID × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.65 Å |
| 1SRI STRUCTURE-BASED DESIGN OF SYNTHETIC AZOBENZENE LIGANDS FOR STREPTAVIDIN 提交 1994-02-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
37–157（121 aa）
链 B
37–157（121 aa）
|
未记录 | DMB 2-((3',5'-DIMETHYL-4'-HYDROXYPHENYL)AZO)BENZOIC ACID × 8 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.65 Å |
| 1SRJ STRUCTURE-BASED DESIGN OF SYNTHETIC AZOBENZENE LIGANDS FOR STREPTAVIDIN 提交 1994-02-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–157（121 aa）
链 B
37–157（121 aa）
|
未记录 | NAB 2-((4'-HYDROXYNAPHTHYL)-AZO)BENZOIC ACID × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å |
| 1STP STRUCTURAL ORIGINS OF HIGH-AFFINITY BIOTIN BINDING TO STREPTAVIDIN 提交 1992-03-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
25–183（159 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.60 Å |
| 1STR STREPTAVIDIN DIMERIZED BY DISULFIDE-BONDED PEPTIDE AC-CHPQNT-NH2 DIMER 提交 1995-09-12 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å R-free 0.233 |
| 1STS STREPTAVIDIN DIMERIZED BY DISULFIDE-BONDED PEPTIDE FCHPQNT-NH2 DIMER 提交 1995-09-12 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.95 Å R-free 0.238 |
| 1SWA APO-CORE-STREPTAVIDIN AT PH 4.5 提交 1997-03-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 B
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 C
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 D
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 47% MPD (PH 4.5)
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.256 |
| 1SWB APO-CORE-STREPTAVIDIN AT PH 7.5 提交 1997-03-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 B
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 C
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 D
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 48% MPD (2-METHYL-PENTANE-2,4-DIOLE, PH 4.5), 5.5H SOAKING IN 0.1M HEPES BUFFER PH 7.5
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.253 |
| 1SWC APO-CORE-STREPTAVIDIN AT PH 4.5 提交 1997-03-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 B
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 C
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 D
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 60% MPD (2-METHYL-PENTANE-2,4-DIOLE, PH 4.5), SOAKING IN 20 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 4.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.232 |
| 1SWD APO-CORE-STREPTAVIDIN IN COMPLEX WITH BIOTIN (TWO UNOCCUPIED BINDING SITES) AT PH 4.5 提交 1997-03-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 B
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 C
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 D
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
|
未记录 | BTN BIOTIN × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；PROTEIN-BIOTIN COMPLEX WAS CO-CRYSTALLIZED FROM 50% MPD (2-METHYL-PENTANE-2,4-DIOLE, PH 4.5) WITH 1.2M EXCESS OF BIOTIN
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.328 |
| 1SWE APO-CORE-STREPTAVIDIN IN COMPLEX WITH BIOTIN AT PH 4.5 提交 1997-03-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 B
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 C
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 D
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；PROTEIN-BIOTIN COMPLEX WAS CO-CRYSTALLIZED FROM 50% MPD (2-METHYL-PENTANE-2,4-DIOLE, PH 4.5) WITH 2.5M EXCESS OF BIOTIN
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.266 |
| 1SWF CIRCULAR PERMUTED STREPTAVIDIN E51/A46 提交 1997-04-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
75–163（89 aa）
链 B
75–163（89 aa）
链 C
75–163（89 aa）
链 D
75–163（89 aa）
|
突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; 突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; 突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; 突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 52% MPD (PH 4.5).
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.288 |
| 1SWF CIRCULAR PERMUTED STREPTAVIDIN E51/A46 提交 1997-04-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
75–163（89 aa）
链 B
75–163（89 aa）
链 C
75–163（89 aa）
链 D
75–163（89 aa）
|
突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; 突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; 突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; 突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 52% MPD (PH 4.5).
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.288 |
| 1SWG CIRCULAR PERMUTED STREPTAVIDIN E51/A46 IN COMPLEX WITH BIOTIN 提交 1997-07-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
75–178（104 aa）
链 B
75–178（104 aa）
链 C
75–178（104 aa）
链 D
75–178（104 aa）
|
突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; 突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; 突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; 突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；PROTEIN (12MG/ML, 10MM BIOTIN) WAS CRYSTALLIZED FROM 52% MPD (PH 4.5)
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.245 |
| 1SWG CIRCULAR PERMUTED STREPTAVIDIN E51/A46 IN COMPLEX WITH BIOTIN 提交 1997-07-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
75–178（104 aa）
链 B
75–178（104 aa）
|
突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; 突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; | BTN BIOTIN × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；PROTEIN (12MG/ML, 10MM BIOTIN) WAS CRYSTALLIZED FROM 52% MPD (PH 4.5)
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.245 |
| 1SWG CIRCULAR PERMUTED STREPTAVIDIN E51/A46 IN COMPLEX WITH BIOTIN 提交 1997-07-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
75–178（104 aa）
链 D
75–178（104 aa）
|
突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; 突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; | BTN BIOTIN × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；PROTEIN (12MG/ML, 10MM BIOTIN) WAS CRYSTALLIZED FROM 52% MPD (PH 4.5)
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.245 |
| 1SWH CORE-STREPTAVIDIN MUTANT W79F AT PH 4.5 提交 1998-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
突变：W79F 突变：W79F 突变：W79F 突变：W79F | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；pH 4.5
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.244 |
| 1SWJ CORE-STREPTAVIDIN MUTANT W79F AT PH 4.5 提交 1998-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
突变：W79F 突变：W79F 突变：W79F 突变：W79F | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；pH 4.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.281 |
| 1SWK CORE-STREPTAVIDIN MUTANT W79F IN COMPLEX WITH BIOTIN AT PH 4.5 提交 1998-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
突变：W79F 突变：W79F 突变：W79F 突变：W79F | BTN BIOTIN × 3 BTQ EPI-BIOTIN × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；pH 4.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.238 |
| 1SWL CORE-STREPTAVIDIN MUTANT W108F AT PH 7.0 提交 1998-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
突变：W108F 突变：W108F 突变：W108F 突变：W108F | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7；pH 7.0
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.309 |
| 1SWN CORE-STREPTAVIDIN MUTANT W108F IN COMPLEX WITH BIOTIN AT PH 7.0 提交 1998-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
突变：W108F 突变：W108F 突变：W108F 突变：W108F | BTN BIOTIN × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7；pH 7.0
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.268 |
| 1SWO CORE-STREPTAVIDIN MUTANT W120F AT PH 7.5 提交 1998-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
突变：W120F 突变：W120F 突变：W120F 突变：W120F | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.257 |
| 1SWP CORE-STREPTAVIDIN MUTANT W120F IN COMPLEX WITH BIOTIN AT PH 7.5 提交 1998-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
突变：W120F 突变：W120F 突变：W120F 突变：W120F | BTN BIOTIN × 3 BTQ EPI-BIOTIN × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.329 |
| 1SWQ CORE-STREPTAVIDIN MUTANT W120A AT PH 7.5 提交 1998-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
突变：W120A 突变：W120A 突变：W120A 突变：W120A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.259 |
| 1SWR CORE-STREPTAVIDIN MUTANT W120A IN COMPLEX WITH BIOTIN AT PH 7.5 提交 1998-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
突变：W120A 突变：W120A 突变：W120A 突变：W120A | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.264 |
| 1SWT CORE-STREPTAVIDIN MUTANT D128A IN COMPLEX WITH BIOTIN AT PH 4.5 提交 1998-10-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
|
突变：D128A 突变：D128A | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；INCUBATED IN 2.5 M BIOTIN/HOH, COCRYSTALLIZED IN 52% MPD (PH 4.5)
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.308 |
| 1SWU STREPTAVIDIN MUTANT Y43F 提交 1998-10-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
突变：Y43F 突变：Y43F 突变：Y43F 突变：Y43F | MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；pH 4.5
|
分辨率 1.14 Å R-free 0.157 |
| 1VWA STREPTAVIDIN-FSHPQNT 提交 1997-03-03 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 50 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 50 % 0.1 M POTASSIUM ACETATE., pH 4.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.259 |
| 1VWB STREPTAVIDIN-CYCLO-AC-[CHPQFC]-NH2, PH 11.8 提交 1997-03-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 11.8；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 50 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 0.1 M CAPS ADJUSTED TO PH 11.8.
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.239 |
| 1VWC STREPTAVIDIN-CYCLO-AC-[CHPQFC]-NH2, PH 2.0 提交 1997-03-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 2.0.
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.209 |
| 1VWD STREPTAVIDIN-CYCLO-AC-[CHPQFC]-NH2, PH 3.0 提交 1997-03-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 3.0.
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.209 |
| 1VWE STREPTAVIDIN-CYCLO-AC-[CHPQFC]-NH2, PH 3.6 提交 1997-03-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.6；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 3.6.
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.246 |
| 1VWF STREPTAVIDIN COMPLEXED WITH CYCLO-AC-[CHPQGPPC]-NH2 MONOMER, PH 3.67 提交 1997-03-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.67；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 3.67.
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.236 |
| 1VWG STREPTAVIDIN COMPLEXED WITH THE HEAD-TO-TAIL DISULFIDE-BONDED PEPTIDE DIMER OF CYCLO-AC-[CHPQGPPC]-NH2, PH 2.5 提交 1997-03-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.5；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 2.5.
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.237 |
| 1VWH STREPTAVIDIN COMPLEXED WITH THE HEAD-TO-TAIL DISULFIDE-BONDED PEPTIDE DIMER OF CYCLO-AC-[CHPQGPPC]-NH2, PH 3.5 提交 1997-03-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.5；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 3.5.
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.239 |
| 1VWI STREPTAVIDIN-CYCLO-[5-S-VALERAMIDE-HPQGPPC]K-NH2, PH 1.5, I222 COMPLEX 提交 1997-03-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | LEA PENTANOIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 1.5；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 1.5.
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.235 |
| 1VWI STREPTAVIDIN-CYCLO-[5-S-VALERAMIDE-HPQGPPC]K-NH2, PH 1.5, I222 COMPLEX 提交 1997-03-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | LEA PENTANOIC ACID × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 1.5；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 1.5.
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.235 |
| 1VWI STREPTAVIDIN-CYCLO-[5-S-VALERAMIDE-HPQGPPC]K-NH2, PH 1.5, I222 COMPLEX 提交 1997-03-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | LEA PENTANOIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 1.5；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 1.5.
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.235 |
| 1VWJ STREPTAVIDIN-CYCLO-[5-S-VALERAMIDE-HPQGPPC]K-NH2, PH 2.5, I222 COMPLEX 提交 1997-03-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | LEA PENTANOIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.5；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 2.5
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.237 |
| 1VWJ STREPTAVIDIN-CYCLO-[5-S-VALERAMIDE-HPQGPPC]K-NH2, PH 2.5, I222 COMPLEX 提交 1997-03-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | LEA PENTANOIC ACID × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.5；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 2.5
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.237 |
| 1VWK STREPTAVIDIN-CYCLO-[5-S-VALERAMIDE-HPQGPPC]K-NH2 提交 1997-03-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | LEA PENTANOIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 3.0.
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.240 |
| 1VWL STREPTAVIDIN-CYCLO-[5-S-VALERAMIDE-HPQGPPC]K-NH2, PH 3.5, I222 COMPLEX 提交 1997-03-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | LEA PENTANOIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.5；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 3.5.
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.244 |
| 1VWM STREPTAVIDIN-CYCLO-AC-[CHPQFC]-NH2, PH 4.2 提交 1997-03-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.2；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 4.2.
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.243 |
| 1VWN STREPTAVIDIN-CYCLO-AC-[CHPQFC]-NH2, PH 4.8 提交 1997-03-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.8；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 4.8.
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.250 |
| 1VWO STREPTAVIDIN COMPLEXED WITH CYCLO-AC-[CHPQGPPC]-NH2 MONOMER, PH 2.85 提交 1997-03-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.85；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 2.85.
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.228 |
| 1VWP STREPTAVIDIN COMPLEXED WITH CYCLO-AC-[CHPQGPPC]-NH2 MONOMER, PH 2.5 提交 1997-03-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.5；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 2.5.
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.235 |
| 1VWQ STREPTAVIDIN-CYCLO-[5-S-VALERAMIDE-HPQGPPC]K-NH2, PH 2.5, I4122 COMPLEX 提交 1997-03-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
|
未记录 | LEA PENTANOIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.5；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 2.5.
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.223 |
| 1VWR STREPTAVIDIN-CYCLO-[5-S-VALERAMIDE-HPQGPPC]K-NH2, PH 3.5, I4122 COMPLEX 提交 1997-03-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
|
未记录 | LEA PENTANOIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.5；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 3.5.
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.246 |
| 2BC3 T7-tagged full-length streptavidin 提交 2005-10-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；293 K；25% Ammonium Sulfate, 0.1M NaAcetate pH4.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.243 |
| 2F01 Epi-biotin complex with core streptavidin 提交 2005-11-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 BTQ EPI-BIOTIN × 4 GOL GLYCEROL × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；277 K；38% saturated ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.5, 0.2 M sodium chloride, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
|
分辨率 0.85 Å R-free 0.174 |
| 2G5L Streptavidin in complex with Nanotag 提交 2006-02-23 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：residues 13-139
链 B
37–163（127 aa）
片段：residues 13-139
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.15 Å R-free 0.172 |
| 2GH7 Epi-biotin complex with core streptavidin 提交 2006-03-26 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 BTQ EPI-BIOTIN × 4 GOL GLYCEROL × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；Protein solution - 10 mg/mL, 10mM Tris Hl, pH 7.0
Reservoir - 38% saturate ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.5,0.2 M NaCl , VAPOR DIFFUSION
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.152 |
| 2IZA APOSTREPTAVIDIN PH 2.00 I4122 STRUCTURE 提交 1997-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–157（121 aa）
|
未记录 | FMT FORMIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 2.00. COMPLEX PRODUCED BY SOAKING STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN CO-CRYSTAL.
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.220 |
| 2IZB APOSTREPTAVIDIN PH 3.12 I4122 STRUCTURE 提交 1997-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–158（122 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 FMT FORMIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.12；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 3.12. COMPLEX PRODUCED BY SOAKING STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN CO-CRYSTAL.
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.235 |
| 2IZC APOSTREPTAVIDIN PH 2.0 I222 COMPLEX 提交 1997-08-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 2.0.
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.241 |
| 2IZC APOSTREPTAVIDIN PH 2.0 I222 COMPLEX 提交 1997-08-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 8 CL CHLORIDE ION × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 2.0.
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.241 |
| 2IZD APOSTREPTAVIDIN pH 3.0 I222 COMPLEX 提交 1997-08-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 4 IOD IODIDE ION × 2 NH4 AMMONIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 3.0.
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.252 |
| 2IZD APOSTREPTAVIDIN pH 3.0 I222 COMPLEX 提交 1997-08-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 8 IOD IODIDE ION × 4 NH4 AMMONIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 3.0.
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.252 |
| 2IZE APOSTREPTAVIDIN PH 3.08 I222 COMPLEX 提交 1997-08-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 4 FMT FORMIC ACID × 4 NH4 AMMONIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.08；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 50 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 50 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 3.08.
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.252 |
| 2IZE APOSTREPTAVIDIN PH 3.08 I222 COMPLEX 提交 1997-08-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 8 FMT FORMIC ACID × 8 NH4 AMMONIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.08；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 50 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 50 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 3.08.
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.252 |
| 2IZF STREPTAVIDIN-BIOTIN PH 4.0 I222 COMPLEX 提交 1997-08-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 4.0.
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.200 |
| 2IZG STREPTAVIDIN-BIOTIN PH 2.0 I222 COMPLEX 提交 1997-08-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 2.0.
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.235 |
| 2IZH STREPTAVIDIN-BIOTIN PH 10.44 I222 COMPLEX 提交 1997-08-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 10.44；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 50.0 MM CAPS ADJUSTED TO PH 10.44.
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.227 |
| 2IZI STREPTAVIDIN-BIOTIN PH 2.53 I4122 STRUCTURE 提交 1997-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–159（123 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.53；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 2.53. COMPLEX PRODUCED BY SOAKING STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN CO-CRYSTAL.
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.246 |
| 2IZJ STREPTAVIDIN-BIOTIN PH 3.50 I4122 STRUCTURE 提交 1997-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–159（123 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.5；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 3.50. COMPLEX PRODUCED BY SOAKING STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN CO-CRYSTAL.
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.222 |
| 2IZK STREPTAVIDIN-GLYCOLURIL PH 2.58 I4122 COMPLEX 提交 1997-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–159（123 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 4 SO4 SULFATE ION × 4 GLL GLYCOLURIL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.58；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 2.58. COMPLEX PRODUCED BY SOAKING STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN CO-CRYSTAL.
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.202 |
| 2IZL STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN PH 7.3 I222 COMPLEX 提交 1997-08-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | IMI 2-IMINOBIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.3；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1M TRIS ADJUSTED TO PH 7.3
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.211 |
| 2QCB T7-tagged full-length streptavidin complexed with ruthenium ligand 提交 2007-06-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：S112K | KYS N-(4-{[(2-AMINOETHYL)AMINO]SULFONYL}PHENYL)-5-[(3AS,4S,6AR)-2-OXOHEXAHYDRO-1H-THIENO[3,4-D]IMIDAZOL-4-YL]PENTANAMIDE-(1,2,3,4,5,6-ETA)-BENZENE-CHLORO-RUTHENIUM(III) × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；protein, 26 mg/ml in water.
4-5x molar excess of ligand.
reservoir, 1.0 M sodium citrate, 0.1 M cacodylate buffer, pH 6.5 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.187 |
| 2RTA APOSTREPTAVIDIN, PH 2.97, SPACE GROUP I4122 提交 1997-09-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
25–159（135 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.97；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 2.97.
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.238 |
| 2RTB APOSTREPTAVIDIN, PH 3.32, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.32；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 3.32.
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.258 |
| 2RTC APOSTREPTAVIDIN, PH 3.60, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 10 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.6；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 3.60.
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.265 |
| 2RTD STREPTAVIDIN-BIOTIN COMPLEX, PH 1.39, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 1.39；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 1.39.
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.236 |
| 2RTE STREPTAVIDIN-BIOTIN COMPLEX, PH 1.90, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 1.9；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 1.90.
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.220 |
| 2RTF STREPTAVIDIN-BIOTIN COMPLEX, PH 2.00, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2；ROOM TEMPERATURE, PH 2.0. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M SODIUM FORMATE, 0.99 MM BIOTIN, 170 MM 2-IMINOBIOTIN, ADJUSTED TO PH 2.00.
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.230 |
| 2RTG STREPTAVIDIN-BIOTIN COMPLEX, PH 2.40, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 BTN BIOTIN × 4 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.4；ROOM TEMPERATURE, PH 2.0. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR, 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M SODIUM FORMATE, 0.2 MM BIOTIN, 25 MM 2-IMINOBIOTIN, ADJUSTED TO PH 2.40.
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.223 |
| 2RTH STREPTAVIDIN-GLYCOLURIL COMPLEX, PH 2.50, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 4 GLL GLYCOLURIL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.5；ROOM TEMPERATURE, PH 2.50. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR, 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M POTASSIUM ACETATE, ADJUSTED TO PH 2.50.
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.269 |
| 2RTH STREPTAVIDIN-GLYCOLURIL COMPLEX, PH 2.50, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 8 GLL GLYCOLURIL × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.5；ROOM TEMPERATURE, PH 2.50. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR, 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M POTASSIUM ACETATE, ADJUSTED TO PH 2.50.
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.269 |
| 2RTI STREPTAVIDIN-GLYCOLURIL COMPLEX, PH 2.50, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | GLL GLYCOLURIL × 4 FMT FORMIC ACID × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 1.9；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR, 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 1.90.
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.232 |
| 2RTI STREPTAVIDIN-GLYCOLURIL COMPLEX, PH 2.50, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | GLL GLYCOLURIL × 8 FMT FORMIC ACID × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 1.9；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR, 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 1.90.
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.232 |
| 2RTJ STREPTAVIDIN-GLYCOLURIL COMPLEX, PH 2.50, SPACE GROUP I4122 提交 1997-09-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
25–159（135 aa）
|
未记录 | GLL GLYCOLURIL × 4 FMT FORMIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.5；ROOM TEMPERATURE, PH 2.50. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 2.50.
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.221 |
| 2RTK STREPTAVIDIN-GLYCOLURIL COMPLEX, PH 2.58, SPACE GROUP I4122 PREPARED FROM AN APOSTREPTAVIDIN CRYSTAL 提交 1997-09-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
25–159（135 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 4 SO4 SULFATE ION × 4 GLL GLYCOLURIL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 1.9；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 1.90.
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.276 |
| 2RTL STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN-SULFATE COMPLEX, PH 2.50, SPACE GROUP I4122 提交 1997-09-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
25–159（135 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 IMI 2-IMINOBIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 1.9；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 1.90.
|
分辨率 1.41 Å R-free 0.234 |
| 2RTM STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN-SULFATE COMPLEX, PH 3.50, SPACE GROUP I4122 提交 1997-09-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
25–159（135 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 IMI 2-IMINOBIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.5；ROOM TEMPERATURE, PH 3.50. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 3.50.
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.238 |
| 2RTN STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN COMPLEX, PH 2.0, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | IMI 2-IMINOBIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2；ROOM TEMPERATURE, PH 2.00. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M SODIUM FORMATE, SATURATED IN 2-IMINOBIOTIN, PH ADJUSTED TO PH 2.00.
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.200 |
| 2RTN STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN COMPLEX, PH 2.0, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | IMI 2-IMINOBIOTIN × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2；ROOM TEMPERATURE, PH 2.00. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M SODIUM FORMATE, SATURATED IN 2-IMINOBIOTIN, PH ADJUSTED TO PH 2.00.
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.200 |
| 2RTO STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN COMPLEX, PH 2.6, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | IMI 2-IMINOBIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.6；ROOM TEMPERATURE, PH 2.60. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 50% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 50% 1 M SODIUM FORMATE, 170 MM 2-IMINOBIOTIN, PH ADJUSTED TO 2.6.
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.253 |
| 2RTO STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN COMPLEX, PH 2.6, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | IMI 2-IMINOBIOTIN × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.6；ROOM TEMPERATURE, PH 2.60. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 50% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 50% 1 M SODIUM FORMATE, 170 MM 2-IMINOBIOTIN, PH ADJUSTED TO 2.6.
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.253 |
| 2RTP STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN COMPLEX, PH 3.25, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | IMI 2-IMINOBIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.25；ROOM TEMPERATURE, PH 3.25. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 50% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 50% 1 M POTASSIUM ACETATE, 170 MM 2-IMINOBIOTIN, PH ADJUSTED TO 3.25
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.243 |
| 2RTP STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN COMPLEX, PH 3.25, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | IMI 2-IMINOBIOTIN × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.25；ROOM TEMPERATURE, PH 3.25. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 50% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 50% 1 M POTASSIUM ACETATE, 170 MM 2-IMINOBIOTIN, PH ADJUSTED TO 3.25
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.243 |
| 2RTQ STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN COMPLEX, PH 3.25, SPACE GROUP I222, CRYSTALLIZED FROM 4.3 M AMMONIUM SULFATE 提交 1997-09-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | IMI 2-IMINOBIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.25；ROOM TEMPERATURE, PH 3.25. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1 M POTASSIUM ACETATE, 25 MM 2-IMINOBIOTIN, PH ADJUSTED TO 3.25
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.243 |
| 2RTQ STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN COMPLEX, PH 3.25, SPACE GROUP I222, CRYSTALLIZED FROM 4.3 M AMMONIUM SULFATE 提交 1997-09-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | IMI 2-IMINOBIOTIN × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.25；ROOM TEMPERATURE, PH 3.25. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1 M POTASSIUM ACETATE, 25 MM 2-IMINOBIOTIN, PH ADJUSTED TO 3.25
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.243 |
| 2RTR STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN COMPLEX, PH 4.0, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | IMI 2-IMINOBIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4；ROOM TEMPERATURE, PH 4.00. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 4.0.
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.234 |
| 2RTR STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN COMPLEX, PH 4.0, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | IMI 2-IMINOBIOTIN × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4；ROOM TEMPERATURE, PH 4.00. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 4.0.
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.234 |
| 2WPU Chaperoned ruthenium metallodrugs that recognize telomeric DNA 提交 2009-08-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | KYT (3AS,4S,6AR)-4-(5-((3R,4R)-3,4-DIAMINOPYRROLIDIN-1-YL)-5-OXOPENTYL)TETRAHYDRO-1H-THIENO[3,4-D]IMIDAZOL-2(3H)-ONE-P-CYMENE-CHLORO-RUTHENIUM(III) × 4 SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；PROTEIN, 26 MG/ML IN WATER. RESERVOIR, 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M SODIUM ACETATE BUFFER, PH 4.0 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K. LIGAND SOAKING CONDITIONS: LIGAND, 10 MM K2OSO2(OH)4 IN 3.0 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 SODIUM ACETATE BUFFER, PH 4.0, CRYO, 1.5 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 SODIUM ACETATE BUFFER, PH 4.0
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.198 |
| 2Y3E Traptavidin, apo-form 提交 2010-12-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
|
突变：YES 突变：YES | GOL GLYCEROL × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；12% PEG 8000, 9% ETHYLENE GLYCOL, 0.1 M HEPES PH 7.5
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.178 |
| 2Y3F Traptavidin, biotin bound form 提交 2010-12-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
|
突变：YES | BTN BIOTIN × 4 GOL GLYCEROL × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.5；27% PEG 4000, 0.25M MGCL2, 0.1M TRIS-HCL PH 8.5
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.151 |
| 3MG5 Core-streptavidin mutant F130L in complex with biotin 提交 2010-04-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：CORE STREPTAVIDIN (RESIDUES 13-139)
链 B
37–163（127 aa）
片段：CORE STREPTAVIDIN (RESIDUES 13-139)
链 C
37–163（127 aa）
片段：CORE STREPTAVIDIN (RESIDUES 13-139)
链 D
37–163（127 aa）
片段：CORE STREPTAVIDIN (RESIDUES 13-139)
|
突变：F154L 突变：F154L 突变：F154L 突变：F154L | BTN BIOTIN × 4 GOL GLYCEROL × 11 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES, pH 7.5, 16% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.178 |
| 3PK2 Artificial Transfer Hydrogenases for the Enantioselective Reduction of Cyclic Imines 提交 2010-11-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：S112A | 4IR {N-(4-{[2-(amino-kappaN)ethyl]sulfamoyl-kappaN}phenyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}(chloro)[(1,2,3,4,5-eta)-1,2,3,4,5-pentamethylcyclopentadienyl]iridium(III) × 4 IR3 IRIDIUM (III) ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；3.5 uL precipitation buffer (2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate) mixed with 6.5 uL protein (26 mg/mL) and equilibrated against precipitation buffer, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.204 |
| 3RDM Crystal structure of R7-2 streptavidin complexed with biotin/PEG 提交 2011-04-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
|
突变：T90S, W108V, L110T, F29L, S52G, R53S | 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 BTN BIOTIN × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；0.2 MgCl2, 0.1 Bis-Tris, pH 5.5, 25% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.245 |
| 3RDM Crystal structure of R7-2 streptavidin complexed with biotin/PEG 提交 2011-04-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
|
突变：T90S, W108V, L110T, F29L, S52G, R53S | 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 4 BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；0.2 MgCl2, 0.1 Bis-Tris, pH 5.5, 25% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.245 |
| 3RDO Crystal structure of R7-2 streptavidin complexed with biotin 提交 2011-04-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
|
突变：T90S, W108V, L110T, F29L, S52G, R53S | BTN BIOTIN × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris, pH 7.5, 20% PEG 1500, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.171 |
| 3RDQ Crystal structure of R7-2 streptavidin complexed with desthiobiotin 提交 2011-04-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
|
突变：T90S, W108V, L110T, F29L, S52G, R53S | DTB 6-(5-METHYL-2-OXO-IMIDAZOLIDIN-4-YL)-HEXANOIC ACID × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；0.1 M Na-acetate, pH 5.0, 2 M Na-formate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.190 |
| 3RDS Crystal structure of the refolded R7-2 streptavidin 提交 2011-04-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
|
突变：T90S, W108V, L110T, F29L, S52G, R53S | 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；25% PEG 1500, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.214 |
| 3RDS Crystal structure of the refolded R7-2 streptavidin 提交 2011-04-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
|
突变：T90S, W108V, L110T, F29L, S52G, R53S | 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；25% PEG 1500, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.214 |
| 3RDU Crystal structure of R7-2 streptavidin complexed with PEG 提交 2011-04-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
|
突变：T90S,W108V,L110T,F29L,S52G,R53S | GOL GLYCEROL × 3 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；10% PEG1000, 10% PEG8000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.207 |
| 3RDU Crystal structure of R7-2 streptavidin complexed with PEG 提交 2011-04-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
|
突变：T90S,W108V,L110T,F29L,S52G,R53S | GOL GLYCEROL × 12 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；10% PEG1000, 10% PEG8000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.207 |
| 3RDX Crystal structure of ligand-free R7-2 streptavidin 提交 2011-04-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
链 B
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
|
突变：T90S,W108V,L110T,F29L,S52G,R53S 突变：T90S,W108V,L110T,F29L,S52G,R53S | GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；298 K；0.1 M Na acetate, pH 4.5, 3 M sodium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.278 |
| 3RDX Crystal structure of ligand-free R7-2 streptavidin 提交 2011-04-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
链 B
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
|
突变：T90S,W108V,L110T,F29L,S52G,R53S 突变：T90S,W108V,L110T,F29L,S52G,R53S | GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；298 K；0.1 M Na acetate, pH 4.5, 3 M sodium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.278 |
| 3RE5 Crystal structure of R4-6 streptavidin 提交 2011-04-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
|
突变：T90S,W108V,L110T,F29L,R53S | 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.2 MgCl2, 0.1 HEPES, pH 7.5, 25% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.231 |
| 3RE5 Crystal structure of R4-6 streptavidin 提交 2011-04-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
|
突变：T90S,W108V,L110T,F29L,R53S | 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 4 GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.2 MgCl2, 0.1 HEPES, pH 7.5, 25% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.231 |
| 3RE6 Crystal structure of R4-6 streptavidin 提交 2011-04-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
|
突变：T90S,W108V,L110T,F29L,R53S | GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；18% PEG 8000, 0.1 M Na-cacodylate, pH 6.5, 0.2 M Ca-acetate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.234 |
| 3RE6 Crystal structure of R4-6 streptavidin 提交 2011-04-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
|
突变：T90S,W108V,L110T,F29L,R53S | GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；18% PEG 8000, 0.1 M Na-cacodylate, pH 6.5, 0.2 M Ca-acetate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.234 |
| 3RY1 Wild-type core streptavidin at atomic resolution 提交 2011-05-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
未记录 | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；298 K；52% MPD, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.135 |
| 3RY2 Wild-type core streptavidin-biotin complex at atomic resolution 提交 2011-05-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 GOL GLYCEROL × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；298 K；30% saturated ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, 0.2 M sodium chloride, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 0.95 Å R-free 0.131 |
| 3T6F Biotin complex of Y54F core streptavidin 提交 2011-07-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
|
突变：Y54F 突变：Y54F | BTN BIOTIN × 4 BSO BIOTIN-D-SULFOXIDE × 4 GOL GLYCEROL × 8 SO4 SULFATE ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；60% saturated ammonium sulfate, 5% isopropanol (30% glycerol cryoprotectant), pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.22 Å R-free 0.151 |
| 3T6L Y54F mutant of core streptavidin 提交 2011-07-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
|
突变：Y54F | CL CHLORIDE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；293 K；2.5 M sodium chloride, 0.1 M sodium-potassium phosphate (30% ethylene glycol cryoprotectant), pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.160 |
| 3WYP Crystal structure of wild-type core streptavidin in complex with D-biotin/biotin-D-sulfoxide at 1.3 A resolution 提交 2014-09-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 C
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 D
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
|
未记录 | BTN BIOTIN × 2 GOL GLYCEROL × 10 BSO BIOTIN-D-SULFOXIDE × 2 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.2；293 K；0.2M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate trihydrate, 24% polyethylene glycol 4000, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.179 |
| 3WYQ Crystal structure of the low-immunogenic core streptavidin mutant LISA-314 (Y22S/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N) at 1.0 A resolution 提交 2014-09-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
|
突变：Y22S/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N 突变：Y22S/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N | BTN BIOTIN × 4 GOL GLYCEROL × 20 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.2；293 K；0.2M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate trihydrate, 24% polyethylene glycol 4000, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.163 |
| 3WZN Crystal structure of the core streptavidin mutant V21 (Y22S/N23D/S27D/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N) complexed with biotin at 1.3 A resolution 提交 2014-10-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
|
突变：Y22S/N23D/S27D/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N 突变：Y22S/N23D/S27D/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N | BTN BIOTIN × 4 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；294 K；100 mM sodium acetate trihydrate, 2.0 M ammonium sulfate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.207 |
| 3WZO Crystal structure of the core streptavidin mutant V21 (Y22S/N23D/S27D/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N) complexed with biotin long tail (BTNtail) at 1.5 A resolution 提交 2014-10-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 C
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 D
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
|
突变：Y22S/N23D/S27D/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N 突变：Y22S/N23D/S27D/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N 突变：Y22S/N23D/S27D/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N 突变：Y22S/N23D/S27D/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N | ZOE 6-({5-[(3aS,4S,5S,6aR)-5-oxido-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoyl}amino)hexanoic acid × 4 GOL GLYCEROL × 3 CD CADMIUM ION × 9 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；0.1 M cadmium chloride hydrate, 0.1 M sodium acetate trihydrate, 30%(v/v) PEG400, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.236 |
| 3WZP Crystal structure of the core streptavidin mutant V21 (Y22S/N23D/S27D/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N) complexed with iminobiotin long tail (IMNtail) at 1.2 A resolution 提交 2014-10-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 C
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 D
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
|
突变：Y22S/N23D/S27D/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N 突变：Y22S/N23D/S27D/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N 突变：Y22S/N23D/S27D/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N 突变：Y22S/N23D/S27D/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N | ZOF 6-({5-[(2E,3aS,4S,6aR)-2-iminohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoyl}amino)hexanoic acid × 4 GOL GLYCEROL × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M sodium citrate tribasic dehydrate, 0.1 M HEPES sodium, 35%(w/v) (+/-)-2-methyl-2, 4-pentandiol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.161 |
| 3WZQ Crystal structure of the core streptavidin mutant V212 (Y22S/N23D/S27D/S45N/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N) complexed with iminobiotin long tail (IMNtail) at 1.7 A resolution 提交 2014-10-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 C
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 D
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
|
突变：Y22S/N23D/S27D/S45N/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N 突变：Y22S/N23D/S27D/S45N/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N 突变：Y22S/N23D/S27D/S45N/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N 突变：Y22S/N23D/S27D/S45N/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N | ZOF 6-({5-[(2E,3aS,4S,6aR)-2-iminohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoyl}amino)hexanoic acid × 4 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；60 mM sodium cacodylate trihydrate, 27%(w/v) PEG300, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.244 |
| 3X00 Crystal structure of the core streptavidin mutant V212 (Y22S/N23D/S27D/S45N/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N) complexed with bis iminobiotin long tail (Bis-IMNtail) at 1.3 A resolution 提交 2014-10-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 C
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 D
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
|
突变：Y22S/N23D/S27D/S45N/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N 突变：Y22S/N23D/S27D/S45N/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N 突变：Y22S/N23D/S27D/S45N/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N 突变：Y22S/N23D/S27D/S45N/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N | ZOF 6-({5-[(2E,3aS,4S,6aR)-2-iminohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoyl}amino)hexanoic acid × 4 EDN ETHANE-1,2-DIAMINE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；0.2 M sodium fluoride, 20% PEG3350, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.188 |
| 4BX5 cis-divalent streptavidin 提交 2013-07-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 C
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 D
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
|
突变：YES 突变：YES | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5；2.5 % W/V POLYETHYLENE GLYCOL (PEG) 1000, 12.5 % W/V PEG 3350, 12.5 % V/V MPD, 30 MM OF ETHYLENE GLYCOL MIX (DI-ETHYLENEGLYCOL, TRI-ETHYLENEGLYCOL, TETRA-ETHYLENEGLYCOL, PENTA-ETHYLENEGLYCOL) AND 0.1 M MES/IMIDAZOLE PH 6.5, CORRESPONDING TO CONDITION E4 OF THE MORPHEUS SCREEN
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.187 |
| 4BX6 trans-divalent streptavidin 提交 2013-07-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 C
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 D
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
|
突变：YES 突变：YES | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；65% V/V 2-METHYL-2, 4-PENTANEDIOL (MPD), 0.1 M 2-(N-MORPHOLINO)ETHANESULFONIC ACID (MES) PH 6.0. CRYSTALS WERE OBTAINED BY THE SITTING-DROP VAPOR-DIFFUSION METHOD AT 291 K AND REACHED A MAXIMUM SIZE AFTER 10 DAYS AND WERE HARVESTED SOON AFTER
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.187 |
| 4BX7 trans-divalent streptavidin bound to biotin-4-fluorescein 提交 2013-07-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
|
突变：YES | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 B4F biotin-4-fluorescein × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；277 K；65% V/V MPD, 0.1 M MES PH 4.0. CRYSTALS WERE OBTAINED BY THE SITTING-DROP VAPOR-DIFFUSION METHOD AT 277 K, REACHED A MAXIMUM SIZE AFTER 14 DAYS AND WERE HARVESTED SOON AFTER
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.237 |
| 4CPE Wild-type streptavidin in complex with love-hate ligand 1 (LH1) 提交 2014-02-06 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
|
未记录 | LUV (3aS,4S,6aR)-2-oxo-hexahydro-1H-thieno[3,4- d]imidazolidin-4-yl]-N-{2-[(2,6- diphenylphenyl)formamido]ethyl}pentanamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；75% SATURATED AMMONIUM SULPHATE, 25% 1M SODIUM ACETATE PH4.5. SITTING DROP
|
分辨率 1.06 Å R-free 0.153 |
| 4CPF Wild-type streptavidin in complex with love-hate ligand 3 (LH3) 提交 2014-02-06 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
|
未记录 | LH3 methyl 4-(2-{5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-hexahydro-1H- thieno[3,4-d]imidazolidin-4-yl]pentanehydrazido}-3- [4-(methoxycarbonyl)phenyl]phenyl)benzoate × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；75% SATURATED AMMONIUM SULPHATE, 25% 1M SODIUM ACETATE PH4.5. SITTING DROP
|
分辨率 1.14 Å R-free 0.165 |
| 4CPH trans-divalent streptavidin with love-hate ligand 4 提交 2014-02-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 C
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 D
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
|
突变：YES 突变：YES | LH4 5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-hexahydro-1H-thieno[3,4- d]imidazolidin-4-yl]-N'-{2,6-bis[4-(morpholine-4- sulfonyl)phenyl]phenyl}pentanehydrazide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；75% AMMONIUM SULPHATE, 25% SODIUM ACETATE PH4.5. SITTING DROP
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.232 |
| 4CPI streptavidin A86D mutant with love-hate ligand 4 提交 2014-02-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 C
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 D
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
|
突变：YES 突变：YES | LH4 5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-hexahydro-1H-thieno[3,4- d]imidazolidin-4-yl]-N'-{2,6-bis[4-(morpholine-4- sulfonyl)phenyl]phenyl}pentanehydrazide × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；CONDITION A9 OF THE MORPHEUS SCREEN: 0.1 M BICINE/TRIZMA BASE PH 8.5, 10% W/V POLYETHYLENE GLYCOL 20,000, 20% V/V POLYETHYLENE GLYCOL MONOMETHYL ETHER 550, 30 MM MAGNESIUM CHLORIDE AND 30 MM CALCIUM CHLORIDE. SITTING DROP.
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.181 |
| 4CPI streptavidin A86D mutant with love-hate ligand 4 提交 2014-02-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
|
突变：YES 突变：YES | LH4 5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-hexahydro-1H-thieno[3,4- d]imidazolidin-4-yl]-N'-{2,6-bis[4-(morpholine-4- sulfonyl)phenyl]phenyl}pentanehydrazide × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；CONDITION A9 OF THE MORPHEUS SCREEN: 0.1 M BICINE/TRIZMA BASE PH 8.5, 10% W/V POLYETHYLENE GLYCOL 20,000, 20% V/V POLYETHYLENE GLYCOL MONOMETHYL ETHER 550, 30 MM MAGNESIUM CHLORIDE AND 30 MM CALCIUM CHLORIDE. SITTING DROP.
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.181 |
| 4CPI streptavidin A86D mutant with love-hate ligand 4 提交 2014-02-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 C
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 D
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
|
突变：YES 突变：YES | LH4 5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-hexahydro-1H-thieno[3,4- d]imidazolidin-4-yl]-N'-{2,6-bis[4-(morpholine-4- sulfonyl)phenyl]phenyl}pentanehydrazide × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；CONDITION A9 OF THE MORPHEUS SCREEN: 0.1 M BICINE/TRIZMA BASE PH 8.5, 10% W/V POLYETHYLENE GLYCOL 20,000, 20% V/V POLYETHYLENE GLYCOL MONOMETHYL ETHER 550, 30 MM MAGNESIUM CHLORIDE AND 30 MM CALCIUM CHLORIDE. SITTING DROP.
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.181 |
| 4DNE Crystal structure of a triple-mutant of streptavidin in complex with desthiobiotin 提交 2012-02-08 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
|
突变：E44V, S45T, V47R 突变：E44V, S45T, V47R | DTB 6-(5-METHYL-2-OXO-IMIDAZOLIDIN-4-YL)-HEXANOIC ACID × 4 SO4 SULFATE ION × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10 mM MgSO4, 50 mM Na caodylate, 2M ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.219 |
| 4EKV Streptavidin 8-aa-loop H127C mutein with reversible biotin binding 提交 2012-04-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
25–183（159 aa）
|
突变：H151C | BTN BIOTIN × 4 CL CHLORIDE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；50% Tacsimate, 10% glycerol, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.225 |
| 4GD9 Circular Permuted Streptavidin N49/G48 提交 2012-07-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
73–163（91 aa）
链 A
37–72（36 aa）
链 B
73–163（91 aa）
链 B
37–72（36 aa）
链 C
73–163（91 aa）
链 C
37–72（36 aa）
链 D
73–163（91 aa）
链 D
37–72（36 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；1.0 M ammonium phosphate, 0.1 M Tris-chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.230 |
| 4GDA Circular Permuted Streptavidin A50/N49 提交 2012-07-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
74–163（90 aa）
链 A
37–73（37 aa）
链 B
74–163（90 aa）
链 B
37–73（37 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 GOL GLYCEROL × 6 SO4 SULFATE ION × 6 EOH ETHANOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；25% saturated ammonium sulfate, 0.1 M Tris-chloride, 0.2 M lithium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.143 |
| 4GJS Streptavidin-K121H 提交 2012-08-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–183（147 aa）
链 B
37–183（147 aa）
|
未记录 | 0OD trichloro{(1,2,3,4,5-eta)-1,2,3,4-tetramethyl-5-[2-({5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoyl}amino)ethyl]cyclopentadienyl}rhodium(1+) × 4 RH Rhodium × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；0.1 M MES, 19 % PEG500, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.250 |
| 4GJV Streptavidin-S112H 提交 2012-08-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–183（147 aa）
|
突变：S112H | 0OD trichloro{(1,2,3,4,5-eta)-1,2,3,4-tetramethyl-5-[2-({5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoyl}amino)ethyl]cyclopentadienyl}rhodium(1+) × 4 CL CHLORIDE ION × 16 RH Rhodium × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；0.1 M MES, 19 % PEG500, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.230 |
| 4IRW Co-crystallization of streptavidin-biotin complex with a lanthanide-ligand complex gives rise to a novel crystal form 提交 2013-01-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
36–163（128 aa）
片段：UNP residues 36-163
|
未记录 | PDC PYRIDINE-2,6-DICARBOXYLIC ACID × 48 BTN BIOTIN × 4 TB TERBIUM(III) ION × 20 NA SODIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；1.5 uL protein (pH 8.0) incubated with saturated biotin solution + 1.5 uL 200 mM Na3[Tb(Dpa)3] + 3 uL 60% v/v MPD, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.154 |
| 4JO6 Streptavidin complex with SBP-Tag 提交 2013-03-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
25–183（159 aa）
片段：UNP residues 25-183
链 B
25–183（159 aa）
片段：UNP residues 25-183
链 C
25–183（159 aa）
片段：UNP residues 25-183
链 D
25–183（159 aa）
片段：UNP residues 25-183
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；56% Tacsimate, 12%(w/v) glycerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.242 |
| 4OKA Structural-, Kinetic- and Docking Studies of Artificial Imine Reductases Based on the Biotin-Streptavidin Technology: An Induced Lock-and-Key Hypothesis 提交 2014-01-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
片段：UNP residues 38-183
|
突变：S112K | 5IR [N-(4-{[2-(amino-kappaN)ethyl]sulfamoyl-kappaN}phenyl)-5-(2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamidato]iridium(III) × 4 IR IRIDIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；ammonium sulfate, sodium acetate, pH 8.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.240 |
| 4Y59 Crystal structure of ALiS1-Streptavidin complex 提交 2015-02-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
链 B
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
链 C
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
链 D
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
|
未记录 | T21 2-[3-(trifluoromethyl)phenyl]furo[3,2-c]pyridin-4(5H)-one × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1M Hepes-NaOH (pH7.0), 50%(v/v) MPD
|
分辨率 1.22 Å R-free 0.155 |
| 4Y5D CRYSTAL STRUCTURE OF ALiS2-STREPTAVIDIN COMPLEX 提交 2015-02-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–160（122 aa）
片段：UNP residues 39-160
链 B
39–160（122 aa）
片段：UNP residues 39-160
链 C
39–160（122 aa）
片段：UNP residues 39-160
链 D
39–160（122 aa）
片段：UNP residues 39-160
|
未记录 | MT6 methyl 3-(4-oxo-4,5-dihydrofuro[3,2-c]pyridin-2-yl)benzoate × 3 PE3 3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39-TRIDECAOXAHENTETRACONTANE-1,41-DIOL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1M Mes-NaOH (pH6.0), 45%(w/v) PEG1000
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.174 |
| 4YVB Structure of D128N streptavidin 提交 2015-03-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
40–159（120 aa）
链 B
40–159（120 aa）
链 C
40–159（120 aa）
链 D
40–159（120 aa）
|
突变：D128N 突变：D128N 突变：D128N 突变：D128N | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.05 M HEPES, pH 7.5 with 7.5% PEG 8000
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.170 |
| 5B5F Crystal structure of ALiS3-Streptavidin complex 提交 2016-05-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
40–159（120 aa）
片段：UNP residues 40-159
链 B
40–159（120 aa）
片段：UNP residues 40-159
链 C
40–159（120 aa）
片段：UNP residues 40-159
链 D
40–159（120 aa）
片段：UNP residues 40-159
|
未记录 | 6F3 N-methyl-3-(4-oxo-4,5-dihydrofuro[3,2-c]pyridin-2-yl)benzenesulfonamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M MES-NaOH (pH6.0), 35%(w/v) PEG 1000, 2.0% agarose hydrogel
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.193 |
| 5B5G Crystal structure of ALiS4-Streptavidin complex 提交 2016-05-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
40–159（120 aa）
片段：UNP residues 40-159
链 B
40–159（120 aa）
片段：UNP residues 40-159
链 C
40–159（120 aa）
片段：UNP residues 40-159
链 D
40–159（120 aa）
片段：UNP residues 40-159
|
未记录 | SO3 SULFITE ION × 7 6FX methyl 5-(4-oxidanylidene-5~{H}-furo[3,2-c]pyridin-2-yl)pyridine-3-carboxylate × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1M Tris-HCl (pH8.0), 30%(w/v) PEG 1000, 2.0% agarose hydrogel
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.193 |
| 5CSE Streptavidin-S112Y-K121E Complexed with Palladium-Containing Biotin Ligand 提交 2015-07-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–158（121 aa）
片段：UNP residues 37-158
链 B
38–158（121 aa）
片段：UNP residues 37-158
|
突变：S112Y-K121E 突变：S112Y-K121E | SVP chloro{di-tert-butyl[2-({5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoyl}amino)ethyl]-lambda~5~-phosphanyl}(1-phenylprop-1-ene-1,3-diyl-kappa~2~C~1~,C~3~)palladium × 4 CL CHLORIDE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；15-25% PEG 1500, 100mM SPG buffer (mixed succinic acid, sodium dihydrogen phosphate and glycine in the ratio 2:7:7; 75% at pH 4 and 25% at pH 10)
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.256 |
| 5CSE Streptavidin-S112Y-K121E Complexed with Palladium-Containing Biotin Ligand 提交 2015-07-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
38–158（121 aa）
片段：UNP residues 37-158
链 B
38–158（121 aa）
片段：UNP residues 37-158
|
突变：S112Y-K121E 突变：S112Y-K121E | SVP chloro{di-tert-butyl[2-({5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoyl}amino)ethyl]-lambda~5~-phosphanyl}(1-phenylprop-1-ene-1,3-diyl-kappa~2~C~1~,C~3~)palladium × 2 CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；15-25% PEG 1500, 100mM SPG buffer (mixed succinic acid, sodium dihydrogen phosphate and glycine in the ratio 2:7:7; 75% at pH 4 and 25% at pH 10)
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.256 |
| 5F2B Expanding Nature's Catalytic Repertoire -Directed Evolution of an Artificial Metalloenzyme for In Vivo Metathesis 提交 2015-12-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：V47A,N49K,T114Q,A119G,K121R | 9RU [1-[4-[[5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]methyl]-2,6-dimethyl-phenyl]-3-(2,4,6-trimethylphenyl)-4,5-dihydroimidazol-1-ium-2-yl]-bis(chloranyl)ruthenium × 4 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；1.5 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.206 |
| 5JD2 SFX structure of corestreptavidin-selenobiotin complex 提交 2016-04-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
40–159（120 aa）
链 B
40–159（120 aa）
链 C
40–159（120 aa）
链 D
40–159（120 aa）
|
未记录 | BYY 5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-selenopheno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH MODE；293 K；24% PEG 1500 and 20% glycerol
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.200 |
| 5K67 Designed Artificial Cupredoxins 提交 2016-05-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | SI4 [CuII(biot-pr-dpea)]2+ × 4 GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；274 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.234 |
| 5K68 Designed Artificial Cupredoxins 提交 2016-05-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | SI9 [CuII(biot-bu-dpea)]2+ × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；274 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.181 |
| 5L3Y Designed Artificial Cupredoxins 提交 2016-05-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | CU6 [CuII(biot-et-dpea)]2+ × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；274 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.244 |
| 5N89 CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTAVIDIN WITH PEPTIDE GNSFDDWLASKG 提交 2017-02-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Potassium chloride
0.1M HEPES pH 7.5
15% PEG6000
|
分辨率 1.27 Å R-free 0.204 |
| 5N89 CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTAVIDIN WITH PEPTIDE GNSFDDWLASKG 提交 2017-02-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 H
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 M
1–183（183 aa）
链 O
1–183（183 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Potassium chloride
0.1M HEPES pH 7.5
15% PEG6000
|
分辨率 1.27 Å R-free 0.204 |
| 5N8B CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTAVIDIN WITH PEPTIDE AFPDYLAEYHGG 提交 2017-02-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 G
1–183（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1M Magnesium chloride
0.1M Sodium citrate pH 5
15% PEG4000
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.155 |
| 5N8E CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTAVIDIN WITH PEPTIDE RDPAPAWAHGGG 提交 2017-02-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；0.2M Ammonium acetate
0.1M Sodium acetate pH 4
15% PEG4000
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.153 |
| 5N8J CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTAVIDIN WITH PEPTIDE D-amino acid containing peptide GyGlanvdessG 提交 2017-02-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
|
未记录 | IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Sodium citrate pH 5.6
20% PEG4000
20% Isopropanol
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.193 |
| 5N8T CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTAVIDIN D-amino acid containing peptide Gdlwqheatwkkq 提交 2017-02-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | DLE D-LEUCINE × 1 DTR D-TRYPTOPHAN × 2 DGN D-GLUTAMINE × 1 DHI D-HISTIDINE × 1 DGL D-GLUTAMIC ACID × 1 DAL D-ALANINE × 1 DTH D-THREONINE × 1 DLY D-LYSINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；0.1M Sodium citrate pH 4.5,
20% PEG4000
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.243 |
| 5N8W CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTAVIDIN with D-amino acid containing peptide GGwhdeatwkpG 提交 2017-02-24 | 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Magnesium acetate
0.1M MOPS pH 7.5
12% PEG8000
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.151 |
| 5N99 CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTAVIDIN with cyclic peptide NQpWQ 提交 2017-02-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 M
1–183（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M Sodium citrate pH 5.5
15% PEG6000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.192 |
| 5N99 CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTAVIDIN with cyclic peptide NQpWQ 提交 2017-02-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 G
1–183（183 aa）
链 I
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 Q
1–183（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M Sodium citrate pH 5.5
15% PEG6000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.192 |
| 5N99 CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTAVIDIN with cyclic peptide NQpWQ 提交 2017-02-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 O
1–183（183 aa）
链 S
1–183（183 aa）
链 U
1–183（183 aa）
链 Y
1–183（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M Sodium citrate pH 5.5
15% PEG6000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.192 |
| 5TO2 Crystal structure of streptavidin with one wild type subunit and three mutated subunits (N23A/S27D/S45A) 提交 2016-10-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–163（125 aa）
链 B
39–163（125 aa）
链 C
39–163（125 aa）
链 D
39–162（124 aa）
|
突变：N23A, S27D, S45A 突变：N23A, S27D, S45A 突变：N23A, S27D, S45A | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Tris pH 8.3, 0.25 M MgCl2, 32% PEG4K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.234 |
| 5VCQ A Hyrdrogen Producing Hybrid Streptavidin-Diiron Catalyst 提交 2017-03-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
|
未记录 | BN7 2-methylpropyl 5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoate × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；100mM TRIS pH 8.5, 200mM MgCl2, 20-30% PEG4000
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.218 |
| 5VKX Coordination Chemistry within a Protein Host: Regulation of the Secondary Coordination Sphere 提交 2017-04-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | S18 [N-(3-{bis[2-(pyridin-2-yl-kappaN)ethyl]amino-kappaN}ethyl)-5-(2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamide](azido)copper × 4 CU COPPER (II) ION × 4 GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；26 mg/mL protein, 2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.0
|
分辨率 1.37 Å R-free 0.187 |
| 5VL5 Coordination Chemistry within a Protein Host: Regulation of the Secondary Coordination Sphere 提交 2017-04-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | S31 [N-(3-{bis[2-(pyridin-2-yl-kappaN)ethyl]amino-kappaN}propyl)-5-(2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamide](azido)(hydroxy)copper × 4 CU COPPER (II) ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.0
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.260 |
| 5VL8 Coordination Chemistry within a Protein Host: Regulation of the Secondary Coordination Sphere 提交 2017-04-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | S32 [N-(3-{bis[2-(pyridin-2-yl-kappaN)ethyl]amino-kappaN}propyl)-5-(2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamide](hydroxy)copper × 4 CU COPPER (II) ION × 4 GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；26 mg/mL protein, 2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.0
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.215 |
| 5WBA Peroxide Activation Regulated by Hydrogen Bonds within Artificial Cu Proteins - WT 提交 2017-06-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
片段：UNP residues 38-183
|
未记录 | SI8 [N-(2-{bis[2-(pyridin-2-yl-kappaN)ethyl]amino-kappaN}ethyl)-5-(2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamide](hydrogen peroxido-kappaO)copper × 4 ACT ACETATE ION × 4 SO4 SULFATE ION × 4 CU COPPER (II) ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；0.1 M sodium acetate, pH 4.0, 2.6 M ammonium sulfate
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.151 |
| 5WBB Peroxide Activation Regulated by Hydrogen Bonds within Artificial Cu Proteins - S112A 提交 2017-06-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
片段：UNP residues 38-183
|
突变：S112A | SQ1 [N-(2-{bis[2-(pyridin-2-yl-kappaN)ethyl]amino-kappaN}ethyl)-5-(2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamide]copper × 4 CU COPPER (II) ION × 4 GOL GLYCEROL × 4 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；0.1 M sodium acetate, 2.6 M sodium sulfate
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.188 |
| 5WBC Designed Artificial Cupredoxins - WT 提交 2017-06-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | CU6 [CuII(biot-et-dpea)]2+ × 4 GOL GLYCEROL × 4 ACT ACETATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；274 K；0.1 M sodium acetate, pH 4, 2.6 M ammonium sulfate
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.168 |
| 5WBD Peroxide Activation Regulated by Hydrogen Bonds within Artificial Cu Proteins - N49A 提交 2017-06-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
片段：UNP residues 38-183
|
突变：N49A | SI7 [N-(2-{bis[2-(pyridin-2-yl-kappaN)ethyl]amino-kappaN}ethyl)-5-(2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamide](hydroxy)copper × 4 ACT ACETATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium sulfate
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.178 |
| 6ANX Peroxide Activation Regulated by Hydrogen Bonds within Artificial Cu Proteins - WT (low exposure) 提交 2017-08-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
片段：UNP residues 38-183
|
未记录 | SI0 [N-(2-{bis[2-(pyridin-2-yl-kappaN)ethyl]amino-kappaN}ethyl)-5-(2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamide](hydrogen peroxido-kappaO)hydroxycopper × 4 ACT ACETATE ION × 4 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；274 K；2.6 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.187 |
| 6AUC Artificial metalloproteins containing a Co4O4 active site - 2xm-Sav 提交 2017-08-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：E101Q, K121A | OLS N-biotin-C-Co4(mu3-O)4(Py)4(H2O)4-beta-alanine × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；2.6 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.0
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.201 |
| 6AUE Artificial Metalloproteins Containing a Co4O4 Active Site - 2xm-S112Y-b 提交 2017-08-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：E101Q, S112Y, K121A | OL3 N-biotin-C-Co4(mu3-O)4(OAc)(Py)4(H2O)3-beta-alanine × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；2.6 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.0
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.229 |
| 6AUH Artificial Metalloproteins Containing a Co4O4 Active Site - 2xm-S112Y-a 提交 2017-09-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：E101Q, S112Y, K121A | OL5 N-biotin-C-Co4(mu3-O)4(OAc)(Py)3(H2O)3-beta-alanine × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；2.6 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.0
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.219 |
| 6AUL Artificial Metalloproteins Containing a Co4O4 Active Site - 2xm-S112Y-b 提交 2017-09-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：E101Q, S112Y, K121A | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；2.6 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.0
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.195 |
| 6AUO Artificial Metalloproteins Containing a Co4O4 Active Site - 2xm-S112F 提交 2017-09-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：E101Q, S112F, K121A | OL4 N-biotin-C-Co4(mu3-O)4(Py)3(H2O)4-beta-alanine × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；2.6 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.0
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.222 |
| 6AVK Streptavidin bound to peptide-like compound KPM-6 提交 2017-09-02 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–159（123 aa）
链 B
37–159（123 aa）
|
未记录 | BZ4 N-[(2H-1,3-benzodioxol-5-yl)methyl]-2-({[(2H-1,3-benzodioxol-5-yl)methyl][2-(chloromethyl)-1,3-oxazole-4-carbonyl]amino}methyl)-N-[(4-carbamoyl-1,3-oxazol-2-yl)methyl]-1,3-oxazole-4-carboxamide × 2 HDO 1-hydroxydodecan-4-one × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；0.2 M potassium iodide, 20% PEG3350
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.186 |
| 6ESS Artificial imine reductase mutant S112A-N118P-K121A-S122M 提交 2017-10-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | 4IR {N-(4-{[2-(amino-kappaN)ethyl]sulfamoyl-kappaN}phenyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}(chloro)[(1,2,3,4,5-eta)-1,2,3,4,5-pentamethylcyclopentadienyl]iridium(III) × 4 IR IRIDIUM ION × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.0
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.327 |
| 6ESU Artificial imine reductase mutant S112A-N118P-K121A-S122M 提交 2017-10-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | 6IR 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-[4-(2-azanylethylsulfamoyl)phenyl]pentanamide × 4 IR IRIDIUM ION × 16 ACT ACETATE ION × 4 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.0
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.211 |
| 6FH8 E. coli surface display of streptavidin for directed evolution of an allylic deallocase 提交 2018-01-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：S112M-K121A | JCT biotinylated ruthenium cyclopentadienide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.0
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.159 |
| 6FRY Photo-Driven Hydrogen Evolution by an Artificial Hydrogenase Utilizing the Biotin-Streptavidin Technology 提交 2018-02-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | 9CO [CoBr(appy)-Biot]Br × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.0
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.202 |
| 6GH7 WILDTYPE CORE-STREPTAVIDIN WITH a conjugated BIOTINYLATED PYRROLIDINE 提交 2018-05-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
未记录 | EYW 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-[(3~{R})-pyrrolidin-3-yl]pentanamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25 mg/mL protein in deionised water is mixed at equal volume with 51% MPD.
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.185 |
| 6GMI Genetic Engineering of an Artificial Metalloenzyme for Transfer Hydrogenation of a Self-Immolative Substrate in E. coli's Periplasm. 提交 2018-05-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–183（145 aa）
|
突变：S112V, E116SPLSEALTKANSPAEAYKASRGAGA, K121A | 4IR {N-(4-{[2-(amino-kappaN)ethyl]sulfamoyl-kappaN}phenyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}(chloro)[(1,2,3,4,5-eta)-1,2,3,4,5-pentamethylcyclopentadienyl]iridium(III) × 4 IR3 IRIDIUM (III) ION × 16 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；0.1 M SPG 9 pH (Buffer)
25 %w/v PEG 1500 (Precipitant)
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.199 |
| 6J6J Biotin-bound streptavidin 提交 2019-01-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
40–158（119 aa）
链 B
40–158（119 aa）
链 C
40–158（119 aa）
链 D
40–158（119 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 6J6K Apo-state streptavidin 提交 2019-01-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
40–158（119 aa）
链 B
40–158（119 aa）
链 C
40–158（119 aa）
链 D
40–158（119 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 6LNG Rapid crystallization of streptavidin using charged peptides 提交 2019-12-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–163（125 aa）
链 B
39–163（125 aa）
链 C
39–163（125 aa）
链 D
39–163（125 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH MODE；298 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.5, 30% w/v polyethylene glycol
monomethyl ether 5000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.219 |
| 6LNG Rapid crystallization of streptavidin using charged peptides 提交 2019-12-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 E
39–163（125 aa）
链 F
39–163（125 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH MODE；298 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.5, 30% w/v polyethylene glycol
monomethyl ether 5000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.219 |
| 6M9B Wild-type streptavidin in complex with biotin solved by native SAD with data collected at 6 keV 提交 2018-08-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；13.25mg SAV WT + 0.610mg biotin in 500uL H2O
in the well: 500uL => 50% MPD
sitting drops: 1uL SAV-biot + 1uL 80% MPD, 100mM MMT pH 5.5
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.183 |
| 6QBB Engineered streptavidin variant (ENAGY) in complex with the Strep-tag II peptide 提交 2018-12-20 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
38–163（126 aa）
链 B
38–163（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；PEG MME 550, zinc sulfate, 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.190 |
| 6QSY Engineered streptavidin variant (H--WY) in complex with the Strep-tag II peptide 提交 2019-02-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
38–163（126 aa）
|
未记录 | PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 12 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；polyethylene glycol 8000, lithium sulfate, tris(hydroxymethyl)aminomethane
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.179 |
| 6QW4 Engineered streptavidin variant (ACGR) in complex with the Strep-tag II peptide 提交 2019-03-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
38–163（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；lithium sulfate, 4-(2-Hydroxyethyl)piperazine-1-ethanesulfonic acid
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.240 |
| 6S4Q scdSav(SASK) - Engineering Single-Chain Dimeric Streptavidin as Host for Artificial Metalloenzymes 提交 2019-06-28 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
39–183（145 aa）
链 B
39–183（145 aa）
|
未记录 | 4IR {N-(4-{[2-(amino-kappaN)ethyl]sulfamoyl-kappaN}phenyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}(chloro)[(1,2,3,4,5-eta)-1,2,3,4,5-pentamethylcyclopentadienyl]iridium(III) × 4 GOL GLYCEROL × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Na-Acetate, pH 4
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.231 |
| 6S50 scdSav(SARK)mv2 - Engineering Single-Chain Dimeric Streptavidin as Host for Artificial Metalloenzymes 提交 2019-06-29 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
39–183（145 aa）
链 B
39–183（145 aa）
|
未记录 | 4IR {N-(4-{[2-(amino-kappaN)ethyl]sulfamoyl-kappaN}phenyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}(chloro)[(1,2,3,4,5-eta)-1,2,3,4,5-pentamethylcyclopentadienyl]iridium(III) × 4 GOL GLYCEROL × 6 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Na-Acetate, pH 4
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.208 |
| 6SOK Engineered streptavidin variant (VTAR) in complex with the Twin-Strep-tag peptide 提交 2019-08-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
38–163（126 aa）
链 B
38–163（126 aa）
链 C
38–163（126 aa）
链 D
38–163（126 aa）
|
未记录 | NH2 AMINO GROUP × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；293 K；ammonium sulfate, sodium citrate-phosphate
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.184 |
| 6SOS Engineered streptavidin variant (ENAGY) in complex with the Twin-Strep-tag peptide 提交 2019-08-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
38–163（126 aa）
链 B
38–163（126 aa）
链 C
38–163（126 aa）
链 D
38–163（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.247 |
| 6T1E Streptavidin variants harbouring an artificial organocatalyst based cofactor 提交 2019-10-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 12 ACT ACETATE ION × 4 HL9 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-(1-pyridin-4-ylpiperidin-4-yl)pentanamide × 4 CL CHLORIDE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；(NH4)2SO4 1.8 M, NaCH3COO 0.1 M, pH 4.6
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.158 |
| 6T1G Streptavidin variants harbouring an artificial organocatalyst based cofactor 提交 2019-10-04 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
|
未记录 | HL9 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-(1-pyridin-4-ylpiperidin-4-yl)pentanamide × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Na-citrate 0.1 M pH 5.5, 40% PEG 600
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.250 |
| 6T1K Streptavidin variants harbouring an artificial organocatalyst based cofactor 提交 2019-10-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | HL9 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-(1-pyridin-4-ylpiperidin-4-yl)pentanamide × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；CHES 0.1 M pH 9.5 30% PEG 3000
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.171 |
| 6T2L Streptavidin variants harbouring an artificial organocatalyst based cofactor 提交 2019-10-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | HL9 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-(1-pyridin-4-ylpiperidin-4-yl)pentanamide × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；273 K；0.17M Na-acetate, 0.085M TRIS-HCl, pH 8.5, 25.5% PEG 4000, 15% glycerol
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.134 |
| 6T2Y Streptavidin variants harbouring an artificial organocatalyst based cofactor 提交 2019-10-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 HL9 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-(1-pyridin-4-ylpiperidin-4-yl)pentanamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M di-Sodium hydrogen phosphate 20% PEG 3350
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.240 |
| 6T2Z Streptavidin variants harbouring an artificial organocatalyst based cofactor 提交 2019-10-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
|
未记录 | HL9 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-(1-pyridin-4-ylpiperidin-4-yl)pentanamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.6M Na2HPO4 0.4M K2HPO4 0.1M Sodium citrate phosphate pH 4.2
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.183 |
| 6T30 Streptavidin variants harbouring an artificial organocatalyst based cofactor 提交 2019-10-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
|
未记录 | HL9 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-(1-pyridin-4-ylpiperidin-4-yl)pentanamide × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M di-Sodium hydrogen phosphate 20% PEG 3350
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.230 |
| 6T31 Streptavidin variants harbouring an artificial organocatalyst based cofactor 提交 2019-10-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
|
未记录 | HL9 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-(1-pyridin-4-ylpiperidin-4-yl)pentanamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；CHES 0.1 M pH 9.5, 30% PEG 3000
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.165 |
| 6T32 Streptavidin variants harbouring an artificial organocatalyst based cofactor 提交 2019-10-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
|
未记录 | HL9 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-(1-pyridin-4-ylpiperidin-4-yl)pentanamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；CHES 0.1 M pH 9.5 30% PEG 3000
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.191 |
| 6TIP Engineered streptavidin variant (YNAFM) in complex with the Strep-tag II peptide 提交 2019-11-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
38–163（126 aa）
|
未记录 | NH2 AMINO GROUP × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.228 |
| 6UC3 Spectroscopic and structural characterization of a genetically encoded direct sensor for protein-ligand interactions 提交 2019-09-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | BTN BIOTIN × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.5；298 K；500 ul of 0.1 M Citric Acid, pH 3.5, 3M NaCl in reservoir with 2 ul of reservoir buffer mixed with 2 ul of 10 mg/ml of protein in the drop. Crystals were soaked to pH 5.5 overnight with 3 exchanges
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.213 |
| 6UD1 Spectroscopic and structural characterization of a genetically encoded direct sensor for protein-ligand interactions 提交 2019-09-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.5；298 K；500 ul of 0.1 M Citric Acid, pH 3.5, 3M NaCl in the reservoir with 2 ul of reservoir buffer mixed with 2 ul of 10 mg/ml of protein in the drop. Crystals were soaked to pH 5.5 overnight with 3 exchanges
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.192 |
| 6UD6 Spectroscopic and structural characterization of a genetically encoded direct sensor for protein-ligand interactions 提交 2019-09-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 7 CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.5；298 K；500 ul of 0.1 M citric acid, pH 3.5, 3M NaCl in the reservoir with 2 ul of reservoir buffer mixed with 2 ul of 10 mg/ml of protein in the drop. Crystals were soaked to pH 5.5 overnight with 3 exchanges
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.190 |
| 6UD6 Spectroscopic and structural characterization of a genetically encoded direct sensor for protein-ligand interactions 提交 2019-09-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 14 CL CHLORIDE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.5；298 K；500 ul of 0.1 M citric acid, pH 3.5, 3M NaCl in the reservoir with 2 ul of reservoir buffer mixed with 2 ul of 10 mg/ml of protein in the drop. Crystals were soaked to pH 5.5 overnight with 3 exchanges
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.190 |
| 6UDB Spectroscopic and structural characterization of a genetically encoded direct sensor for protein-ligand interactions 提交 2019-09-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；500 ul of 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350 in the reservoir with 2 ul of reservoir buffer mixed with 2 ul of 10 mg/ml of protein in the drop
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.201 |
| 6UDC Spectroscopic and structural characterization of a genetically encoded direct sensor for protein-ligand interactions 提交 2019-09-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；500 ul of 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350 in the reservoir with 2 ul of reservoir buffer mixed with 2 ul of 10 mg/ml of protein in the drop
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.256 |
| 6UI0 Artificial Iron Proteins: Modelling the Active Sites in Non-Heme Dioxygenases 提交 2019-09-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：K121A, E101Q, S112E | QFY {N-(2-{bis[(pyridin-2-yl-kappaN)methyl]amino-kappaN}ethyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}iron(3+) × 4 ACT ACETATE ION × 20 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；26 mg/mL protein, 2.0 Ammonium Sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 4
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.179 |
| 6UIU Artificial Iron Proteins: Modelling the Active Sites in Non-Heme Dioxygenases 提交 2019-10-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：K121A, E101Q, S112E | QG7 N-(2-{bis[(pyridin-2-yl)methyl]amino}ethyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；26 mg/mL protein, 2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 4
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.230 |
| 6UIY Artificial Iron Proteins: Modelling the Active Sites in Non-Heme Dioxygenases 提交 2019-10-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：E101Q, S112E, K121A | QG1 {5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-N-(2-{[(pyridin-2-yl)methyl][(pyridin-2-yl-kappaN)methyl]amino-kappaN}ethyl)pentanamide}iron(2+) × 4 ACT ACETATE ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；26 mg/mL protein, 2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.177 |
| 6UIZ Artificial Iron Proteins: Modelling the Active Sites in Non-Heme Dioxygenases 提交 2019-10-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：E101Q, S112E, K121A | QG4 {N-(2-{bis[(pyridin-2-yl-kappaN)methyl]amino-kappaN}ethyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}(triaza-1,2-dien-2-ium-1-ide-kappaN~1~)iron(4+) × 4 ACT ACETATE ION × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；26 mg/mL, 2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 4
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.234 |
| 6US6 Artificial Iron Proteins: Modelling the Active Sites in Non-Heme Dioxygenases 提交 2019-10-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：K121A, E101Q, S112E | QFY {N-(2-{bis[(pyridin-2-yl-kappaN)methyl]amino-kappaN}ethyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}iron(3+) × 4 ACT ACETATE ION × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；26 mg/mL protein, 2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 4
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.182 |
| 6VJK Streptavidin mutant M88 (N49C/A86C) 提交 2020-01-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–160（123 aa）
链 B
38–160（123 aa）
链 E
38–160（123 aa）
链 F
38–160（123 aa）
|
突变：N49C, A86C 突变：N49C, A86C 突变：N49C, A86C 突变：N49C, A86C | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；21% PEG 3350, 8% glycerol, 100 mM Bis-Tris-Cl pH 7.5
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.215 |
| 6VJK Streptavidin mutant M88 (N49C/A86C) 提交 2020-01-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 C
38–160（123 aa）
链 D
38–160（123 aa）
链 I
38–160（123 aa）
链 J
38–160（123 aa）
|
突变：N49C, A86C 突变：N49C, A86C 突变：N49C, A86C 突变：N49C, A86C | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；21% PEG 3350, 8% glycerol, 100 mM Bis-Tris-Cl pH 7.5
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.215 |
| 6VJK Streptavidin mutant M88 (N49C/A86C) 提交 2020-01-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 G
38–160（123 aa）
链 H
38–160（123 aa）
链 K
38–160（123 aa）
链 L
38–160（123 aa）
|
突变：N49C, A86C 突变：N49C, A86C 突变：N49C, A86C 突变：N49C, A86C | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；21% PEG 3350, 8% glycerol, 100 mM Bis-Tris-Cl pH 7.5
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.215 |
| 6VJL Streptavidin mutant M112 (G26C/A46C) 提交 2020-01-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
25–183（159 aa）
|
突变：G26C, A46C | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294.15 K；28% PEG 4000, 0.15 M ammonium sulfate, 50 mM Bis-Tris
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.201 |
| 6VO9 Artificial Metalloproteins with Dinuclear Iron Centers 提交 2020-01-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：K121A, L124Y | KM3 {N-(4-{bis[(pyridin-2-yl-kappaN)methyl]amino-kappaN}butyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}iron(3+) × 4 ACT ACETATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.211 |
| 6VOB Artificial Metalloproteins with Dinuclear Iron Centers 提交 2020-01-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：K121A, L124Y | KM3 {N-(4-{bis[(pyridin-2-yl-kappaN)methyl]amino-kappaN}butyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}iron(3+) × 4 AZI AZIDE ION × 4 ACT ACETATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.197 |
| 6VOZ Artificial Metalloproteins with Dinuclear Iron Centers 提交 2020-02-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：K121A, L124Y | KM3 {N-(4-{bis[(pyridin-2-yl-kappaN)methyl]amino-kappaN}butyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}iron(3+) × 4 ACT ACETATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.206 |
| 6VP1 Artificial Metalloproteins with Dinuclear Iron Centers 提交 2020-02-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
链 C
38–183（146 aa）
链 D
38–183（146 aa）
|
突变：K121A, L124Y 突变：K121A, L124Y 突变：K121A, L124Y 突变：K121A, L124Y | KM3 {N-(4-{bis[(pyridin-2-yl-kappaN)methyl]amino-kappaN}butyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}iron(3+) × 4 ACT ACETATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.197 |
| 6VP2 Artificial Metalloproteins with Dinuclear Iron Centers 提交 2020-02-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
链 C
38–183（146 aa）
链 D
38–183（146 aa）
|
突变：K121A, L124Y 突变：K121A, L124Y 突变：K121A, L124Y 突变：K121A, L124Y | KM3 {N-(4-{bis[(pyridin-2-yl-kappaN)methyl]amino-kappaN}butyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}iron(3+) × 4 AZI AZIDE ION × 2 ACT ACETATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.199 |
| 6VP3 Artificial Metalloproteins with Dinuclear Iron Centers 提交 2020-02-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
链 C
38–183（146 aa）
链 D
38–183（146 aa）
|
突变：K121A, L124Y 突变：K121A, L124Y 突变：K121A, L124Y 突变：K121A, L124Y | KM3 {N-(4-{bis[(pyridin-2-yl-kappaN)methyl]amino-kappaN}butyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}iron(3+) × 4 ACT ACETATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.221 |
| 6Y25 Streptavidin mutant S112R,K121E with a biotC4-1 cofactor - an artificial iron hydroxylase 提交 2020-02-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 AAA
39–183（145 aa）
|
突变：S112R, K121E | O6T biotC4-1 cofactor × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Na-Acetate, pH 4
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.203 |
| 6Y2M Streptavidin mutant S112R with a biotC4-1 cofactor - an artificial iron hydroxylase 提交 2020-02-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 AAA
39–183（145 aa）
|
未记录 | O6T biotC4-1 cofactor × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Na-Acetate, pH 4
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.231 |
| 6Y2T Streptavidin wildtype with a biotC4-1 cofactor - an artificial iron hydroxylase 提交 2020-02-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 AAA
39–183（145 aa）
|
未记录 | O6T biotC4-1 cofactor × 8 GOL GLYCEROL × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Na-Acetate, pH 4
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.200 |
| 6Y33 Streptavidin mutant S112R with a biotC5-1 cofactor - an artificial iron hydroxylase 提交 2020-02-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 AAA
39–183（145 aa）
|
未记录 | O7Q biotC5-1 cofactor × 4 GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Na-Acetate, pH 4
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.192 |
| 6Y34 Streptavidin wildtype with a biotC5-1 cofactor - an artificial iron hydroxylase 提交 2020-02-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 AAA
39–183（145 aa）
|
未记录 | O7Q biotC5-1 cofactor × 4 GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Na-Acetate, pH 4
|
分辨率 1.31 Å R-free 0.198 |
| 6Y3Q Streptavidin mutant S112R_K121E with a biotC5-1 cofactor - an artificial iron hydroxylase 提交 2020-02-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 AAA
39–183（145 aa）
|
未记录 | O7Q biotC5-1 cofactor × 4 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Na-Acetate, pH 4
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.258 |
| 7ALX Sav-SOD: Chimeric Streptavidin-cSOD as Host for Artificial Metalloenzymes 提交 2020-10-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 AAA
39–72（34 aa）
链 AAA
73–183（111 aa）
链 BBB
39–72（34 aa）
链 BBB
73–183（111 aa）
|
未记录 | UFW ((4S)-1,3-dimesityl-4-((5-((3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamido)methyl)imidazolidin-2-yl)gold × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20 %w/v PEG 3350 (Precipitant)
0.2 M Na K Phos (Salt)
0.1 M BIS-TRIS prop 7.5 pH (Buffer)
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.218 |
| 7B74 Chimeric Streptavidin With A Dimerization Domain For Artificial Transfer Hydrogenation 提交 2020-12-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 AAA
39–72（34 aa）
链 AAA
73–183（111 aa）
链 BBB
39–72（34 aa）
链 BBB
73–183（111 aa）
链 CCC
39–72（34 aa）
链 CCC
73–183（111 aa）
链 DDD
39–72（34 aa）
链 DDD
73–183（111 aa）
|
未记录 | 4IR {N-(4-{[2-(amino-kappaN)ethyl]sulfamoyl-kappaN}phenyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}(chloro)[(1,2,3,4,5-eta)-1,2,3,4,5-pentamethylcyclopentadienyl]iridium(III) × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20 %w/v PEG 3350 (Polymer)
0.2 M KF (Salt)
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.218 |
| 7DY0 1.93 A cryo-EM structure of streptavidin 提交 2021-01-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.93 Å |
| 7DY0 1.93 A cryo-EM structure of streptavidin 提交 2021-01-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.93 Å |
| 7DY0 1.93 A cryo-EM structure of streptavidin 提交 2021-01-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.93 Å |
| 7EFC 1.70 A cryo-EM structure of streptavidin 提交 2021-03-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.70 Å |
| 7EFC 1.70 A cryo-EM structure of streptavidin 提交 2021-03-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.70 Å |
| 7EFC 1.70 A cryo-EM structure of streptavidin 提交 2021-03-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.70 Å |
| 7EFD 1.77 A cryo-EM structure of Streptavidin using first 40 frames (corresponding to about 40 e/A^2 total dose) 提交 2021-03-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.77 Å |
| 7EFD 1.77 A cryo-EM structure of Streptavidin using first 40 frames (corresponding to about 40 e/A^2 total dose) 提交 2021-03-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.77 Å |
| 7EFD 1.77 A cryo-EM structure of Streptavidin using first 40 frames (corresponding to about 40 e/A^2 total dose) 提交 2021-03-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.77 Å |
| 7EK8 Crystal structure of apo streptavidin at ambient temperature 提交 2021-04-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–160（123 aa）
链 B
38–160（123 aa）
链 C
38–160（123 aa）
链 D
38–160（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；Pact PremierTM 100 mM MMT buffer pH 6.0 and 25 % w/v PEG 1500
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.224 |
| 7EK9 Crystal structure of apo streptavidin at cryogenic temperature 提交 2021-04-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–160（123 aa）
链 B
38–160（123 aa）
链 C
38–160（123 aa）
链 D
38–160（123 aa）
|
未记录 | MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 3 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 6；294 K；Pact PremierTM 100 mM MMT buffer, PEG 1500
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.187 |
| 7KBY Artificial Metalloproteins with Dinuclear Iron Centers 提交 2020-10-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：K121A, L124Y | KM3 {N-(4-{bis[(pyridin-2-yl-kappaN)methyl]amino-kappaN}butyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}iron(3+) × 4 CYN CYANIDE ION × 4 ACT ACETATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；26 mg/mL
2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 4
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.224 |
| 7KBZ Artificial Metalloproteins with Dinuclear Iron Centers 提交 2020-10-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
链 C
38–183（146 aa）
链 D
38–183（146 aa）
|
突变：K121A, L124Y 突变：K121A, L124Y 突变：K121A, L124Y 突变：K121A, L124Y | KM3 {N-(4-{bis[(pyridin-2-yl-kappaN)methyl]amino-kappaN}butyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}iron(3+) × 4 CYN CYANIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；26 mg/mL
2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 4
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.245 |
| 7KNL Artificial Metalloproteins with Dinuclear Iron Centers 提交 2020-11-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：K121A, L124Y | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；2.0 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Sodium Acetate pH 4
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.241 |
| 7NLV WILDTYPE CORE-STREPTAVIDIN WITH a conjugated BIOTINYLATED PYRROLIDINE II 提交 2021-02-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 AAA
37–163（127 aa）
链 BBB
37–163（127 aa）
链 CCC
37–163（127 aa）
链 DDD
37–163（127 aa）
|
未记录 | UJE 5-((3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)-N-((S)-pyrrolidin-3-yl)pentanamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25 mg/mL protein in deionised water is mixed at equal volume with 52% MPD.
|
分辨率 1.29 Å R-free 0.247 |
| 7ZOF Streptavidin Iron-Porphyrin 提交 2022-04-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
链 C
38–183（146 aa）
链 D
38–183（146 aa）
|
未记录 | JLL (2R)-2-[5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxidanylidene-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]-3-[[(5Z,10Z,14Z,19Z)-15-[[[(2R)-2-[5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxidanylidene-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]-3-sulfo-propanoyl]amino]methyl]-1,4,21,23-tetrahydroporphyrin-5-yl]methylamino]-3-oxidanylidene-propane-1-sulfonic acid × 2 IMD IMIDAZOLE × 4 FE FE (III) ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M MIB 7 pH (Buffer)
22.5 %v/v PEG 1500 (Precipitant)
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.203 |
| 7ZX9 Streptavidin with a fluorescent substrate 提交 2022-05-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–183（145 aa）
|
未记录 | K9D 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-[2-[6-(3,4-dihydro-1~{H}-isoquinolin-2-yl)-1,3-bis(oxidanylidene)benzo[de]isoquinolin-2-yl]ethyl]pentanamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate
26 mg/ml protein
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.199 |
| 7ZXZ dithiol-ligand bound to streptavidin 提交 2022-05-23 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–183（145 aa）
链 B
39–183（145 aa）
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 K9R 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-[(1~{R},3~{S})-3-[3,5-bis(sulfanylmethyl)phenyl]-2,4-bis(oxidanylidene)cyclopentyl]pentanamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M MIB, 25 % w/v PEG 1500
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.204 |
| 8AQD Hydrophobic probe bound to Streptavidin - 1 提交 2022-08-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | N9O 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-[2-[6-(dimethylamino)-1,3-bis(oxidanylidene)benzo[de]isoquinolin-2-yl]ethyl]pentanamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；25 w/v% PEG 3350
0.1 M sodium acetate pH 4.0
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.240 |
| 8AQJ Hydrophobic probe bound to Streptavidin - 2 提交 2022-08-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | N9O 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-[2-[6-(dimethylamino)-1,3-bis(oxidanylidene)benzo[de]isoquinolin-2-yl]ethyl]pentanamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；25 % w/v PEG 3350
0.1 M sodium acetate pH 4.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.234 |
| 8AQO Streptavidin with a bisbiothinilated Fe4S4 cluster 提交 2022-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
链 C
38–183（146 aa）
链 D
38–183（146 aa）
|
未记录 | NUI 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-[2-[[20-[2-[5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]ethanoylamino]-2$l^{3},4,12,14$l^{3},16,24,25$l^{3},27$l^{3}-octathia-1$l^{4},3$l^{4},13$l^{4},15$l^{4}-tetraferranonacyclo[11.11.1.1^{1,13}.1^{6,10}.1^{18,22}.0^{2,15}.0^{3,14}.0^{3,25}.0^{15,27}]octacosa-6(28),7,9,18,20,22(26)-hexaen-8-yl]amino]-2-oxidanylidene-ethyl]pentanamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；25 % w/v PEG 1500
0.1 M boric acid pH 8.5
(anaerobic)
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.217 |
| 8AQX streptavidin mutant S112I with an iridium catalyst for CH activation 提交 2022-08-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
链 C
38–183（146 aa）
链 D
38–183（146 aa）
|
未记录 | NOF tert-butyl 7'-[5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxidanylidene-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]-1-chloranyl-2,3,4,5,6-pentamethyl-spiro[1$l^{8}-iridapentacyclo[2.2.0.0^{1,3}.0^{1,5}.0^{2,6}]hexane-1,2'-3-aza-1-azonia-2$l^{8}-iridatricyclo[6.3.1.0^{4,12}]dodeca-1(11),4,6,8(12),9-pentaene]-3'-carboxylate × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M NaCl
0.1 M BIS-TRIS 6.5 pH
25 % w/v PEG 3350
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.211 |
| 8AQY streptavidin mutant S112A with an iridium catalyst for CH activation 提交 2022-08-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
链 C
38–183（146 aa）
链 D
38–183（146 aa）
|
未记录 | NOF tert-butyl 7'-[5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxidanylidene-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]-1-chloranyl-2,3,4,5,6-pentamethyl-spiro[1$l^{8}-iridapentacyclo[2.2.0.0^{1,3}.0^{1,5}.0^{2,6}]hexane-1,2'-3-aza-1-azonia-2$l^{8}-iridatricyclo[6.3.1.0^{4,12}]dodeca-1(11),4,6,8(12),9-pentaene]-3'-carboxylate × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES 7.5 pH
10 % w/v PEG 8K
8 % v/v EG
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.201 |
| 8BY0 streptavidin mutant S112I K121R with an iridium catalyst for CH activation 提交 2022-12-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | NOF tert-butyl 7'-[5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxidanylidene-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]-1-chloranyl-2,3,4,5,6-pentamethyl-spiro[1$l^{8}-iridapentacyclo[2.2.0.0^{1,3}.0^{1,5}.0^{2,6}]hexane-1,2'-3-aza-1-azonia-2$l^{8}-iridatricyclo[6.3.1.0^{4,12}]dodeca-1(11),4,6,8(12),9-pentaene]-3'-carboxylate × 4 SO4 SULFATE ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；2.0 M ammonium sulfate
0.1 M sodium acetate
(soaking under pH 6.0)
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.251 |
| 8BY1 streptavidin with an iridium catalyst for CH activation 提交 2022-12-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–158（120 aa）
|
未记录 | NOF tert-butyl 7'-[5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxidanylidene-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]-1-chloranyl-2,3,4,5,6-pentamethyl-spiro[1$l^{8}-iridapentacyclo[2.2.0.0^{1,3}.0^{1,5}.0^{2,6}]hexane-1,2'-3-aza-1-azonia-2$l^{8}-iridatricyclo[6.3.1.0^{4,12}]dodeca-1(11),4,6,8(12),9-pentaene]-3'-carboxylate × 4 SO4 SULFATE ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；2 M ammonium sulfate
0.1 M sodium acetate
(soaking at pH 6.0)
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.195 |
| 8CRN Streptavidin S112Y Co-TAML artificial metalloenzyme 提交 2023-03-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–183（145 aa）
链 B
39–183（145 aa）
链 C
39–183（145 aa）
链 D
39–183（145 aa）
|
未记录 | VJL Co-linked Tetra-amido macrocyclic ligand × 4 NA SODIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M sodium acetate pH 4.0
2 M ammonium sulfate
soaking with pH change to pH 6.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.208 |
| 8CRP Streptavidin WT Co-TAML artificial metalloenzyme 提交 2023-03-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–183（145 aa）
链 B
39–183（145 aa）
链 C
39–183（145 aa）
链 D
39–183（145 aa）
|
未记录 | VJL Co-linked Tetra-amido macrocyclic ligand × 4 SO4 SULFATE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；2 M ammonium sulfate,
0.1 M sodium acetate pH 4.0
for soaking pH adjustment to pH 6.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.214 |
| 8GOG Structure of streptavidin mutant (S112Y-K121E) complexed with biotin-cyclopentadienyl-rhodium (III)(Cp*-Rh(III)) 提交 2022-08-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–157（119 aa）
链 B
39–157（119 aa）
|
突变：S112Y,K121E 突变：S112Y,K121E | RH3 RHODIUM(III) ION × 8 JSU trichloro((3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-4-[(5~{R})-5-oxidanyl-5-[2-(2,3,4,5-tetramethylcyclopenta-2,4-dien-1-ylidene)ethylamino]pentyl]-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-2-one)rhodium(3+) × 4 GOL GLYCEROL × 18 CL CHLORIDE ION × 8 SO4 SULFATE ION × 10 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.7；291 K；0.2 M sodium sulfate pH 6.7 with 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.294 |
| 8GVK Cryo-EM structure of streptavidin 提交 2022-09-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.20 Å |
| 8HRM Cryo-EM structure of streptavidin 提交 2022-12-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
40–158（119 aa）
链 B
40–158（119 aa）
链 C
40–158（119 aa）
链 D
40–158（119 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.56 Å |
| 8OJW Streptavidin WT artificial metalloenzyme for carboamination 提交 2023-03-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–159（122 aa）
|
未记录 | 0OD trichloro{(1,2,3,4,5-eta)-1,2,3,4-tetramethyl-5-[2-({5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoyl}amino)ethyl]cyclopentadienyl}rhodium(1+) × 4 CL CHLORIDE ION × 4 SO4 SULFATE ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；2.0 M ammonium sulfate
0.1 M sodium acetate
-> soaking experiment by pH adjustment to pH 6.0
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.202 |
| 8OJX Streptavidin S112YK121E artificial metalloenzyme for carboamination 提交 2023-03-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–158（121 aa）
|
未记录 | 0OD trichloro{(1,2,3,4,5-eta)-1,2,3,4-tetramethyl-5-[2-({5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoyl}amino)ethyl]cyclopentadienyl}rhodium(1+) × 4 IR IRIDIUM ION × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；2 M ammonium sulfate
0.1 M sodium acetate pH 4.0
-> for soaking pH adjustment to pH 6.0
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.197 |
| 8P5Y Artificial transfer hydrogenase with a Mn-12 cofactor and Streptavidin S112Y-K121M mutant 提交 2023-05-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–183（145 aa）
链 B
39–183（145 aa）
链 C
39–183（145 aa）
链 D
39–183（145 aa）
|
突变：S112Y-K121M 突变：S112Y-K121M 突变：S112Y-K121M 突变：S112Y-K121M | WZQ 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-[2-(3,4-dihydro-2~{H}-pyrano[2,3-c]pyridin-6-ylmethylamino)ethyl]pentanamide × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 BR BROMIDE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Sodium/potassium phosphate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 15 % v/v PEG, Smear High, 10 % v/v Ethylene glycol
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.265 |
| 8P5Z Artificial transfer hydrogenase with a Mn-5 cofactor and Streptavidin S112Y-K121M mutant 提交 2023-05-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
链 C
38–183（146 aa）
链 D
38–183（146 aa）
|
突变：S112Y-K121M 突变：S112Y-K121M 突变：S112Y-K121M 突变：S112Y-K121M | X08 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-[2-[(5-methylpyridin-2-yl)methylamino]ethyl]pentanamide × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 BR BROMIDE ION × 4 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；291 K；0.15 M Lithium sulfate, 0.05 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Bis-Tris pH = 6.8, 25 % v/v PEG Smear Low
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.218 |
| 8PXG Structure of Streptactin, solved at wavelength 2.75 A 提交 2023-07-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–163（126 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 28 GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；3 M sodium chloride, 0.1 citric acid, pH 3.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.194 |
| 8QEX Streptavidin variant with a cobalt catalyst for CH metal-catalyzed hydrogen-atom-transfer (M-HAT) 提交 2023-09-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–71（33 aa）
链 A
78–183（106 aa）
链 B
39–71（33 aa）
链 B
78–183（106 aa）
|
未记录 | UFU cobalt Streptavidin × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.05 M Citric acid, 19 % w/v PEG 1000, 0.1 M Lithium sulfate, 0.05 M Sodium phosphate dibasic dihydrate
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.254 |
| 8QQ3 Streptavidin with a Ni-cofactor 提交 2023-10-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–183（145 aa）
链 B
39–183（145 aa）
链 C
39–183（145 aa）
链 D
39–183（145 aa）
|
未记录 | WKF 4-[4-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]butylamino]-~{N}1,~{N}1'-di(quinolin-8-yl)cyclohexane-1,1-dicarboxamide × 4 NI NICKEL (II) ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M sodium acetate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 30% w/v PEG 4K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.191 |
| 8TY0 Streptavidin variant S112E-K121H bound to bis-biotinylated Iron-porphyrin 提交 2023-08-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
链 C
38–183（146 aa）
链 D
38–183（146 aa）
|
未记录 | SIK Bis-biotinylated Iron-porphyrin × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 4.5 , 20% PEG 4000
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.191 |
| 8XG4 X-ray crystal structure of streptavidin flash-cooled in 30% glycerol at ambient pressure 提交 2023-12-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
链 D
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
|
未记录 | PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 1 GOL GLYCEROL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG1,000
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.169 |
| 8XG4 X-ray crystal structure of streptavidin flash-cooled in 30% glycerol at ambient pressure 提交 2023-12-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
链 C
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
|
未记录 | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG1,000
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.169 |
| 8XG5 X-ray crystal structure of streptavidin flash-cooled in 30% PEG1000 at ambient pressure 提交 2023-12-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
39–159（121 aa）
片段：Avidin-like
链 D
39–159（121 aa）
片段：Avidin-like
|
未记录 | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG 1000
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.183 |
| 8XG5 X-ray crystal structure of streptavidin flash-cooled in 30% PEG1000 at ambient pressure 提交 2023-12-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
39–159（121 aa）
片段：Avidin-like
链 C
39–159（121 aa）
片段：Avidin-like
|
未记录 | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG 1000
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.183 |
| 8XG6 X-ray crystal structure of Streptavidine without cryo-protectant using a high-pressure cryocooling method 提交 2023-12-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
39–159（121 aa）
片段：Avidin-like
链 D
39–159（121 aa）
片段：Avidin-like
|
未记录 | PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG 1000
|
分辨率 1.31 Å R-free 0.182 |
| 8XG6 X-ray crystal structure of Streptavidine without cryo-protectant using a high-pressure cryocooling method 提交 2023-12-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
39–159（121 aa）
片段：Avidin-like
链 C
39–159（121 aa）
片段：Avidin-like
|
未记录 | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG 1000
|
分辨率 1.31 Å R-free 0.182 |
| 8Y23 X-ray crystal structure of ALiS4-Streptavidine complex without cryo-protectant using a high-pressure cryocooling method 提交 2024-01-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–159（121 aa）
链 B
39–159（121 aa）
链 C
39–159（121 aa）
链 D
39–159（121 aa）
|
未记录 | 6FX methyl 5-(4-oxidanylidene-5~{H}-furo[3,2-c]pyridin-2-yl)pyridine-3-carboxylate × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG 1000
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.193 |
| 8Y24 X-ray crystal structure of ALiS4-Streptavidine complex with 10% glycerol using a high-pressure cryocooling method 提交 2024-01-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–159（121 aa）
链 B
39–159（121 aa）
链 C
39–159（121 aa）
链 D
39–159（121 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 GOL GLYCEROL × 5 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG 1000
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.184 |
| 8Y25 X-ray crystal structure of ALiS4-Streptavidine complex with 20% glycerol using a high-pressure cryocooling method 提交 2024-01-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–159（121 aa）
链 B
39–159（121 aa）
链 C
39–159（121 aa）
链 D
39–159（121 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 6 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG 1000
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.188 |
| 8Y26 X-ray crystal structure of ALiS5-Streptavidine complex without cryo-protectant using a high-pressure cryocooling method 提交 2024-01-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
链 B
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
链 C
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
链 D
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 A1LXQ dimethyl 5-(4-oxidanylidene-5~{H}-furo[3,2-c]pyridin-2-yl)benzene-1,3-dicarboxylate × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG 1000
|
分辨率 1.23 Å R-free 0.176 |
| 8Y27 X-ray crystal structure of ALiS5-Streptavidine complex with 10% glycerol using a high-pressure cryocooling method 提交 2024-01-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
链 B
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
链 C
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
链 D
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 GOL GLYCEROL × 3 A1LXQ dimethyl 5-(4-oxidanylidene-5~{H}-furo[3,2-c]pyridin-2-yl)benzene-1,3-dicarboxylate × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG1,000
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.185 |
| 8Y28 X-ray crystal structure of ALiS5-Streptavidine complex with 20% glycerol using a high-pressure cryocooling method 提交 2024-01-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–159（121 aa）
链 B
39–159（121 aa）
链 C
39–159（121 aa）
链 D
39–159（121 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG 1000
|
分辨率 1.33 Å R-free 0.185 |
| 8Y29 X-ray crystal structure of ALiS2-Streptavidine complex without cryo-protectant using a high-pressure cryocooling method 提交 2024-01-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–159（121 aa）
链 B
39–159（121 aa）
链 C
39–159（121 aa）
链 D
39–159（121 aa）
|
未记录 | MT6 methyl 3-(4-oxo-4,5-dihydrofuro[3,2-c]pyridin-2-yl)benzoate × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG1,000
|
分辨率 1.42 Å R-free 0.192 |
| 8Y2A X-ray crystal structure of ALiS2-Streptavidine complex with 10% glycerol using a high-pressure cryocooling method 提交 2024-01-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–159（121 aa）
链 B
39–159（121 aa）
链 C
39–159（121 aa）
链 D
39–159（121 aa）
|
未记录 | MT6 methyl 3-(4-oxo-4,5-dihydrofuro[3,2-c]pyridin-2-yl)benzoate × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG 1000
|
分辨率 1.34 Å R-free 0.184 |
| 8Y2B X-ray crystal structure of ALiS2-Streptavidine complex with 20% glycerol using a high-pressure cryocooling method 提交 2024-01-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–159（121 aa）
链 B
39–159（121 aa）
链 C
39–159（121 aa）
链 D
39–159（121 aa）
|
未记录 | MT6 methyl 3-(4-oxo-4,5-dihydrofuro[3,2-c]pyridin-2-yl)benzoate × 2 GOL GLYCEROL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG 1000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.179 |
| 8ZR1 Cocrystallization of engineered streptavidin with A9 oligo DNA 提交 2024-06-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–163（125 aa）
链 B
39–163（125 aa）
链 C
39–163（125 aa）
链 D
39–163（125 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 8；298 K；10 mM Tris-HCl
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.281 |
| 8ZR2 Cocrystallization of engineered streptavidin with C9 oligo DNA 提交 2024-06-03 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–163（125 aa）
链 B
39–163（125 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 8；298 K；20 mM Tris-HCl
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.346 |
| 8ZR2 Cocrystallization of engineered streptavidin with C9 oligo DNA 提交 2024-06-03 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 C
39–163（125 aa）
链 D
39–163（125 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 8；298 K；20 mM Tris-HCl
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.346 |
| 9CST Streptavidin-E101Q-K121A bound to Cu(II)-biotin-ethyl-dipicolylamine cofactor 提交 2024-07-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：E101Q, K121A | QG7 N-(2-{bis[(pyridin-2-yl)methyl]amino}ethyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide × 4 CU COPPER (II) ION × 16 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 1.13 Å R-free 0.160 |
| 9CSU Streptavidin-E101Q-S112Y-K121A bound to Cu(II)-biotin-ethyl-dipicolylamine cofactor 提交 2024-07-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：E101Q, S112Y, K121A | ACY ACETIC ACID × 4 QG7 N-(2-{bis[(pyridin-2-yl)methyl]amino}ethyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide × 4 CU COPPER (II) ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.207 |
| 9CSV Streptavidin-E101Q-S112Y-K121A bound to Cu(II)-biotin-ethyl-dipicolylamine cofactor, oxidized by hydrogen peroxide 提交 2024-07-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：E101Q, S112Y, K121A | QG7 N-(2-{bis[(pyridin-2-yl)methyl]amino}ethyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide × 4 CU COPPER (II) ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.234 |
| 9CSW Streptavidin-E101Q-S112A-K121Y bound to Cu(II)-biotin-ethyl-dipicolylamine cofactor 提交 2024-07-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：E101Q, S112A, K121Y | QG7 N-(2-{bis[(pyridin-2-yl)methyl]amino}ethyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide × 4 CU COPPER (II) ION × 8 ACY ACETIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.189 |
| 9E6Z Streptavidin-E101Q-S112F-K121A bound to Cu(II)-biotin-ethyl-dipicolylamine cofactor 提交 2024-10-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：E101Q, S112F, K121A | QG7 N-(2-{bis[(pyridin-2-yl)methyl]amino}ethyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide × 4 ACY ACETIC ACID × 4 CU COPPER (II) ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；296 K；ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.219 |
| 9EC5 Streptavidin-S112C-L124F bound to Cu(II)dpea cofactor, containing S-nitrosocysteine modification 提交 2024-11-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：E14Q, S112C, L124F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1BIA N-(3-{bis[2-(pyridin-2-yl)ethyl]amino}propyl)-5-[(3aR,4R,6aS)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide × 4 CU COPPER (II) ION × 8 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.228 |
| 9EDF Streptavidin-S112C-L124F bound to Cu(II)dpea cofactor 提交 2024-11-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：S112C, L124F | A1BIA N-(3-{bis[2-(pyridin-2-yl)ethyl]amino}propyl)-5-[(3aR,4R,6aS)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide × 4 CU COPPER (II) ION × 12 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.183 |
| 9EDG Streptavidin-WT bound to Cu(II)dpea cofactor 提交 2024-11-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
片段：UNP residues 33-183
|
未记录 | A1BIA N-(3-{bis[2-(pyridin-2-yl)ethyl]amino}propyl)-5-[(3aR,4R,6aS)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide × 4 ACT ACETATE ION × 4 CU COPPER (II) ION × 8 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.197 |
| 9EDH Streptavidin-S112C-T114F bound to Cu(II)dpea cofactor 提交 2024-11-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：S112C, T114F | A1BIA N-(3-{bis[2-(pyridin-2-yl)ethyl]amino}propyl)-5-[(3aR,4R,6aS)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide × 4 CU COPPER (II) ION × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.222 |
| 9EDI Streptavidin-S112C-L124A bound to Cu(II)dpea cofactor 提交 2024-11-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：S112C, L124A | A1BIA N-(3-{bis[2-(pyridin-2-yl)ethyl]amino}propyl)-5-[(3aR,4R,6aS)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide × 4 CU COPPER (II) ION × 12 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.202 |
| 9EDK Streptavidin-S112C-T114V bound to Cu(II)dpea cofactor 提交 2024-11-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：S112C, T114V | A1BIA N-(3-{bis[2-(pyridin-2-yl)ethyl]amino}propyl)-5-[(3aR,4R,6aS)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide × 4 CU COPPER (II) ION × 16 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.190 |
| 9EDU Streptavidin-S112C bound to Cu(II)dpea cofactor 提交 2024-11-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：S112C | A1BIA N-(3-{bis[2-(pyridin-2-yl)ethyl]amino}propyl)-5-[(3aR,4R,6aS)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide × 4 ACT ACETATE ION × 4 CU COPPER (II) ION × 12 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.183 |
| 9FFJ Artificial metalloenzyme with a nickel-based 1,10-phenanthroline cofactor and streptavidin N49M-S112V mutant 提交 2024-05-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–183（145 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 A1ICD N-methyl-N-[(4,4,6,6-tetrahydroxy-4,6-dioxido-1,3,3a,5,6a-tetrahydrothien[3,4-d]imidazol-4-ium-2-yl)methyl]-5-(2,4,4-trihydroxy-2-keto-3,3a,5,6-tetrahydro-1H-thien[3,4-d]imidazol-4-ium-6-yl × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 8 SO4 SULFATE ION × 8 NH4 AMMONIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；11% w/v PEG 8000 0.1M MES 6.0 0.24M Ammonium sulfate
|
分辨率 1.27 Å R-free 0.197 |
| 9FNR Artificial metalloenzyme with a nickel-based 1,10-phenanthroline cofactor and streptavidin S112V mutant 提交 2024-06-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–183（145 aa）
|
未记录 | A1ICD N-methyl-N-[(4,4,6,6-tetrahydroxy-4,6-dioxido-1,3,3a,5,6a-tetrahydrothien[3,4-d]imidazol-4-ium-2-yl)methyl]-5-(2,4,4-trihydroxy-2-keto-3,3a,5,6-tetrahydro-1H-thien[3,4-d]imidazol-4-ium-6-yl × 4 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；1.6M Magnesium sulfate heptahydrate,0.1M HEPES 7.2, 6% v/v Glycerol
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.206 |
| 9FOA Artificial photoenzyme with anthraquinone cofactor and wild type streptavidin 提交 2024-06-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 D
39–183（145 aa）
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未记录 | A1ID2 ~{N}-[4-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]butyl]-9,10-bis(oxidanylidene)anthracene-2-carboxamide × 4 GOL GLYCEROL × 8 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.2M Ammonium sulfate, 20% w/v PEG 3350
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分辨率 1.36 Å R-free 0.182 |
| 9I4R N-terminal Oic streptag II in Sav E44V-S45T-V47R-D67A-K121R variant 提交 2025-01-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
39–183（145 aa）
链 C
39–183（145 aa）
链 D
39–183（145 aa）
链 E
39–183（145 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.2M Ammonium citrate dibasic, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.213 |
| 9MFZ Streptavidin-E101Q-K121A-L124E bound to Fe(III)-biotin-pentyl-dipicolylamine cofactor 提交 2024-12-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–158（121 aa）
链 B
38–158（121 aa）
链 C
38–158（121 aa）
链 D
38–158（121 aa）
|
突变：E101Q, K121A, L124E 突变：E101Q, K121A, L124E 突变：E101Q, K121A, L124E 突变：E101Q, K121A, L124E | A1BLH N-(5-{bis[(pyridin-2-yl)methyl]amino}pentyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide × 4 FE FE (III) ION × 8 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；ammonium sulfate, sodium acetate
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分辨率 1.55 Å R-free 0.189 |
| 9PUA L-Biotin-streptavidin binding 提交 2025-07-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 J
37–163（127 aa）
链 L
37–163（127 aa）
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未记录 | A1CK6 5-[(3aR,4R,6aS)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoic acid × 4 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；294 K；1 micro-liter protein containing 3 mM Biotin in 10 mM Tris-HCl pH 7.0 mixed with 1 micro-liter 38% Ammonium Sulfate, 100 mM Na-Acetate pH 4.5, 200 mM NaCl at 21C (294 K)
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分辨率 0.94 Å R-free 0.147 |
| 9PUB Biotin-streptavidin binding 提交 2025-07-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 J
37–163（127 aa）
链 K
37–163（127 aa）
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未记录 | BTN BIOTIN × 4 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；294 K；1 micro-liter protein containing 3 mM Biotin in 10 mM Tris-HCl pH 7.0 mixed with 1 micro-liter 38% Ammonium Sulfate, 100 mM Na-Acetate pH 4.5, 200 mM NaCl at 21C (294 K)
|
分辨率 0.95 Å R-free 0.145 |
| 9QNE Streptavidin with a thiophenol cofactor as artificial hydrogen atom transferase 提交 2025-03-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–183（145 aa）
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未记录 | A1I7Y 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-(3-sulfanylphenyl)pentanamide × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 24 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M MES pH 5.5, 25 % w/v PEG 4K, 0.15 M (NH4)2SO4
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分辨率 1.84 Å R-free 0.202 |
| 9QNP Streptavidin K121W with a thiophenol cofactor as artificial hydrogen atom transferase 提交 2025-03-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–183（145 aa）
链 B
39–183（145 aa）
链 C
39–183（145 aa）
链 D
39–183（145 aa）
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未记录 | A1I7Y 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-(3-sulfanylphenyl)pentanamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10 % w/v PEG 1K, 10 % w/v PEG 8K
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分辨率 2.30 Å R-free 0.254 |
| 9QNZ Streptavidin 112Y-121W-124F with a thiophenol cofactor as artificial hydrogen atom transferase 提交 2025-03-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–183（145 aa）
链 B
39–183（145 aa）
链 C
39–183（145 aa）
链 D
39–183（145 aa）
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未记录 | A1I7Y 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-(3-sulfanylphenyl)pentanamide × 4 ACT ACETATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.15 M NH4 acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 45 % v/v MPD
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分辨率 1.88 Å R-free 0.201 |
| 9QO7 Streptavidin K121M with a thiophenol cofactor as artificial hydrogen atom transferase 提交 2025-03-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–183（145 aa）
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未记录 | A1I8C ~{N}-[4-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]butyl]-3-sulfanyl-benzamide × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；1 M Na3 citrate, 0.1 M Na cacodylate pH 6.5
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分辨率 2.00 Å R-free 0.278 |
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| UniProt名称 | SAV_STRAV |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–183； UniProt 1–183 作者链 B； PDB构建体 1–183； UniProt 1–183 作者链 E； PDB构建体 1–183； UniProt 1–183 作者链 F； PDB构建体 1–183； UniProt 1–183 作者链 H； PDB构建体 1–183； UniProt 1–183 作者链 K； PDB构建体 1–183； UniProt 1–183 作者链 M； PDB构建体 1–183； UniProt 1–183 作者链 O； PDB构建体 1–183； UniProt 1–183 |
