9c57

Reconstituted P400 Subcomplex of the human TIP60 complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

RuvB-like 1

Homo sapiens

UniProt Q9Y265

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 13 Enhancer of polycomb homolog 1 × 1 (Q9H2F5) Actin-like protein 6A × 2 (O96019) RuvB-like 2 × 3 (Q9Y230) E1A-binding protein p400 × 1 (Q96L91) DNA methyltransferase 1-associated protein 1 × 1 (Q9NPF5) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (P60709) Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog × 1 (Q15906) PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 7 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RUVB1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–456; UniProt 1–456 作者链 C; PDB构建体 1–456; UniProt 1–456 作者链 E; PDB构建体 1–456; UniProt 1–456

Enhancer of polycomb homolog 1

Homo sapiens

UniProt Q9H2F5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 13 RuvB-like 1 × 3 (Q9Y265) Actin-like protein 6A × 2 (O96019) RuvB-like 2 × 3 (Q9Y230) E1A-binding protein p400 × 1 (Q96L91) DNA methyltransferase 1-associated protein 1 × 1 (Q9NPF5) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (P60709) Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog × 1 (Q15906) PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 7 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 EPC1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–836; UniProt 1–836

Actin-like protein 6A

Homo sapiens

UniProt O96019

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 13 RuvB-like 1 × 3 (Q9Y265) Enhancer of polycomb homolog 1 × 1 (Q9H2F5) RuvB-like 2 × 3 (Q9Y230) E1A-binding protein p400 × 1 (Q96L91) DNA methyltransferase 1-associated protein 1 × 1 (Q9NPF5) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (P60709) Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog × 1 (Q15906) PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 7 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 ACL6A_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 L; PDB构建体 1–429; UniProt 1–429 作者链 M; PDB构建体 1–429; UniProt 1–429

RuvB-like 2

Homo sapiens

UniProt Q9Y230

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 13 RuvB-like 1 × 3 (Q9Y265) Enhancer of polycomb homolog 1 × 1 (Q9H2F5) Actin-like protein 6A × 2 (O96019) E1A-binding protein p400 × 1 (Q96L91) DNA methyltransferase 1-associated protein 1 × 1 (Q9NPF5) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (P60709) Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog × 1 (Q15906) PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 7 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RUVB2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–463; UniProt 1–463 作者链 D; PDB构建体 1–463; UniProt 1–463 作者链 F; PDB构建体 1–463; UniProt 1–463

E1A-binding protein p400

Homo sapiens

UniProt Q96L91

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 13 RuvB-like 1 × 3 (Q9Y265) Enhancer of polycomb homolog 1 × 1 (Q9H2F5) Actin-like protein 6A × 2 (O96019) RuvB-like 2 × 3 (Q9Y230) DNA methyltransferase 1-associated protein 1 × 1 (Q9NPF5) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (P60709) Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog × 1 (Q15906) PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 7 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 EP400_HUMAN
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–3159; UniProt 1–3159

DNA methyltransferase 1-associated protein 1

Homo sapiens

UniProt Q9NPF5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 13 RuvB-like 1 × 3 (Q9Y265) Enhancer of polycomb homolog 1 × 1 (Q9H2F5) Actin-like protein 6A × 2 (O96019) RuvB-like 2 × 3 (Q9Y230) E1A-binding protein p400 × 1 (Q96L91) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (P60709) Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog × 1 (Q15906) PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 7 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 DMAP1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–467; UniProt 1–467

Actin, cytoplasmic 1

Homo sapiens

UniProt P60709

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 13 RuvB-like 1 × 3 (Q9Y265) Enhancer of polycomb homolog 1 × 1 (Q9H2F5) Actin-like protein 6A × 2 (O96019) RuvB-like 2 × 3 (Q9Y230) E1A-binding protein p400 × 1 (Q96L91) DNA methyltransferase 1-associated protein 1 × 1 (Q9NPF5) Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog × 1 (Q15906) PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 7 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 ACTB_HUMAN
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–375; UniProt 1–375

Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog

Homo sapiens

UniProt Q15906

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 13 RuvB-like 1 × 3 (Q9Y265) Enhancer of polycomb homolog 1 × 1 (Q9H2F5) Actin-like protein 6A × 2 (O96019) RuvB-like 2 × 3 (Q9Y230) E1A-binding protein p400 × 1 (Q96L91) DNA methyltransferase 1-associated protein 1 × 1 (Q9NPF5) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (P60709) PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 7 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 VPS72_HUMAN
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 1–364; UniProt 1–364

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9c57
沉积日期 deposition_date2024-06-05
结构标题 titleReconstituted P400 Subcomplex of the human TIP60 complex
关键词 keywordscomplex, chromatin regulator, GENE REGULATION; GENE REGULATION
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9c57__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9c57__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

9c57__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)62.09 Å
Rg(电子密度)61.69 Å
总 Rg61.70 Å
原子数77055
残基数4845
排除体积684640 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 9c57__assembly_1__model_1 tridecameric (13) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (10)

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7. 引用文献 (1)