|
5IY6
Human holo-PIC in the closed state
提交 2016-03-24
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 27
PDB 声明:29-meric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 2
ZN ZINC ION × 11
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 7.20 Å
|
|
5IY7
Human holo-PIC in the open state
提交 2016-03-24
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 27
PDB 声明:29-meric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 2
ZN ZINC ION × 11
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 8.60 Å
|
|
5IY8
Human holo-PIC in the initial transcribing state
提交 2016-03-24
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 27
PDB 声明:29-meric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 2
ZN ZINC ION × 11
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 7.90 Å
|
|
5IY9
Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS)
提交 2016-03-24
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 26
PDB 声明:29-meric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 2
ZN ZINC ION × 10
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 6.30 Å
|
|
5IYA
Human core-PIC in the closed state
提交 2016-03-24
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 21
PDB 声明:23-meric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 2
ZN ZINC ION × 11
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 5.40 Å
|
|
5IYB
Human core-PIC in the open state
提交 2016-03-24
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 21
PDB 声明:23-meric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 2
ZN ZINC ION × 11
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 3.90 Å
|
|
5IYC
Human core-PIC in the initial transcribing state
提交 2016-03-24
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 21
PDB 声明:23-meric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 2
ZN ZINC ION × 11
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 3.90 Å
|
|
5IYD
Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS)
提交 2016-03-24
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 20
PDB 声明:23-meric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 2
ZN ZINC ION × 11
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 3.90 Å
|
|
6DRD
RNA Pol II(G)
提交 2018-06-11
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 13
PDB 声明:tridecameric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 5
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å
|
|
6O9L
Human holo-PIC in the closed state
提交 2019-03-14
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 31
PDB 声明:33-meric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 2
ZN ZINC ION × 17
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.20 Å
|
|
6XRE
Structure of the p53/RNA polymerase II assembly
提交 2020-07-12
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 13
PDB 声明:tridecameric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 1
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;The assembled p53/Pol II co-complex was applied directly on the grid for 10 sec followed by
5.5 sec of blotting. The sample grid was then washed with 3.5% trehalose in 0.1 M KCl/HEM buffer (20 mM HEPES, 0.2 mM EDTA, 2 mM MgCl2 at pH 7.9) for 10 sec, blotted for 5.5 sec, and finally frozen in liquid ethane.
|
分辨率 4.60 Å
|
|
7A6H
Cryo-EM structure of human apo RNA Polymerase III
提交 2020-08-25
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 17
PDB 声明:heptadecameric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 7
MG MAGNESIUM ION × 1
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Wait time 10 s
Blot force 4
Blot time 4 s
|
分辨率 3.30 Å
|
|
7AE1
Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 1
提交 2020-09-17
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 17
PDB 声明:eicosameric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 7
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Wait time 10 s
Blot force 4
Blot time 4 s
|
分辨率 2.80 Å
|
|
7AE3
Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 3
提交 2020-09-17
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 17
PDB 声明:eicosameric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 7
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Wait time 10 s
Blot force 4
Blot time 4 s
|
分辨率 3.10 Å
|
|
7AEA
Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 2
提交 2020-09-17
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 17
PDB 声明:eicosameric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 7
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Wait time 10 s
Blot force 4
Blot time 4 s
|
分辨率 3.40 Å
|
|
7AST
Apo Human RNA Polymerase III
提交 2020-10-28
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 17
PDB 声明:heptadecameric
|
链 E
1–127(127 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å
|
|
7D58
cryo-EM structure of human RNA polymerase III in elongating state
提交 2020-09-25
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 17
PDB 声明:eicosameric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 7
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
7D59
cryo-EM structure of human RNA polymerase III in apo state
提交 2020-09-25
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 17
PDB 声明:heptadecameric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 7
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
7DN3
Structure of Human RNA Polymerase III elongation complex
提交 2020-12-08
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 17
PDB 声明:eicosameric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 1
ZN ZINC ION × 6
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å
|
|
7DTH
Solution structure of RPB6, common subunit of RNA polymerases I, II, and III
提交 2021-01-05
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–127(127 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.8;298 K;离子强度(mmCIF原始值)25;压力 1
NMR样品组成
2.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] RPB6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] RPB6, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供
|
|
7DTI
Solution structure of the complex between RNA polymerase subunit RPB6 and TFIIH p62 PH domain
提交 2021-01-05
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–127(127 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.8;298 K;离子强度(mmCIF原始值)25;压力 1
NMR样品组成
0.38 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] RPB6, 0.38 mM TFIIH p62, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.38 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] RPB6, 0.38 mM TFIIH p62, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.38 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TFIIH p62, 0.38 mM RPB6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.38 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TFIIH p62, 0.38 mM RPB6, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供
|
|
7DU2
RNA polymerase III EC complex in post-translocation state
提交 2021-01-07
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 17
PDB 声明:eicosameric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 1
ZN ZINC ION × 6
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.35 Å
|
|
7FJI
human Pol III elongation complex
提交 2021-08-04
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 17
PDB 声明:eicosameric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 7
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
|
分辨率 3.60 Å
|
|
7FJJ
human Pol III pre-termination complex
提交 2021-08-04
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 17
PDB 声明:eicosameric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 1
ZN ZINC ION × 7
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
|
分辨率 3.60 Å
|
|
7LBM
Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex
提交 2021-01-08
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 54
PDB 声明:56-meric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 2
ZN ZINC ION × 16
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å
|
|
7OB9
Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I in elongation state
提交 2021-04-21
|
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 13
PDB 声明:hexadecameric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 6
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
|
分辨率 2.70 Å
|
|
7OBB
Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I Open Complex
提交 2021-04-21
|
聚集状态不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 13
PDB 声明:pentadecameric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 7
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
|
分辨率 3.30 Å
|
|
7VBA
Structure of the pre state human RNA Polymerase I Elongation Complex
提交 2021-08-31
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 13
PDB 声明:hexadecameric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 5
MG MAGNESIUM ION × 1
2TM 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]cytidine × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.89 Å
|
|
7VBB
Structure of the post state human RNA Polymerase I Elongation Complex
提交 2021-08-31
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 13
PDB 声明:hexadecameric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 5
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.81 Å
|
|
7VBC
Back track state of human RNA Polymerase I Elongation Complex
提交 2021-08-31
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 13
PDB 声明:hexadecameric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 5
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.01 Å
|
|
8A43
Human RNA polymerase I
提交 2022-06-10
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.09 Å
|
|
8ITY
human RNA polymerase III pre-initiation complex closed DNA 1
提交 2023-03-23
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 23
PDB 声明:25-meric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 7
MG MAGNESIUM ION × 1
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.90 Å
|
|
8IUE
RNA polymerase III pre-initiation complex melting complex 1
提交 2023-03-24
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 23
PDB 声明:25-meric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
MG MAGNESIUM ION × 1
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.10 Å
|
|
8IUH
RNA polymerase III pre-initiation complex open complex 1
提交 2023-03-24
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 23
PDB 声明:25-meric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
MG MAGNESIUM ION × 1
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.40 Å
|
|
8XRJ
RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei
提交 2024-01-07
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 20
PDB 声明:23-meric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å
|
|
8XRM
RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei
提交 2024-01-07
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 16
PDB 声明:19-meric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 10
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.13 Å
|
|
8XSO
RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei
提交 2024-01-09
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:15-meric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å
|
|
8XVS
RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei
提交 2024-01-15
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 20
PDB 声明:23-meric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å
|
|
9EHZ
Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex in an Intermediate Translocation State
提交 2024-11-25
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:pentadecameric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å
|
|
9EI1
Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the absence of nucleotide
提交 2024-11-25
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 13
PDB 声明:hexadecameric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
9EI3
Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of AMPPNP
提交 2024-11-25
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 13
PDB 声明:hexadecameric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
MG MAGNESIUM ION × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
9EI4
Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP
提交 2024-11-25
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 13
PDB 声明:hexadecameric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
MG MAGNESIUM ION × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å
|
|
9FSO
Human RNA Polymerase III Class III Open Pre-initiation Complex 1 (OC1)
提交 2024-06-21
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 23
PDB 声明:25-meric
|
链 N
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 9
MG MAGNESIUM ION × 1
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.28 Å
|
|
9FSP
RNA Polymerase III Class III Open Pre-initation Complex 2 (OC2)
提交 2024-06-21
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 23
PDB 声明:25-meric
|
链 N
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 9
MG MAGNESIUM ION × 1
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.39 Å
|
|
9FSQ
RNA Polymerase III Class III Melting Pre-Initiation Complex (MC)
提交 2024-06-21
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 23
PDB 声明:25-meric
|
链 N
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 9
MG MAGNESIUM ION × 1
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.51 Å
|
|
9FSR
RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-initiation Complex 1 (OC1-mini)
提交 2024-06-21
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 23
PDB 声明:25-meric
|
链 N
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 9
MG MAGNESIUM ION × 1
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.76 Å
|
|
9FSS
RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-Initiation complex 2 (OC2-mini)
提交 2024-06-21
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 23
PDB 声明:25-meric
|
链 N
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 9
MG MAGNESIUM ION × 1
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.14 Å
|
|
9K2G
Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 13 (TC13)
提交 2024-10-17
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 18
PDB 声明:21-meric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 6
MG MAGNESIUM ION × 1
3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
9K36
Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 12 (TC12)
提交 2024-10-18
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 18
PDB 声明:21-meric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 6
MG MAGNESIUM ION × 1
3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
9K38
Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 6 (TC6)
提交 2024-10-18
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 18
PDB 声明:21-meric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 6
MG MAGNESIUM ION × 1
3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
9K39
Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 8 (TC8)
提交 2024-10-18
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 18
PDB 声明:21-meric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 6
MG MAGNESIUM ION × 1
3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.80 Å
|
|
9K3B
Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 10 overall (TC10-overall)
提交 2024-10-18
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 23
PDB 声明:26-meric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 6
MG MAGNESIUM ION × 1
3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.80 Å
|
|
9K3U
Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5)
提交 2024-10-20
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 23
PDB 声明:26-meric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 7
MG MAGNESIUM ION × 1
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
9K3V
Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 4 (TC4)
提交 2024-10-20
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 23
PDB 声明:26-meric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 7
3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.50 Å
|
|
9LKT
Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 10 (TC10)
提交 2025-01-16
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 18
PDB 声明:21-meric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 6
MG MAGNESIUM ION × 1
3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.50 Å
|
|
9LXN
Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5)(without 3'dATP)
提交 2025-02-18
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 23
PDB 声明:26-meric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 7
MG MAGNESIUM ION × 1
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
9LXO
Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 6 (TC6)(without 3'dATP)
提交 2025-02-18
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 18
PDB 声明:21-meric
|
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 6
MG MAGNESIUM ION × 1
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.60 Å
|
|
9VD9
Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex
提交 2025-06-07
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 35
PDB 声明:38-meric
|
链 5
1–127(127 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 10
MN MANGANESE (II) ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.60 Å
|