|
7OLC
Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at idle POST state
提交 2021-05-19
|
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 80
PDB 声明:84-meric
|
链 LF
1–249(249 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 571
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
7OLD
Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at pe/E (TI)-POST state
提交 2021-05-19
|
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 80
PDB 声明:85-meric
|
链 LF
1–249(249 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
7Z3N
Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-1 conformation
提交 2022-03-02
|
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 82
PDB 声明:86-meric
|
链 LF
1–249(249 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 455
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
7Z3O
Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-2 conformation
提交 2022-03-02
|
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 82
PDB 声明:86-meric
|
链 LF
1–249(249 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 472
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
8I9P
Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16
提交 2023-02-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 31
PDB 声明:33-meric
|
链 CM
1–249(249 aa)
链 LF
1–249(249 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
8I9R
Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP
提交 2023-02-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 46
PDB 声明:49-meric
|
链 CM
1–249(249 aa)
链 LF
1–249(249 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
8I9T
Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-1
提交 2023-02-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 52
PDB 声明:55-meric
|
链 CM
1–249(249 aa)
链 LF
1–249(249 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ZN ZINC ION × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å
|
|
8I9V
Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2
提交 2023-02-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 53
PDB 声明:56-meric
|
链 CM
1–249(249 aa)
链 LF
1–249(249 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ZN ZINC ION × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
8I9W
Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3
提交 2023-02-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 50
PDB 声明:52-meric
|
链 CM
1–249(249 aa)
链 LF
1–249(249 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
8I9X
Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1
提交 2023-02-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 58
PDB 声明:60-meric
|
链 CM
1–249(249 aa)
链 LF
1–249(249 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å
|
|
8I9Y
Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2
提交 2023-02-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 57
PDB 声明:59-meric
|
链 CM
1–249(249 aa)
链 LF
1–249(249 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
8I9Z
Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4
提交 2023-02-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 58
PDB 声明:60-meric
|
链 CM
1–249(249 aa)
链 LF
1–249(249 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ZN ZINC ION × 2
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å
|
|
8IA0
Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6
提交 2023-02-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 62
PDB 声明:64-meric
|
链 CM
1–249(249 aa)
链 LF
1–249(249 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ZN ZINC ION × 3
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å
|
|
8OO0
Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 autoproteolysis product at the 80S ribosome
提交 2023-04-04
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:85-meric
|
链 LF
1–249(249 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
8PV1
Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure
提交 2023-07-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 55
PDB 声明:59-meric
|
链 CM
1–249(249 aa)
链 LF
1–249(249 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
ZN ZINC ION × 5
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.56 Å
|
|
8PV2
Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1
提交 2023-07-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 54
PDB 声明:57-meric
|
链 CM
1–249(249 aa)
链 LF
1–249(249 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
ZN ZINC ION × 5
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.63 Å
|
|
8PV3
Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure
提交 2023-07-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 55
PDB 声明:59-meric
|
链 CM
1–249(249 aa)
链 LF
1–249(249 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
ZN ZINC ION × 5
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å
|
|
8PV4
Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure
提交 2023-07-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 62
PDB 声明:66-meric
|
链 CM
1–249(249 aa)
链 LF
1–249(249 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
ZN ZINC ION × 5
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
8PV6
Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure
提交 2023-07-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 60
PDB 声明:64-meric
|
链 CM
1–249(249 aa)
链 LF
1–249(249 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
ZN ZINC ION × 5
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.94 Å
|
|
8PV7
Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure
提交 2023-07-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 55
PDB 声明:59-meric
|
链 CM
1–249(249 aa)
链 LF
1–249(249 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
ZN ZINC ION × 5
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.12 Å
|
|
8PV8
Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure
提交 2023-07-17
|
聚集状态不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 57
PDB 声明:60-meric
|
链 LF
1–249(249 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
ZN ZINC ION × 5
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.91 Å
|
|
8PVK
Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure
提交 2023-07-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 56
PDB 声明:60-meric
|
链 CM
1–249(249 aa)
链 LF
1–249(249 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
ZN ZINC ION × 5
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.55 Å
|
|
8PVL
Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure
提交 2023-07-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 54
PDB 声明:58-meric
|
链 CM
1–249(249 aa)
链 LF
1–249(249 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
ZN ZINC ION × 5
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.19 Å
|
|
9I1W
High resolution structure of the thermophilic 60S ribosomal subunit of Chaetomium thermophilum
提交 2025-01-17
|
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 47
PDB 声明:51-meric
|
链 LF
1–249(249 aa)
|
未记录
|
SPD SPERMIDINE × 2
SPM SPERMINE × 2
MG MAGNESIUM ION × 239
K POTASSIUM ION × 188
ZN ZINC ION × 5
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.38 Å
|
|
9I78
Cryo-EM structure of Chaetomium thermophilum ribosome-bound SND3 translocon
提交 2025-01-31
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 47
PDB 声明:50-meric
|
链 LF
1–249(249 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 379
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;waiting time: 15 s
blot force: 0
|
分辨率 2.20 Å
|