SAXSdb — 6f1z

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 o； UniProt 1–612 链 p； UniProt 1–612	未记录	Dynein light chain roadblock-type 1 × 2 （Q9NP97）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6F1Z	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5JPW Molecular basis for protein recognition specificity of the DYNLT1/Tctex1 canonical binding groove. Characterization of the interaction with activin receptor IIB 提交 2016-05-04	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 134–154（21 aa）片段：UNP residues 1-113,UNP residues 134-154 链 B 134–154（21 aa）片段：UNP residues 1-113,UNP residues 134-154	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；压力 1 NMR样品组成 100 uM DYNLT1/Tctex1-DIC chimera, 100 mM potassium phosphate, 1 mM DTT, 50 uM DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 100 uM [U-99% 15N] DYNLT1/Tctex1-DIC chimera, 100 mM potassium phosphate, 1 mM DTT, 50 uM DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 100 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] DYNLT1/Tctex1-DIC chimera, 100 mM potassium phosphate, 1 mM DTT, 50 uM DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
6F1T Cryo-EM structure of two dynein tail domains bound to dynactin and BICDR1 提交 2017-11-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：45-meric	链 g 1–612（612 aa）链 h 1–612（612 aa）链 o 1–612（612 aa）链 p 1–612（612 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
6F1U N terminal region of dynein tail domains in complex with dynactin filament and BICDR-1 提交 2017-11-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 h 1–612（612 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
6F38 Cryo-EM structure of two dynein tail domains bound to dynactin and HOOK3 提交 2017-11-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：45-meric	链 g 1–612（612 aa）链 h 1–612（612 aa）链 o 1–612（612 aa）链 p 1–612（612 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.70 Å
6F3A Cryo-EM structure of a single dynein tail domain bound to dynactin and BICD2N 提交 2017-11-28	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 g 1–612（612 aa）链 h 1–612（612 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.20 Å
7Z8F Composite structure of dynein-dynactin-BICDR on microtubules 提交 2022-03-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 43 PDB 声明：43-meric	链 g 1–638（638 aa）链 h 1–638（638 aa）链 o 1–638（638 aa）链 p 1–638（638 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 13 MG MAGNESIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ZN ZINC ION × 3 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；20 second incubation	分辨率 20.00 Å
7Z8I The barbed end complex of dynactin bound to BICDR1 and the cytoplasmic dynein tails (A2, B1, B2) 提交 2022-03-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric	链 h 1–638（638 aa）链 o 1–638（638 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；20 second incubation	分辨率 3.30 Å
7Z8J Cytoplasmic dynein (A2) bound to BICDR1 提交 2022-03-17	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 h 1–638（638 aa）链 o 1–638（638 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；20 second incubation	分辨率 3.93 Å
7Z8K Cytoplasmic dynein (A1) bound to BICDR1 提交 2022-03-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 h 72–638（567 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；20 second incubation	分辨率 4.37 Å
8PQW Cytoplasmic dynein-1 motor domain bound to dynactin-p150glued and LIS1 提交 2023-07-12	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 H 1–612（612 aa）链 I 1–612（612 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
8PQZ Cytoplasmic dynein-1 A1/A2 motor domains bound to LIS1 提交 2023-07-12	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 H 1–612（612 aa）链 I 1–612（612 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.50 Å
8PR0 Cytoplasmic dynein-A heavy chain bound to dynactin-p150glued and IC-LC tower 提交 2023-07-12	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 C 1–612（612 aa）链 D 1–612（612 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.40 Å
8PR1 Cytoplasmic dynein-B heavy chain bound to IC-LC tower 提交 2023-07-12	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 I 1–612（612 aa）链 J 1–612（612 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.20 Å
8PR2 Cytoplasmic dynein-1 heavy chain bound to JIP3-LZI 提交 2023-07-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 h 1–612（612 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8PR3 Cytoplasmic dynein-1 heavy chain bound to JIP3-RH1 提交 2023-07-12	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 h 1–612（612 aa）链 o 1–612（612 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8PTK Composite structure of Dynein-Dynactin-JIP3-LIS1 提交 2023-07-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：53-meric	链 g 1–612（612 aa）链 h 1–612（612 aa）链 o 1–612（612 aa）链 p 1–612（612 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 6 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.00 Å
9BLY Composite structure of full-length human dynein-1 in phi-particle conformation 提交 2024-05-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 C 1–638（638 aa）链 D 1–638（638 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2；25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9E12 Full-length human dynein-1 in phi comformation under Lis1 condition 提交 2024-10-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–638（638 aa）链 D 1–638（638 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
9E13 Full-length human dynein-1 in phi-like comformation bound to a Lis1 dimer under Lis1 condition 提交 2024-10-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 C 1–638（638 aa）链 D 1–638（638 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2；25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 3 mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
9E14 Full-length human dynein-1 in phi-like comformation bound to a Lis1 dimer under Nde1-Lis1 condition 提交 2024-10-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 C 1–638（638 aa）链 D 1–638（638 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2；25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 3 mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.00 Å
9E23 Cryo-EM structure of Pre-Chi dynein tail 提交 2024-10-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric	链 D 1–612（612 aa）链 H 1–612（612 aa）链 g 1–612（612 aa）链 h 1–612（612 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 6.20 Å
9E28 Cryo-EM structure of Phi dynein tail 提交 2024-10-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric	链 D 1–612（612 aa）链 H 1–612（612 aa）链 g 1–612（612 aa）链 h 1–612（612 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.40 Å
9HHL Structure of Dynein-Dynactin-NuMA-LIS1 提交 2024-11-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：41-meric	链 g 1–612（612 aa）链 h 1–612（612 aa）链 o 1–612（612 aa）链 p 1–612（612 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.53 Å
9YNC Motor domains of phi-like human dynein-1 bound to dynactin-p150glued and LIS1 提交 2025-10-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 G 1–638（638 aa）链 H 1–638（638 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.93 Å
9YND Motor domain of human dynein-1 in pre-power stroke bound to dynactin-p150glued-CC1B and LIS1 提交 2025-10-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 F 1–638（638 aa）链 G 1–638（638 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.26 Å
9YNE Motor domain of human dynein-1 in pre-power stroke bound to dynactin-p150glued-CC1B-ICD and LIS1 提交 2025-10-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 D 1–638（638 aa）链 E 1–638（638 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.46 Å
9YNG Dynactin and dynein-1 tail region of dynein-dynactin complex on microtubule in the presence of LIS1 提交 2025-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric	链 g 1–638（638 aa）链 h 1–638（638 aa）链 o 1–638（638 aa）链 p 1–638（638 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
9YNH Full-length human cytoplasmic dynein-1 in phi-like state bound to dynactin-p150glued and LIS1 提交 2025-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 C 1–638（638 aa）链 D 1–638（638 aa）链 U 1–638（638 aa）链 V 1–638（638 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.50 Å

共 28 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DC1I2_HUMAN
Isoform	Q13409-3
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 o； PDB构建体 1–612； UniProt 1–612 作者链 p； PDB构建体 1–612； UniProt 1–612

Dynein light chain roadblock-type 1

Homo sapiens

UniProt Q9NP97

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 s； UniProt 1–96 链 t； UniProt 1–96	未记录	Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 × 2 （Q13409）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6F1Z	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1Z09 Solution structure of km23 提交 2005-03-01	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–96（96 aa）片段：LC7 Dynein Light Chain KM23 链 B 1–96（96 aa）片段：LC7 Dynein Light Chain KM23	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；315 K；离子强度（mmCIF原始值）0 M NaCl；压力 ambient NMR样品组成 1 mM 15N_Km23; 25 mM Sodium Acetate; pH 6.0; 95 % H2O; 5 % D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1 mM 13C,15N_Km23; 25 mM Sodium Acetate; pH 6.0; 95 % H2O; 5 % D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
2B95 Solution NMR structure of protein dynein light chain 2A, cytoplasmic; Northeast structural genomics consortium TARGET HR2106 提交 2005-10-10	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 0–95（96 aa）链 B 0–95（96 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；298 K；压力 ambient NMR样品组成 1.3mM DYNEIN LIGHT CHAIN 2A, U-15N, 13C, 50 mM MES, 95% H2O, 5% D2O, 0.02% NaN3, pH 6.0 \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
2E8J Solution structure of dynein light chain 2A 提交 2007-01-21	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–96（96 aa）链 B 1–96（96 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；压力 ambient NMR样品组成 0.6mM DL2A U-15, 13C; 20mM phosphate buffer NA; 20mM NaCl; 0.1mM EDTA; 95% H2O, 5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 0.6mM DL2A U-15, 13C; 20mM phosphate buffer NA; 20mM NaCl; 0.1mM EDTA; 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2HZ5 Crystal structure of human dynein light chain Dnlc2A 提交 2006-08-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 0–95（96 aa）链 B 0–95（96 aa）	未记录	CS CESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；298 K；28% PEG 4000, 0.1M CeCl, 0.1M Tris, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.229
2HZ5 Crystal structure of human dynein light chain Dnlc2A 提交 2006-08-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 0–95（96 aa）链 B 0–95（96 aa）	未记录	CS CESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；298 K；28% PEG 4000, 0.1M CeCl, 0.1M Tris, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.229
6F1T Cryo-EM structure of two dynein tail domains bound to dynactin and BICDR1 提交 2017-11-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：45-meric	链 k 1–96（96 aa）链 l 1–96（96 aa）链 s 1–96（96 aa）链 t 1–96（96 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
6F38 Cryo-EM structure of two dynein tail domains bound to dynactin and HOOK3 提交 2017-11-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：45-meric	链 k 1–96（96 aa）链 l 1–96（96 aa）链 s 1–96（96 aa）链 t 1–96（96 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.70 Å
6F3A Cryo-EM structure of a single dynein tail domain bound to dynactin and BICD2N 提交 2017-11-28	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 k 1–96（96 aa）链 l 1–96（96 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.20 Å
6RLB Structure of the dynein-2 complex; tail domain 提交 2019-05-01	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 G 1–96（96 aa）链 H 1–96（96 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
6SC2 Structure of the dynein-2 complex; IFT-train bound model 提交 2019-07-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 G 1–96（96 aa）链 H 1–96（96 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7Z8F Composite structure of dynein-dynactin-BICDR on microtubules 提交 2022-03-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 43 PDB 声明：43-meric	链 k 1–96（96 aa）链 l 1–96（96 aa）链 s 1–96（96 aa）链 t 1–96（96 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 13 MG MAGNESIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ZN ZINC ION × 3 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；20 second incubation	分辨率 20.00 Å
8J07 96nm repeat of human respiratory doublet microtubule and associated axonemal complexes 提交 2023-04-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 974 PDB 声明：974-meric	链 k4 1–96（96 aa）链 m4 1–96（96 aa）链 o4 1–96（96 aa）链 q4 1–96（96 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 285 MG MAGNESIUM ION × 285 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 289	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8PR1 Cytoplasmic dynein-B heavy chain bound to IC-LC tower 提交 2023-07-12	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 s 1–96（96 aa）链 t 1–96（96 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.20 Å
8PTK Composite structure of Dynein-Dynactin-JIP3-LIS1 提交 2023-07-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：53-meric	链 s 1–96（96 aa）链 t 1–96（96 aa）链 w 1–96（96 aa）链 z 1–96（96 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 6 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.00 Å
8RGG Structure of dynein-2 intermediate chain DYNC2I2 (WDR34) in complex with dynein-2 heavy chain DYNC2H1. 提交 2023-12-13	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 G 1–96（96 aa）链 H 1–96（96 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8RGH Structure of dynein-2 intermediate chain DYNC2I1 (WDR60) in complex with the dynein-2 heavy chain DYNC2H1. 提交 2023-12-13	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 1–96（96 aa）链 H 1–96（96 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
9BLY Composite structure of full-length human dynein-1 in phi-particle conformation 提交 2024-05-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 G 1–96（96 aa）链 H 1–96（96 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2；25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9E12 Full-length human dynein-1 in phi comformation under Lis1 condition 提交 2024-10-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 G 1–96（96 aa）链 H 1–96（96 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
9E13 Full-length human dynein-1 in phi-like comformation bound to a Lis1 dimer under Lis1 condition 提交 2024-10-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 G 1–96（96 aa）链 H 1–96（96 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2；25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 3 mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
9E14 Full-length human dynein-1 in phi-like comformation bound to a Lis1 dimer under Nde1-Lis1 condition 提交 2024-10-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 G 1–96（96 aa）链 H 1–96（96 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2；25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 3 mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.00 Å
9E23 Cryo-EM structure of Pre-Chi dynein tail 提交 2024-10-21	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric	链 E 1–96（96 aa）链 F 1–96（96 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 6.20 Å
9E28 Cryo-EM structure of Phi dynein tail 提交 2024-10-21	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric	链 E 1–96（96 aa）链 F 1–96（96 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.40 Å
9HHL Structure of Dynein-Dynactin-NuMA-LIS1 提交 2024-11-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：41-meric	链 s 1–96（96 aa）链 t 1–96（96 aa）链 w 1–96（96 aa）链 z 1–96（96 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.53 Å
9YNH Full-length human cytoplasmic dynein-1 in phi-like state bound to dynactin-p150glued and LIS1 提交 2025-10-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 G 1–96（96 aa）链 H 1–96（96 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.50 Å

共 23 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DLRB1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 s； PDB构建体 1–96； UniProt 1–96 作者链 t； PDB构建体 1–96； UniProt 1–96

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6f1z
沉积日期 deposition_date	2017-11-23
结构标题 title	Roadblock-1 region of the dynein tail/dynactin/BICDR1 complex
关键词 keywords	Cryo-EM, Complex, MOTOR PROTEIN; MOTOR PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	21.07 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	19.97 Å
零角强度 I(0) i0	16255900.00
分子量 molecular_weight	30372.0 kDa
排除体积 excluded_volume	38194 Å³
包络体积 envelope_volume	48696 Å³
水化壳体积 shell_volume	20756 Å³
包络直径 envelope_diameter	75.6 Å
壳层 Rg shell_rg	26.35 Å
包络 Rg envelope_rg	20.32 Å
形状 Rg shape_rg	19.99 Å
总 Rg total_rg	20.91 Å
总原子数 total_atoms	2138
残基数 n_residues	265
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	74.9 Å
Rg (实空间) rg_real	21.07 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.49 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.6260e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.9400e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	21.07 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	16260000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8344
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	24.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.466
峰度 Kurtosis kurtosis	0.115
角度范围 angular_range	— – 0.3750 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	4924000.0000
实空间数据点数 n_real_points	69
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.626; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.971; Smooth: 0.993

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2
分子量 formula_weight	68442.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	o,p
原子数 atom_count	2138

MSDKSELKAELERKKQRLAQIREEKKRKEEERKKKETDQKKEAVAPVQEESDLEKKRREAEALLQSMGLTPESPIVPPPMSPSSKSVSTPSEAGSQDSGDGAVGSRRGPIKLGMAKITQVDFPPREIVTYTKETQTPVMAQPKEDEEEDDDVVAPKPPIEPEEEKTLKKDEENDSKAPPHELTEEEKQQILHSEEFLSFFDHSTRIVERALSEQINIFFDYSGRDLEDKEGEIQAGAKLSLNRQFFDERWSKHRVVSCLDWSSQYPELLVASYNNNEDAPHEPDGVALVWNMKYKKTTPEYVFHCQSAVMSATFAKFHPNLVVGGTYSGQIVLWDNRSNKRTPVQRTPLSAAAHTHPVYCVNVVGTQNAHNLISISTDGKICSWSLDMLSHPQDSMELVHKQSKAVAVTSMSFPVGDVNNFVVGSEEGSVYTACRHGSKAGISEMFEGHQGPITGIHCHAAVGAVDFSHLFVTSSFDWTVKLWSTKNNKPLYSFEDNAGYVYDVMWSPTHPALFACVDGMGRLDLWNLNNDTEVPTASISVEGNPALNRVRWTHSGREIAVGDSEGQIVIYDVGEQIAVPRNDEWARFGRTLAEINANRADAEEEAATRIPA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Dynein light chain roadblock-type 1
分子量 formula_weight	10934.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	s,t

MAEVEETLKRLQSQKGVQGIIVVNTEGIPIKSTMDNPTTTQYASLMHSFILKARSTVRDIDPQNDLTFLRIRSKKNEIMVAPDKDYFLIVIQNPTE

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	6f1zs00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	450 — Beta-Lactamase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Dynein light chain 2a, cytoplasmic

结构域编号 domain_id	6f1zt00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	450 — Beta-Lactamase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Dynein light chain 2a, cytoplasmic

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.40 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	77136

fit	/app/data/saxs_computation/f1/6f1z/6f1z.fit
pddf	/app/data/pr_computation/f1/6f1z/6f1z.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/f1/6f1z/6f1z.dat

Roadblock-1 region of the dynein tail/dynactin/BICDR1 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Dynein light chain roadblock-type 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)