8g4l

Cryo-EM structure of the human cardiac myosin filament

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 481.2 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Myosin-7

物种未注明

UniProt P12883

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 123 PDB 声明:123-meric(123) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–1935 链 AA; UniProt 1–1935 链 AB; UniProt 1–1935 链 AG; UniProt 1–1935 链 AH; UniProt 1–1935 链 AI; UniProt 1–1935 链 AJ; UniProt 1–1935 链 AK; UniProt 1–1935 链 AL; UniProt 1–1935 链 AM; UniProt 1–1935 链 AN; UniProt 1–1935 链 AO; UniProt 1–1935 链 AP; UniProt 1–1935 链 AQ; UniProt 1–1935 链 AR; UniProt 1–1935 链 AS; UniProt 1–1935 链 AT; UniProt 1–1935 链 AU; UniProt 1–1935 链 AV; UniProt 1–1935 链 AW; UniProt 1–1935 链 AX; UniProt 1–1935 链 AY; UniProt 1–1935 链 AZ; UniProt 1–1935 链 B; UniProt 1–1935 链 BA; UniProt 1–1935 链 BB; UniProt 1–1935 链 BG; UniProt 1–1935 链 BH; UniProt 1–1935 链 BI; UniProt 1–1935 链 BJ; UniProt 1–1935 链 BK; UniProt 1–1935 链 BL; UniProt 1–1935 链 BM; UniProt 1–1935 链 BN; UniProt 1–1935 链 BO; UniProt 1–1935 链 BP; UniProt 1–1935 链 BQ; UniProt 1–1935 链 BR; UniProt 1–1935 链 BS; UniProt 1–1935 链 BT; UniProt 1–1935 链 BU; UniProt 1–1935 链 BV; UniProt 1–1935 链 BW; UniProt 1–1935 链 BX; UniProt 1–1935 链 BY; UniProt 1–1935 链 BZ; UniProt 1–1935 链 G; UniProt 1–1935 链 H; UniProt 1–1935 链 I; UniProt 1–1935 链 J; UniProt 1–1935 链 K; UniProt 1–1935 链 L; UniProt 1–1935 链 M; UniProt 1–1935 链 N; UniProt 1–1935 链 O; UniProt 1–1935 链 P; UniProt 1–1935 链 Q; UniProt 1–1935 链 R; UniProt 1–1935 链 S; UniProt 1–1935 链 T; UniProt 1–1935 链 U; UniProt 1–1935 链 V; UniProt 1–1935 链 W; UniProt 1–1935 链 X; UniProt 1–1935 链 Y; UniProt 1–1935 链 Z; UniProt 1–1935 链 ae; UniProt 1–1935 链 af; UniProt 1–1935 链 ak; UniProt 1–1935 链 al; UniProt 1–1935 链 be; UniProt 1–1935 链 bf; UniProt 1–1935 链 bk; UniProt 1–1935 链 bl; UniProt 1–1935 链 e; UniProt 1–1935 链 f; UniProt 1–1935 链 k; UniProt 1–1935 链 l; UniProt 1–1935 未记录 Myosin light chain 3 × 18 (P08590) Myosin regulatory light chain 2, ventricular/cardiac muscle isoform × 18 (P10916) Titin × 6 (Q8WZ42) Myosin-binding protein C, cardiac-type × 3 (Q14896) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 6.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 40 个其他 PDB 条目、55 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MYH7_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 AA; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 AB; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 AG; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 AH; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 AI; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 AJ; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 AK; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 AL; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 AM; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 AN; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 AO; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 AP; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 AQ; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 AR; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 AS; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 AT; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 AU; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 AV; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 AW; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 AX; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 AY; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 AZ; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 B; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 BA; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 BB; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 BG; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 BH; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 BI; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 BJ; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 BK; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 BL; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 BM; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 BN; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 BO; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 BP; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 BQ; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 BR; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 BS; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 BT; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 BU; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 BV; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 BW; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 BX; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 BY; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 BZ; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 G; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 H; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 I; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 J; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 K; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 L; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 M; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 N; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 O; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 P; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 Q; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 R; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 S; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 T; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 U; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 V; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 W; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 X; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 Y; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 Z; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 ae; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 af; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 ak; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 al; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 be; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 bf; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 bk; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 bl; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 e; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 f; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 k; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935 作者链 l; PDB构建体 1–1935; UniProt 1–1935

Myosin light chain 3

物种未注明

UniProt P08590

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 123 PDB 声明:123-meric(123) 与蛋白拷贝数一致 链 AE; UniProt 1–195 链 AF; UniProt 1–195 链 BE; UniProt 1–195 链 BF; UniProt 1–195 链 E; UniProt 1–195 链 F; UniProt 1–195 链 a; UniProt 1–195 链 aa; UniProt 1–195 链 ab; UniProt 1–195 链 ag; UniProt 1–195 链 ah; UniProt 1–195 链 b; UniProt 1–195 链 ba; UniProt 1–195 链 bb; UniProt 1–195 链 bg; UniProt 1–195 链 bh; UniProt 1–195 链 g; UniProt 1–195 链 h; UniProt 1–195 未记录 Myosin-7 × 78 (P12883) Myosin regulatory light chain 2, ventricular/cardiac muscle isoform × 18 (P10916) Titin × 6 (Q8WZ42) Myosin-binding protein C, cardiac-type × 3 (Q14896) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 6.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MYL3_HUMAN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 AE; PDB构建体 1–195; UniProt 1–195 作者链 AF; PDB构建体 1–195; UniProt 1–195 作者链 BE; PDB构建体 1–195; UniProt 1–195 作者链 BF; PDB构建体 1–195; UniProt 1–195 作者链 E; PDB构建体 1–195; UniProt 1–195 作者链 F; PDB构建体 1–195; UniProt 1–195 作者链 a; PDB构建体 1–195; UniProt 1–195 作者链 aa; PDB构建体 1–195; UniProt 1–195 作者链 ab; PDB构建体 1–195; UniProt 1–195 作者链 ag; PDB构建体 1–195; UniProt 1–195 作者链 ah; PDB构建体 1–195; UniProt 1–195 作者链 b; PDB构建体 1–195; UniProt 1–195 作者链 ba; PDB构建体 1–195; UniProt 1–195 作者链 bb; PDB构建体 1–195; UniProt 1–195 作者链 bg; PDB构建体 1–195; UniProt 1–195 作者链 bh; PDB构建体 1–195; UniProt 1–195 作者链 g; PDB构建体 1–195; UniProt 1–195 作者链 h; PDB构建体 1–195; UniProt 1–195

Myosin regulatory light chain 2, ventricular/cardiac muscle isoform

物种未注明

UniProt P10916

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 123 PDB 声明:123-meric(123) 与蛋白拷贝数一致 链 ac; UniProt 1–166 链 ad; UniProt 1–166 链 ai; UniProt 1–166 链 aj; UniProt 1–166 链 aq; UniProt 1–166 链 ar; UniProt 1–166 链 bc; UniProt 1–166 链 bd; UniProt 1–166 链 bi; UniProt 1–166 链 bj; UniProt 1–166 链 bq; UniProt 1–166 链 br; UniProt 1–166 链 c; UniProt 1–166 链 d; UniProt 1–166 链 i; UniProt 1–166 链 j; UniProt 1–166 链 q; UniProt 1–166 链 r; UniProt 1–166 未记录 Myosin-7 × 78 (P12883) Myosin light chain 3 × 18 (P08590) Titin × 6 (Q8WZ42) Myosin-binding protein C, cardiac-type × 3 (Q14896) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 6.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MLRV_HUMAN
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 ac; PDB构建体 1–166; UniProt 1–166 作者链 ad; PDB构建体 1–166; UniProt 1–166 作者链 ai; PDB构建体 1–166; UniProt 1–166 作者链 aj; PDB构建体 1–166; UniProt 1–166 作者链 aq; PDB构建体 1–166; UniProt 1–166 作者链 ar; PDB构建体 1–166; UniProt 1–166 作者链 bc; PDB构建体 1–166; UniProt 1–166 作者链 bd; PDB构建体 1–166; UniProt 1–166 作者链 bi; PDB构建体 1–166; UniProt 1–166 作者链 bj; PDB构建体 1–166; UniProt 1–166 作者链 bq; PDB构建体 1–166; UniProt 1–166 作者链 br; PDB构建体 1–166; UniProt 1–166 作者链 c; PDB构建体 1–166; UniProt 1–166 作者链 d; PDB构建体 1–166; UniProt 1–166 作者链 i; PDB构建体 1–166; UniProt 1–166 作者链 j; PDB构建体 1–166; UniProt 1–166 作者链 q; PDB构建体 1–166; UniProt 1–166 作者链 r; PDB构建体 1–166; UniProt 1–166

Titin

物种未注明

UniProt Q8WZ42

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 123 PDB 声明:123-meric(123) 与蛋白拷贝数一致 链 am; UniProt 22784–23867 链 an; UniProt 22784–23867 链 bm; UniProt 22784–23867 链 bn; UniProt 22784–23867 链 m; UniProt 22784–23867 链 n; UniProt 22784–23867 未记录 Myosin-7 × 78 (P12883) Myosin light chain 3 × 18 (P08590) Myosin regulatory light chain 2, ventricular/cardiac muscle isoform × 18 (P10916) Myosin-binding protein C, cardiac-type × 3 (Q14896) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 6.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 54 个其他 PDB 条目、123 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TITIN_HUMAN
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 am; PDB构建体 1–1084; UniProt 22784–23867 作者链 an; PDB构建体 1–1084; UniProt 22784–23867 作者链 bm; PDB构建体 1–1084; UniProt 22784–23867 作者链 bn; PDB构建体 1–1084; UniProt 22784–23867 作者链 m; PDB构建体 1–1084; UniProt 22784–23867 作者链 n; PDB构建体 1–1084; UniProt 22784–23867

Myosin-binding protein C, cardiac-type

物种未注明

UniProt Q14896

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 123 PDB 声明:123-meric(123) 与蛋白拷贝数一致 链 ao; UniProt 1–1274 链 bo; UniProt 1–1274 链 o; UniProt 1–1274 未记录 Myosin-7 × 78 (P12883) Myosin light chain 3 × 18 (P08590) Myosin regulatory light chain 2, ventricular/cardiac muscle isoform × 18 (P10916) Titin × 6 (Q8WZ42) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 6.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MYPC3_HUMAN
Isoform
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 ao; PDB构建体 1–1274; UniProt 1–1274 作者链 bo; PDB构建体 1–1274; UniProt 1–1274 作者链 o; PDB构建体 1–1274; UniProt 1–1274

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8g4l

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8g4l
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8g4l
沉积日期 deposition_date2023-02-10
结构标题 titleCryo-EM structure of the human cardiac myosin filament
关键词 keywordscardiac, myosin, filament, complex, CONTRACTILE PROTEIN; CONTRACTILE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier
回转半径 Rg (电子) rg_electron167.90
零角强度 I(0) i0489957000000.00
分子量 molecular_weight5895500.0 kDa
排除体积 excluded_volume7344000 ų
包络体积 envelope_volume16577000 ų
水化壳体积 shell_volume840770 ų
包络直径 envelope_diameter579.0
壳层 Rg shell_rg150.60
包络 Rg envelope_rg159.40
形状 Rg shape_rg167.90
总 Rg total_rg167.90
总原子数 total_atoms828952
残基数 n_residues51438
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax481.2
Rg (实空间) rg_real161.40
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.52
I(0) (实空间) i0_real4.6510e+11
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.1650e+10
Rg (倒空间) rg_reciprocal153.40
I(0) (倒空间) i0_reciprocal458100000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8987
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary213.9
偏度 Skewness skewness0.385
峰度 Kurtosis kurtosis-0.381
角度范围 angular_range— – 0.0450 −1
当前正则化参数 α current_alpha1.5260
最高正则化参数 α highest_alpha51220000000.0000
实空间数据点数 n_real_points10
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.078; Oscil: 0.974; Stabil: 0.942; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.996; Smooth: 0.000

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)