6gaz

Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 28S ribosomal subunit.

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 218.1 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Translation initiation factor IF-2, mitochondrial

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 BC； UniProt 78–727	未记录	Mitochondrial ribosomal protein L19 × 1 （I3LNJ0） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Mitochondrial ribosomal protein S5 × 1 （F1SU66） Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （I3LEJ9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） Mitochondrial ribosomal protein S9 × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） Mitochondrial ribosomal protein S15 × 1 （A0A287BMP0） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S17 × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） Mitochondrial ribosomal protein S21 × 1 （A0A286ZNB3） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （I3LK09） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （F1RG19） Mitochondrial ribosomal protein S35 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S37 × 1 （F1SU49） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） Mitochondrial ribosomal protein S39 × 1 （K7GKS8） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric	链 BC 78–727（650 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6GB2 Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 39S ribosomal subunit. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：62-meric	链 BC 78–727（650 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 216 ZN ZINC ION × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 2 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6RW5 Structure of human mitochondrial 28S ribosome in complex with mitochondrial IF2 and IF3 提交 2019-06-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：33-meric	链 7 38–727（690 aa）	未记录	NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 1 SRY STREPTOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 61 K POTASSIUM ION × 17 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.14 Å
7PO2 Initiation complex of human mitochondrial ribosome small subunit with IF2, fMet-tRNAMet and mRNA 提交 2021-09-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 7 1–727（727 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 72 K POTASSIUM ION × 20 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.09 Å
8QRN mt-SSU in GTPBP8 knock-out cells, state 4 提交 2023-10-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 7 38–727（690 aa）	未记录	NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 1 SRY STREPTOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 58 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.98 Å
9G5E Translation-initiation state of human mitochondrial ribosome small subunit (State F) 提交 2024-07-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：32-meric	链 7 1–727（727 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 45 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES-HCl, 100mM KCl, 20mM MgCl2, 0.02% DDM, 1mM PMSF, 1x protease-inhibitor mix, 0.5mM GMP-PNP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9HFN Translation-initiation state of human mitochondrial ribosome small subunit (State E) 提交 2024-11-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：33-meric	链 7 1–727（727 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 45 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES-HCl, 100mM KCl, 20mM MgCl2, 0.02% DDM, 1mM PMSF, 1x protease-inhibitor mix, 0.5mM GMP-PNP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9HFO Translation-initiation state of human mitochondrial ribosome small subunit (State G) 提交 2024-11-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 7 1–727（727 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 45 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES-HCl, 100mM KCl, 20mM MgCl2, 0.02% DDM, 1mM PMSF, 1x protease-inhibitor mix, 0.5mM GMP-PNP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9IGT Assembly intermediate of human mitochondrial ribosome small subunit bound to METTL15, RBFA, and mtIF2 (State M2.1) 提交 2025-02-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric	链 7 37–727（691 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.96 Å
9OJM Human mitochondrial 28S PIC with tRNA and mtIF2 提交 2025-05-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 7 157–727（571 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 72 K POTASSIUM ION × 20 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å

共 10 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IF2M_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 BC； PDB构建体 8–657； UniProt 78–727

Mitochondrial ribosomal protein L19

物种未注明

UniProt I3LNJ0

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 BT； UniProt 12–303	未记录	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial × 1 （P46199） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Mitochondrial ribosomal protein S5 × 1 （F1SU66） Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （I3LEJ9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） Mitochondrial ribosomal protein S9 × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） Mitochondrial ribosomal protein S15 × 1 （A0A287BMP0） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S17 × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） Mitochondrial ribosomal protein S21 × 1 （A0A286ZNB3） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （I3LK09） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （F1RG19） Mitochondrial ribosomal protein S35 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S37 × 1 （F1SU49） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） Mitochondrial ribosomal protein S39 × 1 （K7GKS8） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4CE4 39S large subunit of the porcine mitochondrial ribosome 提交 2013-11-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric	链 T 1–292（292 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH PH 7.9, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 20 MM MGCL2；pH 7.9；20 MM HEPES-KOH PH 7.9, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 20 MM MGCL2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；MANUAL BLOTTING FOLLOWED BY MANUAL PLUNGING INTO LIQUID ETHANE	分辨率 4.90 Å
4V19 Structure of the large subunit of the mammalian mitoribosome, part 1 of 2 提交 2014-09-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：32-meric	链 T 1–292（292 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 169	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE	分辨率 3.40 Å
5AJ4 Structure of the 55S mammalian mitoribosome. 提交 2015-02-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric	链 BT 1–292（292 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 351 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE	分辨率 3.80 Å
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric	链 BT 12–303（292 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric	链 BT 12–303（292 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric	链 BT 12–303（292 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 BT 12–303（292 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 BT 12–303（292 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7NSH 39S mammalian mitochondrial large ribosomal subunit with mtRRF (post) and mtEFG2 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：61-meric	链 BT 12–303（292 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 221 ZN ZINC ION × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.20 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 BT 12–303（292 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric	链 BT 12–303（292 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric	链 BX 1–303（303 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
8OIP 28S mammalian mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 BX 1–303（303 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
8OIQ 39S mammalian mitochondrial large ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：62-meric	链 BX 1–303（303 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 205 K POTASSIUM ION × 30 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å

共 14 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	I3LNJ0_PIG
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 BT； PDB构建体 1–292； UniProt 12–303

Mitochondrial ribosomal protein S2

物种未注明

UniProt F1S001

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 AB； UniProt 1–289	未记录	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial × 1 （P46199） Mitochondrial ribosomal protein L19 × 1 （I3LNJ0） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Mitochondrial ribosomal protein S5 × 1 （F1SU66） Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （I3LEJ9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） Mitochondrial ribosomal protein S9 × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） Mitochondrial ribosomal protein S15 × 1 （A0A287BMP0） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S17 × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） Mitochondrial ribosomal protein S21 × 1 （A0A286ZNB3） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （I3LK09） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （F1RG19） Mitochondrial ribosomal protein S35 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S37 × 1 （F1SU49） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） Mitochondrial ribosomal protein S39 × 1 （K7GKS8） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5AJ3 Structure of the small subunit of the mammalian mitoribosome 提交 2015-02-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：37-meric	链 B 1–289（289 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 144 ZN ZINC ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE	分辨率 3.60 Å
5AJ4 Structure of the 55S mammalian mitoribosome. 提交 2015-02-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric	链 AB 55–274（220 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 351 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE	分辨率 3.80 Å
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric	链 AB 1–289（289 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric	链 AB 1–289（289 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric	链 AB 1–289（289 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AB 1–289（289 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AB 1–289（289 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AB 1–289（289 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric	链 AB 1–289（289 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric	链 Ab 1–289（289 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
8OIP 28S mammalian mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 Ab 1–289（289 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å

共 11 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	F1S001_PIG
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 AB； PDB构建体 1–289； UniProt 1–289

Mitochondrial ribosomal protein S24

物种未注明

UniProt A0A287ANU4

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 AC； UniProt 1–167	未记录	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial × 1 （P46199） Mitochondrial ribosomal protein L19 × 1 （I3LNJ0） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Mitochondrial ribosomal protein S5 × 1 （F1SU66） Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （I3LEJ9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） Mitochondrial ribosomal protein S9 × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） Mitochondrial ribosomal protein S15 × 1 （A0A287BMP0） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S17 × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） Mitochondrial ribosomal protein S21 × 1 （A0A286ZNB3） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （I3LK09） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （F1RG19） Mitochondrial ribosomal protein S35 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S37 × 1 （F1SU49） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） Mitochondrial ribosomal protein S39 × 1 （K7GKS8） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric	链 AC 1–167（167 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric	链 AC 1–167（167 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric	链 AC 1–167（167 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AC 1–167（167 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AC 1–167（167 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AC 1–167（167 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric	链 AC 1–167（167 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric	链 AC 1–167（167 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
8OIP 28S mammalian mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 AC 1–167（167 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A287ANU4_PIG
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 AC； PDB构建体 1–167； UniProt 1–167

Mitochondrial ribosomal protein S5

物种未注明

UniProt F1SU66

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 AE； UniProt 1–430	未记录	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial × 1 （P46199） Mitochondrial ribosomal protein L19 × 1 （I3LNJ0） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （I3LEJ9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） Mitochondrial ribosomal protein S9 × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） Mitochondrial ribosomal protein S15 × 1 （A0A287BMP0） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S17 × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） Mitochondrial ribosomal protein S21 × 1 （A0A286ZNB3） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （I3LK09） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （F1RG19） Mitochondrial ribosomal protein S35 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S37 × 1 （F1SU49） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） Mitochondrial ribosomal protein S39 × 1 （K7GKS8） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5AJ3 Structure of the small subunit of the mammalian mitoribosome 提交 2015-02-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：37-meric	链 E 1–430（430 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 144 ZN ZINC ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE	分辨率 3.60 Å
5AJ4 Structure of the 55S mammalian mitoribosome. 提交 2015-02-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric	链 AE 88–430（343 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 351 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE	分辨率 3.80 Å
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric	链 AE 1–430（430 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric	链 AE 1–430（430 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric	链 AE 1–430（430 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AE 1–430（430 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AE 1–430（430 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AE 1–430（430 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric	链 AE 1–430（430 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric	链 Ad 1–430（430 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
8OIP 28S mammalian mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 Ad 1–430（430 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å

共 11 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	F1SU66_PIG
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 AE； PDB构建体 1–430； UniProt 1–430

Mitochondrial ribosomal protein S6

物种未注明

UniProt I3LEJ9

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 AF； UniProt 1–124	未记录	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial × 1 （P46199） Mitochondrial ribosomal protein L19 × 1 （I3LNJ0） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Mitochondrial ribosomal protein S5 × 1 （F1SU66） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） Mitochondrial ribosomal protein S9 × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） Mitochondrial ribosomal protein S15 × 1 （A0A287BMP0） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S17 × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） Mitochondrial ribosomal protein S21 × 1 （A0A286ZNB3） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （I3LK09） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （F1RG19） Mitochondrial ribosomal protein S35 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S37 × 1 （F1SU49） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） Mitochondrial ribosomal protein S39 × 1 （K7GKS8） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric	链 AF 1–124（124 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric	链 AF 1–276（276 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric	链 AF 1–276（276 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AF 1–276（276 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AF 1–276（276 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AF 1–276（276 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric	链 AF 1–276（276 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	I3LEJ9_PIG
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 AF； PDB构建体 1–124； UniProt 1–124

Mitochondrial ribosomal protein S7

物种未注明

UniProt A0A286ZJ25

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 AG； UniProt 1–242	未记录	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial × 1 （P46199） Mitochondrial ribosomal protein L19 × 1 （I3LNJ0） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Mitochondrial ribosomal protein S5 × 1 （F1SU66） Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （I3LEJ9） Mitochondrial ribosomal protein S9 × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） Mitochondrial ribosomal protein S15 × 1 （A0A287BMP0） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S17 × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） Mitochondrial ribosomal protein S21 × 1 （A0A286ZNB3） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （I3LK09） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （F1RG19） Mitochondrial ribosomal protein S35 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S37 × 1 （F1SU49） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） Mitochondrial ribosomal protein S39 × 1 （K7GKS8） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric	链 AG 1–242（242 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric	链 AG 1–242（242 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric	链 AG 1–242（242 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AG 1–240（240 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AG 1–242（242 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AG 1–242（242 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric	链 AG 1–242（242 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric	链 AF 1–242（242 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
8OIP 28S mammalian mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 AF 1–242（242 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A286ZJ25_PIG
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 AG； PDB构建体 1–242； UniProt 1–242

Mitochondrial ribosomal protein S9

物种未注明

UniProt I3LU08

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 AI； UniProt 1–397	未记录	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial × 1 （P46199） Mitochondrial ribosomal protein L19 × 1 （I3LNJ0） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Mitochondrial ribosomal protein S5 × 1 （F1SU66） Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （I3LEJ9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） Mitochondrial ribosomal protein S15 × 1 （A0A287BMP0） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S17 × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） Mitochondrial ribosomal protein S21 × 1 （A0A286ZNB3） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （I3LK09） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （F1RG19） Mitochondrial ribosomal protein S35 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S37 × 1 （F1SU49） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） Mitochondrial ribosomal protein S39 × 1 （K7GKS8） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric	链 AI 1–397（397 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric	链 AI 1–397（397 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric	链 AI 1–397（397 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AI 1–397（397 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AI 1–397（397 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AI 1–397（397 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric	链 AI 1–397（397 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric	链 Ag 1–397（397 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
8OIP 28S mammalian mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 Ag 1–397（397 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	I3LU08_PIG
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 AI； PDB构建体 1–397； UniProt 1–397

Mitochondrial ribosomal protein S10

物种未注明

UniProt F1RUU2

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 AJ； UniProt 1–201	未记录	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial × 1 （P46199） Mitochondrial ribosomal protein L19 × 1 （I3LNJ0） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Mitochondrial ribosomal protein S5 × 1 （F1SU66） Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （I3LEJ9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） Mitochondrial ribosomal protein S9 × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） Mitochondrial ribosomal protein S15 × 1 （A0A287BMP0） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S17 × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） Mitochondrial ribosomal protein S21 × 1 （A0A286ZNB3） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （I3LK09） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （F1RG19） Mitochondrial ribosomal protein S35 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S37 × 1 （F1SU49） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） Mitochondrial ribosomal protein S39 × 1 （K7GKS8） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric	链 AJ 1–201（201 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric	链 AJ 1–200（200 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric	链 AJ 1–200（200 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AJ 1–200（200 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AJ 1–200（200 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AJ 1–200（200 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric	链 AJ 1–200（200 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric	链 AH 1–200（200 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
8OIP 28S mammalian mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 AH 1–200（200 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	F1RUU2_PIG
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 AJ； PDB构建体 1–201； UniProt 1–201

Mitochondrial ribosomal protein S11

物种未注明

UniProt A0A286ZJJ6

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 AK； UniProt 1–196	未记录	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial × 1 （P46199） Mitochondrial ribosomal protein L19 × 1 （I3LNJ0） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Mitochondrial ribosomal protein S5 × 1 （F1SU66） Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （I3LEJ9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） Mitochondrial ribosomal protein S9 × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） Mitochondrial ribosomal protein S15 × 1 （A0A287BMP0） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S17 × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） Mitochondrial ribosomal protein S21 × 1 （A0A286ZNB3） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （I3LK09） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （F1RG19） Mitochondrial ribosomal protein S35 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S37 × 1 （F1SU49） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） Mitochondrial ribosomal protein S39 × 1 （K7GKS8） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric	链 AK 1–196（196 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric	链 AK 1–196（196 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric	链 AK 1–196（196 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AK 1–196（196 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AK 1–196（196 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AK 1–196（196 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric	链 AK 1–196（196 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric	链 Ai 1–196（196 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
8OIP 28S mammalian mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 Ai 1–196（196 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A286ZJJ6_PIG
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 AK； PDB构建体 1–196； UniProt 1–196

Mitochondrial ribosomal protein S12

物种未注明

UniProt A0A0M3KL52

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 AL； UniProt 1–139	未记录	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial × 1 （P46199） Mitochondrial ribosomal protein L19 × 1 （I3LNJ0） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Mitochondrial ribosomal protein S5 × 1 （F1SU66） Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （I3LEJ9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） Mitochondrial ribosomal protein S9 × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） Mitochondrial ribosomal protein S15 × 1 （A0A287BMP0） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S17 × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） Mitochondrial ribosomal protein S21 × 1 （A0A286ZNB3） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （I3LK09） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （F1RG19） Mitochondrial ribosomal protein S35 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S37 × 1 （F1SU49） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） Mitochondrial ribosomal protein S39 × 1 （K7GKS8） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric	链 AL 1–139（139 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric	链 AL 1–139（139 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric	链 AL 1–139（139 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AL 1–139（139 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AL 1–139（139 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AL 1–139（139 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric	链 AL 1–139（139 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric	链 AJ 1–139（139 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
8OIP 28S mammalian mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 AJ 1–139（139 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A0M3KL52_PIG
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 AL； PDB构建体 1–139； UniProt 1–139

Mitochondrial ribosomal protein S14

物种未注明

UniProt A0A0M3KL53

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 AN； UniProt 1–128	未记录	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial × 1 （P46199） Mitochondrial ribosomal protein L19 × 1 （I3LNJ0） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Mitochondrial ribosomal protein S5 × 1 （F1SU66） Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （I3LEJ9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） Mitochondrial ribosomal protein S9 × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S15 × 1 （A0A287BMP0） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S17 × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） Mitochondrial ribosomal protein S21 × 1 （A0A286ZNB3） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （I3LK09） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （F1RG19） Mitochondrial ribosomal protein S35 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S37 × 1 （F1SU49） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） Mitochondrial ribosomal protein S39 × 1 （K7GKS8） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric	链 AN 1–128（128 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric	链 AN 1–128（128 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric	链 AN 1–128（128 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AN 1–128（128 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AN 1–128（128 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AN 1–128（128 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric	链 AN 1–128（128 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric	链 AK 1–128（128 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
8OIP 28S mammalian mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 AK 1–128（128 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A0M3KL53_PIG
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 AN； PDB构建体 1–128； UniProt 1–128

Mitochondrial ribosomal protein S15

物种未注明

UniProt A0A287BMP0

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 AO； UniProt 1–239	未记录	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial × 1 （P46199） Mitochondrial ribosomal protein L19 × 1 （I3LNJ0） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Mitochondrial ribosomal protein S5 × 1 （F1SU66） Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （I3LEJ9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） Mitochondrial ribosomal protein S9 × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S17 × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） Mitochondrial ribosomal protein S21 × 1 （A0A286ZNB3） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （I3LK09） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （F1RG19） Mitochondrial ribosomal protein S35 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S37 × 1 （F1SU49） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） Mitochondrial ribosomal protein S39 × 1 （K7GKS8） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric	链 AO 1–239（239 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric	链 AO 1–239（239 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric	链 AO 1–239（239 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AO 1–239（239 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AO 1–239（239 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric	链 AO 1–239（239 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å

共 6 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A287BMP0_PIG
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 AO； PDB构建体 1–239； UniProt 1–239

Mitochondrial ribosomal protein S17

物种未注明

UniProt F1RIU0

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 AQ； UniProt 1–130	未记录	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial × 1 （P46199） Mitochondrial ribosomal protein L19 × 1 （I3LNJ0） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Mitochondrial ribosomal protein S5 × 1 （F1SU66） Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （I3LEJ9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） Mitochondrial ribosomal protein S9 × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） Mitochondrial ribosomal protein S15 × 1 （A0A287BMP0） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） Mitochondrial ribosomal protein S21 × 1 （A0A286ZNB3） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （I3LK09） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （F1RG19） Mitochondrial ribosomal protein S35 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S37 × 1 （F1SU49） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） Mitochondrial ribosomal protein S39 × 1 （K7GKS8） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5AJ3 Structure of the small subunit of the mammalian mitoribosome 提交 2015-02-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：37-meric	链 Q 1–130（130 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 144 ZN ZINC ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE	分辨率 3.60 Å
5AJ4 Structure of the 55S mammalian mitoribosome. 提交 2015-02-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric	链 AQ 2–110（109 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 351 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE	分辨率 3.80 Å
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric	链 AQ 1–130（130 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric	链 AQ 1–130（130 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric	链 AQ 1–130（130 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AQ 1–130（130 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AQ 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AQ 1–130（130 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric	链 AQ 1–130（130 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8OIP 28S mammalian mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 AN 1–130（130 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å

共 10 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	F1RIU0_PIG
Isoform	—
PDB实体	16
链与序列区间	作者链 AQ； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130

Mitochondrial ribosomal protein S18C

物种未注明

UniProt A0A0M3KL54

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 AR； UniProt 1–143	未记录	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial × 1 （P46199） Mitochondrial ribosomal protein L19 × 1 （I3LNJ0） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Mitochondrial ribosomal protein S5 × 1 （F1SU66） Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （I3LEJ9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） Mitochondrial ribosomal protein S9 × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） Mitochondrial ribosomal protein S15 × 1 （A0A287BMP0） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S17 × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S21 × 1 （A0A286ZNB3） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （I3LK09） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （F1RG19） Mitochondrial ribosomal protein S35 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S37 × 1 （F1SU49） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） Mitochondrial ribosomal protein S39 × 1 （K7GKS8） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric	链 AR 1–143（143 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric	链 AR 1–143（143 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric	链 AR 1–143（143 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AR 1–143（143 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AR 1–143（143 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AR 1–143（143 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric	链 AR 1–143（143 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric	链 AP 1–143（143 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
8OIP 28S mammalian mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 AP 1–143（143 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A0M3KL54_PIG
Isoform	—
PDB实体	17
链与序列区间	作者链 AR； PDB构建体 1–143； UniProt 1–143

Mitochondrial ribosomal protein S21

物种未注明

UniProt A0A286ZNB3

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 AU； UniProt 1–87	未记录	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial × 1 （P46199） Mitochondrial ribosomal protein L19 × 1 （I3LNJ0） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Mitochondrial ribosomal protein S5 × 1 （F1SU66） Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （I3LEJ9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） Mitochondrial ribosomal protein S9 × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） Mitochondrial ribosomal protein S15 × 1 （A0A287BMP0） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S17 × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （I3LK09） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （F1RG19） Mitochondrial ribosomal protein S35 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S37 × 1 （F1SU49） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） Mitochondrial ribosomal protein S39 × 1 （K7GKS8） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric	链 AU 1–87（87 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric	链 AU 1–87（87 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric	链 AU 1–87（87 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AU 1–87（87 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AU 1–87（87 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 AU 1–87（87 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric	链 AU 1–87（87 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric	链 AQ 1–87（87 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
8OIP 28S mammalian mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 AQ 1–87（87 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	A0A286ZNB3_PIG
Isoform	—
PDB实体	18
链与序列区间	作者链 AU； PDB构建体 1–87； UniProt 1–87

Mitochondrial ribosomal protein S22

物种未注明

UniProt A0A287AQT5

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 Aa； UniProt 1–382	未记录	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial × 1 （P46199） Mitochondrial ribosomal protein L19 × 1 （I3LNJ0） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Mitochondrial ribosomal protein S5 × 1 （F1SU66） Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （I3LEJ9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） Mitochondrial ribosomal protein S9 × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） Mitochondrial ribosomal protein S15 × 1 （A0A287BMP0） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S17 × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） Mitochondrial ribosomal protein S21 × 1 （A0A286ZNB3） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （I3LK09） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （F1RG19） Mitochondrial ribosomal protein S35 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S37 × 1 （F1SU49） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） Mitochondrial ribosomal protein S39 × 1 （K7GKS8） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric	链 Aa 1–382（382 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric	链 Aa 1–382（382 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric	链 Aa 1–382（382 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Aa 1–382（382 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Aa 1–382（382 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Aa 1–382（382 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric	链 Aa 1–382（382 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric	链 AR 1–382（382 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
8OIP 28S mammalian mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 AR 1–382（382 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A287AQT5_PIG
Isoform	—
PDB实体	22
链与序列区间	作者链 Aa； PDB构建体 1–382； UniProt 1–382

Mitochondrial ribosomal protein S23

物种未注明

UniProt A0A287AEW3

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 Ab； UniProt 1–190	未记录	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial × 1 （P46199） Mitochondrial ribosomal protein L19 × 1 （I3LNJ0） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Mitochondrial ribosomal protein S5 × 1 （F1SU66） Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （I3LEJ9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） Mitochondrial ribosomal protein S9 × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） Mitochondrial ribosomal protein S15 × 1 （A0A287BMP0） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S17 × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） Mitochondrial ribosomal protein S21 × 1 （A0A286ZNB3） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （I3LK09） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （F1RG19） Mitochondrial ribosomal protein S35 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S37 × 1 （F1SU49） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） Mitochondrial ribosomal protein S39 × 1 （K7GKS8） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric	链 Ab 1–190（190 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric	链 Ab 1–190（190 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric	链 Ab 1–190（190 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Ab 1–190（190 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Ab 1–190（190 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric	链 Ab 1–190（190 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric	链 AS 1–190（190 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
8OIP 28S mammalian mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 AS 1–190（190 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A287AEW3_PIG
Isoform	—
PDB实体	23
链与序列区间	作者链 Ab； PDB构建体 1–190； UniProt 1–190

Mitochondrial ribosomal protein S25

物种未注明

UniProt A0A0M3KL55

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 Ac； UniProt 1–173	未记录	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial × 1 （P46199） Mitochondrial ribosomal protein L19 × 1 （I3LNJ0） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Mitochondrial ribosomal protein S5 × 1 （F1SU66） Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （I3LEJ9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） Mitochondrial ribosomal protein S9 × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） Mitochondrial ribosomal protein S15 × 1 （A0A287BMP0） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S17 × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） Mitochondrial ribosomal protein S21 × 1 （A0A286ZNB3） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （I3LK09） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （F1RG19） Mitochondrial ribosomal protein S35 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S37 × 1 （F1SU49） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） Mitochondrial ribosomal protein S39 × 1 （K7GKS8） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric	链 Ac 1–173（173 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric	链 Ac 1–173（173 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric	链 Ac 1–173（173 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Ac 1–173（173 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Ac 1–173（173 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Ac 1–173（173 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric	链 Ac 1–173（173 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric	链 AT 1–173（173 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
8OIP 28S mammalian mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 AT 1–173（173 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	A0A0M3KL55_PIG
Isoform	—
PDB实体	24
链与序列区间	作者链 Ac； PDB构建体 1–173； UniProt 1–173

Mitochondrial ribosomal protein S26

物种未注明

UniProt A0A287AY01

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 Ad； UniProt 1–205	未记录	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial × 1 （P46199） Mitochondrial ribosomal protein L19 × 1 （I3LNJ0） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Mitochondrial ribosomal protein S5 × 1 （F1SU66） Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （I3LEJ9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） Mitochondrial ribosomal protein S9 × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） Mitochondrial ribosomal protein S15 × 1 （A0A287BMP0） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S17 × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） Mitochondrial ribosomal protein S21 × 1 （A0A286ZNB3） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （I3LK09） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （F1RG19） Mitochondrial ribosomal protein S35 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S37 × 1 （F1SU49） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） Mitochondrial ribosomal protein S39 × 1 （K7GKS8） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric	链 Ad 1–205（205 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric	链 Ad 1–205（205 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric	链 Ad 1–205（205 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Ad 1–205（205 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Ad 1–205（205 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric	链 Ad 1–205（205 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric	链 AU 1–205（205 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
8OIP 28S mammalian mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 AU 1–205（205 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A287AY01_PIG
Isoform	—
PDB实体	25
链与序列区间	作者链 Ad； PDB构建体 1–205； UniProt 1–205

Mitochondrial ribosomal protein S27

物种未注明

UniProt I3LK09

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 Ae； UniProt 6–395	未记录	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial × 1 （P46199） Mitochondrial ribosomal protein L19 × 1 （I3LNJ0） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Mitochondrial ribosomal protein S5 × 1 （F1SU66） Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （I3LEJ9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） Mitochondrial ribosomal protein S9 × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） Mitochondrial ribosomal protein S15 × 1 （A0A287BMP0） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S17 × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） Mitochondrial ribosomal protein S21 × 1 （A0A286ZNB3） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （F1RG19） Mitochondrial ribosomal protein S35 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S37 × 1 （F1SU49） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） Mitochondrial ribosomal protein S39 × 1 （K7GKS8） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric	链 Ae 1–426（426 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	I3LK09_PIG
Isoform	—
PDB实体	26
链与序列区间	作者链 Ae； PDB构建体 1–390； UniProt 6–395

Mitoribosomal protein ms28, mrps28

物种未注明

UniProt A0A0M3KL56

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 Af； UniProt 1–188	未记录	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial × 1 （P46199） Mitochondrial ribosomal protein L19 × 1 （I3LNJ0） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Mitochondrial ribosomal protein S5 × 1 （F1SU66） Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （I3LEJ9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） Mitochondrial ribosomal protein S9 × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） Mitochondrial ribosomal protein S15 × 1 （A0A287BMP0） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S17 × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） Mitochondrial ribosomal protein S21 × 1 （A0A286ZNB3） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （I3LK09） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （F1RG19） Mitochondrial ribosomal protein S35 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S37 × 1 （F1SU49） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） Mitochondrial ribosomal protein S39 × 1 （K7GKS8） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric	链 Af 1–188（188 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric	链 Af 1–188（188 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric	链 Af 1–188（188 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Af 1–188（188 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Af 1–188（188 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Af 1–188（188 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric	链 Af 1–188（188 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric	链 AW 1–188（188 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
8OIP 28S mammalian mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 AW 1–188（188 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A0M3KL56_PIG
Isoform	—
PDB实体	27
链与序列区间	作者链 Af； PDB构建体 1–188； UniProt 1–188

Death associated protein 3

物种未注明

UniProt I3LS10

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 Ag； UniProt 1–397	未记录	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial × 1 （P46199） Mitochondrial ribosomal protein L19 × 1 （I3LNJ0） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Mitochondrial ribosomal protein S5 × 1 （F1SU66） Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （I3LEJ9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） Mitochondrial ribosomal protein S9 × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） Mitochondrial ribosomal protein S15 × 1 （A0A287BMP0） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S17 × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） Mitochondrial ribosomal protein S21 × 1 （A0A286ZNB3） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （I3LK09） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （F1RG19） Mitochondrial ribosomal protein S35 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S37 × 1 （F1SU49） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） Mitochondrial ribosomal protein S39 × 1 （K7GKS8） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric	链 Ag 1–397（397 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric	链 Ag 1–410（410 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric	链 Ag 1–410（410 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Ag 1–410（410 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Ag 1–410（410 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Ag 1–410（410 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric	链 Ag 1–410（410 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8OIP 28S mammalian mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 AX 1–410（410 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	I3LS10_PIG
Isoform	—
PDB实体	28
链与序列区间	作者链 Ag； PDB构建体 1–397； UniProt 1–397

Mitochondrial ribosomal protein S33

物种未注明

UniProt F1S8G3

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 Ai； UniProt 43–148	未记录	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial × 1 （P46199） Mitochondrial ribosomal protein L19 × 1 （I3LNJ0） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Mitochondrial ribosomal protein S5 × 1 （F1SU66） Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （I3LEJ9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） Mitochondrial ribosomal protein S9 × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） Mitochondrial ribosomal protein S15 × 1 （A0A287BMP0） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S17 × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） Mitochondrial ribosomal protein S21 × 1 （A0A286ZNB3） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （I3LK09） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （F1RG19） Mitochondrial ribosomal protein S35 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S37 × 1 （F1SU49） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） Mitochondrial ribosomal protein S39 × 1 （K7GKS8） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5AJ3 Structure of the small subunit of the mammalian mitoribosome 提交 2015-02-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：37-meric	链 i 1–106（106 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 144 ZN ZINC ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE	分辨率 3.60 Å
5AJ4 Structure of the 55S mammalian mitoribosome. 提交 2015-02-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric	链 Ai 4–102（99 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 351 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE	分辨率 3.80 Å
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric	链 Ai 43–148（106 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric	链 Ai 43–148（106 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric	链 Ai 43–148（106 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Ai 43–148（106 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Ai 43–148（106 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Ai 43–148（106 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric	链 Ai 43–148（106 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric	链 AZ 1–148（148 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
8OIP 28S mammalian mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 AZ 1–148（148 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å

共 11 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	F1S8G3_PIG
Isoform	—
PDB实体	30
链与序列区间	作者链 Ai； PDB构建体 1–106； UniProt 43–148

Mitochondrial ribosomal protein S34

物种未注明

UniProt F1RG19

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 Aj； UniProt 1–218	未记录	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial × 1 （P46199） Mitochondrial ribosomal protein L19 × 1 （I3LNJ0） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Mitochondrial ribosomal protein S5 × 1 （F1SU66） Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （I3LEJ9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） Mitochondrial ribosomal protein S9 × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） Mitochondrial ribosomal protein S15 × 1 （A0A287BMP0） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S17 × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） Mitochondrial ribosomal protein S21 × 1 （A0A286ZNB3） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （I3LK09） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S35 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S37 × 1 （F1SU49） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） Mitochondrial ribosomal protein S39 × 1 （K7GKS8） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric	链 Aj 1–218（218 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	F1RG19_PIG
Isoform	—
PDB实体	31
链与序列区间	作者链 Aj； PDB构建体 1–218； UniProt 1–218

Mitochondrial ribosomal protein S35

物种未注明

UniProt F1SG95

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 Ak； UniProt 42–366	未记录	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial × 1 （P46199） Mitochondrial ribosomal protein L19 × 1 （I3LNJ0） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Mitochondrial ribosomal protein S5 × 1 （F1SU66） Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （I3LEJ9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） Mitochondrial ribosomal protein S9 × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） Mitochondrial ribosomal protein S15 × 1 （A0A287BMP0） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S17 × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） Mitochondrial ribosomal protein S21 × 1 （A0A286ZNB3） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （I3LK09） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （F1RG19） Mitochondrial ribosomal protein S37 × 1 （F1SU49） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） Mitochondrial ribosomal protein S39 × 1 （K7GKS8） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5AJ3 Structure of the small subunit of the mammalian mitoribosome 提交 2015-02-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：37-meric	链 k 1–325（325 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 144 ZN ZINC ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE	分辨率 3.60 Å
5AJ4 Structure of the 55S mammalian mitoribosome. 提交 2015-02-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric	链 Ak 51–325（275 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 351 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE	分辨率 3.80 Å
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric	链 Ak 42–366（325 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric	链 Ak 42–366（325 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric	链 Ak 42–366（325 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Ak 42–366（325 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Ak 42–366（325 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Ak 42–366（325 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric	链 Ak 42–366（325 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric	链 AB 1–366（366 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
8OIP 28S mammalian mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 AB 1–366（366 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å

共 11 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	F1SG95_PIG
Isoform	—
PDB实体	32
链与序列区间	作者链 Ak； PDB构建体 1–325； UniProt 42–366

Mitochondrial ribosomal protein S37

物种未注明

UniProt F1SU49

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 Am； UniProt 1–118	未记录	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial × 1 （P46199） Mitochondrial ribosomal protein L19 × 1 （I3LNJ0） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Mitochondrial ribosomal protein S5 × 1 （F1SU66） Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （I3LEJ9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） Mitochondrial ribosomal protein S9 × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） Mitochondrial ribosomal protein S15 × 1 （A0A287BMP0） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S17 × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） Mitochondrial ribosomal protein S21 × 1 （A0A286ZNB3） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （I3LK09） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （F1RG19） Mitochondrial ribosomal protein S35 × 1 （F1SG95） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） Mitochondrial ribosomal protein S39 × 1 （K7GKS8） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5AJ3 Structure of the small subunit of the mammalian mitoribosome 提交 2015-02-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：37-meric	链 m 1–118（118 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 144 ZN ZINC ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE	分辨率 3.60 Å
5AJ4 Structure of the 55S mammalian mitoribosome. 提交 2015-02-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric	链 Am 2–117（116 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 351 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE	分辨率 3.80 Å
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric	链 Am 1–118（118 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric	链 Am 1–118（118 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric	链 Am 1–118（118 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Am 1–118（118 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Am 1–118（118 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Am 1–118（118 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric	链 Am 1–118（118 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric	链 Ac 1–118（118 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
8OIP 28S mammalian mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 Ac 1–118（118 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å

共 11 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	F1SU49_PIG
Isoform	—
PDB实体	33
链与序列区间	作者链 Am； PDB构建体 1–118； UniProt 1–118

Aurora kinase A interacting protein 1

物种未注明

UniProt A0A287B3R8

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 An； UniProt 1–199	未记录	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial × 1 （P46199） Mitochondrial ribosomal protein L19 × 1 （I3LNJ0） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Mitochondrial ribosomal protein S5 × 1 （F1SU66） Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （I3LEJ9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） Mitochondrial ribosomal protein S9 × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） Mitochondrial ribosomal protein S15 × 1 （A0A287BMP0） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S17 × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） Mitochondrial ribosomal protein S21 × 1 （A0A286ZNB3） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （I3LK09） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （F1RG19） Mitochondrial ribosomal protein S35 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S37 × 1 （F1SU49） Mitochondrial ribosomal protein S39 × 1 （K7GKS8） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric	链 An 1–199（199 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric	链 An 1–199（199 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric	链 An 1–199（199 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 An 1–199（199 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 An 1–199（199 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 An 1–199（199 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric	链 An 1–199（199 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8OIP 28S mammalian mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 AD 1–199（199 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A287B3R8_PIG
Isoform	—
PDB实体	34
链与序列区间	作者链 An； PDB构建体 1–199； UniProt 1–199

Mitochondrial ribosomal protein S39

物种未注明

UniProt K7GKS8

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 Ao； UniProt 1–692	未记录	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial × 1 （P46199） Mitochondrial ribosomal protein L19 × 1 （I3LNJ0） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Mitochondrial ribosomal protein S5 × 1 （F1SU66） Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （I3LEJ9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） Mitochondrial ribosomal protein S9 × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） Mitochondrial ribosomal protein S15 × 1 （A0A287BMP0） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S17 × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） Mitochondrial ribosomal protein S21 × 1 （A0A286ZNB3） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （I3LK09） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （F1RG19） Mitochondrial ribosomal protein S35 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S37 × 1 （F1SU49） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5AJ3 Structure of the small subunit of the mammalian mitoribosome 提交 2015-02-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：37-meric	链 o 1–692（692 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 144 ZN ZINC ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE	分辨率 3.60 Å
5AJ4 Structure of the 55S mammalian mitoribosome. 提交 2015-02-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric	链 Ao 1–143（143 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 351 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE	分辨率 3.80 Å
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric	链 Ao 1–692（692 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric	链 Ao 1–699（699 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric	链 Ao 1–692（692 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Ao 1–699（699 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Ao 1–699（699 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric	链 Ae 1–692（692 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
8OIP 28S mammalian mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 Ae 1–692（692 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	K7GKS8_PIG
Isoform	—
PDB实体	35
链与序列区间	作者链 Ao； PDB构建体 1–692； UniProt 1–692

28S ribosomal protein S18b, mitochondrial

物种未注明

UniProt Q767K8

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物数一致	链 Ap； UniProt 1–258	未记录	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial × 1 （P46199） Mitochondrial ribosomal protein L19 × 1 （I3LNJ0） 12S ribosomal RNA, mitochondrial × 1 Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Mitochondrial ribosomal protein S5 × 1 （F1SU66） Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （I3LEJ9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） Mitochondrial ribosomal protein S9 × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） Mitochondrial ribosomal protein S15 × 1 （A0A287BMP0） bS16m, MRPS16 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S17 × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） Mitochondrial ribosomal protein S21 × 1 （A0A286ZNB3） P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial × 1 MT-CO3 mRNA, mitochondrial × 1 unassigned secondary structure elements × 1 Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （I3LK09） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） mS31, MRPS31 × 1 Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （F1RG19） Mitochondrial ribosomal protein S35 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S37 × 1 （F1SU49） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） Mitochondrial ribosomal protein S39 × 1 （K7GKS8） GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6GAZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5AJ3 Structure of the small subunit of the mammalian mitoribosome 提交 2015-02-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：37-meric	链 p 1–258（258 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 144 ZN ZINC ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE	分辨率 3.60 Å
5AJ4 Structure of the 55S mammalian mitoribosome. 提交 2015-02-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric	链 Ap 51–238（188 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 351 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE	分辨率 3.80 Å
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric	链 Ap 1–258（258 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric	链 Ap 1–258（258 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric	链 Ap 1–258（258 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Ap 1–258（258 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Ap 1–258（258 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric	链 Ap 1–258（258 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric	链 Ap 1–258（258 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric	链 AO 1–258（258 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
8OIP 28S mammalian mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 AO 1–258（258 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å

共 11 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RT18B_PIG
Isoform	—
PDB实体	36
链与序列区间	作者链 Ap； PDB构建体 1–258； UniProt 1–258

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6gaz
沉积日期 deposition_date	2018-04-13
结构标题 title	Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 28S ribosomal subunit.
关键词 keywords	translation initiation, initiation factor IF2, mitochondria, membrane targeting, RIBOSOME; RIBOSOME
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	72.71 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	76.41 Å
零角强度 I(0) i0	23997800000.00
分子量 molecular_weight	1061800.0 kDa
排除体积 excluded_volume	1223600 Å³
包络体积 envelope_volume	2069600 Å³
水化壳体积 shell_volume	221180 Å³
包络直径 envelope_diameter	294.3 Å
壳层 Rg shell_rg	78.04 Å
包络 Rg envelope_rg	75.98 Å
形状 Rg shape_rg	76.61 Å
总 Rg total_rg	75.89 Å
总原子数 total_atoms	73167
残基数 n_residues	7351
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	218.1 Å
Rg (实空间) rg_real	71.40 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.77 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.3580e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	4.3390e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal	72.23 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	23970000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8529
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	79.3 Å
偏度 Skewness skewness	0.373
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.304
角度范围 angular_range	— – 0.1100 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.5140
最高正则化参数 α highest_alpha	1694000000.0000
实空间数据点数 n_real_points	23
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.952; Stabil: 0.994; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.977; Smooth: 0.122

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (44)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Translation initiation factor IF-2, mitochondrial
分子量 formula_weight	72811.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	BC
原子数 atom_count	73172

SGGSGSGWKSQLSSTKSKKVVEVWIGMTIEELARAMEKNTDYVYEALLNTDIDIDSLEADSHLDEVWIKEVITKAGMKLKWSKLKQDKVRKNKDAVRRPQADPALLTPRSPVVTIMGHVDHGKTTLLDKFRKTQVAAVETGGITQHIGAFLVSLPSGEKITFLDTPGHAAFSAMRARGAQVTDIVVLVVAADDGVMKQTVESIQHAKDAQVPIILAVNKCDKAEADPEKVKKELLAYDVVCEDYGGDVQAVPVSALTGDNLMALAEATVALAEMLELKADPNGPVEGTVIESFTDKGRGLVTTAIIQRGTLRKGSVLVAGKCWAKVRLMFDENGKTIDEAYPSMPVGITGWRDLPSAGEEILEVESEPRAREVVDWRKYEQEQEKGQEDLKIIEEKRKEHKEAHQKAREKYGHLLWKKRSILRFLERKEQIPLKPKEKRERDSNVLSVIIKGDVDGSVEAILNIIDTYDASHECELELVHFGVGDVSANDVNLAETFDGVIYGFNVNAGNVIQQSAAKKGVKIKLHKIIYRLVEDLQEELSSRLPCAVEEHPVGEASILATFSVTEGKKKVPVAGCRVQKGQLEKQKKFKLTRNGHVIWKGSLTSLKHHKDDISIVKTGMDCGLSLDEDNMEFQVGDRIVCYEEKQIQAKTSWDPGF

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Mitochondrial ribosomal protein L19
分子量 formula_weight	33441.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	BT

MAASITRGSWAAVGLGQSFPPTRALLPAPASVICRTLAGSGRQQVTGSSEPGAFQPPPKPVIVDKRRPQRPETRFLSPEFIPPRGRTNPLKFQIERKDMLERRKILHIPEFYVGSILRVTTADPYASAKTSQFLGICIQRSGSGLGATFILRNTIEGQGVEICFELYNPRIQEIQVVKLEKRLDNSLLYLRDALPEYSTFDVNMKPITQEFNQEVPVNQLKVKMKPKPWSKRWERPKFNIKGIRFDLCLTEEQMREAQKWSQPWLEFDMMREYDTSKIEAAIWDEIEASKNS

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	12S ribosomal RNA, mitochondrial
分子量 formula_weight	308989.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	AA

ACACAGGUUUGGUCCUGGCCUUUCUAUUAAUUCUUAAUAAAAUUACACAUGCAAGUAUCCGCGCCCCGGUGAGAAUGCCCUCCAGAUCUUAAAGAUCAAAAGGAGCAGGUAUCAAGCACACCUAUAACGGUAGCUCAUAACGCCUUGCUCAACCACACCCCCACGGGAAACAGCAGUGAUAAAAAUUAAGCCAUGAACGAAAGUUUGACUAAGUUAUAUUAAUUAGAGUUGGUAAAUCUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAAUUAAUAGAUCCACGGCGUAAAGAGUGUUUAAGAAAAAAAAUCACAAUAGAGUUAAAUUAUAACUAAGCUGUAAAAAGCCCUAGUUAAAAUAAAAUAACCCACGAAAGUGACUCUAAUAAUCCUGACACACGAUAGCUAGGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCCUAGCCCUAAACCCAAAUAGUUACAUAACAAAACUAUUCGCCAGAGUACUACUCGCAACUGCCUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUCACAUCCACCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUAGACCUUACCAACCCUUGCCAAUUCAGCCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUAAAAAGGAACAAUAGUAAGCACAAUCAUAGCACAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCUUAUGGGUUGGAAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUACAUAAGAAUAUCCACCACACGAAAGUUUUUAUGAAACUAAAAACCAAAGGAGGAUUUAGCAGUAAAUCAAGAAUAGAGUGCUUGAUUGAAUAAGGCCAUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAGCAUGUAGUAAUAAAAAUAACCUAUAUUCAAUUACACAACCAUGCAAGAAGAGACAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGAUUACC

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Mitochondrial ribosomal protein S2
分子量 formula_weight	31731.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AB

MASGPLLPRLLGAGAPRRPLRLHLVPTATPGPAGPTGRTLGSNAAPAAREPELGNDLRDRILSEPLKHADFFNLKELFSVRSLFDARVHLGHKAGCRHRFMEPYLFGSRLGQDIIDLEQTAAHLQLALNFTAHVAYREGIILFVSRHRQFAHLIETTARDCGEYAHTRYFKGGLLTNAPLLLGPGVRLPDLIIFLHTLNNVFEPHVAVRDAAKMNIPTVGIVDTNCNPALITYPVPGNDDSPPAVRLFCRLFQVAISRAKEKRRQVEALYRLQGPAGAERGPAAPPPPE

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Mitochondrial ribosomal protein S24
分子量 formula_weight	18935.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AC

MVASVCGGGLRPLVLSWSRELPCAWRALHISAVCAKNRAARVRVSKGDKPVTYEEAHAPHYIAHRKGWLSLHTGNLDGEDHAAERTVEDVFLRKFMLGTFPGCLADQLVLKRRANQLEICALVLRQLPPHKFYFLVGYSETLLSHFYKCPVHLHLQTVPSKVVYKYI

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Mitochondrial ribosomal protein S5
分子量 formula_weight	48213.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AE

MAAAVRAAGFFPGLFGASAGNLWSRQLYLNTFPAASILTSKTFPSNGPLSPPGTRDNHHFTSLACALQTQCSISSPSNWMGQQYRSYSFFTKLTADELWKGALAESGAGARKGRGKRTKKKRRKDLNRGQIIGEGRHGFLWPGLNIPLMRNGAVQTIAQRSKEDQEKVEADMVQQREEWDRRRKMKVKRERGWSGNTWGGVSLGPPDPGPNGETYDDFDTRILEVRNVFNMTAKEGRKRSVRVLVAVGNGKGAAGFAIGKATERADAFRKAKNRAVHYLHYIERYEDHTIYHDISLKFKRTHIKMKKQPRGYGLHCHRAIMTICRLIGIKDLYAKVSGSVNMLNLTRGLFLGLSRQETHQQLADKKSLHVVEFREECGPLPIVVASPQGALRKDPEPEDEVPDITLDWEDVKAAQGMKRSVWSGLKRAAT

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Mitochondrial ribosomal protein S6
分子量 formula_weight	14283.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AF

MPRYELALILKAMQRPETAAALKRTLEALMDRGAVVRNLENLGERMLPYKISAHNQRHSRGGYFLVDFYAPATTVESMMEHLSRDIDVIRPNIVKHPLTQEVKECEGIVPVPLEEKLYSTKKRK

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Mitochondrial ribosomal protein S7
分子量 formula_weight	28150.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AG

MAAPAVKAARGWSCSALGVRIAVLRFPGLTQVRWSRYGPEYKDPQIDKEYYRKPLAEQTEEEKYERDFKKTQLIKAAPATKTSSVFEDPVISKFTNMMMKGGNKVLARSLMTQTLEAVKRKQFAKYHAASAEEQATIERNPYTIFHQALKNCEPVIGLVPILKGGHFYQVPVPLADRRRRFLAMKWMIAECREKKHRRVLMPEKLSQELLEAFHNQGPVIKRKHDMHKMAEANRALAHYRWW

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Mitochondrial ribosomal protein S9
分子量 formula_weight	45604.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AI

MAAPCVFCGAAVSYRLFLGCRVSFARGQVLWKAAAPELQAGARCQILRLRHTAVVTTKKNVAASRRETYTVDFIKKQIEEFNIGKRHLANMMGEDPETFTQEDIDRAIAYLFPSGLFEKRARPIMKHPEEIFPKQRAIQWGEDGRPFHFLFYTGKQSYYSLMHDTYGKLLDVEKHHNQLRAKDLLAEKTKILKDPIGSRWLIKEELEEMLVEKLSDQDYAQFIRLLERLSALPCGATEEDFVNRFRRSIPIQSKKQLIEPLQYDEQGMAFSRGEGKRKTAKAEVVVYGQGSGRIDVNGVDYLLYFPVTQDREQLMFPLHFLDRLGKHDMTCAVSGGGRSAQAGAVRLAMARALCSFVTEDEVEWMRQAGLLTADPRVRERKKPGQEGARRKFTWKKR

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Mitochondrial ribosomal protein S10
分子量 formula_weight	23192.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AJ

MAARTAFGALARRLWQGSRNFSVSSSRSSTAKNGGFLLSTTMKWVQFSNLHVDVPKDMTKPEITISDEPDTLYKRLSVLVKGHDKAVLDSYEYFAVLAAKELGISIKVHEPPRKIERFTLLKSVHIFKKHRVQYEMRTLYRCLELEHLTGSTADVYLEYIQRNLPEGVAMEVTKTKLEQLPEHIRKPIWETMPEEKEESKS

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Mitochondrial ribosomal protein S11
分子量 formula_weight	20841.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AK

MQVVRNAGSRLLQSWAWPPKTRIVAGLPASTIHRSAPHLQDAAAKLDIEDKEEARTPSHSSFSIYPPIPGQENSLRWAGKKFEEIPIAHIKASYNNTQIQVVSAAHQPLAHASCGTEGFRNAKKGTGIAAQTAGIAAAAKATGKGVTHVRVVVKGLGPGRLSAIKGLTMGGLEVISITDNTPIPHNGCRPRKARRL

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Mitochondrial ribosomal protein S12
分子量 formula_weight	15257.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AL

MSWSGLLRGLGTSLNCGLALVPRPWATRPMATLNQMHRLGPPKHPPGKMGPTAGRPQLKGVVLRTFIRKPKKPNSANRKCCRVRLSTGREAVCFIPGEGHSLQEHHVVLVQGGRTQDLPGVKLTVVRGKYDCGHVQKKK

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Mitochondrial ribosomal protein S14
分子量 formula_weight	15120.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AN

MAASMLGFLLRTVRQMVPSSASGQVRSYYVDWKMLRDVKRRKMAYEYADERLRINSLRKNTILPKDLQEVADEEIASLPRDSCPVRIRNRCVMTSRPRGVKRRWRLSRIVFRHLADHGQLSGVQRAMW

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	Mitochondrial ribosomal protein S15
分子量 formula_weight	27411.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AO

MLRAAWRALSSIRTQAVTQAPVLGLPGGGCARFPSVQRALPSRPAGLILRAARGYAAQKPVQPNQDDPPPSMLLLDYQNVPGIHKVDDVVKRLLSLEMANQKEKLKIKKMQLMNKVLENPEDTSSLEARIVALTVKIRNYEEHMQKHRKDKAHKRFLLMSIDQRKKMLKNLRETNYAVFEKICKELGIEYTFPPPYHRKAHRRWVTKKALCTQVFREVQKLKKQKRALRAAAVAAHKQG

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	bS16m, MRPS16
分子量 formula_weight	15182.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AP

MVQLTTVLCRAYRGGHLTIRLALGGCTNRPFYRIVAAHSKCPRDGRFVEQLGSYDPLPNSHGEKLVALNFDRIRHWIGCGAHLSKPVEKLLGLSGFYPLHPMMITNAERLRRKRAREVLLASQKTDTEATETKAS

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	Mitochondrial ribosomal protein S17
分子量 formula_weight	14452.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AQ

MSIARSSVHAKWVVGKVIGTAMQKTAKVRVTRLVLDPYLLKYFNKRKTYFAHDALQQCTVGDIVLLKALPVPRTKHVKHELAEIIFKVGQVIDPVTGKPCAGTTYLESPISPESTRLTKNLEALQLSSTQ

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	Mitochondrial ribosomal protein S18C
分子量 formula_weight	16211.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AR

MAAVVSLCSRLGRRKSTDFVNAAVCLTDPGTHAVLWRSCSQYKQVASNEDLPVPMENPYKEPLKKCILCEKHVDYKNVQLLSQFISPFTGCIYGRHITGLCGKKQKEITKAIKRAQILGFMPVTYKDPAYLKDPKVCNIKYRE

实体 18 Entity 18 polymer

描述 description	Mitochondrial ribosomal protein S21
分子量 formula_weight	10682.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AU

MANHLKFIARTVMVQEGNVEGAYRTLNRILTMDGLIEDIKRRRYYEKPCRRRQRESYETCRRIYNMEMARKINFLMRKNRADPWQGC

实体 19 Entity 19 polymer

描述 description	P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial
分子量 formula_weight	22664.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	AV

AGUAAGGUCAGCUAAAUAAGCUAUCGGGCCCAUACCCCGAAAAUGUUGGUUAUACCCUUCCCGUACUACCA

实体 20 Entity 20 polymer

描述 description	MT-CO3 mRNA, mitochondrial
分子量 formula_weight	63946.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	AX

AUGACCCACCAAUCACAUGCCUAUCAUAUAGUAAAACCCAGCCCAUGACCCCUAACAGGGGCCCUCUCAGCCCUCCUAAUGACCUCCGGCCUAGCCAUGUGAUUUCACUUCCACUCCAUAACGCUCCUCAUACUAGGCCUACUAACCAACACACUAACCAUAUACCAAUGAUGGCGCGAUGUAACACGAGAAAGCACAUAC

实体 21 Entity 21 polymer

描述 description	unassigned secondary structure elements
分子量 formula_weight	1297.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AZ

AAAAAAAAAAAAAAAAAA

实体 22 Entity 22 polymer

描述 description	Mitochondrial ribosomal protein S22
分子量 formula_weight	43234.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Aa

MPHEPRETRNLSLPLPALVARIIMATLKASALLRSLQTNSCGTGRVCFPVRARPRPRALLQPLPGASGTGTLCRGLGSESESGNSEIRKPTFMDEEVQNILIKMTGLDLQKIFKPALQELKPPTYKLMTQAQLEEATKQAVEAAKVRLKMPPVLEERAPINDVLAEDKILEGTETAKYVFTDISYSIPHRERFIVVREPSGTLRKASWEERDRMIQVYFPREGRRILTPVIFKEENLQTMYSQDQHVDVLNLCVAQFEPDSAEYIKIHHHTYEDIDKCGKYDLLRSTRHFGGMAWYFVNKKKIDGLLIDQIQRDLVSDATSLVHLYHILHPDGQSAQEAKKQGAEGLHLIKVFAKTEAQKGAYIELTLQAYQEAFITHSAAS

实体 23 Entity 23 polymer

描述 description	Mitochondrial ribosomal protein S23
分子量 formula_weight	21666.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Ab

MAGSRLETVGSIFSRTRDLIRAGVLKEKPLWLDIYNAFPPLREPVFRRPRLRYGKAKAAVQDIFYHEDRIRAKFYSAYGSGPKAFDLFNPNFKSTCQRFVEKYIELQRLGETDEEKLFVEAGKALLAEGVTLRRVGEARTQQEGSPISRKSEPTGIKPQTAVEENQPWKEVPQDQPLEAPEKESKGLPPP

实体 24 Entity 24 polymer

描述 description	Mitochondrial ribosomal protein S25
分子量 formula_weight	19954.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Ac

MPMKGRFPIRRTLQYLGQGDVVFKDSVKVMTVNYNTHGELGEGARKFVFFNIPQIQYKNPWVQITMFKNMTPSPFLRFYLDSGEQVLVDVESKSNKEIVEHIRKILGKNEETLEKEEQEKKQLSHPAHFGPRKYCLRECMCEVEGQVPCPGLVPLPKEMTGKYKAALKATAQD

实体 25 Entity 25 polymer

描述 description	Mitochondrial ribosomal protein S26
分子量 formula_weight	23637.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Ad

MLRVLGGLGARPAGRLPAPLLLPTRGRKTRHDPPAKSKAGRVATPPAVDPTEFFVLTERYRQYRQTVRALRLEFMSEVRKKLHEARAGVQAERKAQEDAAEHRELMAWNQAENQRLHELRLARLRQEALEQERRQAEEAVLQAREAQAWAQLKEQEVLQLQEEAKTFITRENLEARVEEALDSPKSYNWAITREGLVVRPQQKGS

实体 26 Entity 26 polymer

描述 description	Mitochondrial ribosomal protein S27
分子量 formula_weight	45244.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Ae

RRCLLSAAYVDSHKWEARDKEDCHLADLASLMDKTYERKLPVSSLTISRFVDNIASREDIDHAEYYLYKFRHSPNCWYLRDWTIHTWIRQCLKYGAQDKALYTLKNKVQYGIFPDNYTFNLLMDYFIKKENYKDALSVVFEIMMQEAFEVPSTQLLSLYVLYHCLAEKTDLSWEEERNFGASLLLPGLKQKNSVGLSSQLYGYALLGKVELQQGLRAVYCNMPLLWQPGYLHRALQVMEKVASSPEDGQLCGEALDVLDRVLKAVTAPAQGTSEEQPQEGEESQRSEELVEQLDVEETEQSKLPQYLERFEALRSKLQALGKVESESLLTLSTQLAKAQLPTCEAEDIAVYEQRLQQWHGERVRLIQREQEQRERARQDYEARRAAKASA

实体 27 Entity 27 polymer

描述 description	Mitoribosomal protein ms28, mrps28
分子量 formula_weight	21014.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Af

MAALCRTRAVTAKSHFLRVFFFSRPCRGTGTESGSGSESSESTEPKQRPGGFASALERHSELQQKAEFGRMRGSPKNVESFASMLRHSPLTQMGPAKNKLVIGQIFHIVEDDLYIDFGGKFHCVCKRPEVDGEKYQKGTRVRLRLLDLELTSRFLGATTDTTILEADAVLLGLQESKDSKSKEERHEK

实体 28 Entity 28 polymer

描述 description	Death associated protein 3
分子量 formula_weight	45582.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Ag

MLKGVTRLISRVHKLDPGHVLYMGTQAPQSLAAHLDNQVPVKSPRAISRTSEDDPAKHREQHEGQHYNISLQELKTVFPHGLPPRFAMQVKTFNEACLMVRKPALELLHYLKNTNFAHPAVRYVLYGEKGTGKTLSLCHILHFCAKQNWLILHIPDAHIWVKNCRDLLQSNYNKQRFDQPLEASTWLKNFKTANEHFLSQIKVQEKYVWNKRESTEKGRPLGEVVEQGIMRVRNATDAVGIVLKELKRQSSLGIFHLLVAVDGVNALWGRTTLKREDKSPIAPEELALIHNLRKMVKNDWQGGAIVLTVSQTGSLFKPRNAYLPQELLGKEGFDALDPFIPILVSNYNPKEFESCIQYYLENNWLQHEKAHTEEGKKELLFLSNRNPGQLERLCAYL

实体 29 Entity 29 polymer

描述 description	mS31, MRPS31
分子量 formula_weight	44092.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Ah

MLPRVSAVIPLRPLSRLPLCSGGPEASAAAILLLDSLRGTVRTENNIQRYFGTNNLVYSKKDEQSGPTCEISKETESKGSVKENSKKDLLNIIKGMKVELSTVNVQTTKPSNKRQLKNLETAIGRIKKAPEDTPQKRSESLSSELVAAVSAVADSLPFDRRMTKSELLRQLQKHEEDSRXQKDGEKPKISFSNIISDMKVARSATARVSTRPVHQIQFDEGTDDFADQEKTLNLKKSFRKNIFKGRRLNIFEPQAVTEEAPETEAVPSLWDIEFAKQLAAVTERPFQNGFEEMIQWTKEGKLWEFPINNEAGFDDDGSEFHEHIFLDKYLQDFPKQGPIRHFMELVTCGLSKNPYLSVKQKVEHIEWFRNYFNEKRVILKESGIQLN

实体 30 Entity 30 polymer

描述 description	Mitochondrial ribosomal protein S33
分子量 formula_weight	12544.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Ai

MSSLSEYAVRMSRLSARLFGEVARPTDSKSMKVVKLFSEQPLAKRKETYDWYPNHNTYFALMGTLRFLGLYRDEHQDFRDEQLRLKKLRGKGKPRKGEGKRAMKKK

实体 31 Entity 31 polymer

描述 description	Mitochondrial ribosomal protein S34
分子量 formula_weight	25843.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Aj

MARKKVRPRLIAELARRVRALREQRERPRDSQRYALDYETMMRPHSGNRLPMRAWADVRHESRLLQLLNRLPLFGLGRLVTRKSWLWQHDEPCYWRLTRVRPDYAAENLDHGKAWGILTFKGKTESEAREIEQVMYHDWRLVPKHEEEAFTAFTLVPEDTPLSVPYPPLLRAMILAQRQKYGDTSTEEPMLNLERARIDPWDYPAKLEAKTKTKGAAV

实体 32 Entity 32 polymer

描述 description	Mitochondrial ribosomal protein S35
分子量 formula_weight	37104.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Ak

MAATSLPAWLILKSRAGTFRAFSTAMSPATRSPRPALRTTERTSKPERALRRKALPPRTEKMAVDQDWPSVYPVAAPFKPSAVPLPVRMGYPVKRGVPMAKEGNLELLKIPNFLHLTPVAIKRHCEALKDFCTEWPAALDSDEKCEKHFPIEIDTADYVSAGPSIRNPKARVVTLRVKLSSLNLDDHAKKKLIKLVGDRYCKSTDVLTIKTDRCPLKRQNYDYAVYLLTVLYHESWKTEEWEKKKTEADMEEYIWENSTSEKNILETLLQIKAAEKNLELSKEELLGTKEVEDYRKSVVSLKNEGDNENTLSQYKESVKRLLNLA

实体 33 Entity 33 polymer

描述 description	Mitochondrial ribosomal protein S37
分子量 formula_weight	13561.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Am

MATPSLRGRLARLGNPRRPILKPNKPLILANHVGERRREKGEATCITEMSVMMACWKQNEFRDEACRKEIQDFFDCASRAEAARKMRSIQENLGELGSLPPKKLNKLLHRFPNKPHVS

实体 34 Entity 34 polymer

描述 description	Aurora kinase A interacting protein 1
分子量 formula_weight	22843.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	An

MFLVRLTSQLLRAVPGAGRSGSPRVSEVLGRHACRPRYSTQPPGPSGIASLPGKHVHPELEEMLVPRKMSISPLESWLTIRYLLPRLGAGTPGTVSPAQLYQCPPSQVGEGVKQGDKEVRDTPQMQCKNILKIRRRKMNHHKYRKLVKRTRFLRRKVREGRLRQKQVKFERDLKRIWQKAGLKEAPAGWQTPKIYLKNQ

实体 35 Entity 35 polymer

描述 description	Mitochondrial ribosomal protein S39
分子量 formula_weight	76473.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Ao

MAAVASARWLGVRSGLCLPLTGRRVGPCGRTPRSRFYSGSAAHPEVEGANVTGIEEVVIPKKKTWDKVAILQALASTVHRDSTAAPYVFQDDPYLIPTSSVESHSFLLAKKSGENAAKFIINSYPKYFQKDIAEPHIPCLMPEYFEPQIEDVSEAALQERIKLXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTWRTKNNAERIFALMPEKNAHSYCTMIRGMVKHQAPTQALNLYTVLLNNRLRADVYTFNSLIEATALVVNEKFEEKWNNILDLLKQMVTQNVKPNLQTFNTILKCLRRFYAFGKLPALQTLREMKAIGIEPSLATYHYVIQLFYQHESPSKGSSLIIYDIMNEVMGKRFSPRDPDDDMFFQSAMRVCSSLRDLELAYQVHGLLNTGDNWKLIGSDHRRNFYYSKFFNLLCFMEQIDVTLKWYKDLIPSVFFPHSQTMIDLLQALDVANRLDMVPQIWKDSKEYGHTFRNELKEEILMLMARDQHPPELQVAFADCAADIKSTYESQDARQTAPEWPASSLNYVAVLFLRAGRTQEAWKMLGLFRKHNKIPRAELLNEFLDSAKASSSPAQAIELVKLASAFSLPVCEGLTRRVMAEFTLTQEQREALGELTALTSDSSSDSDSDSDSDISEGK

实体 36 Entity 36 polymer

描述 description	28S ribosomal protein S18b, mitochondrial
分子量 formula_weight	29220.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Ap

MAASILNVLLRRLPGVSPFRGAYGVQVLLQTLCTKAPPEDDSLPQVPISPYKDEPWKYLDSEEYQNRYGSRPVWADYRRNHKGGIPPQRTRKMCIRGNKVAGNPCPICRDQKLHVDFRNVKLLEQFVCAHTGIIFHAPYTGVCMKQHKKLTQAIQKARDHGLLRYHIPQVEPRDLDFSTTHGAVSSTPPAPTLVSGDPWYPWYSWKQPPERELSRLRRLYQGRLREESGPPPELMPEVPLTAPAEASSTEPGAPQSAL

实体 37 Entity 37 non-polymer

描述 description	5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE
分子量 formula_weight	539.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 38 Entity 38 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	111

实体 39 Entity 39 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 40 Entity 40 non-polymer

描述 description	SPERMINE
分子量 formula_weight	202.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 41 Entity 41 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 42 Entity 42 non-polymer

描述 description	N-FORMYLMETHIONINE
分子量 formula_weight	177.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 43 Entity 43 non-polymer

描述 description	GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	523.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 44 Entity 44 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	5

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.10 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	139206

fit	/app/data/saxs_computation/ga/6gaz/6gaz.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ga/6gaz/6gaz.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ga/6gaz/6gaz.dat