6zbb

bovine ATP synthase Fo domain

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP synthase protein 8

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial × 8 （P32876） ATP synthase subunit a × 1 （P00847） ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial × 1 （P13619） ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 （P13620） ATP synthase subunit e, mitochondrial × 1 （Q00361） ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 （Q28851） ATP synthase subunit g, mitochondrial × 1 （Q28852） ATP synthase subunit ATP5MPL, mitochondrial × 1 （P14790） ATP synthase membrane subunit DAPIT, mitochondrial × 1 （Q3ZBI7） CARDIOLIPIN × 3 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ATP8_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 8； PDB构建体 1–66； UniProt 1–66

ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial

物种未注明

UniProt P32876

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	ATP synthase protein 8 × 1 （P03929） ATP synthase subunit a × 1 （P00847） ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial × 1 （P13619） ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 （P13620） ATP synthase subunit e, mitochondrial × 1 （Q00361） ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 （Q28851） ATP synthase subunit g, mitochondrial × 1 （Q28852） ATP synthase subunit ATP5MPL, mitochondrial × 1 （P14790） ATP synthase membrane subunit DAPIT, mitochondrial × 1 （Q3ZBI7） CARDIOLIPIN × 3 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	AT5G1_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–75； UniProt 62–136 作者链 L； PDB构建体 1–75； UniProt 62–136 作者链 M； PDB构建体 1–75； UniProt 62–136 作者链 N； PDB构建体 1–75； UniProt 62–136 作者链 O； PDB构建体 1–75； UniProt 62–136 作者链 P； PDB构建体 1–75； UniProt 62–136 作者链 Q； PDB构建体 1–75； UniProt 62–136 作者链 R； PDB构建体 1–75； UniProt 62–136

ATP synthase subunit a

物种未注明

UniProt P00847

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	ATP synthase protein 8 × 1 （P03929） ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial × 8 （P32876） ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial × 1 （P13619） ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 （P13620） ATP synthase subunit e, mitochondrial × 1 （Q00361） ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 （Q28851） ATP synthase subunit g, mitochondrial × 1 （Q28852） ATP synthase subunit ATP5MPL, mitochondrial × 1 （P14790） ATP synthase membrane subunit DAPIT, mitochondrial × 1 （Q3ZBI7） CARDIOLIPIN × 3 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ATP6_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 a； PDB构建体 1–226； UniProt 1–226

ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial

物种未注明

UniProt P13619

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	ATP synthase protein 8 × 1 （P03929） ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial × 8 （P32876） ATP synthase subunit a × 1 （P00847） ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 （P13620） ATP synthase subunit e, mitochondrial × 1 （Q00361） ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 （Q28851） ATP synthase subunit g, mitochondrial × 1 （Q28852） ATP synthase subunit ATP5MPL, mitochondrial × 1 （P14790） ATP synthase membrane subunit DAPIT, mitochondrial × 1 （Q3ZBI7） CARDIOLIPIN × 3 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	AT5F1_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 b； PDB构建体 1–214； UniProt 43–256

ATP synthase subunit d, mitochondrial

物种未注明

UniProt P13620

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	ATP synthase protein 8 × 1 （P03929） ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial × 8 （P32876） ATP synthase subunit a × 1 （P00847） ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial × 1 （P13619） ATP synthase subunit e, mitochondrial × 1 （Q00361） ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 （Q28851） ATP synthase subunit g, mitochondrial × 1 （Q28852） ATP synthase subunit ATP5MPL, mitochondrial × 1 （P14790） ATP synthase membrane subunit DAPIT, mitochondrial × 1 （Q3ZBI7） CARDIOLIPIN × 3 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ATP5H_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 d； PDB构建体 1–160； UniProt 2–161

ATP synthase subunit e, mitochondrial

物种未注明

UniProt Q00361

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	ATP synthase protein 8 × 1 （P03929） ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial × 8 （P32876） ATP synthase subunit a × 1 （P00847） ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial × 1 （P13619） ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 （P13620） ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 （Q28851） ATP synthase subunit g, mitochondrial × 1 （Q28852） ATP synthase subunit ATP5MPL, mitochondrial × 1 （P14790） ATP synthase membrane subunit DAPIT, mitochondrial × 1 （Q3ZBI7） CARDIOLIPIN × 3 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ATP5I_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 e； PDB构建体 1–70； UniProt 2–71

ATP synthase subunit f, mitochondrial

物种未注明

UniProt Q28851

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	ATP synthase protein 8 × 1 （P03929） ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial × 8 （P32876） ATP synthase subunit a × 1 （P00847） ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial × 1 （P13619） ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 （P13620） ATP synthase subunit e, mitochondrial × 1 （Q00361） ATP synthase subunit g, mitochondrial × 1 （Q28852） ATP synthase subunit ATP5MPL, mitochondrial × 1 （P14790） ATP synthase membrane subunit DAPIT, mitochondrial × 1 （Q3ZBI7） CARDIOLIPIN × 3 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ATPK_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 f； PDB构建体 1–87； UniProt 2–88

ATP synthase subunit g, mitochondrial

物种未注明

UniProt Q28852

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	ATP synthase protein 8 × 1 （P03929） ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial × 8 （P32876） ATP synthase subunit a × 1 （P00847） ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial × 1 （P13619） ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 （P13620） ATP synthase subunit e, mitochondrial × 1 （Q00361） ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 （Q28851） ATP synthase subunit ATP5MPL, mitochondrial × 1 （P14790） ATP synthase membrane subunit DAPIT, mitochondrial × 1 （Q3ZBI7） CARDIOLIPIN × 3 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ATP5L_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 g； PDB构建体 1–102； UniProt 2–103

ATP synthase subunit ATP5MPL, mitochondrial

物种未注明

UniProt P14790

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	ATP synthase protein 8 × 1 （P03929） ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial × 8 （P32876） ATP synthase subunit a × 1 （P00847） ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial × 1 （P13619） ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 （P13620） ATP synthase subunit e, mitochondrial × 1 （Q00361） ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 （Q28851） ATP synthase subunit g, mitochondrial × 1 （Q28852） ATP synthase membrane subunit DAPIT, mitochondrial × 1 （Q3ZBI7） CARDIOLIPIN × 3 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ATP68_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 j； PDB构建体 1–60； UniProt 1–60

ATP synthase membrane subunit DAPIT, mitochondrial

物种未注明

UniProt Q3ZBI7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	ATP synthase protein 8 × 1 （P03929） ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial × 8 （P32876） ATP synthase subunit a × 1 （P00847） ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial × 1 （P13619） ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 （P13620） ATP synthase subunit e, mitochondrial × 1 （Q00361） ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 （Q28851） ATP synthase subunit g, mitochondrial × 1 （Q28852） ATP synthase subunit ATP5MPL, mitochondrial × 1 （P14790） CARDIOLIPIN × 3 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ATPMD_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 k； PDB构建体 1–57； UniProt 2–58

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6zbb
沉积日期 deposition_date	2020-06-08
结构标题 title	bovine ATP synthase Fo domain
关键词 keywords	ATP synthase, mitochondria, mammalian, complex, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6zbb__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6zbb__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6zbb__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	36.85 Å
Rg（电子密度）	36.07 Å
总 Rg	36.58 Å
原子数	21505
残基数	1320
排除体积	193930 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6zbb__assembly_1__model_1`	heptadecameric （17）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (12)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ATP synthase protein 8
分子量 formula_weight	7944.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	8
原子数 atom_count	21505

MPQLDTSTWLTMILSMFLTLFIIFQLKVSKHNFYHNPELTPTKMLKQNTPWETKWTKIYLPLLLPL

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial
分子量 formula_weight	7653.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,L,M,N,O,P,Q,R

DIDTAAKFIGAGAATVGVAGSGAGIGTVFGSLIIGYARNPSLKQQLFSYAILGFALSEAMGLFCLMVAFLILFAM

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	ATP synthase subunit a
分子量 formula_weight	24801.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a

MNENLFTSFITPVILGLPLVTLIVLFPSLLFPTSNRLVSNRFVTLQQWMLQLVSKQMMSIHNSKGQTWTLMLMSLILFIGSTNLLGLLPHSFTPTTQLSMNLGMAIPLWAGAVITGFRNKTKASLAHFLPQGTPTPLIPMLVIIETISLFIQPMALAVRLTANITAGHLLIHLIGGATLALMSISTTTALITFTILILLTILEFAVAMIQAYVFTLLVSLYLHDNT

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial
分子量 formula_weight	24702.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b

PVPPLPEHGGKVRFGLIPEEFFQFLYPKTGVTGPYVLGTGLILYLLSKEIYVITPETFSAISTIGFLVYIVKKYGASVGEFADKLNEQKIAQLEEVKQASIKQIQDAIDMEKSQQALVQKRHYLFDVQRNNIAMALEVTYRERLHRVYREVKNRLDYHISVQNMMRQKEQEHMINWVEKRVVQSISAQQEKETIAKCIADLKLLSKKAQAQPVM

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	ATP synthase subunit d, mitochondrial
分子量 formula_weight	18588.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	d

AGRKLALKTIDWVAFGEIIPRNQKAVANSLKSWNETLTSRLATLPEKPPAIDWAYYKANVAKAGLVDDFEKKFNALKVPIPEDKYTAQVDAEEKEDVKSCAEFLTQSKTRIQEYEKELEKMRNIIPFDQMTIEDLNEVFPETKLDKKKYPYWPHRPIETL

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	ATP synthase subunit e, mitochondrial
分子量 formula_weight	8205.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	e

VPPVQVSPLIKLGRYSALFLGMAYGAKRYNYLKPRAEEERRLAAEEKKKRDEQKRIERELAEAQEDTILK

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	ATP synthase subunit f, mitochondrial
分子量 formula_weight	10184.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	f

ASVVPLKEKKLLEVKLGELPSWILMRDFTPSGIAGAFQRGYYRYYNKYVNVKKGSIAGLSMVLAAYVFLNYCRSYKELKHERLRKYH

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	ATP synthase subunit g, mitochondrial
分子量 formula_weight	11298.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	g

AEFVRNLAEKAPALVNAAVTYSKPRLATFWYYAKVELVPPTPAEIPTAIQSLKKIINSAKTGSFKQLTVKEALLNGLVATEVWMWFYVGEIIGKRGIIGYDV

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	ATP synthase subunit ATP5MPL, mitochondrial
分子量 formula_weight	6846.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	j

MLQSLIKKVWIPMKPYYTQAYQEIWVGTGLMAYIVYKIRSADKRSKALKASSAAPAHGHH

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	ATP synthase membrane subunit DAPIT, mitochondrial
分子量 formula_weight	6312.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	k

AGPEADAQFHFTGIKKYFNSYTLTGRMNCVLATYGSIALIVLYFKLRSKKTPAVKAT

实体 11 Entity 11 non-polymer

描述 description	CARDIOLIPIN
分子量 formula_weight	1464.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 12 Entity 12 non-polymer

描述 description	1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE
分子量 formula_weight	723.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	6zbbQ00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	3.61 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	253473

bovine ATP synthase Fo domain

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP synthase protein 8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP synthase subunit a

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP synthase subunit d, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP synthase subunit e, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP synthase subunit f, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP synthase subunit g, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP synthase subunit ATP5MPL, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP synthase membrane subunit DAPIT, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体