当前蛋白身份:P30260
重新检索
差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4RG6 Crystal structure of APC3-APC16 complex 提交 2014-09-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–180(180 aa)
片段:UNP residues 1-180, 447-824
链 A
447–824(378 aa)
片段:UNP residues 1-180, 447-824
链 B
1–180(180 aa)
片段:UNP residues 1-180, 447-824
链 B
447–824(378 aa)
片段:UNP residues 1-180, 447-824
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;0.1M MES, pH 6.0, 0.2M magnesium chloride, 8% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.242 |
| 4RG7 Crystal structure of APC3 提交 2014-09-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–180(180 aa)
片段:UNP residues 1-180, 447-824
链 A
447–824(378 aa)
片段:UNP residues 1-180, 447-824
链 B
1–180(180 aa)
片段:UNP residues 1-180, 447-824
链 B
447–824(378 aa)
片段:UNP residues 1-180, 447-824
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;0.1M MES, pH 6.0, 0.2M magnesium chloride, 8% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 4.25 Å R-free 0.282 |
| 4RG9 Crystal structure of APC3-APC16 complex (Selenomethionine Derivative) 提交 2014-09-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–180(180 aa)
片段:UNP RESIDUES 1-180, 447-824
链 A
447–824(378 aa)
片段:UNP RESIDUES 1-180, 447-824
链 B
1–180(180 aa)
片段:UNP RESIDUES 1-180, 447-824
链 B
447–824(378 aa)
片段:UNP RESIDUES 1-180, 447-824
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.2;293 K;0.1M MES, pH 6.2, 0.24M magnesium chloride, 6% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.248 |
| 4UI9 Atomic structure of the human Anaphase-Promoting Complex 提交 2015-03-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:23-meric(23) 与蛋白数一致 |
链 F
1–824(824 aa)
链 H
1–824(824 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 5A31 Structure of the human APC-Cdh1-Hsl1-UbcH10 complex. 提交 2015-05-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致 |
链 F
1–824(824 aa)
链 H
1–824(824 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 5G04 Structure of the human APC-Cdc20-Hsl1 complex 提交 2016-03-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric(21) 与蛋白数一致 |
链 F
1–824(824 aa)
链 H
1–824(824 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20MM HEPES, 150MM NACL, 0. 5MM TCEP;pH 8;20MM HEPES, 150MM NACL, 0. 5MM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;LIQUID ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 5G05 Cryo-EM structure of combined apo phosphorylated APC 提交 2016-03-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白数一致 |
链 F
1–824(824 aa)
链 H
1–824(824 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20MM HEPES, 150MM NACL, 0. 5MM TCEP;pH 8;20MM HEPES, 150MM NACL, 0. 5MM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;LIQUID ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 5KHR Model of human Anaphase-promoting complex/Cyclosome complex (APC15 deletion mutant) in complex with the E2 UBE2C/UBCH10 poised for ubiquitin ligation to substrate (APC/C-CDC20-substrate-UBE2C) 提交 2016-06-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric(21) 与蛋白数一致 |
链 F
1–824(824 aa)
链 H
1–824(824 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.10 Å |
| 5KHU Model of human Anaphase-promoting complex/Cyclosome (APC15 deletion mutant), in complex with the Mitotic checkpoint complex (APC/C-CDC20-MCC) based on cryo EM data at 4.8 Angstrom resolution 提交 2016-06-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:23-meric(23) 与蛋白数一致 |
链 F
1–824(824 aa)
链 H
1–824(824 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 5L9T Model of human Anaphase-promoting complex/Cyclosome (APC/C-CDH1) with E2 UBE2S poised for polyubiquitination where UBE2S, APC2, and APC11 are modeled into low resolution density 提交 2016-06-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白数一致 |
链 F
1–824(824 aa)
链 H
1–824(824 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.40 Å |
| 5L9U Model of human Anaphase-promoting complex/Cyclosome (APC/C-CDH1) with a cross linked Ubiquitin variant-substrate-UBE2C (UBCH10) complex representing key features of multiubiquitination 提交 2016-06-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白数一致 |
链 F
1–824(824 aa)
链 H
1–824(824 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.40 Å |
| 5LCW Cryo-EM structure of the Anaphase-promoting complex/Cyclosome, in complex with the Mitotic checkpoint complex (APC/C-MCC) at 4.2 angstrom resolution 提交 2016-06-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:23-meric(23) 与蛋白数一致 |
链 F
1–824(824 aa)
链 H
1–824(824 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 6Q6G Cryo-EM structure of the APC/C-Cdc20-Cdk2-cyclinA2-Cks2 complex, the D1 box class 提交 2018-12-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric(21) 与蛋白数一致 |
链 J
1–824(824 aa)
链 P
1–824(824 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8;20mM Hepes, 150mM NaCl, 0.5mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 6Q6H Cryo-EM structure of the APC/C-Cdc20-Cdk2-cyclinA2-Cks2 complex, the D2 box class 提交 2018-12-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric(21) 与蛋白数一致 |
链 J
1–824(824 aa)
链 P
1–824(824 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8;20mM Hepes, 150mM NaCl, 0.5mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 6TLJ Cryo-EM structure of the Anaphase-promoting complex/Cyclosome, in complex with the Mitotic checkpoint complex (APC/C-MCC) at 3.8 angstrom resolution 提交 2019-12-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:23-meric(23) 与蛋白数一致 |
链 F
1–824(824 aa)
链 H
1–824(824 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6TM5 Cryo-EM structure of the Anaphase-promoting complex/Cyclosome, in complex with the Nek2A substrate at 3.9 angstrom resolution 提交 2019-12-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白数一致 |
链 F
1–824(824 aa)
链 H
1–824(824 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 6TNT SUMOylated apoAPC/C with repositioned APC2 WHB domain 提交 2019-12-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白数一致 |
链 F
1–824(824 aa)
链 H
1–824(824 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.78 Å |
| 8PKP Cryo-EM structure of the apo Anaphase-promoting complex/cyclosome (APC/C) at 3.2 Angstrom resolution 提交 2023-06-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 19 PDB 声明:19-meric(19) 与蛋白数一致 |
链 J
1–824(824 aa)
链 P
1–824(824 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8TAR APC/C-CDH1-UBE2C-Ubiquitin-CyclinB-NTD 提交 2023-06-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白数一致 |
链 J
1–824(824 aa)
链 P
1–824(824 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 8TAU APC/C-CDH1-UBE2C-UBE2S-Ubiquitin-CyclinB 提交 2023-06-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:23-meric(23) 与蛋白数一致 |
链 J
1–824(824 aa)
链 P
1–824(824 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9FGQ Structure of human APC3loop 375-381 bound to the NCP 提交 2024-05-24 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致 |
链 K
177–446(270 aa)
链 L
177–446(270 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8;20 mM HEPEs pH8.0, 50 mM NaCl, 0.5 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 9GAW High-resolution structure of the Anaphase-promoting complex/cyclosome (APC/C) bound to co-activator Cdh1 提交 2024-07-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric(21) 与蛋白数一致 |
链 J
1–824(824 aa)
链 P
1–824(824 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9N9R Model of APC/C-CDC20-UBE2C from H2A/H2B-bound complex 提交 2025-02-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric(21) 与蛋白数一致 |
链 J
1–824(824 aa)
链 P
1–824(824 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 9N9S Model of APC/C-CDC20-UBE2C from H3/H4-bound complex 提交 2025-02-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric(21) 与蛋白数一致 |
链 J
1–824(824 aa)
链 P
1–824(824 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.90 Å |