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8oip

28S mammalian mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 278.0 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

39S ribosomal protein L19, mitochondrial

物种未注明

UniProt I3LNJ0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 BX； UniProt 1–303 未记录 bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4CE4 39S large subunit of the porcine mitochondrial ribosome 提交 2013-11-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric
链 T 1–292（292 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH PH 7.9, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 20 MM MGCL2；pH 7.9；20 MM HEPES-KOH PH 7.9, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 20 MM MGCL2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；MANUAL BLOTTING FOLLOWED BY MANUAL PLUNGING INTO LIQUID ETHANE
分辨率 4.90 Å
4V19 Structure of the large subunit of the mammalian mitoribosome, part 1 of 2 提交 2014-09-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：32-meric
链 T 1–292（292 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 169 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE
分辨率 3.40 Å
5AJ4 Structure of the 55S mammalian mitoribosome. 提交 2015-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 BT 1–292（292 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 351 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE
分辨率 3.80 Å
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric
链 BT 12–303（292 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GAZ Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 28S ribosomal subunit. 提交 2018-04-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric
链 BT 12–303（292 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric
链 BT 12–303（292 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric
链 BT 12–303（292 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 BT 12–303（292 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 BT 12–303（292 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7NSH 39S mammalian mitochondrial large ribosomal subunit with mtRRF (post) and mtEFG2 提交 2021-03-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：61-meric
链 BT 12–303（292 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 221 ZN ZINC ION × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 BT 12–303（292 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric
链 BT 12–303（292 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric
链 BX 1–303（303 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å
8OIQ 39S mammalian mitochondrial large ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：62-meric
链 BX 1–303（303 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 205 K POTASSIUM ION × 30 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å

共 14 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 I3LNJ0_PIG
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 BX； PDB构建体 1–303； UniProt 1–303

bL31m

物种未注明

UniProt I3L9J0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 Bd； UniProt 1–126 未记录 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric
链 B4 1–126（126 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GB2 Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 39S ribosomal subunit. 提交 2018-04-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：62-meric
链 B4 1–126（126 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 216 ZN ZINC ION × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 2 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric
链 B4 1–126（126 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric
链 B4 1–126（126 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 B4 1–126（126 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 B4 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7NSH 39S mammalian mitochondrial large ribosomal subunit with mtRRF (post) and mtEFG2 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：61-meric
链 B4 1–126（126 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 221 ZN ZINC ION × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 B4 1–126（126 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric
链 B4 1–126（126 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 I3L9J0_PIG
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 Bd； PDB构建体 1–126； UniProt 1–126

28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1

物种未注明

UniProt F1SG95

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 AB； UniProt 1–366 未记录 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5AJ3 Structure of the small subunit of the mammalian mitoribosome 提交 2015-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：37-meric
链 k 1–325（325 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ZN ZINC ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE
分辨率 3.60 Å
5AJ4 Structure of the 55S mammalian mitoribosome. 提交 2015-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Ak 51–325（275 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 351 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE
分辨率 3.80 Å
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric
链 Ak 42–366（325 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GAZ Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 28S ribosomal subunit. 提交 2018-04-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric
链 Ak 42–366（325 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric
链 Ak 42–366（325 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric
链 Ak 42–366（325 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Ak 42–366（325 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Ak 42–366（325 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Ak 42–366（325 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric
链 Ak 42–366（325 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric
链 AB 1–366（366 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å

共 11 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 F1SG95_PIG
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 AB； PDB构建体 1–366； UniProt 1–366

Mitochondrial ribosomal protein S24

物种未注明

UniProt A0A287ANU4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 AC； UniProt 1–167 未记录 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric
链 AC 1–167（167 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GAZ Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 28S ribosomal subunit. 提交 2018-04-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric
链 AC 1–167（167 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric
链 AC 1–167（167 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric
链 AC 1–167（167 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AC 1–167（167 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AC 1–167（167 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AC 1–167（167 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric
链 AC 1–167（167 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric
链 AC 1–167（167 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A287ANU4_PIG
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 AC； PDB构建体 1–167； UniProt 1–167

Aurora kinase A interacting protein 1

物种未注明

UniProt A0A287B3R8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 AD； UniProt 1–199 未记录 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric
链 An 1–199（199 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GAZ Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 28S ribosomal subunit. 提交 2018-04-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric
链 An 1–199（199 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric
链 An 1–199（199 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric
链 An 1–199（199 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 An 1–199（199 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 An 1–199（199 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 An 1–199（199 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric
链 An 1–199（199 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A287B3R8_PIG
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 AD； PDB构建体 1–199； UniProt 1–199

bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6

物种未注明

UniProt A0A4X1TSM9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 AE； UniProt 28–275 未记录 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A4X1TSM9_PIG
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 AE； PDB构建体 129–376； UniProt 28–275

Mitochondrial ribosomal protein S7

物种未注明

UniProt A0A286ZJ25

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 AF； UniProt 1–242 未记录 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric
链 AG 1–242（242 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GAZ Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 28S ribosomal subunit. 提交 2018-04-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric
链 AG 1–242（242 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric
链 AG 1–242（242 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric
链 AG 1–242（242 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AG 1–240（240 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AG 1–242（242 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AG 1–242（242 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric
链 AG 1–242（242 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric
链 AF 1–242（242 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A286ZJ25_PIG
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 AF； PDB构建体 1–242； UniProt 1–242

Mitochondrial ribosomal protein S10

物种未注明

UniProt F1RUU2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 AH； UniProt 1–200 未记录 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric
链 AJ 1–201（201 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GAZ Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 28S ribosomal subunit. 提交 2018-04-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric
链 AJ 1–201（201 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric
链 AJ 1–200（200 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric
链 AJ 1–200（200 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AJ 1–200（200 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AJ 1–200（200 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AJ 1–200（200 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric
链 AJ 1–200（200 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric
链 AH 1–200（200 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 F1RUU2_PIG
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 AH； PDB构建体 1–200； UniProt 1–200

Mitochondrial ribosomal protein S12

物种未注明

UniProt A0A0M3KL52

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 AJ； UniProt 1–139 未记录 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric
链 AL 1–139（139 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GAZ Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 28S ribosomal subunit. 提交 2018-04-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric
链 AL 1–139（139 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric
链 AL 1–139（139 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric
链 AL 1–139（139 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AL 1–139（139 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AL 1–139（139 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AL 1–139（139 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric
链 AL 1–139（139 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric
链 AJ 1–139（139 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A0M3KL52_PIG
Isoform —
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 AJ； PDB构建体 1–139； UniProt 1–139

Mitochondrial ribosomal protein S14

物种未注明

UniProt A0A0M3KL53

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 AK； UniProt 1–128 未记录 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric
链 AN 1–128（128 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GAZ Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 28S ribosomal subunit. 提交 2018-04-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric
链 AN 1–128（128 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric
链 AN 1–128（128 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric
链 AN 1–128（128 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AN 1–128（128 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AN 1–128（128 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AN 1–128（128 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric
链 AN 1–128（128 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric
链 AK 1–128（128 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A0M3KL53_PIG
Isoform —
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 AK； PDB构建体 1–128； UniProt 1–128

28S ribosomal protein S15, mitochondrial

物种未注明

UniProt A0A287AKS1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 AL； UniProt 1–259 未记录 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric
链 AL 1–259（259 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A287AKS1_PIG
Isoform —
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 AL； PDB构建体 1–259； UniProt 1–259

28S ribosomal protein S16, mitochondrial

物种未注明

UniProt A0A480JTD7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 AM； UniProt 1–135 未记录 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric
链 AP 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric
链 AP 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AP 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AP 1–135（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AP 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric
链 AP 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric
链 AM 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A480JTD7_PIG
Isoform —
PDB实体 15
链与序列区间 作者链 AM； PDB构建体 1–135； UniProt 1–135

uS17m

物种未注明

UniProt F1RIU0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 AN； UniProt 1–130 未记录 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5AJ3 Structure of the small subunit of the mammalian mitoribosome 提交 2015-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：37-meric
链 Q 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ZN ZINC ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE
分辨率 3.60 Å
5AJ4 Structure of the 55S mammalian mitoribosome. 提交 2015-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 AQ 2–110（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 351 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE
分辨率 3.80 Å
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric
链 AQ 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GAZ Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 28S ribosomal subunit. 提交 2018-04-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric
链 AQ 1–130（130 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric
链 AQ 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric
链 AQ 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AQ 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AQ 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AQ 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric
链 AQ 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å

共 10 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 F1RIU0_PIG
Isoform —
PDB实体 16
链与序列区间 作者链 AN； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130

28S ribosomal protein S18b, mitochondrial

物种未注明

UniProt Q767K8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 AO； UniProt 1–258 未记录 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5AJ3 Structure of the small subunit of the mammalian mitoribosome 提交 2015-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：37-meric
链 p 1–258（258 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ZN ZINC ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE
分辨率 3.60 Å
5AJ4 Structure of the 55S mammalian mitoribosome. 提交 2015-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Ap 51–238（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 351 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE
分辨率 3.80 Å
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric
链 Ap 1–258（258 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GAZ Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 28S ribosomal subunit. 提交 2018-04-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric
链 Ap 1–258（258 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric
链 Ap 1–258（258 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric
链 Ap 1–258（258 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Ap 1–258（258 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Ap 1–258（258 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Ap 1–258（258 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric
链 Ap 1–258（258 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric
链 AO 1–258（258 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å

共 11 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RT18B_PIG
Isoform —
PDB实体 17
链与序列区间 作者链 AO； PDB构建体 1–258； UniProt 1–258

Mitochondrial ribosomal protein S18C

物种未注明

UniProt A0A0M3KL54

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 AP； UniProt 1–143 未记录 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric
链 AR 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GAZ Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 28S ribosomal subunit. 提交 2018-04-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric
链 AR 1–143（143 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric
链 AR 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric
链 AR 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AR 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AR 1–143（143 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AR 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric
链 AR 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric
链 AP 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A0M3KL54_PIG
Isoform —
PDB实体 18
链与序列区间 作者链 AP； PDB构建体 1–143； UniProt 1–143

28S ribosomal protein S21, mitochondrial

物种未注明

UniProt A0A286ZNB3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 AQ； UniProt 1–87 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric
链 AU 1–87（87 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GAZ Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 28S ribosomal subunit. 提交 2018-04-13 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric
链 AU 1–87（87 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric
链 AU 1–87（87 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric
链 AU 1–87（87 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AU 1–87（87 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AU 1–87（87 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AU 1–87（87 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric
链 AU 1–87（87 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric
链 AQ 1–87（87 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A286ZNB3_PIG
Isoform —
PDB实体 19
链与序列区间 作者链 AQ； PDB构建体 1–87； UniProt 1–87

Mitochondrial ribosomal protein S22

物种未注明

UniProt A0A287AQT5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 AR； UniProt 1–382 未记录 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric
链 Aa 1–382（382 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GAZ Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 28S ribosomal subunit. 提交 2018-04-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric
链 Aa 1–382（382 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric
链 Aa 1–382（382 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric
链 Aa 1–382（382 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Aa 1–382（382 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Aa 1–382（382 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Aa 1–382（382 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric
链 Aa 1–382（382 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric
链 AR 1–382（382 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A287AQT5_PIG
Isoform —
PDB实体 20
链与序列区间 作者链 AR； PDB构建体 1–382； UniProt 1–382

mS23

物种未注明

UniProt A0A287AEW3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 AS； UniProt 1–190 未记录 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric
链 Ab 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GAZ Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 28S ribosomal subunit. 提交 2018-04-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric
链 Ab 1–190（190 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric
链 Ab 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric
链 Ab 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Ab 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Ab 1–190（190 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric
链 Ab 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric
链 AS 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A287AEW3_PIG
Isoform —
PDB实体 21
链与序列区间 作者链 AS； PDB构建体 1–190； UniProt 1–190

Mitochondrial ribosomal protein S25

物种未注明

UniProt A0A0M3KL55

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 AT； UniProt 1–173 未记录 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric
链 Ac 1–173（173 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GAZ Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 28S ribosomal subunit. 提交 2018-04-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric
链 Ac 1–173（173 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric
链 Ac 1–173（173 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric
链 Ac 1–173（173 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Ac 1–173（173 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Ac 1–173（173 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Ac 1–173（173 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric
链 Ac 1–173（173 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric
链 AT 1–173（173 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A0M3KL55_PIG
Isoform —
PDB实体 22
链与序列区间 作者链 AT； PDB构建体 1–173； UniProt 1–173

Mitochondrial ribosomal protein S26

物种未注明

UniProt A0A287AY01

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 AU； UniProt 1–205 未记录 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric
链 Ad 1–205（205 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GAZ Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 28S ribosomal subunit. 提交 2018-04-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric
链 Ad 1–205（205 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric
链 Ad 1–205（205 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric
链 Ad 1–205（205 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Ad 1–205（205 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Ad 1–205（205 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric
链 Ad 1–205（205 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric
链 AU 1–205（205 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A287AY01_PIG
Isoform —
PDB实体 23
链与序列区间 作者链 AU； PDB构建体 1–205； UniProt 1–205

Mitochondrial ribosomal protein S27

物种未注明

UniProt A0A5G2R1I0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 AV； UniProt 1–395 未记录 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric
链 AV 1–395（395 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A5G2R1I0_PIG
Isoform —
PDB实体 24
链与序列区间 作者链 AV； PDB构建体 1–395； UniProt 1–395

Mitoribosomal protein ms28, mrps28

物种未注明

UniProt A0A0M3KL56

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 AW； UniProt 1–188 未记录 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric
链 Af 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GAZ Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 28S ribosomal subunit. 提交 2018-04-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric
链 Af 1–188（188 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric
链 Af 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric
链 Af 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Af 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Af 1–188（188 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Af 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric
链 Af 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric
链 AW 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A0M3KL56_PIG
Isoform —
PDB实体 25
链与序列区间 作者链 AW； PDB构建体 1–188； UniProt 1–188

Death associated protein 3

物种未注明

UniProt I3LS10

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 AX； UniProt 1–410 未记录 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric
链 Ag 1–397（397 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GAZ Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 28S ribosomal subunit. 提交 2018-04-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric
链 Ag 1–397（397 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric
链 Ag 1–410（410 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric
链 Ag 1–410（410 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Ag 1–410（410 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Ag 1–410（410 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Ag 1–410（410 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric
链 Ag 1–410（410 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 I3LS10_PIG
Isoform —
PDB实体 26
链与序列区间 作者链 AX； PDB构建体 1–410； UniProt 1–410

28S ribosomal protein S31, mitochondrial

物种未注明

UniProt F1RME2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 AY； UniProt 1–381 未记录 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5AJ3 Structure of the small subunit of the mammalian mitoribosome 提交 2015-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：37-meric
链 h 1–387（387 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ZN ZINC ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE
分辨率 3.60 Å
5AJ4 Structure of the 55S mammalian mitoribosome. 提交 2015-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Ah 285–387（103 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 351 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE
分辨率 3.80 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric
链 Ah 1–381（381 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric
链 Ah 1–381（381 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Ah 1–381（381 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Ah 1–381（381 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric
链 AY 1–381（381 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 F1RME2_PIG
Isoform —
PDB实体 27
链与序列区间 作者链 AY； PDB构建体 1–381； UniProt 1–381

Mitochondrial ribosomal protein S33

物种未注明

UniProt F1S8G3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 AZ； UniProt 1–148 未记录 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5AJ3 Structure of the small subunit of the mammalian mitoribosome 提交 2015-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：37-meric
链 i 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ZN ZINC ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE
分辨率 3.60 Å
5AJ4 Structure of the 55S mammalian mitoribosome. 提交 2015-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Ai 4–102（99 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 351 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE
分辨率 3.80 Å
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric
链 Ai 43–148（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GAZ Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 28S ribosomal subunit. 提交 2018-04-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric
链 Ai 43–148（106 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric
链 Ai 43–148（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric
链 Ai 43–148（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Ai 43–148（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Ai 43–148（106 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Ai 43–148（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric
链 Ai 43–148（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric
链 AZ 1–148（148 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å

共 11 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 F1S8G3_PIG
Isoform —
PDB实体 28
链与序列区间 作者链 AZ； PDB构建体 1–148； UniProt 1–148

Peptide chain release factor 1, mitochondrial

Homo sapiens

UniProt O75570

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 Aa； UniProt 1–445 未记录 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric
链 Aa 1–445（445 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å
8OIQ 39S mammalian mitochondrial large ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：62-meric
链 Aa 1–445（445 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 205 K POTASSIUM ION × 30 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
8OIR 55S human mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric
链 Aa 1–445（445 aa）
突变：311GGQ313 > AAQ K POTASSIUM ION × 51 MG MAGNESIUM ION × 354 VAL VALINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 3 MET METHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
8OIS 28S human mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric
链 Aa 1–445（445 aa）
突变：311GGQ313 > AAQ K POTASSIUM ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 126 MET METHIONINE × 1 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
8OIT 39S human mitochondrial large ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：62-meric
链 Aa 1–445（445 aa）
突变：311GGQ313 > AAQ K POTASSIUM ION × 34 MG MAGNESIUM ION × 228 VAL VALINE × 1 ZN ZINC ION × 2 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å

共 5 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RF1M_HUMAN
Isoform —
PDB实体 29
链与序列区间 作者链 Aa； PDB构建体 1–445； UniProt 1–445

Mitochondrial ribosomal protein S2

物种未注明

UniProt F1S001

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 Ab； UniProt 1–289 未记录 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5AJ3 Structure of the small subunit of the mammalian mitoribosome 提交 2015-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：37-meric
链 B 1–289（289 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ZN ZINC ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE
分辨率 3.60 Å
5AJ4 Structure of the 55S mammalian mitoribosome. 提交 2015-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 AB 55–274（220 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 351 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE
分辨率 3.80 Å
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric
链 AB 1–289（289 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GAZ Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 28S ribosomal subunit. 提交 2018-04-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric
链 AB 1–289（289 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric
链 AB 1–289（289 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric
链 AB 1–289（289 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AB 1–289（289 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AB 1–289（289 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AB 1–289（289 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric
链 AB 1–289（289 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric
链 Ab 1–289（289 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å

共 11 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 F1S001_PIG
Isoform —
PDB实体 30
链与序列区间 作者链 Ab； PDB构建体 1–289； UniProt 1–289

Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1

物种未注明

UniProt F1SU49

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 Ac； UniProt 1–118 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5AJ3 Structure of the small subunit of the mammalian mitoribosome 提交 2015-02-20 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：37-meric
链 m 1–118（118 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ZN ZINC ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE
分辨率 3.60 Å
5AJ4 Structure of the 55S mammalian mitoribosome. 提交 2015-02-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Am 2–117（116 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 351 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE
分辨率 3.80 Å
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric
链 Am 1–118（118 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GAZ Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 28S ribosomal subunit. 提交 2018-04-13 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric
链 Am 1–118（118 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric
链 Am 1–118（118 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric
链 Am 1–118（118 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Am 1–118（118 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Am 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Am 1–118（118 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric
链 Am 1–118（118 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric
链 Ac 1–118（118 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å

共 11 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 F1SU49_PIG
Isoform —
PDB实体 31
链与序列区间 作者链 Ac； PDB构建体 1–118； UniProt 1–118

28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2

物种未注明

UniProt F1SU66

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 Ad； UniProt 1–430 未记录 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5AJ3 Structure of the small subunit of the mammalian mitoribosome 提交 2015-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：37-meric
链 E 1–430（430 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ZN ZINC ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE
分辨率 3.60 Å
5AJ4 Structure of the 55S mammalian mitoribosome. 提交 2015-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 AE 88–430（343 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 351 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE
分辨率 3.80 Å
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric
链 AE 1–430（430 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GAZ Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 28S ribosomal subunit. 提交 2018-04-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric
链 AE 1–430（430 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric
链 AE 1–430（430 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric
链 AE 1–430（430 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AE 1–430（430 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AE 1–430（430 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AE 1–430（430 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric
链 AE 1–430（430 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric
链 Ad 1–430（430 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å

共 11 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 F1SU66_PIG
Isoform —
PDB实体 32
链与序列区间 作者链 Ad； PDB构建体 1–430； UniProt 1–430

mS39

物种未注明

UniProt K7GKS8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 Ae； UniProt 1–692 未记录 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5AJ3 Structure of the small subunit of the mammalian mitoribosome 提交 2015-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：37-meric
链 o 1–692（692 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ZN ZINC ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE
分辨率 3.60 Å
5AJ4 Structure of the 55S mammalian mitoribosome. 提交 2015-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Ao 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 351 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE
分辨率 3.80 Å
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric
链 Ao 1–692（692 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GAZ Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 28S ribosomal subunit. 提交 2018-04-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric
链 Ao 1–692（692 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric
链 Ao 1–699（699 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric
链 Ao 1–692（692 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Ao 1–699（699 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Ao 1–699（699 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric
链 Ae 1–692（692 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 K7GKS8_PIG
Isoform —
PDB实体 33
链与序列区间 作者链 Ae； PDB构建体 1–692； UniProt 1–692

uS9m

物种未注明

UniProt I3LU08

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 Ag； UniProt 1–397 未记录 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric
链 AI 1–397（397 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GAZ Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 28S ribosomal subunit. 提交 2018-04-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric
链 AI 1–397（397 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric
链 AI 1–397（397 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric
链 AI 1–397（397 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AI 1–397（397 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AI 1–397（397 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AI 1–397（397 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric
链 AI 1–397（397 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric
链 Ag 1–397（397 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 I3LU08_PIG
Isoform —
PDB实体 34
链与序列区间 作者链 Ag； PDB构建体 1–397； UniProt 1–397

Mitochondrial ribosomal protein S11

物种未注明

UniProt A0A286ZJJ6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 Ai； UniProt 1–196 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S34 × 1 （A0A287AVS9） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric
链 AK 1–196（196 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GAZ Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 28S ribosomal subunit. 提交 2018-04-13 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric
链 AK 1–196（196 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 111 NA SODIUM ION × 1 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric
链 AK 1–196（196 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric
链 AK 1–196（196 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AK 1–196（196 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AK 1–196（196 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 AK 1–196（196 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric
链 AK 1–196（196 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric
链 Ai 1–196（196 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A286ZJJ6_PIG
Isoform —
PDB实体 35
链与序列区间 作者链 Ai； PDB构建体 1–196； UniProt 1–196

Mitochondrial ribosomal protein S34

物种未注明

UniProt A0A287AVS9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 33 RNA 3 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 Aj； UniProt 1–505 未记录 39S ribosomal protein L19, mitochondrial × 1 （I3LNJ0） bL31m × 1 （I3L9J0） 12S rRNA × 1 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 × 1 （F1SG95） Mitochondrial ribosomal protein S24 × 1 （A0A287ANU4） Aurora kinase A interacting protein 1 × 1 （A0A287B3R8） bS6m,Mitochondrial ribosomal protein S6 × 1 （A0A4X1TSM9） Mitochondrial ribosomal protein S7 × 1 （A0A286ZJ25） P-site Met-tRNA(fMet) × 1 Mitochondrial ribosomal protein S10 × 1 （F1RUU2） mRNA × 1 Mitochondrial ribosomal protein S12 × 1 （A0A0M3KL52） Mitochondrial ribosomal protein S14 × 1 （A0A0M3KL53） 28S ribosomal protein S15, mitochondrial × 1 （A0A287AKS1） 28S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （A0A480JTD7） uS17m × 1 （F1RIU0） 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial × 1 （Q767K8） Mitochondrial ribosomal protein S18C × 1 （A0A0M3KL54） 28S ribosomal protein S21, mitochondrial × 1 （A0A286ZNB3） Mitochondrial ribosomal protein S22 × 1 （A0A287AQT5） mS23 × 1 （A0A287AEW3） Mitochondrial ribosomal protein S25 × 1 （A0A0M3KL55） Mitochondrial ribosomal protein S26 × 1 （A0A287AY01） Mitochondrial ribosomal protein S27 × 1 （A0A5G2R1I0） Mitoribosomal protein ms28, mrps28 × 1 （A0A0M3KL56） Death associated protein 3 × 1 （I3LS10） 28S ribosomal protein S31, mitochondrial × 1 （F1RME2） Mitochondrial ribosomal protein S33 × 1 （F1S8G3） Peptide chain release factor 1, mitochondrial × 1 （O75570） Mitochondrial ribosomal protein S2 × 1 （F1S001） Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 × 1 （F1SU49） 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 × 1 （F1SU66） mS39 × 1 （K7GKS8） uS9m × 1 （I3LU08） Mitochondrial ribosomal protein S11 × 1 （A0A286ZJJ6） MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8OIP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric
链 Aj 288–505（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric
链 Aj 288–505（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Aj 288–505（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Aj 288–505（218 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric
链 Aj 288–505（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric
链 Aj 288–505（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：94-meric
链 Aj 1–505（505 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A287AVS9_PIG
Isoform —
PDB实体 36
链与序列区间 作者链 Aj； PDB构建体 1–505； UniProt 1–505

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8oip

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8oip
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8oip
沉积日期 deposition_date2023-03-23
结构标题 title28S mammalian mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA
关键词 keywordsmammalian mitochondrial ribosome, release factor mtRF1, non-canonical stop codon, RIBOSOME; RIBOSOME
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier73.13 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron76.80 Å
零角强度 I(0) i023524000000.00
分子量 molecular_weight1050700.0 kDa
排除体积 excluded_volume1210300 ų
包络体积 envelope_volume2060400 ų
水化壳体积 shell_volume220970 ų
包络直径 envelope_diameter298.3 Å
壳层 Rg shell_rg77.99 Å
包络 Rg envelope_rg76.13 Å
形状 Rg shape_rg77.01 Å
总 Rg total_rg76.25 Å
总原子数 total_atoms72358
残基数 n_residues7193
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax278.0 Å
Rg (实空间) rg_real77.55 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error2.18 Å
I(0) (实空间) i0_real2.3750e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error4.9140e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal72.55 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal23490000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8490
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary79.4 Å
偏度 Skewness skewness0.701
峰度 Kurtosis kurtosis0.330
角度范围 angular_range— – 0.1050 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.8799
最高正则化参数 α highest_alpha2267000000.0000
实空间数据点数 n_real_points22
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.639; Stabil: 0.848; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.991; Smooth: 0.621
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (45)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)