ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 19 PDB 声明:nonadecameric(19) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 36–545 链 B; UniProt 36–545 链 C; UniProt 36–545 | 未记录 | ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 3 (P00830) ATP SYNTHASE SUBUNIT GAMMA, MITOCHONDRIAL × 1 (P38077) ATP SYNTHASE SUBUNIT DELTA, MITOCHONDRIAL × 1 (Q12165) ATP SYNTHASE SUBUNIT EPSILON, MITOCHONDRIAL × 1 (P21306) ATP SYNTHASE SUBUNIT 9, MITOCHONDRIAL × 10 (P61829) ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 7.5;0.1 M HEPES/HCL PH 7.5, 12% PEG MME 5000, 100 MM SODIUM CHLORIDE MIXED 1:1 WITH PROTEIN SOLUTION CONTAINING 0.64 MM DDM, 25 MM TRIS/HCL PH 8.0, 100 MM SODIUM CHLORIDE, 25 MM TREHALOSE, 0.5 MM EDTA, 0.02% SODIUM AZIDE, 2 MM MAGNESIUM CHLORIDE, 0.66 MM ADP, 0.1 MM DCCD, 2.5 MM DTT, 0.5 MM PMSF | 分辨率 3.43 Å R-free 0.297 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 2WPD | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2HLD Crystal structure of yeast mitochondrial F1-ATPase 提交 2006-07-06 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 5 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.3;277 K;5.5% PEG 6000, 10% glycerol, 4% methanol, 0.05M sodium acetate, 0.5mM nickel sulphate, 0.5mM AMP/PNP, 0.025 mM ADP, 2mM magnesium chloride, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.244 |
| 2HLD Crystal structure of yeast mitochondrial F1-ATPase 提交 2006-07-06 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 J
36–545(510 aa)
链 K
36–545(510 aa)
链 L
36–545(510 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 5 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.3;277 K;5.5% PEG 6000, 10% glycerol, 4% methanol, 0.05M sodium acetate, 0.5mM nickel sulphate, 0.5mM AMP/PNP, 0.025 mM ADP, 2mM magnesium chloride, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.244 |
| 2HLD Crystal structure of yeast mitochondrial F1-ATPase 提交 2006-07-06 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 S
36–545(510 aa)
链 T
36–545(510 aa)
链 U
36–545(510 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 5 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.3;277 K;5.5% PEG 6000, 10% glycerol, 4% methanol, 0.05M sodium acetate, 0.5mM nickel sulphate, 0.5mM AMP/PNP, 0.025 mM ADP, 2mM magnesium chloride, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.244 |
| 2XOK Refined structure of yeast F1c10 ATPase complex to 3 A resolution 提交 2010-08-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 19 PDB 声明:nonadecameric |
链 A
1–545(545 aa)
链 B
1–545(545 aa)
链 C
1–545(545 aa)
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 8;0.1 M TRIS/CL PH8.0, 12% PEG 6000, 150 MM NACL, 1 MM AMP-PNP, 40 MICROM ADP, 1 MM DTT, 0.02% NAN3. MIXED 1:1 WITH PROTEIN SOLUTION UNDER PARAFFIN OIL IN MICROBATCH PLATE.
|
分辨率 3.01 Å R-free 0.253 |
| 3FKS Yeast F1 ATPase in the absence of bound nucleotides 提交 2008-12-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 A
36–545(510 aa)
片段:UNP residues 36-545
链 B
36–545(510 aa)
片段:UNP residues 36-545
链 C
36–545(510 aa)
片段:UNP residues 36-545
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.3;277 K;6.25% PEG 6000, 10% Glycerol, 4% Methanol, 0.05M Sodium acetate, 0.5mM Nickel sulfate, 2 mM Sodium pyrophosphate, 2mM Magnesium chloride, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.0K
|
分辨率 3.59 Å R-free 0.306 |
| 3FKS Yeast F1 ATPase in the absence of bound nucleotides 提交 2008-12-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 J
36–545(510 aa)
片段:UNP residues 36-545
链 K
36–545(510 aa)
片段:UNP residues 36-545
链 L
36–545(510 aa)
片段:UNP residues 36-545
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.3;277 K;6.25% PEG 6000, 10% Glycerol, 4% Methanol, 0.05M Sodium acetate, 0.5mM Nickel sulfate, 2 mM Sodium pyrophosphate, 2mM Magnesium chloride, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.0K
|
分辨率 3.59 Å R-free 0.306 |
| 3FKS Yeast F1 ATPase in the absence of bound nucleotides 提交 2008-12-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 S
36–545(510 aa)
片段:UNP residues 36-545
链 T
36–545(510 aa)
片段:UNP residues 36-545
链 U
36–545(510 aa)
片段:UNP residues 36-545
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.3;277 K;6.25% PEG 6000, 10% Glycerol, 4% Methanol, 0.05M Sodium acetate, 0.5mM Nickel sulfate, 2 mM Sodium pyrophosphate, 2mM Magnesium chloride, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.0K
|
分辨率 3.59 Å R-free 0.306 |
| 3OE7 Structure of four mutant forms of yeast f1 ATPase: gamma-I270T 提交 2010-08-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 A
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
链 B
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
链 C
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.3;277 K;5.5% PEG 6000, 10% GLYCEROL, 4% METHANOL, 0.05M SODIUM ACETATE, 0.5MM NICKEL SULPHATE, 0.5MM AMP/PNP, 0.025 MM ADP, 2MM MAGNESIUM CHLORIDE, PH 7.3, VAPOR DIFFUSION SITTING DROP, TEMPERATURE 277K
|
分辨率 3.19 Å R-free 0.245 |
| 3OE7 Structure of four mutant forms of yeast f1 ATPase: gamma-I270T 提交 2010-08-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 J
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
链 K
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
链 L
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.3;277 K;5.5% PEG 6000, 10% GLYCEROL, 4% METHANOL, 0.05M SODIUM ACETATE, 0.5MM NICKEL SULPHATE, 0.5MM AMP/PNP, 0.025 MM ADP, 2MM MAGNESIUM CHLORIDE, PH 7.3, VAPOR DIFFUSION SITTING DROP, TEMPERATURE 277K
|
分辨率 3.19 Å R-free 0.245 |
| 3OE7 Structure of four mutant forms of yeast f1 ATPase: gamma-I270T 提交 2010-08-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 S
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
链 T
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
链 U
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.3;277 K;5.5% PEG 6000, 10% GLYCEROL, 4% METHANOL, 0.05M SODIUM ACETATE, 0.5MM NICKEL SULPHATE, 0.5MM AMP/PNP, 0.025 MM ADP, 2MM MAGNESIUM CHLORIDE, PH 7.3, VAPOR DIFFUSION SITTING DROP, TEMPERATURE 277K
|
分辨率 3.19 Å R-free 0.245 |
| 3OEE Structure of four mutant forms of yeast F1 ATPase: alpha-F405S 提交 2010-08-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 A
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
链 B
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
链 C
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
|
突变:F405S 突变:F405S 突变:F405S | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.3;277 K;5.5% PEG 6000, 10% GLYCEROL, 4% METHANOL, 0.05M SODIUM ACETATE, 0.5MM NICKEL SULPHATE, 0.5MM AMP/PNP, 0.025 MM ADP, 2MM MAGNESIUM CHLORIDE, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.74 Å R-free 0.259 |
| 3OEE Structure of four mutant forms of yeast F1 ATPase: alpha-F405S 提交 2010-08-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 J
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
链 K
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
链 L
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
|
突变:F405S 突变:F405S 突变:F405S | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.3;277 K;5.5% PEG 6000, 10% GLYCEROL, 4% METHANOL, 0.05M SODIUM ACETATE, 0.5MM NICKEL SULPHATE, 0.5MM AMP/PNP, 0.025 MM ADP, 2MM MAGNESIUM CHLORIDE, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.74 Å R-free 0.259 |
| 3OEE Structure of four mutant forms of yeast F1 ATPase: alpha-F405S 提交 2010-08-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 S
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
链 T
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
链 U
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
|
突变:F405S 突变:F405S 突变:F405S | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.3;277 K;5.5% PEG 6000, 10% GLYCEROL, 4% METHANOL, 0.05M SODIUM ACETATE, 0.5MM NICKEL SULPHATE, 0.5MM AMP/PNP, 0.025 MM ADP, 2MM MAGNESIUM CHLORIDE, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.74 Å R-free 0.259 |
| 3OEH Structure of four mutant forms of yeast F1 ATPase: beta-V279F 提交 2010-08-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 A
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
链 B
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
链 C
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.3;277 K;5.5% PEG 6000, 10% GLYCEROL, 4% METHANOL, 0.05M SODIUM ACETATE, 0.5MM NICKEL SULPHATE, 0.5MM AMP/PNP, 0.025 MM ADP, 2MM MAGNESIUM CHLORIDE, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.270 |
| 3OEH Structure of four mutant forms of yeast F1 ATPase: beta-V279F 提交 2010-08-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 J
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
链 K
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
链 L
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.3;277 K;5.5% PEG 6000, 10% GLYCEROL, 4% METHANOL, 0.05M SODIUM ACETATE, 0.5MM NICKEL SULPHATE, 0.5MM AMP/PNP, 0.025 MM ADP, 2MM MAGNESIUM CHLORIDE, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.270 |
| 3OEH Structure of four mutant forms of yeast F1 ATPase: beta-V279F 提交 2010-08-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 S
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
链 T
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
链 U
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.3;277 K;5.5% PEG 6000, 10% GLYCEROL, 4% METHANOL, 0.05M SODIUM ACETATE, 0.5MM NICKEL SULPHATE, 0.5MM AMP/PNP, 0.025 MM ADP, 2MM MAGNESIUM CHLORIDE, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.270 |
| 3OFN Structure of four mutant forms of yeast F1 ATPase: alpha-N67I 提交 2010-08-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 A
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
链 B
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
链 C
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
|
突变:N67I 突变:N67I 突变:N67I | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.3;277 K;5.5% PEG 6000, 10% GLYCEROL, 4% METHANOL, 0.05M SODIUM ACETATE, 0.5MM NICKEL SULPHATE, 0.5MM AMP/PNP, 0.025 MM ADP, 2MM MAGNESIUM CHLORIDE, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.276 |
| 3OFN Structure of four mutant forms of yeast F1 ATPase: alpha-N67I 提交 2010-08-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 J
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
链 K
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
链 L
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
|
突变:N67I 突变:N67I 突变:N67I | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.3;277 K;5.5% PEG 6000, 10% GLYCEROL, 4% METHANOL, 0.05M SODIUM ACETATE, 0.5MM NICKEL SULPHATE, 0.5MM AMP/PNP, 0.025 MM ADP, 2MM MAGNESIUM CHLORIDE, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.276 |
| 3OFN Structure of four mutant forms of yeast F1 ATPase: alpha-N67I 提交 2010-08-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 S
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
链 T
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
链 U
36–545(510 aa)
片段:UNP RESIDUES 36-545
|
突变:N67I 突变:N67I 突变:N67I | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.3;277 K;5.5% PEG 6000, 10% GLYCEROL, 4% METHANOL, 0.05M SODIUM ACETATE, 0.5MM NICKEL SULPHATE, 0.5MM AMP/PNP, 0.025 MM ADP, 2MM MAGNESIUM CHLORIDE, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.276 |
| 3ZIA The structure of F1-ATPase from Saccharomyces cerevisiae inhibited by its regulatory protein IF1 提交 2013-01-07 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 K
36–545(510 aa)
链 L
36–545(510 aa)
链 M
36–545(510 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 7.5;296 K;ACTIVE F1-ATPASE (12 MG/ML) WAS EXCHANGED ON A DESALTING COLUMN INTO CRYSTALLISATION BUFFER, PREPARED IN D2O CONSISTING OF 100 MM BIS-TRIS PROPANE, PH 7.5, 100 MM SUCROSE, 1 MM ADP AND 10 MM MAGNESIUM SULPHATE. THEN THE ENZYME WAS INHIBITED AT 23C WITH A 4-FOLD MOLAR EXCESS OF YI1-53 (MUTATION E21A) IN THE PRESENCE OF 1 MM ATP AND 2 MM MAGNESIUM SULPHATE. FURTHER PORTIONS (5 UL OF A NEUTRALISED STOCK SOLUTION CONTAINING 200 MM ATP AND 400 MM MAGNESIUM SULPHATE/ML PROTEIN SOLUTION) WERE ADDED AFTER 5 AND 10 MIN. MORE THAN 95% OF THE ATP HYDROLYSIS ACTIVITY OF THE ENZYME WAS INHIBITED. SODIUM-POTASSIUM TARTRATE WAS ADDED TO 100 MM, AND THE CONCENTRATION OF THE PROTEIN SOLUTION WAS ADJUSTED TO 10 MG/ML WITH CRYSTALLISATION BUFFER. CRYSTALS WERE GROWN AT 23C IN 72 WELL MICRO-BATCH PLATES UNDER FILTERED PARAFFIN OIL. THE CRYSTALLISATION DROPS (4 UL) CONTAINED A 1:1 MIXTURE OF PROTEIN SOLUTION AND PRECIPITANT SOLUTION (20%-26% POLYETHYLENE GLYCOL 3000 AND 600 MM NACL PREPARED IN D2O).
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.262 |
| 3ZIA The structure of F1-ATPase from Saccharomyces cerevisiae inhibited by its regulatory protein IF1 提交 2013-01-07 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 7.5;296 K;ACTIVE F1-ATPASE (12 MG/ML) WAS EXCHANGED ON A DESALTING COLUMN INTO CRYSTALLISATION BUFFER, PREPARED IN D2O CONSISTING OF 100 MM BIS-TRIS PROPANE, PH 7.5, 100 MM SUCROSE, 1 MM ADP AND 10 MM MAGNESIUM SULPHATE. THEN THE ENZYME WAS INHIBITED AT 23C WITH A 4-FOLD MOLAR EXCESS OF YI1-53 (MUTATION E21A) IN THE PRESENCE OF 1 MM ATP AND 2 MM MAGNESIUM SULPHATE. FURTHER PORTIONS (5 UL OF A NEUTRALISED STOCK SOLUTION CONTAINING 200 MM ATP AND 400 MM MAGNESIUM SULPHATE/ML PROTEIN SOLUTION) WERE ADDED AFTER 5 AND 10 MIN. MORE THAN 95% OF THE ATP HYDROLYSIS ACTIVITY OF THE ENZYME WAS INHIBITED. SODIUM-POTASSIUM TARTRATE WAS ADDED TO 100 MM, AND THE CONCENTRATION OF THE PROTEIN SOLUTION WAS ADJUSTED TO 10 MG/ML WITH CRYSTALLISATION BUFFER. CRYSTALS WERE GROWN AT 23C IN 72 WELL MICRO-BATCH PLATES UNDER FILTERED PARAFFIN OIL. THE CRYSTALLISATION DROPS (4 UL) CONTAINED A 1:1 MIXTURE OF PROTEIN SOLUTION AND PRECIPITANT SOLUTION (20%-26% POLYETHYLENE GLYCOL 3000 AND 600 MM NACL PREPARED IN D2O).
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.262 |
| 3ZRY Rotor architecture in the F(1)-c(10)-ring complex of the yeast F-ATP synthase 提交 2011-06-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5;10% PEG 4000, 100 MM SODIUM CHLORIDE, 100 MM HEPES PH 6.5 MIXED 1:1 WITH PROTEIN SOLUTION (10 MG/ML) CONTAINING 0.64 MM DDM, 25 MM TRIS PH 8.0, 100 MM SODIUM CHLORIDE, 25 MM TREHALOSE, 0.5 MM EDTA, 3 MM SODIUM AZIDE, 2 MM MAGNESIUM CHLORIDE, 0.04 MM ADP, 1 MM AMP-PNP, 0.1 MM DCCD, 2.5 MM DTT, 0.5 MM PMSF.
|
分辨率 6.50 Å R-free 0.339 |
| 4B2Q Model of the yeast F1Fo-ATP synthase dimer based on subtomogram average 提交 2012-07-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 46 PDB 声明:46-meric |
链 A
61–545(485 aa)
片段:RESIDUES 61-545
链 B
60–545(486 aa)
片段:RESIDUES 60-545
链 C
61–545(485 aa)
片段:RESIDUES 61-545
链 a
61–545(485 aa)
片段:RESIDUES 61-545
链 b
60–545(486 aa)
片段:RESIDUES 60-545
链 c
61–545(485 aa)
片段:RESIDUES 61-545
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
250MM TREHALOSE 10NM TRIS- HCL PH7.4;pH 7.4;250MM TREHALOSE 10NM TRIS- HCL PH7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, TEMPERATURE- 100, INSTRUMENT- HOMEMADE PLUNGER, METHOD- SINGLE SIDE MANUAL BLOTTING FOR 5 SECONDS.,
|
分辨率 37.00 Å |
| 6B8H Mosaic model of yeast mitochondrial ATP synthase monomer 提交 2017-10-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric |
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
链 K
36–545(510 aa)
链 W
36–545(510 aa)
链 X
36–545(510 aa)
链 n
36–545(510 aa)
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 10 MG MAGNESIUM ION × 10 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.60 Å |
| 6CP3 Monomer yeast ATP synthase (F1Fo) reconstituted in nanodisc with inhibitor of oligomycin bound. 提交 2018-03-13 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8;20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 8.0
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6CP6 Monomer yeast ATP synthase (F1Fo) reconstituted in nanodisc. 提交 2018-03-13 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8;20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 8.0
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7TJT Yeast ATP synthase F1 region State 1-3catalytic beta_tight open without exogenous ATP 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7TJU Yeast ATP synthase F1 region State 1-3binding beta_tight open without exogenous ATP 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7TJV Yeast ATP synthase F1 region State 1catalytic(a) with 10 mM ATP 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7TJW Yeast ATP synthase F1 region State 1catalytic(e-h) with 10 mM ATP 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 7TJX Yeast ATP synthase F1 region State 1binding(a-d) with 10 mM ATP 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 7TJY Yeast ATP synthase State 1catalytic(a) without exogenous ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 7TJZ Yeast ATP synthase State 1catalytic(b) without exogenous ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 7TK0 Yeast ATP synthase State 1catalytic(c) without exogenous ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 7TK1 Yeast ATP synthase State 1catalytic(d) without exogenous ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.10 Å |
| 7TK2 Yeast ATP synthase State 1binding(a) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 6.50 Å |
| 7TK3 Yeast ATP synthase State 1binding(b) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 6.30 Å |
| 7TK4 Yeast ATP synthase State 1binding(c) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.00 Å |
| 7TK5 Yeast ATP synthase State 1binding(d) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.80 Å |
| 7TK6 Yeast ATP synthase State 1catalytic(a) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 6.50 Å |
| 7TK7 Yeast ATP synthase State 1catalytic(b) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 6.70 Å |
| 7TK8 Yeast ATP synthase State 1catalytic(c) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.70 Å |
| 7TK9 Yeast ATP synthase State 1catalytic(d) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 6.00 Å |
| 7TKA Yeast ATP synthase State 1catalytic(e) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.10 Å |
| 7TKB Yeast ATP synthase State 1catalytic(f) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 6.30 Å |
| 7TKC Yeast ATP synthase State 1catalytic(g) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 5.80 Å |
| 7TKD Yeast ATP synthase State 1catalytic(h) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.70 Å |
| 7TKE Yeast ATP synthase State 2binding(a) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.10 Å |
| 7TKF Yeast ATP synthase State 2binding(b) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.10 Å |
| 7TKG Yeast ATP synthase State 2catalytic(a) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 7TKH Yeast ATP synthase State 2catalytic(b) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 7TKI Yeast ATP synthase State 2catalytic(c) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.10 Å |
| 7TKJ Yeast ATP synthase State 2catalytic(d) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.50 Å |
| 7TKK Yeast ATP synthase State 2catalytic(e) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.30 Å |
| 7TKL Yeast ATP synthase State 3binding(a) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 6.40 Å |
| 7TKM Yeast ATP synthase State 3binding(b) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 7TKN Yeast ATP synthase State 3binding(c) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.10 Å |
| 7TKO Yeast ATP synthase State 3catalytic(a) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 7TKP Yeast ATP synthase State 3catalytic(b) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.60 Å |
| 7TKQ Yeast ATP synthase State 3catalytic(c) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 7TKR Yeast ATP synthase State 3catalytic(d) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 6.50 Å |
| 7TKS Yeast ATP synthase State 3catalytic(e) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
36–545(510 aa)
链 B
36–545(510 aa)
链 C
36–545(510 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.50 Å |
| 8F29 Yeast ATP synthase in conformation-1 at pH 6 提交 2022-11-07 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
39–545(507 aa)
链 B
39–545(507 aa)
链 C
39–545(507 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 8F39 Yeast ATP synthase in conformation-2, at pH 6 提交 2022-11-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
39–545(507 aa)
链 B
39–545(507 aa)
链 C
39–545(507 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | ATPA_YEAST |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–510; UniProt 36–545 作者链 B; PDB构建体 1–510; UniProt 36–545 作者链 C; PDB构建体 1–510; UniProt 36–545 |