当前蛋白身份：P09883
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BXI CRYSTAL STRUCTURE OF THE ESCHERICHIA COLI COLICIN E9 DNASE DOMAIN WITH ITS COGNATE IMMUNITY PROTEIN IM9 提交 1998-10-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
449–582（134 aa）
片段：DNASE DOMAIN, RESIDUES 450-581
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NI NICKEL (II) ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.3；24%(W/V)PEG 4K, 0.1MM SODIUM-ACETATE, PH5.3
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.315 |
| 1EMV CRYSTAL STRUCTURE OF COLICIN E9 DNASE DOMAIN WITH ITS COGNATE IMMUNITY PROTEIN IM9 (1.7 ANGSTROMS) 提交 2000-03-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
450–582（133 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, DNASE DOMAIN
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.3；277 K；24% PEG 4000, 0.1M sodium acetate, pH 5.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.260 |
| 1FR2 CRYSTAL STRUCTURE OF THE E9 DNASE DOMAIN WITH A MUTANT IMMUNITY PROTEIN IM9(E41A) 提交 2000-09-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
450–582（133 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, DNASE DOMAIN
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.3；277 K；24% PEG 4000, 0.1M sodium acetate, , pH 5.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.232 |
| 1FSJ CRYSTAL STRUCTURE OF THE E9 DNASE DOMAIN 提交 2000-09-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
450–582（133 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN OF E9 COLICIN
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；285 K；30% (w/v) PEG 5000, 0.1M sodium-acetate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.222 |
| 1FSJ CRYSTAL STRUCTURE OF THE E9 DNASE DOMAIN 提交 2000-09-11 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
450–582（133 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN OF E9 COLICIN
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；285 K；30% (w/v) PEG 5000, 0.1M sodium-acetate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.222 |
| 1FSJ CRYSTAL STRUCTURE OF THE E9 DNASE DOMAIN 提交 2000-09-11 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
450–582（133 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN OF E9 COLICIN
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；285 K；30% (w/v) PEG 5000, 0.1M sodium-acetate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.222 |
| 1FSJ CRYSTAL STRUCTURE OF THE E9 DNASE DOMAIN 提交 2000-09-11 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
450–582（133 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN OF E9 COLICIN
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；285 K；30% (w/v) PEG 5000, 0.1M sodium-acetate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.222 |
| 1V13 CRYSTAL STRUCTURE OF THE MUTANT HIS103ALA OF THE COLICIN E9 DNASE DOMAIN IN COMPLEX WITH ZN+2 (2.0 ANGSTROMS) 提交 2004-04-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
450–582（133 aa）
链 B
450–582（133 aa）
|
突变：YES 突变：YES | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.8；pH 5.80
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.307 |
| 1V14 Crystal Structure of the Colicin E9, mutant His103Ala, in complex with Mg+2 and dsDNA (resolution 2.9A) 提交 2004-04-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
450–582（133 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 450-582
|
突变：YES | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.50
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.306 |
| 1V14 Crystal Structure of the Colicin E9, mutant His103Ala, in complex with Mg+2 and dsDNA (resolution 2.9A) 提交 2004-04-06 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 B
450–582（133 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 450-582
|
突变：YES | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.50
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.306 |
| 1V14 Crystal Structure of the Colicin E9, mutant His103Ala, in complex with Mg+2 and dsDNA (resolution 2.9A) 提交 2004-04-06 | Assembly 3 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 C
450–582（133 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 450-582
|
突变：YES | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.50
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.306 |
| 1V14 Crystal Structure of the Colicin E9, mutant His103Ala, in complex with Mg+2 and dsDNA (resolution 2.9A) 提交 2004-04-06 | Assembly 4 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 D
450–582（133 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 450-582
|
突变：YES | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.50
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.306 |
| 1V15 CRYSTAL STRUCTURE OF THE COLICIN E9, MUTANT HIS103ALA, IN COMPLEX WITH ZN+2 AND DSDNA (RESOLUTION 2.4A) 提交 2004-04-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
450–582（133 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 450-582
|
突变：YES | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.50
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.329 |
| 1V15 CRYSTAL STRUCTURE OF THE COLICIN E9, MUTANT HIS103ALA, IN COMPLEX WITH ZN+2 AND DSDNA (RESOLUTION 2.4A) 提交 2004-04-06 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 B
450–582（133 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 450-582
|
突变：YES | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.50
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.329 |
| 1V15 CRYSTAL STRUCTURE OF THE COLICIN E9, MUTANT HIS103ALA, IN COMPLEX WITH ZN+2 AND DSDNA (RESOLUTION 2.4A) 提交 2004-04-06 | Assembly 3 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 C
450–582（133 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 450-582
|
突变：YES | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.50
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.329 |
| 1V15 CRYSTAL STRUCTURE OF THE COLICIN E9, MUTANT HIS103ALA, IN COMPLEX WITH ZN+2 AND DSDNA (RESOLUTION 2.4A) 提交 2004-04-06 | Assembly 4 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 D
450–582（133 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 450-582
|
突变：YES | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.50
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.329 |
| 2GYK Crystal structure of the complex of the Colicin E9 DNase domain with a mutant immunity protein, IMME9 (D51A) 提交 2006-05-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
450–582（133 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, DNASE DOMAIN
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.3；277 K；24% (W/V) PEG 4K, 100mM SODIUM ACETATE BUFFER pH 5.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.232 |
| 2GYK Crystal structure of the complex of the Colicin E9 DNase domain with a mutant immunity protein, IMME9 (D51A) 提交 2006-05-09 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
450–582（133 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, DNASE DOMAIN
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.3；277 K；24% (W/V) PEG 4K, 100mM SODIUM ACETATE BUFFER pH 5.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.232 |
| 2GZE Crystal structure of the E9 DNase domain with a mutant immunity protein IM9 (Y55A) 提交 2006-05-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
450–582（133 aa）
片段：Colicin E9,C-terminal Domain,DNase Domain
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.3；277 K；24% (W/V) PEG 4K, 100mM SODIUM ACETATE BUFFER pH 5.3, VAPOUR DIFFUSSION,SITTING DROP, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.242 |
| 2GZF Crystal structure of the E9 DNase domain with a mutant immunity protein IM9 (Y54F) 提交 2006-05-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
450–582（133 aa）
片段：Colicin E9,C-terminal Domain,DNase Domain
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOUR DIFFUSSION,SITTING DROP；pH 5.3；277 K；24% (W/V) PEG 4K, 100mM SODIUM ACETATE BUFFER pH 5.3, VAPOUR DIFFUSSION,SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.222 |
| 2GZG Crystal Structure of the E9 DNase Domain with a Mutant Immunity Protein IM9 (Y55F) 提交 2006-05-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
450–582（133 aa）
片段：COLICIN E9,C-TERMINAL DOMAIN,DNASE DOMAIN
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.3；277 K；24% (W/V) PEG 4K, 100mM SODIUM ACETATE BUFFER pH 5.3, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.204 |
| 2GZI Crystal Structure of the E9 DNase Domain with a Mutant Immunity Protein IM9 (V34A) 提交 2006-05-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
450–582（133 aa）
片段：COLICIN E9,C-TERMINAL DOMAIN,DNASE DOMAIN
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.3；277 K；24% (W/V) PEG 4K, 100mM SODIUM ACETATE BUFFER pH 5.3, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.256 |
| 2GZJ Crystal Structure of the E9 DNase Domain with a Mutant Immunity Protein IM9 (D51A) 提交 2006-05-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
450–582（133 aa）
片段：COLICIN E9,C-TERMINAL DOMAIN,DNASE DOMAIN
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.3；277 K；24% (W/V) PEG 4K, 100mM SODIUM ACETATE BUFFER pH 5.3, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.232 |
| 2GZJ Crystal Structure of the E9 DNase Domain with a Mutant Immunity Protein IM9 (D51A) 提交 2006-05-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
450–582（133 aa）
片段：COLICIN E9,C-TERMINAL DOMAIN,DNASE DOMAIN
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.3；277 K；24% (W/V) PEG 4K, 100mM SODIUM ACETATE BUFFER pH 5.3, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.232 |
| 2IVZ Structure of TolB in complex with a peptide of the colicin E9 T- domain 提交 2006-06-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
32–47（16 aa）
片段：T-DOMAIN, RESIDUES 32-47
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；24% POLYETHYLENE GLYCOL MONOMETHYL ETHER 5000, 80 MM CACL2, 100 MM HEPES, PH 7.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.222 |
| 2IVZ Structure of TolB in complex with a peptide of the colicin E9 T- domain 提交 2006-06-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
32–47（16 aa）
片段：T-DOMAIN, RESIDUES 32-47
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；24% POLYETHYLENE GLYCOL MONOMETHYL ETHER 5000, 80 MM CACL2, 100 MM HEPES, PH 7.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.222 |
| 2IVZ Structure of TolB in complex with a peptide of the colicin E9 T- domain 提交 2006-06-23 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
32–47（16 aa）
片段：T-DOMAIN, RESIDUES 32-47
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；24% POLYETHYLENE GLYCOL MONOMETHYL ETHER 5000, 80 MM CACL2, 100 MM HEPES, PH 7.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.222 |
| 2IVZ Structure of TolB in complex with a peptide of the colicin E9 T- domain 提交 2006-06-23 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
32–47（16 aa）
片段：T-DOMAIN, RESIDUES 32-47
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；24% POLYETHYLENE GLYCOL MONOMETHYL ETHER 5000, 80 MM CACL2, 100 MM HEPES, PH 7.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.222 |
| 2K5X Chemical shift structure of COLICIN E9 DNASE domain with its cognate immunity protein IM9 提交 2008-07-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
450–582（133 aa）
片段：UNP residues 450-582
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.2；298 K
|
分辨率未提供 |
| 2VLN N75A mutant of E9 DNase domain in complex with Im9 提交 2008-01-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
450–582（133 aa）
片段：DNASE DOMAIN, RESIDUES 450-582
|
突变：YES | MLA MALONIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.60 Å R-free 0.203 |
| 2VLO K97A mutant of E9 DNase domain in complex with Im9 提交 2008-01-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
450–582（133 aa）
片段：DNASE DOMAIN, RESIDUES 450-582
|
突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å R-free 0.228 |
| 2VLP R54A mutant of E9 DNase domain in complex with Im9 提交 2008-01-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
450–582（133 aa）
片段：DNASE DOMAIN, RESIDUES 450-582
|
突变：YES | MLA MALONIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
2.9 M AMMONIUM SULPHATE AND 100 MM BIS-TRIS PH 5.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.229 |
| 2VLQ F86A mutant of E9 DNase domain in complex with Im9 提交 2008-01-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
450–582（133 aa）
片段：DNASE DOMAIN, RESIDUES 450-582
|
突变：YES | MLA MALONIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
2.9 M AMMONIUM SULPHATE AND 100 MM BIS-TRIS PH 5.5
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.199 |
| 2WPT The crystal structure of Im2 in complex with colicin E9 DNase 提交 2009-08-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
450–582（133 aa）
|
突变：YES | GOL GLYCEROL × 2 NO3 NITRATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.8；pH 6.8
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.223 |
| 3O0E Crystal structure of OmpF in complex with colicin peptide OBS1 提交 2010-07-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 L
2–18（17 aa）
片段：UNP Residues 2-18
链 N
2–18（17 aa）
片段：UNP Residues 2-18
链 P
2–18（17 aa）
片段：UNP Residues 2-18
|
未记录 | BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；25% PEG 3350, 0.2M Li2SO4, 0.1M sodium cacodylate, pH 6.5, sitting drop vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 3.01 Å R-free 0.302 |
| 3O0E Crystal structure of OmpF in complex with colicin peptide OBS1 提交 2010-07-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 M
2–18（17 aa）
片段：UNP Residues 2-18
链 O
2–18（17 aa）
片段：UNP Residues 2-18
链 Q
2–18（17 aa）
片段：UNP Residues 2-18
|
未记录 | BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；25% PEG 3350, 0.2M Li2SO4, 0.1M sodium cacodylate, pH 6.5, sitting drop vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 3.01 Å R-free 0.302 |
| 4JML Crystal structure of the TolB(P201C)-ColicinE9 TBE peptide(A33C) complex. 提交 2013-03-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
32–47（16 aa）
片段：T-domain, Residues 32-47
|
突变：A33C | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；80mM calcium chloride,
24% PEG 5000MME, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.00 Å R-free 0.226 |
| 5EW5 Crystal Structure of Colicin E9 In Complex with Its Immunity Protein Im9 提交 2015-11-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–582（582 aa）
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突变：Y324C, L447C, D448A, K449M | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；1.3M sodium malonate, PEG3350
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分辨率 3.20 Å R-free 0.271 |
| 5EW5 Crystal Structure of Colicin E9 In Complex with Its Immunity Protein Im9 提交 2015-11-20 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–582（582 aa）
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突变：Y324C, L447C, D448A, K449M | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；1.3M sodium malonate, PEG3350
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分辨率 3.20 Å R-free 0.271 |
| 5EW5 Crystal Structure of Colicin E9 In Complex with Its Immunity Protein Im9 提交 2015-11-20 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–582（582 aa）
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突变：Y324C, L447C, D448A, K449M | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；1.3M sodium malonate, PEG3350
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分辨率 3.20 Å R-free 0.271 |
| 5EW5 Crystal Structure of Colicin E9 In Complex with Its Immunity Protein Im9 提交 2015-11-20 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–582（582 aa）
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突变：Y324C, L447C, D448A, K449M | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；1.3M sodium malonate, PEG3350
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分辨率 3.20 Å R-free 0.271 |
| 7NST ColicinE9 partial translocation complex 提交 2021-03-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 D
1–314（314 aa）
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突变：A33C | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3 uL of diluted translocon preparation were applied on freshly glow discharged grids coated with graphene oxide (as described in https://doi.org/10.1038/s41594-019-0355-2); after 30sec waiting grids were blotted for 8-10 using -10 force and plunge frozen in liquid ethane
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分辨率 3.70 Å |
| 7NSU ColicinE9 intact translocation complex 提交 2021-03-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 D
1–582（582 aa）
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突变：A33C | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3 uL of diluted translocon preparation were applied on freshly glow discharged grids coated with graphene oxide (as described in https://doi.org/10.1038/s41594-019-0355-2); after 30sec waiting grids were blotted for 8-10 using -10 force and plunge frozen in liquid ethane
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分辨率 4.70 Å |