8am5

RCII/PSI complex, class 3

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem II protein D1 2

Synechocystis sp. PCC 6803

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	Photosystem II D2 protein × 1 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （P09191） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q54697） Photosystem II assembly lipoprotein Ycf48 × 1 （P73069） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P29254） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P29255） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P32422） Photosystem I reaction center subunit II × 1 （P19569） Photosystem I reaction center subunit IV × 1 （P12975） Photosystem I reaction center subunit III × 1 （P29256） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （Q55330） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （Q55329） Photosystem I reaction center subunit PsaK 1 × 1 （P72712） Photosystem I reaction center subunit XI × 1 （P37277） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （P72986） FE (II) ION × 1 CHLOROPHYLL A × 101 PHEOPHYTIN A × 2 BETA-CAROTENE × 19 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 5 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 4 beta,beta-carotene-4,4'-dione × 1 beta,beta-caroten-4-one × 2 (3'R)-3'-hydroxy-beta,beta-caroten-4-one × 1 ;(1R,2S)-4-{(1E,3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(4S)-4-hydroxy-2,6,6-trimethylcyclohex-1-en-1-yl]-3,7,12,16-tetramethyloctadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaen-1-yl}-2,5,5-trimethylcyclohex-3-en-1-ol ; × 2 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSBA2_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–344； UniProt 1–344

Photosystem II D2 protein

Synechocystis sp. PCC 6803

UniProt P09192

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	Photosystem II protein D1 2 × 1 （P16033） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （P09191） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q54697） Photosystem II assembly lipoprotein Ycf48 × 1 （P73069） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P29254） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P29255） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P32422） Photosystem I reaction center subunit II × 1 （P19569） Photosystem I reaction center subunit IV × 1 （P12975） Photosystem I reaction center subunit III × 1 （P29256） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （Q55330） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （Q55329） Photosystem I reaction center subunit PsaK 1 × 1 （P72712） Photosystem I reaction center subunit XI × 1 （P37277） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （P72986） FE (II) ION × 1 CHLOROPHYLL A × 101 PHEOPHYTIN A × 2 BETA-CAROTENE × 19 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 5 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 4 beta,beta-carotene-4,4'-dione × 1 beta,beta-caroten-4-one × 2 (3'R)-3'-hydroxy-beta,beta-caroten-4-one × 1 ;(1R,2S)-4-{(1E,3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(4S)-4-hydroxy-2,6,6-trimethylcyclohex-1-en-1-yl]-3,7,12,16-tetramethyloctadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaen-1-yl}-2,5,5-trimethylcyclohex-3-en-1-ol ; × 2 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSBD_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 8–336； UniProt 2–330

Cytochrome b559 subunit alpha

Synechocystis sp. PCC 6803

UniProt P09190

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	Photosystem II protein D1 2 × 1 （P16033） Photosystem II D2 protein × 1 （P09192） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （P09191） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q54697） Photosystem II assembly lipoprotein Ycf48 × 1 （P73069） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P29254） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P29255） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P32422） Photosystem I reaction center subunit II × 1 （P19569） Photosystem I reaction center subunit IV × 1 （P12975） Photosystem I reaction center subunit III × 1 （P29256） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （Q55330） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （Q55329） Photosystem I reaction center subunit PsaK 1 × 1 （P72712） Photosystem I reaction center subunit XI × 1 （P37277） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （P72986） FE (II) ION × 1 CHLOROPHYLL A × 101 PHEOPHYTIN A × 2 BETA-CAROTENE × 19 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 5 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 4 beta,beta-carotene-4,4'-dione × 1 beta,beta-caroten-4-one × 2 (3'R)-3'-hydroxy-beta,beta-caroten-4-one × 1 ;(1R,2S)-4-{(1E,3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(4S)-4-hydroxy-2,6,6-trimethylcyclohex-1-en-1-yl]-3,7,12,16-tetramethyloctadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaen-1-yl}-2,5,5-trimethylcyclohex-3-en-1-ol ; × 2 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBE_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–81； UniProt 1–81

Cytochrome b559 subunit beta

Synechocystis sp. PCC 6803

UniProt P09191

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	Photosystem II protein D1 2 × 1 （P16033） Photosystem II D2 protein × 1 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （P09190） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q54697） Photosystem II assembly lipoprotein Ycf48 × 1 （P73069） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P29254） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P29255） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P32422） Photosystem I reaction center subunit II × 1 （P19569） Photosystem I reaction center subunit IV × 1 （P12975） Photosystem I reaction center subunit III × 1 （P29256） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （Q55330） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （Q55329） Photosystem I reaction center subunit PsaK 1 × 1 （P72712） Photosystem I reaction center subunit XI × 1 （P37277） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （P72986） FE (II) ION × 1 CHLOROPHYLL A × 101 PHEOPHYTIN A × 2 BETA-CAROTENE × 19 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 5 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 4 beta,beta-carotene-4,4'-dione × 1 beta,beta-caroten-4-one × 2 (3'R)-3'-hydroxy-beta,beta-caroten-4-one × 1 ;(1R,2S)-4-{(1E,3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(4S)-4-hydroxy-2,6,6-trimethylcyclohex-1-en-1-yl]-3,7,12,16-tetramethyloctadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaen-1-yl}-2,5,5-trimethylcyclohex-3-en-1-ol ; × 2 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBF_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–44； UniProt 1–44

Photosystem II reaction center protein I

Synechocystis sp. PCC 6803

UniProt Q54697

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	Photosystem II protein D1 2 × 1 （P16033） Photosystem II D2 protein × 1 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （P09191） Photosystem II assembly lipoprotein Ycf48 × 1 （P73069） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P29254） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P29255） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P32422） Photosystem I reaction center subunit II × 1 （P19569） Photosystem I reaction center subunit IV × 1 （P12975） Photosystem I reaction center subunit III × 1 （P29256） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （Q55330） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （Q55329） Photosystem I reaction center subunit PsaK 1 × 1 （P72712） Photosystem I reaction center subunit XI × 1 （P37277） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （P72986） FE (II) ION × 1 CHLOROPHYLL A × 101 PHEOPHYTIN A × 2 BETA-CAROTENE × 19 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 5 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 4 beta,beta-carotene-4,4'-dione × 1 beta,beta-caroten-4-one × 2 (3'R)-3'-hydroxy-beta,beta-caroten-4-one × 1 ;(1R,2S)-4-{(1E,3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(4S)-4-hydroxy-2,6,6-trimethylcyclohex-1-en-1-yl]-3,7,12,16-tetramethyloctadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaen-1-yl}-2,5,5-trimethylcyclohex-3-en-1-ol ; × 2 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSBI_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38

Photosystem II assembly lipoprotein Ycf48

Synechocystis sp. PCC 6803

UniProt P73069

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	Photosystem II protein D1 2 × 1 （P16033） Photosystem II D2 protein × 1 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （P09191） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q54697） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P29254） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P29255） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P32422） Photosystem I reaction center subunit II × 1 （P19569） Photosystem I reaction center subunit IV × 1 （P12975） Photosystem I reaction center subunit III × 1 （P29256） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （Q55330） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （Q55329） Photosystem I reaction center subunit PsaK 1 × 1 （P72712） Photosystem I reaction center subunit XI × 1 （P37277） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （P72986） FE (II) ION × 1 CHLOROPHYLL A × 101 PHEOPHYTIN A × 2 BETA-CAROTENE × 19 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 5 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 4 beta,beta-carotene-4,4'-dione × 1 beta,beta-caroten-4-one × 2 (3'R)-3'-hydroxy-beta,beta-caroten-4-one × 1 ;(1R,2S)-4-{(1E,3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(4S)-4-hydroxy-2,6,6-trimethylcyclohex-1-en-1-yl]-3,7,12,16-tetramethyloctadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaen-1-yl}-2,5,5-trimethylcyclohex-3-en-1-ol ; × 2 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	YCF48_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

Synechocystis sp. PCC 6803

UniProt P29254

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	Photosystem II protein D1 2 × 1 （P16033） Photosystem II D2 protein × 1 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （P09191） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q54697） Photosystem II assembly lipoprotein Ycf48 × 1 （P73069） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P29255） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P32422） Photosystem I reaction center subunit II × 1 （P19569） Photosystem I reaction center subunit IV × 1 （P12975） Photosystem I reaction center subunit III × 1 （P29256） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （Q55330） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （Q55329） Photosystem I reaction center subunit PsaK 1 × 1 （P72712） Photosystem I reaction center subunit XI × 1 （P37277） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （P72986） FE (II) ION × 1 CHLOROPHYLL A × 101 PHEOPHYTIN A × 2 BETA-CAROTENE × 19 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 5 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 4 beta,beta-carotene-4,4'-dione × 1 beta,beta-caroten-4-one × 2 (3'R)-3'-hydroxy-beta,beta-caroten-4-one × 1 ;(1R,2S)-4-{(1E,3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(4S)-4-hydroxy-2,6,6-trimethylcyclohex-1-en-1-yl]-3,7,12,16-tetramethyloctadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaen-1-yl}-2,5,5-trimethylcyclohex-3-en-1-ol ; × 2 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSAA_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 a； PDB构建体 1–751； UniProt 1–751

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2

Synechocystis sp. PCC 6803

UniProt P29255

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	Photosystem II protein D1 2 × 1 （P16033） Photosystem II D2 protein × 1 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （P09191） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q54697） Photosystem II assembly lipoprotein Ycf48 × 1 （P73069） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P29254） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P32422） Photosystem I reaction center subunit II × 1 （P19569） Photosystem I reaction center subunit IV × 1 （P12975） Photosystem I reaction center subunit III × 1 （P29256） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （Q55330） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （Q55329） Photosystem I reaction center subunit PsaK 1 × 1 （P72712） Photosystem I reaction center subunit XI × 1 （P37277） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （P72986） FE (II) ION × 1 CHLOROPHYLL A × 101 PHEOPHYTIN A × 2 BETA-CAROTENE × 19 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 5 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 4 beta,beta-carotene-4,4'-dione × 1 beta,beta-caroten-4-one × 2 (3'R)-3'-hydroxy-beta,beta-caroten-4-one × 1 ;(1R,2S)-4-{(1E,3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(4S)-4-hydroxy-2,6,6-trimethylcyclohex-1-en-1-yl]-3,7,12,16-tetramethyloctadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaen-1-yl}-2,5,5-trimethylcyclohex-3-en-1-ol ; × 2 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSAB_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 b； PDB构建体 1–731； UniProt 1–731

Photosystem I iron-sulfur center

Synechocystis sp. PCC 6803

UniProt P32422

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	Photosystem II protein D1 2 × 1 （P16033） Photosystem II D2 protein × 1 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （P09191） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q54697） Photosystem II assembly lipoprotein Ycf48 × 1 （P73069） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P29254） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P29255） Photosystem I reaction center subunit II × 1 （P19569） Photosystem I reaction center subunit IV × 1 （P12975） Photosystem I reaction center subunit III × 1 （P29256） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （Q55330） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （Q55329） Photosystem I reaction center subunit PsaK 1 × 1 （P72712） Photosystem I reaction center subunit XI × 1 （P37277） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （P72986） FE (II) ION × 1 CHLOROPHYLL A × 101 PHEOPHYTIN A × 2 BETA-CAROTENE × 19 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 5 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 4 beta,beta-carotene-4,4'-dione × 1 beta,beta-caroten-4-one × 2 (3'R)-3'-hydroxy-beta,beta-caroten-4-one × 1 ;(1R,2S)-4-{(1E,3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(4S)-4-hydroxy-2,6,6-trimethylcyclohex-1-en-1-yl]-3,7,12,16-tetramethyloctadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaen-1-yl}-2,5,5-trimethylcyclohex-3-en-1-ol ; × 2 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAC_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 c； PDB构建体 1–81； UniProt 1–81

Photosystem I reaction center subunit II

Synechocystis sp. PCC 6803

UniProt P19569

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	Photosystem II protein D1 2 × 1 （P16033） Photosystem II D2 protein × 1 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （P09191） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q54697） Photosystem II assembly lipoprotein Ycf48 × 1 （P73069） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P29254） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P29255） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P32422） Photosystem I reaction center subunit IV × 1 （P12975） Photosystem I reaction center subunit III × 1 （P29256） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （Q55330） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （Q55329） Photosystem I reaction center subunit PsaK 1 × 1 （P72712） Photosystem I reaction center subunit XI × 1 （P37277） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （P72986） FE (II) ION × 1 CHLOROPHYLL A × 101 PHEOPHYTIN A × 2 BETA-CAROTENE × 19 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 5 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 4 beta,beta-carotene-4,4'-dione × 1 beta,beta-caroten-4-one × 2 (3'R)-3'-hydroxy-beta,beta-caroten-4-one × 1 ;(1R,2S)-4-{(1E,3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(4S)-4-hydroxy-2,6,6-trimethylcyclohex-1-en-1-yl]-3,7,12,16-tetramethyloctadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaen-1-yl}-2,5,5-trimethylcyclohex-3-en-1-ol ; × 2 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSAD_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 d； PDB构建体 1–141； UniProt 1–141

Photosystem I reaction center subunit IV

Synechocystis sp. PCC 6803

UniProt P12975

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	Photosystem II protein D1 2 × 1 （P16033） Photosystem II D2 protein × 1 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （P09191） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q54697） Photosystem II assembly lipoprotein Ycf48 × 1 （P73069） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P29254） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P29255） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P32422） Photosystem I reaction center subunit II × 1 （P19569） Photosystem I reaction center subunit III × 1 （P29256） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （Q55330） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （Q55329） Photosystem I reaction center subunit PsaK 1 × 1 （P72712） Photosystem I reaction center subunit XI × 1 （P37277） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （P72986） FE (II) ION × 1 CHLOROPHYLL A × 101 PHEOPHYTIN A × 2 BETA-CAROTENE × 19 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 5 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 4 beta,beta-carotene-4,4'-dione × 1 beta,beta-caroten-4-one × 2 (3'R)-3'-hydroxy-beta,beta-caroten-4-one × 1 ;(1R,2S)-4-{(1E,3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(4S)-4-hydroxy-2,6,6-trimethylcyclohex-1-en-1-yl]-3,7,12,16-tetramethyloctadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaen-1-yl}-2,5,5-trimethylcyclohex-3-en-1-ol ; × 2 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAE_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 e； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74

Photosystem I reaction center subunit III

Synechocystis sp. PCC 6803

UniProt P29256

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	Photosystem II protein D1 2 × 1 （P16033） Photosystem II D2 protein × 1 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （P09191） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q54697） Photosystem II assembly lipoprotein Ycf48 × 1 （P73069） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P29254） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P29255） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P32422） Photosystem I reaction center subunit II × 1 （P19569） Photosystem I reaction center subunit IV × 1 （P12975） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （Q55330） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （Q55329） Photosystem I reaction center subunit PsaK 1 × 1 （P72712） Photosystem I reaction center subunit XI × 1 （P37277） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （P72986） FE (II) ION × 1 CHLOROPHYLL A × 101 PHEOPHYTIN A × 2 BETA-CAROTENE × 19 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 5 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 4 beta,beta-carotene-4,4'-dione × 1 beta,beta-caroten-4-one × 2 (3'R)-3'-hydroxy-beta,beta-caroten-4-one × 1 ;(1R,2S)-4-{(1E,3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(4S)-4-hydroxy-2,6,6-trimethylcyclohex-1-en-1-yl]-3,7,12,16-tetramethyloctadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaen-1-yl}-2,5,5-trimethylcyclohex-3-en-1-ol ; × 2 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAF_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 f； PDB构建体 1–165； UniProt 1–165

Photosystem I reaction center subunit VIII

Synechocystis sp. PCC 6803

UniProt Q55330

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	Photosystem II protein D1 2 × 1 （P16033） Photosystem II D2 protein × 1 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （P09191） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q54697） Photosystem II assembly lipoprotein Ycf48 × 1 （P73069） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P29254） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P29255） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P32422） Photosystem I reaction center subunit II × 1 （P19569） Photosystem I reaction center subunit IV × 1 （P12975） Photosystem I reaction center subunit III × 1 （P29256） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （Q55329） Photosystem I reaction center subunit PsaK 1 × 1 （P72712） Photosystem I reaction center subunit XI × 1 （P37277） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （P72986） FE (II) ION × 1 CHLOROPHYLL A × 101 PHEOPHYTIN A × 2 BETA-CAROTENE × 19 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 5 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 4 beta,beta-carotene-4,4'-dione × 1 beta,beta-caroten-4-one × 2 (3'R)-3'-hydroxy-beta,beta-caroten-4-one × 1 ;(1R,2S)-4-{(1E,3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(4S)-4-hydroxy-2,6,6-trimethylcyclohex-1-en-1-yl]-3,7,12,16-tetramethyloctadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaen-1-yl}-2,5,5-trimethylcyclohex-3-en-1-ol ; × 2 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAI_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 i； PDB构建体 1–40； UniProt 1–40

Photosystem I reaction center subunit IX

Synechocystis sp. PCC 6803

UniProt Q55329

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	Photosystem II protein D1 2 × 1 （P16033） Photosystem II D2 protein × 1 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （P09191） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q54697） Photosystem II assembly lipoprotein Ycf48 × 1 （P73069） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P29254） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P29255） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P32422） Photosystem I reaction center subunit II × 1 （P19569） Photosystem I reaction center subunit IV × 1 （P12975） Photosystem I reaction center subunit III × 1 （P29256） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （Q55330） Photosystem I reaction center subunit PsaK 1 × 1 （P72712） Photosystem I reaction center subunit XI × 1 （P37277） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （P72986） FE (II) ION × 1 CHLOROPHYLL A × 101 PHEOPHYTIN A × 2 BETA-CAROTENE × 19 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 5 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 4 beta,beta-carotene-4,4'-dione × 1 beta,beta-caroten-4-one × 2 (3'R)-3'-hydroxy-beta,beta-caroten-4-one × 1 ;(1R,2S)-4-{(1E,3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(4S)-4-hydroxy-2,6,6-trimethylcyclohex-1-en-1-yl]-3,7,12,16-tetramethyloctadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaen-1-yl}-2,5,5-trimethylcyclohex-3-en-1-ol ; × 2 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAJ_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 j； PDB构建体 1–40； UniProt 1–40

Photosystem I reaction center subunit PsaK 1

Synechocystis sp. PCC 6803

UniProt P72712

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	Photosystem II protein D1 2 × 1 （P16033） Photosystem II D2 protein × 1 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （P09191） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q54697） Photosystem II assembly lipoprotein Ycf48 × 1 （P73069） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P29254） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P29255） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P32422） Photosystem I reaction center subunit II × 1 （P19569） Photosystem I reaction center subunit IV × 1 （P12975） Photosystem I reaction center subunit III × 1 （P29256） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （Q55330） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （Q55329） Photosystem I reaction center subunit XI × 1 （P37277） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （P72986） FE (II) ION × 1 CHLOROPHYLL A × 101 PHEOPHYTIN A × 2 BETA-CAROTENE × 19 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 5 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 4 beta,beta-carotene-4,4'-dione × 1 beta,beta-caroten-4-one × 2 (3'R)-3'-hydroxy-beta,beta-caroten-4-one × 1 ;(1R,2S)-4-{(1E,3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(4S)-4-hydroxy-2,6,6-trimethylcyclohex-1-en-1-yl]-3,7,12,16-tetramethyloctadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaen-1-yl}-2,5,5-trimethylcyclohex-3-en-1-ol ; × 2 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAK1_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	15
链与序列区间	作者链 k； PDB构建体 1–86； UniProt 1–86

Photosystem I reaction center subunit XI

Synechocystis sp. PCC 6803

UniProt P37277

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	Photosystem II protein D1 2 × 1 （P16033） Photosystem II D2 protein × 1 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （P09191） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q54697） Photosystem II assembly lipoprotein Ycf48 × 1 （P73069） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P29254） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P29255） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P32422） Photosystem I reaction center subunit II × 1 （P19569） Photosystem I reaction center subunit IV × 1 （P12975） Photosystem I reaction center subunit III × 1 （P29256） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （Q55330） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （Q55329） Photosystem I reaction center subunit PsaK 1 × 1 （P72712） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （P72986） FE (II) ION × 1 CHLOROPHYLL A × 101 PHEOPHYTIN A × 2 BETA-CAROTENE × 19 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 5 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 4 beta,beta-carotene-4,4'-dione × 1 beta,beta-caroten-4-one × 2 (3'R)-3'-hydroxy-beta,beta-caroten-4-one × 1 ;(1R,2S)-4-{(1E,3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(4S)-4-hydroxy-2,6,6-trimethylcyclohex-1-en-1-yl]-3,7,12,16-tetramethyloctadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaen-1-yl}-2,5,5-trimethylcyclohex-3-en-1-ol ; × 2 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAL_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	16
链与序列区间	作者链 l； PDB构建体 1–157； UniProt 1–157

Photosystem I reaction center subunit XII

Synechocystis sp. PCC 6803

UniProt P72986

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	Photosystem II protein D1 2 × 1 （P16033） Photosystem II D2 protein × 1 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （P09191） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q54697） Photosystem II assembly lipoprotein Ycf48 × 1 （P73069） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P29254） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P29255） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P32422） Photosystem I reaction center subunit II × 1 （P19569） Photosystem I reaction center subunit IV × 1 （P12975） Photosystem I reaction center subunit III × 1 （P29256） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （Q55330） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （Q55329） Photosystem I reaction center subunit PsaK 1 × 1 （P72712） Photosystem I reaction center subunit XI × 1 （P37277） FE (II) ION × 1 CHLOROPHYLL A × 101 PHEOPHYTIN A × 2 BETA-CAROTENE × 19 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 5 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 4 beta,beta-carotene-4,4'-dione × 1 beta,beta-caroten-4-one × 2 (3'R)-3'-hydroxy-beta,beta-caroten-4-one × 1 ;(1R,2S)-4-{(1E,3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(4S)-4-hydroxy-2,6,6-trimethylcyclohex-1-en-1-yl]-3,7,12,16-tetramethyloctadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaen-1-yl}-2,5,5-trimethylcyclohex-3-en-1-ol ; × 2 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSAM_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	17
链与序列区间	作者链 m； PDB构建体 1–31； UniProt 1–31

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8am5
沉积日期 deposition_date	2022-08-02
结构标题 title	RCII/PSI complex, class 3
关键词 keywords	photosystem, assembly factor, membrane protein, PHOTOSYNTHESIS; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8am5__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8am5__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8am5__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	51.84 Å
Rg（电子密度）	51.00 Å
总 Rg	51.27 Å
原子数	32746
残基数	3194
排除体积	610020 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8am5__assembly_1__model_1`	heptadecameric （17）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (32)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Photosystem II protein D1 2
分子量 formula_weight	38280.5 kDa
EC 编号 ec_number	1.10.3.9
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	32746

MTTTLQQRESASLWEQFCQWVTSTNNRIYVGWFGTLMIPTLLTATTCFIIAFIAAPPVDIDGIREPVAGSLLYGNNIISGAVVPSSNAIGLHFYPIWEAASLDEWLYNGGPYQLVVFHFLIGIFCYMGRQWELSYRLGMRPWICVAYSAPVSAATAVFLIYPIGQGSFSDGMPLGISGTFNFMIVFQAEHNILMHPFHMLGVAGVFGGSLFSAMHGSLVTSSLVRETTEVESQNYGYKFGQEEETYNIVAAHGYFGRLIFQYASFNNSRSLHFFLGAWPVIGIWFTAMGVSTMAFNLNGFNFNQSILDSQGRVIGTWADVLNRANIGFEVMHERNAHNFPLDLA

来源 Source

来源生物 organism	Synechocystis sp. PCC 6803
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1148
宿主生物 host_organism	Synechocystis sp. PCC 6803

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Photosystem II D2 protein
分子量 formula_weight	37816.4 kDa
EC 编号 ec_number	1.10.3.9
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MHHHHHHTIAVGRAPVERGWFDVLDDWLKRDRFVFIGWSGLLLFPCAFMALGGWLTGTTFVTSWYTHGLASSYLEGANFLTVAVSSPADAFGHSLLFLWGPEAQGNLTRWFQIGGLWPFVALHGAFGLIGFMLRQFEISRLVGIRPYNAIAFSGPIAVFVSVFLMYPLGQSSWFFAPSFGVAGIFRFILFLQGFHNWTLNPFHMMGVAGILGGALLCAIHGATVENTLFEDGEDSNTFRAFEPTQAEETYSMVTANRFWSQIFGIAFSNKRWLHFFMLFVPVTGLWMSSVGIVGLALNLRAYDFVSQELRAAEDPEFETFYTKNILLNEGMRAWMA

来源 Source

来源生物 organism	Synechocystis sp. PCC 6803
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1148
宿主生物 host_organism	Synechocystis sp. PCC 6803

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Cytochrome b559 subunit alpha
分子量 formula_weight	9454.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MSGTTGERPFSDIVTSIRYWVIHSITIPMLFIAGWLFVSTGLAYDAFGTPRPDEYFTQTRQELPILQERYDINQEIQEFNQ

来源 Source

来源生物 organism	Synechocystis sp. PCC 6803
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1148
宿主生物 host_organism	Synechocystis sp. PCC 6803

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Cytochrome b559 subunit beta
分子量 formula_weight	4935.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MATQNPNQPVTYPIFTVRWLAVHTLAVPSVFFVGAIAAMQFIQR

来源 Source

来源生物 organism	Synechocystis sp. PCC 6803
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1148
宿主生物 host_organism	Synechocystis sp. PCC 6803

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein I
分子量 formula_weight	4310.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MLTLKIAVYIVVGLFISLFIFGFLSSDPTRNPGRKDFE

来源 Source

来源生物 organism	Synechocystis sp. PCC 6803
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1148
宿主生物 host_organism	Synechocystis sp. PCC 6803

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Photosystem II assembly lipoprotein Ycf48
分子量 formula_weight	37321.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S

MPVKFPSLKFEQLKQLVLVAAIAVFCVSCSHVPDLAFNPWQEIALETDSTFADIAFTEDPNHGWLVGTKETIFETTDGGDTWEQKLIDLGEEKASFSAVSFSGNEGWITGKPSILLHTTDGGQTWARIPLSEKLPGAPYSIIALGPQTAEMITDLGAIYKTTNGGKNWKALVEGAVGVARTIQRSTDGRYVAVSARGNFYSTWAPGQTEWTPHNRNSSRRLQTMGYGKDGQLWLLARGGQLQFSTDPDAEEWSDVIAPQDKGSWGLLDLSFRTPEEVWVAGASGNLLMSQDGGQTWAKDTGVEDIPANLYRVVFLSPEKGFVLGQDGILLKYNPSTEVAMVP

来源 Source

来源生物 organism	Synechocystis sp. PCC 6803
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1148
宿主生物 host_organism	Synechocystis sp. PCC 6803

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1
分子量 formula_weight	83036.4 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a

MTISPPEREAKAKVSVDNNPVPTSFEKWGKPGHFDRTLARGPKTTTWIWNLHANAHDFDSQTSDLEDVSRKIFSAHFGHLAVVFVWLSGMYFHGAKFSNYEGWLADPTHIKPSAQVVWPIVGQGILNGDVGGGFHGIQITSGLFYLWRASGFTDSYQLYCTAIGGLVMAALMLFAGWFHYHVKAPKLEWFQNVESMMNHHLAGLLGLGSLGWAGHQIHVSMPINKLLDAGVAPKDIPLPHEFILEPSKMAELYPSFAQGLTPFFTLNWGVYSDFLTFKGGLNPVTGGLWLSDTAHHHLAIAVLFIIAGHMYRTNWGIGHSMKEILEAHKGPFTGEGHKGLYEILTTSWHAQLAINLALLGSLTIIVAQHMYAMPPYPYQAIDYATQLSLFTHHMWIGGFLIVGAGAHGAIFMVRDYDPAKNVNNLLDRMLRHRDAIISHLNWVCIFLGFHSFGLYIHNDTMRALGRPQDMFSDTAIQLQPIFAQWVQHLHTLAPGATAPNALATASYAFGGETIAVAGKVAMMPITLGTADFMVHHIHAFTIHVTALILLKGVLYARSSRLVPDKANLGFRFPCDGPGRGGTCQVSGWDHVFLGLFWMYNSLSIVIFHFSWKMQSDVWGTVSPDGSVTHVTLGNFAQSAITINGWLRDFLWAQAANVINSYGSALSAYGIMFLAGHFVFAFSLMFLFSGRGYWQELIESIVWAHNKLNVAPAIQPRALSIIQGRAVGVAHYLLGGIVTTWAFFLARSLSIG

来源 Source

来源生物 organism	Synechocystis sp. PCC 6803
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1148
宿主生物 host_organism	Synechocystis sp. PCC 6803

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2
分子量 formula_weight	81369.5 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b

MATKFPKFSQDLAQDPTTRRIWYGIATAHDFETHDGMTEENLYQKIFASHFGHIAIIFLWTSGTLFHVAWQGNFEQWIKDPLNIRPIAHAIWDPHFGEGAVNAFTQAGASNPVNIAYSGVYHWFYTIGMTTNQELYSGAVFLLVLASLFLFAGWLHLQPKFRPSLAWFKNAESRLNHHLAGLFGVSSLAWAGHLVHVAIPEARGQHVGWDNFLSTPPHPAGLMPFFTGNWGVYAADPDTAGHIFGTSEGAGTAILTFLGGFHPQTESLWLTDIAHHHLAIAVIFIIAGHMYRTNWGIGHSIKEILNAHKGPLTGAGHTNLYDTINNSLHFQLGLALASLGVITSLVAQHMYSLPSYAFIAQDHTTQAALYTHHQYIAGFLMVGAFAHGAIFFVRDYDPVANKDNVLARMLEHKEALISHLSWVSLFLGFHTLGLYVHNDVVVAFGTPEKQILIEPVFAQWIQATSGKALYGFDVLLSNPDSIASTTGAAWLPGWLDAINSGTNSLFLTIGPGDFLVHHAIALGLHTTALILIKGALDARGSKLMPDKKDFGYSFPCDGPGRGGTCDISAWDAFYLAMFWMLNTLGWLTFYWHWKHLGVWSGNVAQFNENSTYLMGWFRDYLWANSAQLINGYNPYGVNNLSVWAWMFLFGHLVWATGFMFLISWRGYWQELIETIVWAHERTPLANLVRWKDKPVALSIVQARLVGLAHFTVGYVLTYAAFLIASTAGKFG

来源 Source

来源生物 organism	Synechocystis sp. PCC 6803
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1148
宿主生物 host_organism	Synechocystis sp. PCC 6803

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Photosystem I iron-sulfur center
分子量 formula_weight	8837.3 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	c

MSHSVKIYDTCIGCTQCVRACPLDVLEMVPWDGCKAAQIASSPRTEDCVGCKRCETACPTDFLSIRVYLGAETTRSMGLAY

来源 Source

来源生物 organism	Synechocystis sp. PCC 6803
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1148
宿主生物 host_organism	Synechocystis sp. PCC 6803

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit II
分子量 formula_weight	15663.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	d

MTELSGQPPKFGGSTGGLLSKANREEKYAITWTSASEQVFEMPTGGAAIMNEGENLLYLARKEQCLALGTQLRTKFKPKIQDYKIYRVYPSGEVQYLHPADGVFPEKVNEGREAQGTKTRRIGQNPEPVTIKFSGKAPYEV

来源 Source

来源生物 organism	Synechocystis sp. PCC 6803
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1148
宿主生物 host_organism	Synechocystis sp. PCC 6803

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit IV
分子量 formula_weight	8154.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	e

MALNRGDKVRIKRTESYWYGDVGTVASVEKSGILYPVIVRFDRVNYNGFSGSASGVNTNNFAENELELVQAAAK

来源 Source

来源生物 organism	Synechocystis sp. PCC 6803
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1148
宿主生物 host_organism	Synechocystis sp. PCC 6803

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit III
分子量 formula_weight	18267.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	f

MKHLLALLLAFTLWFNFAPSASADDFANLTPCSENPAYLAKSKNFLNTTNDPNSGKIRAERYASALCGPEGYPHLIVDGRFTHAGDFLIPSILFLYIAGWIGWVGRSYLIEIRESKNPEMQEVVINVPLAIKKMLGGFLWPLAAVGEYTSGKLVMKDSEIPTSPR

来源 Source

来源生物 organism	Synechocystis sp. PCC 6803
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1148
宿主生物 host_organism	Synechocystis sp. PCC 6803

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit VIII
分子量 formula_weight	4414.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	i

MDGSYAASYLPWILIPMVGWLFPAVTMGLLFIHIESEGEG

来源 Source

来源生物 organism	Synechocystis sp. PCC 6803
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1148
宿主生物 host_organism	Synechocystis sp. PCC 6803

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit IX
分子量 formula_weight	4535.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	j

MDGLKSFLSTAPVMIMALLTFTAGILIEFNRFYPDLLFHP

来源 Source

来源生物 organism	Synechocystis sp. PCC 6803
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1148
宿主生物 host_organism	Synechocystis sp. PCC 6803

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit PsaK 1
分子量 formula_weight	8649.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	k

MHSFLLATAVPATLSWSPKVAGVMIACNILAIAFGKLTIKQQNVGTPMPSSNFFGGFGLGAVLGTASFGHILGAGVILGLANMGVL

来源 Source

来源生物 organism	Synechocystis sp. PCC 6803
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1148
宿主生物 host_organism	Synechocystis sp. PCC 6803

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit XI
分子量 formula_weight	16631.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	l

MAESNQVVQAYNGDPFVGHLSTPISDSAFTRTFIGNLPAYRKGLSPILRGLEVGMAHGYFLIGPWTLLGPLRDSEYQYIGGLIGALALILVATAALSSYGLVTFQGEQGSGDTLQTADGWSQFAAGFFVGGMGGAFVAYFLLENLSVVDGIFRGLFN

来源 Source

来源生物 organism	Synechocystis sp. PCC 6803
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1148
宿主生物 host_organism	Synechocystis sp. PCC 6803

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit XII
分子量 formula_weight	3382.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	m

MALSDTQILAALVVALLPAFLAFRLSTELYK

来源 Source

来源生物 organism	Synechocystis sp. PCC 6803
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1148
宿主生物 host_organism	Synechocystis sp. PCC 6803

实体 18 Entity 18 non-polymer

描述 description	FE (II) ION
分子量 formula_weight	55.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 19 Entity 19 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	101

实体 20 Entity 20 non-polymer

描述 description	PHEOPHYTIN A
分子量 formula_weight	871.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 21 Entity 21 non-polymer

描述 description	BETA-CAROTENE
分子量 formula_weight	536.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	19

实体 22 Entity 22 non-polymer

描述 description	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
分子量 formula_weight	616.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 23 Entity 23 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A ISOMER
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 24 Entity 24 non-polymer

描述 description	PHYLLOQUINONE
分子量 formula_weight	450.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 25 Entity 25 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 26 Entity 26 non-polymer

描述 description	1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE
分子量 formula_weight	723.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 27 Entity 27 non-polymer

描述 description	1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE
分子量 formula_weight	787.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 28 Entity 28 non-polymer

描述 description	beta,beta-carotene-4,4'-dione
分子量 formula_weight	564.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 29 Entity 29 non-polymer

描述 description	beta,beta-caroten-4-one
分子量 formula_weight	550.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 30 Entity 30 non-polymer

描述 description	(3'R)-3'-hydroxy-beta,beta-caroten-4-one
分子量 formula_weight	566.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 31 Entity 31 non-polymer

描述 description	;(1R,2S)-4-{(1E,3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(4S)-4-hydroxy-2,6,6-trimethylcyclohex-1-en-1-yl]-3,7,12,16-tetramethyloctadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaen-1-yl}-2,5,5-trimethylcyclohex-3-en-1-ol ;
分子量 formula_weight	568.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 32 Entity 32 non-polymer

描述 description	DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE
分子量 formula_weight	510.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	8am5l01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1240 — Photosystem 1 Reaction Centre Subunit Xi; Chain: L;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem I PsaL, reaction centre subunit XI

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.10 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	178513

RCII/PSI complex, class 3

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem II protein D1 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II D2 protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome b559 subunit alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome b559 subunit beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II reaction center protein I

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II assembly lipoprotein Ycf48

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I iron-sulfur center

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit II

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体