SAXSdb — Protein Structure Search

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Main Difference Dimensions in This Set

Different construct Different mutation/modification Different assembly state Different experimental method Different experimental conditions Different structure-quality metrics

Difference tags compare only the current result set; every original PDB and assembly record remains separate.

Related-Structure Differences

Each row represents one biological assembly in one PDB entry; multiple monomers of the same protein are listed separately.

PDB Entry	Assembly / Oligomeric State	Construct	Mutations and Modifications	Ligands, Ions and Non-polymers	Experimental Method	Experimental Conditions	Structure Quality
5WRH FlgG structure based on the CryoEM map of the bacterial flagellar polyrod Deposited 2016-12-02	Assembly 1 Protein homooligomer Homooligomer；Protein × 22 PDB declaration: 22-meric（22） Consistent with protein count	Chain A 1–260（260 aa）	Not recorded	No recorded non-water small molecule	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM buffer pH 8 cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE	Resolution 7.40 Å
5WRH FlgG structure based on the CryoEM map of the bacterial flagellar polyrod Deposited 2016-12-02	Assembly 2 Protein monomer Monomer；Protein × 1 PDB declaration: monomeric（1） Consistent with protein count	Chain A 1–260（260 aa）	Not recorded	No recorded non-water small molecule	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM buffer pH 8 cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE	Resolution 7.40 Å
5WRH FlgG structure based on the CryoEM map of the bacterial flagellar polyrod Deposited 2016-12-02	Assembly 3 Protein monomer Monomer；Protein × 1 PDB declaration: monomeric（1） Consistent with protein count	Chain A 1–260（260 aa）	Not recorded	No recorded non-water small molecule	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM buffer pH 8 cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE	Resolution 7.40 Å
6JF2 Crystal structure of a 20kDa fragment of FlgG Deposited 2019-02-08	Assembly 1 Protein monomer Monomer；Protein × 1 PDB declaration: monomeric（1） Consistent with protein count	Chain A 47–227（181 aa）	Non-standard monomer：Yes (specific site not provided by mmCIF)	No recorded non-water small molecule	X-RAY DIFFRACTION	X-ray crystallization conditions VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；277 K；28-32% PEG monomethyl ether 2000, 0.1M acetate buffer (pH4.6), 0.2M ammonium sulfate	Resolution 2.00 Å R-free 0.229
6JF2 Crystal structure of a 20kDa fragment of FlgG Deposited 2019-02-08	Assembly 2 Protein monomer Monomer；Protein × 1 PDB declaration: monomeric（1） Consistent with protein count	Chain B 47–227（181 aa）	Non-standard monomer：Yes (specific site not provided by mmCIF)	No recorded non-water small molecule	X-RAY DIFFRACTION	X-ray crystallization conditions VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；277 K；28-32% PEG monomethyl ether 2000, 0.1M acetate buffer (pH4.6), 0.2M ammonium sulfate	Resolution 2.00 Å R-free 0.229
7BIN Salmonella export gate and rod refined in focussed C1 map Deposited 2021-01-12	Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 56 PDB declaration: 56-meric（56） Consistent with protein count	Chain 1 1–260（260 aa） Chain 2 1–260（260 aa） Chain 3 1–260（260 aa） Chain 4 1–260（260 aa） Chain g 1–260（260 aa） Chain h 1–260（260 aa） Chain i 1–260（260 aa） Chain j 1–260（260 aa） Chain k 1–260（260 aa） Chain l 1–260（260 aa） Chain m 1–260（260 aa） Chain n 1–260（260 aa） Chain o 1–260（260 aa） Chain p 1–260（260 aa） Chain q 1–260（260 aa） Chain r 1–260（260 aa） Chain s 1–260（260 aa） Chain t 1–260（260 aa） Chain u 1–260（260 aa） Chain v 1–260（260 aa） Chain w 1–260（260 aa） Chain x 1–260（260 aa） Chain y 1–260（260 aa） Chain z 1–260（260 aa）	Not recorded	No recorded non-water small molecule	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM buffer pH 8 cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE	Resolution 3.20 Å
7CBM Cryo-EM structure of the flagellar distal rod with partial hook from Salmonella Deposited 2020-06-12	Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 40 PDB declaration: 40-meric（40） Consistent with protein count	Chain A 1–260（260 aa） Chain B 1–260（260 aa） Chain C 1–260（260 aa） Chain D 1–260（260 aa） Chain E 1–260（260 aa） Chain F 1–260（260 aa） Chain G 1–260（260 aa） Chain H 1–260（260 aa） Chain I 1–260（260 aa） Chain J 1–260（260 aa） Chain K 1–260（260 aa） Chain L 1–260（260 aa） Chain M 1–260（260 aa） Chain N 1–260（260 aa） Chain O 1–260（260 aa） Chain P 1–260（260 aa） Chain Q 1–260（260 aa） Chain R 1–260（260 aa） Chain S 1–260（260 aa） Chain T 1–260（260 aa） Chain U 1–260（260 aa） Chain V 1–260（260 aa） Chain W 1–260（260 aa） Chain X 1–260（260 aa）	Not recorded	No recorded non-water small molecule	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM buffer pH 8 cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE；blot for 6 seconds before plunging	Resolution 3.20 Å
7CGO Cryo-EM structure of the flagellar motor-hook complex from Salmonella Deposited 2020-07-01	Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 219 PDB declaration: 219-meric（219） Consistent with protein count	Chain A 1–260（260 aa） Chain B 1–260（260 aa） Chain C 1–260（260 aa） Chain D 1–260（260 aa） Chain E 1–260（260 aa） Chain F 1–260（260 aa） Chain G 1–260（260 aa） Chain H 1–260（260 aa） Chain I 1–260（260 aa） Chain J 1–260（260 aa） Chain K 1–260（260 aa） Chain L 1–260（260 aa） Chain M 1–260（260 aa） Chain N 1–260（260 aa） Chain O 1–260（260 aa） Chain P 1–260（260 aa） Chain Q 1–260（260 aa） Chain R 1–260（260 aa） Chain S 1–260（260 aa） Chain T 1–260（260 aa） Chain U 1–260（260 aa） Chain V 1–260（260 aa） Chain W 1–260（260 aa） Chain X 1–260（260 aa）	Not recorded	No recorded non-water small molecule	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM buffer pH 8 cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE；blot for 6 seconds before plunging	Resolution 3.90 Å
7E80 Cryo-EM structure of the flagellar rod with hook and export apparatus from Salmonella Deposited 2021-02-28	Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 77 PDB declaration: 77-meric（77） Consistent with protein count	Chain A 1–260（260 aa） Chain B 1–260（260 aa） Chain C 1–260（260 aa） Chain D 1–260（260 aa） Chain E 1–260（260 aa） Chain F 1–260（260 aa） Chain G 1–260（260 aa） Chain H 1–260（260 aa） Chain I 1–260（260 aa） Chain J 1–260（260 aa） Chain K 1–260（260 aa） Chain L 1–260（260 aa） Chain M 1–260（260 aa） Chain N 1–260（260 aa） Chain O 1–260（260 aa） Chain P 1–260（260 aa） Chain Q 1–260（260 aa） Chain R 1–260（260 aa） Chain S 1–260（260 aa） Chain T 1–260（260 aa） Chain U 1–260（260 aa） Chain V 1–260（260 aa） Chain W 1–260（260 aa） Chain X 1–260（260 aa）	Not recorded	No recorded non-water small molecule	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM buffer pH 8 cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE；blot for 6 seconds before plunging	Resolution 3.67 Å
7E82 Cryo-EM structure of the flagellar rod with partial hook from Salmonella Deposited 2021-02-28	Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 67 PDB declaration: 67-meric（67） Consistent with protein count	Chain A 1–260（260 aa） Chain B 1–260（260 aa） Chain C 1–260（260 aa） Chain D 1–260（260 aa） Chain E 1–260（260 aa） Chain F 1–260（260 aa） Chain G 1–260（260 aa） Chain H 1–260（260 aa） Chain I 1–260（260 aa） Chain J 1–260（260 aa） Chain K 1–260（260 aa） Chain L 1–260（260 aa） Chain M 1–260（260 aa） Chain N 1–260（260 aa） Chain O 1–260（260 aa） Chain P 1–260（260 aa） Chain Q 1–260（260 aa） Chain R 1–260（260 aa） Chain S 1–260（260 aa） Chain T 1–260（260 aa） Chain U 1–260（260 aa） Chain V 1–260（260 aa） Chain W 1–260（260 aa） Chain X 1–260（260 aa）	Not recorded	No recorded non-water small molecule	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM buffer pH 8 cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE；blot for 6 seconds before plunging	Resolution 3.30 Å
8WKI Cryo-EM structure of the distal rod-hook within the flagellar motor-hook complex in the CW state. Deposited 2023-09-27	Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 53 PDB declaration: 53-meric（53） Consistent with protein count	Chain 0 1–260（260 aa） Chain 1 1–260（260 aa） Chain 2 1–260（260 aa） Chain 3 1–260（260 aa） Chain 4 1–260（260 aa） Chain 5 1–260（260 aa） Chain 6 1–260（260 aa） Chain 7 1–260（260 aa） Chain 8 1–260（260 aa） Chain 9 1–260（260 aa） Chain ZA 1–260（260 aa） Chain ZB 1–260（260 aa） Chain ZC 1–260（260 aa） Chain ZD 1–260（260 aa） Chain ZE 1–260（260 aa） Chain r 1–260（260 aa） Chain s 1–260（260 aa） Chain t 1–260（260 aa） Chain u 1–260（260 aa） Chain v 1–260（260 aa） Chain w 1–260（260 aa） Chain x 1–260（260 aa） Chain y 1–260（260 aa） Chain z 1–260（260 aa）	Not recorded	No recorded non-water small molecule	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM buffer pH 8 cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE；Blot time: 4 Blot force: 10 Wait time: 30 Blot total: 1 Drain time: 2	Resolution 3.30 Å
8WKK Cryo-EM structure of the whole rod with export apparatus and hook within the flagellar motor-hook complex in the CW state. Deposited 2023-09-28	Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 96 PDB declaration: 96-meric（96） Consistent with protein count	Chain 0 1–260（260 aa） Chain 1 1–260（260 aa） Chain 2 1–260（260 aa） Chain 3 1–260（260 aa） Chain 4 1–260（260 aa） Chain 5 1–260（260 aa） Chain 6 1–260（260 aa） Chain 7 1–260（260 aa） Chain 8 1–260（260 aa） Chain 9 1–260（260 aa） Chain ZA 1–260（260 aa） Chain ZB 1–260（260 aa） Chain ZC 1–260（260 aa） Chain ZD 1–260（260 aa） Chain ZE 1–260（260 aa） Chain r 1–260（260 aa） Chain s 1–260（260 aa） Chain t 1–260（260 aa） Chain u 1–260（260 aa） Chain v 1–260（260 aa） Chain w 1–260（260 aa） Chain x 1–260（260 aa） Chain y 1–260（260 aa） Chain z 1–260（260 aa）	Not recorded	No recorded non-water small molecule	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM buffer pH 8 cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE；Blot time: 4 Blot force: 10 Wait time: 30 Blot total: 1 Drain time: 2	Resolution 3.30 Å
8WL2 Cryo-EM structure of the membrane-anchored part of the flagellar motor-hook complex in the CW state. Deposited 2023-09-29	Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 213 PDB declaration: 213-meric（213） Consistent with protein count	Chain 0 1–260（260 aa） Chain 1 1–260（260 aa） Chain 2 1–260（260 aa） Chain 3 1–260（260 aa） Chain 4 1–260（260 aa） Chain 5 1–260（260 aa） Chain 6 1–260（260 aa） Chain 7 1–260（260 aa） Chain 8 1–260（260 aa） Chain 9 1–260（260 aa） Chain AF 1–260（260 aa） Chain AG 1–260（260 aa） Chain AH 1–260（260 aa） Chain AI 1–260（260 aa） Chain AJ 1–260（260 aa） Chain AK 1–260（260 aa） Chain AL 1–260（260 aa） Chain AM 1–260（260 aa） Chain AN 1–260（260 aa） Chain ZA 1–260（260 aa） Chain ZB 1–260（260 aa） Chain ZC 1–260（260 aa） Chain ZD 1–260（260 aa） Chain ZE 1–260（260 aa）	Not recorded	No recorded non-water small molecule	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM buffer pH 8 cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE；Blot time: 4 Blot force: 10 Wait time: 30 Blot total: 1 Drain time: 2	Resolution 3.40 Å
8WLP Cryo-EM structure of the distal rod-hook within the flagellar motor-hook complex in the CCW state. Deposited 2023-09-30	Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 53 PDB declaration: 53-meric（53） Consistent with protein count	Chain 0 1–260（260 aa） Chain 1 1–260（260 aa） Chain 2 1–260（260 aa） Chain 3 1–260（260 aa） Chain 4 1–260（260 aa） Chain 5 1–260（260 aa） Chain 6 1–260（260 aa） Chain 7 1–260（260 aa） Chain 8 1–260（260 aa） Chain 9 1–260（260 aa） Chain ZA 1–260（260 aa） Chain ZB 1–260（260 aa） Chain ZC 1–260（260 aa） Chain ZD 1–260（260 aa） Chain ZE 1–260（260 aa） Chain r 1–260（260 aa） Chain s 1–260（260 aa） Chain t 1–260（260 aa） Chain u 1–260（260 aa） Chain v 1–260（260 aa） Chain w 1–260（260 aa） Chain x 1–260（260 aa） Chain y 1–260（260 aa） Chain z 1–260（260 aa）	Not recorded	No recorded non-water small molecule	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM buffer pH 8 cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE；Blot time: 2 Blot force: -15 Wait time: 60 Blot total: 1	Resolution 3.80 Å
8WLQ Cryo-EM structure of the whole rod-export apparatus with hook within the flagellar motor-hook complex in the CCW state. Deposited 2023-09-30	Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 96 PDB declaration: 96-meric（96） Consistent with protein count	Chain 0 1–260（260 aa） Chain 1 1–260（260 aa） Chain 2 1–260（260 aa） Chain 3 1–260（260 aa） Chain 4 1–260（260 aa） Chain 5 1–260（260 aa） Chain 6 1–260（260 aa） Chain 7 1–260（260 aa） Chain 8 1–260（260 aa） Chain 9 1–260（260 aa） Chain ZA 1–260（260 aa） Chain ZB 1–260（260 aa） Chain ZC 1–260（260 aa） Chain ZD 1–260（260 aa） Chain ZE 1–260（260 aa） Chain r 1–260（260 aa） Chain s 1–260（260 aa） Chain t 1–260（260 aa） Chain u 1–260（260 aa） Chain v 1–260（260 aa） Chain w 1–260（260 aa） Chain x 1–260（260 aa） Chain y 1–260（260 aa） Chain z 1–260（260 aa）	Not recorded	No recorded non-water small molecule	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM buffer pH 8 cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE；Blot time: 2 Blot force: -15 Wait time: 60 Blot total: 1	Resolution 3.80 Å
8WLT Cryo-EM structure of the membrane-anchored part of the flagellar motor-hook complex in the CCW state Deposited 2023-10-01	Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 213 PDB declaration: 213-meric（213） Consistent with protein count	Chain 0 1–260（260 aa） Chain 1 1–260（260 aa） Chain 2 1–260（260 aa） Chain 3 1–260（260 aa） Chain 4 1–260（260 aa） Chain 5 1–260（260 aa） Chain 6 1–260（260 aa） Chain 7 1–260（260 aa） Chain 8 1–260（260 aa） Chain 9 1–260（260 aa） Chain AF 1–260（260 aa） Chain AG 1–260（260 aa） Chain AH 1–260（260 aa） Chain AI 1–260（260 aa） Chain AJ 1–260（260 aa） Chain AK 1–260（260 aa） Chain AL 1–260（260 aa） Chain AM 1–260（260 aa） Chain AN 1–260（260 aa） Chain ZA 1–260（260 aa） Chain ZB 1–260（260 aa） Chain ZC 1–260（260 aa） Chain ZD 1–260（260 aa） Chain ZE 1–260（260 aa）	Not recorded	No recorded non-water small molecule	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM buffer pH 8 cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE；Blot time: 2 Blot force: -15 Wait time: 60 Blot total: 1	Resolution 4.10 Å
8WO5 Cryo-EM structure of the intact flagellar motor-hook complex in the CCW state Deposited 2023-10-06	Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 417 PDB declaration: 417-meric（417） Consistent with protein count	Chain 0 1–260（260 aa） Chain 1 1–260（260 aa） Chain 2 1–260（260 aa） Chain 3 1–260（260 aa） Chain 4 1–260（260 aa） Chain 5 1–260（260 aa） Chain 6 1–260（260 aa） Chain 7 1–260（260 aa） Chain 8 1–260（260 aa） Chain 9 1–260（260 aa） Chain AF 1–260（260 aa） Chain AG 1–260（260 aa） Chain AH 1–260（260 aa） Chain AI 1–260（260 aa） Chain AJ 1–260（260 aa） Chain AK 1–260（260 aa） Chain AL 1–260（260 aa） Chain AM 1–260（260 aa） Chain AN 1–260（260 aa） Chain ZA 1–260（260 aa） Chain ZB 1–260（260 aa） Chain ZC 1–260（260 aa） Chain ZD 1–260（260 aa） Chain ZE 1–260（260 aa）	Not recorded	No recorded non-water small molecule	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM buffer pH 8 cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE；Blot time: 2 Blot force: -5 Wait time: 5 Blot total: 1 Drain time: 2	Resolution 7.40 Å
8WOE Cryo-EM structure of the intact flagellar motor-hook complex in the CW state Deposited 2023-10-07	Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 451 PDB declaration: 451-meric（451） Consistent with protein count	Chain 0 1–260（260 aa） Chain 1 1–260（260 aa） Chain 2 1–260（260 aa） Chain 3 1–260（260 aa） Chain 4 1–260（260 aa） Chain 5 1–260（260 aa） Chain 6 1–260（260 aa） Chain 7 1–260（260 aa） Chain 8 1–260（260 aa） Chain 9 1–260（260 aa） Chain AF 1–260（260 aa） Chain AG 1–260（260 aa） Chain AH 1–260（260 aa） Chain AI 1–260（260 aa） Chain AJ 1–260（260 aa） Chain AK 1–260（260 aa） Chain AL 1–260（260 aa） Chain AM 1–260（260 aa） Chain AN 1–260（260 aa） Chain ZA 1–260（260 aa） Chain ZB 1–260（260 aa） Chain ZC 1–260（260 aa） Chain ZD 1–260（260 aa） Chain ZE 1–260（260 aa）	Not recorded	No recorded non-water small molecule	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM buffer pH 8 cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE；Blot time: 4 Blot force: 10 Wait time: 30 Blot total: 1 Drain time: 2	Resolution 4.30 Å

Protein Structures and Oligomeric States

Related-Structure Differences