当前蛋白身份：Q9UJX3
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3FFL Crystal Structure of the N-terminal Domain of Anaphase-Promoting Complex Subunit 7 提交 2008-12-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–147（147 aa）
片段：N-terminal domain
链 C
1–147（147 aa）
片段：N-terminal domain
|
突变：M49L, M128L, M134V, M160L 突变：M49L, M128L, M134V, M160L | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；294 K；0.2M sodium/potassium tartrate, 15% PEG 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.240 |
| 3FFL Crystal Structure of the N-terminal Domain of Anaphase-Promoting Complex Subunit 7 提交 2008-12-03 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–147（147 aa）
片段：N-terminal domain
链 D
1–147（147 aa）
片段：N-terminal domain
|
突变：M49L, M128L, M134V, M160L 突变：M49L, M128L, M134V, M160L | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；294 K；0.2M sodium/potassium tartrate, 15% PEG 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.240 |
| 4UI9 Atomic structure of the human Anaphase-Promoting Complex 提交 2015-03-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric（23） 与蛋白数一致 |
链 X
35–599（565 aa）
链 Y
35–599（565 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 5A31 Structure of the human APC-Cdh1-Hsl1-UbcH10 complex. 提交 2015-05-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 X
1–599（599 aa）
链 Y
1–599（599 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 5G04 Structure of the human APC-Cdc20-Hsl1 complex 提交 2016-03-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric（21） 与蛋白数一致 |
链 X
1–599（599 aa）
链 Y
1–599（599 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20MM HEPES, 150MM NACL, 0. 5MM TCEP；pH 8；20MM HEPES, 150MM NACL, 0. 5MM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 5G05 Cryo-EM structure of combined apo phosphorylated APC 提交 2016-03-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric（20） 与蛋白数一致 |
链 X
1–599（599 aa）
链 Y
1–599（599 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20MM HEPES, 150MM NACL, 0. 5MM TCEP；pH 8；20MM HEPES, 150MM NACL, 0. 5MM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 5KHR Model of human Anaphase-promoting complex/Cyclosome complex (APC15 deletion mutant) in complex with the E2 UBE2C/UBCH10 poised for ubiquitin ligation to substrate (APC/C-CDC20-substrate-UBE2C) 提交 2016-06-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric（21） 与蛋白数一致 |
链 X
35–599（565 aa）
链 Y
35–599（565 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.10 Å |
| 5KHU Model of human Anaphase-promoting complex/Cyclosome (APC15 deletion mutant), in complex with the Mitotic checkpoint complex (APC/C-CDC20-MCC) based on cryo EM data at 4.8 Angstrom resolution 提交 2016-06-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric（23） 与蛋白数一致 |
链 X
35–599（565 aa）
链 Y
35–599（565 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 5L9T Model of human Anaphase-promoting complex/Cyclosome (APC/C-CDH1) with E2 UBE2S poised for polyubiquitination where UBE2S, APC2, and APC11 are modeled into low resolution density 提交 2016-06-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric（22） 与蛋白数一致 |
链 X
35–599（565 aa）
链 Y
35–599（565 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.40 Å |
| 5L9U Model of human Anaphase-promoting complex/Cyclosome (APC/C-CDH1) with a cross linked Ubiquitin variant-substrate-UBE2C (UBCH10) complex representing key features of multiubiquitination 提交 2016-06-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric（22） 与蛋白数一致 |
链 X
35–599（565 aa）
链 Y
35–599（565 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.40 Å |
| 5LCW Cryo-EM structure of the Anaphase-promoting complex/Cyclosome, in complex with the Mitotic checkpoint complex (APC/C-MCC) at 4.2 angstrom resolution 提交 2016-06-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric（23） 与蛋白数一致 |
链 X
1–599（599 aa）
链 Y
1–599（599 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 6Q6G Cryo-EM structure of the APC/C-Cdc20-Cdk2-cyclinA2-Cks2 complex, the D1 box class 提交 2018-12-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric（21） 与蛋白数一致 |
链 Y
1–599（599 aa）
链 Z
1–599（599 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；20mM Hepes, 150mM NaCl, 0.5mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 6Q6H Cryo-EM structure of the APC/C-Cdc20-Cdk2-cyclinA2-Cks2 complex, the D2 box class 提交 2018-12-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric（21） 与蛋白数一致 |
链 Y
1–599（599 aa）
链 Z
1–599（599 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；20mM Hepes, 150mM NaCl, 0.5mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 6TLJ Cryo-EM structure of the Anaphase-promoting complex/Cyclosome, in complex with the Mitotic checkpoint complex (APC/C-MCC) at 3.8 angstrom resolution 提交 2019-12-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric（23） 与蛋白数一致 |
链 X
1–599（599 aa）
链 Y
1–599（599 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6TM5 Cryo-EM structure of the Anaphase-promoting complex/Cyclosome, in complex with the Nek2A substrate at 3.9 angstrom resolution 提交 2019-12-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric（22） 与蛋白数一致 |
链 X
1–599（599 aa）
链 Y
1–599（599 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 6TNT SUMOylated apoAPC/C with repositioned APC2 WHB domain 提交 2019-12-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric（20） 与蛋白数一致 |
链 X
1–599（599 aa）
链 Y
1–599（599 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.78 Å |
| 8PKP Cryo-EM structure of the apo Anaphase-promoting complex/cyclosome (APC/C) at 3.2 Angstrom resolution 提交 2023-06-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：19-meric（19） 与蛋白数一致 |
链 Y
1–565（565 aa）
链 Z
1–565（565 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8TAR APC/C-CDH1-UBE2C-Ubiquitin-CyclinB-NTD 提交 2023-06-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric（22） 与蛋白数一致 |
链 Y
35–599（565 aa）
链 Z
35–599（565 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 8TAU APC/C-CDH1-UBE2C-UBE2S-Ubiquitin-CyclinB 提交 2023-06-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric（23） 与蛋白数一致 |
链 Y
35–599（565 aa）
链 Z
35–599（565 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9GAW High-resolution structure of the Anaphase-promoting complex/cyclosome (APC/C) bound to co-activator Cdh1 提交 2024-07-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric（21） 与蛋白数一致 |
链 Y
1–599（599 aa）
链 Z
1–599（599 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9N9R Model of APC/C-CDC20-UBE2C from H2A/H2B-bound complex 提交 2025-02-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric（21） 与蛋白数一致 |
链 Y
35–599（565 aa）
链 Z
35–599（565 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 9N9S Model of APC/C-CDC20-UBE2C from H3/H4-bound complex 提交 2025-02-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric（21） 与蛋白数一致 |
链 Y
35–599（565 aa）
链 Z
35–599（565 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.90 Å |