7ktr

Cryo-EM structure of the human SAGA coactivator complex (TRRAP, core)

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein ;

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	TAF5-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 5L × 1 （O75529） Isoform 3 of Transcription factor SPT20 homolog × 1 （Q8NEM7） ;STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA,STAGA complex 65 subunit gamma,STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA,STAGA complex 65 subunit gamma,STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA ; × 1 （O94864） Transcription initiation factor TFIID subunit 9B × 1 （Q9HBM6） TAF6-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 6L × 1 （Q9Y6J9） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 1 （Q16514） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 1 （Q12962） ;Transcription initiation protein SPT3 homolog,Transcription initiation protein SPT3 homolog,Transcription initiation protein SPT3 homolog ; × 1 （O75486） Transcriptional adapter 1 × 1 （Q96BN2） Ataxin-7 × 1 （O15265） INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	F2Z2U4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 18–1337； UniProt 369–1688 作者链 A； PDB构建体 1647–3195； UniProt 2300–3848

TAF5-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 5L

物种未注明

UniProt O75529

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	;Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein ; × 1 （F2Z2U4） Isoform 3 of Transcription factor SPT20 homolog × 1 （Q8NEM7） ;STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA,STAGA complex 65 subunit gamma,STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA,STAGA complex 65 subunit gamma,STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA ; × 1 （O94864） Transcription initiation factor TFIID subunit 9B × 1 （Q9HBM6） TAF6-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 6L × 1 （Q9Y6J9） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 1 （Q16514） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 1 （Q12962） ;Transcription initiation protein SPT3 homolog,Transcription initiation protein SPT3 homolog,Transcription initiation protein SPT3 homolog ; × 1 （O75486） Transcriptional adapter 1 × 1 （Q96BN2） Ataxin-7 × 1 （O15265） INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TAF5L_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–589； UniProt 1–589

Isoform 3 of Transcription factor SPT20 homolog

物种未注明

UniProt Q8NEM7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	;Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein ; × 1 （F2Z2U4） TAF5-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 5L × 1 （O75529） ;STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA,STAGA complex 65 subunit gamma,STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA,STAGA complex 65 subunit gamma,STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA ; × 1 （O94864） Transcription initiation factor TFIID subunit 9B × 1 （Q9HBM6） TAF6-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 6L × 1 （Q9Y6J9） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 1 （Q16514） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 1 （Q12962） ;Transcription initiation protein SPT3 homolog,Transcription initiation protein SPT3 homolog,Transcription initiation protein SPT3 homolog ; × 1 （O75486） Transcriptional adapter 1 × 1 （Q96BN2） Ataxin-7 × 1 （O15265） INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	SP20H_HUMAN
Isoform	Q8NEM7-3
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–811； UniProt 1–811

;STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA,STAGA complex 65 subunit gamma,STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA,STAGA complex 65 subunit gamma,STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA ;

unclassified Rhodococcus

UniProt O94864

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	;Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein ; × 1 （F2Z2U4） TAF5-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 5L × 1 （O75529） Isoform 3 of Transcription factor SPT20 homolog × 1 （Q8NEM7） Transcription initiation factor TFIID subunit 9B × 1 （Q9HBM6） TAF6-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 6L × 1 （Q9Y6J9） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 1 （Q16514） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 1 （Q12962） ;Transcription initiation protein SPT3 homolog,Transcription initiation protein SPT3 homolog,Transcription initiation protein SPT3 homolog ; × 1 （O75486） Transcriptional adapter 1 × 1 （Q96BN2） Ataxin-7 × 1 （O15265） INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ST65G_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 16–51； UniProt 52–87 作者链 D； PDB构建体 74–369； UniProt 119–414

Transcription initiation factor TFIID subunit 9B

物种未注明

UniProt Q9HBM6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	;Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein ; × 1 （F2Z2U4） TAF5-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 5L × 1 （O75529） Isoform 3 of Transcription factor SPT20 homolog × 1 （Q8NEM7） ;STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA,STAGA complex 65 subunit gamma,STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA,STAGA complex 65 subunit gamma,STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA ; × 1 （O94864） TAF6-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 6L × 1 （Q9Y6J9） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 1 （Q16514） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 1 （Q12962） ;Transcription initiation protein SPT3 homolog,Transcription initiation protein SPT3 homolog,Transcription initiation protein SPT3 homolog ; × 1 （O75486） Transcriptional adapter 1 × 1 （Q96BN2） Ataxin-7 × 1 （O15265） INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TAF9B_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–251； UniProt 1–251

TAF6-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 6L

物种未注明

UniProt Q9Y6J9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	;Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein ; × 1 （F2Z2U4） TAF5-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 5L × 1 （O75529） Isoform 3 of Transcription factor SPT20 homolog × 1 （Q8NEM7） ;STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA,STAGA complex 65 subunit gamma,STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA,STAGA complex 65 subunit gamma,STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA ; × 1 （O94864） Transcription initiation factor TFIID subunit 9B × 1 （Q9HBM6） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 1 （Q16514） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 1 （Q12962） ;Transcription initiation protein SPT3 homolog,Transcription initiation protein SPT3 homolog,Transcription initiation protein SPT3 homolog ; × 1 （O75486） Transcriptional adapter 1 × 1 （Q96BN2） Ataxin-7 × 1 （O15265） INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TAF6L_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–622； UniProt 1–622

Transcription initiation factor TFIID subunit 12

物种未注明

UniProt Q16514

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	;Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein ; × 1 （F2Z2U4） TAF5-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 5L × 1 （O75529） Isoform 3 of Transcription factor SPT20 homolog × 1 （Q8NEM7） ;STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA,STAGA complex 65 subunit gamma,STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA,STAGA complex 65 subunit gamma,STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA ; × 1 （O94864） Transcription initiation factor TFIID subunit 9B × 1 （Q9HBM6） TAF6-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 6L × 1 （Q9Y6J9） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 1 （Q12962） ;Transcription initiation protein SPT3 homolog,Transcription initiation protein SPT3 homolog,Transcription initiation protein SPT3 homolog ; × 1 （O75486） Transcriptional adapter 1 × 1 （Q96BN2） Ataxin-7 × 1 （O15265） INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TAF12_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161

Transcription initiation factor TFIID subunit 10

物种未注明

UniProt Q12962

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	;Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein ; × 1 （F2Z2U4） TAF5-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 5L × 1 （O75529） Isoform 3 of Transcription factor SPT20 homolog × 1 （Q8NEM7） ;STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA,STAGA complex 65 subunit gamma,STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA,STAGA complex 65 subunit gamma,STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA ; × 1 （O94864） Transcription initiation factor TFIID subunit 9B × 1 （Q9HBM6） TAF6-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 6L × 1 （Q9Y6J9） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 1 （Q16514） ;Transcription initiation protein SPT3 homolog,Transcription initiation protein SPT3 homolog,Transcription initiation protein SPT3 homolog ; × 1 （O75486） Transcriptional adapter 1 × 1 （Q96BN2） Ataxin-7 × 1 （O15265） INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TAF10_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–218； UniProt 1–218

;Transcription initiation protein SPT3 homolog,Transcription initiation protein SPT3 homolog,Transcription initiation protein SPT3 homolog ;

物种未注明

UniProt O75486

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	;Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein ; × 1 （F2Z2U4） TAF5-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 5L × 1 （O75529） Isoform 3 of Transcription factor SPT20 homolog × 1 （Q8NEM7） ;STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA,STAGA complex 65 subunit gamma,STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA,STAGA complex 65 subunit gamma,STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA ; × 1 （O94864） Transcription initiation factor TFIID subunit 9B × 1 （Q9HBM6） TAF6-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 6L × 1 （Q9Y6J9） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 1 （Q16514） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 1 （Q12962） Transcriptional adapter 1 × 1 （Q96BN2） Ataxin-7 × 1 （O15265） INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	SUPT3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–156； UniProt 1–156 作者链 I； PDB构建体 169–299； UniProt 187–317

Transcriptional adapter 1

物种未注明

UniProt Q96BN2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	;Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein ; × 1 （F2Z2U4） TAF5-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 5L × 1 （O75529） Isoform 3 of Transcription factor SPT20 homolog × 1 （Q8NEM7） ;STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA,STAGA complex 65 subunit gamma,STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA,STAGA complex 65 subunit gamma,STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA ; × 1 （O94864） Transcription initiation factor TFIID subunit 9B × 1 （Q9HBM6） TAF6-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 6L × 1 （Q9Y6J9） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 1 （Q16514） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 1 （Q12962） ;Transcription initiation protein SPT3 homolog,Transcription initiation protein SPT3 homolog,Transcription initiation protein SPT3 homolog ; × 1 （O75486） Ataxin-7 × 1 （O15265） INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TADA1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–335； UniProt 1–335

Ataxin-7

物种未注明

UniProt O15265

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	;Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein ; × 1 （F2Z2U4） TAF5-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 5L × 1 （O75529） Isoform 3 of Transcription factor SPT20 homolog × 1 （Q8NEM7） ;STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA,STAGA complex 65 subunit gamma,STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA,STAGA complex 65 subunit gamma,STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA ; × 1 （O94864） Transcription initiation factor TFIID subunit 9B × 1 （Q9HBM6） TAF6-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 6L × 1 （Q9Y6J9） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 1 （Q16514） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 1 （Q12962） ;Transcription initiation protein SPT3 homolog,Transcription initiation protein SPT3 homolog,Transcription initiation protein SPT3 homolog ; × 1 （O75486） Transcriptional adapter 1 × 1 （Q96BN2） INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ATX7_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–892； UniProt 1–892

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7ktr
沉积日期 deposition_date	2020-11-24
结构标题 title	Cryo-EM structure of the human SAGA coactivator complex (TRRAP, core)
关键词 keywords	coactivator, gene regulation, transcription, chromatin; TRANSCRIPTION
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7ktr__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7ktr__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7ktr__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	64.28 Å
Rg（电子密度）	64.05 Å
总 Rg	64.04 Å
原子数	79321
残基数	5168
排除体积	717350 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7ktr__assembly_1__model_1`	undecameric （11）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (12)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	;Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein ;
分子量 formula_weight	353170.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	79406

XXXXXXXXXXXXXXXXXETLRPLAYSTLADLVHHVRQHLPLSDLSLAVQLFAKNIDDESLPSSIQTMSCKLLLNLVDCIRSKSEQESGNGRDVLMRMLEVFVLKFHTIARYQLSAIFKKCKPQSELGAVEAALPGVPTAPAAPGPAPSPAPVPAPPPPPPPPPPATPVTPAPVPPFEKQGEKDKEDKQTFQVTDCRSLVKTLVCGVKTITWGITSCKAPGAQFIPNKQLQPKETQIYIKLVKYAMQALDIYQVQIAGNGQTYIRVANCQTVRMKEEKEVLEHFAGVFTMMNPLTFKEIFQTTVPYMVERISKNYALQIVANSFLANPTTSALFATILVEYLLDRLPEMGSNVELSNLYLKLFKLVFGSVSLFAAENEQMLKPHLHKIVNSSMELAQTAKEPYNYFLLLRALFRSIGGGSHDLLYQEFLPLLPNLLQGLNMLQSGLHKQHMKDLFVELCLTVPVRLSSLLPYLPMLMDPLVSALNGSQTLVSQGLRTLELCVDNLQPDFLYDHIQPVRAELMQALWRTLRNPADSISHVAYRVLGKFGGSNRKMLKESQKLHYVVTEVQGPSITVEFSDCKASLQLPMEKAIETALDCLKSANTEPYYRRQAWEVIKCFLVAMMSLEDNKHALYQLLAHPNFTEKTIPNVIISHRYKAQDTPARKTFEQALTGAFMSAVIKDLRPSALPFVASLIRHYTMVAVAQQCGPFLLPCYQVGSQPSTAMFHSEENGSKGMDPLVLIDAIAICMAYEEKELCKIGEVALAVIFDVASIILGSKERACQLPLFSYIVERLCACCYEQAWYAKLGGVVSIKFLMERLPLTWVLQNQQTFLKALLFVMMDLTGEVSNGAVAMAKTTLEQLLMRCATPLKDEERAEEIVAAQEKSFHHVTHDLVREVTSPNSTVRKQAMHSLQVLAQVTGKSVTVIMEPHKEVLQDMVPPKKHLLRHQPANAQIGLMEGNTFCTTLQPRLFTMDLNVVEHKVFYTELLNLCEAEDSALTKLPCYKSLPSLVPLRIAALNALAACNYLPQSREKIIAALFKALNSTNSELQEAGEACMRKFLEGATIEVDQIHTHMRPLLMMLGDYRSLTLNVVNRLTSVTRLFPNSFNDKFCDQMMQHLRKWMEVVVITHKGGQRSDGNEMKICSAIINLFHLIPAAPQTLVKPLLEVVMKTERAMLIEAGSPFREPLIKFLTRHPSQTVELFMMEATLNDPQWSRMFMSFLKHKDARPLRDVLAANPNRFITLLLPGGAQTAVRPGSPSTSTMRLDLQFQAIKIISIIVKNDDSWLASQHSLVSQLRRVWVSENFQERHRKENMAATNWKEPKLLAYCLLNYCKRNXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAGTSELVMLSLELVKTRLAVMSMEMRKNFIQAILTSLIEKSPDAKILRAVVKIVEEWVKNNSPMAANQTPTLREKSILLVKMMTYIEKRFPEDLELNAQFLDLVNYVYRDETLSGSELTAKLEPAFLSGLRCAQPLIRAKFFEVFDNSMKRRVYERLLYVTCSQNWEAMGNHFWIKQCIELLLAVCEKSTPIGTSCQGAMLPSITNVINLADSHDRAAFAMVTHVKQEPRERENSESKEEDVEIDIELAPGDQTSTPKTKELSEKDIGNQLHMLTNRHDKFLDTLREVKTGALLSAFVQLCHISTTLAEKTWVQLFPRLWKILSDRQQHALAGEISPFLCSGSHQVQRDCQPSALNCFVEAMSQCVPPIPIRPCVLKYLGKTHNLWFRSTLMLEHQAFEKGLSLQIKPKQTTEFYEQESITPPQQEILDSLAELYSLLQEEDMWAGLWQKRCKYSETATAIAYEQHGFFEQAQESYEKAMDKAKKEHERSNASPAIFPEYQLWEDHWIRCSKELNQWEALTEYGQSKGHINPYLVLECAWRVSNWTAMKEALVQVEVSCPKEMAWKVNMYRGYLAICHPEEQQLSFIERLVEMASSLAIREWRRLPHVVSHVHTPLLQAAQQIIELQEAAQINAGLQPTNLGRNNSLHDMKTVVKTWRNRLPIVSDDLSHWSSIFMWRQHHYQAIVTAYENSSQHDPSSNNAMLGVHASASAIIQYGKIARKQGLVNVALDILSRIHTIPTVPIVDCFQKIRQQVKCYLQLAGVMGKNECMQGLEVIESTNLKYFTKEMTAEFYALKGMFLAQINKSEEANKAFSAAVQMHDVLVKAWAMWGDYLENIFVKERQLHLGVSAITCYLHACRHQNESKSRKYLAKVLWLLSFDDDKNTLADAVDKYCIGVPPIQWLAWIPQLLTCLVGSEGKLLLNLISQVGRVYPQAVYFPIRTLYLTLKIEQRERYKSDSGQQQPSSVGNQSHSASDPGPIRATAPMWRCSRIMHMQRELHPTLLSSLEGIVDQMVWFRENWHEEVLRQLQQGLAKCYSVAFEKSGAVSDAKITPHTLNFVKKLVSTFGVGLENVSNVSTMFSSAASESLARRAQATAQDPVFQKLKGQFTTDFDFSVPGSMKLHNLISKLKKWIKILEAKTKQLPKFFLIEEKCRFLSNFSAQTAEVEIPGEFLMPKPTHYYIKIARFMPRVEIVQKHNTAARRLYIRGHNGKIYPYLVMNDACLTESRREERVLQLLRLLNPCLEKRKETTKRHLFFTVPRVVAVSPQMRLVEDNPSSLSLVEIYKQRCAKKGIEHDNPISRYYDRLATVQARGTQASHQVLRDILKEVQSNMVPRSMLKEWALHTFPNATDYWTFRKMFTIQLALIGFAEFVLHLNRLNPEMLQIAQDTGKLNVAYFRFDINDATGDLDANRPVPFRLTPNISEFLTTIGVSGPLTASMIAVARCFAQPNFKVDGILKTVLRDEIIAWHKKTQEDTSSPLSAAGQPENMDSQQLVSLVQKAVTAIMTRLHNLAQFEGGESKVNTLVAAANSLDNLCRMDPAWHPWL

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	TAF5-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 5L
分子量 formula_weight	66223.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MKRVRTEQIQMAVSCYLKRRQYVDSDGPLKQGLRLSQTAEEMAANLTVQSESGCANIVSAAPCQAEPQQYEVQFGRLRNFLTDSDSQHSHEVMPLLYPLFVYLHLNLVQNSPKSTVESFYSRFHGMFLQNASQKDVIEQLQTTQTIQDILSNFKLRAFLDNKYVVRLQEDSYNYLIRYLQSDNNTALCKVLTLHIHLDVQPAKRTDYQLYASGSSSRSENNGLEPPDMPSPILQNEAALEVLQESIKRVKDGPPSLTTICFYAFYNTEQLLNTAEISPDSKLLAAGFDNSCIKLWSLRSKKLKSEPHQVDVSRIHLACDILEEEDDEDDNAGTEMKILRGHCGPVYSTRFLADSSGLLSCSEDMSIRYWDLGSFTNTVLYQGHAYPVWDLDISPYSLYFASGSHDRTARLWSFDRTYPLRIYAGHLADVDCVKFHPNSNYLATGSTDKTVRLWSAQQGNSVRLFTGHRGPVLSLAFSPNGKYLASAGEDQRLKLWDLASGTLYKELRGHTDNITSLTFSPDSGLIASASMDNSVRVWDIRNTYCSAPADGSSSELVGVYTGQMSNVLSVQFMACNLLLVTGITQENQEH

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Isoform 3 of Transcription factor SPT20 homolog
分子量 formula_weight	88129.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MQQALELALDRAEYVIESARQRPPKRKYLSSGRKSVFQKLYDLYIEECEKEPEVKKLRRNVNLLEKLVMQETLSCLVVNLYPGNEGYSLMLRGKNGSDSETIRLPYEEGELLEYLDAEELPPILVDLLEKSQVNIFHCGCVIAEIRDYRQSSNMKSPGYQSRHILLRPTMQTLICDVHSITSDNHKWTQEDKLLLESQLILATAEPLCLDPSIAVTCTANRLLYNKQKMNTRPMKRCFKRYSRSSLNRQQDLSHCPPPPQLRLLDFLQKRKERKAGQHYDLKISKAGNCVDMWKRSPCNLAIPSEVDVEKYAKVEKSIKSDDSQPTVWPAHDVKDDYVFECEAGTQYQKTKLTILQSLGDPLYYGKIQPCKADEESDSQMSPSHSSTDDHSNWFIIGSKTDAERVVNQYQELVQNEAKCPVKMSHSSSGSASLSQVSPGKETDQTETVSVQSSVLGKGVKHRPPPIKLPSSSGNSSSGNYFTPQQTSSFLKSPTPPPSSKPSSIPRKSSVDLNQVSMLSPAALSPASSSQRSGTPKPSTPTPTPSSTPHPPDAQSSTPSTPSATPTPQDSGFTPQPTLLTQFAQQQRSLSQAMPVTTIPLSTMVTSITPGTTATQVMANSAGLNFINVVGSVCGAQALMSGSNPMLGCNTGAITPAGINLSGLLPSGGLLPNALPSAMQAASQAGVPFGLKNTSSLRPLNLLQLPGGSLIFNTLQQQQQQLSQFTPQQPQQPTTCSPQQPGEQGSEQGSTSQEQALSAQQAAVINLTGVGSFMQSQAAAVAILAASNGYGSSSSTNSSATSSSAYRQPVKK

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	;STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA,STAGA complex 65 subunit gamma,STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA,STAGA complex 65 subunit gamma,STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA ;
分子量 formula_weight	78079.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

XXXXXXXXXXXXXXXMLDIPSEPCSLTIHTIQLIQHNRRLRNLIATAQAQNXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXDCKNPNAPFQIRHSDPESDFYRGKGEPVTELSWHSCRQLLYQAVATILAHAGFDCANESVLETLTDVAHEYCLKFTKLLRFAVDREARLGQTPFPDVMEQVFHEVGIGSVLSLQKFWQHRIKDYHSYMLQISKQLSEEYERIVNPEKATEDAKPVKIKEEPVSDITFPVSEELEADLASGDQSLPMGVLGAQSERFPSNLEVEASPQASSAEVNASPLWNLAHVKMEPQESEEGNVSGHGVLGSDVFEEPMSGMSEAGIPQSPDDSDSSYGSHSTDSLMGSSPVFNQRCKKRMRKIGTSGEDLYFQSGGSMAEIGTGFPFDPHYVEVLGERMHYVDVGPRDGTPVLFLHGNPTSSYVWRNIIPHVAPTHRCIAPDLIGMGKSDKPDLGYFFDDHVRFMDAFIEALGLEEVVLVIHDWGSALGFHWAKRNPERVKGIAFMEFIRPIPTWDEWPEFARETFQAFRTTDVGRKLIIDQNVFIEGTLPMGVVRPLTEVEMDHYREPFLNPVDREPLWRFPNELPIAGEPANIVALVEEYMDWLHQSPVPKLLFWGTPGVLIPPAEAARLAKSLPNCKAVDIGPGLNLLQEDNPDLIGSEIARWLSTLEISGDYKDHDGDYKDHDIDYKDDDDKGS

来源 Source

来源生物 organism	unclassified Rhodococcus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	192944
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Transcription initiation factor TFIID subunit 9B
分子量 formula_weight	27654.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MESGKMAPPKNAPRDALVMAQILKDMGITEYEPRVINQMLEFAFRYVTTILDDAKIYSSHAKKPNVDADDVRLAIQCRADQSFTSPPPRDFLLDIARQKNQTPLPLIKPYAGPRLPPDRYCLTAPNYRLKSLIKKGPNQGRLVPRLSVGAVSSKPTTPTIATPQTVSVPNKVATPMSVTSQRFTVQIPPSQSTPVKPVPATTAVQNVLINPSMIGPKNILITTNMVSSQNTANEANPLKRKHEDDDDNDIM

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	TAF6-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 6L
分子量 formula_weight	67903.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MSEREERRFVEIPRESVRLMAESTGLELSDEVAALLAEDVCYRLREATQNSSQFMKHTKRRKLTVEDFNRALRWSSVEAVCGYGSQEALPMRPAREGELYFPEDREVNLVELALATNIPKGCAETAVRVHVSYLDGKGNLAPQGSVPSAVSSLTDDLLKYYHQVTRAVLGDDPQLMKVALQDLQTNSKIGALLPYFVYVVSGVKSVSHDLEQLHRLLQVARSLFRNPHLCLGPYVRCLVGSVLYCVLEPLAASINPLNDHWTLRDGAALLLSHIFWTHGDLVSGLYQHILLSLQKILADPVRPLCCHYGAVVGLHALGWKAVERVLYPHLSTYWTNLQAVLDDYSVSNAQVKADGHKVYGAILVAVERLLKMKAQAAEPNRGGPGGRGCRRLDDLPWDSLLFQESSSGGGAEPSFGSGLPLPPGGAGPEDPSLSVTLADIYRELYAFFGDSLATRFGTGQPAPTAPRPPGDKKEPAAAPDSVRKMPQLTASAIVSPHGDESPRGSGGGGPASASGPAASESRPLPRVHRARGAPRQQGPGTGTRDVFQKSRFAPRGAPHFRFIIAGRQAGRRCRGRLFQTAFPAPYGPSPASRYVQKLPMIGRTSRPARRWALSDYSLYLPL

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Transcription initiation factor TFIID subunit 12
分子量 formula_weight	17948.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MNQFGPSALINLSNFSSIKPEPASTPPQGSMANSTAVVKIPGTPGAGGRLSPENNQVLTKKKLQDLVREVDPNEQLDEDVEEMLLQIADDFIESVVTAACQLARHRKSSTLEVKDVQLHLERQWNMWIPGFGSEEIRPYKKACTTEAHKQRMALIRKTTKK

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Transcription initiation factor TFIID subunit 10
分子量 formula_weight	21731.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MSCSGSGADPEAAPASAASAPGPAPPVSAPAALPSSTAAENKASPAGTAGGPGAGAAAGGTGPLAARAGEPAERRGAAPVSAGGAAPPEGAISNGVYVLPSAANGDVKPVVSSTPLVDFLMQLEDYTPTIPDAVTGYYLNRAGFEASDPRIIRLISLAAQKFISDIANDALQHCKMKGTASGSSRSKSKDRKYTLTMEDLTPALSEYGINVKKPHYFT

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	;Transcription initiation protein SPT3 homolog,Transcription initiation protein SPT3 homolog,Transcription initiation protein SPT3 homolog ;
分子量 formula_weight	33197.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MNNTAASPMSTATSSSGRSTGKSISFATELQSMMYSLGDARRPLHETAVLVEDVVHTQLINLLQQAAEVSQLRGARVITPEDLLFLMRKDKKKLRRLLKYMFIRDYKSKIVKGIDEDDLLEDKLSGSNNANKRQKIAQDFLNSIDQTGELLAMFEDXXXXXXXXXXXXESRQLSFSKKASKFRDWLDCSSMEIKPNVVAMEILAYLAYETVAQLVDLALLVRQDMVTKAGDPFSHAISATFIQYHNSAESTAACGVEAHSDAIQPCHIREAIRRYSHRIGPLSPFTNAYRRNGMAFLAC

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Transcriptional adapter 1
分子量 formula_weight	37432.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MATFVSELEAAKKNLSEALGDNVKQYWANLKLWFKQKISKEEFDLEAHRLLTQDNVHSHNDFLLAILTRCQILVSTPDGAGSLPWPGGSAAKPGKPKGKKKLSSVRQKFDHRFQPQNPLSGAQQFVAKDPQDDDDLKLCSHTMMLPTRGQLEGRMIVTAYEHGLDNVTEEAVSAVVYAVENHLKDILTSVVSRRKAYRLRDGHFKYAFGSNVTPQPYLKNSVVAYNNLIESPPAFTAPCAGQNPASHPPPDDAEQQAALLLACSGDTLPASLPPVNMYDLFEALQVHREVIPTHTVYALNIERIITKLWHPNHEELQQDKVHRQRLAAKEGLLLC

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Ataxin-7
分子量 formula_weight	95597.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

MSERAADDVRGEPRRAAAAAGGAAAAAARQQQQQQQQQQPPPPQPQRQQHPPPPPRRTRPEDGGPGAASTSAAAMATVGERRPLPSPEVMLGQSWNLWVEASKLPGKDGTELDESFKEFGKNREVMGLCREDMPIFGFCPAHDDFYLVVCNDCNQVVKPQAFQSHYERRHSSSSKPPLAVPPTSVFSFFPSLSKSKGGSASGSNRSSSGGVLSASSSSSKLLKSPKEKLQLRGNTRPMHPIQQSRVPHGRIMTPSVKVEKIHPKMDGTLLKSAVGPTCPATVSSLVKPGLNCPSIPKPTLPSPGQILNGKGLPAPPTLEKKPEDNSNNRKFLNKRLSEREFDPDIHCGVIDLDTKKPCTRSLTCKTHSLTQRRAVQGRRKRFDVLLAEHKNKTREKELIRHPDSQQPPQPLRDPHPAPPRTSQEPHQNPHGVIPSESKPFVASKPKPHTPSLPRPPGCPAQQGGSAPIDPPPVHESPHPPLPATEPASRLSSEEGEGDDKEESVEKLDCHYSGHHPQPASFCTFGSRQIGRGYYVFDSRWNRLRCALNLMVEKHLNAQLWKKIPPVPSTTSPISTRIPHRTNSVPTSQCGVSYLAAATVSTSPVLLSSTCISPNSKSVPAHGTTLNAQPAASGAMDPVCSMQSRQVSSSSSSPSTPSGLSSVPSSPMSRKPQKLKSSKSLRPKESSGNSTNCQNASSSTSGGSGKKRKNSSPLLVHSSSSSSSSSSSSHSMESFRKNCVAHSGPPYPSTVTSSHSIGLNCVTNKANAVNVRHDQSGRGPPTGSPAESIKRMSVMVNSSDSTLSLGPFIHQSNELPVNSHGSFSHSHTPLDKLIGKKRKCSPSSSSINNSSSKPTKVAKVPAVNNVHMKHTGTIPGAQGLMNSSLLHQPKARP

实体 12 Entity 12 non-polymer

描述 description	INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE
分子量 formula_weight	660.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	7ktrB01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	500 — TFIID subunit TAF5, NTD2 domain

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.93 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	209435

Cryo-EM structure of the human SAGA coactivator complex (TRRAP, core)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein,Transformation/transcription domain-associated protein ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

TAF5-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 5L

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Isoform 3 of Transcription factor SPT20 homolog

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

;STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA,STAGA complex 65 subunit gamma,STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA,STAGA complex 65 subunit gamma,STAGA complex 65 subunit gamma,DhaA ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Transcription initiation factor TFIID subunit 9B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

TAF6-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 6L

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Transcription initiation factor TFIID subunit 12

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Transcription initiation factor TFIID subunit 10

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

;Transcription initiation protein SPT3 homolog,Transcription initiation protein SPT3 homolog,Transcription initiation protein SPT3 homolog ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Transcriptional adapter 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体