2xok

Refined structure of yeast F1c10 ATPase complex to 3 A resolution

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 194.8 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL

物种未注明

UniProt P07251

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 19 PDB 声明:nonadecameric(19) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–545 链 B; UniProt 1–545 链 C; UniProt 1–545 未记录 ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 3 (P00830) ATP SYNTHASE SUBUNIT GAMMA, MITOCHONDRIAL × 1 (P38077) ATP SYNTHASE × 1 (Q12165) ATP SYNTHASE CATALYTIC SECTOR F1 EPSILON SUBUNIT × 1 (Q2XN67) ATP SYNTHASE SUBUNIT 9, MITOCHONDRIAL × 10 (P61829) ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:MICROBATCH;pH 8;0.1 M TRIS/CL PH8.0, 12% PEG 6000, 150 MM NACL, 1 MM AMP-PNP, 40 MICROM ADP, 1 MM DTT, 0.02% NAN3. MIXED 1:1 WITH PROTEIN SOLUTION UNDER PARAFFIN OIL IN MICROBATCH PLATE. 分辨率 3.01 Å R-free 0.253

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 51 个其他 PDB 条目、64 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATPA_YEAST
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–545; UniProt 1–545 作者链 B; PDB构建体 1–545; UniProt 1–545 作者链 C; PDB构建体 1–545; UniProt 1–545

ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL

物种未注明

UniProt P00830

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 19 PDB 声明:nonadecameric(19) 与蛋白拷贝数一致 链 D; UniProt 1–507 链 E; UniProt 1–507 链 F; UniProt 1–507 未记录 ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL × 3 (P07251) ATP SYNTHASE SUBUNIT GAMMA, MITOCHONDRIAL × 1 (P38077) ATP SYNTHASE × 1 (Q12165) ATP SYNTHASE CATALYTIC SECTOR F1 EPSILON SUBUNIT × 1 (Q2XN67) ATP SYNTHASE SUBUNIT 9, MITOCHONDRIAL × 10 (P61829) ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:MICROBATCH;pH 8;0.1 M TRIS/CL PH8.0, 12% PEG 6000, 150 MM NACL, 1 MM AMP-PNP, 40 MICROM ADP, 1 MM DTT, 0.02% NAN3. MIXED 1:1 WITH PROTEIN SOLUTION UNDER PARAFFIN OIL IN MICROBATCH PLATE. 分辨率 3.01 Å R-free 0.253

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 51 个其他 PDB 条目、64 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 ATPB_YEAST
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–507; UniProt 1–507 作者链 E; PDB构建体 1–507; UniProt 1–507 作者链 F; PDB构建体 1–507; UniProt 1–507

ATP SYNTHASE SUBUNIT GAMMA, MITOCHONDRIAL

物种未注明

UniProt P38077

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 19 PDB 声明:nonadecameric(19) 与蛋白拷贝数一致 链 G; UniProt 1–311 未记录 ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL × 3 (P07251) ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 3 (P00830) ATP SYNTHASE × 1 (Q12165) ATP SYNTHASE CATALYTIC SECTOR F1 EPSILON SUBUNIT × 1 (Q2XN67) ATP SYNTHASE SUBUNIT 9, MITOCHONDRIAL × 10 (P61829) ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:MICROBATCH;pH 8;0.1 M TRIS/CL PH8.0, 12% PEG 6000, 150 MM NACL, 1 MM AMP-PNP, 40 MICROM ADP, 1 MM DTT, 0.02% NAN3. MIXED 1:1 WITH PROTEIN SOLUTION UNDER PARAFFIN OIL IN MICROBATCH PLATE. 分辨率 3.01 Å R-free 0.253

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 52 个其他 PDB 条目、65 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATPG_YEAST
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–311; UniProt 1–311

ATP SYNTHASE

物种未注明

UniProt Q12165

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 19 PDB 声明:nonadecameric(19) 与蛋白拷贝数一致 链 H; UniProt 1–160 未记录 ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL × 3 (P07251) ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 3 (P00830) ATP SYNTHASE SUBUNIT GAMMA, MITOCHONDRIAL × 1 (P38077) ATP SYNTHASE CATALYTIC SECTOR F1 EPSILON SUBUNIT × 1 (Q2XN67) ATP SYNTHASE SUBUNIT 9, MITOCHONDRIAL × 10 (P61829) ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:MICROBATCH;pH 8;0.1 M TRIS/CL PH8.0, 12% PEG 6000, 150 MM NACL, 1 MM AMP-PNP, 40 MICROM ADP, 1 MM DTT, 0.02% NAN3. MIXED 1:1 WITH PROTEIN SOLUTION UNDER PARAFFIN OIL IN MICROBATCH PLATE. 分辨率 3.01 Å R-free 0.253

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 48 个其他 PDB 条目、60 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 ATPD_YEAST
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–160; UniProt 1–160

ATP SYNTHASE CATALYTIC SECTOR F1 EPSILON SUBUNIT

物种未注明

UniProt Q2XN67

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 19 PDB 声明:nonadecameric(19) 与蛋白拷贝数一致 链 I; UniProt 2–62 片段:RESIDUES 2-62 ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL × 3 (P07251) ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 3 (P00830) ATP SYNTHASE SUBUNIT GAMMA, MITOCHONDRIAL × 1 (P38077) ATP SYNTHASE × 1 (Q12165) ATP SYNTHASE SUBUNIT 9, MITOCHONDRIAL × 10 (P61829) ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:MICROBATCH;pH 8;0.1 M TRIS/CL PH8.0, 12% PEG 6000, 150 MM NACL, 1 MM AMP-PNP, 40 MICROM ADP, 1 MM DTT, 0.02% NAN3. MIXED 1:1 WITH PROTEIN SOLUTION UNDER PARAFFIN OIL IN MICROBATCH PLATE. 分辨率 3.01 Å R-free 0.253

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

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UniProt名称 Q2XN67_YEAST
Isoform
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–61; UniProt 2–62

ATP SYNTHASE SUBUNIT 9, MITOCHONDRIAL

物种未注明

UniProt P61829

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 19 PDB 声明:nonadecameric(19) 与蛋白拷贝数一致 链 K; UniProt 1–76 链 L; UniProt 1–76 链 M; UniProt 1–76 链 N; UniProt 1–76 链 O; UniProt 1–76 链 P; UniProt 1–76 链 Q; UniProt 1–76 链 R; UniProt 1–76 链 S; UniProt 1–76 链 T; UniProt 1–76 未记录 ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL × 3 (P07251) ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 3 (P00830) ATP SYNTHASE SUBUNIT GAMMA, MITOCHONDRIAL × 1 (P38077) ATP SYNTHASE × 1 (Q12165) ATP SYNTHASE CATALYTIC SECTOR F1 EPSILON SUBUNIT × 1 (Q2XN67) ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:MICROBATCH;pH 8;0.1 M TRIS/CL PH8.0, 12% PEG 6000, 150 MM NACL, 1 MM AMP-PNP, 40 MICROM ADP, 1 MM DTT, 0.02% NAN3. MIXED 1:1 WITH PROTEIN SOLUTION UNDER PARAFFIN OIL IN MICROBATCH PLATE. 分辨率 3.01 Å R-free 0.253

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 48 个其他 PDB 条目、53 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATP9_YEAST
Isoform
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 L; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 M; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 N; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 O; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 P; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 Q; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 R; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 S; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 T; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 2xok

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 2xok
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2xok
沉积日期 deposition_date2010-08-18
结构标题 titleRefined structure of yeast F1c10 ATPase complex to 3 A resolution
关键词 keywordsHYDROLASE, ATP-BINDING, F(O), F(1), ATP SYNTHASE, MITOCHONDRIA, INNER MEMBRANE, TRANSMEMBRANE; HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier56.67
回转半径 Rg (电子) rg_electron58.75
零角强度 I(0) i02453550000.00
分子量 molecular_weight427790.0 kDa
排除体积 excluded_volume541430 ų
包络体积 envelope_volume731510 ų
水化壳体积 shell_volume109530 ų
包络直径 envelope_diameter210.0
壳层 Rg shell_rg57.50
包络 Rg envelope_rg58.12
形状 Rg shape_rg58.67
总 Rg total_rg59.01
总原子数 total_atoms30113
残基数 n_residues4032
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax194.8
Rg (实空间) rg_real57.26
Rg 误差 (实空间) rg_real_error2.20
I(0) (实空间) i0_real2.4540e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error5.1870e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal56.17
I(0) (倒空间) i0_reciprocal2450000000.0000
解质量估计 total_estimate0.7709
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary55.6
偏度 Skewness skewness0.700
峰度 Kurtosis kurtosis-0.008
角度范围 angular_range— – 0.1400 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha444100000.0000
实空间数据点数 n_real_points29
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.599; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.966; Smooth: 0.257

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 45 domains

SCOP 2.08 (13 domains)

结构域编号 domain_idd2xokd1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.49 — Domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase-like
超家族 Superfamily superfamilyb.49.1 — N-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family familyb.49.1.1 — N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase
结构域编号 domain_idd2xokd2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamilyc.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family familyc.37.1.11 — RecA protein-like (ATPase-domain)
结构域编号 domain_idd2xokd3
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.69 — Left-handed superhelix
超家族 Superfamily superfamilya.69.1 — C-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family familya.69.1.1 — C-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase
结构域编号 domain_idd2xoke1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.49 — Domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase-like
超家族 Superfamily superfamilyb.49.1 — N-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family familyb.49.1.1 — N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase
结构域编号 domain_idd2xoke2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamilyc.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family familyc.37.1.11 — RecA protein-like (ATPase-domain)
结构域编号 domain_idd2xoke3
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.69 — Left-handed superhelix
超家族 Superfamily superfamilya.69.1 — C-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family familya.69.1.1 — C-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase
结构域编号 domain_idd2xokf1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.49 — Domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase-like
超家族 Superfamily superfamilyb.49.1 — N-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family familyb.49.1.1 — N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase
结构域编号 domain_idd2xokf2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamilyc.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family familyc.37.1.11 — RecA protein-like (ATPase-domain)
结构域编号 domain_idd2xokf3
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.69 — Left-handed superhelix
超家族 Superfamily superfamilya.69.1 — C-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family familya.69.1.1 — C-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase
结构域编号 domain_idd2xokg_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.49 — Pyruvate kinase C-terminal domain-like
超家族 Superfamily superfamilyc.49.2 — ATP synthase (F1-ATPase), gamma subunit
家族 Family familyc.49.2.1 — ATP synthase (F1-ATPase), gamma subunit
结构域编号 domain_idd2xokh1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.93 — Epsilon subunit of F1F0-ATP synthase N-terminal domain
超家族 Superfamily superfamilyb.93.1 — Epsilon subunit of F1F0-ATP synthase N-terminal domain
家族 Family familyb.93.1.1 — Epsilon subunit of F1F0-ATP synthase N-terminal domain
结构域编号 domain_idd2xokh2
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.2 — Long alpha-hairpin
超家族 Superfamily superfamilya.2.10 — Epsilon subunit of F1F0-ATP synthase C-terminal domain
家族 Family familya.2.10.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd2xoki_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.137 — Non-globular all-alpha subunits of globular proteins
超家族 Superfamily superfamilya.137.8 — Epsilon subunit of mitochondrial F1F0-ATP synthase
家族 Family familya.137.8.1 — Epsilon subunit of mitochondrial F1F0-ATP synthase

CATH v4.4 (32 domains)

结构域编号 domain_id2xokA01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20
结构域编号 domain_id2xokA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id2xokA03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology150 — Lysin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — ATP synthase alpha/beta chain, C-terminal domain
结构域编号 domain_id2xokB01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20
结构域编号 domain_id2xokB02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id2xokB03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology150 — Lysin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — ATP synthase alpha/beta chain, C-terminal domain
结构域编号 domain_id2xokC01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20
结构域编号 domain_id2xokC02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id2xokC03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology150 — Lysin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — ATP synthase alpha/beta chain, C-terminal domain
结构域编号 domain_id2xokD01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170
结构域编号 domain_id2xokD02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id2xokD03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1140 — Bovine Mitochondrial F1-ATPase, ATP Synthase Beta Chain; Chain D, domain3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Bovine Mitochondrial F1-atpase; Atp Synthase Beta Chain; Chain D, domain 3
结构域编号 domain_id2xokE01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170
结构域编号 domain_id2xokE02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id2xokE03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1140 — Bovine Mitochondrial F1-ATPase, ATP Synthase Beta Chain; Chain D, domain3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Bovine Mitochondrial F1-atpase; Atp Synthase Beta Chain; Chain D, domain 3
结构域编号 domain_id2xokF01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170
结构域编号 domain_id2xokF02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id2xokF03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1140 — Bovine Mitochondrial F1-ATPase, ATP Synthase Beta Chain; Chain D, domain3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Bovine Mitochondrial F1-atpase; Atp Synthase Beta Chain; Chain D, domain 3
结构域编号 domain_id2xokG01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily80 — ATP synthase, gamma subunit, helix hairpin domain
结构域编号 domain_id2xokG02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology1380 — Pyruvate Kinase; Chain: A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ATP synthase, F1 complex, gamma subunit
结构域编号 domain_id2xokH01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology15 — ATP Synthase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F0F1 ATP synthase delta/epsilon subunit, N-terminal
结构域编号 domain_id2xokI00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1620 — Atp Synthase Epsilon Chain; Chain: I;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — ATP synthase, F1 complex, epsilon subunit superfamily, mitochondrial
结构域编号 domain_id2xokK00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id2xokL00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id2xokM00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id2xokN00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id2xokO00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id2xokP00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id2xokQ00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id2xokR00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id2xokS00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id2xokT00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)