当前蛋白身份:P30260 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4RG6 Crystal structure of APC3-APC16 complex 提交 2014-09-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–180(180 aa) 片段:UNP residues 1-180, 447-824
链 A 447–824(378 aa) 片段:UNP residues 1-180, 447-824
链 B 1–180(180 aa) 片段:UNP residues 1-180, 447-824
链 B 447–824(378 aa) 片段:UNP residues 1-180, 447-824
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;0.1M MES, pH 6.0, 0.2M magnesium chloride, 8% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.242
4RG7 Crystal structure of APC3 提交 2014-09-29 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–180(180 aa) 片段:UNP residues 1-180, 447-824
链 A 447–824(378 aa) 片段:UNP residues 1-180, 447-824
链 B 1–180(180 aa) 片段:UNP residues 1-180, 447-824
链 B 447–824(378 aa) 片段:UNP residues 1-180, 447-824
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;0.1M MES, pH 6.0, 0.2M magnesium chloride, 8% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 4.25 Å R-free 0.282
4RG9 Crystal structure of APC3-APC16 complex (Selenomethionine Derivative) 提交 2014-09-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–180(180 aa) 片段:UNP RESIDUES 1-180, 447-824
链 A 447–824(378 aa) 片段:UNP RESIDUES 1-180, 447-824
链 B 1–180(180 aa) 片段:UNP RESIDUES 1-180, 447-824
链 B 447–824(378 aa) 片段:UNP RESIDUES 1-180, 447-824
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.2;293 K;0.1M MES, pH 6.2, 0.24M magnesium chloride, 6% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.25 Å R-free 0.248
4UI9 Atomic structure of the human Anaphase-Promoting Complex 提交 2015-03-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:23-meric(23) 与蛋白数一致
链 F 1–824(824 aa)
链 H 1–824(824 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5A31 Structure of the human APC-Cdh1-Hsl1-UbcH10 complex. 提交 2015-05-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致
链 F 1–824(824 aa)
链 H 1–824(824 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
5G04 Structure of the human APC-Cdc20-Hsl1 complex 提交 2016-03-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric(21) 与蛋白数一致
链 F 1–824(824 aa)
链 H 1–824(824 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20MM HEPES, 150MM NACL, 0. 5MM TCEP;pH 8;20MM HEPES, 150MM NACL, 0. 5MM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;LIQUID ETHANE
分辨率 3.90 Å
5G05 Cryo-EM structure of combined apo phosphorylated APC 提交 2016-03-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白数一致
链 F 1–824(824 aa)
链 H 1–824(824 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20MM HEPES, 150MM NACL, 0. 5MM TCEP;pH 8;20MM HEPES, 150MM NACL, 0. 5MM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;LIQUID ETHANE
分辨率 3.40 Å
5KHR Model of human Anaphase-promoting complex/Cyclosome complex (APC15 deletion mutant) in complex with the E2 UBE2C/UBCH10 poised for ubiquitin ligation to substrate (APC/C-CDC20-substrate-UBE2C) 提交 2016-06-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric(21) 与蛋白数一致
链 F 1–824(824 aa)
链 H 1–824(824 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
5KHU Model of human Anaphase-promoting complex/Cyclosome (APC15 deletion mutant), in complex with the Mitotic checkpoint complex (APC/C-CDC20-MCC) based on cryo EM data at 4.8 Angstrom resolution 提交 2016-06-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:23-meric(23) 与蛋白数一致
链 F 1–824(824 aa)
链 H 1–824(824 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
5L9T Model of human Anaphase-promoting complex/Cyclosome (APC/C-CDH1) with E2 UBE2S poised for polyubiquitination where UBE2S, APC2, and APC11 are modeled into low resolution density 提交 2016-06-11 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白数一致
链 F 1–824(824 aa)
链 H 1–824(824 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å
5L9U Model of human Anaphase-promoting complex/Cyclosome (APC/C-CDH1) with a cross linked Ubiquitin variant-substrate-UBE2C (UBCH10) complex representing key features of multiubiquitination 提交 2016-06-11 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白数一致
链 F 1–824(824 aa)
链 H 1–824(824 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å
5LCW Cryo-EM structure of the Anaphase-promoting complex/Cyclosome, in complex with the Mitotic checkpoint complex (APC/C-MCC) at 4.2 angstrom resolution 提交 2016-06-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:23-meric(23) 与蛋白数一致
链 F 1–824(824 aa)
链 H 1–824(824 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6Q6G Cryo-EM structure of the APC/C-Cdc20-Cdk2-cyclinA2-Cks2 complex, the D1 box class 提交 2018-12-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric(21) 与蛋白数一致
链 J 1–824(824 aa)
链 P 1–824(824 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;20mM Hepes, 150mM NaCl, 0.5mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6Q6H Cryo-EM structure of the APC/C-Cdc20-Cdk2-cyclinA2-Cks2 complex, the D2 box class 提交 2018-12-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric(21) 与蛋白数一致
链 J 1–824(824 aa)
链 P 1–824(824 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;20mM Hepes, 150mM NaCl, 0.5mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6TLJ Cryo-EM structure of the Anaphase-promoting complex/Cyclosome, in complex with the Mitotic checkpoint complex (APC/C-MCC) at 3.8 angstrom resolution 提交 2019-12-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:23-meric(23) 与蛋白数一致
链 F 1–824(824 aa)
链 H 1–824(824 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6TM5 Cryo-EM structure of the Anaphase-promoting complex/Cyclosome, in complex with the Nek2A substrate at 3.9 angstrom resolution 提交 2019-12-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白数一致
链 F 1–824(824 aa)
链 H 1–824(824 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6TNT SUMOylated apoAPC/C with repositioned APC2 WHB domain 提交 2019-12-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白数一致
链 F 1–824(824 aa)
链 H 1–824(824 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.78 Å
8PKP Cryo-EM structure of the apo Anaphase-promoting complex/cyclosome (APC/C) at 3.2 Angstrom resolution 提交 2023-06-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 19 PDB 声明:19-meric(19) 与蛋白数一致
链 J 1–824(824 aa)
链 P 1–824(824 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8TAR APC/C-CDH1-UBE2C-Ubiquitin-CyclinB-NTD 提交 2023-06-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白数一致
链 J 1–824(824 aa)
链 P 1–824(824 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8TAU APC/C-CDH1-UBE2C-UBE2S-Ubiquitin-CyclinB 提交 2023-06-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:23-meric(23) 与蛋白数一致
链 J 1–824(824 aa)
链 P 1–824(824 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9FGQ Structure of human APC3loop 375-381 bound to the NCP 提交 2024-05-24 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致
链 K 177–446(270 aa)
链 L 177–446(270 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;20 mM HEPEs pH8.0, 50 mM NaCl, 0.5 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
9GAW High-resolution structure of the Anaphase-promoting complex/cyclosome (APC/C) bound to co-activator Cdh1 提交 2024-07-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric(21) 与蛋白数一致
链 J 1–824(824 aa)
链 P 1–824(824 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9N9R Model of APC/C-CDC20-UBE2C from H2A/H2B-bound complex 提交 2025-02-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric(21) 与蛋白数一致
链 J 1–824(824 aa)
链 P 1–824(824 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
9N9S Model of APC/C-CDC20-UBE2C from H3/H4-bound complex 提交 2025-02-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric(21) 与蛋白数一致
链 J 1–824(824 aa)
链 P 1–824(824 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å