当前蛋白身份：P38507
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BDC STAPHYLOCOCCUS AUREUS PROTEIN A, IMMUNOGLOBULIN-BINDING B DOMAIN, NMR, 10 STRUCTURES 提交 1996-06-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
212–270（59 aa）
片段：B DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5；303 K
|
分辨率未提供 |
| 1BDD STAPHYLOCOCCUS AUREUS PROTEIN A, IMMUNOGLOBULIN-BINDING B DOMAIN, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1996-06-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
212–270（59 aa）
片段：B DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5；303 K
|
分辨率未提供 |
| 1EDI STAPHYLOCOCCAL PROTEIN A E-DOMAIN (180), NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1996-10-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
37–92（56 aa）
片段：E-DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.7；298 K
|
分辨率未提供 |
| 1EDJ STAPHYLOCOCCAL PROTEIN A E-DOMAIN (180), NMR, 20 STRUCTURES 提交 1996-10-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
37–92（56 aa）
片段：E-DOMAIN (180)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.7；298 K
|
分辨率未提供 |
| 1EDK STAPHYLOCOCCAL PROTEIN A E-DOMAIN (-60), NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1996-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
37–92（56 aa）
片段：E-DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.7；298 K
|
分辨率未提供 |
| 1EDL STAPHYLOCOCCAL PROTEIN A E-DOMAIN (-60), NMR, 22 STRUCTURES 提交 1996-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
37–92（56 aa）
片段：E-DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.7；298 K
|
分辨率未提供 |
| 1LP1 Protein Z in complex with an in vitro selected affibody 提交 2002-05-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
212–269（58 aa）
片段：RESIDUES 2-58
|
突变：A1V, G29A | SO4 SULFATE ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；MgSO4, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.256 |
| 1LP1 Protein Z in complex with an in vitro selected affibody 提交 2002-05-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
212–269（58 aa）
片段：RESIDUES 2-58
|
突变：A1V, G29A | SO4 SULFATE ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；MgSO4, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.256 |
| 1Q2N REFINED Solution NMR structure of the Z domain of STAPHYLOCOCCAL PROTEIN A 提交 2003-07-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
212–269（58 aa）
片段：residues 212-269
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM NH4OAc；压力 1
NMR样品组成
1mM Z domain U-15N,13C; 20mM NH4OAc buffer; 95% H2O, 5% D2O. | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1SS1 STAPHYLOCOCCAL PROTEIN A, B-DOMAIN, Y15W MUTANT, NMR, 25 STRUCTURES 提交 2004-03-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
212–270（59 aa）
片段：B DOMAIN
|
突变：Y15W | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM NaCl / 50 mM acetate；压力 ambient
NMR样品组成
2mM sample, U-13C, U-15N; 50 mM D-acetate buffer, 100 mM NaCl, pH 5.5; 90% H2O, 10% D2O | 90% H20, 10% D20
|
分辨率未提供 |
| 2JWD protein A 提交 2007-10-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
213–269（57 aa）
片段：B domain
|
突变：Y15W | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 ambient
NMR样品组成
20mM sodium acetate, 100mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2M5A Protein A binding by an engineered Affibody molecule 提交 2013-02-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
213–269（57 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.095；压力 ambient
NMR样品组成
0.5 to 1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Z domain, 25% molar excess mM ZpA963, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成
0.5 to 1.0 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] ZpA963, 25 5 molar excess mM Z domain, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2SPZ STAPHYLOCOCCAL PROTEIN A, Z-DOMAIN, NMR, 10 STRUCTURES 提交 1998-07-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
212–269（58 aa）
片段：Z DOMAIN
|
突变：A1V, G29A | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）10 MILLIMOLAR K2HPO4；压力 1
|
分辨率未提供 |
| 3MZW HER2 extracelluar region with affinity matured 3-helix affibody ZHER2:342 提交 2010-05-13 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
212–269（58 aa）
片段：B 4 repeat domain residues 212-269
|
突变：A212V, Q220M, Q221R, F224Y, Y225W, L228A, H229L, E235N, E236Q, R238K, N239R, G240A, Q243R, K246Y | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；279 K；0.05M sodium chloride, 7.5% PEG3350, 0.1M ammonium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.278 |
| 4NPD High-resolution structure of C domain of staphylococcal protein A at cryogenic temperature 提交 2013-11-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
270–327（58 aa）
片段：UNP residues 270-327
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 SCN THIOCYANATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；Na Thiocyanate, PEG 3350, Glycerol, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.130 |
| 4NPE High-resolution structure of C domain of staphylococcal protein A at room temperature 提交 2013-11-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
270–327（58 aa）
片段：UNP residues 270-327
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 SCN THIOCYANATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；Na Thiocyanate, PEG 3350, Glycerol, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.42 Å R-free 0.143 |
| 4NPF High-resolution structure of two tandem B domains of staphylococcal protein A connected by the conserved linker 提交 2013-11-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 Y
154–269（116 aa）
片段：UNP residues 212-323
|
突变：W13F, W113F | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；Ammonium Sulfate, MES, pH 6, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.185 |
| 4NPF High-resolution structure of two tandem B domains of staphylococcal protein A connected by the conserved linker 提交 2013-11-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 X
154–269（116 aa）
片段：UNP residues 212-323
|
突变：W13F, W113F | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；Ammonium Sulfate, MES, pH 6, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.185 |
| 4WWI Crystal structure of the C domain of staphylococcal protein A in complex with the Fc fragment of human IgG at 2.3 Angstrom resolution 提交 2014-11-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
270–327（58 aa）
片段：UNP residues 270-327
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；NaOAc, ammonium sulfate, PEG 5K MME, glycerol
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.251 |
| 4WWI Crystal structure of the C domain of staphylococcal protein A in complex with the Fc fragment of human IgG at 2.3 Angstrom resolution 提交 2014-11-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
270–327（58 aa）
片段：UNP residues 270-327
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；NaOAc, ammonium sulfate, PEG 5K MME, glycerol
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.251 |
| 4WWI Crystal structure of the C domain of staphylococcal protein A in complex with the Fc fragment of human IgG at 2.3 Angstrom resolution 提交 2014-11-11 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
270–327（58 aa）
片段：UNP residues 270-327
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；NaOAc, ammonium sulfate, PEG 5K MME, glycerol
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.251 |
| 4ZMD C domain of staphylococcal protein A mutant - Q9W 提交 2015-05-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
270–327（58 aa）
片段：UNP residues 270-327
|
突变：Q9W | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；PEG 3350, sodium thiocyanate
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.256 |
| 4ZMD C domain of staphylococcal protein A mutant - Q9W 提交 2015-05-03 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
270–327（58 aa）
片段：UNP residues 270-327
|
突变：Q9W | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；PEG 3350, sodium thiocyanate
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.256 |
| 4ZNC Fc fragment of human IgG in complex with the C domain of staphylococcal protein A mutant - Q9W 提交 2015-05-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
270–327（58 aa）
片段：UNP residues 270-327
|
突变：Q9W | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；PEG 5000 MME, ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.242 |
| 4ZNC Fc fragment of human IgG in complex with the C domain of staphylococcal protein A mutant - Q9W 提交 2015-05-04 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
270–327（58 aa）
片段：UNP residues 270-327
|
突变：Q9W | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；PEG 5000 MME, ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.242 |
| 4ZNC Fc fragment of human IgG in complex with the C domain of staphylococcal protein A mutant - Q9W 提交 2015-05-04 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
270–327（58 aa）
片段：UNP residues 270-327
|
突变：Q9W | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；PEG 5000 MME, ammonium sulfate, sodium acetate
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.242 |
| 5CBN Fusion protein of mbp3-16 and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus with chemical cross-linker EY-CBS 提交 2015-07-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
218–269（52 aa）
片段：B4 domain (UNP RESIDUES 218-269)
|
突变：E126A, N129A, E133C, G147A | EYC 2,2'-ethyne-1,2-diylbis{5-[(chloroacetyl)amino]benzenesulfonic acid} × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.5；277 K；36% w/v PEG 2000, 0.2M magnesium chloride hexahydrate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.260 |
| 5CBO Fusion protein of mbp3-16 and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus 提交 2015-07-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
102–153（52 aa）
片段：B4 domain (UNP RESIDUES 102-153)
|
突变：D1219A, S1222A, E1226C, N1229H, E1236A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 5.5；298 K；34% w/v PPG P-400
10mM Hexaamine cobalt(III) chloride
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.254 |
| 5CBO Fusion protein of mbp3-16 and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus 提交 2015-07-01 | Assembly 10 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 J
102–153（52 aa）
片段：B4 domain (UNP RESIDUES 102-153)
|
突变：D1219A, S1222A, E1226C, N1229H, E1236A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 5.5；298 K；34% w/v PPG P-400
10mM Hexaamine cobalt(III) chloride
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.254 |
| 5CBO Fusion protein of mbp3-16 and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus 提交 2015-07-01 | Assembly 11 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 K
102–153（52 aa）
片段：B4 domain (UNP RESIDUES 102-153)
|
突变：D1219A, S1222A, E1226C, N1229H, E1236A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 5.5；298 K；34% w/v PPG P-400
10mM Hexaamine cobalt(III) chloride
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.254 |
| 5CBO Fusion protein of mbp3-16 and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus 提交 2015-07-01 | Assembly 12 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 L
102–153（52 aa）
片段：B4 domain (UNP RESIDUES 102-153)
|
突变：D1219A, S1222A, E1226C, N1229H, E1236A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 5.5；298 K；34% w/v PPG P-400
10mM Hexaamine cobalt(III) chloride
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.254 |
| 5CBO Fusion protein of mbp3-16 and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus 提交 2015-07-01 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
102–153（52 aa）
片段：B4 domain (UNP RESIDUES 102-153)
|
突变：D1219A, S1222A, E1226C, N1229H, E1236A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 5.5；298 K；34% w/v PPG P-400
10mM Hexaamine cobalt(III) chloride
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.254 |
| 5CBO Fusion protein of mbp3-16 and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus 提交 2015-07-01 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
102–153（52 aa）
片段：B4 domain (UNP RESIDUES 102-153)
|
突变：D1219A, S1222A, E1226C, N1229H, E1236A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 5.5；298 K；34% w/v PPG P-400
10mM Hexaamine cobalt(III) chloride
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.254 |
| 5CBO Fusion protein of mbp3-16 and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus 提交 2015-07-01 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
102–153（52 aa）
片段：B4 domain (UNP RESIDUES 102-153)
|
突变：D1219A, S1222A, E1226C, N1229H, E1236A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 5.5；298 K；34% w/v PPG P-400
10mM Hexaamine cobalt(III) chloride
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.254 |
| 5CBO Fusion protein of mbp3-16 and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus 提交 2015-07-01 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
102–153（52 aa）
片段：B4 domain (UNP RESIDUES 102-153)
|
突变：D1219A, S1222A, E1226C, N1229H, E1236A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 5.5；298 K；34% w/v PPG P-400
10mM Hexaamine cobalt(III) chloride
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.254 |
| 5CBO Fusion protein of mbp3-16 and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus 提交 2015-07-01 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
102–153（52 aa）
片段：B4 domain (UNP RESIDUES 102-153)
|
突变：D1219A, S1222A, E1226C, N1229H, E1236A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 5.5；298 K；34% w/v PPG P-400
10mM Hexaamine cobalt(III) chloride
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.254 |
| 5CBO Fusion protein of mbp3-16 and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus 提交 2015-07-01 | Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 G
102–153（52 aa）
片段：B4 domain (UNP RESIDUES 102-153)
|
突变：D1219A, S1222A, E1226C, N1229H, E1236A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 5.5；298 K；34% w/v PPG P-400
10mM Hexaamine cobalt(III) chloride
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.254 |
| 5CBO Fusion protein of mbp3-16 and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus 提交 2015-07-01 | Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 H
102–153（52 aa）
片段：B4 domain (UNP RESIDUES 102-153)
|
突变：D1219A, S1222A, E1226C, N1229H, E1236A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 5.5；298 K；34% w/v PPG P-400
10mM Hexaamine cobalt(III) chloride
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.254 |
| 5CBO Fusion protein of mbp3-16 and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus 提交 2015-07-01 | Assembly 9 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 I
102–153（52 aa）
片段：B4 domain (UNP RESIDUES 102-153)
|
突变：D1219A, S1222A, E1226C, N1229H, E1236A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 5.5；298 K；34% w/v PPG P-400
10mM Hexaamine cobalt(III) chloride
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.254 |
| 5COC Fusion protein of human calmodulin and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus 提交 2015-07-20 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
213–267（55 aa）
片段：B4 domain (UNP RESIDUES 213-267),N-terminal (UNP RESIDUES 5-78)
|
突变：G240A, K261C, L1005A, T1006A, Q1009C | CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；298 K；10% w/v PEG 1000, 10% w/v PEG 8000
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.259 |
| 5EWX Fusion protein of T4 lysozyme and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus with chemical cross-linker EY-CBS 提交 2015-11-22 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
212–266（55 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-35, 219-266, 38-164
|
突变：A1212V, G1240A, E1258C, K1261A, L1262A, N40C, C54T, C97A, K162A | EYC 2,2'-ethyne-1,2-diylbis{5-[(chloroacetyl)amino]benzenesulfonic acid} × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 7.5；277 K；1.84M Na/K Phosphate, pH 7.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.253 |
| 5EWX Fusion protein of T4 lysozyme and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus with chemical cross-linker EY-CBS 提交 2015-11-22 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
212–266（55 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-35, 219-266, 38-164
|
突变：A1212V, G1240A, E1258C, K1261A, L1262A, N40C, C54T, C97A, K162A | EYC 2,2'-ethyne-1,2-diylbis{5-[(chloroacetyl)amino]benzenesulfonic acid} × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 7.5；277 K；1.84M Na/K Phosphate, pH 7.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.253 |
| 5H75 Crystal structure of the MrsD-Protein A fusion protein 提交 2016-11-17 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
223–269（47 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-184,223-269
链 B
223–269（47 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-184,223-269
链 C
223–269（47 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-184,223-269
链 D
223–269（47 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-184,223-269
|
突变：K182Q,G240A 突变：K182Q,G240A 突变：K182Q,G240A 突变：K182Q,G240A | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；277 K；0.94M sodium citrate pH 5.5
|
分辨率 2.74 Å R-free 0.243 |
| 5H76 Crystal structure of the DARPin-Protein A fusion protein 提交 2016-11-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
235–267（33 aa）
片段：RESIDUES 9-176,177-209 (UNP RESIDUES 235-267)
|
突变：G182A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 9.5；296 K；0.63M sodium potassium phosphate pH 9.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.250 |
| 5H76 Crystal structure of the DARPin-Protein A fusion protein 提交 2016-11-17 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
235–267（33 aa）
片段：RESIDUES 9-176,177-209 (UNP RESIDUES 235-267)
|
突变：G182A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 9.5；296 K；0.63M sodium potassium phosphate pH 9.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.250 |
| 5H76 Crystal structure of the DARPin-Protein A fusion protein 提交 2016-11-17 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
235–267（33 aa）
片段：RESIDUES 9-176,177-209 (UNP RESIDUES 235-267)
|
突变：G182A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 9.5；296 K；0.63M sodium potassium phosphate pH 9.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.250 |
| 5H77 Crystal structure of the PKA-protein A fusion protein 提交 2016-11-17 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
220–268（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 5-41,UNP RESIDUES 220-268
链 B
220–268（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 5-41,UNP RESIDUES 220-268
|
突变：G222A, G240A 突变：G222A, G240A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 0.68M sodium citrate pH 4.5
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.284 |
| 5H77 Crystal structure of the PKA-protein A fusion protein 提交 2016-11-17 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
220–268（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 5-41,UNP RESIDUES 220-268
链 D
220–268（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 5-41,UNP RESIDUES 220-268
|
突变：G222A, G240A 突变：G222A, G240A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 0.68M sodium citrate pH 4.5
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.284 |
| 5H77 Crystal structure of the PKA-protein A fusion protein 提交 2016-11-17 | Assembly 3 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
220–268（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 5-41,UNP RESIDUES 220-268
链 F
220–268（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 5-41,UNP RESIDUES 220-268
|
突变：G222A, G240A 突变：G222A, G240A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 0.68M sodium citrate pH 4.5
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.284 |
| 5H77 Crystal structure of the PKA-protein A fusion protein 提交 2016-11-17 | Assembly 4 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
220–268（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 5-41,UNP RESIDUES 220-268
链 H
220–268（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 5-41,UNP RESIDUES 220-268
|
突变：G222A, G240A 突变：G222A, G240A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 0.68M sodium citrate pH 4.5
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.284 |
| 5H77 Crystal structure of the PKA-protein A fusion protein 提交 2016-11-17 | Assembly 5 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 I
220–268（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 5-41,UNP RESIDUES 220-268
链 J
220–268（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 5-41,UNP RESIDUES 220-268
|
突变：G222A, G240A 突变：G222A, G240A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 0.68M sodium citrate pH 4.5
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.284 |
| 5H77 Crystal structure of the PKA-protein A fusion protein 提交 2016-11-17 | Assembly 6 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 K
220–268（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 5-41,UNP RESIDUES 220-268
链 L
220–268（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 5-41,UNP RESIDUES 220-268
|
突变：G222A, G240A 突变：G222A, G240A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 0.68M sodium citrate pH 4.5
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.284 |
| 5H79 Crystal structure of a repeat protein with three Protein A repeat module 提交 2016-11-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
217–263（47 aa）
片段：UNP RESIDUES 217-263,UNP RESIDUES 219-263,UNP RESIDUES 219-268
链 D
219–263（45 aa）
片段：UNP RESIDUES 217-263,UNP RESIDUES 219-263,UNP RESIDUES 219-268
链 D
219–268（50 aa）
片段：UNP RESIDUES 217-263,UNP RESIDUES 219-263,UNP RESIDUES 219-268
|
突变：G59A, N131A, G149A 突变：G59A, N131A, G149A 突变：G59A, N131A, G149A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 13.5%(w/v) PEG 1000
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.278 |
| 5H79 Crystal structure of a repeat protein with three Protein A repeat module 提交 2016-11-17 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
217–263（47 aa）
片段：UNP RESIDUES 217-263,UNP RESIDUES 219-263,UNP RESIDUES 219-268
链 C
219–263（45 aa）
片段：UNP RESIDUES 217-263,UNP RESIDUES 219-263,UNP RESIDUES 219-268
链 C
219–268（50 aa）
片段：UNP RESIDUES 217-263,UNP RESIDUES 219-263,UNP RESIDUES 219-268
|
突变：G59A, N131A, G149A 突变：G59A, N131A, G149A 突变：G59A, N131A, G149A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 13.5%(w/v) PEG 1000
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.278 |
| 5H7A Crystal structure of a repeat protein with four Protein A repeat module 提交 2016-11-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
215–263（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
链 C
219–263（45 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
链 C
219–267（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
|
突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 43.2% (w/v) PEG 1000
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.285 |
| 5H7A Crystal structure of a repeat protein with four Protein A repeat module 提交 2016-11-17 | Assembly 10 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 J
215–263（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
链 J
219–263（45 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
链 J
219–267（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
|
突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 43.2% (w/v) PEG 1000
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.285 |
| 5H7A Crystal structure of a repeat protein with four Protein A repeat module 提交 2016-11-17 | Assembly 11 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 K
215–263（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
链 K
219–263（45 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
链 K
219–267（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
|
突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 43.2% (w/v) PEG 1000
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.285 |
| 5H7A Crystal structure of a repeat protein with four Protein A repeat module 提交 2016-11-17 | Assembly 12 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 L
215–263（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
链 L
219–263（45 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
链 L
219–267（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
|
突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 43.2% (w/v) PEG 1000
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.285 |
| 5H7A Crystal structure of a repeat protein with four Protein A repeat module 提交 2016-11-17 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
215–263（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
链 A
219–263（45 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
链 A
219–267（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
|
突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 43.2% (w/v) PEG 1000
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.285 |
| 5H7A Crystal structure of a repeat protein with four Protein A repeat module 提交 2016-11-17 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
215–263（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
链 D
219–263（45 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
链 D
219–267（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
|
突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 43.2% (w/v) PEG 1000
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.285 |
| 5H7A Crystal structure of a repeat protein with four Protein A repeat module 提交 2016-11-17 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
215–263（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
链 B
219–263（45 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
链 B
219–267（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
|
突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 43.2% (w/v) PEG 1000
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.285 |
| 5H7A Crystal structure of a repeat protein with four Protein A repeat module 提交 2016-11-17 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
215–263（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
链 E
219–263（45 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
链 E
219–267（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
|
突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 43.2% (w/v) PEG 1000
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.285 |
| 5H7A Crystal structure of a repeat protein with four Protein A repeat module 提交 2016-11-17 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
215–263（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
链 F
219–263（45 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
链 F
219–267（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
|
突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 43.2% (w/v) PEG 1000
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.285 |
| 5H7A Crystal structure of a repeat protein with four Protein A repeat module 提交 2016-11-17 | Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 G
215–263（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
链 G
219–263（45 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
链 G
219–267（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
|
突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 43.2% (w/v) PEG 1000
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.285 |
| 5H7A Crystal structure of a repeat protein with four Protein A repeat module 提交 2016-11-17 | Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 H
215–263（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
链 H
219–263（45 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
链 H
219–267（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
|
突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 43.2% (w/v) PEG 1000
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.285 |
| 5H7A Crystal structure of a repeat protein with four Protein A repeat module 提交 2016-11-17 | Assembly 9 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 I
215–263（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
链 I
219–263（45 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
链 I
219–267（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267
|
突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 43.2% (w/v) PEG 1000
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.285 |
| 5H7B Crystal structure of a repeat protein with five Protein A repeat modules 提交 2016-11-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
215–263（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263,219-263,219-263,219-263,219-267
链 A
219–263（45 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263,219-263,219-263,219-263,219-267
链 A
219–267（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263,219-263,219-263,219-263,219-267
|
突变：G59A, G104A, G149A, 1G94A, G239A 突变：G59A, G104A, G149A, 1G94A, G239A 突变：G59A, G104A, G149A, 1G94A, G239A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 27.3% PEG MME 2000
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.315 |
| 5H7B Crystal structure of a repeat protein with five Protein A repeat modules 提交 2016-11-17 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
215–263（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263,219-263,219-263,219-263,219-267
链 B
219–263（45 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263,219-263,219-263,219-263,219-267
链 B
219–267（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-263,219-263,219-263,219-263,219-267
|
突变：G59A, G104A, G149A, 1G94A, G239A 突变：G59A, G104A, G149A, 1G94A, G239A 突变：G59A, G104A, G149A, 1G94A, G239A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 27.3% PEG MME 2000
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.315 |
| 5H7C Crystal structure of a repeat protein with two Protein A-DHR14 repeat modules 提交 2016-11-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
215–267（53 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-267,219-267
链 A
219–267（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-267,219-267
|
突变：10 mutations 突变：10 mutations | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；296 K；0.1M Tris pH 8.0, 33.75%(w/v) PEG MME 2000
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.262 |
| 5H7C Crystal structure of a repeat protein with two Protein A-DHR14 repeat modules 提交 2016-11-17 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
215–267（53 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-267,219-267
链 C
219–267（49 aa）
片段：UNP RESIDUES 215-267,219-267
|
突变：10 mutations 突变：10 mutations | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；296 K；0.1M Tris pH 8.0, 33.75%(w/v) PEG MME 2000
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.262 |
| 5H7D Crystal structure of the YgjG-protein A-Zpa963-calmodulin complex 提交 2016-11-17 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
220–267（48 aa）
片段：UNP RESIDUES 7-453,UNP RESIDUES 220-267
链 B
220–267（48 aa）
片段：UNP RESIDUES 7-453,UNP RESIDUES 220-267
链 C
220–267（48 aa）
片段：UNP RESIDUES 7-453,UNP RESIDUES 220-267
链 D
220–267（48 aa）
片段：UNP RESIDUES 7-453,UNP RESIDUES 220-267
|
突变：N222V, G240A 突变：N222V, G240A 突变：N222V, G240A 突变：N222V, G240A | CA CALCIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；296 K；0.1M HEPES pH 7.5, 20.7% PEG 300, 99mM calcium chloride
|
分辨率 2.57 Å R-free 0.241 |
| 5H7D Crystal structure of the YgjG-protein A-Zpa963-calmodulin complex 提交 2016-11-17 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 I
220–267（48 aa）
片段：UNP RESIDUES 7-453,UNP RESIDUES 220-267
链 J
220–267（48 aa）
片段：UNP RESIDUES 7-453,UNP RESIDUES 220-267
链 M
220–267（48 aa）
片段：UNP RESIDUES 7-453,UNP RESIDUES 220-267
链 N
220–267（48 aa）
片段：UNP RESIDUES 7-453,UNP RESIDUES 220-267
|
突变：N222V, G240A 突变：N222V, G240A 突变：N222V, G240A 突变：N222V, G240A | CA CALCIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；296 K；0.1M HEPES pH 7.5, 20.7% PEG 300, 99mM calcium chloride
|
分辨率 2.57 Å R-free 0.241 |
| 5X3F Crystal structure of the YgjG-Protein A-Zpa963-PKA catalytic domain 提交 2017-02-05 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
220–269（50 aa）
片段：UNP RESIDUES 7-453,220-269
|
突变：N222V, G240A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；296 K；91mM MES pH 5.5, 2.33M Na formate
|
分辨率 3.38 Å R-free 0.227 |
| 5XBY Crystal structure of the PKA-Protein A fusion protein (end-to-end fusion) 提交 2017-03-21 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
217–269（53 aa）
片段：UNP RESIDUES 5-44,UNP RESIDUES 217-269
链 B
217–269（53 aa）
片段：UNP RESIDUES 5-44,UNP RESIDUES 217-269
|
突变：G240A 突变：G240A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；296 K；100mM Tris pH 8.5, 2.16M Sodium formate
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.307 |
| 5XBY Crystal structure of the PKA-Protein A fusion protein (end-to-end fusion) 提交 2017-03-21 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
217–269（53 aa）
片段：UNP RESIDUES 5-44,UNP RESIDUES 217-269
链 D
217–269（53 aa）
片段：UNP RESIDUES 5-44,UNP RESIDUES 217-269
|
突变：G240A 突变：G240A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；296 K；100mM Tris pH 8.5, 2.16M Sodium formate
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.307 |
| 6KRV Crystal structure of mouse IgG2b Fc complexed with B domain of Protein A 提交 2019-08-22 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
212–269（58 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；60% (v/v) Tacsimate (pH 7.0)
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.250 |
| 6KRV Crystal structure of mouse IgG2b Fc complexed with B domain of Protein A 提交 2019-08-22 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
212–269（58 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；60% (v/v) Tacsimate (pH 7.0)
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.250 |
| 7EOY Engineered Hepatitis B virus core antigen T=3 提交 2021-04-24 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 180 PDB 声明：180-meric（180） 与蛋白数一致 |
链 A
212–269（58 aa）
链 B
212–269（58 aa）
链 C
212–269（58 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7EOY Engineered Hepatitis B virus core antigen T=3 提交 2021-04-24 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
212–269（58 aa）
链 B
212–269（58 aa）
链 C
212–269（58 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7EOY Engineered Hepatitis B virus core antigen T=3 提交 2021-04-24 | Assembly 3 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白数一致 |
链 A
212–269（58 aa）
链 B
212–269（58 aa）
链 C
212–269（58 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7EOY Engineered Hepatitis B virus core antigen T=3 提交 2021-04-24 | Assembly 4 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 A
212–269（58 aa）
链 B
212–269（58 aa）
链 C
212–269（58 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7EOY Engineered Hepatitis B virus core antigen T=3 提交 2021-04-24 | Assembly 5 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
212–269（58 aa）
链 B
212–269（58 aa）
链 C
212–269（58 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7EP6 Engineered Hepatitis B virus core antigen T=4 提交 2021-04-26 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 240 PDB 声明：240-meric（240） 与蛋白数一致 |
链 A
212–269（58 aa）
链 B
212–269（58 aa）
链 C
212–269（58 aa）
链 D
212–269（58 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.86 Å |
| 7EP6 Engineered Hepatitis B virus core antigen T=4 提交 2021-04-26 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
212–269（58 aa）
链 B
212–269（58 aa）
链 C
212–269（58 aa）
链 D
212–269（58 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.86 Å |
| 7EP6 Engineered Hepatitis B virus core antigen T=4 提交 2021-04-26 | Assembly 3 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric（20） 与蛋白数一致 |
链 A
212–269（58 aa）
链 B
212–269（58 aa）
链 C
212–269（58 aa）
链 D
212–269（58 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.86 Å |
| 7EP6 Engineered Hepatitis B virus core antigen T=4 提交 2021-04-26 | Assembly 4 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
212–269（58 aa）
链 B
212–269（58 aa）
链 C
212–269（58 aa）
链 D
212–269（58 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.86 Å |
| 7EP6 Engineered Hepatitis B virus core antigen T=4 提交 2021-04-26 | Assembly 5 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
212–269（58 aa）
链 B
212–269（58 aa）
链 C
212–269（58 aa）
链 D
212–269（58 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.86 Å |
| 7FDJ Engineered Hepatitis B virus core antigen with short linker T=4 提交 2021-07-16 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 240 PDB 声明：240-meric（240） 与蛋白数一致 |
链 A
212–269（58 aa）
链 B
212–269（58 aa）
链 C
212–269（58 aa）
链 D
212–269（58 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 7FDJ Engineered Hepatitis B virus core antigen with short linker T=4 提交 2021-07-16 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
212–269（58 aa）
链 B
212–269（58 aa）
链 C
212–269（58 aa）
链 D
212–269（58 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 7FDJ Engineered Hepatitis B virus core antigen with short linker T=4 提交 2021-07-16 | Assembly 3 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric（20） 与蛋白数一致 |
链 A
212–269（58 aa）
链 B
212–269（58 aa）
链 C
212–269（58 aa）
链 D
212–269（58 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 7FDJ Engineered Hepatitis B virus core antigen with short linker T=4 提交 2021-07-16 | Assembly 4 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
212–269（58 aa）
链 B
212–269（58 aa）
链 C
212–269（58 aa）
链 D
212–269（58 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 7FDJ Engineered Hepatitis B virus core antigen with short linker T=4 提交 2021-07-16 | Assembly 5 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
212–269（58 aa）
链 B
212–269（58 aa）
链 C
212–269（58 aa）
链 D
212–269（58 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 7NHA 1918 H1N1 Viral influenza polymerase heterotrimer - Endonuclease and priming loop ordered (Class2a) 提交 2021-02-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 C
158–271（114 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3.5 second blot and 3 microlitres sample.
|
分辨率 2.91 Å |
| 7NHC 1918 H1N1 Viral influenza polymerase heterotrimer - Endonuclease ordered (Class2b) 提交 2021-02-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 C
158–271（114 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3.5 second blot and 3 microlitres sample.
|
分辨率 2.87 Å |
| 7NHX 1918 H1N1 Viral influenza polymerase heterotrimer - full transcriptase (Class1) 提交 2021-02-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 C
158–271（114 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3.5 second blot and 3 microlitres sample.
|
分辨率 3.23 Å |
| 7NI0 1918 H1N1 Viral influenza polymerase heterotrimer - Replicase (class 3) 提交 2021-02-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 C
158–271（114 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3.5 second blot and 3 microlitres sample.
|
分辨率 3.32 Å |
| 7NIK 1918 H1N1 Viral influenza polymerase heterotrimer with Nb8189 core 提交 2021-02-12 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 C
158–271（114 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.20 Å |
| 7NIL 1918 H1N1 Viral influenza polymerase heterotrimer with Nb8190 core 提交 2021-02-12 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 C
158–271（114 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.01 Å |
| 7NIR 1918 H1N1 Viral influenza polymerase heterotrimer with Nb8191 core 提交 2021-02-13 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 C
158–271（114 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.70 Å |
| 7NIS 1918 H1N1 Viral influenza polymerase heterotrimer with Nb8192 core 提交 2021-02-13 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 C
158–271（114 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.96 Å |
| 7NJ3 1918 H1N1 Viral influenza polymerase heterotrimer with Nb8196 core 提交 2021-02-15 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 C
158–271（114 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.48 Å |
| 7NJ4 1918 H1N1 Viral influenza polymerase heterotrimer with Nb8198 core 提交 2021-02-16 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 C
158–271（114 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.84 Å |
| 7NJ5 1918 H1N1 Viral influenza polymerase heterotrimer with Nb8199 core 提交 2021-02-16 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 C
158–271（114 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.63 Å |
| 7NJ7 1918 H1N1 Viral influenza polymerase heterotrimer with Nb8200 core 提交 2021-02-16 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 C
158–271（114 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.82 Å |
| 7NK1 1918 Influenza virus polymerase heterotirmer in complex with vRNA promoters and Nb8201 提交 2021-02-17 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 C
158–271（114 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.22 Å |
| 7NK2 1918 H1N1 Viral influenza polymerase heterotrimer with Nb8202 core 提交 2021-02-17 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 C
158–271（114 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.84 Å |
| 8CPL YZw2 a scaffold for cryo-EM of small proteins of interest 提交 2023-03-03 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
220–269（50 aa）
链 B
220–269（50 aa）
链 C
220–269（50 aa）
链 D
220–269（50 aa）
|
未记录 | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；16.6% w/v PEG3350, 0.2M NaF and 0.1M Bis-Tris Propane pH 5.5
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.210 |
| 8DA3 Coevolved affibody-Z domain pair LL1.c1 提交 2022-06-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
213–269（57 aa）
|
突变：Q9L, F13I, L17F, G29A, I31F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 MLI MALONATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；295 K；2.4 M Ammonium Sulfate
0.1 M bicine pH 9.0
Cryoprotected with sodium malonate
|
分辨率 1.06 Å R-free 0.168 |
| 8DA4 Coevolved affibody-Z domain pair LL1.c2 提交 2022-06-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
213–269（57 aa）
|
突变：Q9L, F13I, G29A, I31F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；295 K；2.5 M AmmSO4, 0.1 M NaOAc pH 4.6
cryoprotected with Na malonate
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.247 |
| 8DA4 Coevolved affibody-Z domain pair LL1.c2 提交 2022-06-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
213–269（57 aa）
|
突变：Q9L, F13I, G29A, I31F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；295 K；2.5 M AmmSO4, 0.1 M NaOAc pH 4.6
cryoprotected with Na malonate
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.247 |
| 8DA4 Coevolved affibody-Z domain pair LL1.c2 提交 2022-06-13 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
213–269（57 aa）
|
突变：Q9L, F13I, G29A, I31F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；295 K；2.5 M AmmSO4, 0.1 M NaOAc pH 4.6
cryoprotected with Na malonate
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.247 |
| 8DA5 Coevolved affibody-Z domain pair LL1.c4 提交 2022-06-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
212–269（58 aa）
|
突变：Q9F, F13I, G29A, I31F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；2.3 M AmmPO4, 100 mM Tris pH 8.5
cryoprotected with 30% glycerol
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.191 |
| 8DA5 Coevolved affibody-Z domain pair LL1.c4 提交 2022-06-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
212–269（58 aa）
|
突变：Q9F, F13I, G29A, I31F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；2.3 M AmmPO4, 100 mM Tris pH 8.5
cryoprotected with 30% glycerol
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.191 |
| 8DA6 Coevolved affibody-Z domain pair LL1.c5 提交 2022-06-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
213–269（57 aa）
|
突变：Q9F, F13I, G29A, I31F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；2.4 M ammonium Sulfate
0.1 M citric acid pH 5.0
cryoprotected with sodium malonate
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.251 |
| 8DA6 Coevolved affibody-Z domain pair LL1.c5 提交 2022-06-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
213–269（57 aa）
|
突变：Q9F, F13I, G29A, I31F | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；2.4 M ammonium Sulfate
0.1 M citric acid pH 5.0
cryoprotected with sodium malonate
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.251 |
| 8DA7 Coevolved affibody-Z domain pair LL1.c6 提交 2022-06-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
213–269（57 aa）
|
突变：Q9L, F13I, G29A, I31F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MLI MALONATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；2.5 M AmmSO4, 100 mM tris pH 8.5
cryoprotected with Na malonate
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.183 |
| 8DA8 Coevolved affibody-Z domain pair LL2.c1 提交 2022-06-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
213–269（57 aa）
|
突变：Q9L F13V, G29A, I31F | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；2.5 M ammonium sulfate
100 mM HEPES pH 7.0
Cryoprotected with 30% glycerol
|
分辨率 1.29 Å R-free 0.235 |
| 8DA9 Coevolved affibody-Z domain pair LL2.c3 提交 2022-06-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
213–269（57 aa）
|
突变：Q9L, F13V, G29A, I31F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；2.4 M Ammonium sulfate
0.1M HEPES pH 7.0
Cryoprotected with 30% glycerol
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.198 |
| 8DA9 Coevolved affibody-Z domain pair LL2.c3 提交 2022-06-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
213–269（57 aa）
|
突变：Q9L, F13V, G29A, I31F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；2.4 M Ammonium sulfate
0.1M HEPES pH 7.0
Cryoprotected with 30% glycerol
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.198 |
| 8DAA Coevolved affibody-Z domain pair LL2.c7 提交 2022-06-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
213–269（57 aa）
|
突变：Q9L, F13V, G29A, I31F | MLI MALONATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；3.0 M Ammonium sulfate,
100 mM HEPES pH 7.0
cryoprotected with sodium malonate
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.298 |
| 8DAA Coevolved affibody-Z domain pair LL2.c7 提交 2022-06-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
213–269（57 aa）
|
突变：Q9L, F13V, G29A, I31F | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；3.0 M Ammonium sulfate,
100 mM HEPES pH 7.0
cryoprotected with sodium malonate
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.298 |
| 8DAB Coevolved affibody-Z domain pair LL2.c17 提交 2022-06-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
213–269（57 aa）
|
突变：Q9V, G29A, I31V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；295 K；2.3 M Amm2HPO4, 100 mM Tris pH 8.2
cryoprotected in 30% glycerol
|
分辨率 1.13 Å R-free 0.200 |
| 8DAC Coevolved affibody-Z domain pair LL2.c22 提交 2022-06-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
213–269（57 aa）
|
突变：Q9I, F13V, L17F, G29A, I31F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；295 K；2.5 M AmmSO4, 100 mM Tris pH 8.2
Cryoprotected with 30% glycerol
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.196 |
| 8JXR Structure of nanobody-bound DRD1_LSD complex 提交 2023-07-01 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
289–327（39 aa）
|
突变：E360Q,K363A,D364F,T367I,R368L | 7LD (8alpha)-N,N-diethyl-6-methyl-9,10-didehydroergoline-8-carboxamide × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.57 Å |
| 8JXS Structure of nanobody-bound DRD1_PF-6142 complex 提交 2023-07-01 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
289–327（39 aa）
|
突变：E360Q,K363A,D364F,T367I,R368L,D404E,A405H | V6X 4-[3-methyl-4-(6-methylimidazo[1,2-a]pyrazin-5-yl)phenoxy]furo[3,2-c]pyridine × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8R2P YZwIdeal x16 a scaffold for cryo-EM of small proteins of interest crystallizing in space group 19 (P 21 21 21) 提交 2023-11-07 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
218–269（52 aa）
链 B
218–269（52 aa）
链 C
218–269（52 aa）
链 D
218–269（52 aa）
|
突变：G487A 突变：G487A 突变：G487A 突变：G487A | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；50% w/v PEG200, 0.2M MgCl2 and 0.1M Sodium Cacodylate buffer pH 6.5
|
分辨率 2.22 Å R-free 0.230 |
| 9QU4 Cryo-EM structure of the inward-open choline-bound state of choline/ethanolamine transporter FLVCR2 提交 2025-04-10 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
159–321（163 aa）
|
未记录 | CHT CHOLINE ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.39 Å |
| 9W3K GPR151-Legobody complex 提交 2025-07-29 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
289–327（39 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.08 Å |