7n84

Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 375.1 Å Quality: EXCELLENT

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Nucleoporin NUP188

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 136 PDB 声明：136-meric（136）与蛋白拷贝数一致	链 X； UniProt 1–1655	未记录	unknown × 16 Nucleoporin NUP120 × 16 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 16 （P46673） Nucleoporin 145c × 16 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 16 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 16 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 16 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 16 （P36161）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.60 Å
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17）与蛋白拷贝数一致	链 X； UniProt 1–1655	未记录	unknown × 2 Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.60 Å
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17）与蛋白拷贝数一致	链 X； UniProt 1–1655	未记录	unknown × 2 Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7N84	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 240 PDB 声明：240-meric	链 N 1–1655（1655 aa）链 P 1–1655（1655 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.60 Å
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric	链 N 1–1655（1655 aa）链 P 1–1655（1655 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.60 Å
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric	链 N 1–1655（1655 aa）链 P 1–1655（1655 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.60 Å
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric	链 N 1–1655（1655 aa）链 P 1–1655（1655 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)	分辨率 37.00 Å
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric	链 N 1–1655（1655 aa）链 P 1–1655（1655 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)	分辨率 37.00 Å
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric	链 N 1–1655（1655 aa）链 P 1–1655（1655 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)	分辨率 37.00 Å
7WO9 Cryo-EM structure of full-length Nup188 提交 2022-01-20	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–1655（1655 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.81 Å
7WOO Cryo-EM structure of the inner ring protomer of the Saccharomyces cerevisiae nuclear pore complex 提交 2022-01-22	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 E 1–1655（1655 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.71 Å
7WOT Cryo-EM structure of the inner ring monomer of the Saccharomyces cerevisiae nuclear pore complex 提交 2022-01-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 E 1–1655（1655 aa）链 Q 1–1655（1655 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.73 Å
8TJ5 Inner spoke ring of the yeast NPC 提交 2023-07-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric	链 N 1–1655（1655 aa）链 P 1–1655（1655 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES,50mM Potassium acetate,20mM NaCl,2mM MgCl2,1mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.60 Å

共 6 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NU188_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 X； PDB构建体 1–1655； UniProt 1–1655

Nucleoporin NUP120

物种未注明

UniProt P35729

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 136 PDB 声明：136-meric（136）与蛋白拷贝数一致	链 a； UniProt 1–1037 链 l； UniProt 1–1037	未记录	Nucleoporin NUP188 × 8 （P52593） unknown × 16 Nucleoporin NUP85 × 16 （P46673） Nucleoporin 145c × 16 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 16 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 16 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 16 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 16 （P36161）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.60 Å
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17）与蛋白拷贝数一致	链 a； UniProt 1–1037 链 l； UniProt 1–1037	未记录	Nucleoporin NUP188 × 1 （P52593） unknown × 2 Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.60 Å
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17）与蛋白拷贝数一致	链 a； UniProt 1–1037 链 l； UniProt 1–1037	未记录	Nucleoporin NUP188 × 1 （P52593） unknown × 2 Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 7N84	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3F7F Structure of Nup120 提交 2008-11-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–729（729 aa）片段：UNP residues 1-729	突变：S207C	HG MERCURY (II) ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；Succinic acid, PEG 3350, Sodium bromide, Ethylene glycol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.254
3F7F Structure of Nup120 提交 2008-11-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–729（729 aa）片段：UNP residues 1-729	突变：S207C	HG MERCURY (II) ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；Succinic acid, PEG 3350, Sodium bromide, Ethylene glycol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.254
3F7F Structure of Nup120 提交 2008-11-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–729（729 aa）片段：UNP residues 1-729	突变：S207C	HG MERCURY (II) ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；Succinic acid, PEG 3350, Sodium bromide, Ethylene glycol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.254
3F7F Structure of Nup120 提交 2008-11-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–729（729 aa）片段：UNP residues 1-729	突变：S207C	HG MERCURY (II) ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；Succinic acid, PEG 3350, Sodium bromide, Ethylene glycol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.254
3F7F Structure of Nup120 提交 2008-11-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–729（729 aa）片段：UNP residues 1-729 链 B 1–729（729 aa）片段：UNP residues 1-729	突变：S207C 突变：S207C	HG MERCURY (II) ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；Succinic acid, PEG 3350, Sodium bromide, Ethylene glycol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.254
3F7F Structure of Nup120 提交 2008-11-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–729（729 aa）片段：UNP residues 1-729 链 D 1–729（729 aa）片段：UNP residues 1-729	突变：S207C 突变：S207C	HG MERCURY (II) ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；Succinic acid, PEG 3350, Sodium bromide, Ethylene glycol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.254
3H7N Structure of Nup120 提交 2009-04-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–729（729 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；Sodium citrate (tribasic dihydrate), Potassium thiocynate, PEG 2000 MME, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.274
3H7N Structure of Nup120 提交 2009-04-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–729（729 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；Sodium citrate (tribasic dihydrate), Potassium thiocynate, PEG 2000 MME, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.274
3H7N Structure of Nup120 提交 2009-04-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–729（729 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；Sodium citrate (tribasic dihydrate), Potassium thiocynate, PEG 2000 MME, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.274
3H7N Structure of Nup120 提交 2009-04-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–729（729 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；Sodium citrate (tribasic dihydrate), Potassium thiocynate, PEG 2000 MME, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.274
3HXR Nucleoporin Nup120 from S.cerevisiae (aa 1-757) 提交 2009-06-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–757（757 aa）片段：UNP residues 1-757	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；15% PEG3350, 0.2M KSCN, 0.1M Tris-HCl pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.00 Å R-free 0.299
4XMM Structure of the yeast coat nucleoporin complex, space group C2 提交 2015-01-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 E 2–1037（1036 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；PEG 20000, ethanol, MES	分辨率 7.38 Å R-free 0.353
4XMN Structure of the yeast coat nucleoporin complex, space group P212121 提交 2015-01-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 E 1–1037（1037 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；PEG 20000, ethanol, MES	分辨率 7.60 Å R-free 0.347
6X06 Nup120 (aa1-757) from S. cerevisiae bound by VHH-SAN11 提交 2020-05-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–757（757 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；19% PEG 8,000, 0.1M magnesium chloride, 0.1M Tris/HCl pH 8.5	分辨率 4.27 Å R-free 0.359
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric	链 a 1–1037（1037 aa）链 h 1–1037（1037 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)	分辨率 37.00 Å
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric	链 a 1–1037（1037 aa）链 h 1–1037（1037 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)	分辨率 37.00 Å
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric	链 a 1–1037（1037 aa）链 h 1–1037（1037 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)	分辨率 37.00 Å
8TIE Double nuclear outer ring of Nup84-complexes from the yeast NPC 提交 2023-07-19	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 a 1–1037（1037 aa）链 l 1–1037（1037 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES,50mM Potassium acetate,20mM NaCl,2mM MgCl2,1mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.10 Å

共 8 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NU120_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 a； PDB构建体 1–1037； UniProt 1–1037 作者链 l； PDB构建体 1–1037； UniProt 1–1037

Nucleoporin NUP85

物种未注明

UniProt P46673

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 136 PDB 声明：136-meric（136）与蛋白拷贝数一致	链 b； UniProt 1–744 链 m； UniProt 1–744	未记录	Nucleoporin NUP188 × 8 （P52593） unknown × 16 Nucleoporin NUP120 × 16 （P35729） Nucleoporin 145c × 16 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 16 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 16 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 16 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 16 （P36161）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.60 Å
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17）与蛋白拷贝数一致	链 b； UniProt 1–744 链 m； UniProt 1–744	未记录	Nucleoporin NUP188 × 1 （P52593） unknown × 2 Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.60 Å
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17）与蛋白拷贝数一致	链 b； UniProt 1–744 链 m； UniProt 1–744	未记录	Nucleoporin NUP188 × 1 （P52593） unknown × 2 Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 7N84	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3EWE Crystal Structure of the Nup85/Seh1 Complex 提交 2008-10-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–564（564 aa）片段：UNP residues 1-564	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；289 K；18% PEG 3350, 0.1M Bis Tris propane, 0.2M Sodium Citrate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 3.50 Å R-free 0.369
3EWE Crystal Structure of the Nup85/Seh1 Complex 提交 2008-10-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–564（564 aa）片段：UNP residues 1-564	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；289 K；18% PEG 3350, 0.1M Bis Tris propane, 0.2M Sodium Citrate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 3.50 Å R-free 0.369
3EWE Crystal Structure of the Nup85/Seh1 Complex 提交 2008-10-14	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–564（564 aa）片段：UNP residues 1-564 链 D 1–564（564 aa）片段：UNP residues 1-564	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；289 K；18% PEG 3350, 0.1M Bis Tris propane, 0.2M Sodium Citrate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 3.50 Å R-free 0.369
3F3F Crystal structure of the nucleoporin pair Nup85-Seh1, space group P21 提交 2008-10-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 1–570（570 aa）片段：UNP residues 1-570 链 D 1–570（570 aa）片段：UNP residues 1-570 链 G 1–570（570 aa）片段：UNP residues 1-570 链 H 1–570（570 aa）片段：UNP residues 1-570	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；298 K；PEG 10000, MES buffer, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.90 Å R-free 0.265
3F3G Crystal structure of the nucleoporin pair Nup85-Seh1, space group P212121 提交 2008-10-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 1–570（570 aa）片段：UNP residues 1-570 链 D 1–570（570 aa）片段：UNP residues 1-570 链 G 1–570（570 aa）片段：UNP residues 1-570 链 H 1–570（570 aa）片段：UNP residues 1-570	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；Sodium citrate, Sodium chloride, Tris-HCl buffer, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.75 Å R-free 0.272
3F3P Crystal structure of the nucleoporin pair Nup85-Seh1, space group P21212 提交 2008-10-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–570（570 aa）片段：UNP residues 1-570 链 D 1–570（570 aa）片段：UNP residues 1-570	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 3350, Tacsimate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.20 Å R-free 0.281
3F3P Crystal structure of the nucleoporin pair Nup85-Seh1, space group P21212 提交 2008-10-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 G 1–570（570 aa）片段：UNP residues 1-570 链 H 1–570（570 aa）片段：UNP residues 1-570	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 3350, Tacsimate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.20 Å R-free 0.281
3F3P Crystal structure of the nucleoporin pair Nup85-Seh1, space group P21212 提交 2008-10-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 K 1–570（570 aa）片段：UNP residues 1-570 链 L 1–570（570 aa）片段：UNP residues 1-570	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 3350, Tacsimate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.20 Å R-free 0.281
4XMM Structure of the yeast coat nucleoporin complex, space group C2 提交 2015-01-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 D 44–744（701 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；PEG 20000, ethanol, MES	分辨率 7.38 Å R-free 0.353
4XMN Structure of the yeast coat nucleoporin complex, space group P212121 提交 2015-01-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 D 73–743（671 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；PEG 20000, ethanol, MES	分辨率 7.60 Å R-free 0.347
6X08 Nup85-Seh1 from S. cerevisiae bound by VHH-SAN2 提交 2020-05-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–564（564 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；1M ammonium sulfate, di-sodium succinate pH 5.5, and the addition of 4% 1-propanol	分辨率 4.19 Å R-free 0.346
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric	链 b 1–744（744 aa）链 i 1–744（744 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)	分辨率 37.00 Å
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric	链 b 1–744（744 aa）链 i 1–744（744 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)	分辨率 37.00 Å
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric	链 b 1–744（744 aa）链 i 1–744（744 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)	分辨率 37.00 Å
8TIE Double nuclear outer ring of Nup84-complexes from the yeast NPC 提交 2023-07-19	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 b 1–744（744 aa）链 m 1–744（744 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES,50mM Potassium acetate,20mM NaCl,2mM MgCl2,1mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.10 Å

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UniProt名称	NUP85_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 b； PDB构建体 1–744； UniProt 1–744 作者链 m； PDB构建体 1–744； UniProt 1–744

Nucleoporin 145c

物种未注明

UniProt P49687

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 136 PDB 声明：136-meric（136）与蛋白拷贝数一致	链 c； UniProt 606–1317 链 n； UniProt 606–1317	未记录	Nucleoporin NUP188 × 8 （P52593） unknown × 16 Nucleoporin NUP120 × 16 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 16 （P46673） Protein transport protein SEC13 × 16 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 16 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 16 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 16 （P36161）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.60 Å
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17）与蛋白拷贝数一致	链 c； UniProt 606–1317 链 n； UniProt 606–1317	未记录	Nucleoporin NUP188 × 1 （P52593） unknown × 2 Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.60 Å
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17）与蛋白拷贝数一致	链 c； UniProt 606–1317 链 n； UniProt 606–1317	未记录	Nucleoporin NUP188 × 1 （P52593） unknown × 2 Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 7N84	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 731–1158（428 aa）片段：Nucleoporin NUP145C 链 C 731–1158（428 aa）片段：Nucleoporin NUP145C 链 F 731–1158（428 aa）片段：Nucleoporin NUP145C 链 G 731–1158（428 aa）片段：Nucleoporin NUP145C	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 3.15 Å R-free 0.294
3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 731–1158（428 aa）片段：Nucleoporin NUP145C 链 C 731–1158（428 aa）片段：Nucleoporin NUP145C	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 3.15 Å R-free 0.294
3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 731–1158（428 aa）片段：Nucleoporin NUP145C 链 G 731–1158（428 aa）片段：Nucleoporin NUP145C	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 3.15 Å R-free 0.294
3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 731–1158（428 aa）片段：Nucleoporin NUP145C	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 3.15 Å R-free 0.294
3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 731–1158（428 aa）片段：Nucleoporin NUP145C	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 3.15 Å R-free 0.294
3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 731–1158（428 aa）片段：Nucleoporin NUP145C	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 3.15 Å R-free 0.294
3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 731–1158（428 aa）片段：Nucleoporin NUP145C	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 3.15 Å R-free 0.294
3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 731–1158（428 aa）片段：Nucleoporin NUP145C 链 C 731–1158（428 aa）片段：Nucleoporin NUP145C 链 F 731–1158（428 aa）片段：Nucleoporin NUP145C 链 G 731–1158（428 aa）片段：Nucleoporin NUP145C	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 3.00 Å R-free 0.294
3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 731–1158（428 aa）片段：Nucleoporin NUP145C 链 C 731–1158（428 aa）片段：Nucleoporin NUP145C	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 3.00 Å R-free 0.294
3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 731–1158（428 aa）片段：Nucleoporin NUP145C 链 G 731–1158（428 aa）片段：Nucleoporin NUP145C	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 3.00 Å R-free 0.294
3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 731–1158（428 aa）片段：Nucleoporin NUP145C	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 3.00 Å R-free 0.294
3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 731–1158（428 aa）片段：Nucleoporin NUP145C	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 3.00 Å R-free 0.294
3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 731–1158（428 aa）片段：Nucleoporin NUP145C	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 3.00 Å R-free 0.294
3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 731–1158（428 aa）片段：Nucleoporin NUP145C	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 3.00 Å R-free 0.294
3IKO Crystal structure of the heterotrimeric Sec13-Nup145C-Nup84 nucleoporin complex 提交 2009-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 731–1158（428 aa）片段：UNP residues 731-1158	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 20000, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.273
3IKO Crystal structure of the heterotrimeric Sec13-Nup145C-Nup84 nucleoporin complex 提交 2009-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 731–1158（428 aa）片段：UNP residues 731-1158	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 20000, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.273
3IKO Crystal structure of the heterotrimeric Sec13-Nup145C-Nup84 nucleoporin complex 提交 2009-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 731–1158（428 aa）片段：UNP residues 731-1158	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 20000, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.273
3JRO NUP84-NUP145C-SEC13 edge element of the NPC lattice 提交 2009-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 714–1160（447 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；295 K；1.15M sodium malonate, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 4.00 Å R-free 0.329
3JRP SEC13 with NUP145C (AA109-179) insertion blade 提交 2009-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 714–784（71 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；289 K；0.1M Tris, 22% PEG 4000, 0.25 M LiCl, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.60 Å R-free 0.254
3KEP Crystal structure of the autoproteolytic domain from the nuclear pore complex component NUP145 from Saccharomyces cerevisiae 提交 2009-10-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 442–605（164 aa）片段：residues 442 to 605	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；294 K；100mM HEPES, 25% PEG 3350, 200mM NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K	分辨率 1.82 Å R-free 0.244
3KEP Crystal structure of the autoproteolytic domain from the nuclear pore complex component NUP145 from Saccharomyces cerevisiae 提交 2009-10-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 442–605（164 aa）片段：residues 442 to 605	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；294 K；100mM HEPES, 25% PEG 3350, 200mM NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K	分辨率 1.82 Å R-free 0.244
3KES Crystal structure of the autoproteolytic domain from the nuclear pore complex component NUP145 from Saccharomyces cerevisiae in the Hexagonal, P61 space group 提交 2009-10-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 442–605（164 aa）片段：residues 442 to 605	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；1600mM tri-sodium citrate dehydrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K	分辨率 2.10 Å R-free 0.230
3KES Crystal structure of the autoproteolytic domain from the nuclear pore complex component NUP145 from Saccharomyces cerevisiae in the Hexagonal, P61 space group 提交 2009-10-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 442–605（164 aa）片段：residues 442 to 605	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；1600mM tri-sodium citrate dehydrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K	分辨率 2.10 Å R-free 0.230
4XMM Structure of the yeast coat nucleoporin complex, space group C2 提交 2015-01-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 680–1317（638 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；PEG 20000, ethanol, MES	分辨率 7.38 Å R-free 0.353
4XMN Structure of the yeast coat nucleoporin complex, space group P212121 提交 2015-01-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 B 680–1317（638 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；PEG 20000, ethanol, MES	分辨率 7.60 Å R-free 0.347
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric	链 c 606–1317（712 aa）链 j 606–1317（712 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)	分辨率 37.00 Å
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric	链 c 606–1317（712 aa）链 j 606–1317（712 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)	分辨率 37.00 Å
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric	链 c 606–1317（712 aa）链 j 606–1317（712 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)	分辨率 37.00 Å

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UniProt名称	NU145_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 c； PDB构建体 1–712； UniProt 606–1317 作者链 n； PDB构建体 1–712； UniProt 606–1317

Protein transport protein SEC13

物种未注明

UniProt Q04491

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 136 PDB 声明：136-meric（136）与蛋白拷贝数一致	链 d； UniProt 1–297 链 o； UniProt 1–297	未记录	Nucleoporin NUP188 × 8 （P52593） unknown × 16 Nucleoporin NUP120 × 16 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 16 （P46673） Nucleoporin 145c × 16 （P49687） Nucleoporin SEH1 × 16 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 16 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 16 （P36161）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.60 Å
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17）与蛋白拷贝数一致	链 d； UniProt 1–297 链 o； UniProt 1–297	未记录	Nucleoporin NUP188 × 1 （P52593） unknown × 2 Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.60 Å
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17）与蛋白拷贝数一致	链 d； UniProt 1–297 链 o； UniProt 1–297	未记录	Nucleoporin NUP188 × 1 （P52593） unknown × 2 Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 7N84	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2PM6 Crystal Structure of yeast Sec13/31 edge element of the COPII vesicular coat, native version 提交 2007-04-20	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–297（297 aa）链 D 1–297（297 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；15% PEG 4000, 10% DMSO, 6% dioxanie, 0.1M Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.45 Å R-free 0.301
2PM7 Crystal structure of yeast Sec13/31 edge element of the COPII vesicular coat, selenomethionine version 提交 2007-04-20	突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–297（297 aa）链 D 1–297（297 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；15% PEG 4000, 10% DMSO, 6% dioxane, 0.1M Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.35 Å R-free 0.298
2PM9 Crystal structure of yeast Sec13/31 vertex element of the COPII vesicular coat 提交 2007-04-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–297（297 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；295 K；8% PEG 3350, 0.1M tri-sodium citrate, 10mM manganese chloride, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 3.30 Å R-free 0.305
3IKO Crystal structure of the heterotrimeric Sec13-Nup145C-Nup84 nucleoporin complex 提交 2009-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–297（297 aa）片段：UNP residues 1-297	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 20000, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.273
3IKO Crystal structure of the heterotrimeric Sec13-Nup145C-Nup84 nucleoporin complex 提交 2009-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–297（297 aa）片段：UNP residues 1-297	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 20000, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.273
3IKO Crystal structure of the heterotrimeric Sec13-Nup145C-Nup84 nucleoporin complex 提交 2009-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 1–297（297 aa）片段：UNP residues 1-297	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 20000, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.273
3JRO NUP84-NUP145C-SEC13 edge element of the NPC lattice 提交 2009-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–297（297 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；295 K；1.15M sodium malonate, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 4.00 Å R-free 0.329
3JRP SEC13 with NUP145C (AA109-179) insertion blade 提交 2009-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–297（297 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；289 K；0.1M Tris, 22% PEG 4000, 0.25 M LiCl, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.60 Å R-free 0.254
3MZK Sec13/Sec16 complex, S.cerevisiae 提交 2010-05-12	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–297（297 aa）链 D 1–297（297 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；0.1mM bis-Tris propane, 0.2M NaBr, 12% polyethylene glycol 3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.69 Å R-free 0.243
3MZL Sec13/Sec31 edge element, loop deletion mutant 提交 2010-05-12	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–297（297 aa）链 C 1–297（297 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；289 K；0.1mM bis-Tris propane, 0.2M sodium citrate, 16% polyethylene glycol 3350, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.80 Å R-free 0.300
3MZL Sec13/Sec31 edge element, loop deletion mutant 提交 2010-05-12	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 1–297（297 aa）链 G 1–297（297 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；289 K；0.1mM bis-Tris propane, 0.2M sodium citrate, 16% polyethylene glycol 3350, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.80 Å R-free 0.300
4BZJ The structure of the COPII coat assembled on membranes 提交 2013-07-26	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 2–292（291 aa）链 F 2–292（291 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 HEPES, 50 MM KOAC, 1.2 MM MGCL2；pH 6.8；HEPES, 50 MM KOAC, 1.2 MM MGCL2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；ETHANE; HOMEMADE PLUNGER	分辨率 40.00 Å
4BZK The structure of the COPII coat assembled on membranes 提交 2013-07-26	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–297（297 aa）链 F 1–297（297 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 HEPES, 50 MM KOAC, 1.2 MM MGCL2；pH 6.8；HEPES, 50 MM KOAC, 1.2 MM MGCL2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；ETHANE; HOMEMADE PLUNGER	分辨率 40.00 Å
4XMM Structure of the yeast coat nucleoporin complex, space group C2 提交 2015-01-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–297（297 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；PEG 20000, ethanol, MES	分辨率 7.38 Å R-free 0.353
4XMN Structure of the yeast coat nucleoporin complex, space group P212121 提交 2015-01-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 2–297（296 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；PEG 20000, ethanol, MES	分辨率 7.60 Å R-free 0.347
6ZG5 COPII on membranes, outer coat right-handed rod, class1 提交 2020-06-18	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–297（297 aa）链 F 1–297（297 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 40.00 Å
6ZG6 COPII on membranes, outer coat vertex 提交 2020-06-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 1–297（297 aa）链 D 1–297（297 aa）链 F 1–297（297 aa）链 H 1–297（297 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 12.00 Å
6ZL0 COPII on membranes, outer coat left-handed rod 提交 2020-06-30	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–297（297 aa）链 D 1–297（297 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 40.00 Å
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric	链 d 1–297（297 aa）链 k 1–297（297 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)	分辨率 37.00 Å
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric	链 d 1–297（297 aa）链 k 1–297（297 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)	分辨率 37.00 Å
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric	链 d 1–297（297 aa）链 k 1–297（297 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)	分辨率 37.00 Å
8ADL Cryo-EM structure of the SEA complex 提交 2022-07-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 H 1–297（297 aa）链 P 1–297（297 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 28	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.95 Å
8TIE Double nuclear outer ring of Nup84-complexes from the yeast NPC 提交 2023-07-19	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 d 1–297（297 aa）链 o 1–297（297 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES,50mM Potassium acetate,20mM NaCl,2mM MgCl2,1mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.10 Å
9H5K Cryo-EM structure of the SEAC-EGOC supercomplex 提交 2024-10-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric	链 H 1–297（297 aa）链 P 1–297（297 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

共 19 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SEC13_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 d； PDB构建体 1–297； UniProt 1–297 作者链 o； PDB构建体 1–297； UniProt 1–297

Nucleoporin SEH1

物种未注明

UniProt P53011

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 136 PDB 声明：136-meric（136）与蛋白拷贝数一致	链 e； UniProt 1–349 链 p； UniProt 1–349	未记录	Nucleoporin NUP188 × 8 （P52593） unknown × 16 Nucleoporin NUP120 × 16 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 16 （P46673） Nucleoporin 145c × 16 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 16 （Q04491） Nucleoporin NUP84 × 16 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 16 （P36161）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.60 Å
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17）与蛋白拷贝数一致	链 e； UniProt 1–349 链 p； UniProt 1–349	未记录	Nucleoporin NUP188 × 1 （P52593） unknown × 2 Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.60 Å
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17）与蛋白拷贝数一致	链 e； UniProt 1–349 链 p； UniProt 1–349	未记录	Nucleoporin NUP188 × 1 （P52593） unknown × 2 Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 7N84	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3EWE Crystal Structure of the Nup85/Seh1 Complex 提交 2008-10-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–349（349 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；289 K；18% PEG 3350, 0.1M Bis Tris propane, 0.2M Sodium Citrate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 3.50 Å R-free 0.369
3EWE Crystal Structure of the Nup85/Seh1 Complex 提交 2008-10-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–349（349 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；289 K；18% PEG 3350, 0.1M Bis Tris propane, 0.2M Sodium Citrate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 3.50 Å R-free 0.369
3EWE Crystal Structure of the Nup85/Seh1 Complex 提交 2008-10-14	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–349（349 aa）链 C 1–349（349 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；289 K；18% PEG 3350, 0.1M Bis Tris propane, 0.2M Sodium Citrate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 3.50 Å R-free 0.369
3F3F Crystal structure of the nucleoporin pair Nup85-Seh1, space group P21 提交 2008-10-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–349（349 aa）链 B 1–349（349 aa）链 E 1–349（349 aa）链 F 1–349（349 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；298 K；PEG 10000, MES buffer, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.90 Å R-free 0.265
3F3G Crystal structure of the nucleoporin pair Nup85-Seh1, space group P212121 提交 2008-10-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–349（349 aa）链 B 1–349（349 aa）链 E 1–349（349 aa）链 F 1–349（349 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；Sodium citrate, Sodium chloride, Tris-HCl buffer, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.75 Å R-free 0.272
3F3P Crystal structure of the nucleoporin pair Nup85-Seh1, space group P21212 提交 2008-10-31	突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–349（349 aa）链 B 1–349（349 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 3350, Tacsimate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.20 Å R-free 0.281
3F3P Crystal structure of the nucleoporin pair Nup85-Seh1, space group P21212 提交 2008-10-31	突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 1–349（349 aa）链 F 1–349（349 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 3350, Tacsimate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.20 Å R-free 0.281
3F3P Crystal structure of the nucleoporin pair Nup85-Seh1, space group P21212 提交 2008-10-31	突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 I 1–349（349 aa）链 J 1–349（349 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 3350, Tacsimate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.20 Å R-free 0.281
4XMM Structure of the yeast coat nucleoporin complex, space group C2 提交 2015-01-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 1–349（349 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；PEG 20000, ethanol, MES	分辨率 7.38 Å R-free 0.353
6X08 Nup85-Seh1 from S. cerevisiae bound by VHH-SAN2 提交 2020-05-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–349（349 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；1M ammonium sulfate, di-sodium succinate pH 5.5, and the addition of 4% 1-propanol	分辨率 4.19 Å R-free 0.346
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric	链 e 1–349（349 aa）链 l 1–349（349 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)	分辨率 37.00 Å
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric	链 e 1–349（349 aa）链 l 1–349（349 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)	分辨率 37.00 Å
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric	链 e 1–349（349 aa）链 l 1–349（349 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)	分辨率 37.00 Å
8ADL Cryo-EM structure of the SEA complex 提交 2022-07-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 D 1–349（349 aa）链 E 1–349（349 aa）链 F 1–349（349 aa）链 L 1–349（349 aa）链 M 1–349（349 aa）链 N 1–349（349 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 28	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.95 Å
9H5K Cryo-EM structure of the SEAC-EGOC supercomplex 提交 2024-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric	链 D 1–349（349 aa）链 E 1–349（349 aa）链 F 1–349（349 aa）链 L 1–349（349 aa）链 M 1–349（349 aa）链 N 1–349（349 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

共 9 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SEH1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 e； PDB构建体 1–349； UniProt 1–349 作者链 p； PDB构建体 1–349； UniProt 1–349

Nucleoporin NUP84

物种未注明

UniProt P52891

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 136 PDB 声明：136-meric（136）与蛋白拷贝数一致	链 f； UniProt 1–726 链 q； UniProt 1–726	未记录	Nucleoporin NUP188 × 8 （P52593） unknown × 16 Nucleoporin NUP120 × 16 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 16 （P46673） Nucleoporin 145c × 16 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 16 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 16 （P53011） Nucleoporin NUP133 × 16 （P36161）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.60 Å
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17）与蛋白拷贝数一致	链 f； UniProt 1–726 链 q； UniProt 1–726	未记录	Nucleoporin NUP188 × 1 （P52593） unknown × 2 Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.60 Å
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17）与蛋白拷贝数一致	链 f； UniProt 1–726 链 q； UniProt 1–726	未记录	Nucleoporin NUP188 × 1 （P52593） unknown × 2 Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 7N84	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3IKO Crystal structure of the heterotrimeric Sec13-Nup145C-Nup84 nucleoporin complex 提交 2009-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–460（460 aa）片段：UNP residues 1-460	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 20000, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.273
3IKO Crystal structure of the heterotrimeric Sec13-Nup145C-Nup84 nucleoporin complex 提交 2009-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 1–460（460 aa）片段：UNP residues 1-460	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 20000, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.273
3IKO Crystal structure of the heterotrimeric Sec13-Nup145C-Nup84 nucleoporin complex 提交 2009-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–460（460 aa）片段：UNP residues 1-460	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 20000, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.273
3JRO NUP84-NUP145C-SEC13 edge element of the NPC lattice 提交 2009-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–424（424 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；295 K；1.15M sodium malonate, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 4.00 Å R-free 0.329
4XMM Structure of the yeast coat nucleoporin complex, space group C2 提交 2015-01-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 F 1–451（451 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；PEG 20000, ethanol, MES	分辨率 7.38 Å R-free 0.353
4XMN Structure of the yeast coat nucleoporin complex, space group P212121 提交 2015-01-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 F 2–451（450 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；PEG 20000, ethanol, MES	分辨率 7.60 Å R-free 0.347
6X02 Nup84-Nup133 (aa521-1157) from S. cerevisiae bound by VHH-SAN8 提交 2020-05-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–726（726 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；6% PEG 8,000, 30% ethylene glycol, 0.1M imidazole titrated with MES pH 6.5, 15mM sodium nitrate, 15mM sodium phosphate dibasic, 15mM ammonium sulfate	分辨率 6.38 Å R-free 0.324
6X03 Nup84-Nup133 (aa521-1157) from S. cerevisiae bound by VHH-SAN8 and VHH-SAN9 提交 2020-05-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–726（726 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；6% PEG 8,000, 30% ethylene glycol, 0.1M imidazole titrated with MES pH 6.5, 15mM sodium nitrate, 15mM sodium phosphate dibasic, 15mM ammonium sulfate	分辨率 7.30 Å R-free 0.353
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric	链 f 1–726（726 aa）链 m 1–726（726 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)	分辨率 37.00 Å
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric	链 f 1–726（726 aa）链 m 1–726（726 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)	分辨率 37.00 Å
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric	链 f 1–726（726 aa）链 m 1–726（726 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)	分辨率 37.00 Å
8TIE Double nuclear outer ring of Nup84-complexes from the yeast NPC 提交 2023-07-19	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 f 1–726（726 aa）链 q 1–726（726 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES,50mM Potassium acetate,20mM NaCl,2mM MgCl2,1mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.10 Å

共 8 个其他 PDB 条目、12 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NUP84_YEAST
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 f； PDB构建体 1–726； UniProt 1–726 作者链 q； PDB构建体 1–726； UniProt 1–726

Nucleoporin NUP133

物种未注明

UniProt P36161

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 136 PDB 声明：136-meric（136）与蛋白拷贝数一致	链 g； UniProt 1–1157 链 r； UniProt 1–1157	未记录	Nucleoporin NUP188 × 8 （P52593） unknown × 16 Nucleoporin NUP120 × 16 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 16 （P46673） Nucleoporin 145c × 16 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 16 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 16 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 16 （P52891）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.60 Å
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17）与蛋白拷贝数一致	链 g； UniProt 1–1157 链 r； UniProt 1–1157	未记录	Nucleoporin NUP188 × 1 （P52593） unknown × 2 Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.60 Å
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17）与蛋白拷贝数一致	链 g； UniProt 1–1157 链 r； UniProt 1–1157	未记录	Nucleoporin NUP188 × 1 （P52593） unknown × 2 Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 7N84	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3KFO Crystal structure of the C-terminal domain from the nuclear pore complex component NUP133 from Saccharomyces cerevisiae 提交 2009-10-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 881–1157（277 aa）片段：C-terminal domain, residues 881-1157	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；20% PEG 3350, 200mM Potassium Thiocyanate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K	分辨率 1.90 Å R-free 0.245
6X02 Nup84-Nup133 (aa521-1157) from S. cerevisiae bound by VHH-SAN8 提交 2020-05-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 521–1157（637 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；6% PEG 8,000, 30% ethylene glycol, 0.1M imidazole titrated with MES pH 6.5, 15mM sodium nitrate, 15mM sodium phosphate dibasic, 15mM ammonium sulfate	分辨率 6.38 Å R-free 0.324
6X03 Nup84-Nup133 (aa521-1157) from S. cerevisiae bound by VHH-SAN8 and VHH-SAN9 提交 2020-05-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 521–1157（637 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；6% PEG 8,000, 30% ethylene glycol, 0.1M imidazole titrated with MES pH 6.5, 15mM sodium nitrate, 15mM sodium phosphate dibasic, 15mM ammonium sulfate	分辨率 7.30 Å R-free 0.353
6X04 Nup133 (aa55-481) from S. cerevisiae bound by VHH-SAN5 提交 2020-05-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 55–481（427 aa）链 C 55–481（427 aa）链 E 55–481（427 aa）链 G 55–481（427 aa）链 I 55–481（427 aa）链 K 55–481（427 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；15% PEG MME 2,000, 0.1M potassium chloride, 0.1M Tris/HCl pH 8	分辨率 2.68 Å R-free 0.261
6X05 Nup133 (aa55-481) from S. cerevisiae bound by VHH-SAN4 提交 2020-05-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 55–481（427 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；24% PEG 3,350, 0.2M Ammonium sulfate, 0.1M Bis-Tris pH 5.5	分辨率 2.10 Å R-free 0.219
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric	链 g 1–1157（1157 aa）链 n 1–1157（1157 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)	分辨率 37.00 Å
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric	链 g 1–1157（1157 aa）链 n 1–1157（1157 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)	分辨率 37.00 Å
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric	链 g 1–1157（1157 aa）链 n 1–1157（1157 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)	分辨率 37.00 Å

共 6 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NU133_YEAST
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 g； PDB构建体 1–1157； UniProt 1–1157 作者链 r； PDB构建体 1–1157； UniProt 1–1157

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7n84
沉积日期 deposition_date	2021-06-13
结构标题 title	Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC
关键词 keywords	nuclear pore complex, outer ring, Nup84 complex, TRANSLOCASE; TRANSLOCASE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	— Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	141.90 Å
零角强度 I(0) i0	17651200000.00
分子量 molecular_weight	1178000.0 kDa
排除体积 excluded_volume	1490000 Å³
包络体积 envelope_volume	3144000 Å³
水化壳体积 shell_volume	212150 Å³
包络直径 envelope_diameter	539.1 Å
壳层 Rg shell_rg	92.12 Å
包络 Rg envelope_rg	141.90 Å
形状 Rg shape_rg	141.90 Å
总 Rg total_rg	141.60 Å
总原子数 total_atoms	83142
残基数 n_residues	10313
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	375.1 Å
Rg (实空间) rg_real	128.20 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	2.25 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.6800e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	4.3870e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal	116.10 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	16310000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9131
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	136.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.340
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.581
角度范围 angular_range	— – 0.0550 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.7252
最高正则化参数 α highest_alpha	493600000.0000
实空间数据点数 n_real_points	12
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.051; Oscil: 0.979; Stabil: 0.980; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.988; Smooth: 0.004

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Nucleoporin NUP188
分子量 formula_weight	188753.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X
原子数 atom_count	83142

MATPSFGNSSPQLTFTHVANFMNDAAADVSAVDAKQLAQIRQFLKANKTNLIESLNTIRQNVTSSGDHNKLRSTIANLLQINVDNDPFFAQSEDLSHAVEFFMSERSSRLHIVYSLLVNPDIDLETYSFIDNDRFNVVGKLISIISSVIQNYDIITASSLAHDYNNDQDMFTIVSLVQLKKFSDLKFILQILQILNLMILNTKVPVDIVNQWFLQYQNQFVEFCRNINSTDKSIDTSSLQLYKFQNFQDLSYLSETLISRISSLFTITTILILGLNTSIAQFDIQSPLYMDTETFDTVNSALENDVATNIVNEDPIFHPMIHYSWSFILYYRRALQSSESFDDSDITKFALFAESHDVLQKLNTLSEILSFDPVYTTVITVFLEFSLNFIPITASTSRVFAKIISKAPEQFIENFLTNDTFEKKLSIIKAKLPLLNESLIPLINLALIDTEFANFELKDICSFAVTKSSLNDLDYDLIADTITNSSSSSDIIVPDLIELKSDLLVAPPLENENSNCLLSIPKSTKGKILTIKQQQQQQQQQNGQQPPTTSNLIIFLYKFNGWSLVGRILQNLLHSYMEKGTQLDDLQHELMISIIKLVTNVVDPKTSIEKSSEILSYLSNSLDTSASTINGASIIQVIFEIFEISLQRKDYTSIVQCCEFMTMLTPNYLHLVSSYLNKSDLLDKYGKTGLSNMILGSVELSTGDYTFTIQLLKLTKVFIRESLSLKNIHISKRSKIDIINKLILHAIHIFESYYNWKYNNFLQKFEIAFHLTLIFYDVLHDVFTINPHQKDQLIISSSANKLLQLFLTPMDSIDLAPNTLTNILISPLNTTTKILGDKILGNLYSKVMNNSFKLCTLLIAIRGSNRDLKPSNLEKLLFINSSKLVDVYTLPSYVHFKVQIIELLSYLVEAPWNDDYPFLLSFLGEAKSMAFLKEVLSDLSSPVQDWNLLRSLYIFFTTLLESKQDGLSILFLTGQFASNKKINDESSIDKKSSILTVLQKNSLLLDSTPEEVSCKLLETITYVLNTWTNSKIFIKDPKFVNSLLAKLKDSKKLFQKKENLTRDETVSLIKKYKLISRIVEIFALCIYNSTDSNSEILNFLNQEDLFELVHHFFQIDGFNKTFHDELNLKFKEKWPSLELQSFQKIPLSRINENENFGYDIPLLDIVLKADRSWNEPSKSQTNFKEEITDASLNLQYVNYEISTAKAWGALITTFVKRSTVPLNDGFVDLVEHFLKLNIDFGSDKQMFTQIYLERIELSFYILYSFKLSGKLLKEEKIIELMNKIFTIFKSGEIDFIKNIGKSLKNNFYRPLLRSVLVLLELVSSGDRFIELISDQLLEFFELVFSKGVYLILSEILCQINKCSTRGLSTDHTTQIVNLEDNTQDLLLLLSLFKKITNVNPSKNFNVILASSLNEVGTLKVILNLYSSAHLIRINDEPILGQITLTFISELCSIEPIAAKLINSGLYSVLLESPLSVAIQQGDIKPEFSPRLHNIWSNGLLSIVLLLLSQFGIKVLPETCLFVSYFGKQIKSTIYNWGDNKLAVSSSLIKETNQLVLLQKMLNLLNYQELFIQPKNSDDQQEAVELVIGLDSEHDKKRLSAALSKFLTHPKYLNSRIIPTTLEEQQQLEDESSRLEFVKGISRDIKALQDSLFKDV

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	unknown
分子量 formula_weight	5379.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y,Z

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Nucleoporin NUP120
分子量 formula_weight	120560.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a,l

MACLSRIDANLLQYYEKPEPNNTVDLYVSNNSNNNGLKEGDKSISTPVPQPYGSEYSNCLLLSNSEYICYHFSSRSTLLTFYPLSDAYHGKTINIHLPNASMNQRYTLTIQEVEQQLLVNVILKDGSFLTLQLPLSFLFSSANTLNGEWFHLQNPYDFTVRVPHFLFYVSPQFSVVFLEDGGLLGLKKVDGVHYEPLLFNDNSYLKSLTRFFSRSSKSDYDSVISCKLFHERYLIVLTQNCHLKIWDLTSFTLIQDYDMVSQSDSDPSHFRKVEAVGEYLSLYNNTLVTLLPLENGLFQMGTLLVDSSGILTYTFQNNIPTNLSASAIWSIVDLVLTRPLELNVEASYLNLIVLWKSGTASKLQILNVNDESFKNYEWIESVNKSLVDLQSEHDLDIVTKTGDVERGFCNLKSRYGTQIFERAQQILSENKIIMAHNEDEEYLANLETILRDVKTAFNEASSITLYGDEIILVNCFQPYNHSLYKLNTTVENWFYNMHSETDGSELFKYLRTLNGFASTLSNDVLRSISKKFLDIITGELPDSMTTVEKFTDIFKNCLENQFEITNLKILFDELNSFDIPVVLNDLINNQMKPGIFWKKDFISAIKFDGFTSIISLESLHQLLSIHYRITLQVLLTFVLFDLDTEIFGQHISTLLDLHYKQFLLLNLYRQDKCLLAEVLLKDSSEFSFGVKFFNYGQLIAYIDSLNSNVYNASITENSFFMTFFRSYIIENTSHKNIRFFLENVECPFYLRHNEVQEFMFAMTLFSCGNFDQSYEIFQLHDYPEAINDKLPTFLEDLKSENYHGDSIWKDLLCTFTVPYRHSAFYYQLSLLFDRNNSQEFALKCISKSAEYSLKEIQIEELQDFKEKQHIHYLNLLIHFRMFEEVLDVLRLGHECLSDTVRTNFLQLLLQEDIYSRDFFSTLLRLCNAHSDNGELYLRTVDIKIVDSILSQNLRSGDWECFKKLYCFRMLNKSERAAAEVLYQYILMQADLDVIRKRKCYLMVINVLSSFDSAYDQWILNGSKVVTLTDLRDELRGL

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Nucleoporin NUP85
分子量 formula_weight	84972.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b,m

MTIDDSNRLLMDVDQFDFLDDGTAQLSNNKTDEEEQLYKRDPVSGAILVPMTVNDQPIEKNGDKMPLKFKLGPLSYQNMAFITAKDKYKLYPVRIPRLDTSKEFSAYVSGLFEIYRDLGDDRVFNVPTIGVVNSNFAKEHNATVNLAMEAILNELEVFIGRVKDQDGRVNRFYELEESLTVLNCLRTMYFILDGQDVEENRSEFIESLLNWINRSDGEPDEEYIEQVFSVKDSTAGKKVFETQYFWKLLNQLVLRGLLSQAIGCIERSDLLPYLSDTCAVSFDAVSDSIELLKQYPKDSSSTFREWKNLVLKLSQAFGSSATDISGELRDYIEDFLLVIGGNQRKILQYSRTWYESFCGFLLYYIPSLELSAEYLQMSLEANVVDITNDWEQPCVDIISGKIHSILPVMESLDSCTAAFTAMICEAKGLIENIFEGEKNSDDYSNEDNEMLEDLFSYRNGMASYMLNSFAFELCSLGDKELWPVAIGLIALSATGTRSAKKMVIAELLPHYPFVTNDDIEWMLSICVEWRLPEIAKEIYTTLGNQMLSAHNIIESIANFSRAGKYELVKSYSWLLFEASCMEGQKLDDPVLNAIVSKNSPAEDDVIIPQDILDCVVTNSMRQTLAPYAVLSQFYELRDREDWGQALRLLLLLIEFPYLPKHYLVLLVAKFLYPIFLLDDKKLMDEDSVATVIEVIETKWDDADEKSSNLYETIIEADKSLPSSMATLLKNLRKKLNFKLCQAFM

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Nucleoporin 145c
分子量 formula_weight	81157.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	c,n

SIWGLVNEEDAEIDEDDLSKQEDGGEQPLRKVRTLAQSKPSDKEVILKTDGTFGTLSGKDDSIVEEKAYEPDLSDADFEGIEASPKLDVSKDWVEQLILAGSSLRSVFATSKEFDGPCQNEIDLLFSECNDEIDNAKLIMKERRFTASYTFAKFSTGSMLLTKDIVGKSGVSIKRLPTELQRKFLFDDVYLDKEIEKVTIEARKSNPYPQISESSLLFKDALDYMEKTSSDYNLWKLSSILFDPVSYPYKTDNDQVKMALLKKERHCRLTSWIVSQIGPEIEEKIRNSSNEIEQIFLYLLLNDVVRASKLAIESKNGHLSVLISYLGSNDPRIRDLAELQLQKWSTGGCSIDKNISKIYKLLSGSPFEGLFSLKELESEFSWLCLLNLTLCYGQIDEYSLESLVQSHLDKFSLPYDDPIGVIFQLYAANENTEKLYKEVRQRTNALDVQFCWYLIQTLRFNGTRVFSKETSDEATFAFAAQLEFAQLHGHSLFVSCFLNDDKAAEDTIKRLVMREITLLRASTNDHILNRLKIPSQLIFNAQALKDRYEGNYLSEVQNLLLGSSYDLAEMAIVTSLGPRLLLSNNPVQNNELKTLREILNEFPDSERDKWSVSINVFEVYLKLVLDNVETQETIDSLISGMKIFYDQYKHCREVAACCNVMSQEIVSKILEKNNPSIGDSKAKLLELPLGQPEKAYLRGEFAQDLMKCTYKI

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Protein transport protein SEC13
分子量 formula_weight	33083.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	d,o

MVVIANAHNELIHDAVLDYYGKRLATCSSDKTIKIFEVEGETHKLIDTLTGHEGPVWRVDWAHPKFGTILASCSYDGKVLIWKEENGRWSQIAVHAVHSASVNSVQWAPHEYGPLLLVASSDGKVSVVEFKENGTTSPIIIDAHAIGVNSASWAPATIEEDGEHNGTKESRKFVTGGADNLVKIWKYNSDAQTYVLESTLEGHSDWVRDVAWSPTVLLRSYLASVSQDRTCIIWTQDNEQGPWKKTLLKEEKFPDVLWRASWSLSGNVLALSGGDNKVTLWKENLEGKWEPAGEVHQ

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Nucleoporin SEH1
分子量 formula_weight	39170.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	e,p

MQPFDSGHDDLVHDVVYDFYGRHVATCSSDQHIKVFKLDKDTSNWELSDSWRAHDSSIVAIDWASPEYGRIIASASYDKTVKLWEEDPDQEECSGRRWNKLCTLNDSKGSLYSVKFAPAHLGLKLACLGNDGILRLYDALEPSDLRSWTLTSEMKVLSIPPANHLQSDFCLSWCPSRFSPEKLAVSALEQAIIYQRGKDGKLHVAAKLPGHKSLIRSISWAPSIGRWYQLIATGCKDGRIRIFKITEKLSPLASEESLTNSNMFDNSADVDMDAQGRSDSNTEEKAELQSNLQVELLSEHDDHNGEVWSVSWNLTGTILSSAGDDGKVRLWKATYSNEFKCMSVITAQQ

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Nucleoporin NUP84
分子量 formula_weight	83718.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	f,q

MELSPTYQTERFTKFSDTLKEFKIEQNNEQNPIDPFNIIREFRSAAGQLALDLANSGDESNVISSKDWELEARFWHLVELLLVFRNADLDLDEMELHPYNSRGLFEKKLMQDNKQLYQIWIVMVWLKENTYVMERPKNVPTSKWLNSITSGGLKSCDLDFPLRENTNVLDVKDKEEDHIFFKYIYELILAGAIDEALEEAKLSDNISICMILCGIQEYLNPVIDTQIANEFNTQQGIKKHSLWRRTVYSLSQQAGLDPYERAIYSYLSGAIPNQEVLQYSDWESDLHIHLNQILQTEIENYLLENNQVGTDELILPLPSHALTVQEVLNRVASRHPSESEHPIRVLMASVILDSLPSVIHSSVEMLLDVVKGTEASNDIIDKPYLLRIVTHLAICLDIINPGSVEEVDKSKLITTYISLLKLQGLYENIPIYATFLNESDCLEACSFILSSLEDPQVRKKQIETINFLRLPASNILRRTTQRVFDETEQEYSPSNEISISFDVNNIDMHLIYGVEWLIEGKLYVDAVHSIIALSRRFLLNGRVKALEQFMERNNIGEICKNYELEKIADNISKDENEDQFLEEITQYEHLIKGIREYEEWQKSVSLLSSESNIPTLIEKLQGFSKDTFELIKTFLVDLTSSNFADSADYEILYEIRALYTPFLLMELHKKLVEAAKLLKIPKFISEALAFTSLVANENDKIYLLFQSSGKLKEYLDLVARTATLSN

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Nucleoporin NUP133
分子量 formula_weight	133452.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	g,r

MSEKKVHLRLRKELSVPIAVVENESLAQLSYEEESQASLMDISMEQQQLRLHSHFDNSKVFTENNRYIVKTLQTDYSSGFSNDDELNGYIDMQIGYGLVNDHKKVYIWNIHSTQKDTPYITVPFRSDDNDEIAVAPRCILTFPATMDESPLALNPNDQDETGGLIIIKGSKAIYYEDINSINNLNFKLSEKFSHELELPINSSGGEKCDLMLNCEPAGIVLSTNMGRIFFITIRNSMGKPQLKLGKLLNKPFKLGIWSKIFNTNSSVVSLRNGPILGKGTRLVYITTNKGIFQTWQLSATNSHPTKLIDVNIYEAILESLQDLYPFAHGTLKIWDSHPLQDESSQLFLSSIYDSSCNETYYILSTIIFDSSSNSFTIFSTYRLNTFMESITDTKFKPKIFIPQMENANDTNEVTSILVMFPNAVVITQVNSKLDSSYSMRRKWEDIVSLRNDIDIIGSGYDSKSLYVLTKQMGVLQFFVKENEETNSKPEVGFVKSHVDQAVYFSKINANPIDFNLPPEISLDQESIEHDLKLTSEEIFHSNGKYIPPMLNTLGQHLSVRKEFFQNFLTFVAKNFNYKISPELKLDLIEKFEILNCCIKFNSIIRQSDVLNDIWEKTLSNYNLTQNEHLTTKTVVINSPDVFPVIFKQFLNHVVFVLFPSQNQNFKLNVTNLINLCFYDGILEEGEKTIRYELLELDPMEVDTSKLPWFINFDYLNCINQCFFDFTFACEEEGSLDSYKEGLLKIVKILYYQFNQFKIWINTQPVKSVNANDNFININNLYDDNHLDWNHVLCKVNLKEQCIQIAEFYKDLSGLVQTLQTLDQNDSTTVSLYETFFNEFPKEFSFTLFEYLIKHKKLNDLIFRFPQQHDVLIQFFQESAPKYGHVAWIQQILDGSYADAMNTLKNITVDDSKKGESLSECELHLNVAKLSSLLVEKDNLDINTLRKIQYNLDTIDAEKNISNKLKKGEVQICKRFKNGSIREVFNILVEELKSTTVVNLSDLVELYSMLDDEESLFIPLRLLSVDGNLLNFEVKKFLNALVWRRIVLLNASNEGDKLLQHIVKRVFDEELPKNNDFPLPSVDLLCDKSLLTPEYISETYGRFPIDQNAIREEIYEEISQVETLNSDNSLEIKLHSTIGSVAKEKNYTINYETNTVEY

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	11.60 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	45000

fit	/app/data/saxs_computation/n8/7n84/7n84.fit
pddf	/app/data/pr_computation/n8/7n84/7n84.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/n8/7n84/7n84.dat

Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Nucleoporin NUP188

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Nucleoporin NUP120

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Nucleoporin NUP85

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Nucleoporin 145c

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Protein transport protein SEC13

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Nucleoporin SEH1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Nucleoporin NUP84

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Nucleoporin NUP133

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

实体 7 Entity 7 polymer

聚合物 Polymer

实体 8 Entity 8 polymer

聚合物 Polymer

实体 9 Entity 9 polymer

聚合物 Polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)