SAXSdb — 7d35

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Dynein light chain 1, cytoplasmic

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–89	未记录	Peptide from Polymerase cofactor VP35 × 2 （Q6V1Q9）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200mM ammonium citrate dibasic, 200mM ammonium citrate tribasic (pH 5.5), 30% (w/v) polyethylene glycol 3350	分辨率 2.40 Å R-free 0.292

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7D35	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1CMI STRUCTURE OF THE HUMAN PIN/LC8 DIMER WITH A BOUND PEPTIDE 提交 1999-05-06	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 5–89（85 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.4；pH 8.4	分辨率 2.50 Å R-free 0.283
1CMI STRUCTURE OF THE HUMAN PIN/LC8 DIMER WITH A BOUND PEPTIDE 提交 1999-05-06	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 5–89（85 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.4；pH 8.4	分辨率 2.50 Å R-free 0.283
3ZKE Structure of LC8 in complex with Nek9 peptide 提交 2013-01-22	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–89（89 aa）链 C 1–89（89 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.20 Å R-free 0.228
3ZKE Structure of LC8 in complex with Nek9 peptide 提交 2013-01-22	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 1–89（89 aa）链 G 1–89（89 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.20 Å R-free 0.228
3ZKE Structure of LC8 in complex with Nek9 peptide 提交 2013-01-22	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 I 1–89（89 aa）链 K 1–89（89 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.20 Å R-free 0.228
3ZKF Structure of LC8 in complex with Nek9 phosphopeptide 提交 2013-01-22	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 1–89（89 aa）链 K 1–89（89 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.60 Å R-free 0.269
3ZKF Structure of LC8 in complex with Nek9 phosphopeptide 提交 2013-01-22	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–89（89 aa）链 C 1–89（89 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.60 Å R-free 0.269
3ZKF Structure of LC8 in complex with Nek9 phosphopeptide 提交 2013-01-22	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 G 1–89（89 aa）链 I 1–89（89 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.60 Å R-free 0.269
6GZJ Complex between the dynein light chain DYNLL1/DLC8 and the specific domain of large myelin-associated glycoprotein L-MAG 提交 2018-07-04	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–89（89 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 6.5, 0.2 M lithium sulfate, and 25% (w/v) PEG 3350	分辨率 1.98 Å R-free 0.229
6GZL Complex between the dynein light chain DYNLL1/DLC8 and a peptide from the large myelin-associated glycoprotein L-MAG 提交 2018-07-04	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–89（89 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 6.5, 0.2 M lithium sulfate, and 25% (w/v) PEG 3350	分辨率 1.95 Å R-free 0.251
6RLB Structure of the dynein-2 complex; tail domain 提交 2019-05-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 I 1–89（89 aa）链 J 1–89（89 aa）链 K 1–89（89 aa）链 L 1–89（89 aa）链 M 1–89（89 aa）链 N 1–89（89 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
6SC2 Structure of the dynein-2 complex; IFT-train bound model 提交 2019-07-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 I 1–89（89 aa）链 J 1–89（89 aa）链 K 1–89（89 aa）链 L 1–89（89 aa）链 M 1–89（89 aa）链 N 1–89（89 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8PR0 Cytoplasmic dynein-A heavy chain bound to dynactin-p150glued and IC-LC tower 提交 2023-07-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 E 1–89（89 aa）链 F 1–89（89 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.40 Å
8PR1 Cytoplasmic dynein-B heavy chain bound to IC-LC tower 提交 2023-07-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 D 1–89（89 aa）链 E 1–89（89 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.20 Å
8PTK Composite structure of Dynein-Dynactin-JIP3-LIS1 提交 2023-07-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：53-meric	链 a 1–89（89 aa）链 b 1–89（89 aa）链 d 1–89（89 aa）链 i 1–89（89 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 6 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.00 Å
8RGG Structure of dynein-2 intermediate chain DYNC2I2 (WDR34) in complex with dynein-2 heavy chain DYNC2H1. 提交 2023-12-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 I 1–89（89 aa）链 J 1–89（89 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
9BLY Composite structure of full-length human dynein-1 in phi-particle conformation 提交 2024-05-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 I 1–89（89 aa）链 J 1–89（89 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2；25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9E12 Full-length human dynein-1 in phi comformation under Lis1 condition 提交 2024-10-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 I 1–89（89 aa）链 J 1–89（89 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
9E13 Full-length human dynein-1 in phi-like comformation bound to a Lis1 dimer under Lis1 condition 提交 2024-10-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 I 1–89（89 aa）链 J 1–89（89 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2；25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 3 mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
9E14 Full-length human dynein-1 in phi-like comformation bound to a Lis1 dimer under Nde1-Lis1 condition 提交 2024-10-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 I 1–89（89 aa）链 J 1–89（89 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2；25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 3 mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.00 Å
9E23 Cryo-EM structure of Pre-Chi dynein tail 提交 2024-10-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric	链 d 1–89（89 aa）链 i 1–89（89 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 6.20 Å
9E28 Cryo-EM structure of Phi dynein tail 提交 2024-10-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric	链 d 1–89（89 aa）链 i 1–89（89 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.40 Å
9NZ7 Crystal structure of human DYNLL1-S64A/S88A mutant dimer 提交 2025-03-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–89（89 aa）链 B 1–89（89 aa）	突变：S64A, S88A 突变：S64A, S88A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；24% PEG2000 MME, 50 mM calcium chloride, 100 mM HEPES, 10 mM DTT, 10% glycerol	分辨率 1.41 Å R-free 0.234
9NZ7 Crystal structure of human DYNLL1-S64A/S88A mutant dimer 提交 2025-03-31	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–89（89 aa）	突变：S64A, S88A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；24% PEG2000 MME, 50 mM calcium chloride, 100 mM HEPES, 10 mM DTT, 10% glycerol	分辨率 1.41 Å R-free 0.234
9YNE Motor domain of human dynein-1 in pre-power stroke bound to dynactin-p150glued-CC1B-ICD and LIS1 提交 2025-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 d 1–89（89 aa）链 i 1–89（89 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.46 Å
9YNH Full-length human cytoplasmic dynein-1 in phi-like state bound to dynactin-p150glued and LIS1 提交 2025-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 I 1–89（89 aa）链 J 1–89（89 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.50 Å

共 20 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DYL1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–91； UniProt 1–89

Peptide from Polymerase cofactor VP35

物种未注明

UniProt Q6V1Q9

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 67–76	未记录	Dynein light chain 1, cytoplasmic × 2 （P63167）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200mM ammonium citrate dibasic, 200mM ammonium citrate tribasic (pH 5.5), 30% (w/v) polyethylene glycol 3350	分辨率 2.40 Å R-free 0.292

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7D35	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5BPV Crystal Structure of Zaire ebolavirus VP35 RNA binding domain mutant I278A 提交 2015-05-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 217–340（124 aa）片段：RNA binding domain, UNP residues 217-340	突变：I278A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2 M potassium sodium tartrate tetrahydrate, 20% PEG 3350	分辨率 1.95 Å R-free 0.218
5BPV Crystal Structure of Zaire ebolavirus VP35 RNA binding domain mutant I278A 提交 2015-05-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 217–340（124 aa）片段：RNA binding domain, UNP residues 217-340	突变：I278A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2 M potassium sodium tartrate tetrahydrate, 20% PEG 3350	分辨率 1.95 Å R-free 0.218

共 1 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	VP35_EBOZ5
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–10； UniProt 67–76

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7d35
沉积日期 deposition_date	2020-09-18
结构标题 title	Human LC8 bound to ebola virus VP35(67-76)
关键词 keywords	LC8, Ebola virus, EBOV, VP35, UNKNOWN FUNCTION; UNKNOWN FUNCTION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	13.95 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	12.49 Å
零角强度 I(0) i0	2687160.00
分子量 molecular_weight	11220.0 kDa
排除体积 excluded_volume	14007 Å³
包络体积 envelope_volume	15455 Å³
水化壳体积 shell_volume	10490 Å³
包络直径 envelope_diameter	43.0 Å
壳层 Rg shell_rg	18.29 Å
包络 Rg envelope_rg	12.92 Å
形状 Rg shape_rg	12.45 Å
总 Rg total_rg	13.93 Å
总原子数 total_atoms	790
残基数 n_residues	96
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	43.5 Å
Rg (实空间) rg_real	13.85 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.26 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.6870e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.0580e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal	13.86 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	2687000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8176
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	18.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.094
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.403
角度范围 angular_range	— – 0.5000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	590300.0000
实空间数据点数 n_real_points	80
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.880; Stabil: 0.998; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.991; Smooth: 0.000

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Dynein light chain 1, cytoplasmic
分子量 formula_weight	10577.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	807

GHMCDRKAVIKNADMSEEMQQDSVECATQALEKYNIEKDIAAHIKKEFDKKYNPTWHCIVGRNFGSYVTHETKHFIYFYLGQVAILLFKSG

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Peptide from Polymerase cofactor VP35
分子量 formula_weight	1180.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

KTRNSQTQTD

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	17

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	43.426 Å
晶胞边长 b length_b	43.426 Å
晶胞边长 c length_c	205.190 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 61 2 2
空间群编号 int_tables_number	178
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.401 Å
最低分辨率 resolution_low	30.330 Å
R 因子 r_factor	0.2340
R_work r_work	0.2276
R_free r_free	0.2917

fit	/app/data/saxs_computation/d3/7d35/7d35.fit
pddf	/app/data/pr_computation/d3/7d35/7d35.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/d3/7d35/7d35.dat

Human LC8 bound to ebola virus VP35(67-76)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Dynein light chain 1, cytoplasmic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Peptide from Polymerase cofactor VP35

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 water

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)