Streptavidin
Streptomyces avidinii
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白拷贝数一致 | 链 A； UniProt 38–183 | 未记录 | S31 [N-(3-{bis[2-(pyridin-2-yl-kappaN)ethyl]amino-kappaN}propyl)-5-(2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamide](azido)(hydroxy)copper × 4 CU COPPER (II) ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.0 | 分辨率 1.46 Å R-free 0.260 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 5VL5 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1DF8 S45A MUTANT OF STREPTAVIDIN IN COMPLEX WITH BIOTIN 提交 1999-11-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
3–129（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13-139
链 B
3–129（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13-139
|
突变：S45A 突变：S45A | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；294 K；40% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 0.1 M SODIUM ACETATE, pH 4.5, temperature 294.K
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.225 |
| 1DF8 S45A MUTANT OF STREPTAVIDIN IN COMPLEX WITH BIOTIN 提交 1999-11-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
3–129（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13-139
链 B
3–129（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13-139
|
突变：S45A 突变：S45A | BTN BIOTIN × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；294 K；40% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 0.1 M SODIUM ACETATE, pH 4.5, temperature 294.K
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.225 |
| 1HQQ MINIPROTEIN MP-2 (M9A) COMPLEX WITH STREPTAVIDIN 提交 2000-12-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–129（129 aa）
链 B
1–129（129 aa）
链 C
1–129（129 aa）
链 D
1–129（129 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；100 mM potassium acetate, ammonium sulfate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.249 |
| 1HXL MINIPROTEIN MP-2 (V10A) COMPLEX WITH STREPTAVIDIN 提交 2001-01-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–129（129 aa）
链 B
1–129（129 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；298 K；100 MM POTASSIUM ACETATE, AMMONIUM SULFATE, pH 4.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.236 |
| 1HXZ MINIPROTEIN MP-2 COMPLEX WITH STREPTAVIDIN 提交 2001-01-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–129（129 aa）
链 B
1–129（129 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；100mM potassium acetate, 32% AMMONIUM SULFATE , pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.230 |
| 1HY2 MINIPROTEIN MP-1 COMPLEX WITH STREPTAVIDIN 提交 2001-01-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–129（129 aa）
链 B
1–129（129 aa）
链 C
1–129（129 aa）
链 D
1–129（129 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；100mM potassium acetate, ammonium sulfate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.258 |
| 1I9H CORE STREPTAVIDIN-BNA COMPLEX 提交 2001-03-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
25–163（139 aa）
片段：RESIDUES 25-163
链 B
25–163（139 aa）
片段：RESIDUES 25-163
|
未记录 | BNI 5-(2-OXO-HEXAHYDRO-THIENO[3,4-D]IMIDAZOL-6-YL)-PENTANOIC ACID (4-NITRO-PHENYL)-AMIDE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；10% isopropanol, 0.1M NaCitrate, 0.05M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.250 |
| 1KFF An engineered streptavidin with improved affinity for the strep-tag II peptide: apo-SAM1 提交 2001-11-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–163（126 aa）
链 B
38–163（126 aa）
链 C
38–163（126 aa）
链 D
38–163（126 aa）
|
突变：E44V,S45T,V47R 突变：E44V,S45T,V47R 突变：E44V,S45T,V47R 突变：E44V,S45T,V47R | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；293 K；100 mM Na2HPO4, 1.2-M (NH4)2SO4, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.229 |
| 1KL3 an engineered streptavidin with improved affinity for the strep-tag II peptide : SAm1-StrepII 提交 2001-12-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
38–163（126 aa）
链 B
38–163（126 aa）
链 C
38–163（126 aa）
链 D
38–163（126 aa）
|
突变：E44V,S45T,V47R 突变：E44V,S45T,V47R 突变：E44V,S45T,V47R 突变：E44V,S45T,V47R | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；100 mM Na2HPO4, 1.3-M (NH4)2SO4, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.217 |
| 1KL4 AN ENGINEERED STREPTAVIDIN WITH IMPROVED AFFINITY FOR THE STREP-TAG II PEPTIDE : apo-SAM2 提交 2001-12-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–163（126 aa）
链 B
38–163（126 aa）
链 C
38–163（126 aa）
链 D
38–163（126 aa）
|
突变：E44I,S45G,V47R 突变：E44I,S45G,V47R 突变：E44I,S45G,V47R 突变：E44I,S45G,V47R | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；50 mM Na3PO4, 50 mM Na3-citrate, 30% PEG 600, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.228 |
| 1KL5 an engineered streptavidin with improved affinity for the strep-tag II peptide : SAm2-StrepII 提交 2001-12-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
38–163（126 aa）
链 B
38–163（126 aa）
链 C
38–163（126 aa）
链 D
38–163（126 aa）
|
突变：E44I,S45G,V47R 突变：E44I,S45G,V47R 突变：E44I,S45G,V47R 突变：E44I,S45G,V47R | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM Na2HPO4, 1.2-M (NH4)2SO4, pH 7.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.221 |
| 1LCV streptavidin-norbiotin complex 提交 2002-04-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–159（121 aa）
链 B
39–159（121 aa）
|
未记录 | SNR NORBIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；293 K；1.2 M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.233 |
| 1LCV streptavidin-norbiotin complex 提交 2002-04-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
39–159（121 aa）
链 B
39–159（121 aa）
|
未记录 | SNR NORBIOTIN × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；293 K；1.2 M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.233 |
| 1LCW streptavidin-homobiotin complex 提交 2002-04-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–159（121 aa）
链 B
39–159（121 aa）
|
未记录 | SHM HOMOBIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；293 K；ammonium sulfate, sodium acetate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.233 |
| 1LCZ streptavidin-BCAP complex 提交 2002-04-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
25–159（135 aa）
链 B
25–159（135 aa）
|
未记录 | BH7 E-AMINO BIOTINYL CAPROIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；293 K；1.2M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.237 |
| 1LCZ streptavidin-BCAP complex 提交 2002-04-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
25–159（135 aa）
链 B
25–159（135 aa）
|
未记录 | BH7 E-AMINO BIOTINYL CAPROIC ACID × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；293 K；1.2M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.237 |
| 1MEP Crystal Structure of Streptavidin Double Mutant S45A/D128A with Biotin: Cooperative Hydrogen-Bond Interactions in the Streptavidin-Biotin System. 提交 2002-08-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：Core streptavidin (residues 13-139)
链 B
37–163（127 aa）
片段：Core streptavidin (residues 13-139)
链 C
37–163（127 aa）
片段：Core streptavidin (residues 13-139)
链 D
37–163（127 aa）
片段：Core streptavidin (residues 13-139)
|
突变：S45A, D128A 突变：S45A, D128A 突变：S45A, D128A 突变：S45A, D128A | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；294 K；sodium citrate, cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.295 |
| 1MK5 Wildtype Core-Streptavidin with Biotin at 1.4A. 提交 2002-08-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：Core Streptavidin (residues 13-139)
链 B
37–163（127 aa）
片段：Core Streptavidin (residues 13-139)
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；ammonium sulphate, sodium acetate, sodium chloride, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.189 |
| 1MM9 Streptavidin Mutant with Insertion of Fibronectin Hexapeptide, including RGD 提交 2002-09-03 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：Core Streptavidin (residues 13-139)
|
未记录 | MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；MPD, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.195 |
| 1MM9 Streptavidin Mutant with Insertion of Fibronectin Hexapeptide, including RGD 提交 2002-09-03 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：Core Streptavidin (residues 13-139)
|
未记录 | MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；MPD, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.195 |
| 1MM9 Streptavidin Mutant with Insertion of Fibronectin Hexapeptide, including RGD 提交 2002-09-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：Core Streptavidin (residues 13-139)
|
未记录 | MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；MPD, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.195 |
| 1MOY Streptavidin Mutant with Osteopontin Hexapeptide Insertion Including RGD 提交 2002-09-10 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
|
未记录 | MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；MPD, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.185 |
| 1MOY Streptavidin Mutant with Osteopontin Hexapeptide Insertion Including RGD 提交 2002-09-10 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
|
未记录 | MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；MPD, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.185 |
| 1MOY Streptavidin Mutant with Osteopontin Hexapeptide Insertion Including RGD 提交 2002-09-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
|
未记录 | MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；MPD, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.185 |
| 1N43 Streptavidin Mutant N23A with biotin at 1.89A 提交 2002-10-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 B
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 C
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 D
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
|
突变：N23A 突变：N23A 突变：N23A 突变：N23A | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；MPD, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.301 |
| 1N4J STREPTAVIDIN MUTANT N23A AT 2.18A 提交 2002-10-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
|
突变：N23A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；293 K；PEG4000, phosphate buffer, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.253 |
| 1N7Y STREPTAVIDIN MUTANT N23E AT 1.96A 提交 2002-11-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 B
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 C
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 D
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
|
突变：N23E 突变：N23E 突变：N23E 突变：N23E | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；MPD, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.284 |
| 1N9M Streptavidin Mutant S27A with Biotin at 1.6A Resolution 提交 2002-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 B
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 C
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 D
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
|
突变：S27A 突变：S27A 突变：S27A 突变：S27A | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；MPD, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.207 |
| 1N9Y Streptavidin Mutant S27A at 1.5A Resolution 提交 2002-11-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 B
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 C
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 D
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
|
突变：S27A 突变：S27A 突变：S27A 突变：S27A | MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；MPD, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.243 |
| 1NBX Streptavidin Mutant Y43A at 1.70A Resolution 提交 2002-12-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 B
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 C
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 D
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
|
突变：Y43A 突变：Y43A 突变：Y43A 突变：Y43A | MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；MPD, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.273 |
| 1NC9 STREPTAVIDIN MUTANT Y43A WITH IMINOBIOTIN AT 1.8A RESOLUTION 提交 2002-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：core strepavidin, residues 13-139
链 B
37–163（127 aa）
片段：core strepavidin, residues 13-139
链 C
37–163（127 aa）
片段：core strepavidin, residues 13-139
链 D
37–163（127 aa）
片段：core strepavidin, residues 13-139
|
突变：Y43A 突变：Y43A 突变：Y43A 突变：Y43A | IMI 2-IMINOBIOTIN × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；MPD, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.266 |
| 1NDJ Streptavidin Mutant Y43F with Biotin at 1.81A Resolution 提交 2002-12-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 B
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 C
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
链 D
37–163（127 aa）
片段：core streptavidin, residues 13-139
|
突变：Y43F 突变：Y43F 突变：Y43F 突变：Y43F | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；PEG4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.312 |
| 1NQM Structure of Savm-W120K, streptavidin mutant 提交 2003-01-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
24–159（136 aa）
链 B
24–159（136 aa）
链 C
24–159（136 aa）
链 D
24–159（136 aa）
|
突变：W120K 突变：W120K 突变：W120K 突变：W120K | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.45；293 K；25% PEG 6K, 0.3M sodium acetate, 0.1M cac. buffer, pH 6.45, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 20K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.240 |
| 1PTS CRYSTAL STRUCTURE AND LIGAND BINDING STUDIES OF A SCREENED PEPTIDE COMPLEXED WITH STREPTAVIDIN 提交 1992-07-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
37–157（121 aa）
链 B
37–157（121 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å |
| 1PTS CRYSTAL STRUCTURE AND LIGAND BINDING STUDIES OF A SCREENED PEPTIDE COMPLEXED WITH STREPTAVIDIN 提交 1992-07-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
37–157（121 aa）
链 B
37–157（121 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å |
| 1RST COMPLEX BETWEEN STREPTAVIDIN AND THE STREP-TAG PEPTIDE 提交 1995-10-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
38–163（126 aa）
片段：RESIDUES 13 - 139
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.70 Å R-free 0.227 |
| 1RSU COMPLEX BETWEEN STREPTAVIDIN AND THE STREP-TAG II PEPTIDE 提交 1995-10-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
38–163（126 aa）
片段：RESIDUES 13 - 139
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.70 Å R-free 0.213 |
| 1RXH Crystal structure of streptavidin mutant L124R (M1) complexed with biotinyl p-nitroanilide (BNI) 提交 2003-12-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
|
突变：L124R, L324R 突变：L124R, L324R | BNI 5-(2-OXO-HEXAHYDRO-THIENO[3,4-D]IMIDAZOL-6-YL)-PENTANOIC ACID (4-NITRO-PHENYL)-AMIDE × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.90 Å R-free 0.309 |
| 1RXJ Crystal structure of streptavidin mutant (M2) where the L3,4 loop was replace by that of avidin 提交 2003-12-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–159（121 aa）
链 B
39–159（121 aa）
链 C
39–159（121 aa）
链 D
39–159（121 aa）
|
未记录 | BNI 5-(2-OXO-HEXAHYDRO-THIENO[3,4-D]IMIDAZOL-6-YL)-PENTANOIC ACID (4-NITRO-PHENYL)-AMIDE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 4000, 0.1M NaAc, 0.1M NaCac, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.14 Å R-free 0.200 |
| 1RXK crystal structure of streptavidin mutant (M3) a combination of M1+M2 提交 2003-12-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–159（122 aa）
链 B
38–159（122 aa）
|
突变：L124R 突变：L124R | BNI 5-(2-OXO-HEXAHYDRO-THIENO[3,4-D]IMIDAZOL-6-YL)-PENTANOIC ACID (4-NITRO-PHENYL)-AMIDE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.6；293 K；1.5M AS, 0.1M Tris-HCl, pH 8.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.239 |
| 1SLD STREPTAVIDIN, PH 7.5, BOUND TO CYCLIC DISULFIDE-BONDED PEPTIDE LIGAND AC-CHPQFC-NH2 提交 1995-03-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
25–159（135 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.220 |
| 1SLE STREPTAVIDIN, PH 5.0, BOUND TO CYCLIC PEPTIDE AC-CHPQGPPC-NH2 提交 1995-03-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5；pH 5.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.233 |
| 1SLF APOSTREPTAVIDIN, PH 5.6, TWO MOLECULES OF (SO4)2 BOUND AT THE BIOTIN BINDING SITE 提交 1995-03-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.6；pH 5.6
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.202 |
| 1SLG STREPTAVIDIN, PH 5.6, BOUND TO PEPTIDE FCHPQNT 提交 1995-03-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.6；pH 5.6
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.222 |
| 1SRE CRYSTALLOGRAPHIC AND THERMODYNAMIC COMPARISON OF NATURAL AND SYNTHETIC LIGANDS BOUND TO STREPTAVIDIN 提交 1994-02-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–157（121 aa）
链 B
37–157（121 aa）
|
未记录 | HAB 2-((4'-HYDROXYPHENYL)-AZO)BENZOIC ACID × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.78 Å |
| 1SRE CRYSTALLOGRAPHIC AND THERMODYNAMIC COMPARISON OF NATURAL AND SYNTHETIC LIGANDS BOUND TO STREPTAVIDIN 提交 1994-02-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
37–157（121 aa）
链 B
37–157（121 aa）
|
未记录 | HAB 2-((4'-HYDROXYPHENYL)-AZO)BENZOIC ACID × 8 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.78 Å |
| 1SRF STRUCTURE-BASED DESIGN OF SYNTHETIC AZOBENZENE LIGANDS FOR STREPTAVIDIN 提交 1994-02-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–157（121 aa）
链 B
37–157（121 aa）
|
未记录 | MTB 2-((3'-TERTBUTYL-4'-HYDROXYPHENYL)AZO)BENZOIC ACID × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å |
| 1SRG STRUCTURE-BASED DESIGN OF SYNTHETIC AZOBENZENE LIGANDS FOR STREPTAVIDIN 提交 1994-02-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–157（121 aa）
链 B
37–157（121 aa）
|
未记录 | MHB 2-((3'-METHYL-4'-HYDROXYPHENYL)AZO)BENZOIC ACID × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å |
| 1SRG STRUCTURE-BASED DESIGN OF SYNTHETIC AZOBENZENE LIGANDS FOR STREPTAVIDIN 提交 1994-02-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
37–157（121 aa）
链 B
37–157（121 aa）
|
未记录 | MHB 2-((3'-METHYL-4'-HYDROXYPHENYL)AZO)BENZOIC ACID × 8 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å |
| 1SRH STRUCTURE-BASED DESIGN OF SYNTHETIC AZOBENZENE LIGANDS FOR STREPTAVIDIN 提交 1994-02-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–157（121 aa）
链 B
37–157（121 aa）
|
未记录 | MOB 2-((3',5'-DIMETHOXY-4'-HYDROXYPHENYL)AZO)BENZOIC ACID × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å |
| 1SRI STRUCTURE-BASED DESIGN OF SYNTHETIC AZOBENZENE LIGANDS FOR STREPTAVIDIN 提交 1994-02-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–157（121 aa）
链 B
37–157（121 aa）
|
未记录 | DMB 2-((3',5'-DIMETHYL-4'-HYDROXYPHENYL)AZO)BENZOIC ACID × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.65 Å |
| 1SRI STRUCTURE-BASED DESIGN OF SYNTHETIC AZOBENZENE LIGANDS FOR STREPTAVIDIN 提交 1994-02-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
37–157（121 aa）
链 B
37–157（121 aa）
|
未记录 | DMB 2-((3',5'-DIMETHYL-4'-HYDROXYPHENYL)AZO)BENZOIC ACID × 8 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.65 Å |
| 1SRJ STRUCTURE-BASED DESIGN OF SYNTHETIC AZOBENZENE LIGANDS FOR STREPTAVIDIN 提交 1994-02-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–157（121 aa）
链 B
37–157（121 aa）
|
未记录 | NAB 2-((4'-HYDROXYNAPHTHYL)-AZO)BENZOIC ACID × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å |
| 1STP STRUCTURAL ORIGINS OF HIGH-AFFINITY BIOTIN BINDING TO STREPTAVIDIN 提交 1992-03-12 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
25–183（159 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.60 Å |
| 1STR STREPTAVIDIN DIMERIZED BY DISULFIDE-BONDED PEPTIDE AC-CHPQNT-NH2 DIMER 提交 1995-09-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å R-free 0.233 |
| 1STS STREPTAVIDIN DIMERIZED BY DISULFIDE-BONDED PEPTIDE FCHPQNT-NH2 DIMER 提交 1995-09-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.95 Å R-free 0.238 |
| 1SWA APO-CORE-STREPTAVIDIN AT PH 4.5 提交 1997-03-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 B
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 C
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 D
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 47% MPD (PH 4.5)
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.256 |
| 1SWB APO-CORE-STREPTAVIDIN AT PH 7.5 提交 1997-03-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 B
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 C
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 D
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 48% MPD (2-METHYL-PENTANE-2,4-DIOLE, PH 4.5), 5.5H SOAKING IN 0.1M HEPES BUFFER PH 7.5
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.253 |
| 1SWC APO-CORE-STREPTAVIDIN AT PH 4.5 提交 1997-03-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 B
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 C
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 D
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 60% MPD (2-METHYL-PENTANE-2,4-DIOLE, PH 4.5), SOAKING IN 20 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 4.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.232 |
| 1SWD APO-CORE-STREPTAVIDIN IN COMPLEX WITH BIOTIN (TWO UNOCCUPIED BINDING SITES) AT PH 4.5 提交 1997-03-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 B
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 C
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 D
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
|
未记录 | BTN BIOTIN × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；PROTEIN-BIOTIN COMPLEX WAS CO-CRYSTALLIZED FROM 50% MPD (2-METHYL-PENTANE-2,4-DIOLE, PH 4.5) WITH 1.2M EXCESS OF BIOTIN
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.328 |
| 1SWE APO-CORE-STREPTAVIDIN IN COMPLEX WITH BIOTIN AT PH 4.5 提交 1997-03-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 B
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 C
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
链 D
37–163（127 aa）
片段：CORE, RESIDUES 13 - 139
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；PROTEIN-BIOTIN COMPLEX WAS CO-CRYSTALLIZED FROM 50% MPD (2-METHYL-PENTANE-2,4-DIOLE, PH 4.5) WITH 2.5M EXCESS OF BIOTIN
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.266 |
| 1SWF CIRCULAR PERMUTED STREPTAVIDIN E51/A46 提交 1997-04-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
75–163（89 aa）
链 B
75–163（89 aa）
链 C
75–163（89 aa）
链 D
75–163（89 aa）
|
突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; 突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; 突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; 突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 52% MPD (PH 4.5).
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.288 |
| 1SWF CIRCULAR PERMUTED STREPTAVIDIN E51/A46 提交 1997-04-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
75–163（89 aa）
链 B
75–163（89 aa）
链 C
75–163（89 aa）
链 D
75–163（89 aa）
|
突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; 突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; 突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; 突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 52% MPD (PH 4.5).
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.288 |
| 1SWG CIRCULAR PERMUTED STREPTAVIDIN E51/A46 IN COMPLEX WITH BIOTIN 提交 1997-07-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
75–178（104 aa）
链 B
75–178（104 aa）
链 C
75–178（104 aa）
链 D
75–178（104 aa）
|
突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; 突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; 突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; 突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；PROTEIN (12MG/ML, 10MM BIOTIN) WAS CRYSTALLIZED FROM 52% MPD (PH 4.5)
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.245 |
| 1SWG CIRCULAR PERMUTED STREPTAVIDIN E51/A46 IN COMPLEX WITH BIOTIN 提交 1997-07-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
75–178（104 aa）
链 B
75–178（104 aa）
|
突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; 突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; | BTN BIOTIN × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；PROTEIN (12MG/ML, 10MM BIOTIN) WAS CRYSTALLIZED FROM 52% MPD (PH 4.5)
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.245 |
| 1SWG CIRCULAR PERMUTED STREPTAVIDIN E51/A46 IN COMPLEX WITH BIOTIN 提交 1997-07-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
75–178（104 aa）
链 D
75–178（104 aa）
|
突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; 突变：;DELETION OF SURFACE LOOP RESIDUES 45 - 50 FROM THE SEQUENCE. THE OLD N- AND C-TERMINI (S139, A13, RESPECTIVELY) ARE CONNECTED INTRODUCING THE FOUR ADDITIONAL RESIDUES GGGS ; | BTN BIOTIN × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；PROTEIN (12MG/ML, 10MM BIOTIN) WAS CRYSTALLIZED FROM 52% MPD (PH 4.5)
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.245 |
| 1SWH CORE-STREPTAVIDIN MUTANT W79F AT PH 4.5 提交 1998-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
突变：W79F 突变：W79F 突变：W79F 突变：W79F | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；pH 4.5
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.244 |
| 1SWJ CORE-STREPTAVIDIN MUTANT W79F AT PH 4.5 提交 1998-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
突变：W79F 突变：W79F 突变：W79F 突变：W79F | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；pH 4.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.281 |
| 1SWK CORE-STREPTAVIDIN MUTANT W79F IN COMPLEX WITH BIOTIN AT PH 4.5 提交 1998-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
突变：W79F 突变：W79F 突变：W79F 突变：W79F | BTN BIOTIN × 3 BTQ EPI-BIOTIN × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；pH 4.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.238 |
| 1SWL CORE-STREPTAVIDIN MUTANT W108F AT PH 7.0 提交 1998-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
突变：W108F 突变：W108F 突变：W108F 突变：W108F | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7；pH 7.0
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.309 |
| 1SWN CORE-STREPTAVIDIN MUTANT W108F IN COMPLEX WITH BIOTIN AT PH 7.0 提交 1998-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
突变：W108F 突变：W108F 突变：W108F 突变：W108F | BTN BIOTIN × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7；pH 7.0
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.268 |
| 1SWO CORE-STREPTAVIDIN MUTANT W120F AT PH 7.5 提交 1998-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
突变：W120F 突变：W120F 突变：W120F 突变：W120F | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.257 |
| 1SWP CORE-STREPTAVIDIN MUTANT W120F IN COMPLEX WITH BIOTIN AT PH 7.5 提交 1998-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
突变：W120F 突变：W120F 突变：W120F 突变：W120F | BTN BIOTIN × 3 BTQ EPI-BIOTIN × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.329 |
| 1SWQ CORE-STREPTAVIDIN MUTANT W120A AT PH 7.5 提交 1998-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
突变：W120A 突变：W120A 突变：W120A 突变：W120A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.259 |
| 1SWR CORE-STREPTAVIDIN MUTANT W120A IN COMPLEX WITH BIOTIN AT PH 7.5 提交 1998-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
突变：W120A 突变：W120A 突变：W120A 突变：W120A | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.264 |
| 1SWT CORE-STREPTAVIDIN MUTANT D128A IN COMPLEX WITH BIOTIN AT PH 4.5 提交 1998-10-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
|
突变：D128A 突变：D128A | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；INCUBATED IN 2.5 M BIOTIN/HOH, COCRYSTALLIZED IN 52% MPD (PH 4.5)
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.308 |
| 1SWU STREPTAVIDIN MUTANT Y43F 提交 1998-10-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
突变：Y43F 突变：Y43F 突变：Y43F 突变：Y43F | MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；pH 4.5
|
分辨率 1.14 Å R-free 0.157 |
| 1VWA STREPTAVIDIN-FSHPQNT 提交 1997-03-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 50 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 50 % 0.1 M POTASSIUM ACETATE., pH 4.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.259 |
| 1VWB STREPTAVIDIN-CYCLO-AC-[CHPQFC]-NH2, PH 11.8 提交 1997-03-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 11.8；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 50 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 0.1 M CAPS ADJUSTED TO PH 11.8.
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.239 |
| 1VWC STREPTAVIDIN-CYCLO-AC-[CHPQFC]-NH2, PH 2.0 提交 1997-03-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 2.0.
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.209 |
| 1VWD STREPTAVIDIN-CYCLO-AC-[CHPQFC]-NH2, PH 3.0 提交 1997-03-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 3.0.
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.209 |
| 1VWE STREPTAVIDIN-CYCLO-AC-[CHPQFC]-NH2, PH 3.6 提交 1997-03-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.6；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 3.6.
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.246 |
| 1VWF STREPTAVIDIN COMPLEXED WITH CYCLO-AC-[CHPQGPPC]-NH2 MONOMER, PH 3.67 提交 1997-03-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.67；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 3.67.
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.236 |
| 1VWG STREPTAVIDIN COMPLEXED WITH THE HEAD-TO-TAIL DISULFIDE-BONDED PEPTIDE DIMER OF CYCLO-AC-[CHPQGPPC]-NH2, PH 2.5 提交 1997-03-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.5；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 2.5.
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.237 |
| 1VWH STREPTAVIDIN COMPLEXED WITH THE HEAD-TO-TAIL DISULFIDE-BONDED PEPTIDE DIMER OF CYCLO-AC-[CHPQGPPC]-NH2, PH 3.5 提交 1997-03-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.5；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 3.5.
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.239 |
| 1VWI STREPTAVIDIN-CYCLO-[5-S-VALERAMIDE-HPQGPPC]K-NH2, PH 1.5, I222 COMPLEX 提交 1997-03-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | LEA PENTANOIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 1.5；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 1.5.
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.235 |
| 1VWI STREPTAVIDIN-CYCLO-[5-S-VALERAMIDE-HPQGPPC]K-NH2, PH 1.5, I222 COMPLEX 提交 1997-03-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | LEA PENTANOIC ACID × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 1.5；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 1.5.
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.235 |
| 1VWI STREPTAVIDIN-CYCLO-[5-S-VALERAMIDE-HPQGPPC]K-NH2, PH 1.5, I222 COMPLEX 提交 1997-03-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | LEA PENTANOIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 1.5；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 1.5.
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.235 |
| 1VWJ STREPTAVIDIN-CYCLO-[5-S-VALERAMIDE-HPQGPPC]K-NH2, PH 2.5, I222 COMPLEX 提交 1997-03-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | LEA PENTANOIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.5；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 2.5
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.237 |
| 1VWJ STREPTAVIDIN-CYCLO-[5-S-VALERAMIDE-HPQGPPC]K-NH2, PH 2.5, I222 COMPLEX 提交 1997-03-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | LEA PENTANOIC ACID × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.5；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 2.5
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.237 |
| 1VWK STREPTAVIDIN-CYCLO-[5-S-VALERAMIDE-HPQGPPC]K-NH2 提交 1997-03-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | LEA PENTANOIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 3.0.
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.240 |
| 1VWL STREPTAVIDIN-CYCLO-[5-S-VALERAMIDE-HPQGPPC]K-NH2, PH 3.5, I222 COMPLEX 提交 1997-03-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | LEA PENTANOIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.5；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 3.5.
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.244 |
| 1VWM STREPTAVIDIN-CYCLO-AC-[CHPQFC]-NH2, PH 4.2 提交 1997-03-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.2；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 4.2.
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.243 |
| 1VWN STREPTAVIDIN-CYCLO-AC-[CHPQFC]-NH2, PH 4.8 提交 1997-03-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.8；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 4.8.
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.250 |
| 1VWO STREPTAVIDIN COMPLEXED WITH CYCLO-AC-[CHPQGPPC]-NH2 MONOMER, PH 2.85 提交 1997-03-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.85；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 2.85.
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.228 |
| 1VWP STREPTAVIDIN COMPLEXED WITH CYCLO-AC-[CHPQGPPC]-NH2 MONOMER, PH 2.5 提交 1997-03-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.5；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 2.5.
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.235 |
| 1VWQ STREPTAVIDIN-CYCLO-[5-S-VALERAMIDE-HPQGPPC]K-NH2, PH 2.5, I4122 COMPLEX 提交 1997-03-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
|
未记录 | LEA PENTANOIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.5；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 2.5.
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.223 |
| 1VWR STREPTAVIDIN-CYCLO-[5-S-VALERAMIDE-HPQGPPC]K-NH2, PH 3.5, I4122 COMPLEX 提交 1997-03-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
|
未记录 | LEA PENTANOIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.5；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 3.5.
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.246 |
| 2BC3 T7-tagged full-length streptavidin 提交 2005-10-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；293 K；25% Ammonium Sulfate, 0.1M NaAcetate pH4.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.243 |
| 2F01 Epi-biotin complex with core streptavidin 提交 2005-11-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 BTQ EPI-BIOTIN × 4 GOL GLYCEROL × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；277 K；38% saturated ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.5, 0.2 M sodium chloride, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
|
分辨率 0.85 Å R-free 0.174 |
| 2G5L Streptavidin in complex with Nanotag 提交 2006-02-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：residues 13-139
链 B
37–163（127 aa）
片段：residues 13-139
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.15 Å R-free 0.172 |
| 2GH7 Epi-biotin complex with core streptavidin 提交 2006-03-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 BTQ EPI-BIOTIN × 4 GOL GLYCEROL × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；Protein solution - 10 mg/mL, 10mM Tris Hl, pH 7.0
Reservoir - 38% saturate ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.5,0.2 M NaCl , VAPOR DIFFUSION
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.152 |
| 2IZA APOSTREPTAVIDIN PH 2.00 I4122 STRUCTURE 提交 1997-08-13 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–157（121 aa）
|
未记录 | FMT FORMIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 2.00. COMPLEX PRODUCED BY SOAKING STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN CO-CRYSTAL.
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.220 |
| 2IZB APOSTREPTAVIDIN PH 3.12 I4122 STRUCTURE 提交 1997-08-13 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–158（122 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 FMT FORMIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.12；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 3.12. COMPLEX PRODUCED BY SOAKING STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN CO-CRYSTAL.
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.235 |
| 2IZC APOSTREPTAVIDIN PH 2.0 I222 COMPLEX 提交 1997-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 2.0.
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.241 |
| 2IZC APOSTREPTAVIDIN PH 2.0 I222 COMPLEX 提交 1997-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 8 CL CHLORIDE ION × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 2.0.
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.241 |
| 2IZD APOSTREPTAVIDIN pH 3.0 I222 COMPLEX 提交 1997-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 4 IOD IODIDE ION × 2 NH4 AMMONIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 3.0.
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.252 |
| 2IZD APOSTREPTAVIDIN pH 3.0 I222 COMPLEX 提交 1997-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 8 IOD IODIDE ION × 4 NH4 AMMONIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 3.0.
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.252 |
| 2IZE APOSTREPTAVIDIN PH 3.08 I222 COMPLEX 提交 1997-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 4 FMT FORMIC ACID × 4 NH4 AMMONIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.08；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 50 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 50 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 3.08.
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.252 |
| 2IZE APOSTREPTAVIDIN PH 3.08 I222 COMPLEX 提交 1997-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 8 FMT FORMIC ACID × 8 NH4 AMMONIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.08；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 50 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 50 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 3.08.
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.252 |
| 2IZF STREPTAVIDIN-BIOTIN PH 4.0 I222 COMPLEX 提交 1997-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 4.0.
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.200 |
| 2IZG STREPTAVIDIN-BIOTIN PH 2.0 I222 COMPLEX 提交 1997-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 2.0.
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.235 |
| 2IZH STREPTAVIDIN-BIOTIN PH 10.44 I222 COMPLEX 提交 1997-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 10.44；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 50.0 MM CAPS ADJUSTED TO PH 10.44.
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.227 |
| 2IZI STREPTAVIDIN-BIOTIN PH 2.53 I4122 STRUCTURE 提交 1997-08-13 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–159（123 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.53；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M SODIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 2.53. COMPLEX PRODUCED BY SOAKING STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN CO-CRYSTAL.
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.246 |
| 2IZJ STREPTAVIDIN-BIOTIN PH 3.50 I4122 STRUCTURE 提交 1997-08-13 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–159（123 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.5；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25 % 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 3.50. COMPLEX PRODUCED BY SOAKING STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN CO-CRYSTAL.
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.222 |
| 2IZK STREPTAVIDIN-GLYCOLURIL PH 2.58 I4122 COMPLEX 提交 1997-08-13 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–159（123 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 4 SO4 SULFATE ION × 4 GLL GLYCOLURIL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.58；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 2.58. COMPLEX PRODUCED BY SOAKING STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN CO-CRYSTAL.
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.202 |
| 2IZL STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN PH 7.3 I222 COMPLEX 提交 1997-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
37–159（123 aa）
链 D
37–159（123 aa）
|
未记录 | IMI 2-IMINOBIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.3；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR = 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1M TRIS ADJUSTED TO PH 7.3
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.211 |
| 2QCB T7-tagged full-length streptavidin complexed with ruthenium ligand 提交 2007-06-19 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：S112K | KYS N-(4-{[(2-AMINOETHYL)AMINO]SULFONYL}PHENYL)-5-[(3AS,4S,6AR)-2-OXOHEXAHYDRO-1H-THIENO[3,4-D]IMIDAZOL-4-YL]PENTANAMIDE-(1,2,3,4,5,6-ETA)-BENZENE-CHLORO-RUTHENIUM(III) × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；protein, 26 mg/ml in water.
4-5x molar excess of ligand.
reservoir, 1.0 M sodium citrate, 0.1 M cacodylate buffer, pH 6.5 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.187 |
| 2RTA APOSTREPTAVIDIN, PH 2.97, SPACE GROUP I4122 提交 1997-09-11 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
25–159（135 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.97；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 2.97.
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.238 |
| 2RTB APOSTREPTAVIDIN, PH 3.32, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.32；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 3.32.
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.258 |
| 2RTC APOSTREPTAVIDIN, PH 3.60, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 10 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.6；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 3.60.
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.265 |
| 2RTD STREPTAVIDIN-BIOTIN COMPLEX, PH 1.39, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 1.39；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 1.39.
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.236 |
| 2RTE STREPTAVIDIN-BIOTIN COMPLEX, PH 1.90, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 1.9；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 1.90.
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.220 |
| 2RTF STREPTAVIDIN-BIOTIN COMPLEX, PH 2.00, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2；ROOM TEMPERATURE, PH 2.0. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M SODIUM FORMATE, 0.99 MM BIOTIN, 170 MM 2-IMINOBIOTIN, ADJUSTED TO PH 2.00.
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.230 |
| 2RTG STREPTAVIDIN-BIOTIN COMPLEX, PH 2.40, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 BTN BIOTIN × 4 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.4；ROOM TEMPERATURE, PH 2.0. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR, 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M SODIUM FORMATE, 0.2 MM BIOTIN, 25 MM 2-IMINOBIOTIN, ADJUSTED TO PH 2.40.
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.223 |
| 2RTH STREPTAVIDIN-GLYCOLURIL COMPLEX, PH 2.50, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 4 GLL GLYCOLURIL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.5；ROOM TEMPERATURE, PH 2.50. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR, 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M POTASSIUM ACETATE, ADJUSTED TO PH 2.50.
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.269 |
| 2RTH STREPTAVIDIN-GLYCOLURIL COMPLEX, PH 2.50, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 8 GLL GLYCOLURIL × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.5；ROOM TEMPERATURE, PH 2.50. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR, 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M POTASSIUM ACETATE, ADJUSTED TO PH 2.50.
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.269 |
| 2RTI STREPTAVIDIN-GLYCOLURIL COMPLEX, PH 2.50, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | GLL GLYCOLURIL × 4 FMT FORMIC ACID × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 1.9；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR, 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 1.90.
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.232 |
| 2RTI STREPTAVIDIN-GLYCOLURIL COMPLEX, PH 2.50, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | GLL GLYCOLURIL × 8 FMT FORMIC ACID × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 1.9；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR, 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 1.90.
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.232 |
| 2RTJ STREPTAVIDIN-GLYCOLURIL COMPLEX, PH 2.50, SPACE GROUP I4122 提交 1997-09-11 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
25–159（135 aa）
|
未记录 | GLL GLYCOLURIL × 4 FMT FORMIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.5；ROOM TEMPERATURE, PH 2.50. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 2.50.
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.221 |
| 2RTK STREPTAVIDIN-GLYCOLURIL COMPLEX, PH 2.58, SPACE GROUP I4122 PREPARED FROM AN APOSTREPTAVIDIN CRYSTAL 提交 1997-09-11 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
25–159（135 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 4 SO4 SULFATE ION × 4 GLL GLYCOLURIL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 1.9；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 1.90.
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.276 |
| 2RTL STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN-SULFATE COMPLEX, PH 2.50, SPACE GROUP I4122 提交 1997-09-11 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
25–159（135 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 IMI 2-IMINOBIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 1.9；SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M SODIUM FORMATE ADJUSTED TO PH 1.90.
|
分辨率 1.41 Å R-free 0.234 |
| 2RTM STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN-SULFATE COMPLEX, PH 3.50, SPACE GROUP I4122 提交 1997-09-11 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
25–159（135 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 IMI 2-IMINOBIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.5；ROOM TEMPERATURE, PH 3.50. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 3.50.
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.238 |
| 2RTN STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN COMPLEX, PH 2.0, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | IMI 2-IMINOBIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2；ROOM TEMPERATURE, PH 2.00. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M SODIUM FORMATE, SATURATED IN 2-IMINOBIOTIN, PH ADJUSTED TO PH 2.00.
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.200 |
| 2RTN STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN COMPLEX, PH 2.0, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | IMI 2-IMINOBIOTIN × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2；ROOM TEMPERATURE, PH 2.00. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M SODIUM FORMATE, SATURATED IN 2-IMINOBIOTIN, PH ADJUSTED TO PH 2.00.
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.200 |
| 2RTO STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN COMPLEX, PH 2.6, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | IMI 2-IMINOBIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.6；ROOM TEMPERATURE, PH 2.60. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 50% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 50% 1 M SODIUM FORMATE, 170 MM 2-IMINOBIOTIN, PH ADJUSTED TO 2.6.
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.253 |
| 2RTO STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN COMPLEX, PH 2.6, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | IMI 2-IMINOBIOTIN × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 2.6；ROOM TEMPERATURE, PH 2.60. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 50% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 50% 1 M SODIUM FORMATE, 170 MM 2-IMINOBIOTIN, PH ADJUSTED TO 2.6.
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.253 |
| 2RTP STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN COMPLEX, PH 3.25, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | IMI 2-IMINOBIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.25；ROOM TEMPERATURE, PH 3.25. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 50% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 50% 1 M POTASSIUM ACETATE, 170 MM 2-IMINOBIOTIN, PH ADJUSTED TO 3.25
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.243 |
| 2RTP STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN COMPLEX, PH 3.25, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | IMI 2-IMINOBIOTIN × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.25；ROOM TEMPERATURE, PH 3.25. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 50% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 50% 1 M POTASSIUM ACETATE, 170 MM 2-IMINOBIOTIN, PH ADJUSTED TO 3.25
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.243 |
| 2RTQ STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN COMPLEX, PH 3.25, SPACE GROUP I222, CRYSTALLIZED FROM 4.3 M AMMONIUM SULFATE 提交 1997-09-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | IMI 2-IMINOBIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.25；ROOM TEMPERATURE, PH 3.25. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1 M POTASSIUM ACETATE, 25 MM 2-IMINOBIOTIN, PH ADJUSTED TO 3.25
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.243 |
| 2RTQ STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN COMPLEX, PH 3.25, SPACE GROUP I222, CRYSTALLIZED FROM 4.3 M AMMONIUM SULFATE 提交 1997-09-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | IMI 2-IMINOBIOTIN × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.25；ROOM TEMPERATURE, PH 3.25. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1 M POTASSIUM ACETATE, 25 MM 2-IMINOBIOTIN, PH ADJUSTED TO 3.25
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.243 |
| 2RTR STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN COMPLEX, PH 4.0, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | IMI 2-IMINOBIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4；ROOM TEMPERATURE, PH 4.00. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 4.0.
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.234 |
| 2RTR STREPTAVIDIN-2-IMINOBIOTIN COMPLEX, PH 4.0, SPACE GROUP I222 提交 1997-09-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
25–159（135 aa）
链 D
25–159（135 aa）
|
未记录 | IMI 2-IMINOBIOTIN × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4；ROOM TEMPERATURE, PH 4.00. SYNTHETIC MOTHER LIQUOR OF 75% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 25% 1.0 M POTASSIUM ACETATE ADJUSTED TO PH 4.0.
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.234 |
| 2WPU Chaperoned ruthenium metallodrugs that recognize telomeric DNA 提交 2009-08-10 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | KYT (3AS,4S,6AR)-4-(5-((3R,4R)-3,4-DIAMINOPYRROLIDIN-1-YL)-5-OXOPENTYL)TETRAHYDRO-1H-THIENO[3,4-D]IMIDAZOL-2(3H)-ONE-P-CYMENE-CHLORO-RUTHENIUM(III) × 4 SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；PROTEIN, 26 MG/ML IN WATER. RESERVOIR, 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M SODIUM ACETATE BUFFER, PH 4.0 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K. LIGAND SOAKING CONDITIONS: LIGAND, 10 MM K2OSO2(OH)4 IN 3.0 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 SODIUM ACETATE BUFFER, PH 4.0, CRYO, 1.5 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 SODIUM ACETATE BUFFER, PH 4.0
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.198 |
| 2Y3E Traptavidin, apo-form 提交 2010-12-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
|
突变：YES 突变：YES | GOL GLYCEROL × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；12% PEG 8000, 9% ETHYLENE GLYCOL, 0.1 M HEPES PH 7.5
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.178 |
| 2Y3F Traptavidin, biotin bound form 提交 2010-12-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
|
突变：YES | BTN BIOTIN × 4 GOL GLYCEROL × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.5；27% PEG 4000, 0.25M MGCL2, 0.1M TRIS-HCL PH 8.5
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.151 |
| 3MG5 Core-streptavidin mutant F130L in complex with biotin 提交 2010-04-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：CORE STREPTAVIDIN (RESIDUES 13-139)
链 B
37–163（127 aa）
片段：CORE STREPTAVIDIN (RESIDUES 13-139)
链 C
37–163（127 aa）
片段：CORE STREPTAVIDIN (RESIDUES 13-139)
链 D
37–163（127 aa）
片段：CORE STREPTAVIDIN (RESIDUES 13-139)
|
突变：F154L 突变：F154L 突变：F154L 突变：F154L | BTN BIOTIN × 4 GOL GLYCEROL × 11 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES, pH 7.5, 16% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.178 |
| 3PK2 Artificial Transfer Hydrogenases for the Enantioselective Reduction of Cyclic Imines 提交 2010-11-11 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：S112A | 4IR {N-(4-{[2-(amino-kappaN)ethyl]sulfamoyl-kappaN}phenyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}(chloro)[(1,2,3,4,5-eta)-1,2,3,4,5-pentamethylcyclopentadienyl]iridium(III) × 4 IR3 IRIDIUM (III) ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；3.5 uL precipitation buffer (2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate) mixed with 6.5 uL protein (26 mg/mL) and equilibrated against precipitation buffer, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.204 |
| 3RDM Crystal structure of R7-2 streptavidin complexed with biotin/PEG 提交 2011-04-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
|
突变：T90S, W108V, L110T, F29L, S52G, R53S | 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 BTN BIOTIN × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；0.2 MgCl2, 0.1 Bis-Tris, pH 5.5, 25% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.245 |
| 3RDM Crystal structure of R7-2 streptavidin complexed with biotin/PEG 提交 2011-04-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
|
突变：T90S, W108V, L110T, F29L, S52G, R53S | 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 4 BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；0.2 MgCl2, 0.1 Bis-Tris, pH 5.5, 25% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.245 |
| 3RDO Crystal structure of R7-2 streptavidin complexed with biotin 提交 2011-04-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
|
突变：T90S, W108V, L110T, F29L, S52G, R53S | BTN BIOTIN × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris, pH 7.5, 20% PEG 1500, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.171 |
| 3RDQ Crystal structure of R7-2 streptavidin complexed with desthiobiotin 提交 2011-04-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
|
突变：T90S, W108V, L110T, F29L, S52G, R53S | DTB 6-(5-METHYL-2-OXO-IMIDAZOLIDIN-4-YL)-HEXANOIC ACID × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；0.1 M Na-acetate, pH 5.0, 2 M Na-formate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.190 |
| 3RDS Crystal structure of the refolded R7-2 streptavidin 提交 2011-04-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
|
突变：T90S, W108V, L110T, F29L, S52G, R53S | 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；25% PEG 1500, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.214 |
| 3RDS Crystal structure of the refolded R7-2 streptavidin 提交 2011-04-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
|
突变：T90S, W108V, L110T, F29L, S52G, R53S | 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；25% PEG 1500, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.214 |
| 3RDU Crystal structure of R7-2 streptavidin complexed with PEG 提交 2011-04-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
|
突变：T90S,W108V,L110T,F29L,S52G,R53S | GOL GLYCEROL × 3 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；10% PEG1000, 10% PEG8000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.207 |
| 3RDU Crystal structure of R7-2 streptavidin complexed with PEG 提交 2011-04-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
|
突变：T90S,W108V,L110T,F29L,S52G,R53S | GOL GLYCEROL × 12 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；10% PEG1000, 10% PEG8000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.207 |
| 3RDX Crystal structure of ligand-free R7-2 streptavidin 提交 2011-04-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
链 B
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
|
突变：T90S,W108V,L110T,F29L,S52G,R53S 突变：T90S,W108V,L110T,F29L,S52G,R53S | GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；298 K；0.1 M Na acetate, pH 4.5, 3 M sodium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.278 |
| 3RDX Crystal structure of ligand-free R7-2 streptavidin 提交 2011-04-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
链 B
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
|
突变：T90S,W108V,L110T,F29L,S52G,R53S 突变：T90S,W108V,L110T,F29L,S52G,R53S | GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；298 K；0.1 M Na acetate, pH 4.5, 3 M sodium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.278 |
| 3RE5 Crystal structure of R4-6 streptavidin 提交 2011-04-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
|
突变：T90S,W108V,L110T,F29L,R53S | 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.2 MgCl2, 0.1 HEPES, pH 7.5, 25% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.231 |
| 3RE5 Crystal structure of R4-6 streptavidin 提交 2011-04-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
|
突变：T90S,W108V,L110T,F29L,R53S | 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 4 GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.2 MgCl2, 0.1 HEPES, pH 7.5, 25% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.231 |
| 3RE6 Crystal structure of R4-6 streptavidin 提交 2011-04-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
|
突变：T90S,W108V,L110T,F29L,R53S | GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；18% PEG 8000, 0.1 M Na-cacodylate, pH 6.5, 0.2 M Ca-acetate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.234 |
| 3RE6 Crystal structure of R4-6 streptavidin 提交 2011-04-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–164（128 aa）
片段：UNP Residues 37-164
|
突变：T90S,W108V,L110T,F29L,R53S | GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；18% PEG 8000, 0.1 M Na-cacodylate, pH 6.5, 0.2 M Ca-acetate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.234 |
| 3RY1 Wild-type core streptavidin at atomic resolution 提交 2011-05-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
未记录 | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；298 K；52% MPD, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.135 |
| 3RY2 Wild-type core streptavidin-biotin complex at atomic resolution 提交 2011-05-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 GOL GLYCEROL × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；298 K；30% saturated ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, 0.2 M sodium chloride, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 0.95 Å R-free 0.131 |
| 3T6F Biotin complex of Y54F core streptavidin 提交 2011-07-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
|
突变：Y54F 突变：Y54F | BTN BIOTIN × 4 BSO BIOTIN-D-SULFOXIDE × 4 GOL GLYCEROL × 8 SO4 SULFATE ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；60% saturated ammonium sulfate, 5% isopropanol (30% glycerol cryoprotectant), pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.22 Å R-free 0.151 |
| 3T6L Y54F mutant of core streptavidin 提交 2011-07-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
|
突变：Y54F | CL CHLORIDE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；293 K；2.5 M sodium chloride, 0.1 M sodium-potassium phosphate (30% ethylene glycol cryoprotectant), pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.160 |
| 3WYP Crystal structure of wild-type core streptavidin in complex with D-biotin/biotin-D-sulfoxide at 1.3 A resolution 提交 2014-09-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 C
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 D
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
|
未记录 | BTN BIOTIN × 2 GOL GLYCEROL × 10 BSO BIOTIN-D-SULFOXIDE × 2 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.2；293 K；0.2M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate trihydrate, 24% polyethylene glycol 4000, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.179 |
| 3WYQ Crystal structure of the low-immunogenic core streptavidin mutant LISA-314 (Y22S/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N) at 1.0 A resolution 提交 2014-09-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
|
突变：Y22S/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N 突变：Y22S/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N | BTN BIOTIN × 4 GOL GLYCEROL × 20 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.2；293 K；0.2M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate trihydrate, 24% polyethylene glycol 4000, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.163 |
| 3WZN Crystal structure of the core streptavidin mutant V21 (Y22S/N23D/S27D/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N) complexed with biotin at 1.3 A resolution 提交 2014-10-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
|
突变：Y22S/N23D/S27D/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N 突变：Y22S/N23D/S27D/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N | BTN BIOTIN × 4 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；294 K；100 mM sodium acetate trihydrate, 2.0 M ammonium sulfate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.207 |
| 3WZO Crystal structure of the core streptavidin mutant V21 (Y22S/N23D/S27D/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N) complexed with biotin long tail (BTNtail) at 1.5 A resolution 提交 2014-10-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 C
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 D
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
|
突变：Y22S/N23D/S27D/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N 突变：Y22S/N23D/S27D/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N 突变：Y22S/N23D/S27D/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N 突变：Y22S/N23D/S27D/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N | ZOE 6-({5-[(3aS,4S,5S,6aR)-5-oxido-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoyl}amino)hexanoic acid × 4 GOL GLYCEROL × 3 CD CADMIUM ION × 9 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；0.1 M cadmium chloride hydrate, 0.1 M sodium acetate trihydrate, 30%(v/v) PEG400, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.236 |
| 3WZP Crystal structure of the core streptavidin mutant V21 (Y22S/N23D/S27D/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N) complexed with iminobiotin long tail (IMNtail) at 1.2 A resolution 提交 2014-10-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 C
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 D
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
|
突变：Y22S/N23D/S27D/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N 突变：Y22S/N23D/S27D/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N 突变：Y22S/N23D/S27D/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N 突变：Y22S/N23D/S27D/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N | ZOF 6-({5-[(2E,3aS,4S,6aR)-2-iminohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoyl}amino)hexanoic acid × 4 GOL GLYCEROL × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M sodium citrate tribasic dehydrate, 0.1 M HEPES sodium, 35%(w/v) (+/-)-2-methyl-2, 4-pentandiol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.161 |
| 3WZQ Crystal structure of the core streptavidin mutant V212 (Y22S/N23D/S27D/S45N/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N) complexed with iminobiotin long tail (IMNtail) at 1.7 A resolution 提交 2014-10-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 C
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 D
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
|
突变：Y22S/N23D/S27D/S45N/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N 突变：Y22S/N23D/S27D/S45N/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N 突变：Y22S/N23D/S27D/S45N/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N 突变：Y22S/N23D/S27D/S45N/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N | ZOF 6-({5-[(2E,3aS,4S,6aR)-2-iminohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoyl}amino)hexanoic acid × 4 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；60 mM sodium cacodylate trihydrate, 27%(w/v) PEG300, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.244 |
| 3X00 Crystal structure of the core streptavidin mutant V212 (Y22S/N23D/S27D/S45N/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N) complexed with bis iminobiotin long tail (Bis-IMNtail) at 1.3 A resolution 提交 2014-10-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 C
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
链 D
37–163（127 aa）
片段：UNP residues 37-163
|
突变：Y22S/N23D/S27D/S45N/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N 突变：Y22S/N23D/S27D/S45N/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N 突变：Y22S/N23D/S27D/S45N/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N 突变：Y22S/N23D/S27D/S45N/Y83S/R84K/E101D/R103K/E116N | ZOF 6-({5-[(2E,3aS,4S,6aR)-2-iminohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoyl}amino)hexanoic acid × 4 EDN ETHANE-1,2-DIAMINE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；0.2 M sodium fluoride, 20% PEG3350, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.188 |
| 4BX5 cis-divalent streptavidin 提交 2013-07-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 C
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 D
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
|
突变：YES 突变：YES | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5；2.5 % W/V POLYETHYLENE GLYCOL (PEG) 1000, 12.5 % W/V PEG 3350, 12.5 % V/V MPD, 30 MM OF ETHYLENE GLYCOL MIX (DI-ETHYLENEGLYCOL, TRI-ETHYLENEGLYCOL, TETRA-ETHYLENEGLYCOL, PENTA-ETHYLENEGLYCOL) AND 0.1 M MES/IMIDAZOLE PH 6.5, CORRESPONDING TO CONDITION E4 OF THE MORPHEUS SCREEN
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.187 |
| 4BX6 trans-divalent streptavidin 提交 2013-07-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 C
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 D
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
|
突变：YES 突变：YES | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；65% V/V 2-METHYL-2, 4-PENTANEDIOL (MPD), 0.1 M 2-(N-MORPHOLINO)ETHANESULFONIC ACID (MES) PH 6.0. CRYSTALS WERE OBTAINED BY THE SITTING-DROP VAPOR-DIFFUSION METHOD AT 291 K AND REACHED A MAXIMUM SIZE AFTER 10 DAYS AND WERE HARVESTED SOON AFTER
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.187 |
| 4BX7 trans-divalent streptavidin bound to biotin-4-fluorescein 提交 2013-07-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
|
突变：YES | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 B4F biotin-4-fluorescein × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；277 K；65% V/V MPD, 0.1 M MES PH 4.0. CRYSTALS WERE OBTAINED BY THE SITTING-DROP VAPOR-DIFFUSION METHOD AT 277 K, REACHED A MAXIMUM SIZE AFTER 14 DAYS AND WERE HARVESTED SOON AFTER
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.237 |
| 4CPE Wild-type streptavidin in complex with love-hate ligand 1 (LH1) 提交 2014-02-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
|
未记录 | LUV (3aS,4S,6aR)-2-oxo-hexahydro-1H-thieno[3,4- d]imidazolidin-4-yl]-N-{2-[(2,6- diphenylphenyl)formamido]ethyl}pentanamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；75% SATURATED AMMONIUM SULPHATE, 25% 1M SODIUM ACETATE PH4.5. SITTING DROP
|
分辨率 1.06 Å R-free 0.153 |
| 4CPF Wild-type streptavidin in complex with love-hate ligand 3 (LH3) 提交 2014-02-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
|
未记录 | LH3 methyl 4-(2-{5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-hexahydro-1H- thieno[3,4-d]imidazolidin-4-yl]pentanehydrazido}-3- [4-(methoxycarbonyl)phenyl]phenyl)benzoate × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；75% SATURATED AMMONIUM SULPHATE, 25% 1M SODIUM ACETATE PH4.5. SITTING DROP
|
分辨率 1.14 Å R-free 0.165 |
| 4CPH trans-divalent streptavidin with love-hate ligand 4 提交 2014-02-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 C
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 D
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
|
突变：YES 突变：YES | LH4 5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-hexahydro-1H-thieno[3,4- d]imidazolidin-4-yl]-N'-{2,6-bis[4-(morpholine-4- sulfonyl)phenyl]phenyl}pentanehydrazide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；75% AMMONIUM SULPHATE, 25% SODIUM ACETATE PH4.5. SITTING DROP
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.232 |
| 4CPI streptavidin A86D mutant with love-hate ligand 4 提交 2014-02-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 C
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 D
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
|
突变：YES 突变：YES | LH4 5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-hexahydro-1H-thieno[3,4- d]imidazolidin-4-yl]-N'-{2,6-bis[4-(morpholine-4- sulfonyl)phenyl]phenyl}pentanehydrazide × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；CONDITION A9 OF THE MORPHEUS SCREEN: 0.1 M BICINE/TRIZMA BASE PH 8.5, 10% W/V POLYETHYLENE GLYCOL 20,000, 20% V/V POLYETHYLENE GLYCOL MONOMETHYL ETHER 550, 30 MM MAGNESIUM CHLORIDE AND 30 MM CALCIUM CHLORIDE. SITTING DROP.
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.181 |
| 4CPI streptavidin A86D mutant with love-hate ligand 4 提交 2014-02-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 B
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
|
突变：YES 突变：YES | LH4 5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-hexahydro-1H-thieno[3,4- d]imidazolidin-4-yl]-N'-{2,6-bis[4-(morpholine-4- sulfonyl)phenyl]phenyl}pentanehydrazide × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；CONDITION A9 OF THE MORPHEUS SCREEN: 0.1 M BICINE/TRIZMA BASE PH 8.5, 10% W/V POLYETHYLENE GLYCOL 20,000, 20% V/V POLYETHYLENE GLYCOL MONOMETHYL ETHER 550, 30 MM MAGNESIUM CHLORIDE AND 30 MM CALCIUM CHLORIDE. SITTING DROP.
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.181 |
| 4CPI streptavidin A86D mutant with love-hate ligand 4 提交 2014-02-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 C
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
链 D
37–163（127 aa）
片段：RESIDUES 37-163
|
突变：YES 突变：YES | LH4 5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-hexahydro-1H-thieno[3,4- d]imidazolidin-4-yl]-N'-{2,6-bis[4-(morpholine-4- sulfonyl)phenyl]phenyl}pentanehydrazide × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；CONDITION A9 OF THE MORPHEUS SCREEN: 0.1 M BICINE/TRIZMA BASE PH 8.5, 10% W/V POLYETHYLENE GLYCOL 20,000, 20% V/V POLYETHYLENE GLYCOL MONOMETHYL ETHER 550, 30 MM MAGNESIUM CHLORIDE AND 30 MM CALCIUM CHLORIDE. SITTING DROP.
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.181 |
| 4DNE Crystal structure of a triple-mutant of streptavidin in complex with desthiobiotin 提交 2012-02-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
|
突变：E44V, S45T, V47R 突变：E44V, S45T, V47R | DTB 6-(5-METHYL-2-OXO-IMIDAZOLIDIN-4-YL)-HEXANOIC ACID × 4 SO4 SULFATE ION × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10 mM MgSO4, 50 mM Na caodylate, 2M ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.219 |
| 4EKV Streptavidin 8-aa-loop H127C mutein with reversible biotin binding 提交 2012-04-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
25–183（159 aa）
|
突变：H151C | BTN BIOTIN × 4 CL CHLORIDE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；50% Tacsimate, 10% glycerol, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.225 |
| 4GD9 Circular Permuted Streptavidin N49/G48 提交 2012-07-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
73–163（91 aa）
链 A
37–72（36 aa）
链 B
73–163（91 aa）
链 B
37–72（36 aa）
链 C
73–163（91 aa）
链 C
37–72（36 aa）
链 D
73–163（91 aa）
链 D
37–72（36 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；1.0 M ammonium phosphate, 0.1 M Tris-chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.230 |
| 4GDA Circular Permuted Streptavidin A50/N49 提交 2012-07-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
74–163（90 aa）
链 A
37–73（37 aa）
链 B
74–163（90 aa）
链 B
37–73（37 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 GOL GLYCEROL × 6 SO4 SULFATE ION × 6 EOH ETHANOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；25% saturated ammonium sulfate, 0.1 M Tris-chloride, 0.2 M lithium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.143 |
| 4GJS Streptavidin-K121H 提交 2012-08-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–183（147 aa）
链 B
37–183（147 aa）
|
未记录 | 0OD trichloro{(1,2,3,4,5-eta)-1,2,3,4-tetramethyl-5-[2-({5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoyl}amino)ethyl]cyclopentadienyl}rhodium(1+) × 4 RH Rhodium × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；0.1 M MES, 19 % PEG500, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.250 |
| 4GJV Streptavidin-S112H 提交 2012-08-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–183（147 aa）
|
突变：S112H | 0OD trichloro{(1,2,3,4,5-eta)-1,2,3,4-tetramethyl-5-[2-({5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoyl}amino)ethyl]cyclopentadienyl}rhodium(1+) × 4 CL CHLORIDE ION × 16 RH Rhodium × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；0.1 M MES, 19 % PEG500, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.230 |
| 4IRW Co-crystallization of streptavidin-biotin complex with a lanthanide-ligand complex gives rise to a novel crystal form 提交 2013-01-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
36–163（128 aa）
片段：UNP residues 36-163
|
未记录 | PDC PYRIDINE-2,6-DICARBOXYLIC ACID × 48 BTN BIOTIN × 4 TB TERBIUM(III) ION × 20 NA SODIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；1.5 uL protein (pH 8.0) incubated with saturated biotin solution + 1.5 uL 200 mM Na3[Tb(Dpa)3] + 3 uL 60% v/v MPD, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.154 |
| 4JO6 Streptavidin complex with SBP-Tag 提交 2013-03-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
25–183（159 aa）
片段：UNP residues 25-183
链 B
25–183（159 aa）
片段：UNP residues 25-183
链 C
25–183（159 aa）
片段：UNP residues 25-183
链 D
25–183（159 aa）
片段：UNP residues 25-183
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；56% Tacsimate, 12%(w/v) glycerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.242 |
| 4OKA Structural-, Kinetic- and Docking Studies of Artificial Imine Reductases Based on the Biotin-Streptavidin Technology: An Induced Lock-and-Key Hypothesis 提交 2014-01-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
片段：UNP residues 38-183
|
突变：S112K | 5IR [N-(4-{[2-(amino-kappaN)ethyl]sulfamoyl-kappaN}phenyl)-5-(2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamidato]iridium(III) × 4 IR IRIDIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；ammonium sulfate, sodium acetate, pH 8.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.240 |
| 4Y59 Crystal structure of ALiS1-Streptavidin complex 提交 2015-02-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
链 B
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
链 C
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
链 D
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
|
未记录 | T21 2-[3-(trifluoromethyl)phenyl]furo[3,2-c]pyridin-4(5H)-one × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1M Hepes-NaOH (pH7.0), 50%(v/v) MPD
|
分辨率 1.22 Å R-free 0.155 |
| 4Y5D CRYSTAL STRUCTURE OF ALiS2-STREPTAVIDIN COMPLEX 提交 2015-02-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–160（122 aa）
片段：UNP residues 39-160
链 B
39–160（122 aa）
片段：UNP residues 39-160
链 C
39–160（122 aa）
片段：UNP residues 39-160
链 D
39–160（122 aa）
片段：UNP residues 39-160
|
未记录 | MT6 methyl 3-(4-oxo-4,5-dihydrofuro[3,2-c]pyridin-2-yl)benzoate × 3 PE3 3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39-TRIDECAOXAHENTETRACONTANE-1,41-DIOL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1M Mes-NaOH (pH6.0), 45%(w/v) PEG1000
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.174 |
| 4YVB Structure of D128N streptavidin 提交 2015-03-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
40–159（120 aa）
链 B
40–159（120 aa）
链 C
40–159（120 aa）
链 D
40–159（120 aa）
|
突变：D128N 突变：D128N 突变：D128N 突变：D128N | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.05 M HEPES, pH 7.5 with 7.5% PEG 8000
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.170 |
| 5B5F Crystal structure of ALiS3-Streptavidin complex 提交 2016-05-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
40–159（120 aa）
片段：UNP residues 40-159
链 B
40–159（120 aa）
片段：UNP residues 40-159
链 C
40–159（120 aa）
片段：UNP residues 40-159
链 D
40–159（120 aa）
片段：UNP residues 40-159
|
未记录 | 6F3 N-methyl-3-(4-oxo-4,5-dihydrofuro[3,2-c]pyridin-2-yl)benzenesulfonamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M MES-NaOH (pH6.0), 35%(w/v) PEG 1000, 2.0% agarose hydrogel
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.193 |
| 5B5G Crystal structure of ALiS4-Streptavidin complex 提交 2016-05-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
40–159（120 aa）
片段：UNP residues 40-159
链 B
40–159（120 aa）
片段：UNP residues 40-159
链 C
40–159（120 aa）
片段：UNP residues 40-159
链 D
40–159（120 aa）
片段：UNP residues 40-159
|
未记录 | SO3 SULFITE ION × 7 6FX methyl 5-(4-oxidanylidene-5~{H}-furo[3,2-c]pyridin-2-yl)pyridine-3-carboxylate × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1M Tris-HCl (pH8.0), 30%(w/v) PEG 1000, 2.0% agarose hydrogel
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.193 |
| 5CSE Streptavidin-S112Y-K121E Complexed with Palladium-Containing Biotin Ligand 提交 2015-07-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–158（121 aa）
片段：UNP residues 37-158
链 B
38–158（121 aa）
片段：UNP residues 37-158
|
突变：S112Y-K121E 突变：S112Y-K121E | SVP chloro{di-tert-butyl[2-({5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoyl}amino)ethyl]-lambda~5~-phosphanyl}(1-phenylprop-1-ene-1,3-diyl-kappa~2~C~1~,C~3~)palladium × 4 CL CHLORIDE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；15-25% PEG 1500, 100mM SPG buffer (mixed succinic acid, sodium dihydrogen phosphate and glycine in the ratio 2:7:7; 75% at pH 4 and 25% at pH 10)
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.256 |
| 5CSE Streptavidin-S112Y-K121E Complexed with Palladium-Containing Biotin Ligand 提交 2015-07-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
38–158（121 aa）
片段：UNP residues 37-158
链 B
38–158（121 aa）
片段：UNP residues 37-158
|
突变：S112Y-K121E 突变：S112Y-K121E | SVP chloro{di-tert-butyl[2-({5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoyl}amino)ethyl]-lambda~5~-phosphanyl}(1-phenylprop-1-ene-1,3-diyl-kappa~2~C~1~,C~3~)palladium × 2 CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；15-25% PEG 1500, 100mM SPG buffer (mixed succinic acid, sodium dihydrogen phosphate and glycine in the ratio 2:7:7; 75% at pH 4 and 25% at pH 10)
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.256 |
| 5F2B Expanding Nature's Catalytic Repertoire -Directed Evolution of an Artificial Metalloenzyme for In Vivo Metathesis 提交 2015-12-01 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：V47A,N49K,T114Q,A119G,K121R | 9RU [1-[4-[[5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]methyl]-2,6-dimethyl-phenyl]-3-(2,4,6-trimethylphenyl)-4,5-dihydroimidazol-1-ium-2-yl]-bis(chloranyl)ruthenium × 4 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；1.5 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.206 |
| 5JD2 SFX structure of corestreptavidin-selenobiotin complex 提交 2016-04-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
40–159（120 aa）
链 B
40–159（120 aa）
链 C
40–159（120 aa）
链 D
40–159（120 aa）
|
未记录 | BYY 5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-selenopheno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH MODE；293 K；24% PEG 1500 and 20% glycerol
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.200 |
| 5K67 Designed Artificial Cupredoxins 提交 2016-05-24 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | SI4 [CuII(biot-pr-dpea)]2+ × 4 GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；274 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.234 |
| 5K68 Designed Artificial Cupredoxins 提交 2016-05-24 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | SI9 [CuII(biot-bu-dpea)]2+ × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；274 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.181 |
| 5L3Y Designed Artificial Cupredoxins 提交 2016-05-24 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | CU6 [CuII(biot-et-dpea)]2+ × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；274 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.244 |
| 5N7X CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTAVIDIN WITH PEPTIDE EWVHPQFEQKAK 提交 2017-02-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Magnesium acetate
0.1M Sodium cacodylate pH 6.5
15% PEG6000
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.186 |
| 5N7X CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTAVIDIN WITH PEPTIDE EWVHPQFEQKAK 提交 2017-02-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
1–183（183 aa）
链 M
1–183（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Magnesium acetate
0.1M Sodium cacodylate pH 6.5
15% PEG6000
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.186 |
| 5N7X CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTAVIDIN WITH PEPTIDE EWVHPQFEQKAK 提交 2017-02-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 E
1–183（183 aa）
链 O
1–183（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Magnesium acetate
0.1M Sodium cacodylate pH 6.5
15% PEG6000
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.186 |
| 5N7X CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTAVIDIN WITH PEPTIDE EWVHPQFEQKAK 提交 2017-02-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 F
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Magnesium acetate
0.1M Sodium cacodylate pH 6.5
15% PEG6000
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.186 |
| 5N89 CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTAVIDIN WITH PEPTIDE GNSFDDWLASKG 提交 2017-02-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Potassium chloride
0.1M HEPES pH 7.5
15% PEG6000
|
分辨率 1.27 Å R-free 0.204 |
| 5N89 CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTAVIDIN WITH PEPTIDE GNSFDDWLASKG 提交 2017-02-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 H
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 M
1–183（183 aa）
链 O
1–183（183 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Potassium chloride
0.1M HEPES pH 7.5
15% PEG6000
|
分辨率 1.27 Å R-free 0.204 |
| 5N8B CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTAVIDIN WITH PEPTIDE AFPDYLAEYHGG 提交 2017-02-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 G
1–183（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1M Magnesium chloride
0.1M Sodium citrate pH 5
15% PEG4000
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.155 |
| 5N8E CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTAVIDIN WITH PEPTIDE RDPAPAWAHGGG 提交 2017-02-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；0.2M Ammonium acetate
0.1M Sodium acetate pH 4
15% PEG4000
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.153 |
| 5N8J CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTAVIDIN WITH PEPTIDE D-amino acid containing peptide GyGlanvdessG 提交 2017-02-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
|
未记录 | IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Sodium citrate pH 5.6
20% PEG4000
20% Isopropanol
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.193 |
| 5N8T CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTAVIDIN D-amino acid containing peptide Gdlwqheatwkkq 提交 2017-02-24 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | DLE D-LEUCINE × 1 DTR D-TRYPTOPHAN × 2 DGN D-GLUTAMINE × 1 DHI D-HISTIDINE × 1 DGL D-GLUTAMIC ACID × 1 DAL D-ALANINE × 1 DTH D-THREONINE × 1 DLY D-LYSINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；0.1M Sodium citrate pH 4.5,
20% PEG4000
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.243 |
| 5N8W CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTAVIDIN with D-amino acid containing peptide GGwhdeatwkpG 提交 2017-02-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Magnesium acetate
0.1M MOPS pH 7.5
12% PEG8000
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.151 |
| 5N99 CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTAVIDIN with cyclic peptide NQpWQ 提交 2017-02-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 M
1–183（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M Sodium citrate pH 5.5
15% PEG6000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.192 |
| 5N99 CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTAVIDIN with cyclic peptide NQpWQ 提交 2017-02-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 G
1–183（183 aa）
链 I
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 Q
1–183（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M Sodium citrate pH 5.5
15% PEG6000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.192 |
| 5N99 CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTAVIDIN with cyclic peptide NQpWQ 提交 2017-02-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 O
1–183（183 aa）
链 S
1–183（183 aa）
链 U
1–183（183 aa）
链 Y
1–183（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M Sodium citrate pH 5.5
15% PEG6000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.192 |
| 5TO2 Crystal structure of streptavidin with one wild type subunit and three mutated subunits (N23A/S27D/S45A) 提交 2016-10-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–163（125 aa）
链 B
39–163（125 aa）
链 C
39–163（125 aa）
链 D
39–162（124 aa）
|
突变：N23A, S27D, S45A 突变：N23A, S27D, S45A 突变：N23A, S27D, S45A | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Tris pH 8.3, 0.25 M MgCl2, 32% PEG4K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.234 |
| 5VCQ A Hyrdrogen Producing Hybrid Streptavidin-Diiron Catalyst 提交 2017-03-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
|
未记录 | BN7 2-methylpropyl 5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoate × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；100mM TRIS pH 8.5, 200mM MgCl2, 20-30% PEG4000
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.218 |
| 5VKX Coordination Chemistry within a Protein Host: Regulation of the Secondary Coordination Sphere 提交 2017-04-24 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | S18 [N-(3-{bis[2-(pyridin-2-yl-kappaN)ethyl]amino-kappaN}ethyl)-5-(2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamide](azido)copper × 4 CU COPPER (II) ION × 4 GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；26 mg/mL protein, 2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.0
|
分辨率 1.37 Å R-free 0.187 |
| 5VL8 Coordination Chemistry within a Protein Host: Regulation of the Secondary Coordination Sphere 提交 2017-04-25 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | S32 [N-(3-{bis[2-(pyridin-2-yl-kappaN)ethyl]amino-kappaN}propyl)-5-(2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamide](hydroxy)copper × 4 CU COPPER (II) ION × 4 GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；26 mg/mL protein, 2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.0
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.215 |
| 5WBA Peroxide Activation Regulated by Hydrogen Bonds within Artificial Cu Proteins - WT 提交 2017-06-28 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
片段：UNP residues 38-183
|
未记录 | SI8 [N-(2-{bis[2-(pyridin-2-yl-kappaN)ethyl]amino-kappaN}ethyl)-5-(2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamide](hydrogen peroxido-kappaO)copper × 4 ACT ACETATE ION × 4 SO4 SULFATE ION × 4 CU COPPER (II) ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；0.1 M sodium acetate, pH 4.0, 2.6 M ammonium sulfate
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.151 |
| 5WBB Peroxide Activation Regulated by Hydrogen Bonds within Artificial Cu Proteins - S112A 提交 2017-06-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
片段：UNP residues 38-183
|
突变：S112A | SQ1 [N-(2-{bis[2-(pyridin-2-yl-kappaN)ethyl]amino-kappaN}ethyl)-5-(2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamide]copper × 4 CU COPPER (II) ION × 4 GOL GLYCEROL × 4 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；0.1 M sodium acetate, 2.6 M sodium sulfate
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.188 |
| 5WBC Designed Artificial Cupredoxins - WT 提交 2017-06-28 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | CU6 [CuII(biot-et-dpea)]2+ × 4 GOL GLYCEROL × 4 ACT ACETATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；274 K；0.1 M sodium acetate, pH 4, 2.6 M ammonium sulfate
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.168 |
| 5WBD Peroxide Activation Regulated by Hydrogen Bonds within Artificial Cu Proteins - N49A 提交 2017-06-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
片段：UNP residues 38-183
|
突变：N49A | SI7 [N-(2-{bis[2-(pyridin-2-yl-kappaN)ethyl]amino-kappaN}ethyl)-5-(2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamide](hydroxy)copper × 4 ACT ACETATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium sulfate
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.178 |
| 6ANX Peroxide Activation Regulated by Hydrogen Bonds within Artificial Cu Proteins - WT (low exposure) 提交 2017-08-14 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
片段：UNP residues 38-183
|
未记录 | SI0 [N-(2-{bis[2-(pyridin-2-yl-kappaN)ethyl]amino-kappaN}ethyl)-5-(2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamide](hydrogen peroxido-kappaO)hydroxycopper × 4 ACT ACETATE ION × 4 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；274 K；2.6 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.187 |
| 6AUC Artificial metalloproteins containing a Co4O4 active site - 2xm-Sav 提交 2017-08-31 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：E101Q, K121A | OLS N-biotin-C-Co4(mu3-O)4(Py)4(H2O)4-beta-alanine × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；2.6 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.0
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.201 |
| 6AUE Artificial Metalloproteins Containing a Co4O4 Active Site - 2xm-S112Y-b 提交 2017-08-31 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：E101Q, S112Y, K121A | OL3 N-biotin-C-Co4(mu3-O)4(OAc)(Py)4(H2O)3-beta-alanine × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；2.6 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.0
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.229 |
| 6AUH Artificial Metalloproteins Containing a Co4O4 Active Site - 2xm-S112Y-a 提交 2017-09-01 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：E101Q, S112Y, K121A | OL5 N-biotin-C-Co4(mu3-O)4(OAc)(Py)3(H2O)3-beta-alanine × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；2.6 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.0
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.219 |
| 6AUL Artificial Metalloproteins Containing a Co4O4 Active Site - 2xm-S112Y-b 提交 2017-09-01 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：E101Q, S112Y, K121A | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；2.6 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.0
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.195 |
| 6AUO Artificial Metalloproteins Containing a Co4O4 Active Site - 2xm-S112F 提交 2017-09-01 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：E101Q, S112F, K121A | OL4 N-biotin-C-Co4(mu3-O)4(Py)3(H2O)4-beta-alanine × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；2.6 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.0
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.222 |
| 6AVK Streptavidin bound to peptide-like compound KPM-6 提交 2017-09-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–159（123 aa）
链 B
37–159（123 aa）
|
未记录 | BZ4 N-[(2H-1,3-benzodioxol-5-yl)methyl]-2-({[(2H-1,3-benzodioxol-5-yl)methyl][2-(chloromethyl)-1,3-oxazole-4-carbonyl]amino}methyl)-N-[(4-carbamoyl-1,3-oxazol-2-yl)methyl]-1,3-oxazole-4-carboxamide × 2 HDO 1-hydroxydodecan-4-one × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；0.2 M potassium iodide, 20% PEG3350
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.186 |
| 6ESS Artificial imine reductase mutant S112A-N118P-K121A-S122M 提交 2017-10-24 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | 4IR {N-(4-{[2-(amino-kappaN)ethyl]sulfamoyl-kappaN}phenyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}(chloro)[(1,2,3,4,5-eta)-1,2,3,4,5-pentamethylcyclopentadienyl]iridium(III) × 4 IR IRIDIUM ION × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.0
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.327 |
| 6ESU Artificial imine reductase mutant S112A-N118P-K121A-S122M 提交 2017-10-24 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | 6IR 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-[4-(2-azanylethylsulfamoyl)phenyl]pentanamide × 4 IR IRIDIUM ION × 16 ACT ACETATE ION × 4 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.0
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.211 |
| 6FH8 E. coli surface display of streptavidin for directed evolution of an allylic deallocase 提交 2018-01-12 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：S112M-K121A | JCT biotinylated ruthenium cyclopentadienide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.0
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.159 |
| 6FRY Photo-Driven Hydrogen Evolution by an Artificial Hydrogenase Utilizing the Biotin-Streptavidin Technology 提交 2018-02-16 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | 9CO [CoBr(appy)-Biot]Br × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.0
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.202 |
| 6GH7 WILDTYPE CORE-STREPTAVIDIN WITH a conjugated BIOTINYLATED PYRROLIDINE 提交 2018-05-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
未记录 | EYW 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-[(3~{R})-pyrrolidin-3-yl]pentanamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25 mg/mL protein in deionised water is mixed at equal volume with 51% MPD.
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.185 |
| 6GMI Genetic Engineering of an Artificial Metalloenzyme for Transfer Hydrogenation of a Self-Immolative Substrate in E. coli's Periplasm. 提交 2018-05-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–183（145 aa）
|
突变：S112V, E116SPLSEALTKANSPAEAYKASRGAGA, K121A | 4IR {N-(4-{[2-(amino-kappaN)ethyl]sulfamoyl-kappaN}phenyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}(chloro)[(1,2,3,4,5-eta)-1,2,3,4,5-pentamethylcyclopentadienyl]iridium(III) × 4 IR3 IRIDIUM (III) ION × 16 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；0.1 M SPG 9 pH (Buffer)
25 %w/v PEG 1500 (Precipitant)
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.199 |
| 6J6J Biotin-bound streptavidin 提交 2019-01-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
40–158（119 aa）
链 B
40–158（119 aa）
链 C
40–158（119 aa）
链 D
40–158（119 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 6J6K Apo-state streptavidin 提交 2019-01-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
40–158（119 aa）
链 B
40–158（119 aa）
链 C
40–158（119 aa）
链 D
40–158（119 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 6LNG Rapid crystallization of streptavidin using charged peptides 提交 2019-12-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–163（125 aa）
链 B
39–163（125 aa）
链 C
39–163（125 aa）
链 D
39–163（125 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH MODE；298 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.5, 30% w/v polyethylene glycol
monomethyl ether 5000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.219 |
| 6LNG Rapid crystallization of streptavidin using charged peptides 提交 2019-12-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 E
39–163（125 aa）
链 F
39–163（125 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH MODE；298 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.5, 30% w/v polyethylene glycol
monomethyl ether 5000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.219 |
| 6M9B Wild-type streptavidin in complex with biotin solved by native SAD with data collected at 6 keV 提交 2018-08-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；13.25mg SAV WT + 0.610mg biotin in 500uL H2O
in the well: 500uL => 50% MPD
sitting drops: 1uL SAV-biot + 1uL 80% MPD, 100mM MMT pH 5.5
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.183 |
| 6QBB Engineered streptavidin variant (ENAGY) in complex with the Strep-tag II peptide 提交 2018-12-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
38–163（126 aa）
链 B
38–163（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；PEG MME 550, zinc sulfate, 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.190 |
| 6QSY Engineered streptavidin variant (H--WY) in complex with the Strep-tag II peptide 提交 2019-02-22 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
38–163（126 aa）
|
未记录 | PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 12 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；polyethylene glycol 8000, lithium sulfate, tris(hydroxymethyl)aminomethane
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.179 |
| 6QW4 Engineered streptavidin variant (ACGR) in complex with the Strep-tag II peptide 提交 2019-03-05 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
38–163（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；lithium sulfate, 4-(2-Hydroxyethyl)piperazine-1-ethanesulfonic acid
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.240 |
| 6S4Q scdSav(SASK) - Engineering Single-Chain Dimeric Streptavidin as Host for Artificial Metalloenzymes 提交 2019-06-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
39–183（145 aa）
链 B
39–183（145 aa）
|
未记录 | 4IR {N-(4-{[2-(amino-kappaN)ethyl]sulfamoyl-kappaN}phenyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}(chloro)[(1,2,3,4,5-eta)-1,2,3,4,5-pentamethylcyclopentadienyl]iridium(III) × 4 GOL GLYCEROL × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Na-Acetate, pH 4
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.231 |
| 6S50 scdSav(SARK)mv2 - Engineering Single-Chain Dimeric Streptavidin as Host for Artificial Metalloenzymes 提交 2019-06-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
39–183（145 aa）
链 B
39–183（145 aa）
|
未记录 | 4IR {N-(4-{[2-(amino-kappaN)ethyl]sulfamoyl-kappaN}phenyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}(chloro)[(1,2,3,4,5-eta)-1,2,3,4,5-pentamethylcyclopentadienyl]iridium(III) × 4 GOL GLYCEROL × 6 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Na-Acetate, pH 4
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.208 |
| 6SOK Engineered streptavidin variant (VTAR) in complex with the Twin-Strep-tag peptide 提交 2019-08-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
38–163（126 aa）
链 B
38–163（126 aa）
链 C
38–163（126 aa）
链 D
38–163（126 aa）
|
未记录 | NH2 AMINO GROUP × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；293 K；ammonium sulfate, sodium citrate-phosphate
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.184 |
| 6SOS Engineered streptavidin variant (ENAGY) in complex with the Twin-Strep-tag peptide 提交 2019-08-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
38–163（126 aa）
链 B
38–163（126 aa）
链 C
38–163（126 aa）
链 D
38–163（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.247 |
| 6T1E Streptavidin variants harbouring an artificial organocatalyst based cofactor 提交 2019-10-04 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 12 ACT ACETATE ION × 4 HL9 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-(1-pyridin-4-ylpiperidin-4-yl)pentanamide × 4 CL CHLORIDE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；(NH4)2SO4 1.8 M, NaCH3COO 0.1 M, pH 4.6
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.158 |
| 6T1G Streptavidin variants harbouring an artificial organocatalyst based cofactor 提交 2019-10-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
|
未记录 | HL9 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-(1-pyridin-4-ylpiperidin-4-yl)pentanamide × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Na-citrate 0.1 M pH 5.5, 40% PEG 600
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.250 |
| 6T1K Streptavidin variants harbouring an artificial organocatalyst based cofactor 提交 2019-10-04 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | HL9 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-(1-pyridin-4-ylpiperidin-4-yl)pentanamide × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；CHES 0.1 M pH 9.5 30% PEG 3000
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.171 |
| 6T2L Streptavidin variants harbouring an artificial organocatalyst based cofactor 提交 2019-10-09 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | HL9 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-(1-pyridin-4-ylpiperidin-4-yl)pentanamide × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；273 K；0.17M Na-acetate, 0.085M TRIS-HCl, pH 8.5, 25.5% PEG 4000, 15% glycerol
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.134 |
| 6T2Y Streptavidin variants harbouring an artificial organocatalyst based cofactor 提交 2019-10-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 HL9 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-(1-pyridin-4-ylpiperidin-4-yl)pentanamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M di-Sodium hydrogen phosphate 20% PEG 3350
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.240 |
| 6T2Z Streptavidin variants harbouring an artificial organocatalyst based cofactor 提交 2019-10-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
|
未记录 | HL9 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-(1-pyridin-4-ylpiperidin-4-yl)pentanamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.6M Na2HPO4 0.4M K2HPO4 0.1M Sodium citrate phosphate pH 4.2
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.183 |
| 6T30 Streptavidin variants harbouring an artificial organocatalyst based cofactor 提交 2019-10-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
|
未记录 | HL9 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-(1-pyridin-4-ylpiperidin-4-yl)pentanamide × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M di-Sodium hydrogen phosphate 20% PEG 3350
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.230 |
| 6T31 Streptavidin variants harbouring an artificial organocatalyst based cofactor 提交 2019-10-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
|
未记录 | HL9 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-(1-pyridin-4-ylpiperidin-4-yl)pentanamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；CHES 0.1 M pH 9.5, 30% PEG 3000
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.165 |
| 6T32 Streptavidin variants harbouring an artificial organocatalyst based cofactor 提交 2019-10-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
|
未记录 | HL9 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-(1-pyridin-4-ylpiperidin-4-yl)pentanamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；CHES 0.1 M pH 9.5 30% PEG 3000
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.191 |
| 6TIP Engineered streptavidin variant (YNAFM) in complex with the Strep-tag II peptide 提交 2019-11-22 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
38–163（126 aa）
|
未记录 | NH2 AMINO GROUP × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.228 |
| 6UC3 Spectroscopic and structural characterization of a genetically encoded direct sensor for protein-ligand interactions 提交 2019-09-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | BTN BIOTIN × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.5；298 K；500 ul of 0.1 M Citric Acid, pH 3.5, 3M NaCl in reservoir with 2 ul of reservoir buffer mixed with 2 ul of 10 mg/ml of protein in the drop. Crystals were soaked to pH 5.5 overnight with 3 exchanges
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.213 |
| 6UD1 Spectroscopic and structural characterization of a genetically encoded direct sensor for protein-ligand interactions 提交 2019-09-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.5；298 K；500 ul of 0.1 M Citric Acid, pH 3.5, 3M NaCl in the reservoir with 2 ul of reservoir buffer mixed with 2 ul of 10 mg/ml of protein in the drop. Crystals were soaked to pH 5.5 overnight with 3 exchanges
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.192 |
| 6UD6 Spectroscopic and structural characterization of a genetically encoded direct sensor for protein-ligand interactions 提交 2019-09-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 7 CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.5；298 K；500 ul of 0.1 M citric acid, pH 3.5, 3M NaCl in the reservoir with 2 ul of reservoir buffer mixed with 2 ul of 10 mg/ml of protein in the drop. Crystals were soaked to pH 5.5 overnight with 3 exchanges
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.190 |
| 6UD6 Spectroscopic and structural characterization of a genetically encoded direct sensor for protein-ligand interactions 提交 2019-09-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 14 CL CHLORIDE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.5；298 K；500 ul of 0.1 M citric acid, pH 3.5, 3M NaCl in the reservoir with 2 ul of reservoir buffer mixed with 2 ul of 10 mg/ml of protein in the drop. Crystals were soaked to pH 5.5 overnight with 3 exchanges
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.190 |
| 6UDB Spectroscopic and structural characterization of a genetically encoded direct sensor for protein-ligand interactions 提交 2019-09-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；500 ul of 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350 in the reservoir with 2 ul of reservoir buffer mixed with 2 ul of 10 mg/ml of protein in the drop
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.201 |
| 6UDC Spectroscopic and structural characterization of a genetically encoded direct sensor for protein-ligand interactions 提交 2019-09-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
37–163（127 aa）
链 B
37–163（127 aa）
链 C
37–163（127 aa）
链 D
37–163（127 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；500 ul of 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350 in the reservoir with 2 ul of reservoir buffer mixed with 2 ul of 10 mg/ml of protein in the drop
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.256 |
| 6UI0 Artificial Iron Proteins: Modelling the Active Sites in Non-Heme Dioxygenases 提交 2019-09-29 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：K121A, E101Q, S112E | QFY {N-(2-{bis[(pyridin-2-yl-kappaN)methyl]amino-kappaN}ethyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}iron(3+) × 4 ACT ACETATE ION × 20 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；26 mg/mL protein, 2.0 Ammonium Sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 4
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.179 |
| 6UIU Artificial Iron Proteins: Modelling the Active Sites in Non-Heme Dioxygenases 提交 2019-10-01 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：K121A, E101Q, S112E | QG7 N-(2-{bis[(pyridin-2-yl)methyl]amino}ethyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；26 mg/mL protein, 2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 4
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.230 |
| 6UIY Artificial Iron Proteins: Modelling the Active Sites in Non-Heme Dioxygenases 提交 2019-10-01 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：E101Q, S112E, K121A | QG1 {5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-N-(2-{[(pyridin-2-yl)methyl][(pyridin-2-yl-kappaN)methyl]amino-kappaN}ethyl)pentanamide}iron(2+) × 4 ACT ACETATE ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；26 mg/mL protein, 2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.177 |
| 6UIZ Artificial Iron Proteins: Modelling the Active Sites in Non-Heme Dioxygenases 提交 2019-10-01 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：E101Q, S112E, K121A | QG4 {N-(2-{bis[(pyridin-2-yl-kappaN)methyl]amino-kappaN}ethyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}(triaza-1,2-dien-2-ium-1-ide-kappaN~1~)iron(4+) × 4 ACT ACETATE ION × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；26 mg/mL, 2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 4
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.234 |
| 6US6 Artificial Iron Proteins: Modelling the Active Sites in Non-Heme Dioxygenases 提交 2019-10-24 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：K121A, E101Q, S112E | QFY {N-(2-{bis[(pyridin-2-yl-kappaN)methyl]amino-kappaN}ethyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}iron(3+) × 4 ACT ACETATE ION × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；26 mg/mL protein, 2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 4
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.182 |
| 6VJK Streptavidin mutant M88 (N49C/A86C) 提交 2020-01-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–160（123 aa）
链 B
38–160（123 aa）
链 E
38–160（123 aa）
链 F
38–160（123 aa）
|
突变：N49C, A86C 突变：N49C, A86C 突变：N49C, A86C 突变：N49C, A86C | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；21% PEG 3350, 8% glycerol, 100 mM Bis-Tris-Cl pH 7.5
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.215 |
| 6VJK Streptavidin mutant M88 (N49C/A86C) 提交 2020-01-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 C
38–160（123 aa）
链 D
38–160（123 aa）
链 I
38–160（123 aa）
链 J
38–160（123 aa）
|
突变：N49C, A86C 突变：N49C, A86C 突变：N49C, A86C 突变：N49C, A86C | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；21% PEG 3350, 8% glycerol, 100 mM Bis-Tris-Cl pH 7.5
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.215 |
| 6VJK Streptavidin mutant M88 (N49C/A86C) 提交 2020-01-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 G
38–160（123 aa）
链 H
38–160（123 aa）
链 K
38–160（123 aa）
链 L
38–160（123 aa）
|
突变：N49C, A86C 突变：N49C, A86C 突变：N49C, A86C 突变：N49C, A86C | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；21% PEG 3350, 8% glycerol, 100 mM Bis-Tris-Cl pH 7.5
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.215 |
| 6VJL Streptavidin mutant M112 (G26C/A46C) 提交 2020-01-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
25–183（159 aa）
|
突变：G26C, A46C | BTN BIOTIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294.15 K；28% PEG 4000, 0.15 M ammonium sulfate, 50 mM Bis-Tris
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.201 |
| 6VO9 Artificial Metalloproteins with Dinuclear Iron Centers 提交 2020-01-30 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：K121A, L124Y | KM3 {N-(4-{bis[(pyridin-2-yl-kappaN)methyl]amino-kappaN}butyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}iron(3+) × 4 ACT ACETATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.211 |
| 6VOB Artificial Metalloproteins with Dinuclear Iron Centers 提交 2020-01-30 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：K121A, L124Y | KM3 {N-(4-{bis[(pyridin-2-yl-kappaN)methyl]amino-kappaN}butyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}iron(3+) × 4 AZI AZIDE ION × 4 ACT ACETATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.197 |
| 6VOZ Artificial Metalloproteins with Dinuclear Iron Centers 提交 2020-02-01 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：K121A, L124Y | KM3 {N-(4-{bis[(pyridin-2-yl-kappaN)methyl]amino-kappaN}butyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}iron(3+) × 4 ACT ACETATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.206 |
| 6VP1 Artificial Metalloproteins with Dinuclear Iron Centers 提交 2020-02-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
链 C
38–183（146 aa）
链 D
38–183（146 aa）
|
突变：K121A, L124Y 突变：K121A, L124Y 突变：K121A, L124Y 突变：K121A, L124Y | KM3 {N-(4-{bis[(pyridin-2-yl-kappaN)methyl]amino-kappaN}butyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}iron(3+) × 4 ACT ACETATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.197 |
| 6VP2 Artificial Metalloproteins with Dinuclear Iron Centers 提交 2020-02-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
链 C
38–183（146 aa）
链 D
38–183（146 aa）
|
突变：K121A, L124Y 突变：K121A, L124Y 突变：K121A, L124Y 突变：K121A, L124Y | KM3 {N-(4-{bis[(pyridin-2-yl-kappaN)methyl]amino-kappaN}butyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}iron(3+) × 4 AZI AZIDE ION × 2 ACT ACETATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.199 |
| 6VP3 Artificial Metalloproteins with Dinuclear Iron Centers 提交 2020-02-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
链 C
38–183（146 aa）
链 D
38–183（146 aa）
|
突变：K121A, L124Y 突变：K121A, L124Y 突变：K121A, L124Y 突变：K121A, L124Y | KM3 {N-(4-{bis[(pyridin-2-yl-kappaN)methyl]amino-kappaN}butyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}iron(3+) × 4 ACT ACETATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.221 |
| 6Y25 Streptavidin mutant S112R,K121E with a biotC4-1 cofactor - an artificial iron hydroxylase 提交 2020-02-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 AAA
39–183（145 aa）
|
突变：S112R, K121E | O6T biotC4-1 cofactor × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Na-Acetate, pH 4
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.203 |
| 6Y2M Streptavidin mutant S112R with a biotC4-1 cofactor - an artificial iron hydroxylase 提交 2020-02-17 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 AAA
39–183（145 aa）
|
未记录 | O6T biotC4-1 cofactor × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Na-Acetate, pH 4
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.231 |
| 6Y2T Streptavidin wildtype with a biotC4-1 cofactor - an artificial iron hydroxylase 提交 2020-02-17 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 AAA
39–183（145 aa）
|
未记录 | O6T biotC4-1 cofactor × 8 GOL GLYCEROL × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Na-Acetate, pH 4
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.200 |
| 6Y33 Streptavidin mutant S112R with a biotC5-1 cofactor - an artificial iron hydroxylase 提交 2020-02-17 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 AAA
39–183（145 aa）
|
未记录 | O7Q biotC5-1 cofactor × 4 GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Na-Acetate, pH 4
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.192 |
| 6Y34 Streptavidin wildtype with a biotC5-1 cofactor - an artificial iron hydroxylase 提交 2020-02-17 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 AAA
39–183（145 aa）
|
未记录 | O7Q biotC5-1 cofactor × 4 GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Na-Acetate, pH 4
|
分辨率 1.31 Å R-free 0.198 |
| 6Y3Q Streptavidin mutant S112R_K121E with a biotC5-1 cofactor - an artificial iron hydroxylase 提交 2020-02-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 AAA
39–183（145 aa）
|
未记录 | O7Q biotC5-1 cofactor × 4 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Na-Acetate, pH 4
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.258 |
| 7ALX Sav-SOD: Chimeric Streptavidin-cSOD as Host for Artificial Metalloenzymes 提交 2020-10-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 AAA
39–72（34 aa）
链 AAA
73–183（111 aa）
链 BBB
39–72（34 aa）
链 BBB
73–183（111 aa）
|
未记录 | UFW ((4S)-1,3-dimesityl-4-((5-((3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamido)methyl)imidazolidin-2-yl)gold × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20 %w/v PEG 3350 (Precipitant)
0.2 M Na K Phos (Salt)
0.1 M BIS-TRIS prop 7.5 pH (Buffer)
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.218 |
| 7B74 Chimeric Streptavidin With A Dimerization Domain For Artificial Transfer Hydrogenation 提交 2020-12-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 AAA
39–72（34 aa）
链 AAA
73–183（111 aa）
链 BBB
39–72（34 aa）
链 BBB
73–183（111 aa）
链 CCC
39–72（34 aa）
链 CCC
73–183（111 aa）
链 DDD
39–72（34 aa）
链 DDD
73–183（111 aa）
|
未记录 | 4IR {N-(4-{[2-(amino-kappaN)ethyl]sulfamoyl-kappaN}phenyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}(chloro)[(1,2,3,4,5-eta)-1,2,3,4,5-pentamethylcyclopentadienyl]iridium(III) × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20 %w/v PEG 3350 (Polymer)
0.2 M KF (Salt)
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.218 |
| 7DY0 1.93 A cryo-EM structure of streptavidin 提交 2021-01-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.93 Å |
| 7DY0 1.93 A cryo-EM structure of streptavidin 提交 2021-01-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.93 Å |
| 7DY0 1.93 A cryo-EM structure of streptavidin 提交 2021-01-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.93 Å |
| 7EFC 1.70 A cryo-EM structure of streptavidin 提交 2021-03-21 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.70 Å |
| 7EFC 1.70 A cryo-EM structure of streptavidin 提交 2021-03-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.70 Å |
| 7EFC 1.70 A cryo-EM structure of streptavidin 提交 2021-03-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.70 Å |
| 7EFD 1.77 A cryo-EM structure of Streptavidin using first 40 frames (corresponding to about 40 e/A^2 total dose) 提交 2021-03-21 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.77 Å |
| 7EFD 1.77 A cryo-EM structure of Streptavidin using first 40 frames (corresponding to about 40 e/A^2 total dose) 提交 2021-03-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.77 Å |
| 7EFD 1.77 A cryo-EM structure of Streptavidin using first 40 frames (corresponding to about 40 e/A^2 total dose) 提交 2021-03-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | BTN BIOTIN × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.77 Å |
| 7EK8 Crystal structure of apo streptavidin at ambient temperature 提交 2021-04-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–160（123 aa）
链 B
38–160（123 aa）
链 C
38–160（123 aa）
链 D
38–160（123 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；Pact PremierTM 100 mM MMT buffer pH 6.0 and 25 % w/v PEG 1500
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.224 |
| 7EK9 Crystal structure of apo streptavidin at cryogenic temperature 提交 2021-04-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–160（123 aa）
链 B
38–160（123 aa）
链 C
38–160（123 aa）
链 D
38–160（123 aa）
|
未记录 | MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 3 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 6；294 K；Pact PremierTM 100 mM MMT buffer, PEG 1500
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.187 |
| 7KBY Artificial Metalloproteins with Dinuclear Iron Centers 提交 2020-10-03 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：K121A, L124Y | KM3 {N-(4-{bis[(pyridin-2-yl-kappaN)methyl]amino-kappaN}butyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}iron(3+) × 4 CYN CYANIDE ION × 4 ACT ACETATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；26 mg/mL
2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 4
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.224 |
| 7KBZ Artificial Metalloproteins with Dinuclear Iron Centers 提交 2020-10-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
链 C
38–183（146 aa）
链 D
38–183（146 aa）
|
突变：K121A, L124Y 突变：K121A, L124Y 突变：K121A, L124Y 突变：K121A, L124Y | KM3 {N-(4-{bis[(pyridin-2-yl-kappaN)methyl]amino-kappaN}butyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide}iron(3+) × 4 CYN CYANIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；26 mg/mL
2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 4
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.245 |
| 7KNL Artificial Metalloproteins with Dinuclear Iron Centers 提交 2020-11-04 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：K121A, L124Y | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；2.0 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Sodium Acetate pH 4
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.241 |
| 7NLV WILDTYPE CORE-STREPTAVIDIN WITH a conjugated BIOTINYLATED PYRROLIDINE II 提交 2021-02-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 AAA
37–163（127 aa）
链 BBB
37–163（127 aa）
链 CCC
37–163（127 aa）
链 DDD
37–163（127 aa）
|
未记录 | UJE 5-((3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)-N-((S)-pyrrolidin-3-yl)pentanamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25 mg/mL protein in deionised water is mixed at equal volume with 52% MPD.
|
分辨率 1.29 Å R-free 0.247 |
| 7ZOF Streptavidin Iron-Porphyrin 提交 2022-04-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
链 C
38–183（146 aa）
链 D
38–183（146 aa）
|
未记录 | JLL (2R)-2-[5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxidanylidene-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]-3-[[(5Z,10Z,14Z,19Z)-15-[[[(2R)-2-[5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxidanylidene-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]-3-sulfo-propanoyl]amino]methyl]-1,4,21,23-tetrahydroporphyrin-5-yl]methylamino]-3-oxidanylidene-propane-1-sulfonic acid × 2 IMD IMIDAZOLE × 4 FE FE (III) ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M MIB 7 pH (Buffer)
22.5 %v/v PEG 1500 (Precipitant)
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.203 |
| 7ZX9 Streptavidin with a fluorescent substrate 提交 2022-05-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–183（145 aa）
|
未记录 | K9D 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-[2-[6-(3,4-dihydro-1~{H}-isoquinolin-2-yl)-1,3-bis(oxidanylidene)benzo[de]isoquinolin-2-yl]ethyl]pentanamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate
26 mg/ml protein
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.199 |
| 7ZXZ dithiol-ligand bound to streptavidin 提交 2022-05-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–183（145 aa）
链 B
39–183（145 aa）
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 K9R 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-[(1~{R},3~{S})-3-[3,5-bis(sulfanylmethyl)phenyl]-2,4-bis(oxidanylidene)cyclopentyl]pentanamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1 M MIB, 25 % w/v PEG 1500
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.204 |
| 8AQD Hydrophobic probe bound to Streptavidin - 1 提交 2022-08-12 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | N9O 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-[2-[6-(dimethylamino)-1,3-bis(oxidanylidene)benzo[de]isoquinolin-2-yl]ethyl]pentanamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；25 w/v% PEG 3350
0.1 M sodium acetate pH 4.0
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.240 |
| 8AQJ Hydrophobic probe bound to Streptavidin - 2 提交 2022-08-12 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | N9O 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-[2-[6-(dimethylamino)-1,3-bis(oxidanylidene)benzo[de]isoquinolin-2-yl]ethyl]pentanamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；25 % w/v PEG 3350
0.1 M sodium acetate pH 4.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.234 |
| 8AQO Streptavidin with a bisbiothinilated Fe4S4 cluster 提交 2022-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
链 C
38–183（146 aa）
链 D
38–183（146 aa）
|
未记录 | NUI 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-[2-[[20-[2-[5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]ethanoylamino]-2$l^{3},4,12,14$l^{3},16,24,25$l^{3},27$l^{3}-octathia-1$l^{4},3$l^{4},13$l^{4},15$l^{4}-tetraferranonacyclo[11.11.1.1^{1,13}.1^{6,10}.1^{18,22}.0^{2,15}.0^{3,14}.0^{3,25}.0^{15,27}]octacosa-6(28),7,9,18,20,22(26)-hexaen-8-yl]amino]-2-oxidanylidene-ethyl]pentanamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；25 % w/v PEG 1500
0.1 M boric acid pH 8.5
(anaerobic)
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.217 |
| 8AQX streptavidin mutant S112I with an iridium catalyst for CH activation 提交 2022-08-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
链 C
38–183（146 aa）
链 D
38–183（146 aa）
|
未记录 | NOF tert-butyl 7'-[5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxidanylidene-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]-1-chloranyl-2,3,4,5,6-pentamethyl-spiro[1$l^{8}-iridapentacyclo[2.2.0.0^{1,3}.0^{1,5}.0^{2,6}]hexane-1,2'-3-aza-1-azonia-2$l^{8}-iridatricyclo[6.3.1.0^{4,12}]dodeca-1(11),4,6,8(12),9-pentaene]-3'-carboxylate × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M NaCl
0.1 M BIS-TRIS 6.5 pH
25 % w/v PEG 3350
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.211 |
| 8AQY streptavidin mutant S112A with an iridium catalyst for CH activation 提交 2022-08-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
链 C
38–183（146 aa）
链 D
38–183（146 aa）
|
未记录 | NOF tert-butyl 7'-[5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxidanylidene-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]-1-chloranyl-2,3,4,5,6-pentamethyl-spiro[1$l^{8}-iridapentacyclo[2.2.0.0^{1,3}.0^{1,5}.0^{2,6}]hexane-1,2'-3-aza-1-azonia-2$l^{8}-iridatricyclo[6.3.1.0^{4,12}]dodeca-1(11),4,6,8(12),9-pentaene]-3'-carboxylate × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES 7.5 pH
10 % w/v PEG 8K
8 % v/v EG
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.201 |
| 8BY0 streptavidin mutant S112I K121R with an iridium catalyst for CH activation 提交 2022-12-11 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
未记录 | NOF tert-butyl 7'-[5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxidanylidene-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]-1-chloranyl-2,3,4,5,6-pentamethyl-spiro[1$l^{8}-iridapentacyclo[2.2.0.0^{1,3}.0^{1,5}.0^{2,6}]hexane-1,2'-3-aza-1-azonia-2$l^{8}-iridatricyclo[6.3.1.0^{4,12}]dodeca-1(11),4,6,8(12),9-pentaene]-3'-carboxylate × 4 SO4 SULFATE ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；2.0 M ammonium sulfate
0.1 M sodium acetate
(soaking under pH 6.0)
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.251 |
| 8BY1 streptavidin with an iridium catalyst for CH activation 提交 2022-12-11 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–158（120 aa）
|
未记录 | NOF tert-butyl 7'-[5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxidanylidene-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]-1-chloranyl-2,3,4,5,6-pentamethyl-spiro[1$l^{8}-iridapentacyclo[2.2.0.0^{1,3}.0^{1,5}.0^{2,6}]hexane-1,2'-3-aza-1-azonia-2$l^{8}-iridatricyclo[6.3.1.0^{4,12}]dodeca-1(11),4,6,8(12),9-pentaene]-3'-carboxylate × 4 SO4 SULFATE ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；2 M ammonium sulfate
0.1 M sodium acetate
(soaking at pH 6.0)
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.195 |
| 8CRN Streptavidin S112Y Co-TAML artificial metalloenzyme 提交 2023-03-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–183（145 aa）
链 B
39–183（145 aa）
链 C
39–183（145 aa）
链 D
39–183（145 aa）
|
未记录 | VJL Co-linked Tetra-amido macrocyclic ligand × 4 NA SODIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M sodium acetate pH 4.0
2 M ammonium sulfate
soaking with pH change to pH 6.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.208 |
| 8CRP Streptavidin WT Co-TAML artificial metalloenzyme 提交 2023-03-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–183（145 aa）
链 B
39–183（145 aa）
链 C
39–183（145 aa）
链 D
39–183（145 aa）
|
未记录 | VJL Co-linked Tetra-amido macrocyclic ligand × 4 SO4 SULFATE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；2 M ammonium sulfate,
0.1 M sodium acetate pH 4.0
for soaking pH adjustment to pH 6.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.214 |
| 8GOG Structure of streptavidin mutant (S112Y-K121E) complexed with biotin-cyclopentadienyl-rhodium (III)(Cp*-Rh(III)) 提交 2022-08-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–157（119 aa）
链 B
39–157（119 aa）
|
突变：S112Y,K121E 突变：S112Y,K121E | RH3 RHODIUM(III) ION × 8 JSU trichloro((3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-4-[(5~{R})-5-oxidanyl-5-[2-(2,3,4,5-tetramethylcyclopenta-2,4-dien-1-ylidene)ethylamino]pentyl]-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-2-one)rhodium(3+) × 4 GOL GLYCEROL × 18 CL CHLORIDE ION × 8 SO4 SULFATE ION × 10 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.7；291 K；0.2 M sodium sulfate pH 6.7 with 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.294 |
| 8GVK Cryo-EM structure of streptavidin 提交 2022-09-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.20 Å |
| 8HRM Cryo-EM structure of streptavidin 提交 2022-12-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
40–158（119 aa）
链 B
40–158（119 aa）
链 C
40–158（119 aa）
链 D
40–158（119 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.56 Å |
| 8OJW Streptavidin WT artificial metalloenzyme for carboamination 提交 2023-03-25 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–159（122 aa）
|
未记录 | 0OD trichloro{(1,2,3,4,5-eta)-1,2,3,4-tetramethyl-5-[2-({5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoyl}amino)ethyl]cyclopentadienyl}rhodium(1+) × 4 CL CHLORIDE ION × 4 SO4 SULFATE ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；2.0 M ammonium sulfate
0.1 M sodium acetate
-> soaking experiment by pH adjustment to pH 6.0
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.202 |
| 8OJX Streptavidin S112YK121E artificial metalloenzyme for carboamination 提交 2023-03-25 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–158（121 aa）
|
未记录 | 0OD trichloro{(1,2,3,4,5-eta)-1,2,3,4-tetramethyl-5-[2-({5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoyl}amino)ethyl]cyclopentadienyl}rhodium(1+) × 4 IR IRIDIUM ION × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；2 M ammonium sulfate
0.1 M sodium acetate pH 4.0
-> for soaking pH adjustment to pH 6.0
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.197 |
| 8P5Y Artificial transfer hydrogenase with a Mn-12 cofactor and Streptavidin S112Y-K121M mutant 提交 2023-05-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–183（145 aa）
链 B
39–183（145 aa）
链 C
39–183（145 aa）
链 D
39–183（145 aa）
|
突变：S112Y-K121M 突变：S112Y-K121M 突变：S112Y-K121M 突变：S112Y-K121M | WZQ 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-[2-(3,4-dihydro-2~{H}-pyrano[2,3-c]pyridin-6-ylmethylamino)ethyl]pentanamide × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 BR BROMIDE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Sodium/potassium phosphate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 15 % v/v PEG, Smear High, 10 % v/v Ethylene glycol
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.265 |
| 8P5Z Artificial transfer hydrogenase with a Mn-5 cofactor and Streptavidin S112Y-K121M mutant 提交 2023-05-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
链 C
38–183（146 aa）
链 D
38–183（146 aa）
|
突变：S112Y-K121M 突变：S112Y-K121M 突变：S112Y-K121M 突变：S112Y-K121M | X08 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-[2-[(5-methylpyridin-2-yl)methylamino]ethyl]pentanamide × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 BR BROMIDE ION × 4 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；291 K；0.15 M Lithium sulfate, 0.05 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Bis-Tris pH = 6.8, 25 % v/v PEG Smear Low
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.218 |
| 8PXG Structure of Streptactin, solved at wavelength 2.75 A 提交 2023-07-23 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–163（126 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 28 GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；3 M sodium chloride, 0.1 citric acid, pH 3.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.194 |
| 8QEX Streptavidin variant with a cobalt catalyst for CH metal-catalyzed hydrogen-atom-transfer (M-HAT) 提交 2023-09-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–71（33 aa）
链 A
78–183（106 aa）
链 B
39–71（33 aa）
链 B
78–183（106 aa）
|
未记录 | UFU cobalt Streptavidin × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.05 M Citric acid, 19 % w/v PEG 1000, 0.1 M Lithium sulfate, 0.05 M Sodium phosphate dibasic dihydrate
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.254 |
| 8QQ3 Streptavidin with a Ni-cofactor 提交 2023-10-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–183（145 aa）
链 B
39–183（145 aa）
链 C
39–183（145 aa）
链 D
39–183（145 aa）
|
未记录 | WKF 4-[4-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]butylamino]-~{N}1,~{N}1'-di(quinolin-8-yl)cyclohexane-1,1-dicarboxamide × 4 NI NICKEL (II) ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M sodium acetate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 30% w/v PEG 4K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.191 |
| 8TY0 Streptavidin variant S112E-K121H bound to bis-biotinylated Iron-porphyrin 提交 2023-08-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
链 B
38–183（146 aa）
链 C
38–183（146 aa）
链 D
38–183（146 aa）
|
未记录 | SIK Bis-biotinylated Iron-porphyrin × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 4.5 , 20% PEG 4000
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.191 |
| 8XG4 X-ray crystal structure of streptavidin flash-cooled in 30% glycerol at ambient pressure 提交 2023-12-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
链 D
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
|
未记录 | PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 1 GOL GLYCEROL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG1,000
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.169 |
| 8XG4 X-ray crystal structure of streptavidin flash-cooled in 30% glycerol at ambient pressure 提交 2023-12-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
链 C
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
|
未记录 | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG1,000
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.169 |
| 8XG5 X-ray crystal structure of streptavidin flash-cooled in 30% PEG1000 at ambient pressure 提交 2023-12-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
39–159（121 aa）
片段：Avidin-like
链 D
39–159（121 aa）
片段：Avidin-like
|
未记录 | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG 1000
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.183 |
| 8XG5 X-ray crystal structure of streptavidin flash-cooled in 30% PEG1000 at ambient pressure 提交 2023-12-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
39–159（121 aa）
片段：Avidin-like
链 C
39–159（121 aa）
片段：Avidin-like
|
未记录 | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG 1000
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.183 |
| 8XG6 X-ray crystal structure of Streptavidine without cryo-protectant using a high-pressure cryocooling method 提交 2023-12-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
39–159（121 aa）
片段：Avidin-like
链 D
39–159（121 aa）
片段：Avidin-like
|
未记录 | PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG 1000
|
分辨率 1.31 Å R-free 0.182 |
| 8XG6 X-ray crystal structure of Streptavidine without cryo-protectant using a high-pressure cryocooling method 提交 2023-12-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
39–159（121 aa）
片段：Avidin-like
链 C
39–159（121 aa）
片段：Avidin-like
|
未记录 | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG 1000
|
分辨率 1.31 Å R-free 0.182 |
| 8Y23 X-ray crystal structure of ALiS4-Streptavidine complex without cryo-protectant using a high-pressure cryocooling method 提交 2024-01-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–159（121 aa）
链 B
39–159（121 aa）
链 C
39–159（121 aa）
链 D
39–159（121 aa）
|
未记录 | 6FX methyl 5-(4-oxidanylidene-5~{H}-furo[3,2-c]pyridin-2-yl)pyridine-3-carboxylate × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG 1000
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.193 |
| 8Y24 X-ray crystal structure of ALiS4-Streptavidine complex with 10% glycerol using a high-pressure cryocooling method 提交 2024-01-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–159（121 aa）
链 B
39–159（121 aa）
链 C
39–159（121 aa）
链 D
39–159（121 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 GOL GLYCEROL × 5 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG 1000
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.184 |
| 8Y25 X-ray crystal structure of ALiS4-Streptavidine complex with 20% glycerol using a high-pressure cryocooling method 提交 2024-01-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–159（121 aa）
链 B
39–159（121 aa）
链 C
39–159（121 aa）
链 D
39–159（121 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 6 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG 1000
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.188 |
| 8Y26 X-ray crystal structure of ALiS5-Streptavidine complex without cryo-protectant using a high-pressure cryocooling method 提交 2024-01-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
链 B
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
链 C
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
链 D
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 A1LXQ dimethyl 5-(4-oxidanylidene-5~{H}-furo[3,2-c]pyridin-2-yl)benzene-1,3-dicarboxylate × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG 1000
|
分辨率 1.23 Å R-free 0.176 |
| 8Y27 X-ray crystal structure of ALiS5-Streptavidine complex with 10% glycerol using a high-pressure cryocooling method 提交 2024-01-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
链 B
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
链 C
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
链 D
39–159（121 aa）
片段：UNP residues 39-159
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 GOL GLYCEROL × 3 A1LXQ dimethyl 5-(4-oxidanylidene-5~{H}-furo[3,2-c]pyridin-2-yl)benzene-1,3-dicarboxylate × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG1,000
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.185 |
| 8Y28 X-ray crystal structure of ALiS5-Streptavidine complex with 20% glycerol using a high-pressure cryocooling method 提交 2024-01-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–159（121 aa）
链 B
39–159（121 aa）
链 C
39–159（121 aa）
链 D
39–159（121 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG 1000
|
分辨率 1.33 Å R-free 0.185 |
| 8Y29 X-ray crystal structure of ALiS2-Streptavidine complex without cryo-protectant using a high-pressure cryocooling method 提交 2024-01-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–159（121 aa）
链 B
39–159（121 aa）
链 C
39–159（121 aa）
链 D
39–159（121 aa）
|
未记录 | MT6 methyl 3-(4-oxo-4,5-dihydrofuro[3,2-c]pyridin-2-yl)benzoate × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG1,000
|
分辨率 1.42 Å R-free 0.192 |
| 8Y2A X-ray crystal structure of ALiS2-Streptavidine complex with 10% glycerol using a high-pressure cryocooling method 提交 2024-01-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–159（121 aa）
链 B
39–159（121 aa）
链 C
39–159（121 aa）
链 D
39–159（121 aa）
|
未记录 | MT6 methyl 3-(4-oxo-4,5-dihydrofuro[3,2-c]pyridin-2-yl)benzoate × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG 1000
|
分辨率 1.34 Å R-free 0.184 |
| 8Y2B X-ray crystal structure of ALiS2-Streptavidine complex with 20% glycerol using a high-pressure cryocooling method 提交 2024-01-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–159（121 aa）
链 B
39–159（121 aa）
链 C
39–159（121 aa）
链 D
39–159（121 aa）
|
未记录 | MT6 methyl 3-(4-oxo-4,5-dihydrofuro[3,2-c]pyridin-2-yl)benzoate × 2 GOL GLYCEROL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG 1000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.179 |
| 8ZR1 Cocrystallization of engineered streptavidin with A9 oligo DNA 提交 2024-06-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–163（125 aa）
链 B
39–163（125 aa）
链 C
39–163（125 aa）
链 D
39–163（125 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 8；298 K；10 mM Tris-HCl
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.281 |
| 8ZR2 Cocrystallization of engineered streptavidin with C9 oligo DNA 提交 2024-06-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–163（125 aa）
链 B
39–163（125 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 8；298 K；20 mM Tris-HCl
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.346 |
| 8ZR2 Cocrystallization of engineered streptavidin with C9 oligo DNA 提交 2024-06-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 C
39–163（125 aa）
链 D
39–163（125 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 8；298 K；20 mM Tris-HCl
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.346 |
| 9CST Streptavidin-E101Q-K121A bound to Cu(II)-biotin-ethyl-dipicolylamine cofactor 提交 2024-07-24 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：E101Q, K121A | QG7 N-(2-{bis[(pyridin-2-yl)methyl]amino}ethyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide × 4 CU COPPER (II) ION × 16 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 1.13 Å R-free 0.160 |
| 9CSU Streptavidin-E101Q-S112Y-K121A bound to Cu(II)-biotin-ethyl-dipicolylamine cofactor 提交 2024-07-24 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：E101Q, S112Y, K121A | ACY ACETIC ACID × 4 QG7 N-(2-{bis[(pyridin-2-yl)methyl]amino}ethyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide × 4 CU COPPER (II) ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.207 |
| 9CSV Streptavidin-E101Q-S112Y-K121A bound to Cu(II)-biotin-ethyl-dipicolylamine cofactor, oxidized by hydrogen peroxide 提交 2024-07-24 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：E101Q, S112Y, K121A | QG7 N-(2-{bis[(pyridin-2-yl)methyl]amino}ethyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide × 4 CU COPPER (II) ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.234 |
| 9CSW Streptavidin-E101Q-S112A-K121Y bound to Cu(II)-biotin-ethyl-dipicolylamine cofactor 提交 2024-07-24 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：E101Q, S112A, K121Y | QG7 N-(2-{bis[(pyridin-2-yl)methyl]amino}ethyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide × 4 CU COPPER (II) ION × 8 ACY ACETIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.189 |
| 9E6Z Streptavidin-E101Q-S112F-K121A bound to Cu(II)-biotin-ethyl-dipicolylamine cofactor 提交 2024-10-31 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：E101Q, S112F, K121A | QG7 N-(2-{bis[(pyridin-2-yl)methyl]amino}ethyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide × 4 ACY ACETIC ACID × 4 CU COPPER (II) ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；296 K；ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.219 |
| 9EC5 Streptavidin-S112C-L124F bound to Cu(II)dpea cofactor, containing S-nitrosocysteine modification 提交 2024-11-13 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：E14Q, S112C, L124F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1BIA N-(3-{bis[2-(pyridin-2-yl)ethyl]amino}propyl)-5-[(3aR,4R,6aS)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide × 4 CU COPPER (II) ION × 8 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.228 |
| 9EDF Streptavidin-S112C-L124F bound to Cu(II)dpea cofactor 提交 2024-11-17 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：S112C, L124F | A1BIA N-(3-{bis[2-(pyridin-2-yl)ethyl]amino}propyl)-5-[(3aR,4R,6aS)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide × 4 CU COPPER (II) ION × 12 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.183 |
| 9EDG Streptavidin-WT bound to Cu(II)dpea cofactor 提交 2024-11-17 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
片段：UNP residues 33-183
|
未记录 | A1BIA N-(3-{bis[2-(pyridin-2-yl)ethyl]amino}propyl)-5-[(3aR,4R,6aS)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide × 4 ACT ACETATE ION × 4 CU COPPER (II) ION × 8 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.197 |
| 9EDH Streptavidin-S112C-T114F bound to Cu(II)dpea cofactor 提交 2024-11-17 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：S112C, T114F | A1BIA N-(3-{bis[2-(pyridin-2-yl)ethyl]amino}propyl)-5-[(3aR,4R,6aS)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide × 4 CU COPPER (II) ION × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.222 |
| 9EDI Streptavidin-S112C-L124A bound to Cu(II)dpea cofactor 提交 2024-11-17 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：S112C, L124A | A1BIA N-(3-{bis[2-(pyridin-2-yl)ethyl]amino}propyl)-5-[(3aR,4R,6aS)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide × 4 CU COPPER (II) ION × 12 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.202 |
| 9EDK Streptavidin-S112C-T114V bound to Cu(II)dpea cofactor 提交 2024-11-17 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：S112C, T114V | A1BIA N-(3-{bis[2-(pyridin-2-yl)ethyl]amino}propyl)-5-[(3aR,4R,6aS)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide × 4 CU COPPER (II) ION × 16 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.190 |
| 9EDU Streptavidin-S112C bound to Cu(II)dpea cofactor 提交 2024-11-18 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–183（146 aa）
|
突变：S112C | A1BIA N-(3-{bis[2-(pyridin-2-yl)ethyl]amino}propyl)-5-[(3aR,4R,6aS)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide × 4 ACT ACETATE ION × 4 CU COPPER (II) ION × 12 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.183 |
| 9FFJ Artificial metalloenzyme with a nickel-based 1,10-phenanthroline cofactor and streptavidin N49M-S112V mutant 提交 2024-05-23 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–183（145 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 A1ICD N-methyl-N-[(4,4,6,6-tetrahydroxy-4,6-dioxido-1,3,3a,5,6a-tetrahydrothien[3,4-d]imidazol-4-ium-2-yl)methyl]-5-(2,4,4-trihydroxy-2-keto-3,3a,5,6-tetrahydro-1H-thien[3,4-d]imidazol-4-ium-6-yl × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 8 SO4 SULFATE ION × 8 NH4 AMMONIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；11% w/v PEG 8000 0.1M MES 6.0 0.24M Ammonium sulfate
|
分辨率 1.27 Å R-free 0.197 |
| 9FNR Artificial metalloenzyme with a nickel-based 1,10-phenanthroline cofactor and streptavidin S112V mutant 提交 2024-06-10 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–183（145 aa）
|
未记录 | A1ICD N-methyl-N-[(4,4,6,6-tetrahydroxy-4,6-dioxido-1,3,3a,5,6a-tetrahydrothien[3,4-d]imidazol-4-ium-2-yl)methyl]-5-(2,4,4-trihydroxy-2-keto-3,3a,5,6-tetrahydro-1H-thien[3,4-d]imidazol-4-ium-6-yl × 4 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；1.6M Magnesium sulfate heptahydrate,0.1M HEPES 7.2, 6% v/v Glycerol
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.206 |
| 9FOA Artificial photoenzyme with anthraquinone cofactor and wild type streptavidin 提交 2024-06-11 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 D
39–183（145 aa）
|
未记录 | A1ID2 ~{N}-[4-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]butyl]-9,10-bis(oxidanylidene)anthracene-2-carboxamide × 4 GOL GLYCEROL × 8 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.2M Ammonium sulfate, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.182 |
| 9I4R N-terminal Oic streptag II in Sav E44V-S45T-V47R-D67A-K121R variant 提交 2025-01-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
39–183（145 aa）
链 C
39–183（145 aa）
链 D
39–183（145 aa）
链 E
39–183（145 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.2M Ammonium citrate dibasic, 20% w/v PEG 3350
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分辨率 1.84 Å R-free 0.213 |
| 9MFZ Streptavidin-E101Q-K121A-L124E bound to Fe(III)-biotin-pentyl-dipicolylamine cofactor 提交 2024-12-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
38–158（121 aa）
链 B
38–158（121 aa）
链 C
38–158（121 aa）
链 D
38–158（121 aa）
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突变：E101Q, K121A, L124E 突变：E101Q, K121A, L124E 突变：E101Q, K121A, L124E 突变：E101Q, K121A, L124E | A1BLH N-(5-{bis[(pyridin-2-yl)methyl]amino}pentyl)-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide × 4 FE FE (III) ION × 8 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；ammonium sulfate, sodium acetate
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分辨率 1.55 Å R-free 0.189 |
| 9PUA L-Biotin-streptavidin binding 提交 2025-07-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 J
37–163（127 aa）
链 L
37–163（127 aa）
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未记录 | A1CK6 5-[(3aR,4R,6aS)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoic acid × 4 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；294 K；1 micro-liter protein containing 3 mM Biotin in 10 mM Tris-HCl pH 7.0 mixed with 1 micro-liter 38% Ammonium Sulfate, 100 mM Na-Acetate pH 4.5, 200 mM NaCl at 21C (294 K)
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分辨率 0.94 Å R-free 0.147 |
| 9PUB Biotin-streptavidin binding 提交 2025-07-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 J
37–163（127 aa）
链 K
37–163（127 aa）
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未记录 | BTN BIOTIN × 4 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；294 K；1 micro-liter protein containing 3 mM Biotin in 10 mM Tris-HCl pH 7.0 mixed with 1 micro-liter 38% Ammonium Sulfate, 100 mM Na-Acetate pH 4.5, 200 mM NaCl at 21C (294 K)
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分辨率 0.95 Å R-free 0.145 |
| 9QNE Streptavidin with a thiophenol cofactor as artificial hydrogen atom transferase 提交 2025-03-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–183（145 aa）
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未记录 | A1I7Y 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-(3-sulfanylphenyl)pentanamide × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 24 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M MES pH 5.5, 25 % w/v PEG 4K, 0.15 M (NH4)2SO4
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分辨率 1.84 Å R-free 0.202 |
| 9QNP Streptavidin K121W with a thiophenol cofactor as artificial hydrogen atom transferase 提交 2025-03-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–183（145 aa）
链 B
39–183（145 aa）
链 C
39–183（145 aa）
链 D
39–183（145 aa）
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未记录 | A1I7Y 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-(3-sulfanylphenyl)pentanamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10 % w/v PEG 1K, 10 % w/v PEG 8K
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分辨率 2.30 Å R-free 0.254 |
| 9QNZ Streptavidin 112Y-121W-124F with a thiophenol cofactor as artificial hydrogen atom transferase 提交 2025-03-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–183（145 aa）
链 B
39–183（145 aa）
链 C
39–183（145 aa）
链 D
39–183（145 aa）
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未记录 | A1I7Y 5-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-~{N}-(3-sulfanylphenyl)pentanamide × 4 ACT ACETATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.15 M NH4 acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 45 % v/v MPD
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分辨率 1.88 Å R-free 0.201 |
| 9QO7 Streptavidin K121M with a thiophenol cofactor as artificial hydrogen atom transferase 提交 2025-03-25 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
39–183（145 aa）
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未记录 | A1I8C ~{N}-[4-[(3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-1,3,3~{a},4,6,6~{a}-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]butyl]-3-sulfanyl-benzamide × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；1 M Na3 citrate, 0.1 M Na cacodylate pH 6.5
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分辨率 2.00 Å R-free 0.278 |
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| UniProt名称 | SAV_STRAV |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 14–159； UniProt 38–183 |
