6qb8

Human CCT:mLST8 complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 224.1 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

T-complex protein 1 subunit alpha

Homo sapiens

UniProt P17987

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–556 链 a; UniProt 1–556 未记录 T-complex protein 1 subunit beta × 2 (P78371) T-complex protein 1 subunit delta × 2 (P50991) T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 (P48643) T-complex protein 1 subunit gamma × 2 (P49368) T-complex protein 1 subunit eta × 2 (Q99832) T-complex protein 1 subunit theta × 2 (P50990) T-complex protein 1 subunit zeta × 2 (P40227) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.97 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 64 个其他 PDB 条目、64 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 TCPA_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–556; UniProt 1–556 作者链 a; PDB构建体 1–556; UniProt 1–556

T-complex protein 1 subunit beta

Homo sapiens

UniProt P78371

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 1–535 链 b; UniProt 1–535 未记录 T-complex protein 1 subunit alpha × 2 (P17987) T-complex protein 1 subunit delta × 2 (P50991) T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 (P48643) T-complex protein 1 subunit gamma × 2 (P49368) T-complex protein 1 subunit eta × 2 (Q99832) T-complex protein 1 subunit theta × 2 (P50990) T-complex protein 1 subunit zeta × 2 (P40227) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.97 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 64 个其他 PDB 条目、64 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 TCPB_HUMAN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–535; UniProt 1–535 作者链 b; PDB构建体 1–535; UniProt 1–535

T-complex protein 1 subunit delta

Homo sapiens

UniProt P50991

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白拷贝数一致 链 D; UniProt 1–539 链 d; UniProt 1–539 未记录 T-complex protein 1 subunit alpha × 2 (P17987) T-complex protein 1 subunit beta × 2 (P78371) T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 (P48643) T-complex protein 1 subunit gamma × 2 (P49368) T-complex protein 1 subunit eta × 2 (Q99832) T-complex protein 1 subunit theta × 2 (P50990) T-complex protein 1 subunit zeta × 2 (P40227) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.97 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

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UniProt名称 TCPD_HUMAN
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–539; UniProt 1–539 作者链 d; PDB构建体 1–539; UniProt 1–539

T-complex protein 1 subunit epsilon

Homo sapiens

UniProt P48643

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白拷贝数一致 链 E; UniProt 1–541 链 e; UniProt 1–541 未记录 T-complex protein 1 subunit alpha × 2 (P17987) T-complex protein 1 subunit beta × 2 (P78371) T-complex protein 1 subunit delta × 2 (P50991) T-complex protein 1 subunit gamma × 2 (P49368) T-complex protein 1 subunit eta × 2 (Q99832) T-complex protein 1 subunit theta × 2 (P50990) T-complex protein 1 subunit zeta × 2 (P40227) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.97 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 TCPE_HUMAN
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–541; UniProt 1–541 作者链 e; PDB构建体 1–541; UniProt 1–541

T-complex protein 1 subunit gamma

Homo sapiens

UniProt P49368

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白拷贝数一致 链 G; UniProt 2–545 链 g; UniProt 2–545 未记录 T-complex protein 1 subunit alpha × 2 (P17987) T-complex protein 1 subunit beta × 2 (P78371) T-complex protein 1 subunit delta × 2 (P50991) T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 (P48643) T-complex protein 1 subunit eta × 2 (Q99832) T-complex protein 1 subunit theta × 2 (P50990) T-complex protein 1 subunit zeta × 2 (P40227) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.97 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

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UniProt名称 TCPG_HUMAN
Isoform
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–544; UniProt 2–545 作者链 g; PDB构建体 1–544; UniProt 2–545

T-complex protein 1 subunit eta

Homo sapiens

UniProt Q99832

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白拷贝数一致 链 H; UniProt 1–543 链 h; UniProt 1–543 未记录 T-complex protein 1 subunit alpha × 2 (P17987) T-complex protein 1 subunit beta × 2 (P78371) T-complex protein 1 subunit delta × 2 (P50991) T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 (P48643) T-complex protein 1 subunit gamma × 2 (P49368) T-complex protein 1 subunit theta × 2 (P50990) T-complex protein 1 subunit zeta × 2 (P40227) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.97 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

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UniProt名称 TCPH_HUMAN
Isoform
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–543; UniProt 1–543 作者链 h; PDB构建体 1–543; UniProt 1–543

T-complex protein 1 subunit theta

Homo sapiens

UniProt P50990

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白拷贝数一致 链 Q; UniProt 1–548 链 q; UniProt 1–548 未记录 T-complex protein 1 subunit alpha × 2 (P17987) T-complex protein 1 subunit beta × 2 (P78371) T-complex protein 1 subunit delta × 2 (P50991) T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 (P48643) T-complex protein 1 subunit gamma × 2 (P49368) T-complex protein 1 subunit eta × 2 (Q99832) T-complex protein 1 subunit zeta × 2 (P40227) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.97 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 64 个其他 PDB 条目、64 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 TCPQ_HUMAN
Isoform
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 Q; PDB构建体 1–548; UniProt 1–548 作者链 q; PDB构建体 1–548; UniProt 1–548

T-complex protein 1 subunit zeta

Homo sapiens

UniProt P40227

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白拷贝数一致 链 Z; UniProt 1–531 链 z; UniProt 1–531 未记录 T-complex protein 1 subunit alpha × 2 (P17987) T-complex protein 1 subunit beta × 2 (P78371) T-complex protein 1 subunit delta × 2 (P50991) T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 (P48643) T-complex protein 1 subunit gamma × 2 (P49368) T-complex protein 1 subunit eta × 2 (Q99832) T-complex protein 1 subunit theta × 2 (P50990) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.97 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 TCPZ_HUMAN
Isoform
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 Z; PDB构建体 1–531; UniProt 1–531 作者链 z; PDB构建体 1–531; UniProt 1–531

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6qb8

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6qb8
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6qb8
沉积日期 deposition_date2018-12-20
结构标题 titleHuman CCT:mLST8 complex
关键词 keywordsCCT, folding, WD40, mLST8, CHAPERONE; CHAPERONE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier72.34
回转半径 Rg (电子) rg_electron71.74
零角强度 I(0) i010147000000.00
分子量 molecular_weight858180.0 kDa
排除体积 excluded_volume1078000 ų
包络体积 envelope_volume1978100 ų
水化壳体积 shell_volume222000 ų
包络直径 envelope_diameter213.2
壳层 Rg shell_rg83.26
包络 Rg envelope_rg66.08
形状 Rg shape_rg71.75
总 Rg total_rg71.87
总原子数 total_atoms60035
残基数 n_residues7870
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax224.1
Rg (实空间) rg_real71.87
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.57
I(0) (实空间) i0_real1.0150e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.0680e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal73.91
I(0) (倒空间) i0_reciprocal10190000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8257
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary112.0
偏度 Skewness skewness-0.186
峰度 Kurtosis kurtosis-0.532
角度范围 angular_range— – 0.1100 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha2931000000.0000
实空间数据点数 n_real_points23
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.689; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.924; Smooth: 0.739

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 29 domains

CATH v4.4 (29 domains)

结构域编号 domain_id6qb8B01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology560 — GROEL; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GroEL-like equatorial domain
结构域编号 domain_id6qb8B02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology260 — GROEL; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — TCP-1-like chaperonin intermediate domain
结构域编号 domain_id6qb8B03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology7 — GroEL
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GroEL
结构域编号 domain_id6qb8D01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology560 — GROEL; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GroEL-like equatorial domain
结构域编号 domain_id6qb8D03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology7 — GroEL
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GroEL
结构域编号 domain_id6qb8E01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology560 — GROEL; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GroEL-like equatorial domain
结构域编号 domain_id6qb8G01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology560 — GROEL; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GroEL-like equatorial domain
结构域编号 domain_id6qb8G02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology260 — GROEL; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — TCP-1-like chaperonin intermediate domain
结构域编号 domain_id6qb8H01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology7 — GroEL
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GroEL
结构域编号 domain_id6qb8Q01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology560 — GROEL; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GroEL-like equatorial domain
结构域编号 domain_id6qb8Q02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology260 — GROEL; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — TCP-1-like chaperonin intermediate domain
结构域编号 domain_id6qb8Q03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology7 — GroEL
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GroEL
结构域编号 domain_id6qb8Z01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology560 — GROEL; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GroEL-like equatorial domain
结构域编号 domain_id6qb8Z02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology260 — GROEL; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — TCP-1-like chaperonin intermediate domain
结构域编号 domain_id6qb8a01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology7 — GroEL
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GroEL
结构域编号 domain_id6qb8b01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology560 — GROEL; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GroEL-like equatorial domain
结构域编号 domain_id6qb8b02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology260 — GROEL; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — TCP-1-like chaperonin intermediate domain
结构域编号 domain_id6qb8b03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology7 — GroEL
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GroEL
结构域编号 domain_id6qb8d01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology560 — GROEL; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GroEL-like equatorial domain
结构域编号 domain_id6qb8d03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology7 — GroEL
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GroEL
结构域编号 domain_id6qb8e01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology560 — GROEL; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GroEL-like equatorial domain
结构域编号 domain_id6qb8g01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology560 — GROEL; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GroEL-like equatorial domain
结构域编号 domain_id6qb8g02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology260 — GROEL; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — TCP-1-like chaperonin intermediate domain
结构域编号 domain_id6qb8h01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology7 — GroEL
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GroEL
结构域编号 domain_id6qb8q01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology560 — GROEL; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GroEL-like equatorial domain
结构域编号 domain_id6qb8q02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology260 — GROEL; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — TCP-1-like chaperonin intermediate domain
结构域编号 domain_id6qb8q03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology7 — GroEL
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GroEL
结构域编号 domain_id6qb8z01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology560 — GROEL; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GroEL-like equatorial domain
结构域编号 domain_id6qb8z02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology260 — GROEL; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — TCP-1-like chaperonin intermediate domain

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)