DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 其他组合 异源复合物 蛋白 × 18 DNA 2 RNA 1 PDB 声明:21-meric(21) 与全部聚合物数一致 | 链 A; UniProt 1–1390 | 未记录 | DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2 × 1 (Q9NW08) DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1 × 1 (O15160) DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9 × 1 (O75575) DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 (P19388) DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 (P61218) DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC8 × 1 (Q9Y535) DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 (P52434) DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10 × 1 (Q9Y2Y1) DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 (P62875) DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2 × 1 (P0DPB6) DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 (P53803) DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5 × 1 (Q9NVU0) DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4 × 1 (P05423) DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3 × 1 (Q9BUI4) DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC6 × 1 (Q9H1D9) DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC7 × 1 (O15318) Transcription factor IIIB 50 kDa subunit × 1 (Q9HAW0) DNA (104-MER) × 1 DNA (104-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*CP*UP*CP*GP*CP*UP*UP*CP*GP*G)-3') ; × 1 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE-PROPANE | 分辨率 3.00 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 9K2G | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7A6H Cryo-EM structure of human apo RNA Polymerase III 提交 2020-08-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 17 PDB 声明:heptadecameric |
链 A
1–1390(1390 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Wait time 10 s
Blot force 4
Blot time 4 s
|
分辨率 3.30 Å |
| 7AE1 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 1 提交 2020-09-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 17 PDB 声明:eicosameric |
链 A
1–1390(1390 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Wait time 10 s
Blot force 4
Blot time 4 s
|
分辨率 2.80 Å |
| 7AE3 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 3 提交 2020-09-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 17 PDB 声明:eicosameric |
链 A
1–1390(1390 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Wait time 10 s
Blot force 4
Blot time 4 s
|
分辨率 3.10 Å |
| 7AEA Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 2 提交 2020-09-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 17 PDB 声明:eicosameric |
链 A
1–1390(1390 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Wait time 10 s
Blot force 4
Blot time 4 s
|
分辨率 3.40 Å |
| 7AST Apo Human RNA Polymerase III 提交 2020-10-28 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 17 PDB 声明:heptadecameric |
链 N
1–1390(1390 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 7D58 cryo-EM structure of human RNA polymerase III in elongating state 提交 2020-09-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 17 PDB 声明:eicosameric |
链 A
1–1390(1390 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 7D59 cryo-EM structure of human RNA polymerase III in apo state 提交 2020-09-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 17 PDB 声明:heptadecameric |
链 A
1–1390(1390 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7DN3 Structure of Human RNA Polymerase III elongation complex 提交 2020-12-08 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 17 PDB 声明:eicosameric |
链 A
1–1390(1390 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 7DU2 RNA polymerase III EC complex in post-translocation state 提交 2021-01-07 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 17 PDB 声明:eicosameric |
链 A
1–1390(1390 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.35 Å |
| 7FJI human Pol III elongation complex 提交 2021-08-04 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 17 PDB 声明:eicosameric |
链 A
1–1390(1390 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
|
分辨率 3.60 Å |
| 7FJJ human Pol III pre-termination complex 提交 2021-08-04 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 17 PDB 声明:eicosameric |
链 A
1–1390(1390 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
|
分辨率 3.60 Å |
| 8ITY human RNA polymerase III pre-initiation complex closed DNA 1 提交 2023-03-23 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:25-meric |
链 A
1–1390(1390 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 8IUE RNA polymerase III pre-initiation complex melting complex 1 提交 2023-03-24 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:25-meric |
链 A
1–1390(1390 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 8IUH RNA polymerase III pre-initiation complex open complex 1 提交 2023-03-24 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:25-meric |
链 A
1–1390(1390 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9FSO Human RNA Polymerase III Class III Open Pre-initiation Complex 1 (OC1) 提交 2024-06-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:25-meric |
链 A
1–1390(1390 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.28 Å |
| 9FSP RNA Polymerase III Class III Open Pre-initation Complex 2 (OC2) 提交 2024-06-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:25-meric |
链 A
1–1390(1390 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.39 Å |
| 9FSQ RNA Polymerase III Class III Melting Pre-Initiation Complex (MC) 提交 2024-06-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:25-meric |
链 A
1–1390(1390 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.51 Å |
| 9FSR RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-initiation Complex 1 (OC1-mini) 提交 2024-06-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:25-meric |
链 A
1–1390(1390 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.76 Å |
| 9FSS RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-Initiation complex 2 (OC2-mini) 提交 2024-06-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:25-meric |
链 A
1–1390(1390 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.14 Å |
| 9K36 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 12 (TC12) 提交 2024-10-18 | 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:21-meric |
链 A
1–1390(1390 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9K38 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 6 (TC6) 提交 2024-10-18 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:21-meric |
链 A
1–1390(1390 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9K39 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 8 (TC8) 提交 2024-10-18 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:21-meric |
链 A
1–1390(1390 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9K3B Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 10 overall (TC10-overall) 提交 2024-10-18 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:26-meric |
链 A
1–1390(1390 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 9K3U Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5) 提交 2024-10-20 | 聚集状态不同 配体/离子不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:26-meric |
链 A
1–1390(1390 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9K3V Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 4 (TC4) 提交 2024-10-20 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:26-meric |
链 A
1–1390(1390 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9LKT Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 10 (TC10) 提交 2025-01-16 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:21-meric |
链 A
1–1390(1390 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9LXN Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5)(without 3'dATP) 提交 2025-02-18 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:26-meric |
链 A
1–1390(1390 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9LXO Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 6 (TC6)(without 3'dATP) 提交 2025-02-18 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:21-meric |
链 A
1–1390(1390 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.60 Å |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | RPC1_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–1390; UniProt 1–1390 |