8sfe

Open state CCT-G beta 5 complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 192.1 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

T-complex protein 1 subunit zeta

物种未注明

UniProt P40227

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白拷贝数一致 链 Z; UniProt 17–524 链 z; UniProt 17–524 未记录 T-complex protein 1 subunit alpha × 2 (P17987) T-complex protein 1 subunit beta × 2 (P78371) T-complex protein 1 subunit delta × 2 (P50991) T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 (P48643) T-complex protein 1 subunit gamma × 2 (P49368) T-complex protein 1 subunit eta × 2 (Q99832) T-complex protein 1 subunit theta × 2 (P50990) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.36 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 64 个其他 PDB 条目、64 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 TCPZ_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 Z; PDB构建体 1–508; UniProt 17–524 作者链 z; PDB构建体 1–508; UniProt 17–524

T-complex protein 1 subunit alpha

物种未注明

UniProt P17987

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 2–537 链 a; UniProt 2–537 未记录 T-complex protein 1 subunit zeta × 2 (P40227) T-complex protein 1 subunit beta × 2 (P78371) T-complex protein 1 subunit delta × 2 (P50991) T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 (P48643) T-complex protein 1 subunit gamma × 2 (P49368) T-complex protein 1 subunit eta × 2 (Q99832) T-complex protein 1 subunit theta × 2 (P50990) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.36 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 64 个其他 PDB 条目、64 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 TCPA_HUMAN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–536; UniProt 2–537 作者链 a; PDB构建体 1–536; UniProt 2–537

T-complex protein 1 subunit beta

物种未注明

UniProt P78371

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 2–527 链 b; UniProt 2–527 未记录 T-complex protein 1 subunit zeta × 2 (P40227) T-complex protein 1 subunit alpha × 2 (P17987) T-complex protein 1 subunit delta × 2 (P50991) T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 (P48643) T-complex protein 1 subunit gamma × 2 (P49368) T-complex protein 1 subunit eta × 2 (Q99832) T-complex protein 1 subunit theta × 2 (P50990) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.36 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 64 个其他 PDB 条目、64 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 TCPB_HUMAN
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–526; UniProt 2–527 作者链 b; PDB构建体 1–526; UniProt 2–527

T-complex protein 1 subunit delta

物种未注明

UniProt P50991

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白拷贝数一致 链 D; UniProt 19–539 链 d; UniProt 19–539 未记录 T-complex protein 1 subunit zeta × 2 (P40227) T-complex protein 1 subunit alpha × 2 (P17987) T-complex protein 1 subunit beta × 2 (P78371) T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 (P48643) T-complex protein 1 subunit gamma × 2 (P49368) T-complex protein 1 subunit eta × 2 (Q99832) T-complex protein 1 subunit theta × 2 (P50990) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.36 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 65 个其他 PDB 条目、65 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 TCPD_HUMAN
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–521; UniProt 19–539 作者链 d; PDB构建体 1–521; UniProt 19–539

T-complex protein 1 subunit epsilon

物种未注明

UniProt P48643

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白拷贝数一致 链 E; UniProt 2–541 链 e; UniProt 2–541 未记录 T-complex protein 1 subunit zeta × 2 (P40227) T-complex protein 1 subunit alpha × 2 (P17987) T-complex protein 1 subunit beta × 2 (P78371) T-complex protein 1 subunit delta × 2 (P50991) T-complex protein 1 subunit gamma × 2 (P49368) T-complex protein 1 subunit eta × 2 (Q99832) T-complex protein 1 subunit theta × 2 (P50990) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.36 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 68 个其他 PDB 条目、68 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 TCPE_HUMAN
Isoform
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–540; UniProt 2–541 作者链 e; PDB构建体 1–540; UniProt 2–541

T-complex protein 1 subunit gamma

物种未注明

UniProt P49368

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白拷贝数一致 链 G; UniProt 3–530 链 g; UniProt 3–530 未记录 T-complex protein 1 subunit zeta × 2 (P40227) T-complex protein 1 subunit alpha × 2 (P17987) T-complex protein 1 subunit beta × 2 (P78371) T-complex protein 1 subunit delta × 2 (P50991) T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 (P48643) T-complex protein 1 subunit eta × 2 (Q99832) T-complex protein 1 subunit theta × 2 (P50990) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.36 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 65 个其他 PDB 条目、65 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 TCPG_HUMAN
Isoform
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–528; UniProt 3–530 作者链 g; PDB构建体 1–528; UniProt 3–530

T-complex protein 1 subunit eta

物种未注明

UniProt Q99832

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白拷贝数一致 链 H; UniProt 1–528 链 h; UniProt 1–528 未记录 T-complex protein 1 subunit zeta × 2 (P40227) T-complex protein 1 subunit alpha × 2 (P17987) T-complex protein 1 subunit beta × 2 (P78371) T-complex protein 1 subunit delta × 2 (P50991) T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 (P48643) T-complex protein 1 subunit gamma × 2 (P49368) T-complex protein 1 subunit theta × 2 (P50990) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.36 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 63 个其他 PDB 条目、63 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TCPH_HUMAN
Isoform
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–528; UniProt 1–528 作者链 h; PDB构建体 1–528; UniProt 1–528

T-complex protein 1 subunit theta

物种未注明

UniProt P50990

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白拷贝数一致 链 Q; UniProt 2–539 链 q; UniProt 2–539 未记录 T-complex protein 1 subunit zeta × 2 (P40227) T-complex protein 1 subunit alpha × 2 (P17987) T-complex protein 1 subunit beta × 2 (P78371) T-complex protein 1 subunit delta × 2 (P50991) T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 (P48643) T-complex protein 1 subunit gamma × 2 (P49368) T-complex protein 1 subunit eta × 2 (Q99832) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.36 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 64 个其他 PDB 条目、64 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 TCPQ_HUMAN
Isoform
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 Q; PDB构建体 1–538; UniProt 2–539 作者链 q; PDB构建体 1–538; UniProt 2–539

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8sfe

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8sfe
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8sfe
沉积日期 deposition_date2023-04-10
结构标题 titleOpen state CCT-G beta 5 complex
关键词 keywordsCCT, Gb5, complex, open, CHAPERONE; CHAPERONE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier72.57
回转半径 Rg (电子) rg_electron72.02
零角强度 I(0) i010466600000.00
分子量 molecular_weight865540.0 kDa
排除体积 excluded_volume1084800 ų
包络体积 envelope_volume2030800 ų
水化壳体积 shell_volume226830 ų
包络直径 envelope_diameter212.9
壳层 Rg shell_rg83.65
包络 Rg envelope_rg66.37
形状 Rg shape_rg72.03
总 Rg total_rg72.14
总原子数 total_atoms60512
残基数 n_residues7881
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax192.1
Rg (实空间) rg_real72.07
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.55
I(0) (实空间) i0_real1.0460e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.7680e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal74.16
I(0) (倒空间) i0_reciprocal10510000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8258
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary113.5
偏度 Skewness skewness-0.196
峰度 Kurtosis kurtosis-0.538
角度范围 angular_range— – 0.1100 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0026
最高正则化参数 α highest_alpha3027000000.0000
实空间数据点数 n_real_points23
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.930; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.940; Smooth: 0.000

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)