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4v4f

The structure of the trp RNA-binding attenuation protein (TRAP) bound to a RNA molecule containing UAGAU repeats

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TRANSCRIPTION ATTENUATION PROTEIN MTRB

BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS

UniProt Q9X6J6

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 同源多聚体 蛋白 11 RNA 11 5'-R(*UP*AP*GP*AP*UP)-3' × 11 TRYPTOPHAN × 11 water × 22 与全部聚合物一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 11 TRYPTOPHAN × 11 water × 11 与蛋白数一致
3 蛋白–RNA 同源多聚体 蛋白 11 RNA 11 5'-R(*UP*AP*GP*AP*UP)-3' × 11 TRYPTOPHAN × 11 water × 22 与全部聚合物一致
4 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 11 TRYPTOPHAN × 11 water × 11 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体
1c9s 1gtf 1gtn 1qaw 1utd 2exs 2ext 2zcz 2zcz 2zd0 3aqd 3aqd

共 31 个 assembly，这里只显示前 12 个

异源或核酸复合物
1c9s 1gtf 1gtn 1utd 2zp8 2zp9 2zp9 4v4f 4v4f 5eeu 5eev 5eew

共 19 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MTRB_BACST
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 AA； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 AB； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 AC； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 AD； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 AE； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 AF； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 AG； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 AH； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 AI； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 AJ； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 AK； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 AL； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 AM； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 AN； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 AO； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 AP； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 AQ； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 AR； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 AS； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 AT； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 AU； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 AV； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 BA； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 BB； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 BC； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 BD； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 BE； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 BF； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 BG； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 BH； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 BI； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 BJ； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 BK； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 BL； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 BM； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 BN； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 BO； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 BP； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 BQ； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 BR； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 BS； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 BT； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 BU； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 BV； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4v4f
沉积日期 deposition_date2003-12-08
结构标题 titleThe structure of the trp RNA-binding attenuation protein (TRAP) bound to a RNA molecule containing UAGAU repeats
关键词 keywordsRNA BINDING PROTEIN, TRANSCRIPTION ATTENUATION, RNA-BINDING PROTEIN, TRP RNA; RNA BINDING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4v4f__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4v4f__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4v4f__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）30.42 Å
Rg（电子密度）29.39 Å
总 Rg30.35 Å
原子数6145
残基数772
排除体积108530 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 4v4f__assembly_1__model_1 22-meric （22） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 4v4f__assembly_2__model_1 undecameric （11） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 4v4f__assembly_3__model_1 22-meric （22） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 4v4f__assembly_4__model_1 undecameric （11） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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7. 引用文献 (3)