SAXSdb — 蛋白结构检索

当前蛋白身份：Q9Y4Z0 重新检索

本组结构的主要差异维度

组装状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法	实验环境	结构质量
3JCR 3D structure determination of the humanU4/U6.U5 tri-snRNP complex 提交 2016-01-21	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric（36）与全部聚合物一致	链 4 1–139（139 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM缓冲液 20 mM HEPES, pH 7.9, 100 mM KCl, 5 mM MgCl2, 0.1 mM EDTA；pH 7.9；20 mM HEPES, pH 7.9, 100 mM KCl, 5 mM MgCl2, 0.1 mM EDTA cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.00 Å
5O9Z Cryo-EM structure of a pre-catalytic human spliceosome primed for activation (B complex) 提交 2017-06-20	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric（57）与全部聚合物一致	链 q 1–139（139 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
6AH0 The Cryo-EM Structure of the Precusor of Human Pre-catalytic Spliceosome (pre-B complex) 提交 2018-08-15	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric（57）与全部聚合物一致	链 s 1–139（139 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.70 Å
6AHD The Cryo-EM Structure of Human Pre-catalytic Spliceosome (B complex) at 3.8 angstrom resolution 提交 2018-08-17	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric（63）与全部聚合物一致	链 s 1–139（139 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6QW6 Structure of the human U5.U4/U6 tri-snRNP at 2.9A resolution. 提交 2019-03-05	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric（39）与全部聚合物一致	链 64 1–139（139 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Wait 30s, blot for 2s to 3s.	分辨率 2.92 Å
6QX9 Structure of a human fully-assembled precatalytic spliceosome (pre-B complex). 提交 2019-03-07	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 65 PDB 声明：71-meric（71）与全部聚合物一致	链 64 1–139（139 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.28 Å
7ABG Human pre-Bact-1 spliceosome 提交 2020-09-07	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric（58）与全部聚合物一致	链 C 1–139（139 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTG 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-GUANOSINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.80 Å
8H6E Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the late pre-B state. 提交 2022-10-17	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric（61）与全部聚合物一致	链 6c 1–139（139 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8H6J Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature pre-B state. 提交 2022-10-18	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric（61）与全部聚合物一致	链 6c 1–139（139 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.25 Å
8H6K Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature B state. 提交 2022-10-18	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric（63）与全部聚合物一致	链 6c 1–139（139 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8H6L Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the early B state. 提交 2022-10-18	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：59-meric（59）与全部聚合物一致	链 6c 1–139（139 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
8QO9 Cryo-EM structure of a human spliceosomal B complex protomer 提交 2023-09-28	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 66 PDB 声明：71-meric（71）与全部聚合物一致	链 64 1–139（139 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.29 Å
8QXD Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B complex 提交 2023-10-24	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric（61）与全部聚合物一致	链 64 1–139（139 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.60 Å
8QZS Cryo-EM structure of the cross-exon B-like complex 提交 2023-10-29	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 61 PDB 声明：68-meric（68）与全部聚合物一致	链 64 1–139（139 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8R08 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+AMPPNP complex 提交 2023-10-31	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 64 PDB 声明：71-meric（71）与全部聚合物一致	链 64 1–139（139 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.10 Å
8R09 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss+ATPgammaS complex 提交 2023-10-31	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric（60）与全部聚合物一致	链 64 1–139（139 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
8R0A Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss complex 提交 2023-10-31	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：62-meric（62）与全部聚合物一致	链 64 1–139（139 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.80 Å
8R0B Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+ATP complex 提交 2023-10-31	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric（60）与全部聚合物一致	链 64 1–139（139 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8RM5 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ssLNG+ATPyS complex 提交 2024-01-05	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric（60）与全部聚合物一致	链 64 1–139（139 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.90 Å
9R8V Cryo-EM structure of the human pre-Bact-OTS complex (whole map) 提交 2025-05-17	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：63-meric（63）与全部聚合物一致	链 64 1–139（139 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.50 Å

蛋白结构与聚集状态

相关结构差异明细