5h7d

Crystal structure of the YgjG-protein A-Zpa963-calmodulin complex

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 260.9 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Putrescine aminotransferase,Immunoglobulin G-binding protein A

Staphylococcus aureus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 220–267 链 B； UniProt 220–267 链 C； UniProt 220–267 链 D； UniProt 220–267	片段：UNP RESIDUES 7-453,UNP RESIDUES 220-267 突变：N222V, G240A	Zpa963,Calmodulin × 4 （O16305） CA CALCIUM ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；296 K；0.1M HEPES pH 7.5, 20.7% PEG 300, 99mM calcium chloride	分辨率 2.57 Å R-free 0.241
2	信息不足异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 I； UniProt 220–267 链 J； UniProt 220–267 链 M； UniProt 220–267 链 N； UniProt 220–267	片段：UNP RESIDUES 7-453,UNP RESIDUES 220-267 突变：N222V, G240A	Zpa963,Calmodulin × 4 （O16305） CA CALCIUM ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；296 K；0.1M HEPES pH 7.5, 20.7% PEG 300, 99mM calcium chloride	分辨率 2.57 Å R-free 0.241

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5H7D	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1BDC STAPHYLOCOCCUS AUREUS PROTEIN A, IMMUNOGLOBULIN-BINDING B DOMAIN, NMR, 10 STRUCTURES 提交 1996-06-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 212–270（59 aa）片段：B DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；303 K	分辨率未提供
1BDD STAPHYLOCOCCUS AUREUS PROTEIN A, IMMUNOGLOBULIN-BINDING B DOMAIN, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1996-06-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 212–270（59 aa）片段：B DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；303 K	分辨率未提供
1EDI STAPHYLOCOCCAL PROTEIN A E-DOMAIN (180), NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1996-10-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 37–92（56 aa）片段：E-DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.7；298 K	分辨率未提供
1EDJ STAPHYLOCOCCAL PROTEIN A E-DOMAIN (180), NMR, 20 STRUCTURES 提交 1996-10-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 37–92（56 aa）片段：E-DOMAIN (180)	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.7；298 K	分辨率未提供
1EDK STAPHYLOCOCCAL PROTEIN A E-DOMAIN (-60), NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1996-07-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 37–92（56 aa）片段：E-DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.7；298 K	分辨率未提供
1EDL STAPHYLOCOCCAL PROTEIN A E-DOMAIN (-60), NMR, 22 STRUCTURES 提交 1996-07-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 37–92（56 aa）片段：E-DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.7；298 K	分辨率未提供
1LP1 Protein Z in complex with an in vitro selected affibody 提交 2002-05-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 212–269（58 aa）片段：RESIDUES 2-58	突变：A1V, G29A	SO4 SULFATE ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；MgSO4, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.256
1LP1 Protein Z in complex with an in vitro selected affibody 提交 2002-05-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 212–269（58 aa）片段：RESIDUES 2-58	突变：A1V, G29A	SO4 SULFATE ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；MgSO4, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.256
1Q2N REFINED Solution NMR structure of the Z domain of STAPHYLOCOCCAL PROTEIN A 提交 2003-07-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 212–269（58 aa）片段：residues 212-269	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM NH4OAc；压力 1 NMR样品组成 1mM Z domain U-15N,13C; 20mM NH4OAc buffer; 95% H2O, 5% D2O. \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
1SS1 STAPHYLOCOCCAL PROTEIN A, B-DOMAIN, Y15W MUTANT, NMR, 25 STRUCTURES 提交 2004-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 212–270（59 aa）片段：B DOMAIN	突变：Y15W	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM NaCl / 50 mM acetate；压力 ambient NMR样品组成 2mM sample, U-13C, U-15N; 50 mM D-acetate buffer, 100 mM NaCl, pH 5.5; 90% H2O, 10% D2O \| 90% H20, 10% D20	分辨率未提供
2JWD protein A 提交 2007-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 213–269（57 aa）片段：B domain	突变：Y15W	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 ambient NMR样品组成 20mM sodium acetate, 100mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2M5A Protein A binding by an engineered Affibody molecule 提交 2013-02-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 213–269（57 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.095；压力 ambient NMR样品组成 0.5 to 1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Z domain, 25% molar excess mM ZpA963, 93% H2O/7% D2O \| 93% H2O/7% D2O NMR样品组成 0.5 to 1.0 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] ZpA963, 25 5 molar excess mM Z domain, 93% H2O/7% D2O \| 93% H2O/7% D2O	分辨率未提供
2SPZ STAPHYLOCOCCAL PROTEIN A, Z-DOMAIN, NMR, 10 STRUCTURES 提交 1998-07-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 212–269（58 aa）片段：Z DOMAIN	突变：A1V, G29A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）10 MILLIMOLAR K2HPO4；压力 1	分辨率未提供
3MZW HER2 extracelluar region with affinity matured 3-helix affibody ZHER2:342 提交 2010-05-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 212–269（58 aa）片段：B 4 repeat domain residues 212-269	突变：A212V, Q220M, Q221R, F224Y, Y225W, L228A, H229L, E235N, E236Q, R238K, N239R, G240A, Q243R, K246Y	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；279 K；0.05M sodium chloride, 7.5% PEG3350, 0.1M ammonium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K	分辨率 2.90 Å R-free 0.278
4NPD High-resolution structure of C domain of staphylococcal protein A at cryogenic temperature 提交 2013-11-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 270–327（58 aa）片段：UNP residues 270-327	未记录	ZN ZINC ION × 2 SCN THIOCYANATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；Na Thiocyanate, PEG 3350, Glycerol, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 0.90 Å R-free 0.130
4NPE High-resolution structure of C domain of staphylococcal protein A at room temperature 提交 2013-11-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 270–327（58 aa）片段：UNP residues 270-327	未记录	ZN ZINC ION × 1 SCN THIOCYANATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；Na Thiocyanate, PEG 3350, Glycerol, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.42 Å R-free 0.143
4NPF High-resolution structure of two tandem B domains of staphylococcal protein A connected by the conserved linker 提交 2013-11-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 Y 154–269（116 aa）片段：UNP residues 212-323	突变：W13F, W113F	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；Ammonium Sulfate, MES, pH 6, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K	分辨率 1.49 Å R-free 0.185
4NPF High-resolution structure of two tandem B domains of staphylococcal protein A connected by the conserved linker 提交 2013-11-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 X 154–269（116 aa）片段：UNP residues 212-323	突变：W13F, W113F	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；Ammonium Sulfate, MES, pH 6, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K	分辨率 1.49 Å R-free 0.185
4WWI Crystal structure of the C domain of staphylococcal protein A in complex with the Fc fragment of human IgG at 2.3 Angstrom resolution 提交 2014-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 270–327（58 aa）片段：UNP residues 270-327	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；NaOAc, ammonium sulfate, PEG 5K MME, glycerol	分辨率 2.31 Å R-free 0.251
4WWI Crystal structure of the C domain of staphylococcal protein A in complex with the Fc fragment of human IgG at 2.3 Angstrom resolution 提交 2014-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 270–327（58 aa）片段：UNP residues 270-327	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；NaOAc, ammonium sulfate, PEG 5K MME, glycerol	分辨率 2.31 Å R-free 0.251
4WWI Crystal structure of the C domain of staphylococcal protein A in complex with the Fc fragment of human IgG at 2.3 Angstrom resolution 提交 2014-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 270–327（58 aa）片段：UNP residues 270-327	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；NaOAc, ammonium sulfate, PEG 5K MME, glycerol	分辨率 2.31 Å R-free 0.251
4ZMD C domain of staphylococcal protein A mutant - Q9W 提交 2015-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 270–327（58 aa）片段：UNP residues 270-327	突变：Q9W	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；PEG 3350, sodium thiocyanate	分辨率 1.87 Å R-free 0.256
4ZMD C domain of staphylococcal protein A mutant - Q9W 提交 2015-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 270–327（58 aa）片段：UNP residues 270-327	突变：Q9W	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；PEG 3350, sodium thiocyanate	分辨率 1.87 Å R-free 0.256
4ZNC Fc fragment of human IgG in complex with the C domain of staphylococcal protein A mutant - Q9W 提交 2015-05-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 270–327（58 aa）片段：UNP residues 270-327	突变：Q9W	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；PEG 5000 MME, ammonium sulfate, sodium acetate	分辨率 2.28 Å R-free 0.242
4ZNC Fc fragment of human IgG in complex with the C domain of staphylococcal protein A mutant - Q9W 提交 2015-05-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 270–327（58 aa）片段：UNP residues 270-327	突变：Q9W	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；PEG 5000 MME, ammonium sulfate, sodium acetate	分辨率 2.28 Å R-free 0.242
4ZNC Fc fragment of human IgG in complex with the C domain of staphylococcal protein A mutant - Q9W 提交 2015-05-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 270–327（58 aa）片段：UNP residues 270-327	突变：Q9W	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；PEG 5000 MME, ammonium sulfate, sodium acetate	分辨率 2.28 Å R-free 0.242
5CBN Fusion protein of mbp3-16 and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus with chemical cross-linker EY-CBS 提交 2015-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 218–269（52 aa）片段：B4 domain (UNP RESIDUES 218-269)	突变：E126A, N129A, E133C, G147A	EYC 2,2'-ethyne-1,2-diylbis{5-[(chloroacetyl)amino]benzenesulfonic acid} × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；277 K；36% w/v PEG 2000, 0.2M magnesium chloride hexahydrate	分辨率 2.30 Å R-free 0.260
5CBO Fusion protein of mbp3-16 and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus 提交 2015-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 102–153（52 aa）片段：B4 domain (UNP RESIDUES 102-153)	突变：D1219A, S1222A, E1226C, N1229H, E1236A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；298 K；34% w/v PPG P-400 10mM Hexaamine cobalt(III) chloride	分辨率 2.80 Å R-free 0.254
5CBO Fusion protein of mbp3-16 and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus 提交 2015-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 10 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 J 102–153（52 aa）片段：B4 domain (UNP RESIDUES 102-153)	突变：D1219A, S1222A, E1226C, N1229H, E1236A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；298 K；34% w/v PPG P-400 10mM Hexaamine cobalt(III) chloride	分辨率 2.80 Å R-free 0.254
5CBO Fusion protein of mbp3-16 and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus 提交 2015-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 11 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 K 102–153（52 aa）片段：B4 domain (UNP RESIDUES 102-153)	突变：D1219A, S1222A, E1226C, N1229H, E1236A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；298 K；34% w/v PPG P-400 10mM Hexaamine cobalt(III) chloride	分辨率 2.80 Å R-free 0.254
5CBO Fusion protein of mbp3-16 and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus 提交 2015-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 12 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 L 102–153（52 aa）片段：B4 domain (UNP RESIDUES 102-153)	突变：D1219A, S1222A, E1226C, N1229H, E1236A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；298 K；34% w/v PPG P-400 10mM Hexaamine cobalt(III) chloride	分辨率 2.80 Å R-free 0.254
5CBO Fusion protein of mbp3-16 and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus 提交 2015-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 102–153（52 aa）片段：B4 domain (UNP RESIDUES 102-153)	突变：D1219A, S1222A, E1226C, N1229H, E1236A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；298 K；34% w/v PPG P-400 10mM Hexaamine cobalt(III) chloride	分辨率 2.80 Å R-free 0.254
5CBO Fusion protein of mbp3-16 and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus 提交 2015-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 102–153（52 aa）片段：B4 domain (UNP RESIDUES 102-153)	突变：D1219A, S1222A, E1226C, N1229H, E1236A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；298 K；34% w/v PPG P-400 10mM Hexaamine cobalt(III) chloride	分辨率 2.80 Å R-free 0.254
5CBO Fusion protein of mbp3-16 and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus 提交 2015-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 102–153（52 aa）片段：B4 domain (UNP RESIDUES 102-153)	突变：D1219A, S1222A, E1226C, N1229H, E1236A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；298 K；34% w/v PPG P-400 10mM Hexaamine cobalt(III) chloride	分辨率 2.80 Å R-free 0.254
5CBO Fusion protein of mbp3-16 and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus 提交 2015-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 102–153（52 aa）片段：B4 domain (UNP RESIDUES 102-153)	突变：D1219A, S1222A, E1226C, N1229H, E1236A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；298 K；34% w/v PPG P-400 10mM Hexaamine cobalt(III) chloride	分辨率 2.80 Å R-free 0.254
5CBO Fusion protein of mbp3-16 and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus 提交 2015-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 F 102–153（52 aa）片段：B4 domain (UNP RESIDUES 102-153)	突变：D1219A, S1222A, E1226C, N1229H, E1236A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；298 K；34% w/v PPG P-400 10mM Hexaamine cobalt(III) chloride	分辨率 2.80 Å R-free 0.254
5CBO Fusion protein of mbp3-16 and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus 提交 2015-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 G 102–153（52 aa）片段：B4 domain (UNP RESIDUES 102-153)	突变：D1219A, S1222A, E1226C, N1229H, E1236A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；298 K；34% w/v PPG P-400 10mM Hexaamine cobalt(III) chloride	分辨率 2.80 Å R-free 0.254
5CBO Fusion protein of mbp3-16 and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus 提交 2015-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 H 102–153（52 aa）片段：B4 domain (UNP RESIDUES 102-153)	突变：D1219A, S1222A, E1226C, N1229H, E1236A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；298 K；34% w/v PPG P-400 10mM Hexaamine cobalt(III) chloride	分辨率 2.80 Å R-free 0.254
5CBO Fusion protein of mbp3-16 and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus 提交 2015-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 9 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 I 102–153（52 aa）片段：B4 domain (UNP RESIDUES 102-153)	突变：D1219A, S1222A, E1226C, N1229H, E1236A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；298 K；34% w/v PPG P-400 10mM Hexaamine cobalt(III) chloride	分辨率 2.80 Å R-free 0.254
5COC Fusion protein of human calmodulin and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus 提交 2015-07-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 213–267（55 aa）片段：B4 domain (UNP RESIDUES 213-267),N-terminal (UNP RESIDUES 5-78)	突变：G240A, K261C, L1005A, T1006A, Q1009C	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；298 K；10% w/v PEG 1000, 10% w/v PEG 8000	分辨率 2.67 Å R-free 0.259
5EWX Fusion protein of T4 lysozyme and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus with chemical cross-linker EY-CBS 提交 2015-11-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 212–266（55 aa）片段：UNP RESIDUES 1-35, 219-266, 38-164	突变：A1212V, G1240A, E1258C, K1261A, L1262A, N40C, C54T, C97A, K162A	EYC 2,2'-ethyne-1,2-diylbis{5-[(chloroacetyl)amino]benzenesulfonic acid} × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.5；277 K；1.84M Na/K Phosphate, pH 7.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.253
5EWX Fusion protein of T4 lysozyme and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus with chemical cross-linker EY-CBS 提交 2015-11-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 212–266（55 aa）片段：UNP RESIDUES 1-35, 219-266, 38-164	突变：A1212V, G1240A, E1258C, K1261A, L1262A, N40C, C54T, C97A, K162A	EYC 2,2'-ethyne-1,2-diylbis{5-[(chloroacetyl)amino]benzenesulfonic acid} × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.5；277 K；1.84M Na/K Phosphate, pH 7.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.253
5H75 Crystal structure of the MrsD-Protein A fusion protein 提交 2016-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 223–269（47 aa）片段：UNP RESIDUES 1-184,223-269 链 B 223–269（47 aa）片段：UNP RESIDUES 1-184,223-269 链 C 223–269（47 aa）片段：UNP RESIDUES 1-184,223-269 链 D 223–269（47 aa）片段：UNP RESIDUES 1-184,223-269	突变：K182Q,G240A 突变：K182Q,G240A 突变：K182Q,G240A 突变：K182Q,G240A	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；277 K；0.94M sodium citrate pH 5.5	分辨率 2.74 Å R-free 0.243
5H76 Crystal structure of the DARPin-Protein A fusion protein 提交 2016-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 235–267（33 aa）片段：RESIDUES 9-176,177-209 (UNP RESIDUES 235-267)	突变：G182A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 9.5；296 K；0.63M sodium potassium phosphate pH 9.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.250
5H76 Crystal structure of the DARPin-Protein A fusion protein 提交 2016-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 235–267（33 aa）片段：RESIDUES 9-176,177-209 (UNP RESIDUES 235-267)	突变：G182A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 9.5；296 K；0.63M sodium potassium phosphate pH 9.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.250
5H76 Crystal structure of the DARPin-Protein A fusion protein 提交 2016-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 235–267（33 aa）片段：RESIDUES 9-176,177-209 (UNP RESIDUES 235-267)	突变：G182A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 9.5；296 K；0.63M sodium potassium phosphate pH 9.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.250
5H77 Crystal structure of the PKA-protein A fusion protein 提交 2016-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 220–268（49 aa）片段：UNP RESIDUES 5-41,UNP RESIDUES 220-268 链 B 220–268（49 aa）片段：UNP RESIDUES 5-41,UNP RESIDUES 220-268	突变：G222A, G240A 突变：G222A, G240A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 0.68M sodium citrate pH 4.5	分辨率 3.20 Å R-free 0.284
5H77 Crystal structure of the PKA-protein A fusion protein 提交 2016-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 220–268（49 aa）片段：UNP RESIDUES 5-41,UNP RESIDUES 220-268 链 D 220–268（49 aa）片段：UNP RESIDUES 5-41,UNP RESIDUES 220-268	突变：G222A, G240A 突变：G222A, G240A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 0.68M sodium citrate pH 4.5	分辨率 3.20 Å R-free 0.284
5H77 Crystal structure of the PKA-protein A fusion protein 提交 2016-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 220–268（49 aa）片段：UNP RESIDUES 5-41,UNP RESIDUES 220-268 链 F 220–268（49 aa）片段：UNP RESIDUES 5-41,UNP RESIDUES 220-268	突变：G222A, G240A 突变：G222A, G240A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 0.68M sodium citrate pH 4.5	分辨率 3.20 Å R-free 0.284
5H77 Crystal structure of the PKA-protein A fusion protein 提交 2016-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 220–268（49 aa）片段：UNP RESIDUES 5-41,UNP RESIDUES 220-268 链 H 220–268（49 aa）片段：UNP RESIDUES 5-41,UNP RESIDUES 220-268	突变：G222A, G240A 突变：G222A, G240A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 0.68M sodium citrate pH 4.5	分辨率 3.20 Å R-free 0.284
5H77 Crystal structure of the PKA-protein A fusion protein 提交 2016-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 220–268（49 aa）片段：UNP RESIDUES 5-41,UNP RESIDUES 220-268 链 J 220–268（49 aa）片段：UNP RESIDUES 5-41,UNP RESIDUES 220-268	突变：G222A, G240A 突变：G222A, G240A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 0.68M sodium citrate pH 4.5	分辨率 3.20 Å R-free 0.284
5H77 Crystal structure of the PKA-protein A fusion protein 提交 2016-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 K 220–268（49 aa）片段：UNP RESIDUES 5-41,UNP RESIDUES 220-268 链 L 220–268（49 aa）片段：UNP RESIDUES 5-41,UNP RESIDUES 220-268	突变：G222A, G240A 突变：G222A, G240A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 0.68M sodium citrate pH 4.5	分辨率 3.20 Å R-free 0.284
5H79 Crystal structure of a repeat protein with three Protein A repeat module 提交 2016-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 217–263（47 aa）片段：UNP RESIDUES 217-263,UNP RESIDUES 219-263,UNP RESIDUES 219-268 链 D 219–263（45 aa）片段：UNP RESIDUES 217-263,UNP RESIDUES 219-263,UNP RESIDUES 219-268 链 D 219–268（50 aa）片段：UNP RESIDUES 217-263,UNP RESIDUES 219-263,UNP RESIDUES 219-268	突变：G59A, N131A, G149A 突变：G59A, N131A, G149A 突变：G59A, N131A, G149A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 13.5%(w/v) PEG 1000	分辨率 2.70 Å R-free 0.278
5H79 Crystal structure of a repeat protein with three Protein A repeat module 提交 2016-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 217–263（47 aa）片段：UNP RESIDUES 217-263,UNP RESIDUES 219-263,UNP RESIDUES 219-268 链 C 219–263（45 aa）片段：UNP RESIDUES 217-263,UNP RESIDUES 219-263,UNP RESIDUES 219-268 链 C 219–268（50 aa）片段：UNP RESIDUES 217-263,UNP RESIDUES 219-263,UNP RESIDUES 219-268	突变：G59A, N131A, G149A 突变：G59A, N131A, G149A 突变：G59A, N131A, G149A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 13.5%(w/v) PEG 1000	分辨率 2.70 Å R-free 0.278
5H7A Crystal structure of a repeat protein with four Protein A repeat module 提交 2016-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 215–263（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267 链 C 219–263（45 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267 链 C 219–267（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267	突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 43.2% (w/v) PEG 1000	分辨率 2.70 Å R-free 0.285
5H7A Crystal structure of a repeat protein with four Protein A repeat module 提交 2016-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 10 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 J 215–263（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267 链 J 219–263（45 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267 链 J 219–267（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267	突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 43.2% (w/v) PEG 1000	分辨率 2.70 Å R-free 0.285
5H7A Crystal structure of a repeat protein with four Protein A repeat module 提交 2016-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 11 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 K 215–263（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267 链 K 219–263（45 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267 链 K 219–267（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267	突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 43.2% (w/v) PEG 1000	分辨率 2.70 Å R-free 0.285
5H7A Crystal structure of a repeat protein with four Protein A repeat module 提交 2016-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 12 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 L 215–263（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267 链 L 219–263（45 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267 链 L 219–267（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267	突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 43.2% (w/v) PEG 1000	分辨率 2.70 Å R-free 0.285
5H7A Crystal structure of a repeat protein with four Protein A repeat module 提交 2016-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 215–263（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267 链 A 219–263（45 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267 链 A 219–267（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267	突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 43.2% (w/v) PEG 1000	分辨率 2.70 Å R-free 0.285
5H7A Crystal structure of a repeat protein with four Protein A repeat module 提交 2016-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 215–263（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267 链 D 219–263（45 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267 链 D 219–267（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267	突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 43.2% (w/v) PEG 1000	分辨率 2.70 Å R-free 0.285
5H7A Crystal structure of a repeat protein with four Protein A repeat module 提交 2016-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 215–263（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267 链 B 219–263（45 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267 链 B 219–267（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267	突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 43.2% (w/v) PEG 1000	分辨率 2.70 Å R-free 0.285
5H7A Crystal structure of a repeat protein with four Protein A repeat module 提交 2016-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 215–263（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267 链 E 219–263（45 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267 链 E 219–267（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267	突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 43.2% (w/v) PEG 1000	分辨率 2.70 Å R-free 0.285
5H7A Crystal structure of a repeat protein with four Protein A repeat module 提交 2016-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 F 215–263（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267 链 F 219–263（45 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267 链 F 219–267（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267	突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 43.2% (w/v) PEG 1000	分辨率 2.70 Å R-free 0.285
5H7A Crystal structure of a repeat protein with four Protein A repeat module 提交 2016-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 G 215–263（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267 链 G 219–263（45 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267 链 G 219–267（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267	突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 43.2% (w/v) PEG 1000	分辨率 2.70 Å R-free 0.285
5H7A Crystal structure of a repeat protein with four Protein A repeat module 提交 2016-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 H 215–263（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267 链 H 219–263（45 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267 链 H 219–267（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267	突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 43.2% (w/v) PEG 1000	分辨率 2.70 Å R-free 0.285
5H7A Crystal structure of a repeat protein with four Protein A repeat module 提交 2016-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 9 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 I 215–263（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267 链 I 219–263（45 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267 链 I 219–267（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263, 219-263, 219-263, 219-267	突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A 突变：G59A, G104A, G149A, G194A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 43.2% (w/v) PEG 1000	分辨率 2.70 Å R-free 0.285
5H7B Crystal structure of a repeat protein with five Protein A repeat modules 提交 2016-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 215–263（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263,219-263,219-263,219-263,219-267 链 A 219–263（45 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263,219-263,219-263,219-263,219-267 链 A 219–267（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263,219-263,219-263,219-263,219-267	突变：G59A, G104A, G149A, 1G94A, G239A 突变：G59A, G104A, G149A, 1G94A, G239A 突变：G59A, G104A, G149A, 1G94A, G239A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 27.3% PEG MME 2000	分辨率 3.10 Å R-free 0.315
5H7B Crystal structure of a repeat protein with five Protein A repeat modules 提交 2016-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 215–263（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263,219-263,219-263,219-263,219-267 链 B 219–263（45 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263,219-263,219-263,219-263,219-267 链 B 219–267（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-263,219-263,219-263,219-263,219-267	突变：G59A, G104A, G149A, 1G94A, G239A 突变：G59A, G104A, G149A, 1G94A, G239A 突变：G59A, G104A, G149A, 1G94A, G239A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；296 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 27.3% PEG MME 2000	分辨率 3.10 Å R-free 0.315
5H7C Crystal structure of a repeat protein with two Protein A-DHR14 repeat modules 提交 2016-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 215–267（53 aa）片段：UNP RESIDUES 215-267,219-267 链 A 219–267（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-267,219-267	突变：10 mutations 突变：10 mutations	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；296 K；0.1M Tris pH 8.0, 33.75%(w/v) PEG MME 2000	分辨率 2.70 Å R-free 0.262
5H7C Crystal structure of a repeat protein with two Protein A-DHR14 repeat modules 提交 2016-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 215–267（53 aa）片段：UNP RESIDUES 215-267,219-267 链 C 219–267（49 aa）片段：UNP RESIDUES 215-267,219-267	突变：10 mutations 突变：10 mutations	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；296 K；0.1M Tris pH 8.0, 33.75%(w/v) PEG MME 2000	分辨率 2.70 Å R-free 0.262
5X3F Crystal structure of the YgjG-Protein A-Zpa963-PKA catalytic domain 提交 2017-02-05	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 220–269（50 aa）片段：UNP RESIDUES 7-453,220-269	突变：N222V, G240A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；296 K；91mM MES pH 5.5, 2.33M Na formate	分辨率 3.38 Å R-free 0.227
5XBY Crystal structure of the PKA-Protein A fusion protein (end-to-end fusion) 提交 2017-03-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 217–269（53 aa）片段：UNP RESIDUES 5-44,UNP RESIDUES 217-269 链 B 217–269（53 aa）片段：UNP RESIDUES 5-44,UNP RESIDUES 217-269	突变：G240A 突变：G240A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；296 K；100mM Tris pH 8.5, 2.16M Sodium formate	分辨率 3.25 Å R-free 0.307
5XBY Crystal structure of the PKA-Protein A fusion protein (end-to-end fusion) 提交 2017-03-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 217–269（53 aa）片段：UNP RESIDUES 5-44,UNP RESIDUES 217-269 链 D 217–269（53 aa）片段：UNP RESIDUES 5-44,UNP RESIDUES 217-269	突变：G240A 突变：G240A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；296 K；100mM Tris pH 8.5, 2.16M Sodium formate	分辨率 3.25 Å R-free 0.307
6KRV Crystal structure of mouse IgG2b Fc complexed with B domain of Protein A 提交 2019-08-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 212–269（58 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；60% (v/v) Tacsimate (pH 7.0)	分辨率 3.30 Å R-free 0.250
6KRV Crystal structure of mouse IgG2b Fc complexed with B domain of Protein A 提交 2019-08-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 212–269（58 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；60% (v/v) Tacsimate (pH 7.0)	分辨率 3.30 Å R-free 0.250
7EOY Engineered Hepatitis B virus core antigen T=3 提交 2021-04-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 180 PDB 声明：180-meric	链 A 212–269（58 aa）链 B 212–269（58 aa）链 C 212–269（58 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7EOY Engineered Hepatitis B virus core antigen T=3 提交 2021-04-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 212–269（58 aa）链 B 212–269（58 aa）链 C 212–269（58 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7EOY Engineered Hepatitis B virus core antigen T=3 提交 2021-04-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 A 212–269（58 aa）链 B 212–269（58 aa）链 C 212–269（58 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7EOY Engineered Hepatitis B virus core antigen T=3 提交 2021-04-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 信息不足同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 A 212–269（58 aa）链 B 212–269（58 aa）链 C 212–269（58 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7EOY Engineered Hepatitis B virus core antigen T=3 提交 2021-04-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 信息不足同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 212–269（58 aa）链 B 212–269（58 aa）链 C 212–269（58 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7EP6 Engineered Hepatitis B virus core antigen T=4 提交 2021-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 240 PDB 声明：240-meric	链 A 212–269（58 aa）链 B 212–269（58 aa）链 C 212–269（58 aa）链 D 212–269（58 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.86 Å
7EP6 Engineered Hepatitis B virus core antigen T=4 提交 2021-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 212–269（58 aa）链 B 212–269（58 aa）链 C 212–269（58 aa）链 D 212–269（58 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.86 Å
7EP6 Engineered Hepatitis B virus core antigen T=4 提交 2021-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 A 212–269（58 aa）链 B 212–269（58 aa）链 C 212–269（58 aa）链 D 212–269（58 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.86 Å
7EP6 Engineered Hepatitis B virus core antigen T=4 提交 2021-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 信息不足同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 212–269（58 aa）链 B 212–269（58 aa）链 C 212–269（58 aa）链 D 212–269（58 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.86 Å
7EP6 Engineered Hepatitis B virus core antigen T=4 提交 2021-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 信息不足同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 212–269（58 aa）链 B 212–269（58 aa）链 C 212–269（58 aa）链 D 212–269（58 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.86 Å
7FDJ Engineered Hepatitis B virus core antigen with short linker T=4 提交 2021-07-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 240 PDB 声明：240-meric	链 A 212–269（58 aa）链 B 212–269（58 aa）链 C 212–269（58 aa）链 D 212–269（58 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
7FDJ Engineered Hepatitis B virus core antigen with short linker T=4 提交 2021-07-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 212–269（58 aa）链 B 212–269（58 aa）链 C 212–269（58 aa）链 D 212–269（58 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
7FDJ Engineered Hepatitis B virus core antigen with short linker T=4 提交 2021-07-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 A 212–269（58 aa）链 B 212–269（58 aa）链 C 212–269（58 aa）链 D 212–269（58 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
7FDJ Engineered Hepatitis B virus core antigen with short linker T=4 提交 2021-07-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 信息不足同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 212–269（58 aa）链 B 212–269（58 aa）链 C 212–269（58 aa）链 D 212–269（58 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
7FDJ Engineered Hepatitis B virus core antigen with short linker T=4 提交 2021-07-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 信息不足同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 212–269（58 aa）链 B 212–269（58 aa）链 C 212–269（58 aa）链 D 212–269（58 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
7NHA 1918 H1N1 Viral influenza polymerase heterotrimer - Endonuclease and priming loop ordered (Class2a) 提交 2021-02-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 C 158–271（114 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3.5 second blot and 3 microlitres sample.	分辨率 2.91 Å
7NHC 1918 H1N1 Viral influenza polymerase heterotrimer - Endonuclease ordered (Class2b) 提交 2021-02-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 C 158–271（114 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3.5 second blot and 3 microlitres sample.	分辨率 2.87 Å
7NHX 1918 H1N1 Viral influenza polymerase heterotrimer - full transcriptase (Class1) 提交 2021-02-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 C 158–271（114 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3.5 second blot and 3 microlitres sample.	分辨率 3.23 Å
7NI0 1918 H1N1 Viral influenza polymerase heterotrimer - Replicase (class 3) 提交 2021-02-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 C 158–271（114 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3.5 second blot and 3 microlitres sample.	分辨率 3.32 Å
7NIK 1918 H1N1 Viral influenza polymerase heterotrimer with Nb8189 core 提交 2021-02-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 C 158–271（114 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
7NIL 1918 H1N1 Viral influenza polymerase heterotrimer with Nb8190 core 提交 2021-02-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 C 158–271（114 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.01 Å
7NIR 1918 H1N1 Viral influenza polymerase heterotrimer with Nb8191 core 提交 2021-02-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 C 158–271（114 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.70 Å
7NIS 1918 H1N1 Viral influenza polymerase heterotrimer with Nb8192 core 提交 2021-02-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 C 158–271（114 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.96 Å
7NJ3 1918 H1N1 Viral influenza polymerase heterotrimer with Nb8196 core 提交 2021-02-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 C 158–271（114 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.48 Å
7NJ4 1918 H1N1 Viral influenza polymerase heterotrimer with Nb8198 core 提交 2021-02-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 C 158–271（114 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.84 Å
7NJ5 1918 H1N1 Viral influenza polymerase heterotrimer with Nb8199 core 提交 2021-02-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 C 158–271（114 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.63 Å
7NJ7 1918 H1N1 Viral influenza polymerase heterotrimer with Nb8200 core 提交 2021-02-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 C 158–271（114 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.82 Å
7NK1 1918 Influenza virus polymerase heterotirmer in complex with vRNA promoters and Nb8201 提交 2021-02-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 C 158–271（114 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.22 Å
7NK2 1918 H1N1 Viral influenza polymerase heterotrimer with Nb8202 core 提交 2021-02-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 C 158–271（114 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.84 Å
8CPL YZw2 a scaffold for cryo-EM of small proteins of interest 提交 2023-03-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 220–269（50 aa）链 B 220–269（50 aa）链 C 220–269（50 aa）链 D 220–269（50 aa）	未记录	PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；16.6% w/v PEG3350, 0.2M NaF and 0.1M Bis-Tris Propane pH 5.5	分辨率 1.60 Å R-free 0.210
8DA3 Coevolved affibody-Z domain pair LL1.c1 提交 2022-06-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 213–269（57 aa）	突变：Q9L, F13I, L17F, G29A, I31F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1 MLI MALONATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；295 K；2.4 M Ammonium Sulfate 0.1 M bicine pH 9.0 Cryoprotected with sodium malonate	分辨率 1.06 Å R-free 0.168
8DA4 Coevolved affibody-Z domain pair LL1.c2 提交 2022-06-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 213–269（57 aa）	突变：Q9L, F13I, G29A, I31F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；295 K；2.5 M AmmSO4, 0.1 M NaOAc pH 4.6 cryoprotected with Na malonate	分辨率 1.92 Å R-free 0.247
8DA4 Coevolved affibody-Z domain pair LL1.c2 提交 2022-06-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 213–269（57 aa）	突变：Q9L, F13I, G29A, I31F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；295 K；2.5 M AmmSO4, 0.1 M NaOAc pH 4.6 cryoprotected with Na malonate	分辨率 1.92 Å R-free 0.247
8DA4 Coevolved affibody-Z domain pair LL1.c2 提交 2022-06-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 213–269（57 aa）	突变：Q9L, F13I, G29A, I31F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；295 K；2.5 M AmmSO4, 0.1 M NaOAc pH 4.6 cryoprotected with Na malonate	分辨率 1.92 Å R-free 0.247
8DA5 Coevolved affibody-Z domain pair LL1.c4 提交 2022-06-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 212–269（58 aa）	突变：Q9F, F13I, G29A, I31F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；2.3 M AmmPO4, 100 mM Tris pH 8.5 cryoprotected with 30% glycerol	分辨率 1.00 Å R-free 0.191
8DA5 Coevolved affibody-Z domain pair LL1.c4 提交 2022-06-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 212–269（58 aa）	突变：Q9F, F13I, G29A, I31F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；2.3 M AmmPO4, 100 mM Tris pH 8.5 cryoprotected with 30% glycerol	分辨率 1.00 Å R-free 0.191
8DA6 Coevolved affibody-Z domain pair LL1.c5 提交 2022-06-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 213–269（57 aa）	突变：Q9F, F13I, G29A, I31F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；2.4 M ammonium Sulfate 0.1 M citric acid pH 5.0 cryoprotected with sodium malonate	分辨率 1.50 Å R-free 0.251
8DA6 Coevolved affibody-Z domain pair LL1.c5 提交 2022-06-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 213–269（57 aa）	突变：Q9F, F13I, G29A, I31F	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；2.4 M ammonium Sulfate 0.1 M citric acid pH 5.0 cryoprotected with sodium malonate	分辨率 1.50 Å R-free 0.251
8DA7 Coevolved affibody-Z domain pair LL1.c6 提交 2022-06-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 213–269（57 aa）	突变：Q9L, F13I, G29A, I31F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MLI MALONATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；2.5 M AmmSO4, 100 mM tris pH 8.5 cryoprotected with Na malonate	分辨率 1.02 Å R-free 0.183
8DA8 Coevolved affibody-Z domain pair LL2.c1 提交 2022-06-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 213–269（57 aa）	突变：Q9L F13V, G29A, I31F	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；2.5 M ammonium sulfate 100 mM HEPES pH 7.0 Cryoprotected with 30% glycerol	分辨率 1.29 Å R-free 0.235
8DA9 Coevolved affibody-Z domain pair LL2.c3 提交 2022-06-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 213–269（57 aa）	突变：Q9L, F13V, G29A, I31F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；2.4 M Ammonium sulfate 0.1M HEPES pH 7.0 Cryoprotected with 30% glycerol	分辨率 1.35 Å R-free 0.198
8DA9 Coevolved affibody-Z domain pair LL2.c3 提交 2022-06-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 213–269（57 aa）	突变：Q9L, F13V, G29A, I31F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；2.4 M Ammonium sulfate 0.1M HEPES pH 7.0 Cryoprotected with 30% glycerol	分辨率 1.35 Å R-free 0.198
8DAA Coevolved affibody-Z domain pair LL2.c7 提交 2022-06-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 213–269（57 aa）	突变：Q9L, F13V, G29A, I31F	MLI MALONATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；3.0 M Ammonium sulfate, 100 mM HEPES pH 7.0 cryoprotected with sodium malonate	分辨率 1.75 Å R-free 0.298
8DAA Coevolved affibody-Z domain pair LL2.c7 提交 2022-06-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 213–269（57 aa）	突变：Q9L, F13V, G29A, I31F	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；3.0 M Ammonium sulfate, 100 mM HEPES pH 7.0 cryoprotected with sodium malonate	分辨率 1.75 Å R-free 0.298
8DAB Coevolved affibody-Z domain pair LL2.c17 提交 2022-06-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 213–269（57 aa）	突变：Q9V, G29A, I31V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；295 K；2.3 M Amm2HPO4, 100 mM Tris pH 8.2 cryoprotected in 30% glycerol	分辨率 1.13 Å R-free 0.200
8DAC Coevolved affibody-Z domain pair LL2.c22 提交 2022-06-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 213–269（57 aa）	突变：Q9I, F13V, L17F, G29A, I31F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；295 K；2.5 M AmmSO4, 100 mM Tris pH 8.2 Cryoprotected with 30% glycerol	分辨率 1.19 Å R-free 0.196
8JXR Structure of nanobody-bound DRD1_LSD complex 提交 2023-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 289–327（39 aa）	突变：E360Q,K363A,D364F,T367I,R368L	7LD (8alpha)-N,N-diethyl-6-methyl-9,10-didehydroergoline-8-carboxamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.57 Å
8JXS Structure of nanobody-bound DRD1_PF-6142 complex 提交 2023-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 289–327（39 aa）	突变：E360Q,K363A,D364F,T367I,R368L,D404E,A405H	V6X 4-[3-methyl-4-(6-methylimidazo[1,2-a]pyrazin-5-yl)phenoxy]furo[3,2-c]pyridine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8R2P YZwIdeal x16 a scaffold for cryo-EM of small proteins of interest crystallizing in space group 19 (P 21 21 21) 提交 2023-11-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 218–269（52 aa）链 B 218–269（52 aa）链 C 218–269（52 aa）链 D 218–269（52 aa）	突变：G487A 突变：G487A 突变：G487A 突变：G487A	PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；50% w/v PEG200, 0.2M MgCl2 and 0.1M Sodium Cacodylate buffer pH 6.5	分辨率 2.22 Å R-free 0.230
9QU4 Cryo-EM structure of the inward-open choline-bound state of choline/ethanolamine transporter FLVCR2 提交 2025-04-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 159–321（163 aa）	未记录	CHT CHOLINE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.39 Å
9W3K GPR151-Legobody complex 提交 2025-07-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 289–327（39 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.08 Å

共 66 个其他 PDB 条目、126 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SPA_STAAU
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 452–499； UniProt 220–267 作者链 B； PDB构建体 452–499； UniProt 220–267 作者链 C； PDB构建体 452–499； UniProt 220–267 作者链 D； PDB构建体 452–499； UniProt 220–267 作者链 I； PDB构建体 452–499； UniProt 220–267 作者链 J； PDB构建体 452–499； UniProt 220–267 作者链 M； PDB构建体 452–499； UniProt 220–267 作者链 N； PDB构建体 452–499； UniProt 220–267

Putrescine aminotransferase,Immunoglobulin G-binding protein A

Staphylococcus aureus

UniProt P42588

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 7–453 链 B； UniProt 7–453 链 C； UniProt 7–453 链 D； UniProt 7–453	片段：UNP RESIDUES 7-453,UNP RESIDUES 220-267 突变：N222V, G240A	Zpa963,Calmodulin × 4 （O16305） CA CALCIUM ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；296 K；0.1M HEPES pH 7.5, 20.7% PEG 300, 99mM calcium chloride	分辨率 2.57 Å R-free 0.241
2	信息不足异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 I； UniProt 7–453 链 J； UniProt 7–453 链 M； UniProt 7–453 链 N； UniProt 7–453	片段：UNP RESIDUES 7-453,UNP RESIDUES 220-267 突变：N222V, G240A	Zpa963,Calmodulin × 4 （O16305） CA CALCIUM ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；296 K；0.1M HEPES pH 7.5, 20.7% PEG 300, 99mM calcium chloride	分辨率 2.57 Å R-free 0.241

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 5H7D	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4UOX Crystal structure of YgjG in complex with Pyridoxal-5'-phosphate and putrescine 提交 2014-06-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–459（459 aa）链 B 1–459（459 aa）链 C 1–459（459 aa）链 D 1–459（459 aa）	未记录	PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 4 PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 3 FMT FORMIC ACID × 6 GOL GLYCEROL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；0.1 M HEPES PH 7.5, 15% PEG 3350, 0.2 M SODIUM FORMATE, 0.1 MM N-DODECYL-N,N-DIMETHYLGLYCINE	分辨率 2.08 Å R-free 0.245
4UOY Crystal structure of YgjG in complex with Pyridoxal-5'-phosphate 提交 2014-06-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–459（459 aa）链 B 1–459（459 aa）链 C 1–459（459 aa）链 D 1–459（459 aa）	未记录	PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 4 FMT FORMIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；0.1 M HEPES PH 7.5 15% PEG 3350 0.2 M SODIUM FORMATE 0.1 MM N-DODECYL-N,N-DIMETHYLGLYCINE	分辨率 2.31 Å R-free 0.233
5X3F Crystal structure of the YgjG-Protein A-Zpa963-PKA catalytic domain 提交 2017-02-05	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 7–453（447 aa）片段：UNP RESIDUES 7-453,220-269	突变：N222V, G240A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；296 K；91mM MES pH 5.5, 2.33M Na formate	分辨率 3.38 Å R-free 0.227
8CPL YZw2 a scaffold for cryo-EM of small proteins of interest 提交 2023-03-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 7–457（451 aa）链 B 7–457（451 aa）链 C 7–457（451 aa）链 D 7–457（451 aa）	未记录	PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；16.6% w/v PEG3350, 0.2M NaF and 0.1M Bis-Tris Propane pH 5.5	分辨率 1.60 Å R-free 0.210
8R2P YZwIdeal x16 a scaffold for cryo-EM of small proteins of interest crystallizing in space group 19 (P 21 21 21) 提交 2023-11-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 7–457（451 aa）链 B 7–457（451 aa）链 C 7–457（451 aa）链 D 7–457（451 aa）	突变：G487A 突变：G487A 突变：G487A 突变：G487A	PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；50% w/v PEG200, 0.2M MgCl2 and 0.1M Sodium Cacodylate buffer pH 6.5	分辨率 2.22 Å R-free 0.230

共 5 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PAT_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 5–451； UniProt 7–453 作者链 B； PDB构建体 5–451； UniProt 7–453 作者链 C； PDB构建体 5–451； UniProt 7–453 作者链 D； PDB构建体 5–451； UniProt 7–453 作者链 I； PDB构建体 5–451； UniProt 7–453 作者链 J； PDB构建体 5–451； UniProt 7–453 作者链 M； PDB构建体 5–451； UniProt 7–453 作者链 N； PDB构建体 5–451； UniProt 7–453

Zpa963,Calmodulin

Caenorhabditis elegans

UniProt O16305

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 13–75 链 F； UniProt 13–75 链 G； UniProt 13–75 链 H； UniProt 13–75	片段：RESIDUES 104-156,157-219 (UNP RESIDUES 13-75)	Putrescine aminotransferase,Immunoglobulin G-binding protein A × 4 （P42588,P38507） CA CALCIUM ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；296 K；0.1M HEPES pH 7.5, 20.7% PEG 300, 99mM calcium chloride	分辨率 2.57 Å R-free 0.241
2	信息不足异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 K； UniProt 13–75 链 L； UniProt 13–75 链 O； UniProt 13–75 链 P； UniProt 13–75	片段：RESIDUES 104-156,157-219 (UNP RESIDUES 13-75)	Putrescine aminotransferase,Immunoglobulin G-binding protein A × 4 （P42588,P38507） CA CALCIUM ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；296 K；0.1M HEPES pH 7.5, 20.7% PEG 300, 99mM calcium chloride	分辨率 2.57 Å R-free 0.241

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 5H7D	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1OOJ Structural genomics of Caenorhabditis elegans : Calmodulin 提交 2003-03-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–149（149 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；295 K；PH 5.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 295.0K, RESERVOIR: MPD, PEG3350, DIOXANE, 5 MM CACL2, 50 MM CITRATE, PH 5.7, PROTEIN STOCK: 5 MG/ML IN 5 MM CACL2, 5 MM CACODYLATE, PH 6, DROPS: 5 MICROLITERS OF PROTEIN STOCK SOLUTION, 5 MICROLITERS OF RESERVOIR.	分辨率 2.11 Å R-free 0.271

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CALM_CAEEL
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 58–120； UniProt 13–75 作者链 F； PDB构建体 58–120； UniProt 13–75 作者链 G； PDB构建体 58–120； UniProt 13–75 作者链 H； PDB构建体 58–120； UniProt 13–75 作者链 K； PDB构建体 58–120； UniProt 13–75 作者链 L； PDB构建体 58–120； UniProt 13–75 作者链 O； PDB构建体 58–120； UniProt 13–75 作者链 P； PDB构建体 58–120； UniProt 13–75

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5h7d
沉积日期 deposition_date	2016-11-17
结构标题 title	Crystal structure of the YgjG-protein A-Zpa963-calmodulin complex
关键词 keywords	synthetic protein, TRANSFERASE, IMMUNE SYSTEM-METAL BINDING PROTEIN complex; TRANSFERASE, IMMUNE SYSTEM/METAL BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	71.69 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	71.46 Å
零角强度 I(0) i0	3861510000.00
分子量 molecular_weight	528950.0 kDa
排除体积 excluded_volume	663400 Å³
包络体积 envelope_volume	1052100 Å³
水化壳体积 shell_volume	122750 Å³
包络直径 envelope_diameter	256.5 Å
壳层 Rg shell_rg	68.72 Å
包络 Rg envelope_rg	70.85 Å
形状 Rg shape_rg	71.44 Å
总 Rg total_rg	71.51 Å
总原子数 total_atoms	37132
残基数 n_residues	4860
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	260.9 Å
Rg (实空间) rg_real	71.88 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	4.22 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.8620e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	9.8900e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	70.83 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	3853000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8519
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	71.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.358
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.562
角度范围 angular_range	— – 0.1100 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	131800000.0000
实空间数据点数 n_real_points	23
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.749; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.824

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Putrescine aminotransferase,Immunoglobulin G-binding protein A
分子量 formula_weight	54225.1 kDa
EC 编号 ec_number	2.6.1.82
突变 mutation	N222V, G240A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,I,J,M,N
原子数 atom_count	37132

GSHMSASALACSAHALNLIEKRTLDHEEMKALNREVIEYFKEHVNPGFLEYRKSVTAGGDYGAVEWQAGSLNTLVDTQGQEFIDCLGGFGIFNVGHRNPVVVSAVQNQLAKQPLHSQELLDPLRAMLAKTLAALTPGKLKYSFFCNSGTESVEAALKLAKAYQSPRGKFTFIATSGAFHGKSLGALSATAKSTFRKPFMPLLPGFRHVPFGNIEAMRTALNECKKTGDDVAAVILEPIQGEGGVILPPPGYLTAVRKLCDEFGALMILDEVQTGMGRTGKMFACEHENVQPDILCLAKALGGGVMPIGATIATEEVFSVLFDNPFLHTTTFGGNPLACAAALATINVLLEQNLPAQAEQKGDMLLDGFRQLAREYPDLVQEARGKGMLMAIEFVDNEIGYNFASEMFRQRVLVAGTLNNAKTIRIEPPLTLTIEQCELVIKAARKALAAMRQQVAFYEILHLPNLNEEQRNAFIQSLKDDPSQSANLLAEAKKLNDAQA

来源 Source

来源生物 organism	Staphylococcus aureus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1280
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Zpa963,Calmodulin
分子量 formula_weight	13255.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F,G,H,K,L,O,P

GSHMKFNKETQEASWEIFTLPNLNGRQVAAFISSLLDDPSQSANLLAEAKKLNQIQAFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMAR

来源 Source

来源生物 organism	Caenorhabditis elegans
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	6239
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	16

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	79.489 Å
晶胞边长 b length_b	155.376 Å
晶胞边长 c length_c	155.491 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	84.84 °
晶胞夹角 β angle_beta	89.68 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	89.56 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.570 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	0.2075
R_work r_work	0.2038
R_free r_free	0.2409

fit	/app/data/saxs_computation/h7/5h7d/5h7d.fit
pddf	/app/data/pr_computation/h7/5h7d/5h7d.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/h7/5h7d/5h7d.dat

Crystal structure of the YgjG-protein A-Zpa963-calmodulin complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Putrescine aminotransferase,Immunoglobulin G-binding protein A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Putrescine aminotransferase,Immunoglobulin G-binding protein A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Zpa963,Calmodulin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)