8p6x

Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor BS-194

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 89.0 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CDK-activating kinase assembly factor MAT1

Homo sapiens

UniProt P51948

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 H； UniProt 220–309	未记录	Cyclin-H × 1 （P51946） Cyclin-dependent kinase 7 × 1 （P50613） NS9 (2S,3S)-3-{[7-(benzylamino)-3-(1-methylethyl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino}butane-1,2,4-triol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8P6X	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1G25 SOLUTION STRUCTURE OF THE N-TERMINAL DOMAIN OF THE HUMAN TFIIH MAT1 SUBUNIT 提交 2000-10-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–65（65 aa）片段：N-TERMINAL DOMAIN	未记录	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.5；298 K；压力 ambiant NMR测量条件 pH 7.5；290 K；压力 ambiant NMR测量条件 pH 7.5；283 K；压力 ambiant NMR样品组成 2 mM MAT1; 20 mM Tris-HCl pH 7.5; 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
28JM Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH and XPC initial encounter complex 提交 2026-02-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.29 Å
28JS Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC complex bound to bulky lesion-mimic DNA (composite map) 提交 2026-02-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.32 Å
28JV Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC complex bound to bulky lesion-mimic DNA (consensus map) 提交 2026-02-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.91 Å
28KE Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC-XPA complex bound to bulky lesion-mimic DNA 提交 2026-02-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.60 Å
6NMI Cryo-EM structure of the human TFIIH core complex 提交 2019-01-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；A thin film of continuous carbon was floated onto Protochips C-flat CF-4/2 holey carbon grids and glow discharged or plasma cleaned before application of 4 uL of sample solution.	分辨率 3.70 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric	链 3 1–309（309 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
6O9M Structure of the human apo TFIIH 提交 2019-03-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 3 1–309（309 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
6TUN Helicase domain complex 提交 2020-01-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 66–141（76 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris pH 8.5 25% PEG8000	分辨率 2.07 Å R-free 0.227
6TUN Helicase domain complex 提交 2020-01-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 66–141（76 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris pH 8.5 25% PEG8000	分辨率 2.07 Å R-free 0.227
6XBZ Structure of the human CDK-activating kinase 提交 2020-06-07	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
6XD3 Structure of the human CAK in complex with THZ1 提交 2020-06-09	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）片段：residues 220-309	未记录	V0G N-(3-{[5-chloro-4-(1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}phenyl)-4-{[4-(dimethylamino)butanoyl]amino}benzamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7B5O Cryo-EM structure of the human CAK bound to ICEC0942 at 2.5 Angstroms resolution 提交 2020-12-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	I74 (3R,4R)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.50 Å
7B5Q Cryo-EM structure of the human CAK bound to ICEC0942 (PHENIX-OPLS3e) 提交 2020-12-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	I74 (3R,4R)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.50 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 0 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 0 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 0 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 0 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric	链 d 1–309（309 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric	链 3 1–309（309 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7NVW TFIIH in a pre-translocated state (without ADP-BeF3) 提交 2021-03-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 3 1–309（309 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
7NVX TFIIH in a post-translocated state (with ADP-BeF3) 提交 2021-03-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 3 1–309（309 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 3 1–309（309 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.30 Å
7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 3 1–309（309 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 3 1–309（309 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.60 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 7 1–309（309 aa）	突变：0	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric	链 7 1–309（309 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 HD 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 HD 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8ORM Cryo-EM structure of CAK-THZ1 提交 2023-04-14	配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	V0G N-(3-{[5-chloro-4-(1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}phenyl)-4-{[4-(dimethylamino)butanoyl]amino}benzamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
8P6V Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0942 提交 2023-05-30	配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	I74 (3R,4R)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
8P6W Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor BS-181 提交 2023-05-30	配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	X2H ~{N}5-(6-azanylhexyl)-~{N}7-(phenylmethyl)-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-5,7-diamine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
8P6Y Cryo-EM structure of CAK in complex with nucleotide analogue ATPgS 提交 2023-05-30	配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
8P6Z Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0510-R 提交 2023-05-30	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	X4L N7-(phenylmethyl)-3-propan-2-yl-N5-[(3R)-pyrrolidin-3-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-5,7-diamine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.10 Å
8P70 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0510-S 提交 2023-05-30	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	X4Q N7-(phenylmethyl)-3-propan-2-yl-N5-[(3S)-pyrrolidin-3-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-5,7-diamine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.00 Å
8P71 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0574 提交 2023-05-30	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	X4F (3R,4S)-4-[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]pyrrolidin-3-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.00 Å
8P72 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0768 提交 2023-05-30	配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	X2Z ~{N}7-(phenylmethyl)-~{N}5-[(3~{S})-piperidin-3-yl]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-5,7-diamine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
8P73 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0829 提交 2023-05-30	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	X50 (3R,4R)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidine-3,4-diol × 1 X58 (3S,4S)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidine-3,4-diol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.00 Å
8P74 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0880 (ring-up conformation) 提交 2023-05-30	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	X3Z (2S,3S)-3-[[7-[(2-bromophenyl)methylamino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]butane-1,2,4-triol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.20 Å
8P75 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0880 (ring-down conformation) 提交 2023-05-30	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	X3Z (2S,3S)-3-[[7-[(2-bromophenyl)methylamino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]butane-1,2,4-triol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.00 Å
8P76 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0914 提交 2023-05-30	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	X1W N5-[(3S,4R)-4-phenylmethoxypyrrolidin-3-yl]-N7-(phenylmethyl)-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-5,7-diamine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.00 Å
8P77 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0943 提交 2023-05-30	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	I73 (3S,4S)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.80 Å
8P78 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor dinaciclib 提交 2023-05-30	配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	1QK 3-[({3-ethyl-5-[(2S)-2-(2-hydroxyethyl)piperidin-1-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-7-yl}amino)methyl]-1-hydroxypyridinium × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
8P79 Cryo-EM structure of CAK with averaged inhibitor density 提交 2023-05-30	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；Structure obtained by combining data from six samples of CAK bound to different non-covalent inhibitors. Four samples contained 5 mM beta-mercaptoethanol and two samples did not. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.70 Å
8P7L Cryo-EM structure of CDK7 subunit of CAK in complex with inhibitor LDC4297 提交 2023-05-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	WD9 2-[(3S)-piperidin-3-yl]oxy-8-propan-2-yl-N-[(2-pyrazol-1-ylphenyl)methyl]pyrazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-4-amine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.10 Å
8PLZ Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor CT7030 提交 2023-06-27	配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	ZQ6 (3~{R},4~{R})-4-[[[7-[(2-methoxyphenyl)methylamino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
8PYR Crystal structure of the dual T-loop phosphorylated Cdk7/CycH/Mat1 complex 提交 2023-07-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 230–309（80 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；288 K；0.1 M Hepes (pH 7.0), 12% (v/w) medium weight PEG mix of PEG6K and PEG4K, 10% ethylene-glycol, and 0.2 M NDSB	分辨率 2.15 Å R-free 0.241
8PYR Crystal structure of the dual T-loop phosphorylated Cdk7/CycH/Mat1 complex 提交 2023-07-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 G 230–309（80 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；288 K；0.1 M Hepes (pH 7.0), 12% (v/w) medium weight PEG mix of PEG6K and PEG4K, 10% ethylene-glycol, and 0.2 M NDSB	分辨率 2.15 Å R-free 0.241
8S0R Cryo-EM structure of CAK modified by covalent inhibitor SY-1365 提交 2024-02-14	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	A1H46 ~{N}-[(1~{S},3~{R})-3-[[5-chloranyl-4-(1~{H}-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino]-1-methyl-cyclohexyl]-5-[4-(dimethylamino)butanoylamino]pyridine-2-carboxamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å
8S0T Cryo-EM structure of CAK in complex with SY-5609 提交 2024-02-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	YNK 7-dimethylphosphoryl-3-[2-[[(3~{S})-6,6-dimethylpiperidin-3-yl]amino]-5-(trifluoromethyl)pyrimidin-4-yl]-1~{H}-indole-6-carbonitrile × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；Buffer contained 54 uM inhibitor SY-5609. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.30 Å
8WAK Structure of transcribing complex 2 (TC2), the initially transcribing complex with Pol II positioned 2nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 0 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 0 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 0 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 0 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 0 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 0 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 0 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 0 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å
9HIX Cryo-EM structure of CAK (CDK7 D97N mutant) in complex with THZ1 提交 2024-11-27	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	V0G N-(3-{[5-chloro-4-(1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}phenyl)-4-{[4-(dimethylamino)butanoyl]amino}benzamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
9HIY Cryo-EM structure of CAK (CDK7 D97N mutant) in complex with ATPgS 提交 2024-11-27	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.30 Å
9HJ0 Cryo-EM structure of CAK (CDK7 D97N mutant) in complex with Samuraciclib 提交 2024-11-27	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	I74 (3R,4R)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
9I9I Cryo-EM structure of CAK-CDK11 提交 2025-02-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9I9J Cryo-EM structure of CAK-CDK2 (determined in the presence of ADP-nitrate) 提交 2025-02-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9I9K Cryo-EM structure of CAK-CDK2 (determined in the presence of ADP-AlFx) 提交 2025-02-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å
9QCV Cryo-EM structure of CAK-CDK2-cyclin A2 bound to AMP-PNP 提交 2025-03-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
9QCX Cryo-EM structure of apo-CAK-CDK2-cyclin A2 提交 2025-03-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
9QJN Cryo-EM structure of the human CAK bound to OTS964 提交 2025-03-19	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	NK3 OTS964 × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å
9SKQ Cryo-EM structure of CAK-CDK1-cyclin B1 提交 2025-09-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å

共 66 个其他 PDB 条目、68 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MAT1_HUMAN
Isoform	P51948-1
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 4–93； UniProt 220–309

Cyclin-H

Homo sapiens

UniProt P51946

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 I； UniProt 1–323	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） Cyclin-dependent kinase 7 × 1 （P50613） NS9 (2S,3S)-3-{[7-(benzylamino)-3-(1-methylethyl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino}butane-1,2,4-triol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8P6X	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1JKW STRUCTURE OF CYCLIN MCS2 提交 1996-10-11	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–323（323 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.60 Å R-free 0.272
1KXU CYCLIN H, A POSITIVE REGULATORY SUBUNIT OF CDK ACTIVATING KINASE 提交 1996-08-08	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–323（323 aa）	突变：INS(MSHHHHHHGS-M1) (HISTIDINE TAG)	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.60 Å R-free 0.295
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric	链 9 1–323（323 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
6XBZ Structure of the human CDK-activating kinase 提交 2020-06-07	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–323（323 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
6XD3 Structure of the human CAK in complex with THZ1 提交 2020-06-09	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–323（323 aa）	未记录	V0G N-(3-{[5-chloro-4-(1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}phenyl)-4-{[4-(dimethylamino)butanoyl]amino}benzamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7B5O Cryo-EM structure of the human CAK bound to ICEC0942 at 2.5 Angstroms resolution 提交 2020-12-05	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–323（323 aa）	未记录	I74 (3R,4R)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.50 Å
7B5Q Cryo-EM structure of the human CAK bound to ICEC0942 (PHENIX-OPLS3e) 提交 2020-12-05	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–323（323 aa）	未记录	I74 (3R,4R)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.50 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 9 1–323（323 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 9 1–323（323 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 9 1–323（323 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 9 1–323（323 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric	链 f 1–323（323 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric	链 9 1–323（323 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 9 1–323（323 aa）	突变：0	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric	链 9 1–323（323 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 HJ 1–323（323 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 HJ 1–323（323 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8ORM Cryo-EM structure of CAK-THZ1 提交 2023-04-14	配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–323（323 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	V0G N-(3-{[5-chloro-4-(1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}phenyl)-4-{[4-(dimethylamino)butanoyl]amino}benzamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
8P6V Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0942 提交 2023-05-30	配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–323（323 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	I74 (3R,4R)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
8P6W Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor BS-181 提交 2023-05-30	配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–323（323 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	X2H ~{N}5-(6-azanylhexyl)-~{N}7-(phenylmethyl)-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-5,7-diamine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
8P6Y Cryo-EM structure of CAK in complex with nucleotide analogue ATPgS 提交 2023-05-30	配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–323（323 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
8P6Z Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0510-R 提交 2023-05-30	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–323（323 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	X4L N7-(phenylmethyl)-3-propan-2-yl-N5-[(3R)-pyrrolidin-3-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-5,7-diamine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.10 Å
8P70 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0510-S 提交 2023-05-30	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–323（323 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	X4Q N7-(phenylmethyl)-3-propan-2-yl-N5-[(3S)-pyrrolidin-3-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-5,7-diamine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.00 Å
8P71 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0574 提交 2023-05-30	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–323（323 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	X4F (3R,4S)-4-[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]pyrrolidin-3-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.00 Å
8P72 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0768 提交 2023-05-30	配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–323（323 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	X2Z ~{N}7-(phenylmethyl)-~{N}5-[(3~{S})-piperidin-3-yl]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-5,7-diamine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
8P73 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0829 提交 2023-05-30	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–323（323 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	X50 (3R,4R)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidine-3,4-diol × 1 X58 (3S,4S)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidine-3,4-diol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.00 Å
8P74 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0880 (ring-up conformation) 提交 2023-05-30	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–323（323 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	X3Z (2S,3S)-3-[[7-[(2-bromophenyl)methylamino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]butane-1,2,4-triol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.20 Å
8P75 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0880 (ring-down conformation) 提交 2023-05-30	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–323（323 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	X3Z (2S,3S)-3-[[7-[(2-bromophenyl)methylamino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]butane-1,2,4-triol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.00 Å
8P76 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0914 提交 2023-05-30	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–323（323 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	X1W N5-[(3S,4R)-4-phenylmethoxypyrrolidin-3-yl]-N7-(phenylmethyl)-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-5,7-diamine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.00 Å
8P77 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0943 提交 2023-05-30	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–323（323 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	I73 (3S,4S)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.80 Å
8P78 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor dinaciclib 提交 2023-05-30	配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–323（323 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	1QK 3-[({3-ethyl-5-[(2S)-2-(2-hydroxyethyl)piperidin-1-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-7-yl}amino)methyl]-1-hydroxypyridinium × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
8P79 Cryo-EM structure of CAK with averaged inhibitor density 提交 2023-05-30	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–323（323 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；Structure obtained by combining data from six samples of CAK bound to different non-covalent inhibitors. Four samples contained 5 mM beta-mercaptoethanol and two samples did not. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.70 Å
8PLZ Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor CT7030 提交 2023-06-27	配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–323（323 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZQ6 (3~{R},4~{R})-4-[[[7-[(2-methoxyphenyl)methylamino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
8PYR Crystal structure of the dual T-loop phosphorylated Cdk7/CycH/Mat1 complex 提交 2023-07-26	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–323（323 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；288 K；0.1 M Hepes (pH 7.0), 12% (v/w) medium weight PEG mix of PEG6K and PEG4K, 10% ethylene-glycol, and 0.2 M NDSB	分辨率 2.15 Å R-free 0.241
8PYR Crystal structure of the dual T-loop phosphorylated Cdk7/CycH/Mat1 complex 提交 2023-07-26	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 1–323（323 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；288 K；0.1 M Hepes (pH 7.0), 12% (v/w) medium weight PEG mix of PEG6K and PEG4K, 10% ethylene-glycol, and 0.2 M NDSB	分辨率 2.15 Å R-free 0.241
8S0R Cryo-EM structure of CAK modified by covalent inhibitor SY-1365 提交 2024-02-14	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–323（323 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	A1H46 ~{N}-[(1~{S},3~{R})-3-[[5-chloranyl-4-(1~{H}-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino]-1-methyl-cyclohexyl]-5-[4-(dimethylamino)butanoylamino]pyridine-2-carboxamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å
8S0T Cryo-EM structure of CAK in complex with SY-5609 提交 2024-02-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–323（323 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	YNK 7-dimethylphosphoryl-3-[2-[[(3~{S})-6,6-dimethylpiperidin-3-yl]amino]-5-(trifluoromethyl)pyrimidin-4-yl]-1~{H}-indole-6-carbonitrile × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；Buffer contained 54 uM inhibitor SY-5609. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.30 Å
9HIX Cryo-EM structure of CAK (CDK7 D97N mutant) in complex with THZ1 提交 2024-11-27	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–323（323 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	V0G N-(3-{[5-chloro-4-(1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}phenyl)-4-{[4-(dimethylamino)butanoyl]amino}benzamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
9HIY Cryo-EM structure of CAK (CDK7 D97N mutant) in complex with ATPgS 提交 2024-11-27	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–323（323 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.30 Å
9HJ0 Cryo-EM structure of CAK (CDK7 D97N mutant) in complex with Samuraciclib 提交 2024-11-27	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–323（323 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	I74 (3R,4R)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
9I9I Cryo-EM structure of CAK-CDK11 提交 2025-02-06	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 I 1–323（323 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9I9J Cryo-EM structure of CAK-CDK2 (determined in the presence of ADP-nitrate) 提交 2025-02-06	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 I 1–323（323 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9I9K Cryo-EM structure of CAK-CDK2 (determined in the presence of ADP-AlFx) 提交 2025-02-06	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 I 1–323（323 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å
9QCV Cryo-EM structure of CAK-CDK2-cyclin A2 bound to AMP-PNP 提交 2025-03-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 I 1–323（323 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
9QCX Cryo-EM structure of apo-CAK-CDK2-cyclin A2 提交 2025-03-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 I 1–323（323 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
9QJN Cryo-EM structure of the human CAK bound to OTS964 提交 2025-03-19	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–323（323 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NK3 OTS964 × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å
9SKQ Cryo-EM structure of CAK-CDK1-cyclin B1 提交 2025-09-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 I 1–323（323 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å

共 46 个其他 PDB 条目、47 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CCNH_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 2–324； UniProt 1–323

Cyclin-dependent kinase 7

Homo sapiens

UniProt P50613

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 J； UniProt 1–346	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） Cyclin-H × 1 （P51946） NS9 (2S,3S)-3-{[7-(benzylamino)-3-(1-methylethyl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino}butane-1,2,4-triol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8P6X	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1UA2 Crystal Structure of Human CDK7 提交 2004-08-11	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–346（346 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；277 K；Na Citrate, Na Acetate, PEG 4000, glycerol, NDSB201, ATP, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 4.0K	分辨率 3.02 Å R-free 0.288
1UA2 Crystal Structure of Human CDK7 提交 2004-08-11	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–346（346 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；277 K；Na Citrate, Na Acetate, PEG 4000, glycerol, NDSB201, ATP, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 4.0K	分辨率 3.02 Å R-free 0.288
1UA2 Crystal Structure of Human CDK7 提交 2004-08-11	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–346（346 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；277 K；Na Citrate, Na Acetate, PEG 4000, glycerol, NDSB201, ATP, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 4.0K	分辨率 3.02 Å R-free 0.288
1UA2 Crystal Structure of Human CDK7 提交 2004-08-11	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–346（346 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；277 K；Na Citrate, Na Acetate, PEG 4000, glycerol, NDSB201, ATP, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 4.0K	分辨率 3.02 Å R-free 0.288
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric	链 8 1–346（346 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
6XBZ Structure of the human CDK-activating kinase 提交 2020-06-07	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–346（346 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
6XD3 Structure of the human CAK in complex with THZ1 提交 2020-06-09	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–346（346 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	V0G N-(3-{[5-chloro-4-(1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}phenyl)-4-{[4-(dimethylamino)butanoyl]amino}benzamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7B5O Cryo-EM structure of the human CAK bound to ICEC0942 at 2.5 Angstroms resolution 提交 2020-12-05	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	I74 (3R,4R)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.50 Å
7B5Q Cryo-EM structure of the human CAK bound to ICEC0942 (PHENIX-OPLS3e) 提交 2020-12-05	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	I74 (3R,4R)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.50 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 8 1–346（346 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 8 1–346（346 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 8 1–346（346 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 8 1–346（346 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric	链 e 1–346（346 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric	链 8 1–346（346 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 8 1–346（346 aa）	突变：0	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric	链 8 1–346（346 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 HI 1–346（346 aa）	突变：K41A	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 HI 1–346（346 aa）	突变：K41A	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8ORM Cryo-EM structure of CAK-THZ1 提交 2023-04-14	配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	V0G N-(3-{[5-chloro-4-(1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}phenyl)-4-{[4-(dimethylamino)butanoyl]amino}benzamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
8P4Z Crystal structure of the human CDK7 kinase domain in complex with LDC4297 提交 2023-05-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 10–311（302 aa）	未记录	WZ8 2-[(3R)-piperidin-3-yl]oxy-8-propan-2-yl-N-[(2-pyrazol-1-ylphenyl)methyl]pyrazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-4-amine × 1 GOL GLYCEROL × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate, 12% w/v PEG 3350, 0.2 M NDSB-201	分辨率 2.75 Å R-free 0.251
8P4Z Crystal structure of the human CDK7 kinase domain in complex with LDC4297 提交 2023-05-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 10–311（302 aa）	未记录	WZ8 2-[(3R)-piperidin-3-yl]oxy-8-propan-2-yl-N-[(2-pyrazol-1-ylphenyl)methyl]pyrazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-4-amine × 1 GOL GLYCEROL × 6 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate, 12% w/v PEG 3350, 0.2 M NDSB-201	分辨率 2.75 Å R-free 0.251
8P6V Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0942 提交 2023-05-30	配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	I74 (3R,4R)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
8P6W Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor BS-181 提交 2023-05-30	配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	X2H ~{N}5-(6-azanylhexyl)-~{N}7-(phenylmethyl)-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-5,7-diamine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
8P6Y Cryo-EM structure of CAK in complex with nucleotide analogue ATPgS 提交 2023-05-30	配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
8P6Z Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0510-R 提交 2023-05-30	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	X4L N7-(phenylmethyl)-3-propan-2-yl-N5-[(3R)-pyrrolidin-3-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-5,7-diamine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.10 Å
8P70 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0510-S 提交 2023-05-30	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	X4Q N7-(phenylmethyl)-3-propan-2-yl-N5-[(3S)-pyrrolidin-3-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-5,7-diamine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.00 Å
8P71 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0574 提交 2023-05-30	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	X4F (3R,4S)-4-[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]pyrrolidin-3-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.00 Å
8P72 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0768 提交 2023-05-30	配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	X2Z ~{N}7-(phenylmethyl)-~{N}5-[(3~{S})-piperidin-3-yl]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-5,7-diamine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
8P73 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0829 提交 2023-05-30	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	X50 (3R,4R)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidine-3,4-diol × 1 X58 (3S,4S)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidine-3,4-diol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.00 Å
8P74 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0880 (ring-up conformation) 提交 2023-05-30	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	X3Z (2S,3S)-3-[[7-[(2-bromophenyl)methylamino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]butane-1,2,4-triol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.20 Å
8P75 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0880 (ring-down conformation) 提交 2023-05-30	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	X3Z (2S,3S)-3-[[7-[(2-bromophenyl)methylamino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]butane-1,2,4-triol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.00 Å
8P76 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0914 提交 2023-05-30	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	X1W N5-[(3S,4R)-4-phenylmethoxypyrrolidin-3-yl]-N7-(phenylmethyl)-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-5,7-diamine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.00 Å
8P77 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0943 提交 2023-05-30	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	I73 (3S,4S)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.80 Å
8P78 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor dinaciclib 提交 2023-05-30	配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	1QK 3-[({3-ethyl-5-[(2S)-2-(2-hydroxyethyl)piperidin-1-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-7-yl}amino)methyl]-1-hydroxypyridinium × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
8P79 Cryo-EM structure of CAK with averaged inhibitor density 提交 2023-05-30	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；Structure obtained by combining data from six samples of CAK bound to different non-covalent inhibitors. Four samples contained 5 mM beta-mercaptoethanol and two samples did not. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.70 Å
8P7L Cryo-EM structure of CDK7 subunit of CAK in complex with inhibitor LDC4297 提交 2023-05-30	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	WD9 2-[(3S)-piperidin-3-yl]oxy-8-propan-2-yl-N-[(2-pyrazol-1-ylphenyl)methyl]pyrazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-4-amine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.10 Å
8PLZ Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor CT7030 提交 2023-06-27	配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	ZQ6 (3~{R},4~{R})-4-[[[7-[(2-methoxyphenyl)methylamino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
8PYR Crystal structure of the dual T-loop phosphorylated Cdk7/CycH/Mat1 complex 提交 2023-07-26	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–346（346 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；288 K；0.1 M Hepes (pH 7.0), 12% (v/w) medium weight PEG mix of PEG6K and PEG4K, 10% ethylene-glycol, and 0.2 M NDSB	分辨率 2.15 Å R-free 0.241
8PYR Crystal structure of the dual T-loop phosphorylated Cdk7/CycH/Mat1 complex 提交 2023-07-26	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 1–346（346 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；288 K；0.1 M Hepes (pH 7.0), 12% (v/w) medium weight PEG mix of PEG6K and PEG4K, 10% ethylene-glycol, and 0.2 M NDSB	分辨率 2.15 Å R-free 0.241
8R99 A soakable crystal form of human CDK7 in complex with AMP-PNP 提交 2023-11-30	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–346（346 aa）	突变：W132R, S164D, T170E	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；.1M (NH4)3 citrate .2M NDSB-201 15.2% PEG 3350	分辨率 1.81 Å R-free 0.220
8R9A A soakable crystal form of human CDK7 in complex with AMP-PNP 提交 2023-11-30	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–346（346 aa）	突变：W132R,S164D, T170E	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 I74 (3R,4R)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；.2M Na2HPO4 20% PEG 3350	分辨率 1.71 Å R-free 0.294
8R9B A soakable crystal form of human CDK7 in complex with AMP-PNP 提交 2023-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–326（326 aa）	突变：S164D, T170E, del327-346	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；19% 2-propanol, 5% glycerol, 19%PEG4K, 0.095M Na3citrate pH5.6/HCl	分辨率 2.21 Å R-free 0.243
8R9B A soakable crystal form of human CDK7 in complex with AMP-PNP 提交 2023-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–326（326 aa）	突变：S164D, T170E, del327-346	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；19% 2-propanol, 5% glycerol, 19%PEG4K, 0.095M Na3citrate pH5.6/HCl	分辨率 2.21 Å R-free 0.243
8R9B A soakable crystal form of human CDK7 in complex with AMP-PNP 提交 2023-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–326（326 aa）	突变：S164D, T170E, del327-346	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；19% 2-propanol, 5% glycerol, 19%PEG4K, 0.095M Na3citrate pH5.6/HCl	分辨率 2.21 Å R-free 0.243
8R9B A soakable crystal form of human CDK7 in complex with AMP-PNP 提交 2023-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–326（326 aa）	突变：S164D, T170E, del327-346	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；19% 2-propanol, 5% glycerol, 19%PEG4K, 0.095M Na3citrate pH5.6/HCl	分辨率 2.21 Å R-free 0.243
8R9O A soakable crystal form of human CDK7 in complex with AMP-PNP 提交 2023-11-30	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–346（346 aa）	突变：W132R,S164D, T170E	YN3 ~{N}-[(1~{S})-2-(dimethylamino)-1-phenyl-ethyl]-6,6-dimethyl-3-[[4-(propanoylamino)phenyl]carbonylamino]-1,4-dihydropyrrolo[3,4-c]pyrazole-5-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1M (NH4)3 citrate 15% PEG 3350	分辨率 2.22 Å R-free 0.344
8R9O A soakable crystal form of human CDK7 in complex with AMP-PNP 提交 2023-11-30	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–346（346 aa）	突变：W132R,S164D, T170E	YN3 ~{N}-[(1~{S})-2-(dimethylamino)-1-phenyl-ethyl]-6,6-dimethyl-3-[[4-(propanoylamino)phenyl]carbonylamino]-1,4-dihydropyrrolo[3,4-c]pyrazole-5-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1M (NH4)3 citrate 15% PEG 3350	分辨率 2.22 Å R-free 0.344
8R9S A soakable crystal form of human CDK7 in complex with AMP-PNP 提交 2023-11-30	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–346（346 aa）	突变：W132R,S164D, T170E	PE3 3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39-TRIDECAOXAHENTETRACONTANE-1,41-DIOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 YPK [(3S)-1-[4-(dimethylamino)butanoyl]pyrrolidin-3-yl] 4-[(5-methyl-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-7-yl)amino]piperidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% Glycerol .02M KNa tartrate .02M NH4 acetate .02M Na formate .02M Na oxamate .02M Na3 citrate 10% PEG 4000 .1M pH=7.5 MOPS/NaHEPES	分辨率 2.78 Å R-free 0.296
8R9S A soakable crystal form of human CDK7 in complex with AMP-PNP 提交 2023-11-30	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–346（346 aa）	突变：W132R,S164D, T170E	PE3 3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39-TRIDECAOXAHENTETRACONTANE-1,41-DIOL × 2 YPK [(3S)-1-[4-(dimethylamino)butanoyl]pyrrolidin-3-yl] 4-[(5-methyl-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-7-yl)amino]piperidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% Glycerol .02M KNa tartrate .02M NH4 acetate .02M Na formate .02M Na oxamate .02M Na3 citrate 10% PEG 4000 .1M pH=7.5 MOPS/NaHEPES	分辨率 2.78 Å R-free 0.296
8R9U A soakable crystal form of human CDK7 in complex with AMP-PNP 提交 2023-11-30	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–346（346 aa）	突变：W132R,S164D, T170E	YNK 7-dimethylphosphoryl-3-[2-[[(3~{S})-6,6-dimethylpiperidin-3-yl]amino]-5-(trifluoromethyl)pyrimidin-4-yl]-1~{H}-indole-6-carbonitrile × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1M (NH4)3 citrate 15% PEG 3350	分辨率 1.94 Å R-free 0.340
8R9U A soakable crystal form of human CDK7 in complex with AMP-PNP 提交 2023-11-30	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–346（346 aa）	突变：W132R,S164D, T170E	YNK 7-dimethylphosphoryl-3-[2-[[(3~{S})-6,6-dimethylpiperidin-3-yl]amino]-5-(trifluoromethyl)pyrimidin-4-yl]-1~{H}-indole-6-carbonitrile × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1M (NH4)3 citrate 15% PEG 3350	分辨率 1.94 Å R-free 0.340
8S0R Cryo-EM structure of CAK modified by covalent inhibitor SY-1365 提交 2024-02-14	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	A1H46 ~{N}-[(1~{S},3~{R})-3-[[5-chloranyl-4-(1~{H}-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino]-1-methyl-cyclohexyl]-5-[4-(dimethylamino)butanoylamino]pyridine-2-carboxamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å
8S0T Cryo-EM structure of CAK in complex with SY-5609 提交 2024-02-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	YNK 7-dimethylphosphoryl-3-[2-[[(3~{S})-6,6-dimethylpiperidin-3-yl]amino]-5-(trifluoromethyl)pyrimidin-4-yl]-1~{H}-indole-6-carbonitrile × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；Buffer contained 54 uM inhibitor SY-5609. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.30 Å
9HIX Cryo-EM structure of CAK (CDK7 D97N mutant) in complex with THZ1 提交 2024-11-27	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	V0G N-(3-{[5-chloro-4-(1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}phenyl)-4-{[4-(dimethylamino)butanoyl]amino}benzamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
9HIY Cryo-EM structure of CAK (CDK7 D97N mutant) in complex with ATPgS 提交 2024-11-27	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.30 Å
9HJ0 Cryo-EM structure of CAK (CDK7 D97N mutant) in complex with Samuraciclib 提交 2024-11-27	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	I74 (3R,4R)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
9I9I Cryo-EM structure of CAK-CDK11 提交 2025-02-06	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9I9J Cryo-EM structure of CAK-CDK2 (determined in the presence of ADP-nitrate) 提交 2025-02-06	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9I9K Cryo-EM structure of CAK-CDK2 (determined in the presence of ADP-AlFx) 提交 2025-02-06	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å
9QCV Cryo-EM structure of CAK-CDK2-cyclin A2 bound to AMP-PNP 提交 2025-03-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
9QCX Cryo-EM structure of apo-CAK-CDK2-cyclin A2 提交 2025-03-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
9QJN Cryo-EM structure of the human CAK bound to OTS964 提交 2025-03-19	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	NK3 OTS964 × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å
9SKQ Cryo-EM structure of CAK-CDK1-cyclin B1 提交 2025-09-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 J 1–346（346 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å

共 53 个其他 PDB 条目、64 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CDK7_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 4–349； UniProt 1–346

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8p6x
沉积日期 deposition_date	2023-05-30
结构标题 title	Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor BS-194
关键词 keywords	Kinase, Inhibitor, Transcription, Cell Cycle, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	27.60 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	26.65 Å
零角强度 I(0) i0	80546100.00
分子量 molecular_weight	72591.0 kDa
排除体积 excluded_volume	91845 Å³
包络体积 envelope_volume	108270 Å³
水化壳体积 shell_volume	33522 Å³
包络直径 envelope_diameter	93.5 Å
壳层 Rg shell_rg	34.28 Å
包络 Rg envelope_rg	26.79 Å
形状 Rg shape_rg	26.63 Å
总 Rg total_rg	27.51 Å
总原子数 total_atoms	5112
残基数 n_residues	631
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	89.0 Å
Rg (实空间) rg_real	27.52 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.64 Å
I(0) (实空间) i0_real	8.0550e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.3270e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	27.55 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	80550000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8977
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	32.8 Å
偏度 Skewness skewness	0.275
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.416
角度范围 angular_range	— – 0.2850 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	24980000.0000
实空间数据点数 n_real_points	58
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.901; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.964

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	CDK-activating kinase assembly factor MAT1
分子量 formula_weight	10234.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H
原子数 atom_count	5284

SNAPVTFSTGIKMGQHISLAPIHKLEEALYEYQPLQIETYGPHVPELEMLGRLGYLNHVRAASPQDLAGGYTSSLACHRALQDAFSGLFWQPS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Cyclin-H
分子量 formula_weight	37721.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

XMYHNSSQKRHWTFSSEEQLARLRADANRKFRCKAVANGKVLPNDPVFLEPHEEMTLCKYYEKRLLEFCSVFKPAMPRSVVGTACMYFKRFYLNNSVMEYHPRIIMLTCAFLACKVDEFNVSSPQFVGNLRESPLGQEKALEQILEYELLLIQQLNFHLIVHNPYRPFEGFLIDLKTRYPILENPEILRKTADDFLNRIALTDAYLLYTPSQIALTAILSSASRAGITMESYLSESLMLKENRTCLSQLLDIMKSMRNLVKKYEPPRSEEVAVLKQKLERCHSAELALNVITKKRKGYEDDDYVSKKSKHEEEEWTDDDLVESL

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Cyclin-dependent kinase 7
分子量 formula_weight	39362.6 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.11.22,2.7.11.23
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

SNAMALDVKSRAKRYEKLDFLGEGQFATVYKARDKNTNQIVAIKKIKLGHRSEAKDGINRTALREIKLLQELSHPNIIGLLDAFGHKSNISLVFDFMETDLEVIIKDNSLVLTPSHIKAYMLMTLQGLEYLHQHWILHRDLKPNNLLLDENGVLKLADFGLAKSFGSPNRAYTHQVVTRWYRAPELLFGARMYGVGVDMWAVGCILAELLLRVPFLPGDSDLDQLTRIFETLGTPTEEQWPDMCSLPDYVTFKSFPGIPLHHIFSAAGDDLLDLIQGLFLFNPCARITATQALKMKYFSNRPGPTPGCQLPRPNCPVETLKEQSNPALAIKRKRTEALEQGGLPKKLIF

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	(2S,3S)-3-{[7-(benzylamino)-3-(1-methylethyl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino}butane-1,2,4-triol
分子量 formula_weight	385.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	144

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.90 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	688511

fit	/app/data/saxs_computation/p6/8p6x/8p6x.fit
pddf	/app/data/pr_computation/p6/8p6x/8p6x.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/p6/8p6x/8p6x.dat

Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor BS-194

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CDK-activating kinase assembly factor MAT1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Cyclin-H

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Cyclin-dependent kinase 7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)