9rhj

Pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (dimer)

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 289.0 Å Quality: EXCELLENT

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA replication licensing factor MCM2

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P29469

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 PDB 声明:32-meric(32) 与全部聚合物数一致 链 2; UniProt 1–868 链 a; UniProt 1–868 未记录 DNA replication licensing factor MCM3 × 2 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 2 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 2 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 2 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 2 (P38132) DNA (60-MER) × 1 DNA (60-MER) × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 2 (Q12146) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 2 (Q03406) Cell division control protein 45 × 2 (Q08032) DNA polymerase epsilon subunit B × 2 (P24482) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 2 (Q12488) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 2 (P40359) DNA replication regulator SLD3 × 2 (P53135) Mitochondrial morphogenesis protein SLD7 × 2 (Q08457) DNA replication regulator DPB11 × 2 (P47027) ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 51 个其他 PDB 条目、51 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MCM2_YEAST
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 2; PDB构建体 1–868; UniProt 1–868 作者链 a; PDB构建体 1–868; UniProt 1–868

DNA replication licensing factor MCM3

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P24279

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 PDB 声明:32-meric(32) 与全部聚合物数一致 链 3; UniProt 1–971 链 b; UniProt 1–971 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 2 (P29469) DNA replication licensing factor MCM4 × 2 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 2 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 2 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 2 (P38132) DNA (60-MER) × 1 DNA (60-MER) × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 2 (Q12146) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 2 (Q03406) Cell division control protein 45 × 2 (Q08032) DNA polymerase epsilon subunit B × 2 (P24482) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 2 (Q12488) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 2 (P40359) DNA replication regulator SLD3 × 2 (P53135) Mitochondrial morphogenesis protein SLD7 × 2 (Q08457) DNA replication regulator DPB11 × 2 (P47027) ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 59 个其他 PDB 条目、59 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MCM3_YEAST
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 3; PDB构建体 36–1006; UniProt 1–971 作者链 b; PDB构建体 36–1006; UniProt 1–971

DNA replication licensing factor MCM4

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P30665

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 PDB 声明:32-meric(32) 与全部聚合物数一致 链 4; UniProt 1–933 链 c; UniProt 1–933 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 2 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 2 (P24279) Minichromosome maintenance protein 5 × 2 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 2 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 2 (P38132) DNA (60-MER) × 1 DNA (60-MER) × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 2 (Q12146) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 2 (Q03406) Cell division control protein 45 × 2 (Q08032) DNA polymerase epsilon subunit B × 2 (P24482) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 2 (Q12488) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 2 (P40359) DNA replication regulator SLD3 × 2 (P53135) Mitochondrial morphogenesis protein SLD7 × 2 (Q08457) DNA replication regulator DPB11 × 2 (P47027) ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 58 个其他 PDB 条目、58 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MCM4_YEAST
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 4; PDB构建体 1–933; UniProt 1–933 作者链 c; PDB构建体 1–933; UniProt 1–933

Minichromosome maintenance protein 5

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P29496

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 PDB 声明:32-meric(32) 与全部聚合物数一致 链 5; UniProt 1–775 链 d; UniProt 1–775 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 2 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 2 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 2 (P30665) DNA replication licensing factor MCM6 × 2 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 2 (P38132) DNA (60-MER) × 1 DNA (60-MER) × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 2 (Q12146) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 2 (Q03406) Cell division control protein 45 × 2 (Q08032) DNA polymerase epsilon subunit B × 2 (P24482) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 2 (Q12488) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 2 (P40359) DNA replication regulator SLD3 × 2 (P53135) Mitochondrial morphogenesis protein SLD7 × 2 (Q08457) DNA replication regulator DPB11 × 2 (P47027) ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 54 个其他 PDB 条目、54 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MCM5_YEAST
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 5; PDB构建体 1–775; UniProt 1–775 作者链 d; PDB构建体 1–775; UniProt 1–775

DNA replication licensing factor MCM6

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P53091

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 PDB 声明:32-meric(32) 与全部聚合物数一致 链 6; UniProt 1–1017 链 e; UniProt 1–1017 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 2 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 2 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 2 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 2 (P29496) DNA replication licensing factor MCM7 × 2 (P38132) DNA (60-MER) × 1 DNA (60-MER) × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 2 (Q12146) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 2 (Q03406) Cell division control protein 45 × 2 (Q08032) DNA polymerase epsilon subunit B × 2 (P24482) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 2 (Q12488) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 2 (P40359) DNA replication regulator SLD3 × 2 (P53135) Mitochondrial morphogenesis protein SLD7 × 2 (Q08457) DNA replication regulator DPB11 × 2 (P47027) ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 58 个其他 PDB 条目、58 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MCM6_YEAST
Isoform
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 6; PDB构建体 1–1017; UniProt 1–1017 作者链 e; PDB构建体 1–1017; UniProt 1–1017

DNA replication licensing factor MCM7

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P38132

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 PDB 声明:32-meric(32) 与全部聚合物数一致 链 7; UniProt 1–845 链 f; UniProt 1–845 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 2 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 2 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 2 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 2 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 2 (P53091) DNA (60-MER) × 1 DNA (60-MER) × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 2 (Q12146) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 2 (Q03406) Cell division control protein 45 × 2 (Q08032) DNA polymerase epsilon subunit B × 2 (P24482) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 2 (Q12488) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 2 (P40359) DNA replication regulator SLD3 × 2 (P53135) Mitochondrial morphogenesis protein SLD7 × 2 (Q08457) DNA replication regulator DPB11 × 2 (P47027) ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 55 个其他 PDB 条目、55 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MCM7_YEAST
Isoform
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 7; PDB构建体 1–845; UniProt 1–845 作者链 f; PDB构建体 1–845; UniProt 1–845

DNA replication complex GINS protein PSF3

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q12146

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 PDB 声明:32-meric(32) 与全部聚合物数一致 链 C; UniProt 1–194 链 J; UniProt 1–194 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 2 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 2 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 2 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 2 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 2 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 2 (P38132) DNA (60-MER) × 1 DNA (60-MER) × 1 DNA replication complex GINS protein SLD5 × 2 (Q03406) Cell division control protein 45 × 2 (Q08032) DNA polymerase epsilon subunit B × 2 (P24482) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 2 (Q12488) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 2 (P40359) DNA replication regulator SLD3 × 2 (P53135) Mitochondrial morphogenesis protein SLD7 × 2 (Q08457) DNA replication regulator DPB11 × 2 (P47027) ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 29 个其他 PDB 条目、29 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSF3_YEAST
Isoform
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 24–217; UniProt 1–194 作者链 J; PDB构建体 24–217; UniProt 1–194

DNA replication complex GINS protein SLD5

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q03406

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 PDB 声明:32-meric(32) 与全部聚合物数一致 链 D; UniProt 1–294 链 K; UniProt 1–294 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 2 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 2 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 2 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 2 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 2 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 2 (P38132) DNA (60-MER) × 1 DNA (60-MER) × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 2 (Q12146) Cell division control protein 45 × 2 (Q08032) DNA polymerase epsilon subunit B × 2 (P24482) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 2 (Q12488) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 2 (P40359) DNA replication regulator SLD3 × 2 (P53135) Mitochondrial morphogenesis protein SLD7 × 2 (Q08457) DNA replication regulator DPB11 × 2 (P47027) ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 33 个其他 PDB 条目、33 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SLD5_YEAST
Isoform
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–294; UniProt 1–294 作者链 K; PDB构建体 1–294; UniProt 1–294

Cell division control protein 45

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q08032

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 PDB 声明:32-meric(32) 与全部聚合物数一致 链 E; UniProt 1–197 链 E; UniProt 204–650 链 L; UniProt 1–197 链 L; UniProt 204–650 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 2 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 2 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 2 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 2 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 2 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 2 (P38132) DNA (60-MER) × 1 DNA (60-MER) × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 2 (Q12146) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 2 (Q03406) DNA polymerase epsilon subunit B × 2 (P24482) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 2 (Q12488) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 2 (P40359) DNA replication regulator SLD3 × 2 (P53135) Mitochondrial morphogenesis protein SLD7 × 2 (Q08457) DNA replication regulator DPB11 × 2 (P47027) ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 34 个其他 PDB 条目、34 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CDC45_YEAST
Isoform
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–197; UniProt 1–197 作者链 E; PDB构建体 211–657; UniProt 204–650 作者链 L; PDB构建体 1–197; UniProt 1–197 作者链 L; PDB构建体 211–657; UniProt 204–650

DNA polymerase epsilon subunit B

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P24482

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 PDB 声明:32-meric(32) 与全部聚合物数一致 链 F; UniProt 1–689 链 M; UniProt 1–689 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 2 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 2 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 2 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 2 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 2 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 2 (P38132) DNA (60-MER) × 1 DNA (60-MER) × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 2 (Q12146) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 2 (Q03406) Cell division control protein 45 × 2 (Q08032) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 2 (Q12488) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 2 (P40359) DNA replication regulator SLD3 × 2 (P53135) Mitochondrial morphogenesis protein SLD7 × 2 (Q08457) DNA replication regulator DPB11 × 2 (P47027) ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 18 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DPB2_YEAST
Isoform
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–689; UniProt 1–689 作者链 M; PDB构建体 1–689; UniProt 1–689

DNA replication complex GINS protein PSF1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q12488

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 PDB 声明:32-meric(32) 与全部聚合物数一致 链 H; UniProt 1–208 链 O; UniProt 1–208 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 2 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 2 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 2 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 2 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 2 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 2 (P38132) DNA (60-MER) × 1 DNA (60-MER) × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 2 (Q12146) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 2 (Q03406) Cell division control protein 45 × 2 (Q08032) DNA polymerase epsilon subunit B × 2 (P24482) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 2 (P40359) DNA replication regulator SLD3 × 2 (P53135) Mitochondrial morphogenesis protein SLD7 × 2 (Q08457) DNA replication regulator DPB11 × 2 (P47027) ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 28 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSF1_YEAST
Isoform
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–208; UniProt 1–208 作者链 O; PDB构建体 1–208; UniProt 1–208

DNA replication complex GINS protein PSF2

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P40359

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 PDB 声明:32-meric(32) 与全部聚合物数一致 链 I; UniProt 1–213 链 P; UniProt 1–213 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 2 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 2 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 2 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 2 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 2 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 2 (P38132) DNA (60-MER) × 1 DNA (60-MER) × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 2 (Q12146) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 2 (Q03406) Cell division control protein 45 × 2 (Q08032) DNA polymerase epsilon subunit B × 2 (P24482) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 2 (Q12488) DNA replication regulator SLD3 × 2 (P53135) Mitochondrial morphogenesis protein SLD7 × 2 (Q08457) DNA replication regulator DPB11 × 2 (P47027) ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 27 个其他 PDB 条目、27 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSF2_YEAST
Isoform
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–213; UniProt 1–213 作者链 P; PDB构建体 1–213; UniProt 1–213

DNA replication regulator SLD3

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P53135

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 PDB 声明:32-meric(32) 与全部聚合物数一致 链 Q; UniProt 1–668 链 T; UniProt 1–668 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 2 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 2 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 2 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 2 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 2 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 2 (P38132) DNA (60-MER) × 1 DNA (60-MER) × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 2 (Q12146) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 2 (Q03406) Cell division control protein 45 × 2 (Q08032) DNA polymerase epsilon subunit B × 2 (P24482) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 2 (Q12488) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 2 (P40359) Mitochondrial morphogenesis protein SLD7 × 2 (Q08457) DNA replication regulator DPB11 × 2 (P47027) ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 5 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SLD3_YEAST
Isoform
PDB实体 15
链与序列区间 作者链 Q; PDB构建体 1–668; UniProt 1–668 作者链 T; PDB构建体 1–668; UniProt 1–668

Mitochondrial morphogenesis protein SLD7

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q08457

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 PDB 声明:32-meric(32) 与全部聚合物数一致 链 R; UniProt 1–257 链 U; UniProt 1–257 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 2 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 2 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 2 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 2 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 2 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 2 (P38132) DNA (60-MER) × 1 DNA (60-MER) × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 2 (Q12146) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 2 (Q03406) Cell division control protein 45 × 2 (Q08032) DNA polymerase epsilon subunit B × 2 (P24482) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 2 (Q12488) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 2 (P40359) DNA replication regulator SLD3 × 2 (P53135) DNA replication regulator DPB11 × 2 (P47027) ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 3 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SLD7_YEAST
Isoform
PDB实体 16
链与序列区间 作者链 R; PDB构建体 1–257; UniProt 1–257 作者链 U; PDB构建体 1–257; UniProt 1–257

DNA replication regulator DPB11

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P47027

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 PDB 声明:32-meric(32) 与全部聚合物数一致 链 S; UniProt 1–764 链 V; UniProt 1–764 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 2 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 2 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 2 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 2 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 2 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 2 (P38132) DNA (60-MER) × 1 DNA (60-MER) × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 2 (Q12146) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 2 (Q03406) Cell division control protein 45 × 2 (Q08032) DNA polymerase epsilon subunit B × 2 (P24482) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 2 (Q12488) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 2 (P40359) DNA replication regulator SLD3 × 2 (P53135) Mitochondrial morphogenesis protein SLD7 × 2 (Q08457) ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DPB11_YEAST
Isoform
PDB实体 17
链与序列区间 作者链 S; PDB构建体 1–764; UniProt 1–764 作者链 V; PDB构建体 1–764; UniProt 1–764

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9rhj

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9rhj
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9rhj
沉积日期 deposition_date2025-06-09
结构标题 titlePre-Initiation Complex on ARS1 DNA (dimer)
关键词 keywordsMacromolecular Complex DNA ATPase Helicase MCM2-7, REPLICATION; REPLICATION
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier82.02
回转半径 Rg (电子) rg_electron82.26
零角强度 I(0) i023681800000.00
分子量 molecular_weight1306700.0 kDa
排除体积 excluded_volume1634700 ų
包络体积 envelope_volume2789600 ų
水化壳体积 shell_volume272580 ų
包络直径 envelope_diameter276.0
壳层 Rg shell_rg87.48
包络 Rg envelope_rg79.04
形状 Rg shape_rg82.29
总 Rg total_rg82.19
总原子数 total_atoms91686
残基数 n_residues11264
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax289.0
Rg (实空间) rg_real85.18
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.50
I(0) (实空间) i0_real2.3660e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error4.4930e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal82.67
I(0) (倒空间) i0_reciprocal23720000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9040
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary91.3
偏度 Skewness skewness0.436
峰度 Kurtosis kurtosis-0.037
角度范围 angular_range— – 0.0950 −1
当前正则化参数 α current_alpha1.1160
最高正则化参数 α highest_alpha5383000000.0000
实空间数据点数 n_real_points20
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.832; Stabil: 0.889; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.981; Smooth: 0.626

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (20)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)