当前蛋白身份：P03070
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1EJL MOUSE IMPORTIN ALPHA-SV40 LARGE T ANTIGEN NLS PEPTIDE COMPLEX 提交 2000-03-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
126–132（7 aa）
片段：NLS (NUCLEAR LOCALIZATION SIGNAL) MONOPARTITE PEPTIDE, RESIDUES 126-132
链 B
126–132（7 aa）
片段：NLS (NUCLEAR LOCALIZATION SIGNAL) MONOPARTITE PEPTIDE, RESIDUES 126-132
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；sodium citrate, Hepes, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.254 |
| 1GH6 RETINOBLASTOMA POCKET COMPLEXED WITH SV40 LARGE T ANTIGEN 提交 2000-11-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
7–117（111 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.2；pH 7.2
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.314 |
| 1N25 Crystal structure of the SV40 Large T antigen helicase domain 提交 2002-10-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
260–627（368 aa）
片段：helicase domain
链 B
260–627（368 aa）
片段：helicase domain
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；291 K；glycerol, DTT, Hepes, NaCl, EtOH, EDTA, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.276 |
| 1Q1S Mouse Importin alpha- phosphorylated SV40 CN peptide complex 提交 2003-07-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
110–133（24 aa）
片段：CN peptide - Ser112 chemically phosphorylated
链 B
110–133（24 aa）
片段：CN peptide - Ser112 chemically phosphorylated
链 C
70–529（460 aa）
片段：NLS binding domain (70-529)
|
突变：S120A, S123A, T124A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S120A, S123A, T124A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Sodium Citrate, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.221 |
| 1Q1T Mouse Importin alpha: non-phosphorylated SV40 CN peptide complex 提交 2003-07-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
110–133（24 aa）
片段：CN peptide
链 B
110–133（24 aa）
片段：CN peptide
链 C
70–529（460 aa）
片段：NLS binding domain (70-529)
|
突变：S120A, S123A, T124A 突变：S120A, S123A, T124A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.25；293 K；Sodium Citrate, DTT, pH 6.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.233 |
| 1SVL Co-crystal structure of SV40 large T antigen helicase domain and ADP 提交 2004-03-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
251–627（377 aa）
片段：HELICASE DOMAIN
链 B
251–627（377 aa）
片段：HELICASE DOMAIN
链 C
251–627（377 aa）
片段：HELICASE DOMAIN
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.25；277 K；Tris, magnesium chloride, PEG 8000, DTT, pH 7.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.264 |
| 1SVM Co-crystal structure of SV40 large T antigen helicase domain and ATP 提交 2004-03-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
251–627（377 aa）
片段：HELICASE DOMAIN
链 B
251–627（377 aa）
片段：HELICASE DOMAIN
链 C
251–627（377 aa）
片段：HELICASE DOMAIN
链 D
251–627（377 aa）
片段：HELICASE DOMAIN
链 E
251–627（377 aa）
片段：HELICASE DOMAIN
链 F
251–627（377 aa）
片段：HELICASE DOMAIN
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.25；277 K；Tris, magnesium chloride, PEG 8000, DTT, pH 7.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.241 |
| 1SVO Structure of SV40 large T antigen helicase domain 提交 2004-03-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
251–627（377 aa）
片段：HELICASE DOMAIN
链 B
251–627（377 aa）
片段：HELICASE DOMAIN
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；HEPES, NACL, ETHANOL, EDTA, DTT, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.271 |
| 1TBD SOLUTION STRUCTURE OF THE ORIGIN DNA BINDING DOMAIN OF SV40 T-ANTIGEN, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1996-11-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
131–260（130 aa）
片段：DNA BINDING DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.5；303 K
|
分辨率未提供 |
| 1Z1D Structural Model for the interaction between RPA32 C-terminal domain and SV40 T antigen origin binding domain. 提交 2005-03-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
131–259（129 aa）
片段：SV40 T antigen Origin binding domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.03 M；压力 ambient
NMR样品组成
0.2mM RPA32C U-15N, 0.6mM Tag-OBD, 20mM Tris buffer pH 7.0, 2 mM DTT, 5mM MgCl2, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.2mM Tag-OBD U-15N, 0.6mM RPA32C, 20mM Tris buffer pH 7.0, 2mM DTT, 5mM MgCl2, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2FUF Crystal structure of the SV40 large T antigen origin-binding domain 提交 2006-01-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
131–260（130 aa）
片段：DNA binding domain (residues 131-259)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | FLC CITRATE ANION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；298 K；1.6 M Sodium citrate, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.189 |
| 2IF9 Crystal Structure of SV40 T-antigen origin binding domain disulfide-linked dimer 提交 2006-09-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
131–260（130 aa）
片段：origin binding domain
链 B
131–260（130 aa）
片段：origin binding domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；30 % peg 4000, 0.1M sodium citrate (pH 5.6), 0.2 M ammonium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.296 |
| 2IPR Origin binding domain of the SV40 large T antigen (residues 131-259). P21 crystal form 提交 2006-10-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
131–259（129 aa）
片段：Origin binding domain (residues 131-259)
链 B
131–259（129 aa）
片段：Origin binding domain (residues 131-259)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；300 K；20 mM NaSCN, 10% P4K, 0.1 Tris, pH 8.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.204 |
| 2ITJ Origin binding domain of the SV40 large T antigen (residues 131-259). P212121 crystal form 提交 2006-10-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
131–259（129 aa）
片段：Origin binding domain (residues 131-259)
链 B
131–259（129 aa）
片段：Origin binding domain (residues 131-259)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；297 K；20 mM NaAc, 20% PEG4K, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.289 |
| 2ITL The origin binding domain of the SV40 large T antigen bound to the functional pen palindrome DNA (23 bp) 提交 2006-10-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 A
131–259（129 aa）
片段：Origin binding domain (residues 131-259)
链 B
131–259（129 aa）
片段：Origin binding domain (residues 131-259)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；297 K；20 mM di-ammonium hydrogen citrate, 20% PEG 3000, and 10 mM MgCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.251 |
| 2NL8 The origin binding domain of the SV40 large T antigen bound non specifically to a 17 bp palindrome DNA (sites 1 and 3) 提交 2006-10-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
131–259（129 aa）
片段：Origin binding domain (residues 131-259)
|
突变：CYS216SER | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；297 K；20 mM NaAcetate, 20% PEG 3000 + 4% PEG 600, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.299 |
| 2NTC Crystal Structure of sv40 large T antigen origin binding domain with DNA 提交 2006-11-07 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
131–260（130 aa）
片段：Origin binding domain (residues 131-259)
链 B
131–260（130 aa）
片段：Origin binding domain (residues 131-259)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；273 K；0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 0.1 M calcium acetate, 30 % v/v peg 8000, 20 % glycerol, VAPOR DIFFUSION, temperature 273K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.287 |
| 2TBD SV40 T ANTIGEN DNA-BINDING DOMAIN, NMR, 30 STRUCTURES 提交 1997-01-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
131–260（130 aa）
片段：DNA BINDING DOMAIN, RESIDUES 131 - 260
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.5；303 K
|
分辨率未提供 |
| 3QK2 Structure-Based Analysis of the Interaction between the Simian Virus 40 T-Antigen Origin Binding Domain and Single-Stranded DNA 提交 2011-01-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
131–260（130 aa）
片段：origin binding domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SCN THIOCYANATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；278 K；0.2 M thiocyanate [SCN], 17.5% PEG 3350, 5% glycerol, VAPOR DIFFUSION, temperature 278K
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.187 |
| 3QN2 Structure-based design of a disulfide-linked oligomeric form of the Simian Virus 40 (SV40) large T antigen DNA binding domain 提交 2011-02-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
131–260（130 aa）
片段：origin binding domain
|
突变：F151C, C216A, D256C | FLC CITRATE ANION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；1.6 M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.191 |
| 4FGN Crystal structure of the SV40 large T-antigen origin bining domain bound to Site I DNA 提交 2012-06-04 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
131–260（130 aa）
片段：origin binding domain, UNP residues 131-260
链 B
131–260（130 aa）
片段：origin binding domain, UNP residues 131-260
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；291 K；0.1M sodium acetate pH 4.6, .2M ammonium sulfate, 30 % Peg 4000, 10 mM CaCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.267 |
| 4RXH Crystal Structure of Importin-alpha from Neurospora crassa complexed with SV40NLS 提交 2014-12-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
125–132（8 aa）
链 C
125–132（8 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；297 K；20 Mm Bicine pH 8.5, 20%(w/v) PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.211 |
| 5D9I SV40 Large T antigen origin binding domain bound to artificial DNA fork 提交 2015-08-18 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
131–260（130 aa）
片段：unp residues 131-260
链 B
131–260（130 aa）
片段：unp residues 131-260
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CA CALCIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100 mM Tris, 300 mM NH4Cl, 28% polyethylene glycol [PEG] 4000, 20 mM CaCl2
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.223 |
| 9EVH SV40 large T antigen assembly with DNA in presence of ADP 提交 2024-03-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–708（708 aa）
链 B
1–708（708 aa）
链 C
1–708（708 aa）
链 D
1–708（708 aa）
链 E
1–708（708 aa）
链 F
1–708（708 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；200 mM NaCl, 50 mM Tris-HCl (pH 8.0), 1 mM ADP.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.38 Å |
| 9EVP SV40 LTAg assembly with DNA in presence of AMPPNP and Mg2+. 提交 2024-04-01 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 A
266–627（362 aa）
链 B
266–627（362 aa）
链 C
266–627（362 aa）
链 D
266–627（362 aa）
链 E
266–627（362 aa）
链 F
266–627（362 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM TrisHCl (pH 7.5), 1 mM DTT, 100 mM NaCl, 5 mM MgCl, 3 mM AMP-PMP.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.12 Å |
| 9EXD SV40 LTAg assembly in presence of ATP. 提交 2024-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–708（708 aa）
链 B
1–708（708 aa）
链 C
1–708（708 aa）
链 D
1–708（708 aa）
链 E
1–708（708 aa）
链 F
1–708（708 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；200 mM NaCl, 50 mM Tris-HCl (pH 8.0), 1 mM ATP.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9F3T Active SV40 LTAg complex with DNA (3D variability component_000, frame_010). 提交 2024-04-25 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 A
266–627（362 aa）
链 B
266–627（362 aa）
链 C
266–627（362 aa）
链 D
266–627（362 aa）
链 E
266–627（362 aa）
链 F
266–627（362 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM HEPES (pH 7.5), 1 mM ATP, 3 mM MgCl2, 1 mM DTT and 50 mM NaCl.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9F3U Active SV40 LTAg complex with DNA (3D variability component_001, frame_010). 提交 2024-04-26 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 A
266–627（362 aa）
链 B
266–627（362 aa）
链 C
266–627（362 aa）
链 D
266–627（362 aa）
链 E
266–627（362 aa）
链 F
266–627（362 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM HEPES (pH 7.5), 1 mM ATP, 3 mM MgCl2, 1 mM DTT and 50 mM NaCl.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9F5I Active SV40 LTAg complex with DNA (3D variability component_000, frame_005). 提交 2024-04-28 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 A
266–627（362 aa）
链 B
266–627（362 aa）
链 C
266–627（362 aa）
链 D
266–627（362 aa）
链 E
266–627（362 aa）
链 F
266–627（362 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM HEPES (pH 7.5), 1 mM ATP, 3 mM MgCl2, 1 mM DTT and 50 mM NaCl.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9F73 Active SV40 LTAg complex with DNA (3D variability component_002, frame_015). 提交 2024-05-03 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 A
266–627（362 aa）
链 B
266–627（362 aa）
链 C
266–627（362 aa）
链 D
266–627（362 aa）
链 E
266–627（362 aa）
链 F
266–627（362 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM HEPES (pH 7.5), 1 mM ATP, 3 mM MgCl2, 1 mM DTT and 50 mM NaCl.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9F74 Active SV40 LTAg complex with DNA (3D variability component_000, frame_015). 提交 2024-05-03 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 A
266–627（362 aa）
链 B
266–627（362 aa）
链 C
266–627（362 aa）
链 D
266–627（362 aa）
链 E
266–627（362 aa）
链 F
266–627（362 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM HEPES (pH 7.5), 1 mM ATP, 3 mM MgCl2, 1 mM DTT and 50 mM NaCl.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9F75 Active SV40 LTAg complex with DNA (3D variability component_000, frame_019). 提交 2024-05-03 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 A
266–627（362 aa）
链 B
266–627（362 aa）
链 C
266–627（362 aa）
链 D
266–627（362 aa）
链 E
266–627（362 aa）
链 F
266–627（362 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM HEPES (pH 7.5), 1 mM ATP, 3 mM MgCl2, 1 mM DTT and 50 mM NaCl.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9F7N Active SV40 LTAg complex with DNA (3D variability component_000, frame_000). 提交 2024-05-04 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 A
266–627（362 aa）
链 B
266–627（362 aa）
链 C
266–627（362 aa）
链 D
266–627（362 aa）
链 E
266–627（362 aa）
链 F
266–627（362 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM HEPES (pH 7.5), 1 mM ATP, 3 mM MgCl2, 1 mM DTT and 50 mM NaCl.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9F9N Active SV40 LTAg complex with DNA (3D variability component_001, frame_005). 提交 2024-05-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 A
266–627（362 aa）
链 B
266–627（362 aa）
链 C
266–627（362 aa）
链 D
266–627（362 aa）
链 E
266–627（362 aa）
链 F
266–627（362 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM HEPES (pH 7.5), 1 mM ATP, 3 mM MgCl2, 1 mM DTT and 50 mM NaCl.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9F9O Active SV40 LTAg complex with DNA (3D variability component_001, frame_015). 提交 2024-05-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 A
266–627（362 aa）
链 B
266–627（362 aa）
链 C
266–627（362 aa）
链 D
266–627（362 aa）
链 E
266–627（362 aa）
链 F
266–627（362 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM HEPES (pH 7.5), 1 mM ATP, 3 mM MgCl2, 1 mM DTT and 50 mM NaCl.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9F9W Active SV40 LTAg complex with DNA (3D variability component_001, frame_019). 提交 2024-05-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 A
266–627（362 aa）
链 B
266–627（362 aa）
链 C
266–627（362 aa）
链 D
266–627（362 aa）
链 E
266–627（362 aa）
链 F
266–627（362 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM HEPES (pH 7.5), 1 mM ATP, 3 mM MgCl2, 1 mM DTT and 50 mM NaCl.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9F9X Active SV40 LTAg complex with DNA (3D variability component_001, frame_000). 提交 2024-05-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 A
266–627（362 aa）
链 B
266–627（362 aa）
链 C
266–627（362 aa）
链 D
266–627（362 aa）
链 E
266–627（362 aa）
链 F
266–627（362 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM HEPES (pH 7.5), 1 mM ATP, 3 mM MgCl2, 1 mM DTT and 50 mM NaCl.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9FA1 Active SV40 LTAg complex with DNA (3D variability component_002, frame_010). 提交 2024-05-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 A
266–627（362 aa）
链 B
266–627（362 aa）
链 C
266–627（362 aa）
链 D
266–627（362 aa）
链 E
266–627（362 aa）
链 F
266–627（362 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM HEPES (pH 7.5), 1 mM ATP, 3 mM MgCl2, 1 mM DTT and 50 mM NaCl.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9FA2 Active SV40 LTAg complex with DNA (3D variability component_002, frame_005). 提交 2024-05-10 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 A
266–627（362 aa）
链 B
266–627（362 aa）
链 C
266–627（362 aa）
链 D
266–627（362 aa）
链 E
266–627（362 aa）
链 F
266–627（362 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM HEPES (pH 7.5), 1 mM ATP, 3 mM MgCl2, 1 mM DTT and 50 mM NaCl.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9FB0 Active SV40 LTAg complex with DNA (3D variability component_002, frame_019). 提交 2024-05-10 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 A
266–627（362 aa）
链 B
266–627（362 aa）
链 C
266–627（362 aa）
链 D
266–627（362 aa）
链 E
266–627（362 aa）
链 F
266–627（362 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM HEPES (pH 7.5), 1 mM ATP, 3 mM MgCl2, 1 mM DTT and 50 mM NaCl.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9FB4 SV40 large T antigen assembly with DNA in presence of ATP. 提交 2024-05-11 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 A
266–627（362 aa）
链 B
266–627（362 aa）
链 C
266–627（362 aa）
链 D
266–627（362 aa）
链 E
266–627（362 aa）
链 F
266–627（362 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；200 mM NaCl, 50 mM Tris-HCl (pH 8.0), 1 mM ATP.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.13 Å |
| 9FB5 Active SV40 LTAg complex with DNA (3D variability component_002, frame_000). 提交 2024-05-12 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 A
266–627（362 aa）
链 B
266–627（362 aa）
链 C
266–627（362 aa）
链 D
266–627（362 aa）
链 E
266–627（362 aa）
链 F
266–627（362 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM HEPES (pH 7.5), 1 mM ATP, 3 mM MgCl2, 1 mM DTT and 50 mM NaCl.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9FB6 SV40 large T antigen assembly with DNA in presence of ATP. 提交 2024-05-12 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 A
266–627（362 aa）
链 B
266–627（362 aa）
链 C
266–627（362 aa）
链 D
266–627（362 aa）
链 E
266–627（362 aa）
链 F
266–627（362 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；200 mM NaCl, 50 mM Tris-HCl (pH 8.0), 1 mM ATP.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.13 Å |
| 9KAE CryoEM structure of LTag bound to SV40 EP half origin DNA 提交 2024-10-28 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 A
266–627（362 aa）
链 B
266–627（362 aa）
链 C
266–627（362 aa）
链 D
266–627（362 aa）
链 E
266–627（362 aa）
链 F
266–627（362 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9KAK CryoEM structure of LTag bound to SV40 AT half origin DNA 提交 2024-10-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 A
266–627（362 aa）
链 B
266–627（362 aa）
链 C
266–627（362 aa）
链 D
266–627（362 aa）
链 E
266–627（362 aa）
链 F
266–627（362 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |