当前蛋白身份：P00573
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1ARO T7 RNA POLYMERASE COMPLEXED WITH T7 LYSOZYME 提交 1997-08-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 P
1–883（883 aa）
|
突变：C347S, C723S, C839S | HG MERCURY (II) ION × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；pH 7.0
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.309 |
| 1CEZ CRYSTAL STRUCTURE OF A T7 RNA POLYMERASE-T7 PROMOTER COMPLEX 提交 1999-03-11 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–883（883 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.7；pH 8.7
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.270 |
| 1H38 Structure of a T7 RNA polymerase elongation complex at 2.9A resolution 提交 2002-08-24 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–883（883 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.1；10% PEG 8000, 8% GLYCEROL, 5MM BETA-MERCAPTOETHANOL,100 MM TRIS BUFFER, PH8.1, pH 8.10
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.284 |
| 1H38 Structure of a T7 RNA polymerase elongation complex at 2.9A resolution 提交 2002-08-24 | Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–883（883 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.1；10% PEG 8000, 8% GLYCEROL, 5MM BETA-MERCAPTOETHANOL,100 MM TRIS BUFFER, PH8.1, pH 8.10
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.284 |
| 1H38 Structure of a T7 RNA polymerase elongation complex at 2.9A resolution 提交 2002-08-24 | Assembly 3 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–883（883 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.1；10% PEG 8000, 8% GLYCEROL, 5MM BETA-MERCAPTOETHANOL,100 MM TRIS BUFFER, PH8.1, pH 8.10
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.284 |
| 1H38 Structure of a T7 RNA polymerase elongation complex at 2.9A resolution 提交 2002-08-24 | Assembly 4 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.1；10% PEG 8000, 8% GLYCEROL, 5MM BETA-MERCAPTOETHANOL,100 MM TRIS BUFFER, PH8.1, pH 8.10
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.284 |
| 1MSW Structural basis for the transition from initiation to elongation transcription in T7 RNA polymerase 提交 2002-09-19 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；PEG 8000, LiSO4, Mg(OAc)2, Tris-HCL, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 294K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.275 |
| 1S0V Structural basis for substrate selection by T7 RNA polymerase 提交 2004-01-05 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–882（882 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.20 Å R-free 0.307 |
| 1S0V Structural basis for substrate selection by T7 RNA polymerase 提交 2004-01-05 | Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–882（882 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.20 Å R-free 0.307 |
| 1S0V Structural basis for substrate selection by T7 RNA polymerase 提交 2004-01-05 | Assembly 3 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–882（882 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.20 Å R-free 0.307 |
| 1S0V Structural basis for substrate selection by T7 RNA polymerase 提交 2004-01-05 | Assembly 4 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–882（882 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.20 Å R-free 0.307 |
| 1S76 T7 RNA polymerase alpha beta methylene ATP elongation complex 提交 2004-01-29 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；T7 RNAP, DNA, RNA, alpha-beta methylene ATP, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.88 Å R-free 0.290 |
| 1S77 T7 RNAP product pyrophosphate elongation complex 提交 2004-01-29 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；T7RNAP, DNA,RNA, 3'deoxyATP, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.285 |
| 2PI4 T7RNAP complexed with a phi10 protein and initiating GTPs. 提交 2007-04-12 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
6–883（878 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GH3 3'-DEOXY-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；300 K；50 mM Tris-HCl, 200 mM Li2SO4, 20% PEG 8000, 5% Glycerol, 15 mM magnesium acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.297 |
| 2PI5 T7 RNA polymerase complexed with a phi10 promoter 提交 2007-04-12 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
6–883（878 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；300 K；50 mM Tris-HCl, 200 mM Li2SO4, 20% PEG 8000, 5% Glycerol, 15 mM magnesium acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.268 |
| 3E2E Crystal Structure of an Intermediate Complex of T7 RNAP and 7nt of RNA 提交 2008-08-05 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–883（883 aa）
|
突变：P266L | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；285 K；PEG 6000, MgCl2, Tris ph8.0 at 285K, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.292 |
| 3E3J Crystal Structure of an Intermediate Complex of T7 RNAP and 8nt of RNA 提交 2008-08-07 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–883（883 aa）
|
突变：P266L | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；285 K；PEG 6000, MgCl2, Tris ph8.5 at 285K, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 6.70 Å R-free 0.454 |
| 3E3J Crystal Structure of an Intermediate Complex of T7 RNAP and 8nt of RNA 提交 2008-08-07 | Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–883（883 aa）
|
突变：P266L | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；285 K；PEG 6000, MgCl2, Tris ph8.5 at 285K, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 6.70 Å R-free 0.454 |
| 4RNP BACTERIOPHAGE T7 RNA POLYMERASE, HIGH SALT CRYSTAL FORM, LOW TEMPERATURE DATA, ALPHA-CARBONS ONLY 提交 1997-09-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.00 Å |
| 4RNP BACTERIOPHAGE T7 RNA POLYMERASE, HIGH SALT CRYSTAL FORM, LOW TEMPERATURE DATA, ALPHA-CARBONS ONLY 提交 1997-09-11 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–883（883 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.00 Å |
| 4RNP BACTERIOPHAGE T7 RNA POLYMERASE, HIGH SALT CRYSTAL FORM, LOW TEMPERATURE DATA, ALPHA-CARBONS ONLY 提交 1997-09-11 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–883（883 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.00 Å |
| 8DH0 T7 RNA polymerase elongation complex with unnatural base dDs 提交 2022-06-24 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetradecameric（14） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–883（883 aa）
链 F
1–883（883 aa）
链 J
1–883（883 aa）
链 N
1–883（883 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；298 K；10% PEG 8000, 8% glycerol, 5 mM B-mercaptoethanol, 100 mM Tris pH 8.1
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.261 |
| 8DH1 T7 RNA polymerase elongation complex with unnatural base dDs-PaTP pair 提交 2022-06-24 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–883（883 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 S8L 1-{5-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-D-ribofuranosyl}-1H-pyrrole-2-carbaldehyde × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；298 K；10% PEG 8000, 8% glycerol, 5 mM B-mercaptoethanol, 100 mM Tris pH 8.1
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.272 |
| 8DH1 T7 RNA polymerase elongation complex with unnatural base dDs-PaTP pair 提交 2022-06-24 | Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 E
1–883（883 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；298 K；10% PEG 8000, 8% glycerol, 5 mM B-mercaptoethanol, 100 mM Tris pH 8.1
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.272 |
| 8DH1 T7 RNA polymerase elongation complex with unnatural base dDs-PaTP pair 提交 2022-06-24 | Assembly 3 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 I
1–883（883 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；298 K；10% PEG 8000, 8% glycerol, 5 mM B-mercaptoethanol, 100 mM Tris pH 8.1
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.272 |
| 8DH1 T7 RNA polymerase elongation complex with unnatural base dDs-PaTP pair 提交 2022-06-24 | Assembly 4 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 L
1–883（883 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；298 K；10% PEG 8000, 8% glycerol, 5 mM B-mercaptoethanol, 100 mM Tris pH 8.1
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.272 |
| 8DH2 T7 RNA polymerase elongation complex with unnatural base dDs-ATP mismatch 提交 2022-06-24 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–883（883 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 3PO TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；298 K；10% PEG 8000, 8% glycerol, 5 mM B-mercaptoethanol, 100 mM Tris pH 8.1
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.307 |
| 8DH2 T7 RNA polymerase elongation complex with unnatural base dDs-ATP mismatch 提交 2022-06-24 | Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 E
1–883（883 aa）
|
未记录 | 3PO TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；298 K；10% PEG 8000, 8% glycerol, 5 mM B-mercaptoethanol, 100 mM Tris pH 8.1
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.307 |
| 8DH2 T7 RNA polymerase elongation complex with unnatural base dDs-ATP mismatch 提交 2022-06-24 | Assembly 3 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 I
1–883（883 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 3PO TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；298 K；10% PEG 8000, 8% glycerol, 5 mM B-mercaptoethanol, 100 mM Tris pH 8.1
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.307 |
| 8DH2 T7 RNA polymerase elongation complex with unnatural base dDs-ATP mismatch 提交 2022-06-24 | Assembly 4 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 L
1–883（883 aa）
|
未记录 | 3PO TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；298 K；10% PEG 8000, 8% glycerol, 5 mM B-mercaptoethanol, 100 mM Tris pH 8.1
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.307 |
| 8DH3 T7 RNA polymerase elongation complex with unnatural base dPa 提交 2022-06-24 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–883（883 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；298 K；10% PEG 8000, 8% glycerol, 5 mM B-mercaptoethanol, 100 mM Tris pH 8.1
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.276 |
| 8DH3 T7 RNA polymerase elongation complex with unnatural base dPa 提交 2022-06-24 | Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 E
1–883（883 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；298 K；10% PEG 8000, 8% glycerol, 5 mM B-mercaptoethanol, 100 mM Tris pH 8.1
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.276 |
| 8DH3 T7 RNA polymerase elongation complex with unnatural base dPa 提交 2022-06-24 | Assembly 3 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 I
1–883（883 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；298 K；10% PEG 8000, 8% glycerol, 5 mM B-mercaptoethanol, 100 mM Tris pH 8.1
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.276 |
| 8DH3 T7 RNA polymerase elongation complex with unnatural base dPa 提交 2022-06-24 | Assembly 4 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–883（883 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；298 K；10% PEG 8000, 8% glycerol, 5 mM B-mercaptoethanol, 100 mM Tris pH 8.1
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.276 |
| 8DH4 T7 RNA polymerase elongation complex with unnatural base dPa-DsTP pair 提交 2022-06-24 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–883（883 aa）
|
未记录 | S96 (7P)-3-{5-O-[(R)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-D-ribofuranosyl}-7-(thiophen-2-yl)-3H-imidazo[4,5-b]pyridine × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；298 K；10% PEG 8000, 8% glycerol, 5 mM B-mercaptoethanol, 100 mM Tris pH 8.1
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.275 |
| 8DH4 T7 RNA polymerase elongation complex with unnatural base dPa-DsTP pair 提交 2022-06-24 | Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 E
1–883（883 aa）
|
未记录 | S96 (7P)-3-{5-O-[(R)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-D-ribofuranosyl}-7-(thiophen-2-yl)-3H-imidazo[4,5-b]pyridine × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；298 K；10% PEG 8000, 8% glycerol, 5 mM B-mercaptoethanol, 100 mM Tris pH 8.1
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.275 |
| 8DH4 T7 RNA polymerase elongation complex with unnatural base dPa-DsTP pair 提交 2022-06-24 | Assembly 3 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 I
1–883（883 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；298 K；10% PEG 8000, 8% glycerol, 5 mM B-mercaptoethanol, 100 mM Tris pH 8.1
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.275 |
| 8DH4 T7 RNA polymerase elongation complex with unnatural base dPa-DsTP pair 提交 2022-06-24 | Assembly 4 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–883（883 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；298 K；10% PEG 8000, 8% glycerol, 5 mM B-mercaptoethanol, 100 mM Tris pH 8.1
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.275 |
| 8DH5 T7 RNA polymerase elongation complex with unnatural base dPa-ATP mismatch 提交 2022-06-24 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–883（883 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；298 K；10% PEG 8000, 8% glycerol, 5 mM B-mercaptoethanol, 100 mM Tris pH 8.1
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.267 |
| 8DH5 T7 RNA polymerase elongation complex with unnatural base dPa-ATP mismatch 提交 2022-06-24 | Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 E
1–883（883 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；298 K；10% PEG 8000, 8% glycerol, 5 mM B-mercaptoethanol, 100 mM Tris pH 8.1
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.267 |
| 8DH5 T7 RNA polymerase elongation complex with unnatural base dPa-ATP mismatch 提交 2022-06-24 | Assembly 3 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 I
1–883（883 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；298 K；10% PEG 8000, 8% glycerol, 5 mM B-mercaptoethanol, 100 mM Tris pH 8.1
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.267 |
| 8DH5 T7 RNA polymerase elongation complex with unnatural base dPa-ATP mismatch 提交 2022-06-24 | Assembly 4 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–883（883 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；298 K；10% PEG 8000, 8% glycerol, 5 mM B-mercaptoethanol, 100 mM Tris pH 8.1
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.267 |
| 9YXM 10-23 DNAzyme in complex with T7 RNA Polymerase 提交 2025-10-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–883（883 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 4.62 Å |