5fyw

Transcription initiation complex structures elucidate DNA opening (OC)

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 20 DNA 2	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （P08518） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （P16370） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB4 × 1 （P20433） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 1 × 1 （P20434） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 2 × 1 （P20435） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （P34087） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 3 × 1 （P20436） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB9 × 1 （P27999） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 5 × 1 （P22139） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB11 × 1 （P38902） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 4 × 1 （P40422） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-BOX-BINDING PROTEIN × 1 （P13393） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT ALPHA × 1 （P41895） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT BETA × 1 （P41896） NONTEMPLATE DNA × 1 TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA LARGE SUBUNIT × 1 （P32773） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA SUBUNIT 2 × 1 （P32774） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT ALPHA × 1 （P36100） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT BETA × 1 （P36145） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPB1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–1733； UniProt 1–1733

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2

物种未注明

UniProt P08518

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 20 DNA 2	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （P04050） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （P16370） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB4 × 1 （P20433） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 1 × 1 （P20434） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 2 × 1 （P20435） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （P34087） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 3 × 1 （P20436） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB9 × 1 （P27999） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 5 × 1 （P22139） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB11 × 1 （P38902） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 4 × 1 （P40422） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-BOX-BINDING PROTEIN × 1 （P13393） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT ALPHA × 1 （P41895） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT BETA × 1 （P41896） NONTEMPLATE DNA × 1 TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA LARGE SUBUNIT × 1 （P32773） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA SUBUNIT 2 × 1 （P32774） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT ALPHA × 1 （P36100） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT BETA × 1 （P36145） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPB2_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–1224； UniProt 1–1224

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3

物种未注明

UniProt P16370

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 20 DNA 2	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （P04050） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （P08518） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB4 × 1 （P20433） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 1 × 1 （P20434） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 2 × 1 （P20435） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （P34087） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 3 × 1 （P20436） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB9 × 1 （P27999） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 5 × 1 （P22139） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB11 × 1 （P38902） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 4 × 1 （P40422） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-BOX-BINDING PROTEIN × 1 （P13393） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT ALPHA × 1 （P41895） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT BETA × 1 （P41896） NONTEMPLATE DNA × 1 TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA LARGE SUBUNIT × 1 （P32773） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA SUBUNIT 2 × 1 （P32774） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT ALPHA × 1 （P36100） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT BETA × 1 （P36145） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPB3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–318； UniProt 1–318

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB4

物种未注明

UniProt P20433

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 20 DNA 2	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （P04050） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （P08518） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （P16370） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 1 × 1 （P20434） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 2 × 1 （P20435） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （P34087） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 3 × 1 （P20436） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB9 × 1 （P27999） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 5 × 1 （P22139） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB11 × 1 （P38902） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 4 × 1 （P40422） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-BOX-BINDING PROTEIN × 1 （P13393） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT ALPHA × 1 （P41895） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT BETA × 1 （P41896） NONTEMPLATE DNA × 1 TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA LARGE SUBUNIT × 1 （P32773） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA SUBUNIT 2 × 1 （P32774） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT ALPHA × 1 （P36100） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT BETA × 1 （P36145） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPB4_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–221； UniProt 1–221

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 1

物种未注明

UniProt P20434

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 20 DNA 2	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （P04050） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （P08518） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （P16370） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB4 × 1 （P20433） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 2 × 1 （P20435） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （P34087） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 3 × 1 （P20436） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB9 × 1 （P27999） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 5 × 1 （P22139） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB11 × 1 （P38902） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 4 × 1 （P40422） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-BOX-BINDING PROTEIN × 1 （P13393） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT ALPHA × 1 （P41895） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT BETA × 1 （P41896） NONTEMPLATE DNA × 1 TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA LARGE SUBUNIT × 1 （P32773） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA SUBUNIT 2 × 1 （P32774） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT ALPHA × 1 （P36100） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT BETA × 1 （P36145） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPAB1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–215； UniProt 1–215

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 2

物种未注明

UniProt P20435

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 20 DNA 2	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （P04050） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （P08518） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （P16370） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB4 × 1 （P20433） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 1 × 1 （P20434） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （P34087） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 3 × 1 （P20436） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB9 × 1 （P27999） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 5 × 1 （P22139） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB11 × 1 （P38902） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 4 × 1 （P40422） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-BOX-BINDING PROTEIN × 1 （P13393） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT ALPHA × 1 （P41895） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT BETA × 1 （P41896） NONTEMPLATE DNA × 1 TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA LARGE SUBUNIT × 1 （P32773） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA SUBUNIT 2 × 1 （P32774） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT ALPHA × 1 （P36100） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT BETA × 1 （P36145） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPAB2_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–155； UniProt 1–155

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7

物种未注明

UniProt P34087

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 20 DNA 2	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （P04050） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （P08518） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （P16370） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB4 × 1 （P20433） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 1 × 1 （P20434） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 2 × 1 （P20435） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 3 × 1 （P20436） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB9 × 1 （P27999） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 5 × 1 （P22139） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB11 × 1 （P38902） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 4 × 1 （P40422） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-BOX-BINDING PROTEIN × 1 （P13393） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT ALPHA × 1 （P41895） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT BETA × 1 （P41896） NONTEMPLATE DNA × 1 TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA LARGE SUBUNIT × 1 （P32773） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA SUBUNIT 2 × 1 （P32774） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT ALPHA × 1 （P36100） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT BETA × 1 （P36145） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPB7_YEAST
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–171； UniProt 1–171

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 3

物种未注明

UniProt P20436

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 20 DNA 2	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （P04050） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （P08518） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （P16370） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB4 × 1 （P20433） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 1 × 1 （P20434） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 2 × 1 （P20435） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （P34087） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB9 × 1 （P27999） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 5 × 1 （P22139） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB11 × 1 （P38902） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 4 × 1 （P40422） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-BOX-BINDING PROTEIN × 1 （P13393） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT ALPHA × 1 （P41895） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT BETA × 1 （P41896） NONTEMPLATE DNA × 1 TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA LARGE SUBUNIT × 1 （P32773） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA SUBUNIT 2 × 1 （P32774） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT ALPHA × 1 （P36100） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT BETA × 1 （P36145） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPAB3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–146； UniProt 1–146

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB9

物种未注明

UniProt P27999

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 20 DNA 2	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （P04050） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （P08518） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （P16370） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB4 × 1 （P20433） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 1 × 1 （P20434） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 2 × 1 （P20435） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （P34087） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 3 × 1 （P20436） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 5 × 1 （P22139） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB11 × 1 （P38902） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 4 × 1 （P40422） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-BOX-BINDING PROTEIN × 1 （P13393） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT ALPHA × 1 （P41895） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT BETA × 1 （P41896） NONTEMPLATE DNA × 1 TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA LARGE SUBUNIT × 1 （P32773） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA SUBUNIT 2 × 1 （P32774） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT ALPHA × 1 （P36100） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT BETA × 1 （P36145） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPB9_YEAST
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–122； UniProt 1–122

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 5

物种未注明

UniProt P22139

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 20 DNA 2	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （P04050） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （P08518） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （P16370） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB4 × 1 （P20433） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 1 × 1 （P20434） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 2 × 1 （P20435） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （P34087） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 3 × 1 （P20436） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB9 × 1 （P27999） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB11 × 1 （P38902） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 4 × 1 （P40422） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-BOX-BINDING PROTEIN × 1 （P13393） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT ALPHA × 1 （P41895） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT BETA × 1 （P41896） NONTEMPLATE DNA × 1 TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA LARGE SUBUNIT × 1 （P32773） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA SUBUNIT 2 × 1 （P32774） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT ALPHA × 1 （P36100） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT BETA × 1 （P36145） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPAB5_YEAST
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–70； UniProt 1–70

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB11

物种未注明

UniProt P38902

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 20 DNA 2	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （P04050） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （P08518） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （P16370） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB4 × 1 （P20433） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 1 × 1 （P20434） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 2 × 1 （P20435） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （P34087） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 3 × 1 （P20436） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB9 × 1 （P27999） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 5 × 1 （P22139） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 4 × 1 （P40422） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-BOX-BINDING PROTEIN × 1 （P13393） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT ALPHA × 1 （P41895） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT BETA × 1 （P41896） NONTEMPLATE DNA × 1 TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA LARGE SUBUNIT × 1 （P32773） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA SUBUNIT 2 × 1 （P32774） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT ALPHA × 1 （P36100） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT BETA × 1 （P36145） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RPB11_YEAST
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–120； UniProt 1–120

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 4

物种未注明

UniProt P40422

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 20 DNA 2	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （P04050） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （P08518） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （P16370） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB4 × 1 （P20433） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 1 × 1 （P20434） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 2 × 1 （P20435） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （P34087） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 3 × 1 （P20436） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB9 × 1 （P27999） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 5 × 1 （P22139） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB11 × 1 （P38902） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-BOX-BINDING PROTEIN × 1 （P13393） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT ALPHA × 1 （P41895） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT BETA × 1 （P41896） NONTEMPLATE DNA × 1 TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA LARGE SUBUNIT × 1 （P32773） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA SUBUNIT 2 × 1 （P32774） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT ALPHA × 1 （P36100） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT BETA × 1 （P36145） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RPAB4_YEAST
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–70； UniProt 1–70

TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIB

SACCHAROMYCES CEREVISIAE

UniProt P29055

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 20 DNA 2	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （P04050） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （P08518） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （P16370） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB4 × 1 （P20433） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 1 × 1 （P20434） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 2 × 1 （P20435） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （P34087） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 3 × 1 （P20436） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB9 × 1 （P27999） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 5 × 1 （P22139） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB11 × 1 （P38902） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 4 × 1 （P40422） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-BOX-BINDING PROTEIN × 1 （P13393） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT ALPHA × 1 （P41895） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT BETA × 1 （P41896） NONTEMPLATE DNA × 1 TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA LARGE SUBUNIT × 1 （P32773） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA SUBUNIT 2 × 1 （P32774） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT ALPHA × 1 （P36100） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT BETA × 1 （P36145） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TF2B_YEAST
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–345； UniProt 1–345

TATA-BOX-BINDING PROTEIN

SACCHAROMYCES CEREVISIAE

UniProt P13393

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 20 DNA 2	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （P04050） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （P08518） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （P16370） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB4 × 1 （P20433） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 1 × 1 （P20434） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 2 × 1 （P20435） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （P34087） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 3 × 1 （P20436） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB9 × 1 （P27999） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 5 × 1 （P22139） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB11 × 1 （P38902） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 4 × 1 （P40422） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT ALPHA × 1 （P41895） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT BETA × 1 （P41896） NONTEMPLATE DNA × 1 TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA LARGE SUBUNIT × 1 （P32773） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA SUBUNIT 2 × 1 （P32774） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT ALPHA × 1 （P36100） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT BETA × 1 （P36145） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TBP_YEAST
Isoform	—
PDB实体	15
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240

TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT ALPHA

SACCHAROMYCES CEREVISIAE

UniProt P41895

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 20 DNA 2	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （P04050） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （P08518） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （P16370） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB4 × 1 （P20433） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 1 × 1 （P20434） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 2 × 1 （P20435） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （P34087） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 3 × 1 （P20436） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB9 × 1 （P27999） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 5 × 1 （P22139） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB11 × 1 （P38902） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 4 × 1 （P40422） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-BOX-BINDING PROTEIN × 1 （P13393） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT BETA × 1 （P41896） NONTEMPLATE DNA × 1 TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA LARGE SUBUNIT × 1 （P32773） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA SUBUNIT 2 × 1 （P32774） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT ALPHA × 1 （P36100） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT BETA × 1 （P36145） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	T2FA_YEAST
Isoform	—
PDB实体	16
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 1–735； UniProt 1–735

TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT BETA

SACCHAROMYCES CEREVISIAE

UniProt P41896

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 20 DNA 2	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （P04050） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （P08518） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （P16370） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB4 × 1 （P20433） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 1 × 1 （P20434） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 2 × 1 （P20435） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （P34087） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 3 × 1 （P20436） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB9 × 1 （P27999） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 5 × 1 （P22139） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB11 × 1 （P38902） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 4 × 1 （P40422） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-BOX-BINDING PROTEIN × 1 （P13393） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT ALPHA × 1 （P41895） NONTEMPLATE DNA × 1 TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA LARGE SUBUNIT × 1 （P32773） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA SUBUNIT 2 × 1 （P32774） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT ALPHA × 1 （P36100） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT BETA × 1 （P36145） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	T2FB_YEAST
Isoform	—
PDB实体	17
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 1–400； UniProt 1–400

TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA LARGE SUBUNIT

SACCHAROMYCES CEREVISIAE

UniProt P32773

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 20 DNA 2	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （P04050） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （P08518） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （P16370） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB4 × 1 （P20433） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 1 × 1 （P20434） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 2 × 1 （P20435） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （P34087） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 3 × 1 （P20436） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB9 × 1 （P27999） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 5 × 1 （P22139） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB11 × 1 （P38902） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 4 × 1 （P40422） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-BOX-BINDING PROTEIN × 1 （P13393） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT ALPHA × 1 （P41895） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT BETA × 1 （P41896） NONTEMPLATE DNA × 1 TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA SUBUNIT 2 × 1 （P32774） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT ALPHA × 1 （P36100） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT BETA × 1 （P36145） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TOA1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	19
链与序列区间	作者链 U； PDB构建体 1–286； UniProt 1–286

TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA SUBUNIT 2

SACCHAROMYCES CEREVISIAE

UniProt P32774

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 20 DNA 2	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （P04050） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （P08518） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （P16370） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB4 × 1 （P20433） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 1 × 1 （P20434） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 2 × 1 （P20435） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （P34087） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 3 × 1 （P20436） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB9 × 1 （P27999） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 5 × 1 （P22139） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB11 × 1 （P38902） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 4 × 1 （P40422） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-BOX-BINDING PROTEIN × 1 （P13393） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT ALPHA × 1 （P41895） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT BETA × 1 （P41896） NONTEMPLATE DNA × 1 TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA LARGE SUBUNIT × 1 （P32773） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT ALPHA × 1 （P36100） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT BETA × 1 （P36145） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	T2AG_YEAST
Isoform	—
PDB实体	20
链与序列区间	作者链 V； PDB构建体 1–122； UniProt 1–122

TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT ALPHA

SACCHAROMYCES CEREVISIAE

UniProt P36100

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 20 DNA 2	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （P04050） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （P08518） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （P16370） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB4 × 1 （P20433） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 1 × 1 （P20434） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 2 × 1 （P20435） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （P34087） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 3 × 1 （P20436） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB9 × 1 （P27999） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 5 × 1 （P22139） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB11 × 1 （P38902） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 4 × 1 （P40422） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-BOX-BINDING PROTEIN × 1 （P13393） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT ALPHA × 1 （P41895） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT BETA × 1 （P41896） NONTEMPLATE DNA × 1 TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA LARGE SUBUNIT × 1 （P32773） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA SUBUNIT 2 × 1 （P32774） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT BETA × 1 （P36145） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	T2EA_YEAST
Isoform	—
PDB实体	21
链与序列区间	作者链 W； PDB构建体 1–482； UniProt 1–482

TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT BETA

SACCHAROMYCES CEREVISIAE

UniProt P36145

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 20 DNA 2	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （P04050） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （P08518） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （P16370） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB4 × 1 （P20433） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 1 × 1 （P20434） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 2 × 1 （P20435） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （P34087） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 3 × 1 （P20436） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB9 × 1 （P27999） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 5 × 1 （P22139） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB11 × 1 （P38902） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 4 × 1 （P40422） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-BOX-BINDING PROTEIN × 1 （P13393） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT ALPHA × 1 （P41895） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT BETA × 1 （P41896） NONTEMPLATE DNA × 1 TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA LARGE SUBUNIT × 1 （P32773） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA SUBUNIT 2 × 1 （P32774） TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT ALPHA × 1 （P36100） ZINC ION × 10 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	T2EB_YEAST
Isoform	—
PDB实体	22
链与序列区间	作者链 X； PDB构建体 1–328； UniProt 1–328

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5fyw
沉积日期 deposition_date	2016-03-10
结构标题 title	Transcription initiation complex structures elucidate DNA opening (OC)
关键词 keywords	GENE EXPRESSION, TRANSCRIPTION INITIATION, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5fyw__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5fyw__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5fyw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	59.82 Å
Rg（电子密度）	59.25 Å
总 Rg	59.26 Å
原子数	41710
残基数	5270
排除体积	736380 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5fyw__assembly_1__model_1`	22-meric （22）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (24)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1
分子量 formula_weight	191821.6 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	41710

MVGQQYSSAPLRTVKEVQFGLFSPEEVRAISVAKIRFPETMDETQTRAKIGGLNDPRLGSIDRNLKCQTCQEGMNECPGHFGHIDLAKPVFHVGFIAKIKKVCECVCMHCGKLLLDEHNELMRQALAIKDSKKRFAAIWTLCKTKMVCETDVPSEDDPTQLVSRGGCGNTQPTIRKDGLKLVGSWKKDRATGDADEPELRVLSTEEILNIFKHISVKDFTSLGFNEVFSRPEWMILTCLPVPPPPVRPSISFNESQRGEDDLTFKLADILKANISLETLEHNGAPHHAIEEAESLLQFHVATYMDNDIAGQPQALQKSGRPVKSIRARLKGKEGRIRGNLMGKRVDFSARTVISGDPNLELDQVGVPKSIAKTLTYPEVVTPYNIDRLTQLVRNGPNEHPGAKYVIRDSGDRIDLRYSKRAGDIQLQYGWKVERHIMDNDPVLFNRQPSLHKMSMMAHRVKVIPYSTFRLNLSVTSPYNADFDGDEMNLHVPQSEETRAELSQLCAVPLQIVSPQSNKPCMGIVQDTLCGIRKLTLRDTFIELDQVLNMLYWVPDWDGVIPTPAIIKPKPLWSGKQILSVAIPNGIHLQRFDEGTTLLSPKDNGMLIIDGQIIFGVVEKKTVGSSNGGLIHVVTREKGPQVCAKLFGNIQKVVNFWLLHNGFSTGIGDTIADGPTMREITETIAEAKKKVLDVTKEAQANLLTAKHGMTLRESFEDNVVRFLNEARDKAGRLAEVNLKDLNNVKQMVMAGSKGSFINIAQMSACVGQQSVEGKRIAFGFVDRTLPHFSKDDYSPESKGFVENSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDTAVKTAETGYIQRRLVKALEDIMVHYDNTTRNSLGNVIQFIYGEDGMDAAHIEKQSLDTIGGSDAAFEKRYRVDLLNTDHTLDPSLLESGSEILGDLKLQVLLDEEYKQLVKDRKFLREVFVDGEANWPLPVNIRRIIQNAQQTFHIDHTKPSDLTIKDIVLGVKDLQENLLVLRGKNEIIQNAQRDAVTLFCCLLRSRLATRRVLQEYRLTKQAFDWVLSNIEAQFLRSVVHPGEMVGVLAAQSIGEPATQMTLNTFHFAGVASKKVTSGVPRLKEILNVAKNMKTPSLTVYLEPGHAADQEQAKLIRSAIEHTTLKSVTIASEIYYDPDPRSTVIPEDEEIIQLHFSLLDEEAEQSFDQQSPWLLRLELDRAAMNDKDLTMGQVGERIKQTFKNDLFVIWSEDNDEKLIIRCRVVRPKSLDAETEAEEDHMLKKIENTMLENITLRGVENIERVVMMKYDRKVPSPTGEYVKEPEWVLETDGVNLSEVMTVPGIDPTRIYTNSFIDIMEVLGIEAGRAALYKEVYNVIASDGSYVNYRHMALLVDVMTTQGGLTSVTRHGFNRSNTGALMRCSFEETVEILFEAGASAELDDCRGVSENVILGQMAPIGTGAFDVMIDEESLVKYMPEQKITEIEDGQDGGVTPYSNESGLVNADLDVKDELMFSPLVDSGSNDAMAGGFTAYGGADYGEATSPFGAYGEAPTSPGFGVSSPGFSPTSPTYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPGYSPGSPAYSPKQDEQKHNENENSR

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2
分子量 formula_weight	138937.3 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MSDLANSEKYYDEDPYGFEDESAPITAEDSWAVISAFFREKGLVSQQLDSFNQFVDYTLQDIICEDSTLILEQLAQHTTESDNISRKYEISFGKIYVTKPMVNESDGVTHALYPQEARLRNLTYSSGLFVDVKKRTYEAIDVPGRELKYELIAEESEDDSESGKVFIGRLPIMLRSKNCYLSEATESDLYKLKECPFDMGGYFIINGSEKVLIAQERSAGNIVQVFKKAAPSPISHVAEIRSALEKGSRFISTLQVKLYGREGSSARTIKATLPYIKQDIPIVIIFRALGIIPDGEILEHICYDVNDWQMLEMLKPCVEDGFVIQDRETALDFIGRRGTALGIKKEKRIQYAKDILQKEFLPHITQLEGFESRKAFFLGYMINRLLLCALDRKDQDDRDHFGKKRLDLAGPLLAQLFKTLFKKLTKDIFRYMQRTVEEAHDFNMKLAINAKTITSGLKYALATGNWGEQKKAMSSRAGVSQVLNRYTYSSTLSHLRRTNTPIGRDGKLAKPRQLHNTHWGLVCPAETPEGQACGLVKNLSLMSCISVGTDPMPIITFLSEWGMEPLEDYVPHQSPDATRVFVNGVWHGVHRNPARLMETLRTLRRKGDINPEVSMIRDIREKELKIFTDAGRVYRPLFIVEDDESLGHKELKVRKGHIAKLMATEYQDIEGGFEDVEEYTWSSLLNEGLVEYIDAEEEESILIAMQPEDLEPAEANEENDLDVDPAKRIRVSHHATTFTHCEIHPSMILGVAASIIPFPDHNQSPRNTYQSAMGKQAMGVFLTNYNVRMDTMANILYYPQKPLGTTRAMEYLKFRELPAGQNAIVAIACYSGYNQEDSMIMNQSSIDRGLFRSLFFRSYMDQEKKYGMSITETFEKPQRTNTLRMKHGTYDKLDDDGLIAPGVRVSGEDVIIGKTTPISPDEEELGQRTAYHSKRDASTPLRSTENGIVDQVLVTTNQDGLKFVKVRVRTTKIPQIGDKFASRHGQKGTIGITYRREDMPFTAEGIVPDLIINPHAIPSRMTVAHLIECLLSKVAALSGNEGDASPFTDITVEGISKLLREHGYQSRGFEVMYNGHTGKKLMAQIFFGPTYYQRLRHMVDDKIHARARGPMQVLTRQPVEGRSRDGGLRFGEMERDCMIAHGAASFLKERLMEASDAFRVHICGICGLMTVIAKLNHNQFECKGCDNKIDIYQIHIPYAAKLLFQELMAMNITPRLYTDRSRDF

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3
分子量 formula_weight	35330.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MSEEGPQVKIREASKDNVDFILSNVDLAMANSLRRVMIAEIPTLAIDSVEVETNTTVLADEFIAHRLGLIPLQSMDIEQLEYSRDCFCEDHCDKCSVVLTLQAFGESESTTNVYSKDLVIVSNLMGRNIGHPIIQDKEGNGVLICKLRKGQELKLTCVAKKGIAKEHAKWGPAAAIEFEYDPWNKLKHTDYWYEQDSAKEWPQSKNCEYEDPPNEGDPFDYKAQADTFYMNVESVGSIPVDQVVVRGIDTLQKKVASILLALTQMDQDKVNFASGDNNTASNMLGSNEDVMMTGAEQDPYSNASQMGNTGSGGYDNAW

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB4
分子量 formula_weight	25451.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MNVSTSTFQTRRRRLKKVEEEENAATLQLGQEFQLKQINHQGEEEELIALNLSEARLVIKEALVERRRAFKRSQKKHKKKHLKHENANDETTAVEDEDDDLDEDDVNADDDDFMHSETREKELESIDVLLEQTTGGNNKDLKNTMQYLTNFSRFRDQETVGAVIQLLKSTGLHPFEVAQLGSLACDTADEAKTLIPSLNNKISDDELERILKELSNLETLY

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 1
分子量 formula_weight	25117.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MDQENERNISRLWRAFRTVKEMVKDRGYFITQEEVELPLEDFKAKYCDSMGRPQRKMMSFQANPTEESISKFPDMGSLWVEFCDEPSVGVKTMKTFVIHIQEKNFQTGIFVYQNNITPSAMKLVPSIPPATIETFNEAALVVNITHHELVPKHIRLSSDEKRELLKRYRLKESQLPRIQRADPVALYLGLKRGEVVKIIRKSETSGRYASYRICM

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 2
分子量 formula_weight	17931.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MSDYEEAFNDGNENFEDFDVEHFSDEETYEEKPQFKDGETTDANGKTIVTGGNGPEDFQQHEQIRRKTLKEKAIPKDQRATTPYMTKYERARILGTRALQISMNAPVFVDLEGETDPLRIAMKELAEKKIPLVIRRYLPDGSFEDWSVEELIVDL

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7
分子量 formula_weight	19081.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MFFIKDLSLNITLHPSFFGPRMKQYLKTKLLEEVEGSCTGKFGYILCVLDYDNIDIQRGRILPTDGSAEFNVKYRAVVFKPFKGEVVDGTVVSCSQHGFEVQVGPMKVFVTKHLMPQDLTFNAGSNPPSYQSSEDVITIKSRIRVKIEGCISQVSSIHAIGSIKEDYLGAI

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 3
分子量 formula_weight	16525.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MSNTLFDDIFQVSEVDPGRYNKVCRIEAASTTQDQCKLTLDINVELFPVAAQDSLTVTIASSLNLEDTPANDSSATRSWRPPQAGDRSLADDYDYVMYGTAYKFEEVSKDLIAVYYSFGGLLMRLEGNYRNLNNLKQENAYLLIRR

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB9
分子量 formula_weight	14308.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MTTFRFCRDCNNMLYPREDKENNRLLFECRTCSYVEEAGSPLVYRHELITNIGETAGVVQDIGSDPTLPRSDRECPKCHSRENVFFQSQQRRKDTSMVLFFVCLSCSHIFTSDQKNKRTQFS

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 5
分子量 formula_weight	8290.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MIVPVRCFSCGKVVGDKWESYLNLLQEDELDEGTALSRLGLKRYCCRRMILTHVDLIEKFLRYNPLEKRD

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB11
分子量 formula_weight	13633.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MNAPDRFELFLLGEGESKLKIDPDTKAPNAVVITFEKEDHTLGNLIRAELLNDRKVLFAAYKVEHPFFARFKLRIQTTEGYDPKDALKNACNSIINKLGALKTNFETEWNLQTLAADDAF

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 4
分子量 formula_weight	7730.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MSREGFQIPTNLDAAAAGTSQARTATLKYICAECSSKLSLSRTDAVRCKDCGHRILLKARTKRLVQFEAR

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIB
分子量 formula_weight	38257.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MMTRESIDKRAGRRGPNLNIVLTCPECKVYPPKIVERFSEGDVVCALCGLVLSDKLVDTRSEWRTFSNDDHNGDDPSRVGEASNPLLDGNNLSTRIGKGETTDMRFTKELNKAQGKNVMDKKDNEVQAAFAKITMLCDAAELPKIVKDCAKEAYKLCHDEKTLKGKSMESIMAASILIGCRRAEVARTFKEIQSLIHVKTKEFGKTLNIMKNILRGKSEDGFLKIDTDNMSGAQNLTYIPRFCSHLGLPMQVTTSAEYTAKKCKEIKEIAGKSPITIAVVSIYLNILLFQIPITAAKVGQTLQVTEGTIKSGYKILYEHRDKLVDPQLIANGVVSLDNLPGVEKK

来源 Source

来源生物 organism	SACCHAROMYCES CEREVISIAE
通用名 common_name	;BAKER'S YEAST ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	NONTEMPLATE DNA
分子量 formula_weight	22424.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	N

CGAGAACAGTAGCACGCTGTGTATATAATAGTGTGTTGTACATAGCGGAGGTCGGTGGGGCACAACTGCGCT

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	TATA-BOX-BINDING PROTEIN
分子量 formula_weight	27042.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O

MADEERLKEFKEANKIVFDPNTRQVWENQNRDGTKPATTFQSEEDIKRAAPESEKDTSATSGIVPTLQNIVATVTLGCRLDLKTVALHARNAEYNPKRFAAVIMRIREPKTTALIFASGKMVVTGAKSEDDSKLASRKYARIIQKIGFAAKFTDFKIQNIVGSCDVKFPIRLEGLAFSHGTFSSYEPELFPGLIYRMVKPKIVLLIFVSGKIVLTGAKQREEIYQAFEAIYPVLSEFRKM

来源 Source

来源生物 organism	SACCHAROMYCES CEREVISIAE
通用名 common_name	;BAKER'S YEAST ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT ALPHA
分子量 formula_weight	82320.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q

MSRRNPPGSRNGGGPTNASPFIKRDRMRRNFLRMRMGQNGSNSSSPGVPNGDNSRGSLVKKDDPEYAEEREKMLLQIGVEADAGRSNVKVKDEDPNEYNEFPLRAIPKEDLENMRTHLLKFQSKKKINPVTDFHLPVRLHRKDTRNLQFQLTRAEIVQRQKEISEYKKKAEQERSTPNSGGMNKSGTVSLNNTVKDGSQTPTVDSVTKDNTANGVNSSIPTVTGSSVPPASPTTVSAVESNGLSNGSTSAANGLDGNASTANLANGRPLVTKLEDAGPAEDPTKVGMVKYDGKEVTNEPEFEEGTMDPLADVAPDGGGRAKRGNLRRKTRQLKVLDENAKKLRFEEFYPWVMEDFDGYNTWVGSYEAGNSDSYVLLSVEDDGSFTMIPADKVYKFTARNKYATLTIDEAEKRMDKKSGEVPRWLMKHLDNIGTTTTRYDRTRRKLKAVADQQAMDEDDRDDNSEVELDYDEEFADDEEAPIIDGNEQENKESEQRIKKEMLQANAMGLRDEEAPSENEEDELFGEKKIDEDGERIKKALQKTELAALYSSDENEINPYLSESDIENKENESPVKKEEDSDTLSKSKRSSPKKQQKKATNAHVHKEPTLRVKSIKNCVIILKGDKKILKSFPEGEWNPQTTKAVDSSNNASNTVPSPIKQEEGLNSTVAEREETPAPTITEKDIIEAIGDGKVNIKEFGKFIRRKYPGAENKKLMFAIVKKLCRKVGNDHMELKKE

来源 Source

来源生物 organism	SACCHAROMYCES CEREVISIAE
通用名 common_name	;BAKER'S YEAST ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF SUBUNIT BETA
分子量 formula_weight	46684.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.12
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

MSSGSAGAPALSNNSTNSVAKEKSGNISGDEYLSQEEEVFDGNDIENNETKVYEESLDLDLERSNRQVWLVRLPMFLAEKWRDRNNLHGQELGKIRINKDGSKITLLLNENDNDSIPHEYDLELTKKVVENEYVFTEQNLKKYQQRKKELEADPEKQRQAYLKKQEREEELKKKQQQQKRRNNRKKFNHRVMTDRDGRDRYIPYVKTIPKKTAIVGTVCHECQVMPSMNDPNYHKIVEQRRNIVKLNNKERITTLDETVGVTMSHTGMSMRSDNSNFLKVGREKAKSNIKSIRMPKKEILDYLFKLFDEYDYWSLKGLKERTRQPEAHLKECLDKVATLVKKGPYAFKYTLRPEYKKLKEEERKATLGELADEQTGSAGDNAQGDAEADLEDEIEMEDVV

来源 Source

来源生物 organism	SACCHAROMYCES CEREVISIAE
通用名 common_name	;BAKER'S YEAST ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 18 Entity 18 polymer

描述 description	NONTEMPLATE DNA
分子量 formula_weight	22143.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	T

AGCGCAGTTGTGCTATGATATTTTTATGTATGTACAACACACTATTATATACACAGCGTGCTACTGTTCTCG

实体 19 Entity 19 polymer

描述 description	TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA LARGE SUBUNIT
分子量 formula_weight	32230.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U

MSNAEASRVYEIIVESVVNEVREDFENAGIDEQTLQDLKNIWQKKLTETKVTTFSWDNQFNEGNINGVQNDLNFNLATPGVNSSEFNIKEENTGNEGLILPNINSNNNIPHSGETNINTNTVEATNNSGATLNTNTSGNTNADVTSQPKIEVKPEIELTINNANITTVENIDDESEKKDDEEKEEDVEKTRKEKEQIEQVKLQAKKEKRSALLDTDEVGSELDDSDDDYLISEGEEDGPDENLMLCLYDKVTRTKARWKCSLKDGVVTINRNDYTFQKAQVEAEWV

来源 Source

来源生物 organism	SACCHAROMYCES CEREVISIAE
通用名 common_name	;BAKER'S YEAST ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 20 Entity 20 polymer

描述 description	TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIA SUBUNIT 2
分子量 formula_weight	13473.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V

MAVPGYYELYRRSTIGNSLVDALDTLISDGRIEASLAMRVLETFDKVVAETLKDNTQSKLTVKGNLDTYGFCDDVWTFIVKNCQVTVEDSHRDASQNGSGDSQSVISVDKLRIVACNSKKSE

来源 Source

来源生物 organism	SACCHAROMYCES CEREVISIAE
通用名 common_name	;BAKER'S YEAST ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 21 Entity 21 polymer

描述 description	TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT ALPHA
分子量 formula_weight	54804.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	W

MDRPIDDIVKNLLKFVVRGFYGGSFVLVLDAILFHSVLAEDDLKQLLSINKTELGPLIARLRSDRLISIHKQREYPPNSKSVERVYYYVKYPHAIDAIKWKVHQVVQRLKDDLDKNSEPNGYMCPICLTKYTQLEAVQLLNFDRTEFLCSLCDEPLVEDDSGKKNKEKQDKLNRLMDQIQPIIDSLKKIDDSRIEENTFEIALARLIPPQNQSHAAYTYNPKKGSTMFRPGDSAPLPNLMGTALGNDSSRRAGANSQATLHINITTASDEVAQRELQERQAEEKRKQNAVPEWHKQSTIGKTALGRLDNEEEFDPVVTASAMDSINPDNEPAQETSYQNNRTLTEQEMEERENEKTLNDYYAALAKKQAKLNKEEEEEEEEEEDEEEEEEEEMEDVMDDNDETARENALEDEFEDVTDTAGTAKTESNTSNDVKQESINDKTEDAVNATATASGPSANAKPNDGDDDDDDDDDEMDIEFEDV

来源 Source

来源生物 organism	SACCHAROMYCES CEREVISIAE
通用名 common_name	;BAKER'S YEAST ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 22 Entity 22 polymer

描述 description	TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIE SUBUNIT BETA
分子量 formula_weight	37050.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X

MSKNRDPLLANLNAFKSKVKSAPVIAPAKVGQKKTNDTVITIDGNTRKRTASERAQENTLNSAKNPVLVDIKKEAGSNSSNAISLDDDDDDEDFGSSPSKKVRPGSIAAAALQANQTDISKSHDSSKLLWATEYIQKKGKPVLVNELLDYLSMKKDDKVIELLKKLDRIEFDPKKGTFKYLSTYDVHSPSELLKLLRSQVTFKGISCKDLKDGWPQCDETINQLEEDSKILVLRTKKDKTPRYVWYNSGGNLKCIDEEFVKMWENVQLPQFAELPRKLQDLGLKPASVDPATIKRQTKRVEVKKKRQRKGKITNTHMTGILKDYSHRV

来源 Source

来源生物 organism	SACCHAROMYCES CEREVISIAE
通用名 common_name	;BAKER'S YEAST ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 23 Entity 23 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

实体 24 Entity 24 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.350 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	4.35 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	11231

Transcription initiation complex structures elucidate DNA opening (OC)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体