6hv9

S. cerevisiae CMG-Pol epsilon-DNA

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 217.6 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA replication licensing factor MCM3

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P24279

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 13 DNA 3 PDB 声明:hexadecameric(16) 与全部聚合物数一致 链 3; UniProt 1–971 未记录 DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (P30665) DNA replication licensing factor MCM5 × 1 (A0A6A5PUY8) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (A0A6A5Q1S9) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 (A0A6A5Q203) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 (A0A6A5PX40) DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 (A0A8H4BWH3) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 (Q03406) Cell division control protein 45 × 1 (Q08032) ;DNA (5'-D(*GP*CP*AP*GP*CP*CP*AP*CP*GP*CP*TP*GP*GP*CP*CP*GP*TP*TP*TP*TP*A)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*TP*AP*AP*AP*AP*CP*GP*GP*CP*CP*AP*GP*CP*GP*TP*GP*GP*CP*TP*GP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*TP*TP*TP*TP*TP*TP*T)-3') ; × 1 DNA polymerase epsilon subunit B × 1 (P24482) DNA polymerase epsilon catalytic subunit × 1 (A0A8H4BWE7) AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.98 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 59 个其他 PDB 条目、59 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MCM3_YEAST
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 3; PDB构建体 1–971; UniProt 1–971

DNA replication licensing factor MCM4

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P30665

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 13 DNA 3 PDB 声明:hexadecameric(16) 与全部聚合物数一致 链 4; UniProt 1–933 未记录 DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (P24279) DNA replication licensing factor MCM5 × 1 (A0A6A5PUY8) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (A0A6A5Q1S9) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 (A0A6A5Q203) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 (A0A6A5PX40) DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 (A0A8H4BWH3) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 (Q03406) Cell division control protein 45 × 1 (Q08032) ;DNA (5'-D(*GP*CP*AP*GP*CP*CP*AP*CP*GP*CP*TP*GP*GP*CP*CP*GP*TP*TP*TP*TP*A)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*TP*AP*AP*AP*AP*CP*GP*GP*CP*CP*AP*GP*CP*GP*TP*GP*GP*CP*TP*GP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*TP*TP*TP*TP*TP*TP*T)-3') ; × 1 DNA polymerase epsilon subunit B × 1 (P24482) DNA polymerase epsilon catalytic subunit × 1 (A0A8H4BWE7) AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.98 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 58 个其他 PDB 条目、58 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MCM4_YEAST
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 4; PDB构建体 1–933; UniProt 1–933

DNA replication licensing factor MCM5

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A6A5PUY8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 13 DNA 3 PDB 声明:hexadecameric(16) 与全部聚合物数一致 链 5; UniProt 1–775 未记录 DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (P30665) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (A0A6A5Q1S9) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 (A0A6A5Q203) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 (A0A6A5PX40) DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 (A0A8H4BWH3) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 (Q03406) Cell division control protein 45 × 1 (Q08032) ;DNA (5'-D(*GP*CP*AP*GP*CP*CP*AP*CP*GP*CP*TP*GP*GP*CP*CP*GP*TP*TP*TP*TP*A)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*TP*AP*AP*AP*AP*CP*GP*GP*CP*CP*AP*GP*CP*GP*TP*GP*GP*CP*TP*GP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*TP*TP*TP*TP*TP*TP*T)-3') ; × 1 DNA polymerase epsilon subunit B × 1 (P24482) DNA polymerase epsilon catalytic subunit × 1 (A0A8H4BWE7) AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.98 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A6A5PUY8_YEASX
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 5; PDB构建体 1–775; UniProt 1–775

DNA replication licensing factor MCM6

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P53091

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 13 DNA 3 PDB 声明:hexadecameric(16) 与全部聚合物数一致 链 6; UniProt 1–1017 未记录 DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (P30665) DNA replication licensing factor MCM5 × 1 (A0A6A5PUY8) DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (A0A6A5Q1S9) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 (A0A6A5Q203) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 (A0A6A5PX40) DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 (A0A8H4BWH3) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 (Q03406) Cell division control protein 45 × 1 (Q08032) ;DNA (5'-D(*GP*CP*AP*GP*CP*CP*AP*CP*GP*CP*TP*GP*GP*CP*CP*GP*TP*TP*TP*TP*A)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*TP*AP*AP*AP*AP*CP*GP*GP*CP*CP*AP*GP*CP*GP*TP*GP*GP*CP*TP*GP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*TP*TP*TP*TP*TP*TP*T)-3') ; × 1 DNA polymerase epsilon subunit B × 1 (P24482) DNA polymerase epsilon catalytic subunit × 1 (A0A8H4BWE7) AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.98 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 58 个其他 PDB 条目、58 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MCM6_YEAST
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 6; PDB构建体 1–1017; UniProt 1–1017

DNA replication licensing factor MCM2

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A6A5Q1S9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 13 DNA 3 PDB 声明:hexadecameric(16) 与全部聚合物数一致 链 2; UniProt 1–868 未记录 DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (P30665) DNA replication licensing factor MCM5 × 1 (A0A6A5PUY8) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 (A0A6A5Q203) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 (A0A6A5PX40) DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 (A0A8H4BWH3) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 (Q03406) Cell division control protein 45 × 1 (Q08032) ;DNA (5'-D(*GP*CP*AP*GP*CP*CP*AP*CP*GP*CP*TP*GP*GP*CP*CP*GP*TP*TP*TP*TP*A)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*TP*AP*AP*AP*AP*CP*GP*GP*CP*CP*AP*GP*CP*GP*TP*GP*GP*CP*TP*GP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*TP*TP*TP*TP*TP*TP*T)-3') ; × 1 DNA polymerase epsilon subunit B × 1 (P24482) DNA polymerase epsilon catalytic subunit × 1 (A0A8H4BWE7) AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.98 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 A0A6A5Q1S9_YEASX
Isoform
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 2; PDB构建体 1–868; UniProt 1–868

DNA replication licensing factor MCM7

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P38132

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 13 DNA 3 PDB 声明:hexadecameric(16) 与全部聚合物数一致 链 7; UniProt 1–845 未记录 DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (P30665) DNA replication licensing factor MCM5 × 1 (A0A6A5PUY8) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (A0A6A5Q1S9) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 (A0A6A5Q203) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 (A0A6A5PX40) DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 (A0A8H4BWH3) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 (Q03406) Cell division control protein 45 × 1 (Q08032) ;DNA (5'-D(*GP*CP*AP*GP*CP*CP*AP*CP*GP*CP*TP*GP*GP*CP*CP*GP*TP*TP*TP*TP*A)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*TP*AP*AP*AP*AP*CP*GP*GP*CP*CP*AP*GP*CP*GP*TP*GP*GP*CP*TP*GP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*TP*TP*TP*TP*TP*TP*T)-3') ; × 1 DNA polymerase epsilon subunit B × 1 (P24482) DNA polymerase epsilon catalytic subunit × 1 (A0A8H4BWE7) AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.98 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 55 个其他 PDB 条目、55 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MCM7_YEAST
Isoform
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 7; PDB构建体 1–845; UniProt 1–845

DNA replication complex GINS protein PSF1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A6A5Q203

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 13 DNA 3 PDB 声明:hexadecameric(16) 与全部聚合物数一致 链 C; UniProt 1–208 未记录 DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (P30665) DNA replication licensing factor MCM5 × 1 (A0A6A5PUY8) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (A0A6A5Q1S9) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 (A0A6A5PX40) DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 (A0A8H4BWH3) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 (Q03406) Cell division control protein 45 × 1 (Q08032) ;DNA (5'-D(*GP*CP*AP*GP*CP*CP*AP*CP*GP*CP*TP*GP*GP*CP*CP*GP*TP*TP*TP*TP*A)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*TP*AP*AP*AP*AP*CP*GP*GP*CP*CP*AP*GP*CP*GP*TP*GP*GP*CP*TP*GP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*TP*TP*TP*TP*TP*TP*T)-3') ; × 1 DNA polymerase epsilon subunit B × 1 (P24482) DNA polymerase epsilon catalytic subunit × 1 (A0A8H4BWE7) AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.98 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A6A5Q203_YEASX
Isoform
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–208; UniProt 1–208

DNA replication complex GINS protein PSF2

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A6A5PX40

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 13 DNA 3 PDB 声明:hexadecameric(16) 与全部聚合物数一致 链 D; UniProt 1–213 未记录 DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (P30665) DNA replication licensing factor MCM5 × 1 (A0A6A5PUY8) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (A0A6A5Q1S9) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 (A0A6A5Q203) DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 (A0A8H4BWH3) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 (Q03406) Cell division control protein 45 × 1 (Q08032) ;DNA (5'-D(*GP*CP*AP*GP*CP*CP*AP*CP*GP*CP*TP*GP*GP*CP*CP*GP*TP*TP*TP*TP*A)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*TP*AP*AP*AP*AP*CP*GP*GP*CP*CP*AP*GP*CP*GP*TP*GP*GP*CP*TP*GP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*TP*TP*TP*TP*TP*TP*T)-3') ; × 1 DNA polymerase epsilon subunit B × 1 (P24482) DNA polymerase epsilon catalytic subunit × 1 (A0A8H4BWE7) AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.98 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A6A5PX40_YEASX
Isoform
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–213; UniProt 1–213

DNA replication complex GINS protein PSF3

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A8H4BWH3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 13 DNA 3 PDB 声明:hexadecameric(16) 与全部聚合物数一致 链 E; UniProt 1–194 未记录 DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (P30665) DNA replication licensing factor MCM5 × 1 (A0A6A5PUY8) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (A0A6A5Q1S9) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 (A0A6A5Q203) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 (A0A6A5PX40) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 (Q03406) Cell division control protein 45 × 1 (Q08032) ;DNA (5'-D(*GP*CP*AP*GP*CP*CP*AP*CP*GP*CP*TP*GP*GP*CP*CP*GP*TP*TP*TP*TP*A)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*TP*AP*AP*AP*AP*CP*GP*GP*CP*CP*AP*GP*CP*GP*TP*GP*GP*CP*TP*GP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*TP*TP*TP*TP*TP*TP*T)-3') ; × 1 DNA polymerase epsilon subunit B × 1 (P24482) DNA polymerase epsilon catalytic subunit × 1 (A0A8H4BWE7) AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.98 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A8H4BWH3_YEASX
Isoform
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–194; UniProt 1–194

DNA replication complex GINS protein SLD5

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q03406

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 13 DNA 3 PDB 声明:hexadecameric(16) 与全部聚合物数一致 链 F; UniProt 1–294 未记录 DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (P30665) DNA replication licensing factor MCM5 × 1 (A0A6A5PUY8) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (A0A6A5Q1S9) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 (A0A6A5Q203) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 (A0A6A5PX40) DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 (A0A8H4BWH3) Cell division control protein 45 × 1 (Q08032) ;DNA (5'-D(*GP*CP*AP*GP*CP*CP*AP*CP*GP*CP*TP*GP*GP*CP*CP*GP*TP*TP*TP*TP*A)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*TP*AP*AP*AP*AP*CP*GP*GP*CP*CP*AP*GP*CP*GP*TP*GP*GP*CP*TP*GP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*TP*TP*TP*TP*TP*TP*T)-3') ; × 1 DNA polymerase epsilon subunit B × 1 (P24482) DNA polymerase epsilon catalytic subunit × 1 (A0A8H4BWE7) AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.98 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 33 个其他 PDB 条目、33 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SLD5_YEAST
Isoform
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–294; UniProt 1–294

Cell division control protein 45

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q08032

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 13 DNA 3 PDB 声明:hexadecameric(16) 与全部聚合物数一致 链 G; UniProt 1–650 未记录 DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (P30665) DNA replication licensing factor MCM5 × 1 (A0A6A5PUY8) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (A0A6A5Q1S9) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 (A0A6A5Q203) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 (A0A6A5PX40) DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 (A0A8H4BWH3) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 (Q03406) ;DNA (5'-D(*GP*CP*AP*GP*CP*CP*AP*CP*GP*CP*TP*GP*GP*CP*CP*GP*TP*TP*TP*TP*A)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*TP*AP*AP*AP*AP*CP*GP*GP*CP*CP*AP*GP*CP*GP*TP*GP*GP*CP*TP*GP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*TP*TP*TP*TP*TP*TP*T)-3') ; × 1 DNA polymerase epsilon subunit B × 1 (P24482) DNA polymerase epsilon catalytic subunit × 1 (A0A8H4BWE7) AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.98 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 34 个其他 PDB 条目、34 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CDC45_YEAST
Isoform
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–650; UniProt 1–650

DNA polymerase epsilon subunit B

物种未注明

UniProt P24482

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 13 DNA 3 PDB 声明:hexadecameric(16) 与全部聚合物数一致 链 B; UniProt 1–689 未记录 DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (P30665) DNA replication licensing factor MCM5 × 1 (A0A6A5PUY8) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (A0A6A5Q1S9) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 (A0A6A5Q203) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 (A0A6A5PX40) DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 (A0A8H4BWH3) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 (Q03406) Cell division control protein 45 × 1 (Q08032) ;DNA (5'-D(*GP*CP*AP*GP*CP*CP*AP*CP*GP*CP*TP*GP*GP*CP*CP*GP*TP*TP*TP*TP*A)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*TP*AP*AP*AP*AP*CP*GP*GP*CP*CP*AP*GP*CP*GP*TP*GP*GP*CP*TP*GP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*TP*TP*TP*TP*TP*TP*T)-3') ; × 1 DNA polymerase epsilon catalytic subunit × 1 (A0A8H4BWE7) AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.98 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 18 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DPB2_YEAST
Isoform
PDB实体 15
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–689; UniProt 1–689

DNA polymerase epsilon catalytic subunit

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A8H4BWE7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 13 DNA 3 PDB 声明:hexadecameric(16) 与全部聚合物数一致 链 A; UniProt 1308–2221 未记录 DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (P30665) DNA replication licensing factor MCM5 × 1 (A0A6A5PUY8) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (A0A6A5Q1S9) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 (A0A6A5Q203) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 (A0A6A5PX40) DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 (A0A8H4BWH3) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 (Q03406) Cell division control protein 45 × 1 (Q08032) ;DNA (5'-D(*GP*CP*AP*GP*CP*CP*AP*CP*GP*CP*TP*GP*GP*CP*CP*GP*TP*TP*TP*TP*A)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*TP*AP*AP*AP*AP*CP*GP*GP*CP*CP*AP*GP*CP*GP*TP*GP*GP*CP*TP*GP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*TP*TP*TP*TP*TP*TP*T)-3') ; × 1 DNA polymerase epsilon subunit B × 1 (P24482) AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.98 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A8H4BWE7_YEASX
Isoform
PDB实体 16
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–914; UniProt 1308–2221

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6hv9

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6hv9
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6hv9
沉积日期 deposition_date2018-10-10
结构标题 titleS. cerevisiae CMG-Pol epsilon-DNA
关键词 keywordsHelicase, Polymerase, DNA Replication, AAA+ protein, DNA BINDING PROTEIN; DNA BINDING PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier66.21
回转半径 Rg (电子) rg_electron65.78
零角强度 I(0) i06590870000.00
分子量 molecular_weight677620.0 kDa
排除体积 excluded_volume844860 ų
包络体积 envelope_volume1463100 ų
水化壳体积 shell_volume180100 ų
包络直径 envelope_diameter238.7
壳层 Rg shell_rg71.11
包络 Rg envelope_rg64.25
形状 Rg shape_rg65.78
总 Rg total_rg65.89
总原子数 total_atoms47617
残基数 n_residues6089
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax217.6
Rg (实空间) rg_real66.03
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.40
I(0) (实空间) i0_real6.5900e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.3650e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal66.32
I(0) (倒空间) i0_reciprocal6594000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8582
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary81.6
偏度 Skewness skewness0.335
峰度 Kurtosis kurtosis-0.199
角度范围 angular_range— – 0.1200 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0051
最高正则化参数 α highest_alpha865700000.0000
实空间数据点数 n_real_points25
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.850; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.962; Smooth: 0.639

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (18)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)