9qgk

F-actin decorated by ITPKA

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 177.3 Å Quality: REASONABLE

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Inositol-trisphosphate 3-kinase A

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric（13）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–461 链 B； UniProt 1–461 链 C； UniProt 1–461 链 D； UniProt 1–461 链 E； UniProt 1–461	未记录	Actin, alpha skeletal muscle × 5 （P68139） Phalloidin × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.97 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9QGK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1W2C Human Inositol (1,4,5) trisphosphate 3-kinase complexed with Mn2+/AMPPNP/Ins(1,4,5)P3 提交 2004-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 197–461（265 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 197-461	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 I3P D-MYO-INOSITOL-1,4,5-TRIPHOSPHATE × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；0.835 M NA CITRATE, 0.1 M NACL, 0.1 M TRIS PH=8, pH 8.00	分辨率 1.95 Å R-free 0.243
1W2C Human Inositol (1,4,5) trisphosphate 3-kinase complexed with Mn2+/AMPPNP/Ins(1,4,5)P3 提交 2004-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 197–461（265 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 197-461	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 I3P D-MYO-INOSITOL-1,4,5-TRIPHOSPHATE × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；0.835 M NA CITRATE, 0.1 M NACL, 0.1 M TRIS PH=8, pH 8.00	分辨率 1.95 Å R-free 0.243
1W2D Human Inositol (1,4,5)-trisphosphate 3-kinase complexed with Mn2+/ADP/Ins(1,3,4,5)P4 提交 2004-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 197–461（265 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 197-461	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 4IP INOSITOL-(1,3,4,5)-TETRAKISPHOSPHATE × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；0.82 M NA CITRATE, 0.1 M NACL, 0.1 M TRIS PH 8.	分辨率 1.94 Å R-free 0.267
1W2D Human Inositol (1,4,5)-trisphosphate 3-kinase complexed with Mn2+/ADP/Ins(1,3,4,5)P4 提交 2004-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 197–461（265 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 197-461	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 4IP INOSITOL-(1,3,4,5)-TETRAKISPHOSPHATE × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；0.82 M NA CITRATE, 0.1 M NACL, 0.1 M TRIS PH 8.	分辨率 1.94 Å R-free 0.267
1W2F Human Inositol (1,4,5)-trisphosphate 3-kinase substituted with selenomethionine 提交 2004-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 187–461（275 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 186-461	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；0.9 M NA CITRATE, 0.1 M NACL, 0.1 M TRIS PH 8.	分辨率 1.80 Å R-free 0.241
1W2F Human Inositol (1,4,5)-trisphosphate 3-kinase substituted with selenomethionine 提交 2004-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 187–461（275 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 186-461	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；0.9 M NA CITRATE, 0.1 M NACL, 0.1 M TRIS PH 8.	分辨率 1.80 Å R-free 0.241
4UPU Crystal structure of IP3 3-K calmodulin binding region in complex with Calmodulin 提交 2014-06-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric	链 B 158–183（26 aa）片段：CALMODULIN BINDING REGION, RESIDUES 158-183	未记录	CA CALCIUM ION × 120 GOL GLYCEROL × 24	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4；29% W/V POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M SODIUM ACETATE TRIHYDRATE PH 4.0 AND 10 MM SPERMIDINE	分辨率 2.34 Å R-free 0.210
8PP8 Human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A (IP3K) catalytic domain in complex with L-scyllo-inositol 1,2,4-trisphosphate/AMP-PNP/Mn 提交 2023-07-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 188–461（274 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 3IA L-scyllo-inositol 1,2,4-trisphosphate × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.81 M sodium citrate, 0.1M Tris pH 8.5 and 0.1 M NaCl. Protein:precipitant ratio 1:1. Protein concentration: 17 mg/ml. Protein buffer: 20 mM Tris pH 7.5, 50 mM ammonium sulfate and 2 mM DTT. Soaking 2h with 1.5 M lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 5 mM ligand, 3 mM AMP-PNP and 3 mM MnCl2.	分辨率 1.59 Å R-free 0.212
8PP8 Human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A (IP3K) catalytic domain in complex with L-scyllo-inositol 1,2,4-trisphosphate/AMP-PNP/Mn 提交 2023-07-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 188–461（274 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 3IA L-scyllo-inositol 1,2,4-trisphosphate × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.81 M sodium citrate, 0.1M Tris pH 8.5 and 0.1 M NaCl. Protein:precipitant ratio 1:1. Protein concentration: 17 mg/ml. Protein buffer: 20 mM Tris pH 7.5, 50 mM ammonium sulfate and 2 mM DTT. Soaking 2h with 1.5 M lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 5 mM ligand, 3 mM AMP-PNP and 3 mM MnCl2.	分辨率 1.59 Å R-free 0.212
8PP9 Human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A (IP3K) catalytic domain in complex with scyllo-inositol 1,2,3,5-tetrakisphosphate/ADP/Mn 提交 2023-07-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 188–461（274 aa）	未记录	4IM scyllo-inositol 1,2,3,5-tetrakisphosphate × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.81 M sodium citrate, 0.1M Tris pH 8.5 and 0.1 M NaCl. Protein:precipitant ratio 1:1. Protein concentration: 17 mg/ml. Protein buffer: 20 mM Tris pH 7.5, 50 mM ammonium sulfate and 2 mM DTT. Soaking 2h with 1.5 M lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 5 mM ligand, 3 mM ADP and 3 mM MnCl2.	分辨率 1.73 Å R-free 0.210
8PP9 Human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A (IP3K) catalytic domain in complex with scyllo-inositol 1,2,3,5-tetrakisphosphate/ADP/Mn 提交 2023-07-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 188–461（274 aa）	未记录	4IM scyllo-inositol 1,2,3,5-tetrakisphosphate × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.81 M sodium citrate, 0.1M Tris pH 8.5 and 0.1 M NaCl. Protein:precipitant ratio 1:1. Protein concentration: 17 mg/ml. Protein buffer: 20 mM Tris pH 7.5, 50 mM ammonium sulfate and 2 mM DTT. Soaking 2h with 1.5 M lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 5 mM ligand, 3 mM ADP and 3 mM MnCl2.	分辨率 1.73 Å R-free 0.210
8PPA Human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A (IP3K) catalytic domain in complex with D-myo-inositol 1,4,6-trisphosphate/AMP-PNP/Mn 提交 2023-07-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 188–461（274 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 06G D-myo-inositol 1,4,6-trisphosphate × 1 SO4 SULFATE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.81 M sodium citrate, 0.1M Tris pH 8.5 and 0.1 M NaCl. Protein:precipitant ratio 1:1. Protein concentration: 18 mg/ml. Protein buffer: 20 mM Tris pH 7.5, 50 mM ammonium sulfate and 2 mM DTT. Soaking 2h with 1.5 M lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 5 mM ligand, 3 mM AMP-PNP and 3 mM MnCl2.	分辨率 1.73 Å R-free 0.218
8PPA Human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A (IP3K) catalytic domain in complex with D-myo-inositol 1,4,6-trisphosphate/AMP-PNP/Mn 提交 2023-07-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 188–461（274 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 06G D-myo-inositol 1,4,6-trisphosphate × 1 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.81 M sodium citrate, 0.1M Tris pH 8.5 and 0.1 M NaCl. Protein:precipitant ratio 1:1. Protein concentration: 18 mg/ml. Protein buffer: 20 mM Tris pH 7.5, 50 mM ammonium sulfate and 2 mM DTT. Soaking 2h with 1.5 M lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 5 mM ligand, 3 mM AMP-PNP and 3 mM MnCl2.	分辨率 1.73 Å R-free 0.218
8PPA Human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A (IP3K) catalytic domain in complex with D-myo-inositol 1,4,6-trisphosphate/AMP-PNP/Mn 提交 2023-07-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 188–461（274 aa）链 B 188–461（274 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 06G D-myo-inositol 1,4,6-trisphosphate × 2 SO4 SULFATE ION × 6 MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.81 M sodium citrate, 0.1M Tris pH 8.5 and 0.1 M NaCl. Protein:precipitant ratio 1:1. Protein concentration: 18 mg/ml. Protein buffer: 20 mM Tris pH 7.5, 50 mM ammonium sulfate and 2 mM DTT. Soaking 2h with 1.5 M lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 5 mM ligand, 3 mM AMP-PNP and 3 mM MnCl2.	分辨率 1.73 Å R-free 0.218
8PPB Human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A (IP3K) catalytic domain in complex with D-3-deoxy-myo-inositol 1,4,6-trisphosphate/ATP/Mn 提交 2023-07-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 188–461（274 aa）	未记录	3I2 D-3-deoxy-myo-inositol 1,4,6-trisphosphate × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.84 M sodium citrate, 0.1M Tris pH 8.5 and 0.1 M NaCl. Protein:precipitant ratio 1:1. Protein concentration: 18 mg/ml. Protein buffer: 20 mM Tris pH 7.5, 50 mM ammonium sulfate and 2 mM DTT. Soaking 2h with 1.5 M lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 5 mM ligand, 3 mM ATP and 3 mM MnCl2.	分辨率 1.80 Å R-free 0.216
8PPB Human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A (IP3K) catalytic domain in complex with D-3-deoxy-myo-inositol 1,4,6-trisphosphate/ATP/Mn 提交 2023-07-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 188–461（274 aa）	未记录	3I2 D-3-deoxy-myo-inositol 1,4,6-trisphosphate × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.84 M sodium citrate, 0.1M Tris pH 8.5 and 0.1 M NaCl. Protein:precipitant ratio 1:1. Protein concentration: 18 mg/ml. Protein buffer: 20 mM Tris pH 7.5, 50 mM ammonium sulfate and 2 mM DTT. Soaking 2h with 1.5 M lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 5 mM ligand, 3 mM ATP and 3 mM MnCl2.	分辨率 1.80 Å R-free 0.216
8PPC Human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A (IP3K) catalytic domain in complex with L-chiro-inositol 2,3,5-trisphosphate/ATP/Mn 提交 2023-07-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 188–461（274 aa）	未记录	2KM L-chiro-inositol 2,3,5-trisphosphate × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.80 M sodium citrate, 0.1M Tris pH 8.5 and 0.1 M NaCl. Protein:precipitant ratio 1:1. Protein concentration: 9 mg/ml. Protein buffer: 20 mM Tris pH 7.5, 50 mM ammonium sulfate and 2 mM DTT. Soaking 2h with 1.5 M lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 5 mM ligand, 3 mM ATP and 3 mM MnCl2.	分辨率 1.92 Å R-free 0.219
8PPC Human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A (IP3K) catalytic domain in complex with L-chiro-inositol 2,3,5-trisphosphate/ATP/Mn 提交 2023-07-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 188–461（274 aa）	未记录	2KM L-chiro-inositol 2,3,5-trisphosphate × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.80 M sodium citrate, 0.1M Tris pH 8.5 and 0.1 M NaCl. Protein:precipitant ratio 1:1. Protein concentration: 9 mg/ml. Protein buffer: 20 mM Tris pH 7.5, 50 mM ammonium sulfate and 2 mM DTT. Soaking 2h with 1.5 M lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 5 mM ligand, 3 mM ATP and 3 mM MnCl2.	分辨率 1.92 Å R-free 0.219
8PPD Human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A (IP3K) catalytic domain in complex with DL-6-deoxy-6-hydroxy-methyl-scyllo-inositol 1,2,4-trisphosphate/ATP/Mn 提交 2023-07-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 188–461（274 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 75I DL-6-deoxy-6-hydroxy-methyl-scyllo-inositol 1,2,4-trisphosphate × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.83 M sodium citrate, 0.1M Tris pH 8.5 and 0.1 M NaCl. Protein:precipitant ratio 1:1. Protein concentration: 18 mg/ml. Protein buffer: 20 mM Tris pH 7.5, 50 mM ammonium sulfate and 2 mM DTT. Soaking 2h with 1.5 M lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 10 mM ligand, 3 mM ATP and 3 mM MnCl2.	分辨率 1.77 Å R-free 0.230
8PPD Human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A (IP3K) catalytic domain in complex with DL-6-deoxy-6-hydroxy-methyl-scyllo-inositol 1,2,4-trisphosphate/ATP/Mn 提交 2023-07-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 188–461（274 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 75I DL-6-deoxy-6-hydroxy-methyl-scyllo-inositol 1,2,4-trisphosphate × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.83 M sodium citrate, 0.1M Tris pH 8.5 and 0.1 M NaCl. Protein:precipitant ratio 1:1. Protein concentration: 18 mg/ml. Protein buffer: 20 mM Tris pH 7.5, 50 mM ammonium sulfate and 2 mM DTT. Soaking 2h with 1.5 M lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 10 mM ligand, 3 mM ATP and 3 mM MnCl2.	分辨率 1.77 Å R-free 0.230
8PPE Human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A (IP3K) catalytic domain in complex with DL-6-deoxy-6-phosphoryloxymethyl-scyllo-inositol 1,2,4-trisphosphate/ADP/Mn 提交 2023-07-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 188–461（274 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7I8 DL-6-deoxy-6-phosphoryloxymethyl-scyllo-inositol 1,2,4-trisphosphate × 1 GOL GLYCEROL × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.81 M sodium citrate, 0.1M Tris pH 8.5 and 0.1 M NaCl. Protein:precipitant ratio 1:1. Protein concentration: 17 mg/ml. Protein buffer: 20 mM Tris pH 7.5, 50 mM ammonium sulfate and 2 mM DTT. Soaking overnight with 0.83 M sodium citrate, 0.1 M Tris pH 8.5, 0.1 M NaCl, 30 mM ligand, 3 mM ADP and 3 mM MnCl2. Cryoprotectant: Glycerol 30%.	分辨率 1.59 Å R-free 0.240
8PPE Human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A (IP3K) catalytic domain in complex with DL-6-deoxy-6-phosphoryloxymethyl-scyllo-inositol 1,2,4-trisphosphate/ADP/Mn 提交 2023-07-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 188–461（274 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7I8 DL-6-deoxy-6-phosphoryloxymethyl-scyllo-inositol 1,2,4-trisphosphate × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.81 M sodium citrate, 0.1M Tris pH 8.5 and 0.1 M NaCl. Protein:precipitant ratio 1:1. Protein concentration: 17 mg/ml. Protein buffer: 20 mM Tris pH 7.5, 50 mM ammonium sulfate and 2 mM DTT. Soaking overnight with 0.83 M sodium citrate, 0.1 M Tris pH 8.5, 0.1 M NaCl, 30 mM ligand, 3 mM ADP and 3 mM MnCl2. Cryoprotectant: Glycerol 30%.	分辨率 1.59 Å R-free 0.240
8PPF Human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A (IP3K) catalytic domain in complex with beta-D-glucopyranosyl 1,3,4-trisphosphate/AMP-PNP/Mg 提交 2023-07-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 188–461（274 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 6II beta-D-glucopyranosyl 1,3,4-trisphosphate × 1 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.81 M sodium citrate, 0.1M Tris pH 8.5 and 0.1 M NaCl. Protein:precipitant ratio 1:1. Protein concentration: 18 mg/ml. Protein buffer: 20 mM Tris pH 7.5, 50 mM ammonium sulfate and 2 mM DTT. Soaking 2h with 1.5 M lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 5 mM ligand, 3 mM AMP-PNP and 3 mM MgCl2.	分辨率 1.85 Å R-free 0.228
8PPF Human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A (IP3K) catalytic domain in complex with beta-D-glucopyranosyl 1,3,4-trisphosphate/AMP-PNP/Mg 提交 2023-07-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 188–461（274 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 6II beta-D-glucopyranosyl 1,3,4-trisphosphate × 1 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.81 M sodium citrate, 0.1M Tris pH 8.5 and 0.1 M NaCl. Protein:precipitant ratio 1:1. Protein concentration: 18 mg/ml. Protein buffer: 20 mM Tris pH 7.5, 50 mM ammonium sulfate and 2 mM DTT. Soaking 2h with 1.5 M lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 5 mM ligand, 3 mM AMP-PNP and 3 mM MgCl2.	分辨率 1.85 Å R-free 0.228
8PPG Human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A (IP3K) catalytic domain in complex with beta-D-glucopyranosyl 1,3,4,6-tetrakisphosphate/ADP/Mn after reaction 提交 2023-07-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 188–461（274 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 46I beta-D-glucopyranosyl 1,3,4,6-tetrakisphosphate × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.81 M sodium citrate, 0.1M Tris pH 8.5 and 0.1 M NaCl. Protein:precipitant ratio 1:1. Protein concentration: 17 mg/ml. Protein buffer: 20 mM Tris pH 7.5, 50 mM ammonium sulfate and 2 mM DTT. Soaking overnight with 1.5 M lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 7 mM beta-D-glucopyranosyl 1,3,4-trisphosphate (substrate), 10 mM ATP and 10 mM MnCl2.	分辨率 1.75 Å R-free 0.243
8PPG Human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A (IP3K) catalytic domain in complex with beta-D-glucopyranosyl 1,3,4,6-tetrakisphosphate/ADP/Mn after reaction 提交 2023-07-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 188–461（274 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 46I beta-D-glucopyranosyl 1,3,4,6-tetrakisphosphate × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.81 M sodium citrate, 0.1M Tris pH 8.5 and 0.1 M NaCl. Protein:precipitant ratio 1:1. Protein concentration: 17 mg/ml. Protein buffer: 20 mM Tris pH 7.5, 50 mM ammonium sulfate and 2 mM DTT. Soaking overnight with 1.5 M lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 7 mM beta-D-glucopyranosyl 1,3,4-trisphosphate (substrate), 10 mM ATP and 10 mM MnCl2.	分辨率 1.75 Å R-free 0.243
8PPH Human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A (IP3K) catalytic domain in complex with alpha-D-glucopyranosyl 1,3,4-trisphosphate/ATP/Mn 提交 2023-07-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 188–461（274 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5AI alpha-D-glucopyranosyl 1,3,4-trisphosphate × 1 SO4 SULFATE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.84 M sodium citrate, 0.1M Tris pH 8.5 and 0.1 M NaCl. Protein:precipitant ratio 1:1. Protein concentration: 18 mg/ml. Protein buffer: 20 mM Tris pH 7.5, 50 mM ammonium sulfate and 2 mM DTT. Soaking 2h with 1.5 M lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 5 mM ligand, 3 mM ATP and 3 mM MnCl2.	分辨率 1.70 Å R-free 0.231
8PPH Human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A (IP3K) catalytic domain in complex with alpha-D-glucopyranosyl 1,3,4-trisphosphate/ATP/Mn 提交 2023-07-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 188–461（274 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.84 M sodium citrate, 0.1M Tris pH 8.5 and 0.1 M NaCl. Protein:precipitant ratio 1:1. Protein concentration: 18 mg/ml. Protein buffer: 20 mM Tris pH 7.5, 50 mM ammonium sulfate and 2 mM DTT. Soaking 2h with 1.5 M lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 5 mM ligand, 3 mM ATP and 3 mM MnCl2.	分辨率 1.70 Å R-free 0.231
8PPI Human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A (IP3K) catalytic domain in complex with beta-D-glucopyranosylmethanol 3,4,1'-trisphosphate/ATP/Mn 提交 2023-07-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 188–461（274 aa）	未记录	69I beta-D-glucopyranosylmethanol 3,4,1'-trisphosphate × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.81 M sodium citrate, 0.1M Tris pH 8.5 and 0.1 M NaCl. Protein:precipitant ratio 1:1. Protein concentration: 18 mg/ml. Protein buffer: 20 mM Tris pH 7.5, 50 mM ammonium sulfate and 2 mM DTT. Soaking 2h with 1.5 M lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 5 mM ligand, 3 mM ATP and 3 mM MnCl2.	分辨率 1.65 Å R-free 0.214
8PPI Human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A (IP3K) catalytic domain in complex with beta-D-glucopyranosylmethanol 3,4,1'-trisphosphate/ATP/Mn 提交 2023-07-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 188–461（274 aa）	未记录	69I beta-D-glucopyranosylmethanol 3,4,1'-trisphosphate × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.81 M sodium citrate, 0.1M Tris pH 8.5 and 0.1 M NaCl. Protein:precipitant ratio 1:1. Protein concentration: 18 mg/ml. Protein buffer: 20 mM Tris pH 7.5, 50 mM ammonium sulfate and 2 mM DTT. Soaking 2h with 1.5 M lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 5 mM ligand, 3 mM ATP and 3 mM MnCl2.	分辨率 1.65 Å R-free 0.214
8PPJ Human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A (IP3K) catalytic domain in complex with beta-D-glucopyranosylmethanol 3,4,6,1'-tetrakisphosphate/ADP/Mn after reaction 提交 2023-07-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 188–461（274 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 661 beta-D-glucopyranosylmethanol 3,4,6,1'-tetrakisphosphate × 1 SO4 SULFATE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.80 M sodium citrate, 0.1M Tris pH 8.5 and 0.1 M NaCl. Protein:precipitant ratio 1:1. Protein concentration: 17 mg/ml. Protein buffer: 20 mM Tris pH 7.5, 50 mM ammonium sulfate and 2 mM DTT. Soaking overnight with 1.5 M lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 7 mM beta-D-glucopyranosylmethanol 3,4,1'-trisphosphate (substrate), 10 mM ATP and 10 mM MnCl2.	分辨率 1.75 Å R-free 0.234
8PPJ Human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A (IP3K) catalytic domain in complex with beta-D-glucopyranosylmethanol 3,4,6,1'-tetrakisphosphate/ADP/Mn after reaction 提交 2023-07-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 188–461（274 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 661 beta-D-glucopyranosylmethanol 3,4,6,1'-tetrakisphosphate × 1 SO4 SULFATE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.80 M sodium citrate, 0.1M Tris pH 8.5 and 0.1 M NaCl. Protein:precipitant ratio 1:1. Protein concentration: 17 mg/ml. Protein buffer: 20 mM Tris pH 7.5, 50 mM ammonium sulfate and 2 mM DTT. Soaking overnight with 1.5 M lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 7 mM beta-D-glucopyranosylmethanol 3,4,1'-trisphosphate (substrate), 10 mM ATP and 10 mM MnCl2.	分辨率 1.75 Å R-free 0.234

共 16 个其他 PDB 条目、32 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	IP3KA_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–461； UniProt 1–461 作者链 B； PDB构建体 1–461； UniProt 1–461 作者链 C； PDB构建体 1–461； UniProt 1–461 作者链 D； PDB构建体 1–461； UniProt 1–461 作者链 E； PDB构建体 1–461； UniProt 1–461

Actin, alpha skeletal muscle

Gallus

UniProt P68139

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric（13）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 1–377 链 G； UniProt 1–377 链 H； UniProt 1–377 链 I； UniProt 1–377 链 J； UniProt 1–377	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Inositol-trisphosphate 3-kinase A × 5 （P23677） Phalloidin × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.97 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9QGK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1MDU Crystal structure of the chicken actin trimer complexed with human gelsolin segment 1 (GS-1) 提交 2002-08-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 12 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；PEG 3350, tris, calcium chloride, magnesium chloride, ADP, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.20 Å R-free 0.233
1MDU Crystal structure of the chicken actin trimer complexed with human gelsolin segment 1 (GS-1) 提交 2002-08-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；PEG 3350, tris, calcium chloride, magnesium chloride, ADP, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.20 Å R-free 0.233
5YU8 Cofilin decorated actin filament 提交 2017-11-21	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 3–377（375 aa）链 B 3–377（375 aa）链 C 3–377（375 aa）链 D 3–377（375 aa）链 E 3–377（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6D8C Cryo-EM structure of FLNaABD E254K bound to phalloidin-stabilized F-actin 提交 2018-04-26	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 H 3–377（375 aa）链 J 3–377（375 aa）链 K 3–377（375 aa）链 L 3–377（375 aa）链 M 3–377（375 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.54 Å
6DJM Cryo-EM structure of AMPPNP-actin filaments 提交 2018-05-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 3–377（375 aa）链 B 3–377（375 aa）链 C 3–377（375 aa）链 D 3–377（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 4 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
6DJN Cryo-EM structure of ADP-Pi-actin filaments 提交 2018-05-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 3–377（375 aa）链 B 3–377（375 aa）链 C 3–377（375 aa）链 D 3–377（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
6DJO Cryo-EM structure of ADP-actin filaments 提交 2018-05-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 3–377（375 aa）链 B 3–377（375 aa）链 C 3–377（375 aa）链 D 3–377（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
6M5G F-actin-Utrophin complex 提交 2020-03-10	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 D 1–377（377 aa）链 E 1–377（377 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot for 3 seconds	分辨率 3.60 Å
6UPV Alpha-E-catenin ABD-F-actin complex 提交 2019-10-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 3–377（375 aa）链 B 3–377（375 aa）链 C 3–377（375 aa）链 D 3–377（375 aa）链 E 3–377（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6UPW Metavinculin ABD-F-actin complex 提交 2019-10-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 3–377（375 aa）链 B 3–377（375 aa）链 C 3–377（375 aa）链 D 3–377（375 aa）链 E 3–377（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
6X5Z Bovine Cardiac Myosin in Complex with Chicken Skeletal Actin and Human Cardiac Tropomyosin in the Rigor State 提交 2020-05-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Thin filaments were reconstituted by first mixing F-actin and tropomyosin to final concentrations of 10 uM actin and 7 uM tropomyosin. Just before applying 1.5 uL actin-tropomyosin to a freshly glow discharged holey-carbon grid, the surfactant octyl B-D-glucopyranoside was added to the protein solution to a concentration of 12 nM. The grid sample was manually blotted for 1 second and a 1.5 uL drop of 7.5 uM myosin-S1 sub-fragment was then applied to the blotted grid sample. The sample was immediately blotted for 4 seconds and plunge-frozen in liquid ethane.	分辨率 4.24 Å
7BT7 F-actin-ADP complex structure 提交 2020-03-31	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 D 1–377（377 aa）链 E 1–377（377 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot for 3.5 seconds	分辨率 3.80 Å
7BTE Lifeact-F-actin complex 提交 2020-04-01	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 E 1–377（377 aa）链 G 1–377（377 aa）链 I 1–377（377 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50mM KCl,1mM MgCl2,0.2mM EGTA, 10mM Imidazole buffer pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot for 3.5 seconds	分辨率 4.20 Å
7BTI Phalloidin bound F-actin complex 提交 2020-04-01	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 D 1–377（377 aa）链 E 1–377（377 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50mM KCl,1mM MgCl2,0.2mM EGTA, 10mM Imidazole buffer pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot for 3.5 seconds	分辨率 3.60 Å
7K20 Cryo-EM structure of pyrene-labeled ADP-actin filaments 提交 2020-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 3–377（375 aa）链 B 3–377（375 aa）链 C 3–377（375 aa）链 D 3–377（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 1T4 N-(pyren-1-yl)acetamide × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7K21 Cryo-EM structure of pyrene-labeled ADP-Pi-actin filaments 提交 2020-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 3–377（375 aa）链 B 3–377（375 aa）链 C 3–377（375 aa）链 D 3–377（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 4 1T4 N-(pyren-1-yl)acetamide × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7KCH Myosin XI-F-actin complex 提交 2020-10-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 G 1–377（377 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM imidazole pH 7.0,50 mM KCl,1mM MgCl2, 1mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.33 Å
7R8V Cryo-EM structure of the ADP state actin filament 提交 2021-06-27	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 7–377（371 aa）链 B 7–377（371 aa）链 C 7–377（371 aa）链 D 7–377（371 aa）链 E 7–377（371 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.82 Å
7R91 cryo-EM structure of the rigor state wild type myosin-15-F-actin complex 提交 2021-06-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 7–377（371 aa）链 B 7–377（371 aa）链 C 7–377（371 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.83 Å
7R94 T-Plastin-F-actin complex 提交 2021-06-28	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 D 1–377（377 aa）链 E 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
7RB8 cryo-EM structure of the ADP state wild type myosin-15-F-actin complex 提交 2021-07-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 5–377（373 aa）链 B 5–377（373 aa）链 C 5–377（373 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.63 Å
7RB9 Cryo-EM structure of the rigor state Jordan myosin-15-F-actin complex 提交 2021-07-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 5–377（373 aa）链 B 5–377（373 aa）链 C 5–377（373 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.76 Å
7SX8 T-Plastin-F-actin complex, parallel bundled state 提交 2021-11-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 E 1–377（377 aa）链 G 1–377（377 aa）链 H 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.00 Å
7SX9 T-Plastin-F-actin complex, anti-parallel bundled state 提交 2021-11-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 E 1–377（377 aa）链 G 1–377（377 aa）链 H 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.00 Å
7SXA T-Plastin-F-actin complex, pre-bundling intermediate state 提交 2021-11-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 D 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.87 Å
7UDT cryo-EM structure of the rigor state wild type myosin-15-F-actin complex (symmetry expansion and re-centering) 提交 2022-03-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 5–377（373 aa）链 B 5–377（373 aa）链 C 5–377（373 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.17 Å
7UDU cryo-EM structure of the ADP state wild type myosin-15-F-actin complex (symmetry expansion and re-centering) 提交 2022-03-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 5–377（373 aa）链 B 5–377（373 aa）链 C 5–377（373 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.15 Å
7W4Z Crystal structure of fragmin domain-1 in complex with actin (AMPPNP-form) 提交 2021-11-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM Na2HPO4, 19% PEG3350	分辨率 1.15 Å R-free 0.158
7W50 Crystal structure of fragmin domain-1 in complex with actin (ADP-Pi-form) 提交 2021-11-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM Na2HPO4, 18% PEG3350	分辨率 1.15 Å R-free 0.162
7W51 Crystal structure of fragmin domain-1 in complex with actin (ADP-form) 提交 2021-11-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M HEPES-NaOH, pH 8.0, 16% PEG3350	分辨率 1.20 Å R-free 0.176
7W52 Crystal structure of fragmin domain-1 (15-160) in complex with actin 提交 2021-11-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 ACT ACETATE ION × 3 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 4.5, 0.1 M calcium acetate, and 7% PEG3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.246
7W52 Crystal structure of fragmin domain-1 (15-160) in complex with actin 提交 2021-11-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 ACT ACETATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 4.5, 0.1 M calcium acetate, and 7% PEG3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.246
7W52 Crystal structure of fragmin domain-1 (15-160) in complex with actin 提交 2021-11-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 4.5, 0.1 M calcium acetate, and 7% PEG3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.246
7W52 Crystal structure of fragmin domain-1 (15-160) in complex with actin 提交 2021-11-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 4.5, 0.1 M calcium acetate, and 7% PEG3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.246
7YNE Crystal structure of fragmin domain-1 (1-160) in complex with G-form actin 提交 2022-07-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 ACT ACETATE ION × 3 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 5.0, 0.1 M calcium acetate, and 12% PEG4000	分辨率 2.70 Å R-free 0.308
7YNE Crystal structure of fragmin domain-1 (1-160) in complex with G-form actin 提交 2022-07-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 ACT ACETATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 5.0, 0.1 M calcium acetate, and 12% PEG4000	分辨率 2.70 Å R-free 0.308
7YNE Crystal structure of fragmin domain-1 (1-160) in complex with G-form actin 提交 2022-07-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 5.0, 0.1 M calcium acetate, and 12% PEG4000	分辨率 2.70 Å R-free 0.308
7YNE Crystal structure of fragmin domain-1 (1-160) in complex with G-form actin 提交 2022-07-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 5.0, 0.1 M calcium acetate, and 12% PEG4000	分辨率 2.70 Å R-free 0.308
8C4C F-actin decorated by SipA497-669 提交 2023-01-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 D 1–377（377 aa）链 E 1–377（377 aa）链 F 1–377（377 aa）链 G 1–377（377 aa）链 H 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 PO4 PHOSPHATE ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；5 mM Tris buffer, pH 7.5, 0.1 mM DTT, 0.2 mM ATP, 0.2 mM EGTA and 0.05 mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.70 Å
8C4E F-actin decorated by SipA426-685 提交 2023-01-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 D 1–377（377 aa）链 E 1–377（377 aa）链 F 1–377（377 aa）链 G 1–377（377 aa）链 H 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 PO4 PHOSPHATE ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；5 mM Tris buffer, pH 7.5, 0.1 mM DTT, 0.2 mM ATP, 0.2 mM EGTA and 0.05 mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.60 Å
8D13 Helical ADP-F-actin 提交 2022-05-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.43 Å
8D14 Helical ADP-Pi-F-actin 提交 2022-05-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.51 Å
8D15 Bent ADP-F-actin 提交 2022-05-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 D 1–377（377 aa）链 E 1–377（377 aa）链 F 1–377（377 aa）链 G 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.61 Å
8D16 Bent ADP-Pi-F-actin 提交 2022-05-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 7–377（371 aa）链 B 7–377（371 aa）链 C 7–377（371 aa）链 D 7–377（371 aa）链 E 7–377（371 aa）链 F 7–377（371 aa）链 G 7–377（371 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 PO4 PHOSPHATE ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.71 Å
8D17 Straight ADP-F-actin 1 提交 2022-05-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 D 1–377（377 aa）链 E 1–377（377 aa）链 F 1–377（377 aa）链 G 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.69 Å
8D18 Straight ADP-F-actin 2 提交 2022-05-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 D 1–377（377 aa）链 E 1–377（377 aa）链 F 1–377（377 aa）链 G 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.66 Å
8E9B Cryo-EM structure of S. pombe Arp2/3 complex in the branch junction 提交 2022-08-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 H 3–377（375 aa）链 I 3–377（375 aa）链 M 3–377（375 aa）链 N 3–377（375 aa）链 O 3–377（375 aa）链 P 3–377（375 aa）链 Q 3–377（375 aa）链 R 3–377（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8R3H Phalloidin bound F-actin 提交 2023-11-09	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 F 1–377（377 aa）链 G 1–377（377 aa）链 H 1–377（377 aa）链 I 1–377（377 aa）链 J 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.13 Å
8SYF Homology model of Acto-HMM complex in ADP-state. Chicken smooth muscle HMM and chicken pectoralis actin 提交 2023-05-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 3–377（375 aa）链 D 3–377（375 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 19.00 Å
8VFM Salmonella effector protein SipA decorated actin filament 提交 2023-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 J 1–377（377 aa）链 L 1–377（377 aa）链 M 1–377（377 aa）链 N 1–377（377 aa）链 R 1–377（377 aa）链 S 1–377（377 aa）链 U 1–377（377 aa）链 W 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8VO5 Cryo-EM structure of fascin bound to F-actin (actin binding site 1) 提交 2024-01-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 5–377（373 aa）链 C 5–377（373 aa）链 D 5–377（373 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8VO6 Cryo-EM structure of fascin bound to F-actin (actin binding site 2) 提交 2024-01-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 5–377（373 aa）链 F 5–377（373 aa）链 G 5–377（373 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8VO7 Cryo-EM structure of fascin crosslinked F-actin 提交 2024-01-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 B 5–377（373 aa）链 C 5–377（373 aa）链 D 5–377（373 aa）链 E 5–377（373 aa）链 F 5–377（373 aa）链 G 5–377（373 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8VO8 Cryo-EM structure of fascin crosslinked F-actin (Eigen_left) 提交 2024-01-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 B 5–377（373 aa）链 C 5–377（373 aa）链 D 5–377（373 aa）链 E 5–377（373 aa）链 F 5–377（373 aa）链 G 5–377（373 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8VO9 Cryo-EM structure of fascin crosslinked F-actin (Eigen_middle) 提交 2024-01-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 B 5–377（373 aa）链 C 5–377（373 aa）链 D 5–377（373 aa）链 E 5–377（373 aa）链 F 5–377（373 aa）链 G 5–377（373 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8VOA Cryo-EM structure of fascin crosslinked F-actin (Eigen_right) 提交 2024-01-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 B 5–377（373 aa）链 C 5–377（373 aa）链 D 5–377（373 aa）链 E 5–377（373 aa）链 F 5–377（373 aa）链 G 5–377（373 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
9DVA F-actin binding interface of alpha-E-catenin ABD (cadherin-catenin complex) and afadin 提交 2024-10-07	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 3–377（375 aa）链 B 3–377（375 aa）链 C 3–377（375 aa）链 D 3–377（375 aa）链 E 3–377（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9JUS Structure of villin bound to an actin trimer 提交 2024-10-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 f 1–377（377 aa）链 g 1–377（377 aa）链 p 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 8 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.5 10% PEG 3350 0.2 M KSCN 5 mM CaCl2/MgCl2	分辨率 2.70 Å R-free 0.226
9JUS Structure of villin bound to an actin trimer 提交 2024-10-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 1–377（377 aa）链 G 1–377（377 aa）链 P 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 8 SCN THIOCYANATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.5 10% PEG 3350 0.2 M KSCN 5 mM CaCl2/MgCl2	分辨率 2.70 Å R-free 0.226
9JVT Structure of the C-terminal 4 domains (V4-V6-HP) villin bound to an actin 提交 2024-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 g 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Tris, pH 8.0 50% PEG 400 0.2 M Li2SO4 1 mM CaCl2	分辨率 3.29 Å R-free 0.268
9JVT Structure of the C-terminal 4 domains (V4-V6-HP) villin bound to an actin 提交 2024-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Tris, pH 8.0 50% PEG 400 0.2 M Li2SO4 1 mM CaCl2	分辨率 3.29 Å R-free 0.268
9JW0 Structure of the N-terminal 3 domains (V1-V3) villin bound to actin 提交 2024-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–377（377 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 8.5, 20% PEG 3350, 0.2 M sodium nitrate, 1 mM CaCl2	分辨率 2.69 Å R-free 0.259
9L2N Crystal structure of Cytochalasin D bound to a filamentous conformation actin 提交 2024-12-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 3–377（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 CY9 (3S,3aR,4S,6S,6aR,7E,10S,12R,13E,15R,15aR)-3-benzyl-6,12-dihydroxy-4,10,12-trimethyl-5-methylidene-1,11-dioxo-2,3,3a,4,5,6,6a,9,10,11,12,15-dodecahydro-1H-cycloundeca[d]isoindol-15-yl acetate × 1 CA CALCIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；17% (w/v) PEG3350 and 20 mM Na2HPO4	分辨率 1.70 Å R-free 0.204
9M5E Structure of SPIN90 dimer-Arp2/3 complex-nucleated actin filament (singlet complex) 提交 2025-03-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 I 1–377（377 aa）链 J 1–377（377 aa）链 K 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.55 Å
9M64 Structure of SPIN90 dimer-Arp2/3 complexes-nucleated actin filaments (Doublet Complex) 提交 2025-03-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 I 1–377（377 aa）链 J 1–377（377 aa）链 K 1–377（377 aa）链 L 1–377（377 aa）链 i 1–377（377 aa）链 j 1–377（377 aa）链 k 1–377（377 aa）链 l 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9SGK F-actin in complex with USP54 M1 actin binding motif 提交 2025-08-22	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 F 1–377（377 aa）链 G 1–377（377 aa）链 H 1–377（377 aa）链 I 1–377（377 aa）链 J 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	ACTS_CHICK
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 G； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 H； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 I； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 J； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9qgk
沉积日期 deposition_date	2025-03-13
结构标题 title	F-actin decorated by ITPKA
关键词 keywords	actin, CYTOSOLIC PROTEIN; CYTOSOLIC PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	46.98 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	47.50 Å
零角强度 I(0) i0	745393000.00
分子量 molecular_weight	223250.0 kDa
排除体积 excluded_volume	278430 Å³
包络体积 envelope_volume	363460 Å³
水化壳体积 shell_volume	67139 Å³
包络直径 envelope_diameter	189.9 Å
壳层 Rg shell_rg	47.78 Å
包络 Rg envelope_rg	47.79 Å
形状 Rg shape_rg	47.51 Å
总 Rg total_rg	47.48 Å
总原子数 total_atoms	30895
残基数 n_residues	1977
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	177.3 Å
Rg (实空间) rg_real	47.51 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	2.40 Å
I(0) (实空间) i0_real	7.4540e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.4860e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	46.98 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	744900000.0000
解质量估计 total_estimate	0.5815
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	46.9 Å
偏度 Skewness skewness	0.619
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.074
角度范围 angular_range	— – 0.1700 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	96260000.0000
实空间数据点数 n_real_points	35
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.558; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.021; Positv: 1.000; Valcen: 0.882; Smooth: 0.935

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Inositol-trisphosphate 3-kinase A
分子量 formula_weight	51083.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	5

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E
原子数 atom_count	30895

MTLPGGPTGMARPGGARPCSPGLERAPRRSVGELRLLFEARCAAVAAAAAAGEPRARGAKRRGGQVPNGLPRAPPAPVIPQLTVTAEEPDVPPTSPGPPERERDCLPAAGSSHLQQPRRLSTSSVSSTGSSSLLEDSEDDLLSDSESRSRGNVQLEAGEDVGQKNHWQKIRTMVNLPVISPFKKRYAWVQLAGHTGSFKAAGTSGLILKRCSEPERYCLARLMADALRGCVPAFHGVVERDGESYLQLQDLLDGFDGPCVLDCKMGVRTYLEEELTKARERPKLRKDMYKKMLAVDPEAPTEEEHAQRAVTKPRYMQWREGISSSTTLGFRIEGIKKADGSCSTDFKTTRSREQVLRVFEEFVQGDEEVLRRYLNRLQQIRDTLEVSEFFRRHEVIGSSLLFVHDHCHRAGVWLIDFGKTTPLPDGQILDHRRPWEEGNREDGYLLGLDNLIGILASLAER

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	;Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG' ;

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Actin, alpha skeletal muscle
分子量 formula_weight	42110.0 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	5

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,G,H,I,J

MCDEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF

来源 Source

来源生物 organism	Gallus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9030
宿主生物 host_organism	Gallus

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Phalloidin
分子量 formula_weight	808.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X,Y,Z

PAWXATC

来源 Source

来源生物 organism	Amanita phalloides
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	67723
宿主生物 host_organism	Amanita phalloides

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	2.97 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	65917

fit	/app/data/saxs_computation/qg/9qgk/9qgk.fit
pddf	/app/data/pr_computation/qg/9qgk/9qgk.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/qg/9qgk/9qgk.dat

F-actin decorated by ITPKA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Inositol-trisphosphate 3-kinase A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Actin, alpha skeletal muscle

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)