6yac

Plant PSI-ferredoxin supercomplex

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （A0A0F6NGI2） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P10793） PsaD × 1 PsaE × 1 PsaF × 1 PsaG × 1 PsaH × 1 Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （P17227） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （D5MAL3） Photosystem I reaction center subunit X psaK × 1 （E1C9L3） PsaL × 1 Lhca1 × 1 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 （Q41038） Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic × 1 （Q32904） Chlorophyll a-b binding protein P4, chloroplastic × 1 （Q9SQL2） Ferredoxin-1, chloroplastic × 1 （P09911） CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CHLOROPHYLL A × 141 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 BETA-CAROTENE × 27 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 8 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 6 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 19 CALCIUM ION × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 7 CHLOROPHYLL B × 15 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 2 ;(1~{S})-3,5,5-trimethyl-4-[(1~{E},3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(4~{S})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohexen-1-yl]octadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaenyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 1 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 water × 14	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A0F6NFW5_PEA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–743； UniProt 16–758

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2

物种未注明

UniProt A0A0F6NGI2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （A0A0F6NFW5） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P10793） PsaD × 1 PsaE × 1 PsaF × 1 PsaG × 1 PsaH × 1 Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （P17227） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （D5MAL3） Photosystem I reaction center subunit X psaK × 1 （E1C9L3） PsaL × 1 Lhca1 × 1 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 （Q41038） Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic × 1 （Q32904） Chlorophyll a-b binding protein P4, chloroplastic × 1 （Q9SQL2） Ferredoxin-1, chloroplastic × 1 （P09911） CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CHLOROPHYLL A × 141 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 BETA-CAROTENE × 27 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 8 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 6 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 19 CALCIUM ION × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 7 CHLOROPHYLL B × 15 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 2 ;(1~{S})-3,5,5-trimethyl-4-[(1~{E},3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(4~{S})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohexen-1-yl]octadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaenyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 1 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 water × 14	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A0F6NGI2_PEA
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–733； UniProt 2–734

Photosystem I iron-sulfur center

物种未注明

UniProt P10793

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （A0A0F6NFW5） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （A0A0F6NGI2） PsaD × 1 PsaE × 1 PsaF × 1 PsaG × 1 PsaH × 1 Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （P17227） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （D5MAL3） Photosystem I reaction center subunit X psaK × 1 （E1C9L3） PsaL × 1 Lhca1 × 1 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 （Q41038） Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic × 1 （Q32904） Chlorophyll a-b binding protein P4, chloroplastic × 1 （Q9SQL2） Ferredoxin-1, chloroplastic × 1 （P09911） CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CHLOROPHYLL A × 141 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 BETA-CAROTENE × 27 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 8 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 6 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 19 CALCIUM ION × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 7 CHLOROPHYLL B × 15 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 2 ;(1~{S})-3,5,5-trimethyl-4-[(1~{E},3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(4~{S})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohexen-1-yl]octadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaenyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 1 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 water × 14	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAC_PEA
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–80； UniProt 2–81

Photosystem I reaction center subunit VIII

物种未注明

UniProt P17227

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （A0A0F6NFW5） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （A0A0F6NGI2） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P10793） PsaD × 1 PsaE × 1 PsaF × 1 PsaG × 1 PsaH × 1 Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （D5MAL3） Photosystem I reaction center subunit X psaK × 1 （E1C9L3） PsaL × 1 Lhca1 × 1 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 （Q41038） Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic × 1 （Q32904） Chlorophyll a-b binding protein P4, chloroplastic × 1 （Q9SQL2） Ferredoxin-1, chloroplastic × 1 （P09911） CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CHLOROPHYLL A × 141 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 BETA-CAROTENE × 27 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 8 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 6 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 19 CALCIUM ION × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 7 CHLOROPHYLL B × 15 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 2 ;(1~{S})-3,5,5-trimethyl-4-[(1~{E},3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(4~{S})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohexen-1-yl]octadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaenyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 1 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 water × 14	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAI_PEA
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–31； UniProt 2–32

Photosystem I reaction center subunit IX

物种未注明

UniProt D5MAL3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （A0A0F6NFW5） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （A0A0F6NGI2） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P10793） PsaD × 1 PsaE × 1 PsaF × 1 PsaG × 1 PsaH × 1 Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （P17227） Photosystem I reaction center subunit X psaK × 1 （E1C9L3） PsaL × 1 Lhca1 × 1 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 （Q41038） Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic × 1 （Q32904） Chlorophyll a-b binding protein P4, chloroplastic × 1 （Q9SQL2） Ferredoxin-1, chloroplastic × 1 （P09911） CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CHLOROPHYLL A × 141 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 BETA-CAROTENE × 27 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 8 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 6 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 19 CALCIUM ION × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 7 CHLOROPHYLL B × 15 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 2 ;(1~{S})-3,5,5-trimethyl-4-[(1~{E},3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(4~{S})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohexen-1-yl]octadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaenyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 1 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 water × 14	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	D5MAL3_PEA
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–42； UniProt 1–42

Photosystem I reaction center subunit X psaK

物种未注明

UniProt E1C9L3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （A0A0F6NFW5） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （A0A0F6NGI2） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P10793） PsaD × 1 PsaE × 1 PsaF × 1 PsaG × 1 PsaH × 1 Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （P17227） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （D5MAL3） PsaL × 1 Lhca1 × 1 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 （Q41038） Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic × 1 （Q32904） Chlorophyll a-b binding protein P4, chloroplastic × 1 （Q9SQL2） Ferredoxin-1, chloroplastic × 1 （P09911） CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CHLOROPHYLL A × 141 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 BETA-CAROTENE × 27 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 8 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 6 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 19 CALCIUM ION × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 7 CHLOROPHYLL B × 15 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 2 ;(1~{S})-3,5,5-trimethyl-4-[(1~{E},3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(4~{S})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohexen-1-yl]octadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaenyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 1 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 water × 14	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	E1C9L3_PEA
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–81； UniProt 2–82

Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic

物种未注明

UniProt Q41038

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （A0A0F6NFW5） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （A0A0F6NGI2） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P10793） PsaD × 1 PsaE × 1 PsaF × 1 PsaG × 1 PsaH × 1 Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （P17227） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （D5MAL3） Photosystem I reaction center subunit X psaK × 1 （E1C9L3） PsaL × 1 Lhca1 × 1 Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic × 1 （Q32904） Chlorophyll a-b binding protein P4, chloroplastic × 1 （Q9SQL2） Ferredoxin-1, chloroplastic × 1 （P09911） CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CHLOROPHYLL A × 141 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 BETA-CAROTENE × 27 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 8 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 6 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 19 CALCIUM ION × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 7 CHLOROPHYLL B × 15 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 2 ;(1~{S})-3,5,5-trimethyl-4-[(1~{E},3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(4~{S})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohexen-1-yl]octadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaenyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 1 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 water × 14	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q41038_PEA
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 2； PDB构建体 1–208； UniProt 58–265

Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic

物种未注明

UniProt Q32904

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （A0A0F6NFW5） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （A0A0F6NGI2） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P10793） PsaD × 1 PsaE × 1 PsaF × 1 PsaG × 1 PsaH × 1 Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （P17227） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （D5MAL3） Photosystem I reaction center subunit X psaK × 1 （E1C9L3） PsaL × 1 Lhca1 × 1 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 （Q41038） Chlorophyll a-b binding protein P4, chloroplastic × 1 （Q9SQL2） Ferredoxin-1, chloroplastic × 1 （P09911） CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CHLOROPHYLL A × 141 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 BETA-CAROTENE × 27 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 8 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 6 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 19 CALCIUM ION × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 7 CHLOROPHYLL B × 15 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 2 ;(1~{S})-3,5,5-trimethyl-4-[(1~{E},3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(4~{S})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohexen-1-yl]octadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaenyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 1 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 water × 14	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CB23_PEA
Isoform	—
PDB实体	15
链与序列区间	作者链 3； PDB构建体 1–221； UniProt 55–275

Chlorophyll a-b binding protein P4, chloroplastic

物种未注明

UniProt Q9SQL2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （A0A0F6NFW5） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （A0A0F6NGI2） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P10793） PsaD × 1 PsaE × 1 PsaF × 1 PsaG × 1 PsaH × 1 Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （P17227） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （D5MAL3） Photosystem I reaction center subunit X psaK × 1 （E1C9L3） PsaL × 1 Lhca1 × 1 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 （Q41038） Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic × 1 （Q32904） Ferredoxin-1, chloroplastic × 1 （P09911） CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CHLOROPHYLL A × 141 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 BETA-CAROTENE × 27 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 8 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 6 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 19 CALCIUM ION × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 7 CHLOROPHYLL B × 15 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 2 ;(1~{S})-3,5,5-trimethyl-4-[(1~{E},3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(4~{S})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohexen-1-yl]octadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaenyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 1 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 water × 14	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CB24_PEA
Isoform	—
PDB实体	16
链与序列区间	作者链 4； PDB构建体 1–198； UniProt 52–249

Ferredoxin-1, chloroplastic

物种未注明

UniProt P09911

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （A0A0F6NFW5） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （A0A0F6NGI2） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P10793） PsaD × 1 PsaE × 1 PsaF × 1 PsaG × 1 PsaH × 1 Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （P17227） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （D5MAL3） Photosystem I reaction center subunit X psaK × 1 （E1C9L3） PsaL × 1 Lhca1 × 1 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 （Q41038） Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic × 1 （Q32904） Chlorophyll a-b binding protein P4, chloroplastic × 1 （Q9SQL2） CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CHLOROPHYLL A × 141 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 BETA-CAROTENE × 27 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 8 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 6 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 19 CALCIUM ION × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 7 CHLOROPHYLL B × 15 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 2 ;(1~{S})-3,5,5-trimethyl-4-[(1~{E},3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(4~{S})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohexen-1-yl]octadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaenyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 1 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 water × 14	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	FER1_PEA
Isoform	—
PDB实体	17
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–97； UniProt 53–149

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6yac
沉积日期 deposition_date	2020-03-12
结构标题 title	Plant PSI-ferredoxin supercomplex
关键词 keywords	Membrane complex, photosystem I, ferredoxin, light harvesting, excitation transfer, PHOTOSYNTHESIS; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6yac__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6yac__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6yac__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	52.55 Å
Rg（电子密度）	51.91 Å
总 Rg	52.02 Å
原子数	38413
残基数	3332
排除体积	721830 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6yac__assembly_1__model_1`	heptadecameric （17）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (33)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1
分子量 formula_weight	82571.5 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	38469

PEVKILVDRDPIKTSFEQWAKPGHFSRTIAKGPDTTTWIWNLHADAHDFDSHTSDLEEISRKVFSAHFGQLSIIFLWLSGMYFHGARFSNYEAWLNDPTHIRPSAQVVWPIVGQEILNGDVGGGFRGIQITSGFFQIWRASGITSELQLYCTAIGALVFAALMLFAGWFHYHKAAPKLVWFQDVESMLNHHLAGLLGLGSLSWAGHQVHVSLPINQFLNAGVDPKEIPLPHEFILNRDLLAQLYPSFAEGATPFFTLNWSKYADFLTFRGGLDPLTGGLWLTDIAHHHLAIAILFLIAGHMYRTNWGIGHGIKDILEAHKGPFTGQGHKGLYEILTTSWHAQLSINLAMLGSLTIIVAHHMYAMPPYPYLATDYGTQLSLFTHHMWIGGFLIVGAAAHAAIFMVRDYDPTTRYNDLLDRVLRHRDAIISHLNWVCIFLGFHSFGLYIHNDTMSALGRPQDMFSDTAIQLQPVFAQWIQNTHALAPGTTAPGATTSTSLTWGGGDLVSVGGKVALLPIPLGTADFLVHHIHAFTIHVTVLILLKGVLFARSSRLIPDKANLGFRFPCDGPGRGGTCQVSAWDHVFLGLFWMYNAISVVIFHFSWKMQSDVWGSINDQGVVTHITGGNFAQSSITINGWLRDFLWAQASQVIQSYGSSLSAYGLFFLGAHFVWAFSLMFLFSGRGYWQELIESIVWAHNKLKVAPATQPRALSIVQGRAVGVTHYLLGGIATTWAFFLARIIAVG

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2
分子量 formula_weight	82381.7 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

ALRFPRFSQGLAQDPTTRRIWFGIATAHDFESHDDITEGRLYQNIFASHFGQLAIIFLWTSGNLFHVAWQGNFEAWVQDPLHVRPIAHAIWDPHFGQPAVEAFTRGGALGPVNIAYSGVYQWWYTIGLRTNEDLYTGAIFLLFLSFISLLAGWLHLQPKWKPSVSWFKNAESRLNHHLSGLFGVSSLAWAGHLVHVAIPGSRGEYVRWNNFLSVLPHPQGLGPLFTGQWNLYAQNPDSSNHLFSTSQGAGTAILTLLGGFHPQTQSLWLTDMAHHHLAIAILFLIGGHMYRTNFGIGHSIKYILEAHIPPGGRLGRGHKGLYDTINNSIHFQLGLALASLGVITSLVAQHMYSLPAYAFIAQDFTTQAALYTHHQYIAGFIMTGAFAHGAIFFIRDYNPEQNADNVLARMLEHKEAIISHLSWASLFLGFHTLGLYVHNDVMLAFGTPEKQILIEPIFAQWIQSAHGKTSYGFDVLLSSTNSPALNAGRSIWLPGWLNAINENSNSLFLTIGPGDFLVHHAIALGLHTTTLILVKGALDARGSKLMPDKKDFGYSFPCDGPGRGGTCDISAWDAFYLAVFWMLNTIGWVTFYWHWKHITLWQGNVSQFNESSTYLMGWLRDYLWLNSSQLINGYNPFGMNSLSVWAWMFLFGHLVWATGFMFLISWRGYWQELIETLAWAHERTPLANLIRWRDKPVALSIVQARLVGLVHFSVGYIFTYAAFLIASTSGKFG

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Photosystem I iron-sulfur center
分子量 formula_weight	8860.3 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

SHSVKIYDTCIGCTQCVRACPTDVLEMIPWGGCKAKQIASAPRTEDCVGCKRCESACPTDFLSVRVYLWHETTRSMGLAY

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	PsaD
分子量 formula_weight	16041.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

GFTPPELDPNTPSPIFGGSTGGLLRKAQVEEFYVITWESPKEQIFEMPTGGAAIMREGPNLLKLARKEQCLALGTRLRSKYKIKYQFYRVFPSGEVQYLHPKDGVYPEKVNPGRQGVGVNFRSIGKNVSPIEVKFTGKQPYDL

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	PsaE
分子量 formula_weight	7479.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

PPIGPKRGAKVKILRQESYWYKGTGSVVAVDQDPNTRYPVVVRFNKVNYANVSTNNYALDEVEEVK

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	PsaF
分子量 formula_weight	17137.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

DIAGLTPCKDSKQFAKREKQSIKKLESSLKLYAPDSAPALAINATIEKTKRRFDNYGKQGLLCGADGLPHLIVSGDQRHWGEFITPGILFLYIAGWIGWVGRSYLIAIRDDKKPTQKEIIIDVPLATGLVFRGFSWPIAAYRELLNGELVAKDV

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	PsaG
分子量 formula_weight	10678.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

LNPSLVISLSTGLSLFLGRFVFFNFQRENVAKQGLPEQNGVTHFEAGDTRAKEYVSLLKSNDPVGFNIVDVLAWGSIGHIVAYYILATSSNGYDPKF

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	PsaH
分子量 formula_weight	9491.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

VYFDLEDLGNTTGQWDLYGSDAPSPYNSLQSKFFETFAAPFTKRGLLLKFLILGGGSTLAYFSATASGDILPIKKGPQLPPQLGPRLG

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit VIII
分子量 formula_weight	3409.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

INLPSLFVPLVGLLFPAVAMASLFLHVEKRL

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit IX
分子量 formula_weight	4767.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MRDLKTYLSVAPVASTLWFAALAGLLIEINRFFPDALTFPFF

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit X psaK
分子量 formula_weight	8135.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

FIGSPTNLIMVTSTSLMLFAGRFGLAPSANRKATAGLKLEARDSGLQTGDPAGFTLADTLACGVVGHIIGVGVVLGLKNIG

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	PsaL
分子量 formula_weight	16565.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

YQVVQPINGDPFIGSLETPVTSSPLVAWYLSNLPGYRTAVNPLLRGIEVGLAHGFLLVGPFVKAGPLRNTEIAGQAGSLAAGGLVVILSICLTIYGISSFNEGDPSTAPSLTLTGRKKQPDQLQTADGWAKFTGGFFFGGISGVIWAFFLLYVLDLP

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Lhca1
分子量 formula_weight	21335.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1

DWMPGQPRPSYLDGSAPGDFGFDPLRLGEVPENLERFKESELIHCRWAMLAVPGILVPEALGLGNWVKAQEWAALPGGQATYLGNPVPWGTLPTILVIEFLSIAFVEHQRSMEKDPEKKKYPGGAFDPLGYSKDPKKFHEYKIKEVKNGRLALLAFVGICVQQSAYPGTGPLENLATHLADPWHNTIGNVLIP

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic
分子量 formula_weight	22845.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	2

TVAEPDRPLWFPGSTPPPWLDGSLPGDFGFDPLGLGSDPESLRWNVQAELVHSRWAMLGAAGIFIPEFLTKLGILNTPSWYTAGEQEYFTDTTTLFIVELVFIGWAEGRRWADILNPGCVNTDPIFPNNKLTGTDVGYPGGLWFDPLGWGSASPQKLKELRTKEIKNGRLAMLAVMGAWFQHIYTGTGPIDNLFAHLADPGHATIFAA

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic
分子量 formula_weight	24139.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	3

RPLWFASKQSLSYLDGSLPGDYGFDPLGLSDPEGTGGFIEPRWLAYGEVINGRFAMLGAVGAIAPEYLGKVGLIPQETALAWFQTGVIPPAGTYNYWADNYTLFVLEMALMGFAEHRRFQDWAKPGSMGKQYFLGLEKGFGGSGNPAYPGGPFFNPLGFGKDEKSLKELKLKEVKNGRLAMLAILGYFIQGLVTGVGPYQNLLDHVADPVNNNVLTSLKFH

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	Chlorophyll a-b binding protein P4, chloroplastic
分子量 formula_weight	21994.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	4

KKGEWLPGLASPGYLTGSLPGDNGFDPLGLAEDPENLKWFVQAELVNGRWAMLGVAGMLLPEVFTSIGIINVPKWYDAGKEEYFASSSTLFVIEFILFHYVEIRRWQDIKNPGSVNQDPIFKQYSLPAGEVGYPGGIFNPLNFAPTLEAKEKEIANGRLAMLAFLGFIIQHNVTGKGPFDNLLQHISDPWHNTIVQTL

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	Ferredoxin-1, chloroplastic
分子量 formula_weight	10359.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

ASYKVKLVTPDGTQEFECPSDVYILDHAEEVGIDLPYSCRAGSCSSCAGKVVGGEVDQSDGSFLDDEQIEAGFVLTCVAYPTSDVVIETHKEEDLTA

实体 18 Entity 18 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A ISOMER
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 19 Entity 19 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	141

实体 20 Entity 20 non-polymer

描述 description	PHYLLOQUINONE
分子量 formula_weight	450.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 21 Entity 21 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 22 Entity 22 non-polymer

描述 description	BETA-CAROTENE
分子量 formula_weight	536.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	27

实体 23 Entity 23 non-polymer

描述 description	1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE
分子量 formula_weight	723.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 24 Entity 24 non-polymer

描述 description	DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE
分子量 formula_weight	510.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 25 Entity 25 non-polymer

描述 description	1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE
分子量 formula_weight	787.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	19

实体 26 Entity 26 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 27 Entity 27 non-polymer

描述 description	DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)
分子量 formula_weight	949.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 28 Entity 28 non-polymer

描述 description	(3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL
分子量 formula_weight	568.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

实体 29 Entity 29 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL B
分子量 formula_weight	907.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	15

实体 30 Entity 30 non-polymer

描述 description	;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ;
分子量 formula_weight	600.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 31 Entity 31 non-polymer

描述 description	;(1~{S})-3,5,5-trimethyl-4-[(1~{E},3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(4~{S})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohexen-1-yl]octadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaenyl]cyclohex-3-en-1-ol ;
分子量 formula_weight	568.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 32 Entity 32 non-polymer

描述 description	FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
分子量 formula_weight	175.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 33 Entity 33 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	56

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 19 domains

SCOP 2.08 (14 domains)

结构域编号 domain_id	d6yac1_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.43 — Chlorophyll a-b binding protein
超家族 Superfamily superfamily	f.43.1 — Chlorophyll a-b binding protein
家族 Family family	f.43.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6yac2_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.43 — Chlorophyll a-b binding protein
超家族 Superfamily superfamily	f.43.1 — Chlorophyll a-b binding protein
家族 Family family	f.43.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6yac3_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.43 — Chlorophyll a-b binding protein
超家族 Superfamily superfamily	f.43.1 — Chlorophyll a-b binding protein
家族 Family family	f.43.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6yac4_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.43 — Chlorophyll a-b binding protein
超家族 Superfamily superfamily	f.43.1 — Chlorophyll a-b binding protein
家族 Family family	f.43.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6yaca_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.29 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB
超家族 Superfamily superfamily	f.29.1 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB
家族 Family family	f.29.1.1 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB

结构域编号 domain_id	d6yacb_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.29 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB
超家族 Superfamily superfamily	f.29.1 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB
家族 Family family	f.29.1.1 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB

结构域编号 domain_id	d6yacc_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.1 — 4Fe-4S ferredoxins
家族 Family family	d.58.1.2 — 7-Fe ferredoxin

结构域编号 domain_id	d6yacd_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.187 — Photosystem I subunit PsaD
超家族 Superfamily superfamily	d.187.1 — Photosystem I subunit PsaD
家族 Family family	d.187.1.1 — Photosystem I subunit PsaD

结构域编号 domain_id	d6yace1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.34 — SH3-like barrel
超家族 Superfamily superfamily	b.34.4 — Electron transport accessory proteins
家族 Family family	b.34.4.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6yace2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d6yacf_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.16 — Subunit III of photosystem I reaction centre, PsaF
家族 Family family	f.23.16.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6yacj_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.18 — Subunit IX of photosystem I reaction centre, PsaJ
家族 Family family	f.23.18.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6yacl_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.31 — Photosystem I reaction center subunit XI, PsaL
超家族 Superfamily superfamily	f.31.1 — Photosystem I reaction center subunit XI, PsaL
家族 Family family	f.31.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6yacn_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.4 — 2Fe-2S ferredoxin-like
家族 Family family	d.15.4.1 — 2Fe-2S ferredoxin-related

CATH v4.4 (5 domains)

结构域编号 domain_id	6yac101
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3460 — Chlorophyll a-b binding protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Chlorophyll a/b binding protein domain

结构域编号 domain_id	6yac201
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3460 — Chlorophyll a-b binding protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Chlorophyll a/b binding protein domain

结构域编号 domain_id	6yac301
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3460 — Chlorophyll a-b binding protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Chlorophyll a/b binding protein domain

结构域编号 domain_id	6yac401
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3460 — Chlorophyll a-b binding protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Chlorophyll a/b binding protein domain

结构域编号 domain_id	6yacL01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1240 — Photosystem 1 Reaction Centre Subunit Xi; Chain: L;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem I PsaL, reaction centre subunit XI

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	2.50 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	269657

Plant PSI-ferredoxin supercomplex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I iron-sulfur center

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit VIII

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit IX

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit X psaK

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Chlorophyll a-b binding protein P4, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Ferredoxin-1, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体