当前蛋白身份：P02794
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1FHA SOLVING THE STRUCTURE OF HUMAN H FERRITIN BY GENETICALLY ENGINEERING INTERMOLECULAR CRYSTAL CONTACTS 提交 1990-12-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–182（182 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 24 CA CALCIUM ION × 48 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.40 Å |
| 21HO Crystal strucrue of HuHF-C2-MEO complex 提交 2025-12-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.40 Å R-free 0.241 |
| 21KV Crystal strucrue of HuHF-C2-DAC complex 提交 2025-12-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
链 B
2–183（182 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å R-free 0.202 |
| 21KW Crystal strucrue of HuHF-C2-SEM complex 提交 2025-12-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å R-free 0.200 |
| 21LE Crystal strucrue of HuHF-C2-CAR complex 提交 2025-12-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å R-free 0.187 |
| 28JY Iron loaded E61A human H-chain ferritin, anaerobic 提交 2026-02-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.60 Å R-free 0.198 |
| 28JZ Iron loaded E61A human H-chain ferritin, 1 hour oxygen soak 提交 2026-02-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.41 Å R-free 0.239 |
| 28KA Iron loaded human H-chain ferritin, anaerobic 提交 2026-02-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.11 Å R-free 0.191 |
| 28KB Iron loaded human H-chain ferritin, 3 hour oxygen soak 提交 2026-02-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.83 Å R-free 0.228 |
| 28KC Iron loaded human H-chain ferritin, 2 minute oxygen soak 提交 2026-02-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.94 Å R-free 0.192 |
| 28LZ Iron loaded human H-chain ferritin, 20 minute oxygen soak 提交 2026-02-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.94 Å R-free 0.195 |
| 2CEI Recombinant human H ferritin, K86Q mutant, soaked with Zn 提交 2006-02-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–182（182 aa）
|
突变：YES | ZN ZINC ION × 192 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；HANGING DROP. RESERVOIR: MPD 21%, CACL2 5.7 MM, HEPES 50 MM PH 7.5 DROP: 2 UL PROTEIN (4.5 MG/ML) AND 1 UL RESERVOIR
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.192 |
| 2CHI Recombinant human H ferritin, K86Q and E27D mutant 提交 2006-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–182（182 aa）
|
突变：YES | CA CALCIUM ION × 72 ZN ZINC ION × 48 GOL GLYCEROL × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；HANGING DROP. RESERVOIR: MPD 5%, CACL2 4.7 MM, HEPES 50 MM PH 7.5 DROP: 1 UL PROTEIN (27MG/ML) AND 1 UL RESERVOIR
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.193 |
| 2CIH Recombinant human H ferritin, K86Q and E27D mutant, soaked with Zn 提交 2006-03-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–182（182 aa）
|
突变：YES | ZN ZINC ION × 216 GOL GLYCEROL × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；HANGING DROP. RESERVOIR: MPD 5% CACL2 4.7 MM, HEPES 50 MM PH 7.5 DROP: 1 UL PROTEIN (27MG/ML) AND 1 UL RESERVOIR
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.198 |
| 2CLU Recombinant human H ferritin, K86Q and E107D mutant 提交 2006-05-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–182（182 aa）
|
突变：YES | CA CALCIUM ION × 48 ZN ZINC ION × 24 GOL GLYCEROL × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；HANGING DROP. RESERVOIR: MPD 5% CACL2 4.7 MM, TRIS 50 MM PH 8.5. DROP: 1 UL PROTEIN (22 MG/ML) AND 1 UL RESERVOIR
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.246 |
| 2CN6 Recombinant human H ferritin, K86Q and E107D mutant, soaked with Zn ions 提交 2006-05-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–182（182 aa）
|
突变：YES | ZN ZINC ION × 168 CA CALCIUM ION × 24 GOL GLYCEROL × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；HANGING DROP. RESERVOIR: MPD 5% CACL2 4.7 MM, TRIS 50 MM PH 8.5 DROP: 1 UL PROTEIN (22 MG/ML) AND 1 UL RESERVOIR
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.230 |
| 2CN7 Recombinant human H ferritin, K86Q, E27D and E107D mutant 提交 2006-05-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–182（182 aa）
|
突变：YES | CA CALCIUM ION × 72 GOL GLYCEROL × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；HANGING DROP. RESERVOIR: MPD 5.2%, CACL2 3.9 MM, TRIS 50MM PH 8.5. DROP: 1UL PROTEIN (24 MG/ML) AND 1 UL RESERVOIR
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.204 |
| 2FHA HUMAN H CHAIN FERRITIN 提交 1997-03-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–182（182 aa）
|
突变：K86Q | CA CALCIUM ION × 48 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 0.08% CACL2 / 15% MPD IN 50 MM HEPES BUFFER PH 7.5
|
分辨率 1.90 Å |
| 2IU2 Recombinant human H ferritin, K86Q, E27D and E107D mutant, soaked with Zn ions 提交 2006-05-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–182（182 aa）
|
突变：YES | ZN ZINC ION × 144 GOL GLYCEROL × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；HANGING DROP. RESERVOIR : MPD 5.2%, CACL2 3.9 MM, TRIS 50 MM PH 8.5. DROP: 1UL PROTEIN (24 MG/ML) AND 1 UL RESERVOIR
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.219 |
| 2Z6M Crystal structure of Human Ferritin H8 as biotemplate for noble metal nanoparticle synthesis 提交 2007-08-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–177（176 aa）
片段：residues 1-176
链 B
2–177（176 aa）
片段：residues 1-176
链 C
2–177（176 aa）
片段：residues 1-176
链 D
2–177（176 aa）
片段：residues 1-176
链 E
2–177（176 aa）
片段：residues 1-176
链 F
2–177（176 aa）
片段：residues 1-176
|
突变：H13D, E64C, C90R, C102A, H105Q, E140C, K143C, E147C 突变：H13D, E64C, C90R, C102A, H105Q, E140C, K143C, E147C 突变：H13D, E64C, C90R, C102A, H105Q, E140C, K143C, E147C 突变：H13D, E64C, C90R, C102A, H105Q, E140C, K143C, E147C 突变：H13D, E64C, C90R, C102A, H105Q, E140C, K143C, E147C 突变：H13D, E64C, C90R, C102A, H105Q, E140C, K143C, E147C | ZN ZINC ION × 8 CA CALCIUM ION × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；protein solution(11.0 mg/mL H8 in unbuffered 3.0mM NaN3), 2.5mL of precipitant buffer(0.1 M sodium acetate(pH 4.6), 20%(v/v) isopropanol, 0.2M CaCl2) , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.72 Å R-free 0.252 |
| 2Z6M Crystal structure of Human Ferritin H8 as biotemplate for noble metal nanoparticle synthesis 提交 2007-08-04 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 G
2–177（176 aa）
片段：residues 1-176
链 H
2–177（176 aa）
片段：residues 1-176
链 I
2–177（176 aa）
片段：residues 1-176
链 J
2–177（176 aa）
片段：residues 1-176
链 K
2–177（176 aa）
片段：residues 1-176
链 L
2–177（176 aa）
片段：residues 1-176
|
突变：H13D, E64C, C90R, C102A, H105Q, E140C, K143C, E147C 突变：H13D, E64C, C90R, C102A, H105Q, E140C, K143C, E147C 突变：H13D, E64C, C90R, C102A, H105Q, E140C, K143C, E147C 突变：H13D, E64C, C90R, C102A, H105Q, E140C, K143C, E147C 突变：H13D, E64C, C90R, C102A, H105Q, E140C, K143C, E147C 突变：H13D, E64C, C90R, C102A, H105Q, E140C, K143C, E147C | ZN ZINC ION × 12 CA CALCIUM ION × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；protein solution(11.0 mg/mL H8 in unbuffered 3.0mM NaN3), 2.5mL of precipitant buffer(0.1 M sodium acetate(pH 4.6), 20%(v/v) isopropanol, 0.2M CaCl2) , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.72 Å R-free 0.252 |
| 3AJO Crystal structure of wild-type human ferritin H chain 提交 2010-06-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 288 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；2.0M magnesium chloride, 0.1M Bicine (pH 9.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.183 |
| 3AJP Crystal structure of human H ferritin E140A mutant 提交 2010-06-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
突变：E140A | MG MAGNESIUM ION × 240 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；2.0M magnesium chloride, 0.1M Bicine (pH 9.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.218 |
| 3AJQ Crystal structure of human H ferritin E140Q mutant 提交 2010-06-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
突变：E140Q | MG MAGNESIUM ION × 264 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；2.0M magnesium chloride, 0.1M Bicine (pH 9.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.185 |
| 3ERZ Directing Noble Metal Ion Chemistry within a Designed Ferritin Protein. Mercury Ions on the Three-Fold Channel 提交 2008-10-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
|
突变：H13D, E64C, C90R, C102A, H105Q, E140C, K143C, E147C 突变：H13D, E64C, C90R, C102A, H105Q, E140C, K143C, E147C 突变：H13D, E64C, C90R, C102A, H105Q, E140C, K143C, E147C 突变：H13D, E64C, C90R, C102A, H105Q, E140C, K143C, E147C 突变：H13D, E64C, C90R, C102A, H105Q, E140C, K143C, E147C 突变：H13D, E64C, C90R, C102A, H105Q, E140C, K143C, E147C | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 24 HG MERCURY (II) ION × 24 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；protein solution (11.0 mg/mL H8 in unbuffered 3.0MM NAN3), 2.5mL of precipitant buffer (0.1M sodium acetate (PH 4.6), 20%(v/v) isopropanol, 0.2M CaCl2), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K. Soaking experiment performed with mercury ions using the mother liquor without calcium ions.
|
分辨率 3.06 Å R-free 0.256 |
| 3ERZ Directing Noble Metal Ion Chemistry within a Designed Ferritin Protein. Mercury Ions on the Three-Fold Channel 提交 2008-10-03 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 G
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
链 I
1–183（183 aa）
链 J
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 L
1–183（183 aa）
|
突变：H13D, E64C, C90R, C102A, H105Q, E140C, K143C, E147C 突变：H13D, E64C, C90R, C102A, H105Q, E140C, K143C, E147C 突变：H13D, E64C, C90R, C102A, H105Q, E140C, K143C, E147C 突变：H13D, E64C, C90R, C102A, H105Q, E140C, K143C, E147C 突变：H13D, E64C, C90R, C102A, H105Q, E140C, K143C, E147C 突变：H13D, E64C, C90R, C102A, H105Q, E140C, K143C, E147C | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 20 HG MERCURY (II) ION × 24 CA CALCIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；protein solution (11.0 mg/mL H8 in unbuffered 3.0MM NAN3), 2.5mL of precipitant buffer (0.1M sodium acetate (PH 4.6), 20%(v/v) isopropanol, 0.2M CaCl2), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K. Soaking experiment performed with mercury ions using the mother liquor without calcium ions.
|
分辨率 3.06 Å R-free 0.256 |
| 3ES3 Directing Noble Metal Ion Chemistry within a Designed Ferritin Protein. The Complex with Gold ions. Ferritin H8-H9x Mutant 提交 2008-10-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
|
突变：H13D, E64C, K86Q, C90R, C102A, H105Q, C130S, E140C, K143C, E147C | AU GOLD ION × 96 CA CALCIUM ION × 48 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；Protein solution (11.0 mG/mL H8 in unbuffered 3.0MM NaN3), 2.5mL of precipitant buffer (0.1 M sodium acetate (PH 4.6), 20%(V/V) isopropanol, 0.2M CaCl2), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K. Soaking crystals were performed using a mother liquor (no calcium ions) with the addition of 0.5 mM AuCl3 for one week.
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.275 |
| 4DYX Crystal Structure of the Cu-adduct of Human H-Ferritin variant 4His-delta C-star 提交 2012-02-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
6–177（172 aa）
|
突变：K86Q, C90E, C102A, C130A | CU COPPER (II) ION × 96 CA CALCIUM ION × 72 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；50 mM Tris, 5 mM calcium chloride, 200 microM cupric chloride , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.197 |
| 4DYY Crystal Structure of the Cu-adduct of Human H-Ferritin variant MIC1 提交 2012-02-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
6–177（172 aa）
|
突变：L56H, R63H, E67H, K86Q, C90E, C102A, C130A | CU COPPER (II) ION × 72 CA CALCIUM ION × 48 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 24 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；50 mM Tris, 5 mM calcium chloride, 8% PEG 1900 MME, 700 micro M cupric chloride, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.241 |
| 4DYZ Crystal Structure of the apo form of Human H-Ferritin variant MIC1 提交 2012-02-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
6–177（172 aa）
|
突变：L56H, R63H, E67H, K86Q, C90E, C102A, C130A | CU COPPER (II) ION × 24 CA CALCIUM ION × 96 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；50 mM Tris, 10 mM calcium chloride, 4% PEG 400, soaked in 20 mM EDTA, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.272 |
| 4DZ0 Crystal structure of the Cu-adduct of human H-Ferritin variant MIC1 labeled with a dansyl fluorophore 提交 2012-02-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
6–177（172 aa）
片段：UNP residues 6-177
|
突变：K53C, L56H, R63H, E67H, K86Q, C90E, C102A, C130A | AEN 5-(1-SULFONAPHTHYL)-ACETYLAMINO-ETHYLAMINE × 24 CU COPPER (II) ION × 72 CA CALCIUM ION × 72 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；50 mM Tris, 5 mM calcium chloride, 50 mM sodium chloride, 10% PEG 3350, 350 M cupric chloride, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.300 |
| 4OYN Fifteen minutes iron loaded human H ferritin 提交 2014-02-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 24 BCN BICINE × 24 FE FE (III) ION × 168 CL CHLORIDE ION × 312 MG MAGNESIUM ION × 72 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；277 K；1.6 M MgCl2 and 0.1 M bicine pH 9.0
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.179 |
| 4Y08 ONE MINUTE IRON LOADED HUMAN H FERRITIN 提交 2015-02-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | FE2 FE (II) ION × 120 CL CHLORIDE ION × 216 MG MAGNESIUM ION × 120 OXY OXYGEN MOLECULE × 48 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；281 K；2.0 M magnesium chloride and 0.1 M BICINE at pH 9.0
|
分辨率 1.34 Å R-free 0.173 |
| 4YKH Thirty minutes iron loaded human H ferritin 提交 2015-03-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | BCN BICINE × 24 FE2 FE (II) ION × 168 MG MAGNESIUM ION × 96 CL CHLORIDE ION × 288 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；281 K；2.0 M magnesium chloride, 0.1 M Bicine pH 9.0
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.187 |
| 4ZJK FIVE MINUTES IRON LOADED HUMAN H FERRITIN 提交 2015-04-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
片段：UNP residues 2-183
|
未记录 | FE2 FE (II) ION × 120 MG MAGNESIUM ION × 120 CL CHLORIDE ION × 336 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；281 K；0.1 Bicine pH 9.0, 2.0 M Magnesium Chloride
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.192 |
| 5CMQ Crystal Structure of Zn-bound Human H-Ferritin variant 122H-delta C-star 提交 2015-07-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
片段：Ferritin-like diiron domain containing residues 6-177
|
突变：K86Q, C90E, C102A, C130A, T122H | ZN ZINC ION × 216 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；25 mM Tris, 10 mM calcium chloride, 10 mM zinc chloride, 2% PEG 3350
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.180 |
| 5CMR Crystal Structure of Linker-Mediated Zn-bound Human H-Ferritin variant 122H-delta C-star 提交 2015-07-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
片段：Ferritin-like diiron domain containing residues 6-178
|
突变：K86A, C90E, C102A, C130A, T122H | ZN ZINC ION × 48 NA SODIUM ION × 72 BYD N,N'-dihydroxybenzene-1,4-dicarboxamide × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；50 mM CHES, 150 mM sodium chloride, 0.3 mM zinc chloride, 1 mM H2BDH
|
分辨率 3.79 Å R-free 0.256 |
| 5GN8 Structure of a 48-mer protein nanocage fabricated from its 24-mer analogue by subunit interface redesign 提交 2016-07-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric（48） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
链 B
2–153（152 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 48 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；300 K；0.1 M imidazol-HCl at pH 7.5, 10% reagent alcohol (15%) and 0.2 M MgCl2
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.251 |
| 5GOU Structure of a 16-mer protein nanocage fabricated from its 24-mer analogue by subunit interface redesign 提交 2016-07-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
链 G
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
链 I
1–183（183 aa）
链 J
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 L
1–183（183 aa）
链 M
1–183（183 aa）
链 N
1–183（183 aa）
链 O
1–183（183 aa）
链 P
1–183（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；300 K；1% PEG 4K, 1% MPD, 0.1M NaAC
|
分辨率 2.91 Å R-free 0.275 |
| 5JKK Crystal structure of the negatively supercharged variant Ftn(neg) of human heavy chain ferritin 提交 2016-04-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
链 G
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 30 MG MAGNESIUM ION × 51 CL CHLORIDE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.52 M magnesium acetate, 100 mM Tris, pH 8.5, 8 mg/mL Ftn(neg)
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.143 |
| 5JKL Binary crystal structure of positively and negatively supercharged variants Ftn(pos) and Ftn(neg) from human heavy chain ferritin (Mg formate condition) 提交 2016-04-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 36 MG MAGNESIUM ION × 32 CL CHLORIDE ION × 12 GOL GLYCEROL × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.19 M magnesium formate, 4 mg/mL Ftn(pos) and 4 mg/mL Ftn(neg)
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.176 |
| 5JKL Binary crystal structure of positively and negatively supercharged variants Ftn(pos) and Ftn(neg) from human heavy chain ferritin (Mg formate condition) 提交 2016-04-26 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 G
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
链 I
1–183（183 aa）
链 J
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 L
1–183（183 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 36 MG MAGNESIUM ION × 24 CL CHLORIDE ION × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.19 M magnesium formate, 4 mg/mL Ftn(pos) and 4 mg/mL Ftn(neg)
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.176 |
| 5JKM Binary crystal structure of positively and negatively supercharged variants Ftn(pos) and Ftn(neg) from human heavy chain ferritin (Mg acetate condition) 提交 2016-04-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 24 MG MAGNESIUM ION × 32 GOL GLYCEROL × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.20 M magnesium acetate, 100 mM Tris, pH 8.5, 8 mg/mL Ftn(pos) and 8 mg/mL Ftn(neg)
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.191 |
| 5JKM Binary crystal structure of positively and negatively supercharged variants Ftn(pos) and Ftn(neg) from human heavy chain ferritin (Mg acetate condition) 提交 2016-04-26 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 G
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
链 I
1–183（183 aa）
链 J
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 L
1–183（183 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 24 MG MAGNESIUM ION × 36 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.20 M magnesium acetate, 100 mM Tris, pH 8.5, 8 mg/mL Ftn(pos) and 8 mg/mL Ftn(neg)
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.191 |
| 5N26 X-ray structure of human heavy chain ferritin in complex with cisplatin 提交 2017-02-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
未记录 | CPT Cisplatin × 72 73M bis(azanyl)-chloranyl-oxidanyl-platinum × 24 CL CHLORIDE ION × 144 MG MAGNESIUM ION × 120 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；2.0 M Magnesium chloride, 0.1 M bicine pH 9.0
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.206 |
| 5N27 X-ray structure of human heavy chain ferritin (apo form) 提交 2017-02-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 144 MG MAGNESIUM ION × 192 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.0 M MgCl2, 0.1 M bicine pH 9.0
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.191 |
| 5UP7 Crystal Structure of the Ni-bound Human Heavy-Chain Ferritin 122H-delta C-star variant 提交 2017-02-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
未记录 | NI NICKEL (II) ION × 120 CA CALCIUM ION × 48 CL CHLORIDE ION × 24 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；Reservoir: 500 uL total volume: 25 mM Tris (pH 8), 10 mM CaCl2, 1 mM NiCl2, 1% PEG 6000
Sitting Drop: 2 uL reservoir, 2 uL of
12.5 uM ferritin
|
分辨率 1.79 Å |
| 5UP8 Crystal Structure of the Zn-bound Human Heavy-Chain variant 122H-delta C-star with para-benzenedihydroxamate 提交 2017-02-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 72 NA SODIUM ION × 24 BYD N,N'-dihydroxybenzene-1,4-dicarboxamide × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；Reservoir: 500 uL total volume: 50 mM CHES (pH 8.5), 150 mM NaCl,
0.14 mM ZnCl2
Sitting Drop: 8.6 uL reservoir, 1 uL of 12.5 uM ferritin, 2.4 uL of 5 mM
p-H2bdh in 50 mM CHES (pH 9.5) with 150 mM NaCl
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.262 |
| 5UP9 Crystal Structure of Zn-bound Human Heavy-Chain ferritin variant 122H-delta C-star with para-xylenedihydroxamate 提交 2017-02-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
链 B
2–183（182 aa）
链 C
2–183（182 aa）
链 D
2–183（182 aa）
链 E
2–183（182 aa）
链 F
2–183（182 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 76 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 20 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 76 BYX 2,2'-(1,4-phenylene)bis(N-hydroxyacetamide) × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Reservoir: 500 uL total volume: 50 mM CHES (pH 8.5), 150 mM NaCl,
0.474 mM ZnCl2, 3% PEG 300
Sitting Drop: 7.6 uL reservoir, 2 uL of 12.5 uM ferritin, 2.4 uL of 5 mM
p-H2xdh in 50 mM CHES (pH 9.5) with 150 mM NaCl
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.289 |
| 5VTD Crystal Structure of the Co-bound Human Heavy-Chain Ferritin variant 122H-delta C-star 提交 2017-05-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
未记录 | CO COBALT (II) ION × 120 CL CHLORIDE ION × 24 CA CALCIUM ION × 72 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；Reservoir: 500 uL total volume: 25 mM Tris (pH 8), 12 mM CaCl2, 150 mM NaCl, 0.3 mM CoCl2, 1% PEG 1900 MME
Sitting Drop: 2 uL reservoir, 2 uL of
4 uM ferritin
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.217 |
| 5XB1 human ferritin mutant - E-helix deletion 提交 2017-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–160（160 aa）
片段：UNP residues 6-160
链 B
1–160（160 aa）
片段：UNP residues 6-160
链 C
1–160（160 aa）
片段：UNP residues 6-160
链 D
1–160（160 aa）
片段：UNP residues 6-160
链 E
1–160（160 aa）
片段：UNP residues 6-160
链 F
1–160（160 aa）
片段：UNP residues 6-160
链 G
1–160（160 aa）
片段：UNP residues 6-160
链 H
1–160（160 aa）
片段：UNP residues 6-160
链 I
1–160（160 aa）
片段：UNP residues 6-160
链 J
1–160（160 aa）
片段：UNP residues 6-160
链 K
1–160（160 aa）
片段：UNP residues 6-160
链 L
1–160（160 aa）
片段：UNP residues 6-160
链 M
1–160（160 aa）
片段：UNP residues 6-160
链 N
1–160（160 aa）
片段：UNP residues 6-160
链 O
1–160（160 aa）
片段：UNP residues 6-160
链 P
1–160（160 aa）
片段：UNP residues 6-160
链 Q
1–160（160 aa）
片段：UNP residues 6-160
链 R
1–160（160 aa）
片段：UNP residues 6-160
链 S
1–160（160 aa）
片段：UNP residues 6-160
链 T
1–160（160 aa）
片段：UNP residues 6-160
链 U
1–160（160 aa）
片段：UNP residues 6-160
链 V
1–160（160 aa）
片段：UNP residues 6-160
链 W
1–160（160 aa）
片段：UNP residues 6-160
链 X
1–160（160 aa）
片段：UNP residues 6-160
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；buffers were titrated with HCl to pH8.0
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 9 seconds before plunging
|
分辨率 3.00 Å |
| 5YI5 human ferritin mutant - E-helix deletion 提交 2017-10-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–177（177 aa）
链 B
1–177（177 aa）
链 C
1–177（177 aa）
链 D
1–177（177 aa）
链 E
1–177（177 aa）
链 F
1–177（177 aa）
链 G
1–177（177 aa）
链 H
1–177（177 aa）
链 I
1–177（177 aa）
链 J
1–177（177 aa）
链 K
1–177（177 aa）
链 L
1–177（177 aa）
链 M
1–177（177 aa）
链 N
1–177（177 aa）
链 O
1–177（177 aa）
链 P
1–177（177 aa）
链 Q
1–177（177 aa）
链 R
1–177（177 aa）
链 S
1–177（177 aa）
链 T
1–177（177 aa）
链 U
1–177（177 aa）
链 V
1–177（177 aa）
链 W
1–177（177 aa）
链 X
1–177（177 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2；buffers were titrated with HCl to pH7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 9 seconds before plunging
|
分辨率 3.00 Å |
| 5ZND 8-mer nanotube derived from 24-mer rHuHF nanocage 提交 2018-04-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–134（134 aa）
|
突变：K86Q | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.2M ammonium citrate (pH=8.0), 0.1M Tris-HCl (pH=8.0), 22% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.276 |
| 6B8F Contracted Human Heavy-Chain Ferritin Crystal-Hydrogel Hybrid 提交 2017-10-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 48 CA CALCIUM ION × 264 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Reservoir: 500 uL of 25 mM HEPES pH 7.0 with 10 mM CaCl2
Well: 2 uL of reservoir solution and 2 uL of 2.5 uM ferritin (by 24-mer) in 15 mM TRIS pH 7.4 with 150 mM NaCl
After crystals formed, a crystal was harvested and soaked in a buffered solution comprised of 25 mM HEPES pH 7.0, 30 mM CaCl2, 8.6 % (w/v) sodium acrylate, 2.5 % (w/v) acrylamide, and 0.2 % (w/v) Bis-acrylamide overnight.
Crystal was transferred to a solution containing 1 % APS and 1% TEMED with 4 M NaCl for 5 min. Crystal was then transferred to a clean slide and soaked in 30 uL H2O for 5 min. This solution was removed and the crystal was soaked in 1 M CaCl2 for 2 min. The crystal was removed, cryoprotected in perfluoro polyether, and frozen in liquid N2.
|
分辨率 1.06 Å R-free 0.103 |
| 6B8G Twice-Contracted Human Heavy-Chain Ferritin Crystal-Hydrogel Hybrid 提交 2017-10-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 48 CA CALCIUM ION × 264 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Reservoir: 500 uL of 25 mM HEPES pH 7.0 with 10 mM CaCl2
Well: 2 uL of reservoir solution and 2 uL of 2.5 uM ferritin (by 24-mer) in 15 mM TRIS pH 7.4 with 150 mM NaCl
After crystals formed, a crystal was harvested and soaked in a buffered solution comprised of 25 mM HEPES pH 7.0, 30 mM CaCl2, 8.6 % (w/v) sodium acrylate, 2.5 % (w/v) acrylamide, and 0.2 % (w/v) Bis-acrylamide overnight.
Crystal was transferred to a solution containing 1 % APS and 1% TEMED with 4 M NaCl for 5 min. Crystal was then transferred to a clean slide and soaked in 30 uL H2O for 5 min. The H2O was removed the crystal was soaked in 4 M NaCl for 2 min. The crystal was removed, and soaked in 30 uL H2O for 5 min. This solution was removed and the crystal was soaked in 1 M CaCl2 for 2 min. The crystal was removed, cryoprotected in perfluoro polyether, and frozen in liquid N2.
|
分辨率 1.13 Å R-free 0.121 |
| 6FTV X-ray structure of human heavy chain ferritin in complex with NAMI A 提交 2018-02-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 168 MG MAGNESIUM ION × 216 RU RUTHENIUM ION × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.0 M MgCl2, 0.1 M bicine pH 9.0
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.183 |
| 6GSR Single Particle Cryo-EM map of human Transferrin receptor 1 - H-Ferritin complex at 5.5 Angstrom resolution. 提交 2018-06-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：26-meric（26） 与蛋白数一致 |
链 Aa
2–183（182 aa）
链 Ac
2–183（182 aa）
链 Ad
2–183（182 aa）
链 Ae
2–183（182 aa）
链 Af
2–183（182 aa）
链 Ag
2–183（182 aa）
链 Ah
2–183（182 aa）
链 Ai
2–183（182 aa）
链 Aj
2–183（182 aa）
链 Ak
2–183（182 aa）
链 Al
2–183（182 aa）
链 Am
2–183（182 aa）
链 An
2–183（182 aa）
链 Ao
2–183（182 aa）
链 Ap
2–183（182 aa）
链 Ar
2–183（182 aa）
链 As
2–183（182 aa）
链 At
2–183（182 aa）
链 Au
2–183（182 aa）
链 Av
2–183（182 aa）
链 Aw
2–183（182 aa）
链 Ax
2–183（182 aa）
链 Ay
2–183（182 aa）
链 Az
2–183（182 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.50 Å |
| 6H5I Single Particle Cryo-EM map of human Transferrin receptor 1 - H-Ferritin complex. 提交 2018-07-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：26-meric（26） 与蛋白数一致 |
链 Aa
6–177（172 aa）
链 Ac
6–177（172 aa）
链 Ad
6–177（172 aa）
链 Ae
6–177（172 aa）
链 Af
6–177（172 aa）
链 Ag
6–177（172 aa）
链 Ah
6–177（172 aa）
链 Ai
6–177（172 aa）
链 Aj
6–177（172 aa）
链 Ak
6–177（172 aa）
链 Al
6–177（172 aa）
链 Am
6–177（172 aa）
链 An
6–177（172 aa）
链 Ao
6–177（172 aa）
链 Ap
6–177（172 aa）
链 Ar
6–177（172 aa）
链 As
6–177（172 aa）
链 At
6–177（172 aa）
链 Au
6–177（172 aa）
链 Av
6–177（172 aa）
链 Aw
6–177（172 aa）
链 Ax
6–177（172 aa）
链 Ay
6–177（172 aa）
链 Az
6–177（172 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 6H6T Binary crystal structure of positively and negatively supercharged variants Ftn(pos) and Ftn(neg) from human heavy chain ferritin (propandiol condition, coordination number 8) 提交 2018-07-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 24 ACT ACETATE ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 12 CL CHLORIDE ION × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；100 mM sodium acetate pH 4.5, 42 % propanediol
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.222 |
| 6H6T Binary crystal structure of positively and negatively supercharged variants Ftn(pos) and Ftn(neg) from human heavy chain ferritin (propandiol condition, coordination number 8) 提交 2018-07-30 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 G
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
链 I
1–183（183 aa）
链 J
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 L
1–183（183 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 24 ACT ACETATE ION × 4 ZN ZINC ION × 12 CL CHLORIDE ION × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；100 mM sodium acetate pH 4.5, 42 % propanediol
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.222 |
| 6H6U Unitary crystal structure of the positively supercharged variant Ftn(pos) from human heavy chain ferritin (PEG 400 condition) 提交 2018-07-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 60 GOL GLYCEROL × 4 CA CALCIUM ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.22 M CaCl2, 0.1 M HEPES pH 7.5 M, 30% PEG 400
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.308 |
| 6IPC Non-native human ferritin 8-mer 提交 2018-11-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
链 B
2–183（182 aa）
链 C
2–183（182 aa）
链 D
2–183（182 aa）
链 E
2–183（182 aa）
链 F
2–183（182 aa）
链 G
2–183（182 aa）
链 H
2–183（182 aa）
|
突变：C90A, C102A, C130A, 140~145 deletion 突变：C90A, C102A, C130A, 140~145 deletion 突变：C90A, C102A, C130A, 140~145 deletion 突变：C90A, C102A, 140~145 deletion 突变：C90A, C102A, C130A, 140~145 deletion 突变：C90A, C102A, C130A, 140~145 deletion 突变：C90A, C102A, C130A, 140~145 deletion 突变：C90A, C102A, C130A, 140~145 deletion | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293.15 K；0.1 M HEPES pH 7.5;
10% PEG 6000;
5% MPD
|
分辨率 4.44 Å R-free 0.277 |
| 6IPC Non-native human ferritin 8-mer 提交 2018-11-03 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 I
2–183（182 aa）
链 J
2–183（182 aa）
链 K
2–183（182 aa）
链 L
2–183（182 aa）
链 M
2–183（182 aa）
链 N
2–183（182 aa）
链 O
2–183（182 aa）
链 P
2–183（182 aa）
|
突变：C90A, C102A, C130A, 140~145 deletion 突变：C90A, C102A, C130A, 140~145 deletion 突变：C90A, C102A, C130A, 140~145 deletion 突变：C90A, C102A, 140~145 deletion 突变：C90A, C102A, C130A, 140~145 deletion 突变：C90A, C102A, C130A, 140~145 deletion 突变：C90A, C102A, C130A, 140~145 deletion 突变：C90A, C102A, C130A, 140~145 deletion | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293.15 K；0.1 M HEPES pH 7.5;
10% PEG 6000;
5% MPD
|
分辨率 4.44 Å R-free 0.277 |
| 6IPO Ferritin mutant C90A/C102A/C130A/D144C 提交 2018-11-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric（48） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
链 B
2–183（182 aa）
|
突变：C90A/C102A/C130A/D144C 突变：C90A/C102A/C130A/D144C | MG MAGNESIUM ION × 72 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293.15 K；magnesium chloride, PEG 400, TRIS
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.245 |
| 6IPP Non-native ferritin 8-mer mutant-C90A/C102A/C130A/D144C 提交 2018-11-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric（48） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
链 B
2–183（182 aa）
|
突变：C90A/C102A/C130A/D144C 突变：C90A/C102A/C130A/D144C | FE FE (III) ION × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 7；293.17 K；Sodium chloride,MPD,TRIS
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.232 |
| 6IPQ Non-native ferritin 8-mer mutant-C90A/C102A/C130A 提交 2018-11-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
突变：C90A/C102A/C130A | MG MAGNESIUM ION × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；200mM MgCl2, 3.4M 1,6-Hexanediol, 100mM Tris/HCl
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.276 |
| 6J4A Human H chain ferritin with an extension peptide 提交 2019-01-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
链 G
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
链 I
1–183（183 aa）
链 J
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 L
1–183（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；PEG 8000, Hepes, ethylene glycol
|
分辨率 3.99 Å R-free 0.351 |
| 6J7G Human H-ferritin mutant-C90A/C102A/C130A/D144C 提交 2019-01-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
链 B
2–183（182 aa）
链 C
2–183（182 aa）
链 D
2–183（182 aa）
链 G
2–183（182 aa）
链 H
2–183（182 aa）
链 I
2–183（182 aa）
链 J
2–183（182 aa）
链 M
2–183（182 aa）
链 N
2–183（182 aa）
链 O
2–183（182 aa）
链 P
2–183（182 aa）
链 Q
2–183（182 aa）
链 R
2–183（182 aa）
链 S
2–183（182 aa）
链 T
2–183（182 aa）
链 W
2–183（182 aa）
链 X
2–183（182 aa）
链 Y
2–183（182 aa）
链 Z
2–183（182 aa）
链 a
2–183（182 aa）
链 b
2–183（182 aa）
链 e
2–183（182 aa）
链 f
2–183（182 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；Amonium Sulfate, HEPES
|
分辨率 3.87 Å R-free 0.328 |
| 6JOB Ferritin variant with "GMG" motif 提交 2019-03-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
链 G
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
链 I
1–183（183 aa）
链 J
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 L
1–183（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | 未声明 |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；sodium citrate tribase dihydrate, 1,6-Hexanediol
|
分辨率 2.93 Å R-free 0.368 |
| 6KE2 ABloop reengineered Ferritin Nanocage 提交 2019-07-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
|
突变：Deletion,K84Q | MG MAGNESIUM ION × 120 FE FE (III) ION × 48 CL CHLORIDE ION × 48 CA CALCIUM ION × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1M bincine pH 9.0, 2M MgCl2
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.179 |
| 6KE4 ABloop reengineered Ferritin Nanocage 提交 2019-07-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
|
突变：Deletion,K84Q | FE FE (III) ION × 48 MG MAGNESIUM ION × 72 CL CHLORIDE ION × 48 CA CALCIUM ION × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1M Bincine pH 9.0, 2M MgCl2
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.236 |
| 6M52 Human apo ferritin frozen on TEM grid with amorphous carbon supporting film 提交 2020-03-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
链 G
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
链 I
1–183（183 aa）
链 J
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 L
1–183（183 aa）
链 M
1–183（183 aa）
链 N
1–183（183 aa）
链 O
1–183（183 aa）
链 P
1–183（183 aa）
链 Q
1–183（183 aa）
链 R
1–183（183 aa）
链 S
1–183（183 aa）
链 T
1–183（183 aa）
链 U
1–183（183 aa）
链 V
1–183（183 aa）
链 W
1–183（183 aa）
链 X
1–183（183 aa）
|
未记录 | FE2 FE (II) ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 6M54 Human apo ferritin frozen on TEM grid with Amorphous nickel titanium alloy supporting film 提交 2020-03-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
链 G
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
链 I
1–183（183 aa）
链 J
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 L
1–183（183 aa）
链 M
1–183（183 aa）
链 N
1–183（183 aa）
链 O
1–183（183 aa）
链 P
1–183（183 aa）
链 Q
1–183（183 aa）
链 R
1–183（183 aa）
链 S
1–183（183 aa）
链 T
1–183（183 aa）
链 U
1–183（183 aa）
链 V
1–183（183 aa）
链 W
1–183（183 aa）
链 X
1–183（183 aa）
|
未记录 | FE2 FE (II) ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å |
| 6WYF Crystal structure of Human H-chain Ferritin variant 157C Delta C-star Modified with a RAFT Agent Soaked in an Acrylate Solution 提交 2020-05-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
突变：K86Q, C90E, C102A, C130A, K157C | RFT butyl 1-{[2-(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)ethyl]amino}-2-methyl-1-oxopropan-2-yl carbonotrithioate × 24 CA CALCIUM ION × 264 FE FE (III) ION × 48 NA SODIUM ION × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；5 uL reservoir + 5 uL 25 uM 157C delta C-star Human H-chain Ferritin in 15 mM HEPES, pH 7.0 against reservoir of 500 uL 25 mM HEPES, pH 8.0, 10 mM calcium chloride, 140 mM sodium chloride
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.131 |
| 6WYG Crystal structure of Human H-chain Ferritin variant 157C Delta C-star Modified with a RAFT agent 提交 2020-05-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
链 B
2–183（182 aa）
链 C
2–183（182 aa）
链 D
2–183（182 aa）
|
突变：K86Q, C90E, C102A, C130A, K157C 突变：K86Q, C90E, C102A, C130A, K157C 突变：K86Q, C90E, C102A, C130A, K157C 突变：K86Q, C90E, C102A, C130A, K157C | FE FE (III) ION × 54 CA CALCIUM ION × 48 RFT butyl 1-{[2-(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)ethyl]amino}-2-methyl-1-oxopropan-2-yl carbonotrithioate × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；5 uL reservoir + 5 uL 25 uM 157C delta C-star Human H-chain Ferritin in 15 mM HEPES, pH 7.0 against reservoir of 500 uL 50 mM MES, pH 6.5, 6 mM calcium chloride
|
分辨率 2.27 Å R-free 0.260 |
| 6WYH Crystal structure of Human H-chain Ferritin variant 157C Delta C-star Modified with a RAFT Agent Soaked in an Acrylate Solution 提交 2020-05-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
链 B
2–183（182 aa）
链 C
2–183（182 aa）
链 D
2–183（182 aa）
|
突变：K86Q, C90E, C102A, C130A, K157C 突变：K86Q, C90E, C102A, C130A, K157C 突变：K86Q, C90E, C102A, C130A, K157C 突变：K86Q, C90E, C102A, C130A, K157C | FE FE (III) ION × 60 RFT butyl 1-{[2-(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)ethyl]amino}-2-methyl-1-oxopropan-2-yl carbonotrithioate × 24 CA CALCIUM ION × 42 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；5 uL reservoir + 5 uL of 25 uM 157C delta C-star Human H-chain Ferritin in 15 mM HEPES, pH 7.0 against reservoir of 500 uL 50 mM MES, pH 6.5, 6 mM calcium chloride; crystals soaked in 1 M sodium acrylate, 50 mM calcium chloride, 25 mM MES, pH 6.5
|
分辨率 2.22 Å R-free 0.245 |
| 6Z6U 1.25 A structure of human apoferritin obtained from Titan Mono-BCOR microscope 提交 2020-05-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 1
1–183（183 aa）
链 2
1–183（183 aa）
链 4
1–183（183 aa）
链 6
1–183（183 aa）
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
链 G
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
链 I
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 M
1–183（183 aa）
链 O
1–183（183 aa）
链 P
1–183（183 aa）
链 Q
1–183（183 aa）
链 S
1–183（183 aa）
链 U
1–183（183 aa）
链 W
1–183（183 aa）
链 X
1–183（183 aa）
链 Y
1–183（183 aa）
链 a
1–183（183 aa）
链 e
1–183（183 aa）
链 r
1–183（183 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 24 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.25 Å |
| 6Z9E 1.55 A structure of human apoferritin obtained from data subset of Titan Mono-BCOR microscope 提交 2020-06-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 1
1–183（183 aa）
链 2
1–183（183 aa）
链 4
1–183（183 aa）
链 6
1–183（183 aa）
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
链 G
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
链 I
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 M
1–183（183 aa）
链 O
1–183（183 aa）
链 P
1–183（183 aa）
链 Q
1–183（183 aa）
链 S
1–183（183 aa）
链 U
1–183（183 aa）
链 W
1–183（183 aa）
链 X
1–183（183 aa）
链 Y
1–183（183 aa）
链 a
1–183（183 aa）
链 e
1–183（183 aa）
链 r
1–183（183 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 32 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.55 Å |
| 6Z9F 1.56 A structure of human apoferritin obtained from data subset of Titan Mono-BCOR microscope 提交 2020-06-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 1
1–183（183 aa）
链 2
1–183（183 aa）
链 4
1–183（183 aa）
链 6
1–183（183 aa）
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
链 G
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
链 I
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 M
1–183（183 aa）
链 O
1–183（183 aa）
链 P
1–183（183 aa）
链 Q
1–183（183 aa）
链 S
1–183（183 aa）
链 U
1–183（183 aa）
链 W
1–183（183 aa）
链 X
1–183（183 aa）
链 Y
1–183（183 aa）
链 a
1–183（183 aa）
链 e
1–183（183 aa）
链 r
1–183（183 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 32 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.56 Å |
| 7A6A 1.15 A structure of human apoferritin obtained from Titan Mono- BCOR microscope 提交 2020-08-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 1
1–183（183 aa）
链 2
1–183（183 aa）
链 4
1–183（183 aa）
链 6
1–183（183 aa）
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
链 G
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
链 I
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 M
1–183（183 aa）
链 O
1–183（183 aa）
链 P
1–183（183 aa）
链 Q
1–183（183 aa）
链 S
1–183（183 aa）
链 U
1–183（183 aa）
链 W
1–183（183 aa）
链 X
1–183（183 aa）
链 Y
1–183（183 aa）
链 a
1–183（183 aa）
链 e
1–183（183 aa）
链 r
1–183（183 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 32 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.15 Å |
| 7A6B 1.33 A structure of human apoferritin obtained from Titan Mono- BCOR microscope 提交 2020-08-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 1
1–183（183 aa）
链 2
1–183（183 aa）
链 4
1–183（183 aa）
链 6
1–183（183 aa）
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
链 G
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
链 I
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 M
1–183（183 aa）
链 O
1–183（183 aa）
链 P
1–183（183 aa）
链 Q
1–183（183 aa）
链 S
1–183（183 aa）
链 U
1–183（183 aa）
链 W
1–183（183 aa）
链 X
1–183（183 aa）
链 Y
1–183（183 aa）
链 a
1–183（183 aa）
链 e
1–183（183 aa）
链 r
1–183（183 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 32 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.33 Å |
| 7CK8 Crystal structure of human ferritin heavy chain mutant C90S/C102S/C130S 提交 2020-07-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
5–177（173 aa）
链 B
5–177（173 aa）
链 C
5–177（173 aa）
链 D
5–177（173 aa）
链 E
5–177（173 aa）
链 F
5–177（173 aa）
链 G
5–177（173 aa）
链 H
5–177（173 aa）
链 I
5–177（173 aa）
链 J
5–177（173 aa）
链 K
5–177（173 aa）
链 L
5–177（173 aa）
|
突变：C90S, C102S, C130S 突变：C90S, C102S, C130S 突变：C90S, C102S, C130S 突变：C90S, C102S, C130S 突变：C90S, C102S, C130S 突变：C90S, C102S, C130S 突变：C90S, C102S, C130S 突变：C90S, C102S, C130S 突变：C90S, C102S, C130S 突变：C90S, C102S, C130S 突变：C90S, C102S, C130S 突变：C90S, C102S, C130S | CL CHLORIDE ION × 90 MG MAGNESIUM ION × 58 GOL GLYCEROL × 12 OXY OXYGEN MOLECULE × 30 FE FE (III) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；291 K；0.1 M Bicine, pH 9.0, 1.7-2.0 M MgCl2
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.223 |
| 7CK9 Crystal structure of Doxorubicin loaded human ferritin heavy chain 提交 2020-07-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
6–177（172 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 96 MG MAGNESIUM ION × 72 OXY OXYGEN MOLECULE × 24 GOL GLYCEROL × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Bicine, pH 9.0, 1.7 - 2 M MgCl2
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.169 |
| 7JGK Crystal Structure of the Ni-bound Human Heavy-chain variant 122H-delta C-star with 2,5-furandihyrdoxamate collected at 100K 提交 2020-07-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
未记录 | V9Y N~2~,N~5~-dihydroxyfuran-2,5-dicarboxamide × 24 NI NICKEL (II) ION × 72 NA SODIUM ION × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Reservoir: 500 uL total volume: 31 mM CHES (pH 10), 93 mM NaCl,
0.474 mM NiCl2, 12% PEP
Sitting Drop: 7.6 uL reservoir, 2 uL of 25 uM ferritin, 2.4 uL of 10 mM
H2fdh in 50 mM CHES (pH 9.5) with 150 mM NaCl
|
分辨率 2.68 Å R-free 0.244 |
| 7JGL Crystal Structure of the Zn-bound Human Heavy-chain variant 122H-delta C-star with 2,5-furandihyrdoxamate collected at 100K 提交 2020-07-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
链 B
2–183（182 aa）
链 C
2–183（182 aa）
链 D
2–183（182 aa）
链 E
2–183（182 aa）
链 F
2–183（182 aa）
链 G
2–183（182 aa）
链 H
2–183（182 aa）
链 I
2–183（182 aa）
链 J
2–183（182 aa）
链 K
2–183（182 aa）
链 L
2–183（182 aa）
链 M
2–183（182 aa）
链 N
2–183（182 aa）
链 O
2–183（182 aa）
链 P
2–183（182 aa）
链 Q
2–183（182 aa）
链 R
2–183（182 aa）
链 S
2–183（182 aa）
链 T
2–183（182 aa）
链 U
2–183（182 aa）
链 V
2–183（182 aa）
链 W
2–183（182 aa）
链 X
2–183（182 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 62 NA SODIUM ION × 8 V9Y N~2~,N~5~-dihydroxyfuran-2,5-dicarboxamide × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Reservoir: 500 uL total volume: 25 mM CHES (pH 8.5), 75 mM NaCl,
0.474 mM ZnCl2, 10% PEP
Sitting Drop: 7.6 uL reservoir, 2 uL of 25 uM ferritin, 2.4 uL of 5 mM
H2fdh in 50 mM CHES (pH 9.5) with 150 mM NaCl
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.278 |
| 7JGL Crystal Structure of the Zn-bound Human Heavy-chain variant 122H-delta C-star with 2,5-furandihyrdoxamate collected at 100K 提交 2020-07-19 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 a
2–183（182 aa）
链 b
2–183（182 aa）
链 c
2–183（182 aa）
链 d
2–183（182 aa）
链 e
2–183（182 aa）
链 f
2–183（182 aa）
链 g
2–183（182 aa）
链 h
2–183（182 aa）
链 i
2–183（182 aa）
链 j
2–183（182 aa）
链 k
2–183（182 aa）
链 l
2–183（182 aa）
链 m
2–183（182 aa）
链 n
2–183（182 aa）
链 o
2–183（182 aa）
链 p
2–183（182 aa）
链 q
2–183（182 aa）
链 r
2–183（182 aa）
链 s
2–183（182 aa）
链 t
2–183（182 aa）
链 u
2–183（182 aa）
链 v
2–183（182 aa）
链 w
2–183（182 aa）
链 x
2–183（182 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 62 NA SODIUM ION × 8 V9Y N~2~,N~5~-dihydroxyfuran-2,5-dicarboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Reservoir: 500 uL total volume: 25 mM CHES (pH 8.5), 75 mM NaCl,
0.474 mM ZnCl2, 10% PEP
Sitting Drop: 7.6 uL reservoir, 2 uL of 25 uM ferritin, 2.4 uL of 5 mM
H2fdh in 50 mM CHES (pH 9.5) with 150 mM NaCl
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.278 |
| 7JGM Crystal Structure of the Ni-bound Human Heavy-chain variant 122H-delta C-star with meta-benzenedihyrdoxamate 提交 2020-07-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
链 B
2–183（182 aa）
链 C
2–183（182 aa）
链 D
2–183（182 aa）
链 E
2–183（182 aa）
链 F
2–183（182 aa）
链 G
2–183（182 aa）
链 H
2–183（182 aa）
链 I
2–183（182 aa）
链 J
2–183（182 aa）
链 K
2–183（182 aa）
链 L
2–183（182 aa）
链 M
2–183（182 aa）
链 N
2–183（182 aa）
链 O
2–183（182 aa）
链 P
2–183（182 aa）
链 Q
2–183（182 aa）
链 R
2–183（182 aa）
链 S
2–183（182 aa）
链 T
2–183（182 aa）
链 U
2–183（182 aa）
链 V
2–183（182 aa）
链 W
2–183（182 aa）
链 X
2–183（182 aa）
|
未记录 | NI NICKEL (II) ION × 38 NA SODIUM ION × 8 V9D N~1~,N~3~-dihydroxybenzene-1,3-dicarboxamide × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Reservoir: 500 uL total volume: 40 mM CHES (pH 8.5), 120 mM NaCl, 0.474 mM NiCl2, 10% PEP
Sitting Drop: 7.6 uL reservoir, 2 uL of 25 uM ferritin, 2.4 uL of 5 mM
m-bdh in 50 mM CHES (pH 9.5) with 150 mM NaCl
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.245 |
| 7JGM Crystal Structure of the Ni-bound Human Heavy-chain variant 122H-delta C-star with meta-benzenedihyrdoxamate 提交 2020-07-19 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 a
2–183（182 aa）
链 b
2–183（182 aa）
链 c
2–183（182 aa）
链 d
2–183（182 aa）
链 e
2–183（182 aa）
链 f
2–183（182 aa）
链 g
2–183（182 aa）
链 h
2–183（182 aa）
链 i
2–183（182 aa）
链 j
2–183（182 aa）
链 k
2–183（182 aa）
链 l
2–183（182 aa）
链 m
2–183（182 aa）
链 n
2–183（182 aa）
链 o
2–183（182 aa）
链 p
2–183（182 aa）
链 q
2–183（182 aa）
链 r
2–183（182 aa）
链 s
2–183（182 aa）
链 t
2–183（182 aa）
链 u
2–183（182 aa）
链 v
2–183（182 aa）
链 w
2–183（182 aa）
链 x
2–183（182 aa）
|
未记录 | NI NICKEL (II) ION × 38 NA SODIUM ION × 8 V9D N~1~,N~3~-dihydroxybenzene-1,3-dicarboxamide × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Reservoir: 500 uL total volume: 40 mM CHES (pH 8.5), 120 mM NaCl, 0.474 mM NiCl2, 10% PEP
Sitting Drop: 7.6 uL reservoir, 2 uL of 25 uM ferritin, 2.4 uL of 5 mM
m-bdh in 50 mM CHES (pH 9.5) with 150 mM NaCl
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.245 |
| 7JGN Crystal Structure of the Zn-bound Human Heavy-chain variant 122H-delta C-star with meta-benzenedihyrdoxamate collected at 100K 提交 2020-07-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
链 B
2–183（182 aa）
链 C
2–183（182 aa）
链 D
2–183（182 aa）
链 E
2–183（182 aa）
链 F
2–183（182 aa）
链 G
2–183（182 aa）
链 H
2–183（182 aa）
链 I
2–183（182 aa）
链 J
2–183（182 aa）
链 K
2–183（182 aa）
链 L
2–183（182 aa）
链 M
2–183（182 aa）
链 N
2–183（182 aa）
链 O
2–183（182 aa）
链 P
2–183（182 aa）
链 Q
2–183（182 aa）
链 R
2–183（182 aa）
链 S
2–183（182 aa）
链 T
2–183（182 aa）
链 U
2–183（182 aa）
链 V
2–183（182 aa）
链 W
2–183（182 aa）
链 X
2–183（182 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 62 NA SODIUM ION × 8 V9D N~1~,N~3~-dihydroxybenzene-1,3-dicarboxamide × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Reservoir: 500 uL total volume: 50 mM CHES (pH 9.5), 150 mM NaCl, 0.474 mM ZnCl2, 12.6% PEP
Sitting Drop: 7.6 uL reservoir, 2 uL of 25 uM ferritin, 2.4 uL of 10 mM
m-bdh in 50 mM CHES (pH 9.5) with 150 mM NaCl
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.229 |
| 7JGN Crystal Structure of the Zn-bound Human Heavy-chain variant 122H-delta C-star with meta-benzenedihyrdoxamate collected at 100K 提交 2020-07-19 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 a
2–183（182 aa）
链 b
2–183（182 aa）
链 c
2–183（182 aa）
链 d
2–183（182 aa）
链 e
2–183（182 aa）
链 f
2–183（182 aa）
链 g
2–183（182 aa）
链 h
2–183（182 aa）
链 i
2–183（182 aa）
链 j
2–183（182 aa）
链 k
2–183（182 aa）
链 l
2–183（182 aa）
链 m
2–183（182 aa）
链 n
2–183（182 aa）
链 o
2–183（182 aa）
链 p
2–183（182 aa）
链 q
2–183（182 aa）
链 r
2–183（182 aa）
链 s
2–183（182 aa）
链 t
2–183（182 aa）
链 u
2–183（182 aa）
链 v
2–183（182 aa）
链 w
2–183（182 aa）
链 x
2–183（182 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 62 NA SODIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Reservoir: 500 uL total volume: 50 mM CHES (pH 9.5), 150 mM NaCl, 0.474 mM ZnCl2, 12.6% PEP
Sitting Drop: 7.6 uL reservoir, 2 uL of 25 uM ferritin, 2.4 uL of 10 mM
m-bdh in 50 mM CHES (pH 9.5) with 150 mM NaCl
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.229 |
| 7JGO Crystal Structure of the Ni-bound Human Heavy-chain variant 122H-delta C-star with 2,5-furandihyrdoxamate collected at 278K 提交 2020-07-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
未记录 | V9Y N~2~,N~5~-dihydroxyfuran-2,5-dicarboxamide × 24 NI NICKEL (II) ION × 72 NA SODIUM ION × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；298 K；Reservoir: 500 uL total volume: 50 mM CHES (pH 9.5), 150 mM NaCl, 0.474 mM NiCl2, 12.6% PEP
Sitting Drop: 12.7 uL reservoir, 3.3 uL of 25 uM ferritin, 4 uL of 10 mM
fdh in 50 mM CHES (pH 9.5) with 150 mM NaCl
|
分辨率 3.08 Å R-free 0.248 |
| 7JGP Crystal Structure of the Ni-bound Human Heavy-chain variant 122H-delta C-star with 2,5-furandihyrdoxamate at 318K 提交 2020-07-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
未记录 | NI NICKEL (II) ION × 72 NA SODIUM ION × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；Reservoir: 500 uL total volume: 50 mM CHES (pH 9.5), 150 mM NaCl, 0.474 mM NiCl2, 12.6% PEP
Sitting Drop: 7.6 uL reservoir, 2 uL of 25 uM ferritin, 2.4 uL of 5 mM
H2fdh in 50 mM CHES (pH 9.5) with 150 mM NaCl
|
分辨率 6.42 Å R-free 0.302 |
| 7JGQ Crystal Structure of the Ni-bound Human Heavy-chain variant 122H-delta C-star with 2,5-furandihyrdoxamate collected at 278K after one heating/cooling cycle 提交 2020-07-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
未记录 | V9Y N~2~,N~5~-dihydroxyfuran-2,5-dicarboxamide × 24 NI NICKEL (II) ION × 72 NA SODIUM ION × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Reservoir: 500 uL total volume: 50 mM CHES (pH 9.5), 150 mM NaCl, 0.474 mM NiCl2, 12.6% PEP
Sitting Drop: 12.7 uL reservoir, 3.3 uL of 25 uM ferritin, 4 uL of 10 mM
fdh in 50 mM CHES (pH 9.5) with 150 mM NaCl
|
分辨率 3.01 Å R-free 0.251 |
| 7K26 Crystal structure of Human H-chain Ferritin variant infused with Sodium Acrylate 提交 2020-09-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
链 B
2–183（182 aa）
链 C
2–183（182 aa）
链 D
2–183（182 aa）
链 E
2–183（182 aa）
链 F
2–183（182 aa）
链 G
2–183（182 aa）
链 H
2–183（182 aa）
链 I
2–183（182 aa）
链 J
2–183（182 aa）
链 K
2–183（182 aa）
链 L
2–183（182 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 24 NA SODIUM ION × 14 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 14 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Reservoir: 525 uL total volume 100 uL of 500 mM HEPES pH 7.0, 125 uL of 1 M NH4OAc, 300 uL 2-Methyl-2,4-pentanediol
Sitting drop: 5 uL reservoir, 5 uL of 25 uM dCs ferritin
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.254 |
| 7K3V Apoferritin structure at 1.34 angstrom resolution determined from a 300 kV Titan Krios G3i electron microscope with K3 detector 提交 2020-09-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
6–177（172 aa）
链 B
6–177（172 aa）
链 C
6–177（172 aa）
链 D
6–177（172 aa）
链 E
6–177（172 aa）
链 F
6–177（172 aa）
链 G
6–177（172 aa）
链 H
6–177（172 aa）
链 I
6–177（172 aa）
链 J
6–177（172 aa）
链 K
6–177（172 aa）
链 L
6–177（172 aa）
链 M
6–177（172 aa）
链 N
6–177（172 aa）
链 O
6–177（172 aa）
链 P
6–177（172 aa）
链 Q
6–177（172 aa）
链 R
6–177（172 aa）
链 S
6–177（172 aa）
链 T
6–177（172 aa）
链 U
6–177（172 aa）
链 V
6–177（172 aa）
链 W
6–177（172 aa）
链 X
6–177（172 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 254 NA SODIUM ION × 80 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；50 mM Tris-HCl (pH 8.0), 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.34 Å |
| 7K3W Apoferritin structure at 1.36 angstrom resolution determined from a 300 kV Titan Krios G3i electron microscope with Falcon4 detector 提交 2020-09-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
6–177（172 aa）
链 B
6–177（172 aa）
链 C
6–177（172 aa）
链 D
6–177（172 aa）
链 E
6–177（172 aa）
链 F
6–177（172 aa）
链 G
6–177（172 aa）
链 H
6–177（172 aa）
链 I
6–177（172 aa）
链 J
6–177（172 aa）
链 K
6–177（172 aa）
链 L
6–177（172 aa）
链 M
6–177（172 aa）
链 N
6–177（172 aa）
链 O
6–177（172 aa）
链 P
6–177（172 aa）
链 Q
6–177（172 aa）
链 R
6–177（172 aa）
链 S
6–177（172 aa）
链 T
6–177（172 aa）
链 U
6–177（172 aa）
链 V
6–177（172 aa）
链 W
6–177（172 aa）
链 X
6–177（172 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 270 NA SODIUM ION × 112 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；50 mM Tris-HCl (pH 8.0), 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.36 Å |
| 7KE3 Heavy chain ferritin with C-terminal EBNA1 epitope 提交 2020-10-10 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
链 G
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
链 I
1–183（183 aa）
链 J
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 L
1–183（183 aa）
|
未记录 | TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 12 FE FE (III) ION × 40 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；0.1M HEPES pH 7.0, 30% Jeffamine M-600 pH 7.0
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.271 |
| 7KE5 Heavy chain ferritin with N-terminal EBNA1 epitope 提交 2020-10-10 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
链 B
2–183（182 aa）
链 C
2–183（182 aa）
链 D
2–183（182 aa）
链 E
2–183（182 aa）
链 F
2–183（182 aa）
链 G
2–183（182 aa）
链 H
2–183（182 aa）
链 I
2–183（182 aa）
链 J
2–183（182 aa）
链 K
2–183（182 aa）
链 L
2–183（182 aa）
|
未记录 | TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 12 FE FE (III) ION × 32 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；289.15 K；0.1M ammonium citrate tribasic pH 7.0, 12% PEG 3350
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.317 |
| 7PF1 UVC treated Human apoferritin 提交 2021-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
4–177（174 aa）
链 B
4–177（174 aa）
链 C
4–177（174 aa）
链 D
4–177（174 aa）
链 E
4–177（174 aa）
链 F
4–177（174 aa）
链 G
4–177（174 aa）
链 H
4–177（174 aa）
链 I
4–177（174 aa）
链 J
4–177（174 aa）
链 K
4–177（174 aa）
链 L
4–177（174 aa）
链 M
4–177（174 aa）
链 N
4–177（174 aa）
链 O
4–177（174 aa）
链 P
4–177（174 aa）
链 Q
4–177（174 aa）
链 R
4–177（174 aa）
链 S
4–177（174 aa）
链 T
4–177（174 aa）
链 U
4–177（174 aa）
链 V
4–177（174 aa）
链 W
4–177（174 aa）
链 X
4–177（174 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 96 MG MAGNESIUM ION × 167 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.10 Å |
| 7R5O 1.58 A STRUCTURE OF HUMAN APOFERRITIN OBTAINED FROM TITAN KRIOS 2 AT eBIC, DLS UNDER COMMISSIONING SESSION CM26464-2 提交 2022-02-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
5–177（173 aa）
链 B
5–177（173 aa）
链 C
5–177（173 aa）
链 D
5–177（173 aa）
链 E
5–177（173 aa）
链 F
5–177（173 aa）
链 G
5–177（173 aa）
链 H
5–177（173 aa）
链 I
5–177（173 aa）
链 J
5–177（173 aa）
链 K
5–177（173 aa）
链 L
5–177（173 aa）
链 M
5–177（173 aa）
链 N
5–177（173 aa）
链 O
5–177（173 aa）
链 P
5–177（173 aa）
链 Q
5–177（173 aa）
链 R
5–177（173 aa）
链 S
5–177（173 aa）
链 T
5–177（173 aa）
链 U
5–177（173 aa）
链 V
5–177（173 aa）
链 W
5–177（173 aa）
链 X
5–177（173 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 24 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM Tris-HCl, pH 7.5, 100 mM NaCl, 1 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot time of 2.5 seconds
|
分辨率 1.60 Å |
| 7RRP Apoferritin structure at 1.27 angstrom resolution determined from a 300 kV Titan Krios G3i electron microscope with Falcon4 detector 提交 2021-08-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
6–177（172 aa）
链 B
6–177（172 aa）
链 C
6–177（172 aa）
链 D
6–177（172 aa）
链 E
6–177（172 aa）
链 F
6–177（172 aa）
链 G
6–177（172 aa）
链 H
6–177（172 aa）
链 I
6–177（172 aa）
链 J
6–177（172 aa）
链 K
6–177（172 aa）
链 L
6–177（172 aa）
链 M
6–177（172 aa）
链 N
6–177（172 aa）
链 O
6–177（172 aa）
链 P
6–177（172 aa）
链 Q
6–177（172 aa）
链 R
6–177（172 aa）
链 S
6–177（172 aa）
链 T
6–177（172 aa）
链 U
6–177（172 aa）
链 V
6–177（172 aa）
链 W
6–177（172 aa）
链 X
6–177（172 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 206 NA SODIUM ION × 72 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；50 mM Tris-HCl (pH 8.0), 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.27 Å |
| 7V66 Structure of Apoferritin 提交 2021-08-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
6–177（172 aa）
链 B
6–177（172 aa）
链 C
6–177（172 aa）
链 D
6–177（172 aa）
链 E
6–177（172 aa）
链 F
6–177（172 aa）
链 G
6–177（172 aa）
链 H
6–177（172 aa）
链 I
6–177（172 aa）
链 J
6–177（172 aa）
链 K
6–177（172 aa）
链 L
6–177（172 aa）
链 M
6–177（172 aa）
链 N
6–177（172 aa）
链 O
6–177（172 aa）
链 P
6–177（172 aa）
链 Q
6–177（172 aa）
链 R
6–177（172 aa）
链 S
6–177（172 aa）
链 T
6–177（172 aa）
链 U
6–177（172 aa）
链 V
6–177（172 aa）
链 W
6–177（172 aa）
链 X
6–177（172 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.89 Å |
| 7VD8 1.96 A structure of human apoferritin obtained from Talos Arctica microscope 提交 2021-09-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
6–177（172 aa）
链 B
6–177（172 aa）
链 C
6–177（172 aa）
链 D
6–177（172 aa）
链 E
6–177（172 aa）
链 F
6–177（172 aa）
链 G
6–177（172 aa）
链 H
6–177（172 aa）
链 I
6–177（172 aa）
链 J
6–177（172 aa）
链 K
6–177（172 aa）
链 L
6–177（172 aa）
链 M
6–177（172 aa）
链 N
6–177（172 aa）
链 O
6–177（172 aa）
链 P
6–177（172 aa）
链 Q
6–177（172 aa）
链 R
6–177（172 aa）
链 S
6–177（172 aa）
链 T
6–177（172 aa）
链 U
6–177（172 aa）
链 V
6–177（172 aa）
链 W
6–177（172 aa）
链 X
6–177（172 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 254 NA SODIUM ION × 75 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.96 Å |
| 7ZG7 Structure of human Apoferritin obtained from ssDNA coated grid 提交 2022-04-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
6–177（172 aa）
链 B
6–177（172 aa）
链 C
6–177（172 aa）
链 D
6–177（172 aa）
链 E
6–177（172 aa）
链 F
6–177（172 aa）
链 G
6–177（172 aa）
链 H
6–177（172 aa）
链 I
6–177（172 aa）
链 J
6–177（172 aa）
链 K
6–177（172 aa）
链 L
6–177（172 aa）
链 M
6–177（172 aa）
链 N
6–177（172 aa）
链 O
6–177（172 aa）
链 P
6–177（172 aa）
链 Q
6–177（172 aa）
链 R
6–177（172 aa）
链 S
6–177（172 aa）
链 T
6–177（172 aa）
链 U
6–177（172 aa）
链 V
6–177（172 aa）
链 W
6–177（172 aa）
链 X
6–177（172 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 270 NA SODIUM ION × 112 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；6 s blot time,30 s waiting time, ssDNA covered grid
|
分辨率 1.77 Å |
| 8A2L X-ray structure of TRIL-encapsulated human heavy chain ferritin 提交 2022-06-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 AAA
2–183（182 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 FE FE (III) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；2.0 M magnesium chloride, 0.1 M bicine buffer pH 9.0
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.224 |
| 8A2M X-ray structure of Ru(bpy)3]2+ complex (Ru1)-encapsulated human heavy chain ferritin 提交 2022-06-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 AAA
2–183（182 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 192 MG MAGNESIUM ION × 192 FE FE (III) ION × 48 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；2.0 M magnesium chloride, 0.1 M bicine buffer pH 9.0
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.190 |
| 8A5N X-ray structure of human H-chain ferritin treated with SDS 提交 2022-06-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 AAA
2–183（182 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 240 GOL GLYCEROL × 24 FE FE (III) ION × 24 MG MAGNESIUM ION × 240 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；2.0 M magnesium chloride
0.1 M bicine buffer pH 9.0
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.190 |
| 8AAV Human heavy chain ferritin with introduced Cys residues modified with C10 ligand 提交 2022-07-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
链 B
2–183（182 aa）
链 C
2–183（182 aa）
链 D
2–183（182 aa）
链 E
2–183（182 aa）
链 F
2–183（182 aa）
链 G
2–183（182 aa）
链 H
2–183（182 aa）
|
未记录 | O3K 2-bromanyl-N-decyl-ethanamide × 48 FE FE (III) ION × 24 MG MAGNESIUM ION × 45 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；Crystallization of little amounts of protein or functionalized protein variants were performed via hanging drop vapor diffusion techniques. Reservoir solution (100 mM Tris, 500 mM MgOAc, pH 8.5) was prepared in a 24- well manual plate set. Drops were prepared on siliconized glass cover slides (Jena Bioscience) by mixing 2 microL reservoir solutions with 1 microL 50 mM Tris, 1 M NaCl, pH 7.5 buffer and 1 microL of respective ferritin variant. Plates were incubated at 298K. After one day first crystals were visible.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.177 |
| 8B7O X-ray structure of Auranofin-human H-chain ferritin 提交 2022-09-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 AAA
2–183（182 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 144 MG MAGNESIUM ION × 192 FE FE (III) ION × 24 AU GOLD ION × 120 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；2.0 M magnesium chloride
0.1 M Bicine buffer pH 9.0
|
分辨率 1.17 Å R-free 0.167 |
| 8CPM Human apoferritin after 405 nm laser exposure 提交 2023-03-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 1
5–177（173 aa）
链 2
5–177（173 aa）
链 4
5–177（173 aa）
链 6
5–177（173 aa）
链 A
5–177（173 aa）
链 B
5–177（173 aa）
链 E
5–177（173 aa）
链 F
5–177（173 aa）
链 G
5–177（173 aa）
链 H
5–177（173 aa）
链 I
5–177（173 aa）
链 K
5–177（173 aa）
链 M
5–177（173 aa）
链 O
5–177（173 aa）
链 P
5–177（173 aa）
链 Q
5–177（173 aa）
链 S
5–177（173 aa）
链 U
5–177（173 aa）
链 W
5–177（173 aa）
链 X
5–177（173 aa）
链 Y
5–177（173 aa）
链 a
5–177（173 aa）
链 e
5–177（173 aa）
链 r
5–177（173 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 24 MG MAGNESIUM ION × 14 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.81 Å |
| 8CPS Human apoferritin 提交 2023-03-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 1
5–177（173 aa）
链 2
5–177（173 aa）
链 4
5–177（173 aa）
链 6
5–177（173 aa）
链 A
5–177（173 aa）
链 B
5–177（173 aa）
链 E
5–177（173 aa）
链 F
5–177（173 aa）
链 G
5–177（173 aa）
链 H
5–177（173 aa）
链 I
5–177（173 aa）
链 K
5–177（173 aa）
链 M
5–177（173 aa）
链 O
5–177（173 aa）
链 P
5–177（173 aa）
链 Q
5–177（173 aa）
链 S
5–177（173 aa）
链 U
5–177（173 aa）
链 W
5–177（173 aa）
链 X
5–177（173 aa）
链 Y
5–177（173 aa）
链 a
5–177（173 aa）
链 e
5–177（173 aa）
链 r
5–177（173 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 24 MG MAGNESIUM ION × 14 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.82 Å |
| 8CPT Human apoferritin after 488 nm laser exposure 提交 2023-03-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 1
5–177（173 aa）
链 2
5–177（173 aa）
链 4
5–177（173 aa）
链 6
5–177（173 aa）
链 A
5–177（173 aa）
链 B
5–177（173 aa）
链 E
5–177（173 aa）
链 F
5–177（173 aa）
链 G
5–177（173 aa）
链 H
5–177（173 aa）
链 I
5–177（173 aa）
链 K
5–177（173 aa）
链 M
5–177（173 aa）
链 O
5–177（173 aa）
链 P
5–177（173 aa）
链 Q
5–177（173 aa）
链 S
5–177（173 aa）
链 U
5–177（173 aa）
链 W
5–177（173 aa）
链 X
5–177（173 aa）
链 Y
5–177（173 aa）
链 a
5–177（173 aa）
链 e
5–177（173 aa）
链 r
5–177（173 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 24 MG MAGNESIUM ION × 14 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.79 Å |
| 8CPU Human apoferritin after 561 nm laser exposure 提交 2023-03-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 1
5–177（173 aa）
链 2
5–177（173 aa）
链 4
5–177（173 aa）
链 6
5–177（173 aa）
链 A
5–177（173 aa）
链 B
5–177（173 aa）
链 E
5–177（173 aa）
链 F
5–177（173 aa）
链 G
5–177（173 aa）
链 H
5–177（173 aa）
链 I
5–177（173 aa）
链 K
5–177（173 aa）
链 M
5–177（173 aa）
链 O
5–177（173 aa）
链 P
5–177（173 aa）
链 Q
5–177（173 aa）
链 S
5–177（173 aa）
链 U
5–177（173 aa）
链 W
5–177（173 aa）
链 X
5–177（173 aa）
链 Y
5–177（173 aa）
链 a
5–177（173 aa）
链 e
5–177（173 aa）
链 r
5–177（173 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 24 MG MAGNESIUM ION × 14 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.76 Å |
| 8CPV Human apoferritin 提交 2023-03-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 1
5–177（173 aa）
链 2
5–177（173 aa）
链 4
5–177（173 aa）
链 6
5–177（173 aa）
链 A
5–177（173 aa）
链 B
5–177（173 aa）
链 E
5–177（173 aa）
链 F
5–177（173 aa）
链 G
5–177（173 aa）
链 H
5–177（173 aa）
链 I
5–177（173 aa）
链 K
5–177（173 aa）
链 M
5–177（173 aa）
链 O
5–177（173 aa）
链 P
5–177（173 aa）
链 Q
5–177（173 aa）
链 S
5–177（173 aa）
链 U
5–177（173 aa）
链 W
5–177（173 aa）
链 X
5–177（173 aa）
链 Y
5–177（173 aa）
链 a
5–177（173 aa）
链 e
5–177（173 aa）
链 r
5–177（173 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 24 MG MAGNESIUM ION × 14 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.76 Å |
| 8CPW Human apoferritin after 405 nm + 488 nm laser exposure in presence of rsEGFP2 提交 2023-03-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 1
5–177（173 aa）
链 2
5–177（173 aa）
链 4
5–177（173 aa）
链 6
5–177（173 aa）
链 A
5–177（173 aa）
链 B
5–177（173 aa）
链 E
5–177（173 aa）
链 F
5–177（173 aa）
链 G
5–177（173 aa）
链 H
5–177（173 aa）
链 I
5–177（173 aa）
链 K
5–177（173 aa）
链 M
5–177（173 aa）
链 O
5–177（173 aa）
链 P
5–177（173 aa）
链 Q
5–177（173 aa）
链 S
5–177（173 aa）
链 U
5–177（173 aa）
链 W
5–177（173 aa）
链 X
5–177（173 aa）
链 Y
5–177（173 aa）
链 a
5–177（173 aa）
链 e
5–177（173 aa）
链 r
5–177（173 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 24 MG MAGNESIUM ION × 14 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.79 Å |
| 8CPX Human apoferritin after 488 nm laser exposure in presence of rsEGFP2 提交 2023-03-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 1
5–177（173 aa）
链 2
5–177（173 aa）
链 4
5–177（173 aa）
链 6
5–177（173 aa）
链 A
5–177（173 aa）
链 B
5–177（173 aa）
链 E
5–177（173 aa）
链 F
5–177（173 aa）
链 G
5–177（173 aa）
链 H
5–177（173 aa）
链 I
5–177（173 aa）
链 K
5–177（173 aa）
链 M
5–177（173 aa）
链 O
5–177（173 aa）
链 P
5–177（173 aa）
链 Q
5–177（173 aa）
链 S
5–177（173 aa）
链 U
5–177（173 aa）
链 W
5–177（173 aa）
链 X
5–177（173 aa）
链 Y
5–177（173 aa）
链 a
5–177（173 aa）
链 e
5–177（173 aa）
链 r
5–177（173 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 24 MG MAGNESIUM ION × 14 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.76 Å |
| 8DHX Human liver ferritin 提交 2022-06-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 1
1–183（183 aa）
链 2
1–183（183 aa）
链 4
1–183（183 aa）
链 6
1–183（183 aa）
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
链 G
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
链 I
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 M
1–183（183 aa）
链 O
1–183（183 aa）
链 P
1–183（183 aa）
链 Q
1–183（183 aa）
链 S
1–183（183 aa）
链 U
1–183（183 aa）
链 W
1–183（183 aa）
链 X
1–183（183 aa）
链 Y
1–183（183 aa）
链 a
1–183（183 aa）
链 e
1–183（183 aa）
链 r
1–183（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.92 Å |
| 8DNP Human Brain Ferritin Heavy Chain 提交 2022-07-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
链 G
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
链 I
1–183（183 aa）
链 J
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 L
1–183（183 aa）
链 M
1–183（183 aa）
链 N
1–183（183 aa）
链 O
1–183（183 aa）
链 P
1–183（183 aa）
链 Q
1–183（183 aa）
链 R
1–183（183 aa）
链 S
1–183（183 aa）
链 T
1–183（183 aa）
链 U
1–183（183 aa）
链 V
1–183（183 aa）
链 W
1–183（183 aa）
链 X
1–183（183 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 24 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.69 Å |
| 8F49 1.8 angstrom structure of apoferritin embedded in crystalline ice 提交 2022-11-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
6–177（172 aa）
链 B
6–177（172 aa）
链 C
6–177（172 aa）
链 D
6–177（172 aa）
链 E
6–177（172 aa）
链 F
6–177（172 aa）
链 G
6–177（172 aa）
链 H
6–177（172 aa）
链 I
6–177（172 aa）
链 J
6–177（172 aa）
链 K
6–177（172 aa）
链 L
6–177（172 aa）
链 M
6–177（172 aa）
链 N
6–177（172 aa）
链 O
6–177（172 aa）
链 P
6–177（172 aa）
链 Q
6–177（172 aa）
链 R
6–177（172 aa）
链 S
6–177（172 aa）
链 T
6–177（172 aa）
链 U
6–177（172 aa）
链 V
6–177（172 aa）
链 W
6–177（172 aa）
链 X
6–177（172 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
|
分辨率 1.80 Å |
| 8F4L Structure of human apoferritin embedded in crystalline ice 提交 2022-11-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
6–177（172 aa）
链 B
6–177（172 aa）
链 C
6–177（172 aa）
链 D
6–177（172 aa）
链 E
6–177（172 aa）
链 F
6–177（172 aa）
链 G
6–177（172 aa）
链 H
6–177（172 aa）
链 I
6–177（172 aa）
链 J
6–177（172 aa）
链 K
6–177（172 aa）
链 L
6–177（172 aa）
链 M
6–177（172 aa）
链 N
6–177（172 aa）
链 O
6–177（172 aa）
链 P
6–177（172 aa）
链 Q
6–177（172 aa）
链 R
6–177（172 aa）
链 S
6–177（172 aa）
链 T
6–177（172 aa）
链 U
6–177（172 aa）
链 V
6–177（172 aa）
链 W
6–177（172 aa）
链 X
6–177（172 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Apo-ferritin embedded in crystalline ice.
|
分辨率 2.40 Å |
| 8HHS Structure of human apoferritin embedded in crystalline ice 提交 2022-11-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
6–177（172 aa）
链 B
6–177（172 aa）
链 C
6–177（172 aa）
链 D
6–177（172 aa）
链 E
6–177（172 aa）
链 F
6–177（172 aa）
链 G
6–177（172 aa）
链 H
6–177（172 aa）
链 I
6–177（172 aa）
链 J
6–177（172 aa）
链 K
6–177（172 aa）
链 L
6–177（172 aa）
链 M
6–177（172 aa）
链 N
6–177（172 aa）
链 O
6–177（172 aa）
链 P
6–177（172 aa）
链 Q
6–177（172 aa）
链 R
6–177（172 aa）
链 S
6–177（172 aa）
链 T
6–177（172 aa）
链 U
6–177（172 aa）
链 V
6–177（172 aa）
链 W
6–177（172 aa）
链 X
6–177（172 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
|
分辨率 2.40 Å |
| 8J9L Crystal Structure of Human H-Ferritin variant 123F assembling in solution2 提交 2023-05-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
链 G
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
链 I
1–183（183 aa）
链 J
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 L
1–183（183 aa）
|
突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F | FE FE (III) ION × 32 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 9.5；293 K；50 mM BICINE pH 9.5, 800 mM sodium chloride
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.289 |
| 8J9M Crystal Structure of Human H-Ferritin variant 123F assembling in solution3 提交 2023-05-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
|
突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F | FE FE (III) ION × 64 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；50 mM TRIS-HCL pH 7.5, 200 mM Sodium chloride
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.243 |
| 8JAI Crystal Structure of Human H-Ferritin variant 123F assembling in solution 1 提交 2023-05-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
链 G
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
链 I
1–183（183 aa）
链 J
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 L
1–183（183 aa）
链 M
1–183（183 aa）
链 N
1–183（183 aa）
链 O
1–183（183 aa）
链 P
1–183（183 aa）
链 Q
1–183（183 aa）
链 R
1–183（183 aa）
链 S
1–183（183 aa）
链 T
1–183（183 aa）
链 U
1–183（183 aa）
链 V
1–183（183 aa）
链 W
1–183（183 aa）
链 X
1–183（183 aa）
|
突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F 突变：D123F | FE FE (III) ION × 18 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 9.5；293 K；50 mM CAPS pH 9.5, 200 mM Sodium chloride
|
分辨率 2.56 Å R-free 0.368 |
| 8KFD Ferritin drug carrier(FDC) for encapsulated platinum (IV) prodrug for esophageal squamous cell carcinoma targeted therapy 提交 2023-08-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
未记录 | PT PLATINUM (II) ION × 24 GOL GLYCEROL × 72 CA CALCIUM ION × 24 CL CHLORIDE ION × 288 MG MAGNESIUM ION × 72 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；291 K；1.6-1.9 M MgCl2 and 0.1 M Bicine pH 9.0
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.166 |
| 8PP2 Binary crystal structure of positively supercharged ferritin variant Ftn(pos) and native(K86Q) human heavy chain ferritin (Mg formate condition) 提交 2023-07-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
6–177（172 aa）
链 B
6–177（172 aa）
链 C
6–177（172 aa）
链 D
6–177（172 aa）
链 E
6–177（172 aa）
链 F
6–177（172 aa）
|
突变：K86Q, A18K, C90K, N98R, C102K, H105K, N25R, N109K, D123K, E162R 突变：K86Q, A18K, C90K, N98R, C102K, H105K, N25R, N109K, D123K, E162R 突变：K86Q, A18K, C90K, N98R, C102K, H105K, N25R, N109K, D123K, E162R 突变：K86Q, A18K, C90K, N98R, C102K, H105K, N25R, N109K, D123K, E162R 突变：K86Q, A18K, C90K, N98R, C102K, H105K, N25R, N109K, D123K, E162R 突变：K86Q, A18K, C90K, N98R, C102K, H105K, N25R, N109K, D123K, E162R | GOL GLYCEROL × 20 FE FE (III) ION × 24 MG MAGNESIUM ION × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293.15 K；reservoir: 0.19M Magnesium Formate
Ftn(pos): 4 mg/mL in 50mM Tris pH 7.5 1 M NaCl
Ftn(Wildtype): 4mg/mL in 50mM Tris pH 7.5 0.3 M NaCl
2 uL reservoir + 1uL Ftn(pos) + 1uL Ftn(Wildtype) added to coverslide in this order.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.247 |
| 8PP2 Binary crystal structure of positively supercharged ferritin variant Ftn(pos) and native(K86Q) human heavy chain ferritin (Mg formate condition) 提交 2023-07-06 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 G
6–177（172 aa）
链 H
6–177（172 aa）
链 I
6–177（172 aa）
链 J
6–177（172 aa）
链 K
6–177（172 aa）
链 L
6–177（172 aa）
|
突变：K86Q 突变：K86Q 突变：K86Q 突变：K86Q 突变：K86Q 突变：K86Q | FE FE (III) ION × 24 MG MAGNESIUM ION × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293.15 K；reservoir: 0.19M Magnesium Formate
Ftn(pos): 4 mg/mL in 50mM Tris pH 7.5 1 M NaCl
Ftn(Wildtype): 4mg/mL in 50mM Tris pH 7.5 0.3 M NaCl
2 uL reservoir + 1uL Ftn(pos) + 1uL Ftn(Wildtype) added to coverslide in this order.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.247 |
| 8PP3 Binary crystal structure of positively supercharged ferritin variant Ftn(pos) and crystal contact tuned negatively supercharged ferritin variant Ftn(neg)-m1 (Mg formate condition) 提交 2023-07-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
|
突变：A18K, C90K, N98R, C102K, H105K N25R, N109K, D123K, E162R 突变：A18K, C90K, N98R, C102K, H105K N25R, N109K, D123K, E162R 突变：A18K, C90K, N98R, C102K, H105K N25R, N109K, D123K, E162R 突变：A18K, C90K, N98R, C102K, H105K N25R, N109K, D123K, E162R 突变：A18K, C90K, N98R, C102K, H105K N25R, N109K, D123K, E162R 突变：A18K, C90K, N98R, C102K, H105K N25R, N109K, D123K, E162R | FE FE (III) ION × 24 GOL GLYCEROL × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293.15 K；reservoir: 0.19M Magnesium FormateFtn(pos): 4 mg/mL in 50mM Tris pH 7.5 1 M NaClFtn(Wildtype): 4mg/mL in 50mM Tris pH 7.5 0.3 M NaCl2 uL reservoir + 1uL Ftn(pos) + 1uL Ftn(Wildtype) added to coverslide in this order.
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.241 |
| 8PP3 Binary crystal structure of positively supercharged ferritin variant Ftn(pos) and crystal contact tuned negatively supercharged ferritin variant Ftn(neg)-m1 (Mg formate condition) 提交 2023-07-06 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 G
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
链 I
1–183（183 aa）
链 J
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 L
1–183（183 aa）
|
突变：C90E, C102E, H105E 突变：C90E, C102E, H105E 突变：C90E, C102E, H105E 突变：C90E, C102E, H105E 突变：C90E, C102E, H105E 突变：C90E, C102E, H105E | FE FE (III) ION × 24 MG MAGNESIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293.15 K；reservoir: 0.19M Magnesium FormateFtn(pos): 4 mg/mL in 50mM Tris pH 7.5 1 M NaClFtn(Wildtype): 4mg/mL in 50mM Tris pH 7.5 0.3 M NaCl2 uL reservoir + 1uL Ftn(pos) + 1uL Ftn(Wildtype) added to coverslide in this order.
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.241 |
| 8PP4 Binary crystal structure of positively supercharged ferritin variant Ftn(pos) and reduced charge negatively supercharged ferritin variant Ftn(neg)-m3 (Mg formate condition) 提交 2023-07-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
|
突变：A18K, C90K, N98R, C102K, H105K N25R, N109K, D123K, E162R 突变：A18K, C90K, N98R, C102K, H105K N25R, N109K, D123K, E162R 突变：A18K, C90K, N98R, C102K, H105K N25R, N109K, D123K, E162R 突变：A18K, C90K, N98R, C102K, H105K N25R, N109K, D123K, E162R 突变：A18K, C90K, N98R, C102K, H105K N25R, N109K, D123K, E162R 突变：A18K, C90K, N98R, C102K, H105K N25R, N109K, D123K, E162R | FE FE (III) ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 12 CL CHLORIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293.15 K；reservoir: 0.19M Magnesium FormateFtn(pos): 4 mg/mL in 50mM Tris pH 7.5 1 M NaClFtn(Wildtype): 4mg/mL in 50mM Tris pH 7.5 0.3 M NaCl2 uL reservoir + 1uL Ftn(pos) + 1uL Ftn(neg)-m3 added to coverslide in this order.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.221 |
| 8PP4 Binary crystal structure of positively supercharged ferritin variant Ftn(pos) and reduced charge negatively supercharged ferritin variant Ftn(neg)-m3 (Mg formate condition) 提交 2023-07-06 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 G
2–183（182 aa）
链 H
2–183（182 aa）
链 I
2–183（182 aa）
链 J
2–183（182 aa）
链 K
2–183（182 aa）
链 L
2–183（182 aa）
|
突变：A18E 突变：A18E 突变：A18E 突变：A18E 突变：A18E 突变：A18E | FE FE (III) ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 16 CL CHLORIDE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293.15 K；reservoir: 0.19M Magnesium FormateFtn(pos): 4 mg/mL in 50mM Tris pH 7.5 1 M NaClFtn(Wildtype): 4mg/mL in 50mM Tris pH 7.5 0.3 M NaCl2 uL reservoir + 1uL Ftn(pos) + 1uL Ftn(neg)-m3 added to coverslide in this order.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.221 |
| 8PP5 Unitary crystal structure of positively supercharged ferritin variant Ftn(pos)-m1 (Mg Formate condition) 提交 2023-07-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
6–177（172 aa）
链 B
6–177（172 aa）
链 C
6–177（172 aa）
链 D
6–177（172 aa）
链 E
6–177（172 aa）
链 F
6–177（172 aa）
|
突变：C90K, N98R, C102K, H105K N25R, N109K, D123K, E162R 突变：C90K, N98R, C102K, H105K N25R, N109K, D123K, E162R 突变：C90K, N98R, C102K, H105K N25R, N109K, D123K, E162R 突变：C90K, N98R, C102K, H105K N25R, N109K, D123K, E162R 突变：C90K, N98R, C102K, H105K N25R, N109K, D123K, E162R 突变：C90K, N98R, C102K, H105K N25R, N109K, D123K, E162R | FE FE (III) ION × 24 MG MAGNESIUM ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293.15 K；reservoir: 0.19M Magnesium Formate
Ftn(pos)-m1: 4 mg/mL in 50mM Tris pH 7.5 0.9 M NaCl
2microliter reservoir + 1microliter Ftn(pos)-m1 +1 microliterL 50mM Tris pH 7.5 0.3 M NaCl
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.193 |
| 8QU9 Structure of the NCOA4 (Nuclear Receptor Coactivator 4)-FTH1 (H-Ferritin) complex 提交 2023-10-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric（48） 与蛋白数一致 |
链 A
6–183（178 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 48 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.88 Å |
| 8W92 human H ferritin with 2 Fe(II)/subunit loading 提交 2023-09-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 72 CA CALCIUM ION × 72 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM HEPES, pH7, 20 mM CaCl2
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.200 |
| 8WB3 Human H Chain Ferritin mutant-K86Q with 2 Fe(III)/subunit loading 提交 2023-09-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
|
突变：K86Q | FE FE (III) ION × 48 CA CALCIUM ION × 72 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM HEPES, pH7, 20 mM CaCl2
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.235 |
| 8WIE Peptide 10-1/FTH1-1 Complex 提交 2023-09-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–177（177 aa）
链 B
1–177（177 aa）
链 C
1–177（177 aa）
链 D
1–177（177 aa）
链 E
1–177（177 aa）
链 F
1–177（177 aa）
|
突变：Q15R,R23K,N26T,K87Q,N110E,S114E,E117N 突变：Q15R,R23K,N26T,K87Q,N110E,S114E,E117N 突变：Q15R,R23K,N26T,K87Q,N110E,S114E,E117N 突变：Q15R,R23K,N26T,K87Q,N110E,S114E,E117N 突变：Q15R,R23K,N26T,K87Q,N110E,S114E,E117N 突变：Q15R,R23K,N26T,K87Q,N110E,S114E,E117N | FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；1.5M Sodium chloride , 15% Ethanol and 20% PEG 3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.212 |
| 8WIQ NCOA4/FTH1 complex 提交 2023-09-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
链 G
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
链 I
1–183（183 aa）
链 J
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 L
1–183（183 aa）
链 M
1–183（183 aa）
链 N
1–183（183 aa）
链 O
1–183（183 aa）
链 P
1–183（183 aa）
链 Q
1–183（183 aa）
链 R
1–183（183 aa）
链 S
1–183（183 aa）
链 T
1–183（183 aa）
链 U
1–183（183 aa）
链 V
1–183（183 aa）
链 W
1–183（183 aa）
链 X
1–183（183 aa）
|
突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；250mM NaCl, 50mM Tris-HCL, pH 8.0
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.19 Å |
| 8WJF Peptide 10/FTH1 complex 提交 2023-09-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
链 G
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
链 I
1–183（183 aa）
链 J
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 L
1–183（183 aa）
链 M
1–183（183 aa）
链 N
1–183（183 aa）
链 O
1–183（183 aa）
链 P
1–183（183 aa）
链 Q
1–183（183 aa）
链 R
1–183（183 aa）
链 S
1–183（183 aa）
链 T
1–183（183 aa）
链 U
1–183（183 aa）
链 V
1–183（183 aa）
链 W
1–183（183 aa）
链 X
1–183（183 aa）
|
突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q 突变：K87Q | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；250mM NaCl, 50mM Tris-HCL, pH 8.0
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.02 Å |
| 8XWB Crystal structure of dinitrosyl iron units binding with human heavy chain Ferritin 提交 2024-01-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
6–177（172 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 96 MG MAGNESIUM ION × 72 CL CHLORIDE ION × 72 NO NITRIC OXIDE × 48 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；Bicine,Magnesium chloride
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.195 |
| 9EQC Iron loaded human h-chain ferritin exposed to oxygen for 20 minutes 提交 2024-03-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 144 MG MAGNESIUM ION × 144 CL CHLORIDE ION × 48 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；289 K；0.1 M bicine
2.0 M magnesium chloride
100 mM sodiem chloride
60 mM ferrous chloride
3 mM sodium azide
pH 9.0
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.237 |
| 9HQ6 Structural insights in the HuHf@gold-monocarbene adduct: aurophilicity revealed in a biological context 提交 2024-12-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
链 B
2–183（182 aa）
链 C
2–183（182 aa）
链 D
2–183（182 aa）
链 E
2–183（182 aa）
链 F
2–183（182 aa）
链 G
2–183（182 aa）
链 H
2–183（182 aa）
链 I
2–183（182 aa）
链 J
2–183（182 aa）
链 K
2–183（182 aa）
链 L
2–183（182 aa）
链 M
2–183（182 aa）
链 N
2–183（182 aa）
链 O
2–183（182 aa）
链 P
2–183（182 aa）
链 Q
2–183（182 aa）
链 R
2–183（182 aa）
链 S
2–183（182 aa）
链 T
2–183（182 aa）
链 V
2–183（182 aa）
链 W
2–183（182 aa）
链 X
2–183（182 aa）
链 Y
2–183（182 aa）
|
突变：NONE 突变：NONE 突变：NONE 突变：NONE 突变：NONE 突变：NONE 突变：NONE 突变：NONE 突变：NONE 突变：NONE 突变：NONE 突变：NONE 突变：NONE 突变：NONE 突变：NONE 突变：NONE 突变：NONE 突变：NONE 突变：NONE 突变：NONE 突变：NONE 突变：NONE 突变：NONE 突变：NONE | BM0 1-butyl-3-methyl-1H-imidazol-3-ium × 24 AU GOLD ION × 96 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.51 Å |
| 9I19 Iron loaded human H-chain ferritin D131N mutant 5 minute oxygen soak 提交 2025-01-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：monomeric（1） 待复核 |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 72 MG MAGNESIUM ION × 96 CL CHLORIDE ION × 96 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；289 K；0.1 M Bicine
2 M Magnesium chloride
0.1 M Sodium chloride
60 mM Ferrous chloride
3 mM Sodium chloride
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.192 |
| 9I1B Iron loaded human H-chain ferritin 20 minute oxygen soak 提交 2025-01-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 47 PDB 声明：24-meric（24） 待复核 |
链 A
2–183（182 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 141 CL CHLORIDE ION × 47 MG MAGNESIUM ION × 282 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；289 K；0.1 M Bicine
2 M Magnesium chloride
0.1 M Sodium chloride
60 mM Ferrous chloride
3 mM Sodium azide
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.214 |
| 9I1C Iron loaded human H-chain ferritin 5 minute oxygen soak 提交 2025-01-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：monomeric（1） 待复核 |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 96 MG MAGNESIUM ION × 240 CL CHLORIDE ION × 72 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；289 K；0.1 M Bicine
2 M Magnesium chloride
100 mM Sodium chloride
60 mM Ferrous chloride
3 mM Sodium azide
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.186 |
| 9I1E Iron loaded human H-chain ferritin D131N mutant 20 minute oxygen soak 提交 2025-01-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 72 CL CHLORIDE ION × 48 MG MAGNESIUM ION × 120 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；289 K；0.1 M Bicine
2 M Magnesium chloride
0.1 M Sodium chloride
60 mM Ferrous chloride
3 mM Sodium chloride
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.190 |
| 9IVP 24-mer DARPin-apoferritin scaffold in complex with the maltose binding protein 提交 2024-07-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric（48） 与蛋白数一致 |
链 A
20–177（158 aa）
链 BA
20–177（158 aa）
链 C
20–177（158 aa）
链 DA
20–177（158 aa）
链 E
20–177（158 aa）
链 FA
20–177（158 aa）
链 G
20–177（158 aa）
链 HA
20–177（158 aa）
链 I
20–177（158 aa）
链 JA
20–177（158 aa）
链 K
20–177（158 aa）
链 LA
20–177（158 aa）
链 M
20–177（158 aa）
链 NA
20–177（158 aa）
链 O
20–177（158 aa）
链 PA
20–177（158 aa）
链 Q
20–177（158 aa）
链 RA
20–177（158 aa）
链 S
20–177（158 aa）
链 TA
20–177（158 aa）
链 V
20–177（158 aa）
链 VA
20–177（158 aa）
链 X
20–177（158 aa）
链 Z
20–177（158 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9J48 GFP bound to 24-mer DARPin-apoferritin model 6c 提交 2024-08-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric（48） 与蛋白数一致 |
链 A
16–177（162 aa）
链 B
16–177（162 aa）
链 C
16–177（162 aa）
链 D
16–177（162 aa）
链 E
16–177（162 aa）
链 F
16–177（162 aa）
链 G
16–177（162 aa）
链 H
16–177（162 aa）
链 I
16–177（162 aa）
链 J
16–177（162 aa）
链 K
16–177（162 aa）
链 L
16–177（162 aa）
链 M
16–177（162 aa）
链 N
16–177（162 aa）
链 O
16–177（162 aa）
链 P
16–177（162 aa）
链 Q
16–177（162 aa）
链 R
16–177（162 aa）
链 S
16–177（162 aa）
链 T
16–177（162 aa）
链 V
16–177（162 aa）
链 W
16–177（162 aa）
链 X
16–177（162 aa）
链 Y
16–177（162 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.04 Å |
| 9JGO Structure of Pd ions bound to human heavy chain ferritin nanocage. 提交 2024-09-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 72 PD PALLADIUM ION × 48 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；283 K；2 M MgCl2, 0.1 M Bicine, pH 9.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.197 |
| 9JGP Structure of Pd ions bound to human heavy chain ferritin nanocage. 提交 2024-09-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 96 MG MAGNESIUM ION × 96 PD PALLADIUM ION × 48 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；283 K；2 M MgCl2, 0.1 M Bicine, pH 9.0
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.184 |
| 9JIU Ferritin mutant R63MeHis 提交 2024-09-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：12-meric（12） 待复核 |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
链 G
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
链 I
1–183（183 aa）
链 J
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 L
1–183（183 aa）
|
突变：R63H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 36 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 14 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1M Bicine pH 8.5, 20%(v/v) PEG 300
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.272 |
| 9JQB Cryo-EM structure of ferritin variant R63BrThA/E67BrThA 提交 2024-09-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
链 G
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
链 I
1–183（183 aa）
链 J
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 L
1–183（183 aa）
链 M
1–183（183 aa）
链 N
1–183（183 aa）
链 O
1–183（183 aa）
链 P
1–183（183 aa）
链 Q
1–183（183 aa）
链 R
1–183（183 aa）
链 S
1–183（183 aa）
链 T
1–183（183 aa）
链 U
1–183（183 aa）
链 V
1–183（183 aa）
链 W
1–183（183 aa）
链 X
1–183（183 aa）
|
突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 24 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.78 Å |
| 9JQC Cryo-EM structure of ferritin variant R63BrThA/E67BrThA with Cu(II) 提交 2024-09-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
链 G
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
链 I
1–183（183 aa）
链 J
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 L
1–183（183 aa）
链 M
1–183（183 aa）
链 N
1–183（183 aa）
链 O
1–183（183 aa）
链 P
1–183（183 aa）
链 Q
1–183（183 aa）
链 R
1–183（183 aa）
链 S
1–183（183 aa）
链 T
1–183（183 aa）
链 U
1–183（183 aa）
链 V
1–183（183 aa）
链 W
1–183（183 aa）
链 X
1–183（183 aa）
|
突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63BrThA/E67BrThA 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CU COPPER (II) ION × 24 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.73 Å |
| 9JQD Cryo-EM structure of ferritin variant R63MeH/R67MeH 提交 2024-09-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
链 G
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
链 I
1–183（183 aa）
链 J
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 L
1–183（183 aa）
链 M
1–183（183 aa）
链 N
1–183（183 aa）
链 O
1–183（183 aa）
链 P
1–183（183 aa）
链 Q
1–183（183 aa）
链 R
1–183（183 aa）
链 S
1–183（183 aa）
链 T
1–183（183 aa）
链 U
1–183（183 aa）
链 V
1–183（183 aa）
链 W
1–183（183 aa）
链 X
1–183（183 aa）
|
突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | FE FE (III) ION × 48 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.81 Å |
| 9JQE Cryo-EM structure of ferritin variant R63MeH/R67MeH with Cu(II) 提交 2024-09-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
链 G
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
链 I
1–183（183 aa）
链 J
1–183（183 aa）
链 K
1–183（183 aa）
链 L
1–183（183 aa）
链 M
1–183（183 aa）
链 N
1–183（183 aa）
链 O
1–183（183 aa）
链 P
1–183（183 aa）
链 Q
1–183（183 aa）
链 R
1–183（183 aa）
链 S
1–183（183 aa）
链 T
1–183（183 aa）
链 U
1–183（183 aa）
链 V
1–183（183 aa）
链 W
1–183（183 aa）
链 X
1–183（183 aa）
|
突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R63MeH/R67MeH 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CU COPPER (II) ION × 48 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.83 Å |
| 9KAY Bioengineered protein nanocarrier facilitating siRNA escape from lysosomes for targeted RNAi therapy in glioblastoma 提交 2024-10-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 Aa
2–160（159 aa）
链 Ab
2–160（159 aa）
链 Ac
2–160（159 aa）
链 Ad
2–160（159 aa）
链 Ae
2–160（159 aa）
链 Af
2–160（159 aa）
链 Ag
2–160（159 aa）
链 Ah
2–160（159 aa）
链 Ai
2–160（159 aa）
链 Aj
2–160（159 aa）
链 Ak
2–160（159 aa）
链 Al
2–160（159 aa）
链 Am
2–160（159 aa）
链 An
2–160（159 aa）
链 Ao
2–160（159 aa）
链 Ap
2–160（159 aa）
链 Aq
2–160（159 aa）
链 Ar
2–160（159 aa）
链 As
2–160（159 aa）
链 At
2–160（159 aa）
链 Au
2–160（159 aa）
链 Av
2–160（159 aa）
链 Aw
2–160（159 aa）
链 Ax
2–160（159 aa）
|
突变：E61K,E64R,E140K,E147K 突变：E61K,E64R,E140K,E147K 突变：E61K,E64R,E140K,E147K 突变：E61K,E64R,E140K,E147K 突变：E61K,E64R,E140K,E147K 突变：E61K,E64R,E140K,E147K 突变：E61K,E64R,E140K,E147K 突变：E61K,E64R,E140K,E147K 突变：E61K,E64R,E140K,E147K 突变：E61K,E64R,E140K,E147K 突变：E61K,E64R,E140K,E147K 突变：E61K,E64R,E140K,E147K 突变：E61K,E64R,E140K,E147K 突变：E61K,E64R,E140K,E147K 突变：E61K,E64R,E140K,E147K 突变：E61K,E64R,E140K,E147K 突变：E61K,E64R,E140K,E147K 突变：E61K,E64R,E140K,E147K 突变：E61K,E64R,E140K,E147K 突变：E61K,E64R,E140K,E147K 突变：E61K,E64R,E140K,E147K 突变：E61K,E64R,E140K,E147K 突变：E61K,E64R,E140K,E147K 突变：E61K,E64R,E140K,E147K | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；20 mM Tris, pH8.0, 50 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.73 Å |
| 9LNY Crystal structure of human heavy chain Ferritin binding with dinitrosyl iron complex modificated by phenylboronic acid 提交 2025-01-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
6–177（172 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 96 MG MAGNESIUM ION × 72 CL CHLORIDE ION × 72 NO NITRIC OXIDE × 48 A1EKS [3-(bromomethyl)phenyl]boronic acid × 24 H2S HYDROSULFURIC ACID × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；Bicine,Magnesium chloride
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.242 |
| 9LNY Crystal structure of human heavy chain Ferritin binding with dinitrosyl iron complex modificated by phenylboronic acid 提交 2025-01-22 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
6–177（172 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 96 MG MAGNESIUM ION × 72 CL CHLORIDE ION × 72 NO NITRIC OXIDE × 48 A1EKS [3-(bromomethyl)phenyl]boronic acid × 24 H2S HYDROSULFURIC ACID × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；Bicine,Magnesium chloride
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.242 |
| 9LUW Enhancing Monodispersity and Thermal Stability of Human H-Ferritin for Improved Applications in Nanocarrier Systems 提交 2025-02-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
链 B
1–183（183 aa）
链 C
1–183（183 aa）
链 D
1–183（183 aa）
链 E
1–183（183 aa）
链 F
1–183（183 aa）
链 G
1–183（183 aa）
链 H
1–183（183 aa）
|
突变：C90A, C102A, H105A, E116A, T122H, C130A, L165H 突变：C90A, C102A, H105A, E116A, T122H, C130A, L165H 突变：C90A, C102A, H105A, E116A, T122H, C130A, L165H 突变：C90A, C102A, H105A, E116A, T122H, C130A, L165H 突变：C90A, C102A, H105A, E116A, T122H, C130A, L165H 突变：C90A, C102A, H105A, E116A, T122H, C130A, L165H 突变：C90A, C102A, H105A, E116A, T122H, C130A, L165H 突变：C90A, C102A, H105A, E116A, T122H, C130A, L165H | FE FE (III) ION × 42 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；sodium phosphate monobasic , potassium phosphate dibasic, imidazole, NaCl
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.209 |
| 9RGH X-ray structure of a polyoxidovanadate/human H-ferritin adduct obtained when the protein is treated overnight with [VIVO(acac)2] 提交 2025-06-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 AAA
2–183（182 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 144 MG MAGNESIUM ION × 144 A1JGJ Polyoxidovanadate complex × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；2.0 M magnesium chloride, 0.1 M bicine buffer pH 9.0
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.177 |
| 9RGI X-ray structure of a polyoxidovanadate/human H-ferritin adduct obtained when the protein is treated 6 days with [VIVO(acac)2] 提交 2025-06-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 AAA
2–183（182 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 144 MG MAGNESIUM ION × 144 A1JGJ Polyoxidovanadate complex × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M bicine buffer pH 9.0, 2.0 M magnesium chloride
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.198 |
| 9RGJ X-ray structure of a polyoxidovanadate/human H-ferritin adduct obtained when the protein is treated 24 h with [VIVO(acac)2] 提交 2025-06-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 AAA
2–183（182 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 168 MG MAGNESIUM ION × 144 A1JGJ Polyoxidovanadate complex × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；2.0 M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.1 M bicine buffer pH 9.0
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.196 |
| 9SJR Cryo-EM structure of Human Apoferritin at pH 3.5 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
5–177（173 aa）
链 B
5–177（173 aa）
链 C
5–177（173 aa）
链 D
5–177（173 aa）
链 E
5–177（173 aa）
链 F
5–177（173 aa）
链 G
5–177（173 aa）
链 H
5–177（173 aa）
链 I
5–177（173 aa）
链 J
5–177（173 aa）
链 K
5–177（173 aa）
链 L
5–177（173 aa）
链 M
5–177（173 aa）
链 N
5–177（173 aa）
链 O
5–177（173 aa）
链 P
5–177（173 aa）
链 Q
5–177（173 aa）
链 R
5–177（173 aa）
链 S
5–177（173 aa）
链 T
5–177（173 aa）
链 V
5–177（173 aa）
链 W
5–177（173 aa）
链 X
5–177（173 aa）
链 Y
5–177（173 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 24 MG MAGNESIUM ION × 24 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 3.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.99 Å |
| 9SJS Cryo-EM structure of Human Apoferritin at pH 4 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
5–177（173 aa）
链 B
5–177（173 aa）
链 C
5–177（173 aa）
链 D
5–177（173 aa）
链 E
5–177（173 aa）
链 F
5–177（173 aa）
链 G
5–177（173 aa）
链 H
5–177（173 aa）
链 I
5–177（173 aa）
链 J
5–177（173 aa）
链 K
5–177（173 aa）
链 L
5–177（173 aa）
链 M
5–177（173 aa）
链 N
5–177（173 aa）
链 O
5–177（173 aa）
链 P
5–177（173 aa）
链 Q
5–177（173 aa）
链 R
5–177（173 aa）
链 S
5–177（173 aa）
链 T
5–177（173 aa）
链 V
5–177（173 aa）
链 W
5–177（173 aa）
链 X
5–177（173 aa）
链 Y
5–177（173 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 24 MG MAGNESIUM ION × 24 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.06 Å |
| 9SJT Cryo-EM structure of Human Apoferritin at pH 5 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
5–177（173 aa）
链 B
5–177（173 aa）
链 C
5–177（173 aa）
链 D
5–177（173 aa）
链 E
5–177（173 aa）
链 F
5–177（173 aa）
链 G
5–177（173 aa）
链 H
5–177（173 aa）
链 I
5–177（173 aa）
链 J
5–177（173 aa）
链 K
5–177（173 aa）
链 L
5–177（173 aa）
链 M
5–177（173 aa）
链 N
5–177（173 aa）
链 O
5–177（173 aa）
链 P
5–177（173 aa）
链 Q
5–177（173 aa）
链 R
5–177（173 aa）
链 S
5–177（173 aa）
链 T
5–177（173 aa）
链 V
5–177（173 aa）
链 W
5–177（173 aa）
链 X
5–177（173 aa）
链 Y
5–177（173 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 24 MG MAGNESIUM ION × 24 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.96 Å |
| 9SJU Cryo-EM structure of Human Apoferritin at pH 7 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
5–177（173 aa）
链 B
5–177（173 aa）
链 C
5–177（173 aa）
链 D
5–177（173 aa）
链 E
5–177（173 aa）
链 F
5–177（173 aa）
链 G
5–177（173 aa）
链 H
5–177（173 aa）
链 I
5–177（173 aa）
链 J
5–177（173 aa）
链 K
5–177（173 aa）
链 L
5–177（173 aa）
链 M
5–177（173 aa）
链 N
5–177（173 aa）
链 O
5–177（173 aa）
链 P
5–177（173 aa）
链 Q
5–177（173 aa）
链 R
5–177（173 aa）
链 S
5–177（173 aa）
链 T
5–177（173 aa）
链 V
5–177（173 aa）
链 W
5–177（173 aa）
链 X
5–177（173 aa）
链 Y
5–177（173 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 24 MG MAGNESIUM ION × 24 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.08 Å |
| 9SJV Cryo-EM structure of Human Apoferritin at pH 9 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
5–177（173 aa）
链 B
5–177（173 aa）
链 C
5–177（173 aa）
链 D
5–177（173 aa）
链 E
5–177（173 aa）
链 F
5–177（173 aa）
链 G
5–177（173 aa）
链 H
5–177（173 aa）
链 I
5–177（173 aa）
链 J
5–177（173 aa）
链 K
5–177（173 aa）
链 L
5–177（173 aa）
链 M
5–177（173 aa）
链 N
5–177（173 aa）
链 O
5–177（173 aa）
链 P
5–177（173 aa）
链 Q
5–177（173 aa）
链 R
5–177（173 aa）
链 S
5–177（173 aa）
链 T
5–177（173 aa）
链 V
5–177（173 aa）
链 W
5–177（173 aa）
链 X
5–177（173 aa）
链 Y
5–177（173 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 24 MG MAGNESIUM ION × 24 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.89 Å |
| 9VO7 Crystal structure of HuHF-C1, a HuHF varitant 提交 2025-07-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
突变：E28A/Y35A/E63A/H66A/K87Q/E108A/Y138A/Q142A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.60 Å R-free 0.257 |
| 9VOC Crystal strucrue of HuHF-C2, a variant of HuHF 提交 2025-07-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
突变：E28A/Y35A/Y55A/H58A/Q59A/E62A/E63A/H66A/K69A/K87Q/E108A/H137A/Y138A/E141A/Q142A/K144A/E148A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å R-free 0.224 |
| 9VOD Crystal strucrue of HuHF-C2-Cur complex 1 提交 2025-07-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
突变：E28A/Y35A/Y55A/H58A/Q59A/E62A/E63A/H66A/K69A/K87Q/E108A/H137A/Y138A/E141A/Q142A/K144A/E148A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.92 Å R-free 0.192 |
| 9VOE Crystal strucrue of HuHF-C2-Cur complex 2 提交 2025-07-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
突变：E28A/Y35A/Y55A/H58A/Q59A/E62A/E63A/H66A/K69A/K87Q/E108A/H137A/Y138A/E141A/Q142A/K144A/E148A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å R-free 0.220 |
| 9VOF Crystal strucrue of HuHF-C2-ALY complex 提交 2025-07-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
突变：E28A/Y35A/Y55A/H58A/Q59A/E62A/E63A/H66A/K69A/K87Q/E108A/H137A/Y138A/E141A/Q142A/K144A/E148A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.90 Å R-free 0.194 |
| 9VOM Crystal strucrue of HuHF-C2-AZB complex 提交 2025-07-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–183（182 aa）
|
突变：E28A/Y35A/Y55A/H58A/Q59A/E62A/E63A/H66A/K69A/K87Q/E108A/H137A/Y138A/E141A/Q142A/K144A/E148A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å R-free 0.199 |
| 9VON Crystal strucrue of HuHF-71-Cur complex 提交 2025-07-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
2–177（176 aa）
链 B
2–177（176 aa）
链 C
2–177（176 aa）
链 D
2–177（176 aa）
链 E
2–177（176 aa）
链 F
2–177（176 aa）
链 G
2–177（176 aa）
链 H
2–177（176 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å R-free 0.237 |
| 9W28 Structure of Au3+ bound to human heavy chain ferritin nanocage. 提交 2025-07-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.52 Å R-free 0.215 |
| 9W29 Structure of Au bound to human heavy chain ferritin nanocage. 提交 2025-07-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.99 Å R-free 0.246 |