5ef0

RADIATION DAMAGE TO THE TRAP-RNA COMPLEX: DOSE (DWD) 16.7 MGy

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 101.2 Å Quality: EXCELLENT

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transcription attenuation protein MtrB

Geobacillus stearothermophilus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–74 链 B； UniProt 1–74 链 C； UniProt 1–74 链 D； UniProt 1–74 链 E； UniProt 1–74 链 F； UniProt 1–74 链 G； UniProt 1–74 链 H； UniProt 1–74 链 I； UniProt 1–74 链 J； UniProt 1–74 链 K； UniProt 1–74	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Potassium phosphate,L-tryptophan,potassium glutamate,triethanolamine,MgCl2,monomethyl ether PEG 2000	分辨率 1.98 Å R-free 0.256
2	蛋白–RNA 同源多聚体蛋白 × 11 RNA 1 PDB 声明：dodecameric（12）与全部聚合物数一致	链 L； UniProt 1–74 链 M； UniProt 1–74 链 N； UniProt 1–74 链 O； UniProt 1–74 链 P； UniProt 1–74 链 Q； UniProt 1–74 链 R； UniProt 1–74 链 S； UniProt 1–74 链 T； UniProt 1–74 链 U； UniProt 1–74 链 V； UniProt 1–74	未记录	(GAGUU)10GAG 53-NUCLEOTIDE RNA × 1 TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Potassium phosphate,L-tryptophan,potassium glutamate,triethanolamine,MgCl2,monomethyl ether PEG 2000	分辨率 1.98 Å R-free 0.256

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5EF0	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1C9S CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX OF TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN WITH A 53-BASE SINGLE STRANDED RNA CONTAINING ELEVEN GAG TRIPLETS SEPARATED BY AU DINUCLEOTIDES 提交 1999-08-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 A 1–74（74 aa）链 B 1–74（74 aa）链 C 1–74（74 aa）链 D 1–74（74 aa）链 E 1–74（74 aa）链 F 1–74（74 aa）链 G 1–74（74 aa）链 H 1–74（74 aa）链 I 1–74（74 aa）链 J 1–74（74 aa）链 K 1–74（74 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；PEG 2000 MONOMETHYL ETHER, TRIETHANOLAMINE, MGCL2, K-GLUTAMATE, K-PHOSPHATE, L- TRYPTOPHAN, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.235
1C9S CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX OF TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN WITH A 53-BASE SINGLE STRANDED RNA CONTAINING ELEVEN GAG TRIPLETS SEPARATED BY AU DINUCLEOTIDES 提交 1999-08-03	实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 L 1–74（74 aa）链 M 1–74（74 aa）链 N 1–74（74 aa）链 O 1–74（74 aa）链 P 1–74（74 aa）链 Q 1–74（74 aa）链 R 1–74（74 aa）链 S 1–74（74 aa）链 T 1–74（74 aa）链 U 1–74（74 aa）链 V 1–74（74 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；PEG 2000 MONOMETHYL ETHER, TRIETHANOLAMINE, MGCL2, K-GLUTAMATE, K-PHOSPHATE, L- TRYPTOPHAN, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.235
1GTF The structure of the trp RNA-binding attenuation protein (TRAP) bound to a 53-nucleotide RNA molecule containing GAGUU repeats 提交 2002-01-15	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 A 1–74（74 aa）链 B 1–74（74 aa）链 C 1–74（74 aa）链 D 1–74（74 aa）链 E 1–74（74 aa）链 F 1–74（74 aa）链 G 1–74（74 aa）链 H 1–74（74 aa）链 I 1–74（74 aa）链 J 1–74（74 aa）链 K 1–74（74 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；0.2M K-GLUTAMATE, 50 MM TRIETHANOLAMINE PH8.0, 10MM MGCL2, 8-11% MONOMETHYL ETHER PEG 2000 + 0.4M KCL AT END, pH 8.00	分辨率 1.75 Å R-free 0.242
1GTF The structure of the trp RNA-binding attenuation protein (TRAP) bound to a 53-nucleotide RNA molecule containing GAGUU repeats 提交 2002-01-15	实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 L 1–74（74 aa）链 M 1–74（74 aa）链 N 1–74（74 aa）链 O 1–74（74 aa）链 P 1–74（74 aa）链 Q 1–74（74 aa）链 R 1–74（74 aa）链 S 1–74（74 aa）链 T 1–74（74 aa）链 U 1–74（74 aa）链 V 1–74（74 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；0.2M K-GLUTAMATE, 50 MM TRIETHANOLAMINE PH8.0, 10MM MGCL2, 8-11% MONOMETHYL ETHER PEG 2000 + 0.4M KCL AT END, pH 8.00	分辨率 1.75 Å R-free 0.242
1GTN Structure of the trp RNA-binding attenuation protein (TRAP) bound to an RNA molecule containing 11 GAGCC repeats 提交 2002-01-16	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 A 1–74（74 aa）链 B 1–74（74 aa）链 C 1–74（74 aa）链 D 1–74（74 aa）链 E 1–74（74 aa）链 F 1–74（74 aa）链 G 1–74（74 aa）链 H 1–74（74 aa）链 I 1–74（74 aa）链 J 1–74（74 aa）链 K 1–74（74 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；0.2M K-GLUTAMATE, 50MM TRIETHANOLAMINE PH8.0,10MM MGCL2, 8-11% MONOMETHYL PEG 2000,+0.4M KCL AT END, pH 8.00	分辨率 2.50 Å R-free 0.273
1GTN Structure of the trp RNA-binding attenuation protein (TRAP) bound to an RNA molecule containing 11 GAGCC repeats 提交 2002-01-16	实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 L 1–74（74 aa）链 M 1–74（74 aa）链 N 1–74（74 aa）链 O 1–74（74 aa）链 P 1–74（74 aa）链 Q 1–74（74 aa）链 R 1–74（74 aa）链 S 1–74（74 aa）链 T 1–74（74 aa）链 U 1–74（74 aa）链 V 1–74（74 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；0.2M K-GLUTAMATE, 50MM TRIETHANOLAMINE PH8.0,10MM MGCL2, 8-11% MONOMETHYL PEG 2000,+0.4M KCL AT END, pH 8.00	分辨率 2.50 Å R-free 0.273
1QAW Regulatory Features of the TRP Operon and the Crystal Structure of the TRP RNA-Binding Attenuation Protein from Bacillus Stearothermophilus. 提交 1999-03-31	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 A 1–74（74 aa）链 B 1–74（74 aa）链 C 1–74（74 aa）链 D 1–74（74 aa）链 E 1–74（74 aa）链 F 1–74（74 aa）链 G 1–74（74 aa）链 H 1–74（74 aa）链 I 1–74（74 aa）链 J 1–74（74 aa）链 K 1–74（74 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；L-tryptophan, K-Phosphate, Na-Phosphate, PEG 2000 monomethyl ether, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.50 Å R-free 0.299
1UTD The structure of the trp RNA-binding attenuation protein (TRAP) bound to a 63-nucleotide RNA molecule containing GAGUUU repeats 提交 2003-12-08	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 A 1–74（74 aa）链 B 1–74（74 aa）链 C 1–74（74 aa）链 D 1–74（74 aa）链 E 1–74（74 aa）链 F 1–74（74 aa）链 G 1–74（74 aa）链 H 1–74（74 aa）链 I 1–74（74 aa）链 J 1–74（74 aa）链 K 1–74（74 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；0.2M K-GLUTAMATE, 50 MM TRIETHANOLAMINE PH8.0, 10MM MGCL2, 8-11% MONOMETHYL ETHER PEG 2000+0.4M KCL AT END, pH 8.00	分辨率 2.10 Å R-free 0.228
1UTD The structure of the trp RNA-binding attenuation protein (TRAP) bound to a 63-nucleotide RNA molecule containing GAGUUU repeats 提交 2003-12-08	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：22-meric	链 L 1–74（74 aa）链 M 1–74（74 aa）链 N 1–74（74 aa）链 O 1–74（74 aa）链 P 1–74（74 aa）链 Q 1–74（74 aa）链 R 1–74（74 aa）链 S 1–74（74 aa）链 T 1–74（74 aa）链 U 1–74（74 aa）链 V 1–74（74 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；0.2M K-GLUTAMATE, 50 MM TRIETHANOLAMINE PH8.0, 10MM MGCL2, 8-11% MONOMETHYL ETHER PEG 2000+0.4M KCL AT END, pH 8.00	分辨率 2.10 Å R-free 0.228
2EXS TRAP3 (engineered TRAP) 提交 2005-11-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 2–74（73 aa）链 B 2–74（73 aa）链 C 2–74（73 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	TRP TRYPTOPHAN × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；30% PEG 300, 90mM CAPS, 150mM ammonium sulphate, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.264
2EXT TRAP4 (engineered TRAP) 提交 2005-11-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 2–74（73 aa）链 B 2–74（73 aa）链 C 2–74（73 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；40% PEG 200, 90mM CAPS, 200mM ammonium sulphate, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.80 Å R-free 0.218
2ZCZ Crystal structures and thermostability of mutant TRAP3 A7 (ENGINEERED TRAP) 提交 2007-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–74（74 aa）链 B 1–74（74 aa）链 C 1–74（74 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M sodium citrate pH5.5, 30%(w/v)MPD, 0.2M ammonium acetate, 10mM L-tryptophan, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.80 Å R-free 0.244
2ZCZ Crystal structures and thermostability of mutant TRAP3 A7 (ENGINEERED TRAP) 提交 2007-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 D 1–74（74 aa）链 E 1–74（74 aa）链 F 1–74（74 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M sodium citrate pH5.5, 30%(w/v)MPD, 0.2M ammonium acetate, 10mM L-tryptophan, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.80 Å R-free 0.244
2ZD0 Crystal structures and thermostability of mutant TRAP3 A5 (ENGINEERED TRAP) 提交 2007-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–74（74 aa）链 B 1–74（74 aa）链 C 1–74（74 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.5；293 K；0.09M CAPS pH 10.5, 30%(w/v) PEG300, 0.15M Ammonium sulfate, 10mM L-tryptophan, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.256
2ZP8 The Nature of the TRAP:Anti-TRAP complex 提交 2008-07-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric	链 A 1–74（74 aa）链 B 1–74（74 aa）链 C 1–74（74 aa）链 D 1–74（74 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 12 ZN ZINC ION × 18	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；0.1M bicine pH 9.0, 10-13% PEG 10000, 2% dioxane, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.268
2ZP9 The Nature of the TRAP:Anti-TRAP complex 提交 2008-07-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric	链 F 1–74（74 aa）链 G 1–74（74 aa）链 K 1–74（74 aa）链 L 1–74（74 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 12 ZN ZINC ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1M succinate pH 7.0, 13-15% PEG 10000, 2% dioxane, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.325
2ZP9 The Nature of the TRAP:Anti-TRAP complex 提交 2008-07-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric	链 A 1–74（74 aa）链 B 1–74（74 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 12 ZN ZINC ION × 18	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1M succinate pH 7.0, 13-15% PEG 10000, 2% dioxane, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.325
3AQD Unliganded TRAP 提交 2010-10-29	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 A 1–74（74 aa）链 B 1–74（74 aa）链 C 1–74（74 aa）链 D 1–74（74 aa）链 E 1–74（74 aa）链 F 1–74（74 aa）链 G 1–74（74 aa）链 H 1–74（74 aa）链 I 1–74（74 aa）链 J 1–74（74 aa）链 K 1–74（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25% PEG 400, 0.2M calcium chloride, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.267
3AQD Unliganded TRAP 提交 2010-10-29	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 L 1–74（74 aa）链 M 1–74（74 aa）链 N 1–74（74 aa）链 O 1–74（74 aa）链 P 1–74（74 aa）链 Q 1–74（74 aa）链 R 1–74（74 aa）链 S 1–74（74 aa）链 T 1–74（74 aa）链 U 1–74（74 aa）链 V 1–74（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25% PEG 400, 0.2M calcium chloride, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.267
3ZZS Engineered 12-subunit Bacillus stearothermophilus trp RNA-binding attenuation protein (TRAP) 提交 2011-09-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 5–69（65 aa）片段：RESIDUES 5-69 链 B 5–69（65 aa）片段：RESIDUES 5-69 链 C 5–69（65 aa）片段：RESIDUES 5-69	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 12	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.49 Å R-free 0.182
3ZZS Engineered 12-subunit Bacillus stearothermophilus trp RNA-binding attenuation protein (TRAP) 提交 2011-09-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 D 5–69（65 aa）片段：RESIDUES 5-69 链 E 5–69（65 aa）片段：RESIDUES 5-69 链 F 5–69（65 aa）片段：RESIDUES 5-69	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 12	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.49 Å R-free 0.182
3ZZS Engineered 12-subunit Bacillus stearothermophilus trp RNA-binding attenuation protein (TRAP) 提交 2011-09-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 G 5–69（65 aa）片段：RESIDUES 5-69 链 H 5–69（65 aa）片段：RESIDUES 5-69 链 I 5–69（65 aa）片段：RESIDUES 5-69	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 12	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.49 Å R-free 0.182
4V4F The structure of the trp RNA-binding attenuation protein (TRAP) bound to a RNA molecule containing UAGAU repeats 提交 2003-12-08	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：22-meric	链 AA 1–74（74 aa）链 AB 1–74（74 aa）链 AC 1–74（74 aa）链 AD 1–74（74 aa）链 AE 1–74（74 aa）链 AF 1–74（74 aa）链 AG 1–74（74 aa）链 AH 1–74（74 aa）链 AI 1–74（74 aa）链 AJ 1–74（74 aa）链 AK 1–74（74 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；0.2M K-GLUTAMATE, 50 MM TRIETHANOLAMINE PH8.0, 10MM MGCL2, 8-11% MONOMETHYL ETHER PEG 2000, +0.4M KCL AT END, pH 8.00	分辨率 1.90 Å R-free 0.236
4V4F The structure of the trp RNA-binding attenuation protein (TRAP) bound to a RNA molecule containing UAGAU repeats 提交 2003-12-08	实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 AL 1–74（74 aa）链 AM 1–74（74 aa）链 AN 1–74（74 aa）链 AO 1–74（74 aa）链 AP 1–74（74 aa）链 AQ 1–74（74 aa）链 AR 1–74（74 aa）链 AS 1–74（74 aa）链 AT 1–74（74 aa）链 AU 1–74（74 aa）链 AV 1–74（74 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；0.2M K-GLUTAMATE, 50 MM TRIETHANOLAMINE PH8.0, 10MM MGCL2, 8-11% MONOMETHYL ETHER PEG 2000, +0.4M KCL AT END, pH 8.00	分辨率 1.90 Å R-free 0.236
4V4F The structure of the trp RNA-binding attenuation protein (TRAP) bound to a RNA molecule containing UAGAU repeats 提交 2003-12-08	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：22-meric	链 BA 1–74（74 aa）链 BB 1–74（74 aa）链 BC 1–74（74 aa）链 BD 1–74（74 aa）链 BE 1–74（74 aa）链 BF 1–74（74 aa）链 BG 1–74（74 aa）链 BH 1–74（74 aa）链 BI 1–74（74 aa）链 BJ 1–74（74 aa）链 BK 1–74（74 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；0.2M K-GLUTAMATE, 50 MM TRIETHANOLAMINE PH8.0, 10MM MGCL2, 8-11% MONOMETHYL ETHER PEG 2000, +0.4M KCL AT END, pH 8.00	分辨率 1.90 Å R-free 0.236
4V4F The structure of the trp RNA-binding attenuation protein (TRAP) bound to a RNA molecule containing UAGAU repeats 提交 2003-12-08	实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 BL 1–74（74 aa）链 BM 1–74（74 aa）链 BN 1–74（74 aa）链 BO 1–74（74 aa）链 BP 1–74（74 aa）链 BQ 1–74（74 aa）链 BR 1–74（74 aa）链 BS 1–74（74 aa）链 BT 1–74（74 aa）链 BU 1–74（74 aa）链 BV 1–74（74 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；0.2M K-GLUTAMATE, 50 MM TRIETHANOLAMINE PH8.0, 10MM MGCL2, 8-11% MONOMETHYL ETHER PEG 2000, +0.4M KCL AT END, pH 8.00	分辨率 1.90 Å R-free 0.236
5EEU RADIATION DAMAGE TO THE TRAP-RNA COMPLEX: DOSE (DWD) 1.31 MGy 提交 2015-10-23	结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 A 1–74（74 aa）链 B 1–74（74 aa）链 C 1–74（74 aa）链 D 1–74（74 aa）链 E 1–74（74 aa）链 F 1–74（74 aa）链 G 1–74（74 aa）链 H 1–74（74 aa）链 I 1–74（74 aa）链 J 1–74（74 aa）链 K 1–74（74 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Potassium phosphate,L-tryptophan,potassium glutamate,triethanolamine,MgCl2,monomethyl ether PEG 2000	分辨率 1.98 Å R-free 0.232
5EEU RADIATION DAMAGE TO THE TRAP-RNA COMPLEX: DOSE (DWD) 1.31 MGy 提交 2015-10-23	结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 L 1–74（74 aa）链 M 1–74（74 aa）链 N 1–74（74 aa）链 O 1–74（74 aa）链 P 1–74（74 aa）链 Q 1–74（74 aa）链 R 1–74（74 aa）链 S 1–74（74 aa）链 T 1–74（74 aa）链 U 1–74（74 aa）链 V 1–74（74 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Potassium phosphate,L-tryptophan,potassium glutamate,triethanolamine,MgCl2,monomethyl ether PEG 2000	分辨率 1.98 Å R-free 0.232
5EEV RADIATION DAMAGE TO THE TRAP-RNA COMPLEX: DOSE (DWD) 3.88 MGy 提交 2015-10-23	结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 A 1–74（74 aa）链 B 1–74（74 aa）链 C 1–74（74 aa）链 D 1–74（74 aa）链 E 1–74（74 aa）链 F 1–74（74 aa）链 G 1–74（74 aa）链 H 1–74（74 aa）链 I 1–74（74 aa）链 J 1–74（74 aa）链 K 1–74（74 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Potassium phosphate,L-tryptophan,potassium glutamate,triethanolamine,MgCl2,monomethyl ether PEG 2000	分辨率 1.98 Å R-free 0.244
5EEV RADIATION DAMAGE TO THE TRAP-RNA COMPLEX: DOSE (DWD) 3.88 MGy 提交 2015-10-23	结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 L 1–74（74 aa）链 M 1–74（74 aa）链 N 1–74（74 aa）链 O 1–74（74 aa）链 P 1–74（74 aa）链 Q 1–74（74 aa）链 R 1–74（74 aa）链 S 1–74（74 aa）链 T 1–74（74 aa）链 U 1–74（74 aa）链 V 1–74（74 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Potassium phosphate,L-tryptophan,potassium glutamate,triethanolamine,MgCl2,monomethyl ether PEG 2000	分辨率 1.98 Å R-free 0.244
5EEW RADIATION DAMAGE TO THE TRAP-RNA COMPLEX: DOSE (DWD) 6.45 MGy 提交 2015-10-23	构建体不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 A 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 B 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 C 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 D 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 E 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 F 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 G 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 H 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 I 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 J 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 K 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP)	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Potassium phosphate,L-tryptophan,potassium glutamate,triethanolamine,MgCl2,monomethyl ether PEG 2000	分辨率 1.98 Å R-free 0.243
5EEW RADIATION DAMAGE TO THE TRAP-RNA COMPLEX: DOSE (DWD) 6.45 MGy 提交 2015-10-23	构建体不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 L 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 M 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 N 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 O 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 P 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 Q 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 R 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 S 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 T 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 U 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 V 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP)	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Potassium phosphate,L-tryptophan,potassium glutamate,triethanolamine,MgCl2,monomethyl ether PEG 2000	分辨率 1.98 Å R-free 0.243
5EEX RADIATION DAMAGE TO THE TRAP-RNA COMPLEX: DOSE (DWD) 9.02 MGy 提交 2015-10-23	构建体不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 A 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 B 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 C 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 D 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 E 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 F 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 G 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 H 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 I 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 J 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 K 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP)	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Potassium phosphate,L-tryptophan,potassium glutamate,triethanolamine,MgCl2,monomethyl ether PEG 2000	分辨率 1.98 Å R-free 0.245
5EEX RADIATION DAMAGE TO THE TRAP-RNA COMPLEX: DOSE (DWD) 9.02 MGy 提交 2015-10-23	构建体不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 L 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 M 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 N 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 O 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 P 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 Q 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 R 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 S 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 T 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 U 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 V 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP)	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Potassium phosphate,L-tryptophan,potassium glutamate,triethanolamine,MgCl2,monomethyl ether PEG 2000	分辨率 1.98 Å R-free 0.245
5EEY RADIATION DAMAGE TO THE TRAP-RNA COMPLEX: DOSE (DWD) 11.6 MGy 提交 2015-10-23	构建体不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 A 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 B 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 C 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 D 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 E 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 F 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 G 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 H 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 I 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 J 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 K 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP)	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Potassium phosphate,L-tryptophan,potassium glutamate,triethanolamine,MgCl2,monomethyl ether PEG 2000	分辨率 1.98 Å R-free 0.248
5EEY RADIATION DAMAGE TO THE TRAP-RNA COMPLEX: DOSE (DWD) 11.6 MGy 提交 2015-10-23	构建体不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 L 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 M 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 N 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 O 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 P 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 Q 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 R 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 S 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 T 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 U 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 V 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP)	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Potassium phosphate,L-tryptophan,potassium glutamate,triethanolamine,MgCl2,monomethyl ether PEG 2000	分辨率 1.98 Å R-free 0.248
5EEZ RADIATION DAMAGE TO THE TRAP-RNA COMPLEX: DOSE (DWD) 14.2 MGy 提交 2015-10-23	构建体不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 A 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 B 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 C 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 D 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 E 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 F 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 G 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 H 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 I 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 J 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 K 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP)	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Potassium phosphate,L-tryptophan,potassium glutamate,triethanolamine,MgCl2,monomethyl ether PEG 2000	分辨率 1.98 Å R-free 0.252
5EEZ RADIATION DAMAGE TO THE TRAP-RNA COMPLEX: DOSE (DWD) 14.2 MGy 提交 2015-10-23	构建体不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 L 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 M 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 N 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 O 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 P 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 Q 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 R 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 S 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 T 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 U 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP) 链 V 1–74（74 aa）片段：TRP RNA-BINDING ATTENUATION PROTEIN (TRAP)	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Potassium phosphate,L-tryptophan,potassium glutamate,triethanolamine,MgCl2,monomethyl ether PEG 2000	分辨率 1.98 Å R-free 0.252
5EF1 RADIATION DAMAGE TO THE TRAP-RNA COMPLEX: DOSE (DWD) 19.3 MGy 提交 2015-10-23	结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 A 1–74（74 aa）链 B 1–74（74 aa）链 C 1–74（74 aa）链 D 1–74（74 aa）链 E 1–74（74 aa）链 F 1–74（74 aa）链 G 1–74（74 aa）链 H 1–74（74 aa）链 I 1–74（74 aa）链 J 1–74（74 aa）链 K 1–74（74 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Potassium phosphate,L-tryptophan,potassium glutamate,triethanolamine,MgCl2,monomethyl ether PEG 2000	分辨率 1.98 Å R-free 0.263
5EF1 RADIATION DAMAGE TO THE TRAP-RNA COMPLEX: DOSE (DWD) 19.3 MGy 提交 2015-10-23	结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 L 1–74（74 aa）链 M 1–74（74 aa）链 N 1–74（74 aa）链 O 1–74（74 aa）链 P 1–74（74 aa）链 Q 1–74（74 aa）链 R 1–74（74 aa）链 S 1–74（74 aa）链 T 1–74（74 aa）链 U 1–74（74 aa）链 V 1–74（74 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Potassium phosphate,L-tryptophan,potassium glutamate,triethanolamine,MgCl2,monomethyl ether PEG 2000	分辨率 1.98 Å R-free 0.263
5EF2 RADIATION DAMAGE TO THE TRAP-RNA COMPLEX: DOSE (DWD) 21.9 MGy 提交 2015-10-23	结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 A 1–74（74 aa）链 B 1–74（74 aa）链 C 1–74（74 aa）链 D 1–74（74 aa）链 E 1–74（74 aa）链 F 1–74（74 aa）链 G 1–74（74 aa）链 H 1–74（74 aa）链 I 1–74（74 aa）链 J 1–74（74 aa）链 K 1–74（74 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Potassium phosphate,L-tryptophan,potassium glutamate,triethanolamine,MgCl2,monomethyl ether PEG 2000	分辨率 1.98 Å R-free 0.264
5EF2 RADIATION DAMAGE TO THE TRAP-RNA COMPLEX: DOSE (DWD) 21.9 MGy 提交 2015-10-23	结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 L 1–74（74 aa）链 M 1–74（74 aa）链 N 1–74（74 aa）链 O 1–74（74 aa）链 P 1–74（74 aa）链 Q 1–74（74 aa）链 R 1–74（74 aa）链 S 1–74（74 aa）链 T 1–74（74 aa）链 U 1–74（74 aa）链 V 1–74（74 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Potassium phosphate,L-tryptophan,potassium glutamate,triethanolamine,MgCl2,monomethyl ether PEG 2000	分辨率 1.98 Å R-free 0.264
5EF3 RADIATION DAMAGE TO THE TRAP-RNA COMPLEX: DOSE (DWD) 25.0 MGy 提交 2015-10-23	结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 A 1–74（74 aa）链 B 1–74（74 aa）链 C 1–74（74 aa）链 D 1–74（74 aa）链 E 1–74（74 aa）链 F 1–74（74 aa）链 G 1–74（74 aa）链 H 1–74（74 aa）链 I 1–74（74 aa）链 J 1–74（74 aa）链 K 1–74（74 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Potassium phosphate,L-tryptophan,potassium glutamate,triethanolamine,MgCl2,monomethyl ether PEG 2000	分辨率 1.98 Å R-free 0.271
5EF3 RADIATION DAMAGE TO THE TRAP-RNA COMPLEX: DOSE (DWD) 25.0 MGy 提交 2015-10-23	结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 L 1–74（74 aa）链 M 1–74（74 aa）链 N 1–74（74 aa）链 O 1–74（74 aa）链 P 1–74（74 aa）链 Q 1–74（74 aa）链 R 1–74（74 aa）链 S 1–74（74 aa）链 T 1–74（74 aa）链 U 1–74（74 aa）链 V 1–74（74 aa）	未记录	TRP TRYPTOPHAN × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Potassium phosphate,L-tryptophan,potassium glutamate,triethanolamine,MgCl2,monomethyl ether PEG 2000	分辨率 1.98 Å R-free 0.271
6RVV Structure of left-handed protein cage consisting of 24 eleven-membered ring proteins held together by gold (I) bridges. 提交 2019-06-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 264 PDB 声明：264-meric	链 AA 1–74（74 aa）链 AB 1–74（74 aa）链 AC 1–74（74 aa）链 AD 1–74（74 aa）链 AE 1–74（74 aa）链 AF 1–74（74 aa）链 AG 1–74（74 aa）链 AH 1–74（74 aa）链 AI 1–74（74 aa）链 AJ 1–74（74 aa）链 AK 1–74（74 aa）链 BA 1–74（74 aa）链 BB 1–74（74 aa）链 BC 1–74（74 aa）链 BD 1–74（74 aa）链 BE 1–74（74 aa）链 BF 1–74（74 aa）链 BG 1–74（74 aa）链 BH 1–74（74 aa）链 BI 1–74（74 aa）链 BJ 1–74（74 aa）链 BK 1–74（74 aa）链 CA 1–74（74 aa）链 CB 1–74（74 aa）链 CC 1–74（74 aa）链 CD 1–74（74 aa）链 CE 1–74（74 aa）链 CF 1–74（74 aa）链 CG 1–74（74 aa）链 CH 1–74（74 aa）链 CI 1–74（74 aa）链 CJ 1–74（74 aa）链 CK 1–74（74 aa）链 DA 1–74（74 aa）链 DB 1–74（74 aa）链 DC 1–74（74 aa）链 DD 1–74（74 aa）链 DE 1–74（74 aa）链 DF 1–74（74 aa）链 DG 1–74（74 aa）链 DH 1–74（74 aa）链 DI 1–74（74 aa）链 DJ 1–74（74 aa）链 DK 1–74（74 aa）链 EA 1–74（74 aa）链 EB 1–74（74 aa）链 EC 1–74（74 aa）链 ED 1–74（74 aa）链 EE 1–74（74 aa）链 EF 1–74（74 aa）链 EG 1–74（74 aa）链 EH 1–74（74 aa）链 EI 1–74（74 aa）链 EJ 1–74（74 aa）链 EK 1–74（74 aa）链 FA 1–74（74 aa）链 FB 1–74（74 aa）链 FC 1–74（74 aa）链 FD 1–74（74 aa）链 FE 1–74（74 aa）链 FF 1–74（74 aa）链 FG 1–74（74 aa）链 FH 1–74（74 aa）链 FI 1–74（74 aa）链 FJ 1–74（74 aa）链 FK 1–74（74 aa）链 GA 1–74（74 aa）链 GB 1–74（74 aa）链 GC 1–74（74 aa）链 GD 1–74（74 aa）链 GE 1–74（74 aa）链 GF 1–74（74 aa）链 GG 1–74（74 aa）链 GH 1–74（74 aa）链 GI 1–74（74 aa）链 GJ 1–74（74 aa）链 GK 1–74（74 aa）链 HA 1–74（74 aa）链 HB 1–74（74 aa）链 HC 1–74（74 aa）链 HD 1–74（74 aa）链 HE 1–74（74 aa）链 HF 1–74（74 aa）链 HG 1–74（74 aa）链 HH 1–74（74 aa）链 HI 1–74（74 aa）链 HJ 1–74（74 aa）链 HK 1–74（74 aa）链 IA 1–74（74 aa）链 IB 1–74（74 aa）链 IC 1–74（74 aa）链 ID 1–74（74 aa）链 IE 1–74（74 aa）链 IF 1–74（74 aa）链 IG 1–74（74 aa）链 IH 1–74（74 aa）链 II 1–74（74 aa）链 IJ 1–74（74 aa）链 IK 1–74（74 aa）链 JA 1–74（74 aa）链 JB 1–74（74 aa）链 JC 1–74（74 aa）链 JD 1–74（74 aa）链 JE 1–74（74 aa）链 JF 1–74（74 aa）链 JG 1–74（74 aa）链 JH 1–74（74 aa）链 JI 1–74（74 aa）链 JJ 1–74（74 aa）链 JK 1–74（74 aa）链 KA 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6RVW Structure of right-handed protein cage consisting of 24 eleven-membered ring proteins held together by gold (I) bridges. 提交 2019-06-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 264 PDB 声明：264-meric	链 AA 1–74（74 aa）链 AB 1–74（74 aa）链 AC 1–74（74 aa）链 AD 1–74（74 aa）链 AE 1–74（74 aa）链 AF 1–74（74 aa）链 AG 1–74（74 aa）链 AH 1–74（74 aa）链 AI 1–74（74 aa）链 AJ 1–74（74 aa）链 AK 1–74（74 aa）链 BA 1–74（74 aa）链 BB 1–74（74 aa）链 BC 1–74（74 aa）链 BD 1–74（74 aa）链 BE 1–74（74 aa）链 BF 1–74（74 aa）链 BG 1–74（74 aa）链 BH 1–74（74 aa）链 BI 1–74（74 aa）链 BJ 1–74（74 aa）链 BK 1–74（74 aa）链 CA 1–74（74 aa）链 CB 1–74（74 aa）链 CC 1–74（74 aa）链 CD 1–74（74 aa）链 CE 1–74（74 aa）链 CF 1–74（74 aa）链 CG 1–74（74 aa）链 CH 1–74（74 aa）链 CI 1–74（74 aa）链 CJ 1–74（74 aa）链 CK 1–74（74 aa）链 DA 1–74（74 aa）链 DB 1–74（74 aa）链 DC 1–74（74 aa）链 DD 1–74（74 aa）链 DE 1–74（74 aa）链 DF 1–74（74 aa）链 DG 1–74（74 aa）链 DH 1–74（74 aa）链 DI 1–74（74 aa）链 DJ 1–74（74 aa）链 DK 1–74（74 aa）链 EA 1–74（74 aa）链 EB 1–74（74 aa）链 EC 1–74（74 aa）链 ED 1–74（74 aa）链 EE 1–74（74 aa）链 EF 1–74（74 aa）链 EG 1–74（74 aa）链 EH 1–74（74 aa）链 EI 1–74（74 aa）链 EJ 1–74（74 aa）链 EK 1–74（74 aa）链 FA 1–74（74 aa）链 FB 1–74（74 aa）链 FC 1–74（74 aa）链 FD 1–74（74 aa）链 FE 1–74（74 aa）链 FF 1–74（74 aa）链 FG 1–74（74 aa）链 FH 1–74（74 aa）链 FI 1–74（74 aa）链 FJ 1–74（74 aa）链 FK 1–74（74 aa）链 GA 1–74（74 aa）链 GB 1–74（74 aa）链 GC 1–74（74 aa）链 GD 1–74（74 aa）链 GE 1–74（74 aa）链 GF 1–74（74 aa）链 GG 1–74（74 aa）链 GH 1–74（74 aa）链 GI 1–74（74 aa）链 GJ 1–74（74 aa）链 GK 1–74（74 aa）链 HA 1–74（74 aa）链 HB 1–74（74 aa）链 HC 1–74（74 aa）链 HD 1–74（74 aa）链 HE 1–74（74 aa）链 HF 1–74（74 aa）链 HG 1–74（74 aa）链 HH 1–74（74 aa）链 HI 1–74（74 aa）链 HJ 1–74（74 aa）链 HK 1–74（74 aa）链 IA 1–74（74 aa）链 IB 1–74（74 aa）链 IC 1–74（74 aa）链 ID 1–74（74 aa）链 IE 1–74（74 aa）链 IF 1–74（74 aa）链 IG 1–74（74 aa）链 IH 1–74（74 aa）链 II 1–74（74 aa）链 IJ 1–74（74 aa）链 IK 1–74（74 aa）链 JA 1–74（74 aa）链 JB 1–74（74 aa）链 JC 1–74（74 aa）链 JD 1–74（74 aa）链 JE 1–74（74 aa）链 JF 1–74（74 aa）链 JG 1–74（74 aa）链 JH 1–74（74 aa）链 JI 1–74（74 aa）链 JJ 1–74（74 aa）链 JK 1–74（74 aa）链 KA 1–74（74 aa）链 KB 1–74（74 aa）链 KC 1–74（74 aa）链 KD 1–74（74 aa）链 KE 1–74（74 aa）链 KF 1–74（74 aa）链 KG 1–74（74 aa）链 KH 1–74（74 aa）链 KI 1–74（74 aa）链 KJ 1–74（74 aa）链 KK 1–74（74 aa）链 LA 1–74（74 aa）链 LB 1–74（74 aa）链 LC 1–74（74 aa）链 LD 1–74（74 aa）链 LE 1–74（74 aa）链 LF 1–74（74 aa）链 LG 1–74（74 aa）链 LH 1–74（74 aa）链 LI 1–74（74 aa）链 LJ 1–74（74 aa）链 LK 1–74（74 aa）链 MA 1–74（74 aa）链 MB 1–74（74 aa）链 MC 1–74（74 aa）链 MD 1–74（74 aa）链 ME 1–74（74 aa）链 MF 1–74（74 aa）链 MG 1–74（74 aa）链 MH 1–74（74 aa）链 MI 1–74（74 aa）链 MJ 1–74（74 aa）链 MK 1–74（74 aa）链 NA 1–74（74 aa）链 NB 1–74（74 aa）链 NC 1–74（74 aa）链 ND 1–74（74 aa）链 NE 1–74（74 aa）链 NF 1–74（74 aa）链 NG 1–74（74 aa）链 NH 1–74（74 aa）链 NI 1–74（74 aa）链 NJ 1–74（74 aa）链 NK 1–74（74 aa）链 OA 1–74（74 aa）链 OB 1–74（74 aa）链 OC 1–74（74 aa）链 OD 1–74（74 aa）链 OE 1–74（74 aa）链 OF 1–74（74 aa）链 OG 1–74（74 aa）链 OH 1–74（74 aa）链 OI 1–74（74 aa）链 OJ 1–74（74 aa）链 OK 1–74（74 aa）链 PA 1–74（74 aa）链 PB 1–74（74 aa）链 PC 1–74（74 aa）链 PD 1–74（74 aa）链 PE 1–74（74 aa）链 PF 1–74（74 aa）链 PG 1–74（74 aa）链 PH 1–74（74 aa）链 PI 1–74（74 aa）链 PJ 1–74（74 aa）链 PK 1–74（74 aa）链 QA 1–74（74 aa）链 QB 1–74（74 aa）链 QC 1–74（74 aa）链 QD 1–74（74 aa）链 QE 1–74（74 aa）链 QF 1–74（74 aa）链 QG 1–74（74 aa）链 QH 1–74（74 aa）链 QI 1–74（74 aa）链 QJ 1–74（74 aa）链 QK 1–74（74 aa）链 RA 1–74（74 aa）链 RB 1–74（74 aa）链 RC 1–74（74 aa）链 RD 1–74（74 aa）链 RE 1–74（74 aa）链 RF 1–74（74 aa）链 RG 1–74（74 aa）链 RH 1–74（74 aa）链 RI 1–74（74 aa）链 RJ 1–74（74 aa）链 RK 1–74（74 aa）链 SA 1–74（74 aa）链 SB 1–74（74 aa）链 SC 1–74（74 aa）链 SD 1–74（74 aa）链 SE 1–74（74 aa）链 SF 1–74（74 aa）链 SG 1–74（74 aa）链 SH 1–74（74 aa）链 SI 1–74（74 aa）链 SJ 1–74（74 aa）链 SK 1–74（74 aa）链 TA 1–74（74 aa）链 TB 1–74（74 aa）链 TC 1–74（74 aa）链 TD 1–74（74 aa）链 TE 1–74（74 aa）链 TF 1–74（74 aa）链 TG 1–74（74 aa）链 TH 1–74（74 aa）链 TI 1–74（74 aa）链 TJ 1–74（74 aa）链 TK 1–74（74 aa）链 UA 1–74（74 aa）链 UB 1–74（74 aa）链 UC 1–74（74 aa）链 UD 1–74（74 aa）链 UE 1–74（74 aa）链 UF 1–74（74 aa）链 UG 1–74（74 aa）链 UH 1–74（74 aa）链 UI 1–74（74 aa）链 UJ 1–74（74 aa）链 UK 1–74（74 aa）链 VA 1–74（74 aa）链 VB 1–74（74 aa）链 VC 1–74（74 aa）链 VD 1–74（74 aa）链 VE 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8R59 Structure of the Co(II) triggered TRAP (S33HK35H) protein cage (levo form) 提交 2023-11-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 264 PDB 声明：264-meric	链 0 1–74（74 aa）链 0A 1–74（74 aa）链 0B 1–74（74 aa）链 0C 1–74（74 aa）链 1 1–74（74 aa）链 1A 1–74（74 aa）链 1B 1–74（74 aa）链 1C 1–74（74 aa）链 2 1–74（74 aa）链 2A 1–74（74 aa）链 2B 1–74（74 aa）链 2C 1–74（74 aa）链 3 1–74（74 aa）链 3A 1–74（74 aa）链 3B 1–74（74 aa）链 3C 1–74（74 aa）链 4 1–74（74 aa）链 4A 1–74（74 aa）链 4B 1–74（74 aa）链 4C 1–74（74 aa）链 5 1–74（74 aa）链 5A 1–74（74 aa）链 5B 1–74（74 aa）链 5C 1–74（74 aa）链 6 1–74（74 aa）链 6A 1–74（74 aa）链 6B 1–74（74 aa）链 6C 1–74（74 aa）链 7 1–74（74 aa）链 7A 1–74（74 aa）链 7B 1–74（74 aa）链 7C 1–74（74 aa）链 8 1–74（74 aa）链 8A 1–74（74 aa）链 8B 1–74（74 aa）链 8C 1–74（74 aa）链 9 1–74（74 aa）链 9A 1–74（74 aa）链 9B 1–74（74 aa）链 9C 1–74（74 aa）链 A 1–74（74 aa）链 AA 1–74（74 aa）链 AB 1–74（74 aa）链 AC 1–74（74 aa）链 AD 1–74（74 aa）链 B 1–74（74 aa）链 BA 1–74（74 aa）链 BB 1–74（74 aa）链 BC 1–74（74 aa）链 BD 1–74（74 aa）链 C 1–74（74 aa）链 CA 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8R5A Structure of the Co(II) triggered TRAP (S33HK35H) protein cage (dextro form) 提交 2023-11-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 264 PDB 声明：264-meric	链 0 1–74（74 aa）链 0A 1–74（74 aa）链 0B 1–74（74 aa）链 0C 1–74（74 aa）链 1 1–74（74 aa）链 1A 1–74（74 aa）链 1B 1–74（74 aa）链 1C 1–74（74 aa）链 2 1–74（74 aa）链 2A 1–74（74 aa）链 2B 1–74（74 aa）链 2C 1–74（74 aa）链 3 1–74（74 aa）链 3A 1–74（74 aa）链 3B 1–74（74 aa）链 3C 1–74（74 aa）链 4 1–74（74 aa）链 4A 1–74（74 aa）链 4B 1–74（74 aa）链 4C 1–74（74 aa）链 5 1–74（74 aa）链 5A 1–74（74 aa）链 5B 1–74（74 aa）链 5C 1–74（74 aa）链 6 1–74（74 aa）链 6A 1–74（74 aa）链 6B 1–74（74 aa）链 6C 1–74（74 aa）链 7 1–74（74 aa）链 7A 1–74（74 aa）链 7B 1–74（74 aa）链 7C 1–74（74 aa）链 8 1–74（74 aa）链 8A 1–74（74 aa）链 8B 1–74（74 aa）链 8C 1–74（74 aa）链 9 1–74（74 aa）链 9A 1–74（74 aa）链 9B 1–74（74 aa）链 9C 1–74（74 aa）链 A 1–74（74 aa）链 AA 1–74（74 aa）链 AB 1–74（74 aa）链 AC 1–74（74 aa）链 AD 1–74（74 aa）链 B 1–74（74 aa）链 BA 1–74（74 aa）链 BB 1–74（74 aa）链 BC 1–74（74 aa）链 BD 1–74（74 aa）链 C 1–74（74 aa）链 CA 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UniProt名称	MTRB_GEOSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 B； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 C； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 D； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 E； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 F； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 G； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 H； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 I； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 J； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 K； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 L； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 M； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 N； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 O； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 P； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 Q； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 R； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 S； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 T； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 U； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74 作者链 V； PDB构建体 1–74； UniProt 1–74

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5ef0
沉积日期 deposition_date	2015-10-23
结构标题 title	RADIATION DAMAGE TO THE TRAP-RNA COMPLEX: DOSE (DWD) 16.7 MGy
关键词 keywords	protein-RNA complex, radiation damage, RNA binding protein; RNA BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	36.08 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	34.61 Å
零角强度 I(0) i0	598303000.00
分子量 molecular_weight	186000.0 kDa
排除体积 excluded_volume	227690 Å³
包络体积 envelope_volume	288940 Å³
水化壳体积 shell_volume	65457 Å³
包络直径 envelope_diameter	99.6 Å
壳层 Rg shell_rg	44.62 Å
包络 Rg envelope_rg	33.53 Å
形状 Rg shape_rg	34.56 Å
总 Rg total_rg	35.36 Å
总原子数 total_atoms	13087
残基数 n_residues	1565
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	101.2 Å
Rg (实空间) rg_real	35.72 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.33 Å
I(0) (实空间) i0_real	5.9830e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	7.5840e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	35.94 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	598400000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9076
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	50.6 Å
偏度 Skewness skewness	-0.120
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.652
角度范围 angular_range	— – 0.2200 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	628000000.0000
实空间数据点数 n_real_points	45
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.953; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.965; Smooth: 0.971

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Transcription attenuation protein MtrB
分子量 formula_weight	8257.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	22

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V
原子数 atom_count	13846

MYTNSDFVVIKALEDGVNVIGLTRGADTRFHHSEKLDKGEVLIAQFTEHTSAIKVRGKAYIQTRHGVIESEGKK

来源 Source

来源生物 organism	Geobacillus stearothermophilus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1422
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	(GAGUU)10GAG 53-NUCLEOTIDE RNA
分子量 formula_weight	17906.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	W

GAGUUGAGUUGAGUUGAGUUGAGUUGAGUUGAGUUGAGUUGAGUUGAGUUGAGUU

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	TRYPTOPHAN
分子量 formula_weight	204.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	22

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	743

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 22 domains

CATH v4.4 (22 domains)

结构域编号 domain_id	5ef0A00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — TRAP-like

结构域编号 domain_id	5ef0B00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — TRAP-like

结构域编号 domain_id	5ef0C00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — TRAP-like

结构域编号 domain_id	5ef0D00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — TRAP-like

结构域编号 domain_id	5ef0E00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — TRAP-like

结构域编号 domain_id	5ef0F00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — TRAP-like

结构域编号 domain_id	5ef0G00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — TRAP-like

结构域编号 domain_id	5ef0H00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — TRAP-like

结构域编号 domain_id	5ef0I00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — TRAP-like

结构域编号 domain_id	5ef0J00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — TRAP-like

结构域编号 domain_id	5ef0K00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — TRAP-like

结构域编号 domain_id	5ef0L00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — TRAP-like

结构域编号 domain_id	5ef0M00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — TRAP-like

结构域编号 domain_id	5ef0N00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — TRAP-like

结构域编号 domain_id	5ef0O00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — TRAP-like

结构域编号 domain_id	5ef0P00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — TRAP-like

结构域编号 domain_id	5ef0Q00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — TRAP-like

结构域编号 domain_id	5ef0R00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — TRAP-like

结构域编号 domain_id	5ef0S00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — TRAP-like

结构域编号 domain_id	5ef0T00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — TRAP-like

结构域编号 domain_id	5ef0U00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — TRAP-like

结构域编号 domain_id	5ef0V00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — TRAP-like

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8. 引用文献 (2)

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晶胞边长 a length_a	141.160 Å
晶胞边长 b length_b	111.130 Å
晶胞边长 c length_c	138.180 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	117.39 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	88

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.980 Å
最低分辨率 resolution_low	58.652 Å
R 因子 r_factor	0.2263
R_work r_work	0.2247
R_free r_free	0.2560

fit	/app/data/saxs_computation/ef/5ef0/5ef0.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ef/5ef0/5ef0.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ef/5ef0/5ef0.dat

RADIATION DAMAGE TO THE TRAP-RNA COMPLEX: DOSE (DWD) 16.7 MGy

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transcription attenuation protein MtrB

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 22 domains

CATH v4.4 (22 domains)

8. 引用文献 (2)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)