8pkp

Cryo-EM structure of the apo Anaphase-promoting complex/cyclosome (APC/C) at 3.2 Angstrom resolution

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 275.1 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Anaphase-promoting complex subunit 1

Homo sapiens

UniProt Q9H1A4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 19 PDB 声明:19-meric(19) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–1944 未记录 Anaphase-promoting complex subunit 15 × 1 (P60006) Anaphase-promoting complex subunit CDC26 × 2 (Q8NHZ8) Anaphase-promoting complex subunit 16 × 1 (Q96DE5) Cell division cycle protein 27 homolog × 2 (P30260) Cell division cycle protein 16 homolog × 2 (Q13042) Anaphase-promoting complex subunit 10 × 1 (Q9UM13) Anaphase-promoting complex subunit 13 × 1 (Q9BS18) Anaphase-promoting complex subunit 5 × 1 (Q9UJX4) Cell division cycle protein 23 homolog × 2 (Q9UJX2) Anaphase-promoting complex subunit 7 × 2 (Q9UJX3) Anaphase-promoting complex subunit 4 × 1 (Q9UJX5) Anaphase-promoting complex subunit 2 × 1 (Q9UJX6) Anaphase-promoting complex subunit 11 × 1 (Q9NYG5) ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 18 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 APC1_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–1944; UniProt 1–1944

Anaphase-promoting complex subunit 15

Homo sapiens

UniProt P60006

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 19 PDB 声明:19-meric(19) 与蛋白拷贝数一致 链 D; UniProt 1–121 未记录 Anaphase-promoting complex subunit 1 × 1 (Q9H1A4) Anaphase-promoting complex subunit CDC26 × 2 (Q8NHZ8) Anaphase-promoting complex subunit 16 × 1 (Q96DE5) Cell division cycle protein 27 homolog × 2 (P30260) Cell division cycle protein 16 homolog × 2 (Q13042) Anaphase-promoting complex subunit 10 × 1 (Q9UM13) Anaphase-promoting complex subunit 13 × 1 (Q9BS18) Anaphase-promoting complex subunit 5 × 1 (Q9UJX4) Cell division cycle protein 23 homolog × 2 (Q9UJX2) Anaphase-promoting complex subunit 7 × 2 (Q9UJX3) Anaphase-promoting complex subunit 4 × 1 (Q9UJX5) Anaphase-promoting complex subunit 2 × 1 (Q9UJX6) Anaphase-promoting complex subunit 11 × 1 (Q9NYG5) ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 17 个其他 PDB 条目、17 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 APC15_HUMAN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–121; UniProt 1–121

Anaphase-promoting complex subunit CDC26

Homo sapiens

UniProt Q8NHZ8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 19 PDB 声明:19-meric(19) 与蛋白拷贝数一致 链 G; UniProt 1–85 链 W; UniProt 1–85 未记录 Anaphase-promoting complex subunit 1 × 1 (Q9H1A4) Anaphase-promoting complex subunit 15 × 1 (P60006) Anaphase-promoting complex subunit 16 × 1 (Q96DE5) Cell division cycle protein 27 homolog × 2 (P30260) Cell division cycle protein 16 homolog × 2 (Q13042) Anaphase-promoting complex subunit 10 × 1 (Q9UM13) Anaphase-promoting complex subunit 13 × 1 (Q9BS18) Anaphase-promoting complex subunit 5 × 1 (Q9UJX4) Cell division cycle protein 23 homolog × 2 (Q9UJX2) Anaphase-promoting complex subunit 7 × 2 (Q9UJX3) Anaphase-promoting complex subunit 4 × 1 (Q9UJX5) Anaphase-promoting complex subunit 2 × 1 (Q9UJX6) Anaphase-promoting complex subunit 11 × 1 (Q9NYG5) ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 20 个其他 PDB 条目、29 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CDC26_HUMAN
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–85; UniProt 1–85 作者链 W; PDB构建体 1–85; UniProt 1–85

Anaphase-promoting complex subunit 16

Homo sapiens

UniProt Q96DE5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 19 PDB 声明:19-meric(19) 与蛋白拷贝数一致 链 H; UniProt 1–110 未记录 Anaphase-promoting complex subunit 1 × 1 (Q9H1A4) Anaphase-promoting complex subunit 15 × 1 (P60006) Anaphase-promoting complex subunit CDC26 × 2 (Q8NHZ8) Cell division cycle protein 27 homolog × 2 (P30260) Cell division cycle protein 16 homolog × 2 (Q13042) Anaphase-promoting complex subunit 10 × 1 (Q9UM13) Anaphase-promoting complex subunit 13 × 1 (Q9BS18) Anaphase-promoting complex subunit 5 × 1 (Q9UJX4) Cell division cycle protein 23 homolog × 2 (Q9UJX2) Anaphase-promoting complex subunit 7 × 2 (Q9UJX3) Anaphase-promoting complex subunit 4 × 1 (Q9UJX5) Anaphase-promoting complex subunit 2 × 1 (Q9UJX6) Anaphase-promoting complex subunit 11 × 1 (Q9NYG5) ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 21 个其他 PDB 条目、21 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 APC16_HUMAN
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–110; UniProt 1–110

Cell division cycle protein 27 homolog

Homo sapiens

UniProt P30260

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 19 PDB 声明:19-meric(19) 与蛋白拷贝数一致 链 J; UniProt 1–824 链 P; UniProt 1–824 未记录 Anaphase-promoting complex subunit 1 × 1 (Q9H1A4) Anaphase-promoting complex subunit 15 × 1 (P60006) Anaphase-promoting complex subunit CDC26 × 2 (Q8NHZ8) Anaphase-promoting complex subunit 16 × 1 (Q96DE5) Cell division cycle protein 16 homolog × 2 (Q13042) Anaphase-promoting complex subunit 10 × 1 (Q9UM13) Anaphase-promoting complex subunit 13 × 1 (Q9BS18) Anaphase-promoting complex subunit 5 × 1 (Q9UJX4) Cell division cycle protein 23 homolog × 2 (Q9UJX2) Anaphase-promoting complex subunit 7 × 2 (Q9UJX3) Anaphase-promoting complex subunit 4 × 1 (Q9UJX5) Anaphase-promoting complex subunit 2 × 1 (Q9UJX6) Anaphase-promoting complex subunit 11 × 1 (Q9NYG5) ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CDC27_HUMAN
Isoform
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–824; UniProt 1–824 作者链 P; PDB构建体 1–824; UniProt 1–824

Cell division cycle protein 16 homolog

Homo sapiens

UniProt Q13042

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 19 PDB 声明:19-meric(19) 与蛋白拷贝数一致 链 K; UniProt 1–620 链 Q; UniProt 1–620 未记录 Anaphase-promoting complex subunit 1 × 1 (Q9H1A4) Anaphase-promoting complex subunit 15 × 1 (P60006) Anaphase-promoting complex subunit CDC26 × 2 (Q8NHZ8) Anaphase-promoting complex subunit 16 × 1 (Q96DE5) Cell division cycle protein 27 homolog × 2 (P30260) Anaphase-promoting complex subunit 10 × 1 (Q9UM13) Anaphase-promoting complex subunit 13 × 1 (Q9BS18) Anaphase-promoting complex subunit 5 × 1 (Q9UJX4) Cell division cycle protein 23 homolog × 2 (Q9UJX2) Anaphase-promoting complex subunit 7 × 2 (Q9UJX3) Anaphase-promoting complex subunit 4 × 1 (Q9UJX5) Anaphase-promoting complex subunit 2 × 1 (Q9UJX6) Anaphase-promoting complex subunit 11 × 1 (Q9NYG5) ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 20 个其他 PDB 条目、29 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CDC16_HUMAN
Isoform
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 1–620; UniProt 1–620 作者链 Q; PDB构建体 1–620; UniProt 1–620

Anaphase-promoting complex subunit 10

Homo sapiens

UniProt Q9UM13

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 19 PDB 声明:19-meric(19) 与蛋白拷贝数一致 链 L; UniProt 1–185 未记录 Anaphase-promoting complex subunit 1 × 1 (Q9H1A4) Anaphase-promoting complex subunit 15 × 1 (P60006) Anaphase-promoting complex subunit CDC26 × 2 (Q8NHZ8) Anaphase-promoting complex subunit 16 × 1 (Q96DE5) Cell division cycle protein 27 homolog × 2 (P30260) Cell division cycle protein 16 homolog × 2 (Q13042) Anaphase-promoting complex subunit 13 × 1 (Q9BS18) Anaphase-promoting complex subunit 5 × 1 (Q9UJX4) Cell division cycle protein 23 homolog × 2 (Q9UJX2) Anaphase-promoting complex subunit 7 × 2 (Q9UJX3) Anaphase-promoting complex subunit 4 × 1 (Q9UJX5) Anaphase-promoting complex subunit 2 × 1 (Q9UJX6) Anaphase-promoting complex subunit 11 × 1 (Q9NYG5) ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 APC10_HUMAN
Isoform
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 L; PDB构建体 1–185; UniProt 1–185

Anaphase-promoting complex subunit 13

Homo sapiens

UniProt Q9BS18

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 19 PDB 声明:19-meric(19) 与蛋白拷贝数一致 链 M; UniProt 1–74 未记录 Anaphase-promoting complex subunit 1 × 1 (Q9H1A4) Anaphase-promoting complex subunit 15 × 1 (P60006) Anaphase-promoting complex subunit CDC26 × 2 (Q8NHZ8) Anaphase-promoting complex subunit 16 × 1 (Q96DE5) Cell division cycle protein 27 homolog × 2 (P30260) Cell division cycle protein 16 homolog × 2 (Q13042) Anaphase-promoting complex subunit 10 × 1 (Q9UM13) Anaphase-promoting complex subunit 5 × 1 (Q9UJX4) Cell division cycle protein 23 homolog × 2 (Q9UJX2) Anaphase-promoting complex subunit 7 × 2 (Q9UJX3) Anaphase-promoting complex subunit 4 × 1 (Q9UJX5) Anaphase-promoting complex subunit 2 × 1 (Q9UJX6) Anaphase-promoting complex subunit 11 × 1 (Q9NYG5) ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 17 个其他 PDB 条目、17 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 APC13_HUMAN
Isoform
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 M; PDB构建体 1–74; UniProt 1–74

Anaphase-promoting complex subunit 5

Homo sapiens

UniProt Q9UJX4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 19 PDB 声明:19-meric(19) 与蛋白拷贝数一致 链 O; UniProt 1–755 未记录 Anaphase-promoting complex subunit 1 × 1 (Q9H1A4) Anaphase-promoting complex subunit 15 × 1 (P60006) Anaphase-promoting complex subunit CDC26 × 2 (Q8NHZ8) Anaphase-promoting complex subunit 16 × 1 (Q96DE5) Cell division cycle protein 27 homolog × 2 (P30260) Cell division cycle protein 16 homolog × 2 (Q13042) Anaphase-promoting complex subunit 10 × 1 (Q9UM13) Anaphase-promoting complex subunit 13 × 1 (Q9BS18) Cell division cycle protein 23 homolog × 2 (Q9UJX2) Anaphase-promoting complex subunit 7 × 2 (Q9UJX3) Anaphase-promoting complex subunit 4 × 1 (Q9UJX5) Anaphase-promoting complex subunit 2 × 1 (Q9UJX6) Anaphase-promoting complex subunit 11 × 1 (Q9NYG5) ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 19 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 APC5_HUMAN
Isoform
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 O; PDB构建体 1–755; UniProt 1–755

Cell division cycle protein 23 homolog

Homo sapiens

UniProt Q9UJX2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 19 PDB 声明:19-meric(19) 与蛋白拷贝数一致 链 U; UniProt 1–597 链 V; UniProt 1–597 未记录 Anaphase-promoting complex subunit 1 × 1 (Q9H1A4) Anaphase-promoting complex subunit 15 × 1 (P60006) Anaphase-promoting complex subunit CDC26 × 2 (Q8NHZ8) Anaphase-promoting complex subunit 16 × 1 (Q96DE5) Cell division cycle protein 27 homolog × 2 (P30260) Cell division cycle protein 16 homolog × 2 (Q13042) Anaphase-promoting complex subunit 10 × 1 (Q9UM13) Anaphase-promoting complex subunit 13 × 1 (Q9BS18) Anaphase-promoting complex subunit 5 × 1 (Q9UJX4) Anaphase-promoting complex subunit 7 × 2 (Q9UJX3) Anaphase-promoting complex subunit 4 × 1 (Q9UJX5) Anaphase-promoting complex subunit 2 × 1 (Q9UJX6) Anaphase-promoting complex subunit 11 × 1 (Q9NYG5) ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 19 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CDC23_HUMAN
Isoform
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 U; PDB构建体 1–597; UniProt 1–597 作者链 V; PDB构建体 1–597; UniProt 1–597

Anaphase-promoting complex subunit 7

Homo sapiens

UniProt Q9UJX3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 19 PDB 声明:19-meric(19) 与蛋白拷贝数一致 链 Y; UniProt 1–565 链 Z; UniProt 1–565 未记录 Anaphase-promoting complex subunit 1 × 1 (Q9H1A4) Anaphase-promoting complex subunit 15 × 1 (P60006) Anaphase-promoting complex subunit CDC26 × 2 (Q8NHZ8) Anaphase-promoting complex subunit 16 × 1 (Q96DE5) Cell division cycle protein 27 homolog × 2 (P30260) Cell division cycle protein 16 homolog × 2 (Q13042) Anaphase-promoting complex subunit 10 × 1 (Q9UM13) Anaphase-promoting complex subunit 13 × 1 (Q9BS18) Anaphase-promoting complex subunit 5 × 1 (Q9UJX4) Cell division cycle protein 23 homolog × 2 (Q9UJX2) Anaphase-promoting complex subunit 4 × 1 (Q9UJX5) Anaphase-promoting complex subunit 2 × 1 (Q9UJX6) Anaphase-promoting complex subunit 11 × 1 (Q9NYG5) ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 20 个其他 PDB 条目、21 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 APC7_HUMAN
Isoform
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 Y; PDB构建体 1–565; UniProt 1–565 作者链 Z; PDB构建体 1–565; UniProt 1–565

Anaphase-promoting complex subunit 4

Homo sapiens

UniProt Q9UJX5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 19 PDB 声明:19-meric(19) 与蛋白拷贝数一致 链 I; UniProt 1–808 未记录 Anaphase-promoting complex subunit 1 × 1 (Q9H1A4) Anaphase-promoting complex subunit 15 × 1 (P60006) Anaphase-promoting complex subunit CDC26 × 2 (Q8NHZ8) Anaphase-promoting complex subunit 16 × 1 (Q96DE5) Cell division cycle protein 27 homolog × 2 (P30260) Cell division cycle protein 16 homolog × 2 (Q13042) Anaphase-promoting complex subunit 10 × 1 (Q9UM13) Anaphase-promoting complex subunit 13 × 1 (Q9BS18) Anaphase-promoting complex subunit 5 × 1 (Q9UJX4) Cell division cycle protein 23 homolog × 2 (Q9UJX2) Anaphase-promoting complex subunit 7 × 2 (Q9UJX3) Anaphase-promoting complex subunit 2 × 1 (Q9UJX6) Anaphase-promoting complex subunit 11 × 1 (Q9NYG5) ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 APC4_HUMAN
Isoform
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–808; UniProt 1–808

Anaphase-promoting complex subunit 2

Homo sapiens

UniProt Q9UJX6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 19 PDB 声明:19-meric(19) 与蛋白拷贝数一致 链 N; UniProt 1–822 未记录 Anaphase-promoting complex subunit 1 × 1 (Q9H1A4) Anaphase-promoting complex subunit 15 × 1 (P60006) Anaphase-promoting complex subunit CDC26 × 2 (Q8NHZ8) Anaphase-promoting complex subunit 16 × 1 (Q96DE5) Cell division cycle protein 27 homolog × 2 (P30260) Cell division cycle protein 16 homolog × 2 (Q13042) Anaphase-promoting complex subunit 10 × 1 (Q9UM13) Anaphase-promoting complex subunit 13 × 1 (Q9BS18) Anaphase-promoting complex subunit 5 × 1 (Q9UJX4) Cell division cycle protein 23 homolog × 2 (Q9UJX2) Anaphase-promoting complex subunit 7 × 2 (Q9UJX3) Anaphase-promoting complex subunit 4 × 1 (Q9UJX5) Anaphase-promoting complex subunit 11 × 1 (Q9NYG5) ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 21 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ANC2_HUMAN
Isoform
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 N; PDB构建体 1–822; UniProt 1–822

Anaphase-promoting complex subunit 11

Homo sapiens

UniProt Q9NYG5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 19 PDB 声明:19-meric(19) 与蛋白拷贝数一致 链 C; UniProt 1–84 未记录 Anaphase-promoting complex subunit 1 × 1 (Q9H1A4) Anaphase-promoting complex subunit 15 × 1 (P60006) Anaphase-promoting complex subunit CDC26 × 2 (Q8NHZ8) Anaphase-promoting complex subunit 16 × 1 (Q96DE5) Cell division cycle protein 27 homolog × 2 (P30260) Cell division cycle protein 16 homolog × 2 (Q13042) Anaphase-promoting complex subunit 10 × 1 (Q9UM13) Anaphase-promoting complex subunit 13 × 1 (Q9BS18) Anaphase-promoting complex subunit 5 × 1 (Q9UJX4) Cell division cycle protein 23 homolog × 2 (Q9UJX2) Anaphase-promoting complex subunit 7 × 2 (Q9UJX3) Anaphase-promoting complex subunit 4 × 1 (Q9UJX5) Anaphase-promoting complex subunit 2 × 1 (Q9UJX6) ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 22 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 APC11_HUMAN
Isoform
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–84; UniProt 1–84

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8pkp

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8pkp
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8pkp
沉积日期 deposition_date2023-06-27
结构标题 titleCryo-EM structure of the apo Anaphase-promoting complex/cyclosome (APC/C) at 3.2 Angstrom resolution
关键词 keywordsAPC/C, cyclosome, Cdc20, Cdh1, ubiquitination, Emi1, mitosis, Cell cycle; CELL CYCLE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier75.00
回转半径 Rg (电子) rg_electron74.82
零角强度 I(0) i011007200000.00
分子量 molecular_weight905910.0 kDa
排除体积 excluded_volume1138900 ų
包络体积 envelope_volume1784600 ų
水化壳体积 shell_volume194790 ų
包络直径 envelope_diameter231.9
壳层 Rg shell_rg76.74
包络 Rg envelope_rg72.17
形状 Rg shape_rg74.80
总 Rg total_rg74.92
总原子数 total_atoms63725
残基数 n_residues8076
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax275.1
Rg (实空间) rg_real75.00
Rg 误差 (实空间) rg_real_error2.72
I(0) (实空间) i0_real1.1010e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.1220e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal75.34
I(0) (倒空间) i0_reciprocal11020000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8629
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary78.6
偏度 Skewness skewness0.175
峰度 Kurtosis kurtosis-0.654
角度范围 angular_range— – 0.1050 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0258
最高正则化参数 α highest_alpha891100000.0000
实空间数据点数 n_real_points22
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.746; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.981; Smooth: 0.993

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (15)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id8pkpK01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Tetratricopeptide repeat domain
结构域编号 domain_id8pkpQ01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Tetratricopeptide repeat domain

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)