2zp9

The Nature of the TRAP:Anti-TRAP complex

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transcription attenuation protein mtrB

Bacillus stearothermophilus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 30	Tryptophan RNA-binding attenuator protein-inhibitory protein × 18 （O31466） TRYPTOPHAN × 12 ZINC ION × 6	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 30	Tryptophan RNA-binding attenuator protein-inhibitory protein × 18 （O31466） TRYPTOPHAN × 12 ZINC ION × 18	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MTRB_BACST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 B； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 F； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 G； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 K； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 L； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74

Tryptophan RNA-binding attenuator protein-inhibitory protein

Bacillus subtilis

UniProt O31466

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 30	Transcription attenuation protein mtrB × 12 （Q9X6J6） TRYPTOPHAN × 12 ZINC ION × 6	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 30	Transcription attenuation protein mtrB × 12 （Q9X6J6） TRYPTOPHAN × 12 ZINC ION × 18	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RTPA_BACSU
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–53； UniProt 1–53 作者链 D； PDB构建体 1–53； UniProt 1–53 作者链 E； PDB构建体 1–53； UniProt 1–53 作者链 H； PDB构建体 1–53； UniProt 1–53 作者链 I； PDB构建体 1–53； UniProt 1–53 作者链 J； PDB构建体 1–53； UniProt 1–53 作者链 M； PDB构建体 1–53； UniProt 1–53 作者链 N； PDB构建体 1–53； UniProt 1–53 作者链 O； PDB构建体 1–53； UniProt 1–53

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2zp9
沉积日期 deposition_date	2008-07-08
结构标题 title	The Nature of the TRAP:Anti-TRAP complex
关键词 keywords	PROTEIN-PROTEIN COMPLEX, TRANSCRIPTION, RNA-binding, Transcription regulation, RNA BINDING PROTEIN-TRANSCRIPTION COMPLEX; RNA BINDING PROTEIN/TRANSCRIPTION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2zp9__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2zp9__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2zp9__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	41.42 Å
Rg（电子密度）	40.97 Å
总 Rg	41.89 Å
原子数	11031
残基数	1422
排除体积	197980 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2zp9__assembly_1__model_1`	30-meric （30）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2zp9__assembly_2__model_1`	30-meric （30）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Transcription attenuation protein mtrB
分子量 formula_weight	8754.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,F,G,K,L
原子数 atom_count	5728

MYTNSDFVVIKALEDGVNVIGLTRGADTRFHHSEKLDKGEVLIAQFTEHTSAIKVRGKAYIQTRHGVIESEGKKAAAAAAA

来源 Source

来源生物 organism	Bacillus stearothermophilus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1422
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Tryptophan RNA-binding attenuator protein-inhibitory protein
分子量 formula_weight	5655.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	9

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D,E,H,I,J,M,N,O

MVIATDDLEVACPKCERAGEIEGTPCPACSGKGVILTAQGYTLLDFIQKHLNK

来源 Source

来源生物 organism	Bacillus subtilis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1423
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	TRYPTOPHAN
分子量 formula_weight	204.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 13 domains

CATH v4.4 (13 domains)

结构域编号 domain_id	2zp9A00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — TRAP-like

结构域编号 domain_id	2zp9B00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — TRAP-like

结构域编号 domain_id	2zp9C00
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	20 — Other non-globular
拓扑 Topology topology	20 — Chaperone, DNAj Protein; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	2zp9D00
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	20 — Other non-globular
拓扑 Topology topology	20 — Chaperone, DNAj Protein; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	2zp9E00
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	20 — Other non-globular
拓扑 Topology topology	20 — Chaperone, DNAj Protein; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	2zp9F00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — TRAP-like

结构域编号 domain_id	2zp9G00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — TRAP-like

结构域编号 domain_id	2zp9H00
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	20 — Other non-globular
拓扑 Topology topology	240 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 —

结构域编号 domain_id	2zp9J00
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	20 — Other non-globular
拓扑 Topology topology	20 — Chaperone, DNAj Protein; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	2zp9K00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — TRAP-like

结构域编号 domain_id	2zp9L00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — TRAP-like

结构域编号 domain_id	2zp9M00
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	20 — Other non-globular
拓扑 Topology topology	20 — Chaperone, DNAj Protein; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	2zp9O00
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	20 — Other non-globular
拓扑 Topology topology	20 — Chaperone, DNAj Protein; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

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晶胞边长 a length_a	197.134 Å
晶胞边长 b length_b	197.135 Å
晶胞边长 c length_c	56.658 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	54

空间群 space_group	P 6
空间群编号 int_tables_number	168
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.200 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	0.3046
R_work r_work	0.3035
R_free r_free	0.3248

The Nature of the TRAP:Anti-TRAP complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transcription attenuation protein mtrB

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Tryptophan RNA-binding attenuator protein-inhibitory protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2zp9__assembly_1__model_1

2zp9__assembly_1__model_1 | I(q)

2zp9__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 13 domains

CATH v4.4 (13 domains)

7. 引用文献 (1)

The Nature of the TRAP:Anti-TRAP complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transcription attenuation protein mtrB

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Tryptophan RNA-binding attenuator protein-inhibitory protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2zp9__assembly_1__model_1

2zp9__assembly_1__model_1 | I(q)

2zp9__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 13 domains

CATH v4.4 (13 domains)

7. 引用文献 (1)