8g6f

Structure of the Plasmodium falciparum 20S proteasome beta-6 A117D mutant complexed with inhibitor WLW-vs

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 195.9 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Proteasome subunit alpha type-6

物种未注明

UniProt Q8IAR3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–260 链 O; UniProt 1–260 未记录 Proteasome subunit alpha type-2 × 2 (C6KST3) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (Q8IDG3) Proteasome subunit alpha type-4 × 2 (Q8IDG2) Proteasome subunit alpha type-5 × 2 (A0A0L7LVZ5) Proteasome subunit alpha type-1 × 2 (Q8IK90) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (O77396) Proteasome endopeptidase complex × 2 (A0A0L7M1M6) Proteasome subunit beta-2 × 2 (Q8I6T3) Proteasome subunit beta-3 × 2 (Q8I261) Proteasome subunit beta-4 × 2 (Q8IKC9) Proteasome subunit beta-5 × 2 (Q8IJT1) Proteasome subunit beta-6 × 2 (A0A2I0BU46) Proteasome subunit beta-7 × 2 (A0A0L7LW03) 7F1 (2S)-N-[(E,2S)-1-(1H-indol-3-yl)-4-methylsulfonyl-but-3-en-2-yl]-2-[[(2S)-3-(1H-indol-3-yl)-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]-4-methyl-pentanamide × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.58 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 13 个其他 PDB 条目、13 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 Q8IAR3_PLAF7
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–260; UniProt 1–260 作者链 O; PDB构建体 1–260; UniProt 1–260

Proteasome subunit alpha type-2

物种未注明

UniProt C6KST3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 1–235 链 P; UniProt 1–235 未记录 Proteasome subunit alpha type-6 × 2 (Q8IAR3) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (Q8IDG3) Proteasome subunit alpha type-4 × 2 (Q8IDG2) Proteasome subunit alpha type-5 × 2 (A0A0L7LVZ5) Proteasome subunit alpha type-1 × 2 (Q8IK90) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (O77396) Proteasome endopeptidase complex × 2 (A0A0L7M1M6) Proteasome subunit beta-2 × 2 (Q8I6T3) Proteasome subunit beta-3 × 2 (Q8I261) Proteasome subunit beta-4 × 2 (Q8IKC9) Proteasome subunit beta-5 × 2 (Q8IJT1) Proteasome subunit beta-6 × 2 (A0A2I0BU46) Proteasome subunit beta-7 × 2 (A0A0L7LW03) 7F1 (2S)-N-[(E,2S)-1-(1H-indol-3-yl)-4-methylsulfonyl-but-3-en-2-yl]-2-[[(2S)-3-(1H-indol-3-yl)-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]-4-methyl-pentanamide × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.58 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 C6KST3_PLAF7
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–235; UniProt 1–235 作者链 P; PDB构建体 1–235; UniProt 1–235

Proteasome subunit alpha type-3

物种未注明

UniProt Q8IDG3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白拷贝数一致 链 C; UniProt 1–246 链 Q; UniProt 1–246 未记录 Proteasome subunit alpha type-6 × 2 (Q8IAR3) Proteasome subunit alpha type-2 × 2 (C6KST3) Proteasome subunit alpha type-4 × 2 (Q8IDG2) Proteasome subunit alpha type-5 × 2 (A0A0L7LVZ5) Proteasome subunit alpha type-1 × 2 (Q8IK90) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (O77396) Proteasome endopeptidase complex × 2 (A0A0L7M1M6) Proteasome subunit beta-2 × 2 (Q8I6T3) Proteasome subunit beta-3 × 2 (Q8I261) Proteasome subunit beta-4 × 2 (Q8IKC9) Proteasome subunit beta-5 × 2 (Q8IJT1) Proteasome subunit beta-6 × 2 (A0A2I0BU46) Proteasome subunit beta-7 × 2 (A0A0L7LW03) 7F1 (2S)-N-[(E,2S)-1-(1H-indol-3-yl)-4-methylsulfonyl-but-3-en-2-yl]-2-[[(2S)-3-(1H-indol-3-yl)-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]-4-methyl-pentanamide × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.58 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 Q8IDG3_PLAF7
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–246; UniProt 1–246 作者链 Q; PDB构建体 1–246; UniProt 1–246

Proteasome subunit alpha type-4

物种未注明

UniProt Q8IDG2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白拷贝数一致 链 D; UniProt 1–241 链 R; UniProt 1–241 未记录 Proteasome subunit alpha type-6 × 2 (Q8IAR3) Proteasome subunit alpha type-2 × 2 (C6KST3) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (Q8IDG3) Proteasome subunit alpha type-5 × 2 (A0A0L7LVZ5) Proteasome subunit alpha type-1 × 2 (Q8IK90) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (O77396) Proteasome endopeptidase complex × 2 (A0A0L7M1M6) Proteasome subunit beta-2 × 2 (Q8I6T3) Proteasome subunit beta-3 × 2 (Q8I261) Proteasome subunit beta-4 × 2 (Q8IKC9) Proteasome subunit beta-5 × 2 (Q8IJT1) Proteasome subunit beta-6 × 2 (A0A2I0BU46) Proteasome subunit beta-7 × 2 (A0A0L7LW03) 7F1 (2S)-N-[(E,2S)-1-(1H-indol-3-yl)-4-methylsulfonyl-but-3-en-2-yl]-2-[[(2S)-3-(1H-indol-3-yl)-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]-4-methyl-pentanamide × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.58 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 Q8IDG2_PLAF7
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–241; UniProt 1–241 作者链 R; PDB构建体 1–241; UniProt 1–241

Proteasome subunit alpha type-5

物种未注明

UniProt A0A0L7LVZ5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白拷贝数一致 链 E; UniProt 1–256 链 S; UniProt 1–256 未记录 Proteasome subunit alpha type-6 × 2 (Q8IAR3) Proteasome subunit alpha type-2 × 2 (C6KST3) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (Q8IDG3) Proteasome subunit alpha type-4 × 2 (Q8IDG2) Proteasome subunit alpha type-1 × 2 (Q8IK90) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (O77396) Proteasome endopeptidase complex × 2 (A0A0L7M1M6) Proteasome subunit beta-2 × 2 (Q8I6T3) Proteasome subunit beta-3 × 2 (Q8I261) Proteasome subunit beta-4 × 2 (Q8IKC9) Proteasome subunit beta-5 × 2 (Q8IJT1) Proteasome subunit beta-6 × 2 (A0A2I0BU46) Proteasome subunit beta-7 × 2 (A0A0L7LW03) 7F1 (2S)-N-[(E,2S)-1-(1H-indol-3-yl)-4-methylsulfonyl-but-3-en-2-yl]-2-[[(2S)-3-(1H-indol-3-yl)-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]-4-methyl-pentanamide × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.58 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

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UniProt名称 A0A0L7LVZ5_PLAF4
Isoform
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–256; UniProt 1–256 作者链 S; PDB构建体 1–256; UniProt 1–256

Proteasome subunit alpha type-1

物种未注明

UniProt Q8IK90

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白拷贝数一致 链 F; UniProt 1–254 链 T; UniProt 1–254 未记录 Proteasome subunit alpha type-6 × 2 (Q8IAR3) Proteasome subunit alpha type-2 × 2 (C6KST3) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (Q8IDG3) Proteasome subunit alpha type-4 × 2 (Q8IDG2) Proteasome subunit alpha type-5 × 2 (A0A0L7LVZ5) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (O77396) Proteasome endopeptidase complex × 2 (A0A0L7M1M6) Proteasome subunit beta-2 × 2 (Q8I6T3) Proteasome subunit beta-3 × 2 (Q8I261) Proteasome subunit beta-4 × 2 (Q8IKC9) Proteasome subunit beta-5 × 2 (Q8IJT1) Proteasome subunit beta-6 × 2 (A0A2I0BU46) Proteasome subunit beta-7 × 2 (A0A0L7LW03) 7F1 (2S)-N-[(E,2S)-1-(1H-indol-3-yl)-4-methylsulfonyl-but-3-en-2-yl]-2-[[(2S)-3-(1H-indol-3-yl)-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]-4-methyl-pentanamide × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.58 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 Q8IK90_PLAF7
Isoform
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–254; UniProt 1–254 作者链 T; PDB构建体 1–254; UniProt 1–254

Proteasome subunit alpha type-3

物种未注明

UniProt O77396

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白拷贝数一致 链 G; UniProt 1–252 链 U; UniProt 1–252 未记录 Proteasome subunit alpha type-6 × 2 (Q8IAR3) Proteasome subunit alpha type-2 × 2 (C6KST3) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (Q8IDG3) Proteasome subunit alpha type-4 × 2 (Q8IDG2) Proteasome subunit alpha type-5 × 2 (A0A0L7LVZ5) Proteasome subunit alpha type-1 × 2 (Q8IK90) Proteasome endopeptidase complex × 2 (A0A0L7M1M6) Proteasome subunit beta-2 × 2 (Q8I6T3) Proteasome subunit beta-3 × 2 (Q8I261) Proteasome subunit beta-4 × 2 (Q8IKC9) Proteasome subunit beta-5 × 2 (Q8IJT1) Proteasome subunit beta-6 × 2 (A0A2I0BU46) Proteasome subunit beta-7 × 2 (A0A0L7LW03) 7F1 (2S)-N-[(E,2S)-1-(1H-indol-3-yl)-4-methylsulfonyl-but-3-en-2-yl]-2-[[(2S)-3-(1H-indol-3-yl)-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]-4-methyl-pentanamide × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.58 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

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UniProt名称 O77396_PLAF7
Isoform
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–252; UniProt 1–252 作者链 U; PDB构建体 1–252; UniProt 1–252

Proteasome endopeptidase complex

物种未注明

UniProt A0A0L7M1M6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白拷贝数一致 链 H; UniProt 31–282 链 V; UniProt 31–282 未记录 Proteasome subunit alpha type-6 × 2 (Q8IAR3) Proteasome subunit alpha type-2 × 2 (C6KST3) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (Q8IDG3) Proteasome subunit alpha type-4 × 2 (Q8IDG2) Proteasome subunit alpha type-5 × 2 (A0A0L7LVZ5) Proteasome subunit alpha type-1 × 2 (Q8IK90) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (O77396) Proteasome subunit beta-2 × 2 (Q8I6T3) Proteasome subunit beta-3 × 2 (Q8I261) Proteasome subunit beta-4 × 2 (Q8IKC9) Proteasome subunit beta-5 × 2 (Q8IJT1) Proteasome subunit beta-6 × 2 (A0A2I0BU46) Proteasome subunit beta-7 × 2 (A0A0L7LW03) 7F1 (2S)-N-[(E,2S)-1-(1H-indol-3-yl)-4-methylsulfonyl-but-3-en-2-yl]-2-[[(2S)-3-(1H-indol-3-yl)-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]-4-methyl-pentanamide × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.58 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 A0A0L7M1M6_PLAF4
Isoform
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–252; UniProt 31–282 作者链 V; PDB构建体 1–252; UniProt 31–282

Proteasome subunit beta-2

物种未注明

UniProt Q8I6T3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白拷贝数一致 链 I; UniProt 42–270 链 W; UniProt 42–270 未记录 Proteasome subunit alpha type-6 × 2 (Q8IAR3) Proteasome subunit alpha type-2 × 2 (C6KST3) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (Q8IDG3) Proteasome subunit alpha type-4 × 2 (Q8IDG2) Proteasome subunit alpha type-5 × 2 (A0A0L7LVZ5) Proteasome subunit alpha type-1 × 2 (Q8IK90) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (O77396) Proteasome endopeptidase complex × 2 (A0A0L7M1M6) Proteasome subunit beta-3 × 2 (Q8I261) Proteasome subunit beta-4 × 2 (Q8IKC9) Proteasome subunit beta-5 × 2 (Q8IJT1) Proteasome subunit beta-6 × 2 (A0A2I0BU46) Proteasome subunit beta-7 × 2 (A0A0L7LW03) 7F1 (2S)-N-[(E,2S)-1-(1H-indol-3-yl)-4-methylsulfonyl-but-3-en-2-yl]-2-[[(2S)-3-(1H-indol-3-yl)-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]-4-methyl-pentanamide × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.58 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 12 个其他 PDB 条目、12 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q8I6T3_PLAF7
Isoform
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–229; UniProt 42–270 作者链 W; PDB构建体 1–229; UniProt 42–270

Proteasome subunit beta-3

物种未注明

UniProt Q8I261

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白拷贝数一致 链 J; UniProt 1–218 链 X; UniProt 1–218 未记录 Proteasome subunit alpha type-6 × 2 (Q8IAR3) Proteasome subunit alpha type-2 × 2 (C6KST3) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (Q8IDG3) Proteasome subunit alpha type-4 × 2 (Q8IDG2) Proteasome subunit alpha type-5 × 2 (A0A0L7LVZ5) Proteasome subunit alpha type-1 × 2 (Q8IK90) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (O77396) Proteasome endopeptidase complex × 2 (A0A0L7M1M6) Proteasome subunit beta-2 × 2 (Q8I6T3) Proteasome subunit beta-4 × 2 (Q8IKC9) Proteasome subunit beta-5 × 2 (Q8IJT1) Proteasome subunit beta-6 × 2 (A0A2I0BU46) Proteasome subunit beta-7 × 2 (A0A0L7LW03) 7F1 (2S)-N-[(E,2S)-1-(1H-indol-3-yl)-4-methylsulfonyl-but-3-en-2-yl]-2-[[(2S)-3-(1H-indol-3-yl)-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]-4-methyl-pentanamide × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.58 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 13 个其他 PDB 条目、13 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q8I261_PLAF7
Isoform
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–218; UniProt 1–218 作者链 X; PDB构建体 1–218; UniProt 1–218

Proteasome subunit beta-4

物种未注明

UniProt Q8IKC9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白拷贝数一致 链 K; UniProt 1–195 链 Y; UniProt 1–195 未记录 Proteasome subunit alpha type-6 × 2 (Q8IAR3) Proteasome subunit alpha type-2 × 2 (C6KST3) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (Q8IDG3) Proteasome subunit alpha type-4 × 2 (Q8IDG2) Proteasome subunit alpha type-5 × 2 (A0A0L7LVZ5) Proteasome subunit alpha type-1 × 2 (Q8IK90) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (O77396) Proteasome endopeptidase complex × 2 (A0A0L7M1M6) Proteasome subunit beta-2 × 2 (Q8I6T3) Proteasome subunit beta-3 × 2 (Q8I261) Proteasome subunit beta-5 × 2 (Q8IJT1) Proteasome subunit beta-6 × 2 (A0A2I0BU46) Proteasome subunit beta-7 × 2 (A0A0L7LW03) 7F1 (2S)-N-[(E,2S)-1-(1H-indol-3-yl)-4-methylsulfonyl-but-3-en-2-yl]-2-[[(2S)-3-(1H-indol-3-yl)-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]-4-methyl-pentanamide × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.58 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 13 个其他 PDB 条目、13 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q8IKC9_PLAF7
Isoform
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 1–195; UniProt 1–195 作者链 Y; PDB构建体 1–195; UniProt 1–195

Proteasome subunit beta-5

物种未注明

UniProt Q8IJT1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白拷贝数一致 链 L; UniProt 61–271 链 Z; UniProt 61–271 未记录 Proteasome subunit alpha type-6 × 2 (Q8IAR3) Proteasome subunit alpha type-2 × 2 (C6KST3) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (Q8IDG3) Proteasome subunit alpha type-4 × 2 (Q8IDG2) Proteasome subunit alpha type-5 × 2 (A0A0L7LVZ5) Proteasome subunit alpha type-1 × 2 (Q8IK90) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (O77396) Proteasome endopeptidase complex × 2 (A0A0L7M1M6) Proteasome subunit beta-2 × 2 (Q8I6T3) Proteasome subunit beta-3 × 2 (Q8I261) Proteasome subunit beta-4 × 2 (Q8IKC9) Proteasome subunit beta-6 × 2 (A0A2I0BU46) Proteasome subunit beta-7 × 2 (A0A0L7LW03) 7F1 (2S)-N-[(E,2S)-1-(1H-indol-3-yl)-4-methylsulfonyl-but-3-en-2-yl]-2-[[(2S)-3-(1H-indol-3-yl)-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]-4-methyl-pentanamide × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.58 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 11 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q8IJT1_PLAF7
Isoform
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 L; PDB构建体 1–211; UniProt 61–271 作者链 Z; PDB构建体 1–211; UniProt 61–271

Proteasome subunit beta-6

物种未注明

UniProt A0A2I0BU46

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白拷贝数一致 链 M; UniProt 1–240 链 a; UniProt 1–240 突变:A117D Proteasome subunit alpha type-6 × 2 (Q8IAR3) Proteasome subunit alpha type-2 × 2 (C6KST3) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (Q8IDG3) Proteasome subunit alpha type-4 × 2 (Q8IDG2) Proteasome subunit alpha type-5 × 2 (A0A0L7LVZ5) Proteasome subunit alpha type-1 × 2 (Q8IK90) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (O77396) Proteasome endopeptidase complex × 2 (A0A0L7M1M6) Proteasome subunit beta-2 × 2 (Q8I6T3) Proteasome subunit beta-3 × 2 (Q8I261) Proteasome subunit beta-4 × 2 (Q8IKC9) Proteasome subunit beta-5 × 2 (Q8IJT1) Proteasome subunit beta-7 × 2 (A0A0L7LW03) 7F1 (2S)-N-[(E,2S)-1-(1H-indol-3-yl)-4-methylsulfonyl-but-3-en-2-yl]-2-[[(2S)-3-(1H-indol-3-yl)-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]-4-methyl-pentanamide × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.58 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A2I0BU46_PLAFO
Isoform
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 M; PDB构建体 1–240; UniProt 1–240 作者链 a; PDB构建体 1–240; UniProt 1–240

Proteasome subunit beta-7

物种未注明

UniProt A0A0L7LW03

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白拷贝数一致 链 N; UniProt 1–265 链 b; UniProt 1–265 未记录 Proteasome subunit alpha type-6 × 2 (Q8IAR3) Proteasome subunit alpha type-2 × 2 (C6KST3) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (Q8IDG3) Proteasome subunit alpha type-4 × 2 (Q8IDG2) Proteasome subunit alpha type-5 × 2 (A0A0L7LVZ5) Proteasome subunit alpha type-1 × 2 (Q8IK90) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (O77396) Proteasome endopeptidase complex × 2 (A0A0L7M1M6) Proteasome subunit beta-2 × 2 (Q8I6T3) Proteasome subunit beta-3 × 2 (Q8I261) Proteasome subunit beta-4 × 2 (Q8IKC9) Proteasome subunit beta-5 × 2 (Q8IJT1) Proteasome subunit beta-6 × 2 (A0A2I0BU46) 7F1 (2S)-N-[(E,2S)-1-(1H-indol-3-yl)-4-methylsulfonyl-but-3-en-2-yl]-2-[[(2S)-3-(1H-indol-3-yl)-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]-4-methyl-pentanamide × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.58 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A0L7LW03_PLAF4
Isoform
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 N; PDB构建体 1–265; UniProt 1–265 作者链 b; PDB构建体 1–265; UniProt 1–265

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8g6f

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8g6f
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8g6f
沉积日期 deposition_date2023-02-15
结构标题 titleStructure of the Plasmodium falciparum 20S proteasome beta-6 A117D mutant complexed with inhibitor WLW-vs
关键词 keywordsbeta-6 A117D, inhibitor, proteasome, HYDROLASE, HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR complex; HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier60.46
回转半径 Rg (电子) rg_electron59.98
零角强度 I(0) i07322950000.00
分子量 molecular_weight735840.0 kDa
排除体积 excluded_volume925400 ų
包络体积 envelope_volume1296500 ų
水化壳体积 shell_volume172250 ų
包络直径 envelope_diameter195.8
壳层 Rg shell_rg68.58
包络 Rg envelope_rg58.13
形状 Rg shape_rg59.95
总 Rg total_rg60.25
总原子数 total_atoms51748
残基数 n_residues6465
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax195.9
Rg (实空间) rg_real60.15
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.63
I(0) (实空间) i0_real7.3230e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.4670e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal60.69
I(0) (倒空间) i0_reciprocal7329000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8578
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary75.3
偏度 Skewness skewness0.198
峰度 Kurtosis kurtosis-0.412
角度范围 angular_range— – 0.1300 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha1167000000.0000
实空间数据点数 n_real_points27
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.803; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.952; Smooth: 0.787

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (16)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)