2xok

Refined structure of yeast F1c10 ATPase complex to 3 A resolution

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 19	ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 3 （P00830） ATP SYNTHASE SUBUNIT GAMMA, MITOCHONDRIAL × 1 （P38077） ATP SYNTHASE × 1 （Q12165） ATP SYNTHASE CATALYTIC SECTOR F1 EPSILON SUBUNIT × 1 （Q2XN67） ATP SYNTHASE SUBUNIT 9, MITOCHONDRIAL × 10 （P61829） PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MAGNESIUM ION × 5	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ATPA_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–545； UniProt 1–545 作者链 B； PDB构建体 1–545； UniProt 1–545 作者链 C； PDB构建体 1–545； UniProt 1–545

ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL

物种未注明

UniProt P00830

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 19	ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL × 3 （P07251） ATP SYNTHASE SUBUNIT GAMMA, MITOCHONDRIAL × 1 （P38077） ATP SYNTHASE × 1 （Q12165） ATP SYNTHASE CATALYTIC SECTOR F1 EPSILON SUBUNIT × 1 （Q2XN67） ATP SYNTHASE SUBUNIT 9, MITOCHONDRIAL × 10 （P61829） PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MAGNESIUM ION × 5	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ATPB_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–507； UniProt 1–507 作者链 E； PDB构建体 1–507； UniProt 1–507 作者链 F； PDB构建体 1–507； UniProt 1–507

ATP SYNTHASE SUBUNIT GAMMA, MITOCHONDRIAL

物种未注明

UniProt P38077

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 19	ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL × 3 （P07251） ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 3 （P00830） ATP SYNTHASE × 1 （Q12165） ATP SYNTHASE CATALYTIC SECTOR F1 EPSILON SUBUNIT × 1 （Q2XN67） ATP SYNTHASE SUBUNIT 9, MITOCHONDRIAL × 10 （P61829） PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MAGNESIUM ION × 5	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ATPG_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–311； UniProt 1–311

ATP SYNTHASE

物种未注明

UniProt Q12165

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 19	ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL × 3 （P07251） ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 3 （P00830） ATP SYNTHASE SUBUNIT GAMMA, MITOCHONDRIAL × 1 （P38077） ATP SYNTHASE CATALYTIC SECTOR F1 EPSILON SUBUNIT × 1 （Q2XN67） ATP SYNTHASE SUBUNIT 9, MITOCHONDRIAL × 10 （P61829） PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MAGNESIUM ION × 5	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ATPD_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–160； UniProt 1–160

ATP SYNTHASE CATALYTIC SECTOR F1 EPSILON SUBUNIT

物种未注明

UniProt Q2XN67

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 19	ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL × 3 （P07251） ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 3 （P00830） ATP SYNTHASE SUBUNIT GAMMA, MITOCHONDRIAL × 1 （P38077） ATP SYNTHASE × 1 （Q12165） ATP SYNTHASE SUBUNIT 9, MITOCHONDRIAL × 10 （P61829） PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MAGNESIUM ION × 5	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q2XN67_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–61； UniProt 2–62

ATP SYNTHASE SUBUNIT 9, MITOCHONDRIAL

物种未注明

UniProt P61829

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 19	ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL × 3 （P07251） ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 3 （P00830） ATP SYNTHASE SUBUNIT GAMMA, MITOCHONDRIAL × 1 （P38077） ATP SYNTHASE × 1 （Q12165） ATP SYNTHASE CATALYTIC SECTOR F1 EPSILON SUBUNIT × 1 （Q2XN67） PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MAGNESIUM ION × 5	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ATP9_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–76； UniProt 1–76 作者链 L； PDB构建体 1–76； UniProt 1–76 作者链 M； PDB构建体 1–76； UniProt 1–76 作者链 N； PDB构建体 1–76； UniProt 1–76 作者链 O； PDB构建体 1–76； UniProt 1–76 作者链 P； PDB构建体 1–76； UniProt 1–76 作者链 Q； PDB构建体 1–76； UniProt 1–76 作者链 R； PDB构建体 1–76； UniProt 1–76 作者链 S； PDB构建体 1–76； UniProt 1–76 作者链 T； PDB构建体 1–76； UniProt 1–76

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2xok
沉积日期 deposition_date	2010-08-18
结构标题 title	Refined structure of yeast F1c10 ATPase complex to 3 A resolution
关键词 keywords	HYDROLASE, ATP-BINDING, F(O), F(1), ATP SYNTHASE, MITOCHONDRIA, INNER MEMBRANE, TRANSMEMBRANE; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2xok__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2xok__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2xok__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	56.67 Å
Rg（电子密度）	58.75 Å
总 Rg	59.01 Å
原子数	30113
残基数	4032
排除体积	541430 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2xok__assembly_1__model_1`	nonadecameric （19）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL
分子量 formula_weight	58677.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	30113

MLARTAAIRSLSRTLINSTKAARPAAAALASTRRLASTKAQPTEVSSILEERIKGVSDEANLNETGRVLAVGDGIARVFGLNNIQAEELVEFSSGVKGMALNLEPGQVGIVLFGSDRLVKEGELVKRTGNIVDVPVGPGLLGRVVDALGNPIDGKGPIDAAGRSRAQVKAPGILPRRSVHEPVQTGLKAVDALVPIGRGQRELIIGDRQTGKTAVALDTILNQKRWNNGSDESKKLYCVYVAVGQKRSTVAQLVQTLEQHDAMKYSIIVAATASEAAPLQYLAPFTAASIGEWFRDNGKHALIVYDDLSKQAVAYRQLSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKLSEKEGSGSLTALPVIETQGGDVSAYIPTNVISITDGQIFLEAELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQVKALKQVAGSLKLFLAQYREVAAFAQFGSDLDASTKQTLVRGERLTQLLKQNQYSPLATEEQVPLIYAGVNGHLDGIELSRIGEFESSFLSYLKSNHNELLTEIREKGELSKELLASLKSATESFVATF

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL
分子量 formula_weight	54854.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.1.34
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,E,F

MVLPRLYTATSRAAFKAAKQSAPLLSTSWKRCMASAAQSTPITGKVTAVIGAIVDVHFEQSELPAILNALEIKTPQGKLVLEVAQHLGENTVRTIAMDGTEGLVRGEKVLDTGGPISVPVGRETLGRIINVIGEPIDERGPIKSKLRKPIHADPPSFAEQSTSAEILETGIKVVDLLAPYARGGKIGLFGGAGVGKTVFIQELINNIAKAHGGFSVFTGVGERTREGNDLYREMKETGVINLEGESKVALVFGQMNEPPGARARVALTGLTIAEYFRDEEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGLLQERITTTKKGSVTSVQAVYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRGISELGIYPAVDPLDSKSRLLDAAVVGQEHYDVASKVQETLQTYKSLQDIIAILGMDELSEQDKLTVERARKIQRFLSQPFAVAEVFTGIPGKLVRLKDTVASFKAVLEGKYDNIPEHAFYMVGGIEDVVAKAEKLAAEAN

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	ATP SYNTHASE SUBUNIT GAMMA, MITOCHONDRIAL
分子量 formula_weight	34396.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MLSRIVSNNATRSVMCHQAQVGILYKTNPVRTYATLKEVEMRLKSIKNIEKITKTMKIVASTRLSKAEKAKISAKKMDEAEQLFYKNAETKNLDVEATETGAPKELIVAITSDKGLCGSIHSQLAKAVRRHLNDQPNADIVTIGDKIKMQLLRTHPNNIKLSINGIGKDAPTFQESALIADKLLSVMKAGTYPKISIFYNDPVSSLSFEPSEKPIFNAKTIEQSPSFGKFEIDTDANVPRDLFEYTLANQMLTAMAQGYAAEISARRNAMDNASKNAGDMINRYSILYNRTRQAVITNELVDIITGASSLG

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	ATP SYNTHASE
分子量 formula_weight	17037.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MLRSIIGKSASRSLNFVAKRSYAEAAAASSGLKLQFALPHETLYSGSEVTQVNLPAKSGRIGVLANHVPTVEQLLPGVVEVMEGSNSKKFFISGGFATVQPDSQLCVTAIEAFPLESFSQENIKNLLAEAKKNVSSSDAREAAEAAIQVEVLENLQSVLK

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	ATP SYNTHASE CATALYTIC SECTOR F1 EPSILON SUBUNIT
分子量 formula_weight	6642.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

SAWRKAGMSYAAYLNVAAQAIRSSLKTELQTASVTNRSQTDAFYTQYKNGTAASEPTPMTK

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	ATP SYNTHASE SUBUNIT 9, MITOCHONDRIAL
分子量 formula_weight	7762.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	10

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T

MQLVLAAKYIGAGISTIGLLGAGIGIAIVFAALINGVSRNPSIKDTVFPMAILGFALSEATGLFCLMVSFLLLFGV

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER
分子量 formula_weight	506.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 45 domains

SCOP 2.08 (13 domains)

结构域编号 domain_id	d2xokd1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.49 — Domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	b.49.1 — N-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	b.49.1.1 — N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase

结构域编号 domain_id	d2xokd2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.11 — RecA protein-like (ATPase-domain)

结构域编号 domain_id	d2xokd3
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.69 — Left-handed superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.69.1 — C-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	a.69.1.1 — C-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase

结构域编号 domain_id	d2xoke1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.49 — Domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	b.49.1 — N-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	b.49.1.1 — N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase

结构域编号 domain_id	d2xoke2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.11 — RecA protein-like (ATPase-domain)

结构域编号 domain_id	d2xoke3
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.69 — Left-handed superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.69.1 — C-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	a.69.1.1 — C-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase

结构域编号 domain_id	d2xokf1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.49 — Domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	b.49.1 — N-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	b.49.1.1 — N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase

结构域编号 domain_id	d2xokf2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.11 — RecA protein-like (ATPase-domain)

结构域编号 domain_id	d2xokf3
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.69 — Left-handed superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.69.1 — C-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	a.69.1.1 — C-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase

结构域编号 domain_id	d2xokg_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.49 — Pyruvate kinase C-terminal domain-like
超家族 Superfamily superfamily	c.49.2 — ATP synthase (F1-ATPase), gamma subunit
家族 Family family	c.49.2.1 — ATP synthase (F1-ATPase), gamma subunit

结构域编号 domain_id	d2xokh1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.93 — Epsilon subunit of F1F0-ATP synthase N-terminal domain
超家族 Superfamily superfamily	b.93.1 — Epsilon subunit of F1F0-ATP synthase N-terminal domain
家族 Family family	b.93.1.1 — Epsilon subunit of F1F0-ATP synthase N-terminal domain

结构域编号 domain_id	d2xokh2
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.2 — Long alpha-hairpin
超家族 Superfamily superfamily	a.2.10 — Epsilon subunit of F1F0-ATP synthase C-terminal domain
家族 Family family	a.2.10.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2xoki_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.137 — Non-globular all-alpha subunits of globular proteins
超家族 Superfamily superfamily	a.137.8 — Epsilon subunit of mitochondrial F1F0-ATP synthase
家族 Family family	a.137.8.1 — Epsilon subunit of mitochondrial F1F0-ATP synthase

CATH v4.4 (32 domains)

结构域编号 domain_id	2xokA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	2xokA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	2xokA03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	150 — Lysin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — ATP synthase alpha/beta chain, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	2xokB01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	2xokB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	2xokB03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	150 — Lysin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — ATP synthase alpha/beta chain, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	2xokC01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	2xokC02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	2xokC03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	150 — Lysin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — ATP synthase alpha/beta chain, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	2xokD01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	2xokD02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	2xokD03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1140 — Bovine Mitochondrial F1-ATPase, ATP Synthase Beta Chain; Chain D, domain3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Bovine Mitochondrial F1-atpase; Atp Synthase Beta Chain; Chain D, domain 3

结构域编号 domain_id	2xokE01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	2xokE02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	2xokE03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1140 — Bovine Mitochondrial F1-ATPase, ATP Synthase Beta Chain; Chain D, domain3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Bovine Mitochondrial F1-atpase; Atp Synthase Beta Chain; Chain D, domain 3

结构域编号 domain_id	2xokF01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	2xokF02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	2xokF03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1140 — Bovine Mitochondrial F1-ATPase, ATP Synthase Beta Chain; Chain D, domain3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Bovine Mitochondrial F1-atpase; Atp Synthase Beta Chain; Chain D, domain 3

结构域编号 domain_id	2xokG01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 — ATP synthase, gamma subunit, helix hairpin domain

结构域编号 domain_id	2xokG02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1380 — Pyruvate Kinase; Chain: A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATP synthase, F1 complex, gamma subunit

结构域编号 domain_id	2xokH01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	15 — ATP Synthase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F0F1 ATP synthase delta/epsilon subunit, N-terminal

结构域编号 domain_id	2xokI00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1620 — Atp Synthase Epsilon Chain; Chain: I;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — ATP synthase, F1 complex, epsilon subunit superfamily, mitochondrial

结构域编号 domain_id	2xokK00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	2xokL00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	2xokM00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	2xokN00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	2xokO00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	2xokP00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	2xokQ00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	2xokR00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	2xokS00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	2xokT00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

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晶胞边长 a length_a	135.352 Å
晶胞边长 b length_b	173.711 Å
晶胞边长 c length_c	137.889 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	91.77 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	20

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.010 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	0.2107
R_work r_work	0.2095
R_free r_free	0.2534

Refined structure of yeast F1c10 ATPase complex to 3 A resolution

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP SYNTHASE SUBUNIT GAMMA, MITOCHONDRIAL

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP SYNTHASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP SYNTHASE CATALYTIC SECTOR F1 EPSILON SUBUNIT

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP SYNTHASE SUBUNIT 9, MITOCHONDRIAL

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2xok__assembly_1__model_1

2xok__assembly_1__model_1 | I(q)

2xok__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 45 domains

SCOP 2.08 (13 domains)

CATH v4.4 (32 domains)

7. 引用文献 (1)