6gen

Chromatin remodeller-nucleosome complex at 4.5 A resolution.

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone H3

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	Vacuolar protein sorting-associated protein 72 × 1 Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2A.1 × 2 （P04911） Histone H2B.1 × 2 （P02293） DNA (173-MER) × 1 DNA (173-MER) × 1 Helicase SWR1 × 1 （Q05471） Actin-like protein ARP6 × 1 （Q12509） Vacuolar protein sorting-associated protein 71 × 1 （Q03433） RuvB-like protein 1 × 3 （Q03940） RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	H3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 B； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136

Histone H4

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P02309

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	Vacuolar protein sorting-associated protein 72 × 1 Histone H3 × 2 （P61830） Histone H2A.1 × 2 （P04911） Histone H2B.1 × 2 （P02293） DNA (173-MER) × 1 DNA (173-MER) × 1 Helicase SWR1 × 1 （Q05471） Actin-like protein ARP6 × 1 （Q12509） Vacuolar protein sorting-associated protein 71 × 1 （Q03433） RuvB-like protein 1 × 3 （Q03940） RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	H4_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 D； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103

Histone H2A.1

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P04911

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	Vacuolar protein sorting-associated protein 72 × 1 Histone H3 × 2 （P61830） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2B.1 × 2 （P02293） DNA (173-MER) × 1 DNA (173-MER) × 1 Helicase SWR1 × 1 （Q05471） Actin-like protein ARP6 × 1 （Q12509） Vacuolar protein sorting-associated protein 71 × 1 （Q03433） RuvB-like protein 1 × 3 （Q03940） RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H2A1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132 作者链 F； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132

Histone H2B.1

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P02293

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	Vacuolar protein sorting-associated protein 72 × 1 Histone H3 × 2 （P61830） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2A.1 × 2 （P04911） DNA (173-MER) × 1 DNA (173-MER) × 1 Helicase SWR1 × 1 （Q05471） Actin-like protein ARP6 × 1 （Q12509） Vacuolar protein sorting-associated protein 71 × 1 （Q03433） RuvB-like protein 1 × 3 （Q03940） RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H2B1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–131； UniProt 1–131 作者链 H； PDB构建体 1–131； UniProt 1–131

Helicase SWR1

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt Q05471

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	Vacuolar protein sorting-associated protein 72 × 1 Histone H3 × 2 （P61830） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2A.1 × 2 （P04911） Histone H2B.1 × 2 （P02293） DNA (173-MER) × 1 DNA (173-MER) × 1 Actin-like protein ARP6 × 1 （Q12509） Vacuolar protein sorting-associated protein 71 × 1 （Q03433） RuvB-like protein 1 × 3 （Q03940） RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	SWR1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–1514； UniProt 1–1514

Actin-like protein ARP6

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt Q12509

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	Vacuolar protein sorting-associated protein 72 × 1 Histone H3 × 2 （P61830） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2A.1 × 2 （P04911） Histone H2B.1 × 2 （P02293） DNA (173-MER) × 1 DNA (173-MER) × 1 Helicase SWR1 × 1 （Q05471） Vacuolar protein sorting-associated protein 71 × 1 （Q03433） RuvB-like protein 1 × 3 （Q03940） RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ARP6_YEAST
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 1–438； UniProt 1–438

Vacuolar protein sorting-associated protein 71

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt Q03433

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	Vacuolar protein sorting-associated protein 72 × 1 Histone H3 × 2 （P61830） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2A.1 × 2 （P04911） Histone H2B.1 × 2 （P02293） DNA (173-MER) × 1 DNA (173-MER) × 1 Helicase SWR1 × 1 （Q05471） Actin-like protein ARP6 × 1 （Q12509） RuvB-like protein 1 × 3 （Q03940） RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	VPS71_YEAST
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 1–280； UniProt 1–280

RuvB-like protein 1

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt Q03940

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	Vacuolar protein sorting-associated protein 72 × 1 Histone H3 × 2 （P61830） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2A.1 × 2 （P04911） Histone H2B.1 × 2 （P02293） DNA (173-MER) × 1 DNA (173-MER) × 1 Helicase SWR1 × 1 （Q05471） Actin-like protein ARP6 × 1 （Q12509） Vacuolar protein sorting-associated protein 71 × 1 （Q03433） RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RUVB1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 T； PDB构建体 1–463； UniProt 1–463 作者链 V； PDB构建体 1–463； UniProt 1–463 作者链 X； PDB构建体 1–463； UniProt 1–463

RuvB-like protein 2

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt Q12464

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	Vacuolar protein sorting-associated protein 72 × 1 Histone H3 × 2 （P61830） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2A.1 × 2 （P04911） Histone H2B.1 × 2 （P02293） DNA (173-MER) × 1 DNA (173-MER) × 1 Helicase SWR1 × 1 （Q05471） Actin-like protein ARP6 × 1 （Q12509） Vacuolar protein sorting-associated protein 71 × 1 （Q03433） RuvB-like protein 1 × 3 （Q03940） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RUVB2_YEAST
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 U； PDB构建体 1–471； UniProt 1–471 作者链 W； PDB构建体 1–471； UniProt 1–471 作者链 Y； PDB构建体 1–471； UniProt 1–471

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6gen
沉积日期 deposition_date	2018-04-27
结构标题 title	Chromatin remodeller-nucleosome complex at 4.5 A resolution.
关键词 keywords	Chromatin, Remodeller, ATPase, Histone, NUCLEAR PROTEIN; NUCLEAR PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6gen__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6gen__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6gen__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	65.95 Å
Rg（电子密度）	64.14 Å
总 Rg	64.41 Å
原子数	44481
残基数	5160
排除体积	771340 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6gen__assembly_1__model_1`	eicosameric （20）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (16)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Vacuolar protein sorting-associated protein 72
分子量 formula_weight	11166.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Z
原子数 atom_count	44481

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Histone H3
分子量 formula_weight	15405.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B

MARTKQTARKSTGGKAPRKQLASKAARKSAPSTGGVKKPHRYKPGTVALREIRRFQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSSAIGALQESVEAYLVSLFEDTNLAAIHAKRVTIQKKEIKLARRLRGERS

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Histone H4
分子量 formula_weight	11395.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKILRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEEVRAVLKSFLESVIRDSVTYTEHAKRKTVTSLDVVYALKRQGRTLYGFGG

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Histone H2A.1
分子量 formula_weight	14013.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F

MSGGKGGKAGSAAKASQSRSAKAGLTFPVGRVHRLLRRGNYAQRIGSGAPVYLTAVLEYLAAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDDELNKLLGNVTIAQGGVLPNIHQNLLPKKSAKATKASQEL

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Histone H2B.1
分子量 formula_weight	14280.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,H

MSAKAEKKPASKAPAEKKPAAKKTSTSTDGKKRSKARKETYSSYIYKVLKQTHPDTGISQKSMSILNSFVNDIFERIATEASKLAAYNKKSTISAREIQTAVRLILPGELAKHAVSEGTRAVTKYSSSTQA

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	DNA (173-MER)
分子量 formula_weight	53124.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	I

GCATTAATGCATCCGCGGCCGCCCTGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCAGATATATACATCCTGTGCA

来源 Source

来源生物 organism	synthetic construct
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	32630
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	DNA (173-MER)
分子量 formula_weight	53694.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	J

TGCACAGGATGTATATATCTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTCCAGGGCGGCCGCGGATGCATTAATGC

来源 Source

来源生物 organism	synthetic construct
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	32630
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Helicase SWR1
分子量 formula_weight	174793.0 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.12
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MTTSRKSHAKDKKAGGEQDLADLKFRYDLLTNELFHLREFVSLVDYDPTHFNDSESFQKFLRETHLSLEERGEKFTDDVAKKGTNGDLTRRRRNLRTSTVVSSETTNEKKGDIELKLESIAPLVRNKCEELKYKLSDHSNRKSIVPQKRPIQHLKKREAAKSLKFKSERKENPLPLHEHIAEERYDHIAKVEEPSEAFTIKCPSDDSSFENTSEHYSDNFYFTTSSEEEDIKKKRGRKKKKPRIKLVVHPPKQTITNPLHVVKPGYESLHEYIASFKSLEDDLTLEEYNKYIDEQRRLLSRLKKGIENGALKYDKETDSLQPITSKEIKTIITYKPDPISYFYKQQDLQIHTDHLINQGIHMSKLFRSSTKARIARAKKVSQMIEQHFKHVAGAEERKAKEEERHKKSLARFAVQAVKKRWNMAEKAYRILRKDEEEQLKRIEGKQHLSKMLEKSTQLLEAQLNQVNDDGRSSTPSSDSNDVLSESDDDMDDELSTSSDEDEEVDADVGLENSPASTEATPTDESLNLIQLKEKYGHFNGSSTVYDSRNKDEKFPTLDKHESSSSESSVMTGEESSIYSSSENESQNENDRESDDKTPSVGLSALFGKGEESDGDLDLDDSEDFTVNSSSVEGEELEKDQVDNSAATFERAGDFVHTQNENRDDIKDVEEDAETKVQEEQLSVVDVPVPSLLRGNLRTYQKQGLNWLASLYNNHTNGILADEMGLGKTIQTISLLAYLACEKENWGPHLIVVPTSVLLNWEMEFKRFAPGFKVLTYYGSPQQRKEKRKGWNKPDAFHVCIVSYQLVVQDQHSFKRKRWQYMVLDEAHNIKNFRSTRWQALLNFNTQRRLLLTGTPLQNNLAELWSLLYFLMPQTVIDGKKVSGFADLDAFQQWFGRPVDKIIETGQNFGQDKETKKTVAKLHQVLRPYLLRRLKADVEKQMPAKYEHIVYCKLSKRQRFLYDDFMSRAQTKATLASGNFMSIVNCLMQLRKVCNHPNLFEVRPILTSFVLEHCVASDYKDVERTLLKLFKKNNQVNRVDLDFLNLVFTLNDKDLTSYHAEEISKLTCVKNFVEEVNKLRETNKQLQEEFGEASFLNFQDANQYFKYSNKQKLEGTVDMLNFLKMVNKLRCDRRPIFGKNLIDLLTKDRRVKYDKSSIIDNELIKPLQTRVLDNRKIIDTFAVLTPSAVSLDMRKLALGLNDDSSVGENTRLKVMQNCFEVSNPLHQLQTKLTIAFPDKSLLQYDCGKLQKLAILLQQLKDNGHRALIFTQMTKVLDVLEQFLNYHGYLYMRLDGATKIEDRQILTERFNTDSRITVFILSSRSGGLGINLTGADTVIFYDSDWNPAMDKQCQDRCHRIGQTRDVHIYRFVSEHTIESNILKKANQKRQLDNVVIQEGDFTTDYFSKLSVRDLLGSELPENASGGDKPLIADADVAAKDPRQLERLLAQAEDEDDVKAANLAMREVEIDNDDFDESTEKKAANEEEENHAELDEYEGTAHVDEYMIRFIANGYYY

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Actin-like protein ARP6
分子量 formula_weight	50100.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

METPPIVIDNGSYEIKFGPSTNKKPFRALNALAKDKFGTSYLSNHIKNIKDISSITFRRPHELGQLTLWELESCIWDYCLFNPSEFDGFDLKEGKGHHLVASESCMTLPELSKHADQVIFEEYEFDSLFKSPVAVFVPFTKSYKGEMRTISGKDEDIDIVRGNSDSTNSTSSESKNAQDSGSDYHDFQLVIDSGFNCTWIIPVLKGIPYYKAVKKLDIGGRFLTGLLKETLSFRHYNMMDETILVNNIKEQCLFVSPVSYFDSFKTKDKHALEYVLPDFQTSFLGYVRNPRKENVPLPEDAQIITLTDELFTIPETFFHPEISQITKPGIVEAILESLSMLPEIVRPLMVGNIVCTGGNFNLPNFAQRLAAELQRQLPTDWTCHVSVPEGDCALFGWEVMSQFAKTDSYRKARVTREEYYEHGPDWCTKHRFGYQNWI

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Vacuolar protein sorting-associated protein 71
分子量 formula_weight	32073.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S

MKALVEEIDKKTYNPDIYFTSLDPQARRYTSKKINKQGTISTSRPVKRINYSLADLEARLYTSRSEGDGNSISRQDDRNSKNSHSFEERYTQQEILQSDRRFMELNTENFSDLPNVPTLLSDLTGVPRDRIESTTKPISQTSDGLSALMGGSSFVKEHSKYGHGWVLKPETLREIQLSYKSTKLPKPKRKNTNRIVALKKVLSSKRNLHSFLDSALLNLMDKNVIYHNVYNKRYFKVLPLITTCSICGGYDSISSCVNCGNKICSVSCFKLHNETRCRNR

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	RuvB-like protein 1
分子量 formula_weight	50516.9 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.12
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T,V,X

MVAISEVKENPGVNSSNSGAVTRTAAHTHIKGLGLDESGVAKRVEGGFVGQIEAREACGVIVDLIKAKKMSGRAILLAGGPSTGKTALALAISQELGPKVPFCPLVGSELYSVEVKKTETLMENFRRAIGLRIKETKEVYEGEVTELTPEDAENPLGGYGKTISHVIVGLKSAKGTKTLRLDPTIYESIQREKVSIGDVIYIEANTGAVKRVGRSDAYATEFDLETEEYVPLPKGEVHKKKEIVQDVTLHDLDVANARPQGGQDVISMMGQLLKPKKTEITEKLRQEVNKVVAKYIDQGVAELIPGVLFIDEVNMLDIEIFTYLNKALESNIAPVVVLASNRGMTTVRGTEDVISPHGVPPDLIDRLLIVRTLPYDKDEIRTIIERRATVERLQVESSALDLLATMGTETSLRYALQLLAPCGILAQTSNRKEIVVNDVNEAKLLFLDAKRSTKILETSANYL

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	RuvB-like protein 2
分子量 formula_weight	51673.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.12
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U,W,Y

MSIQTSDPNETSDLKSLSLIAAHSHITGLGLDENLQPRPTSEGMVGQLQARRAAGVILKMVQNGTIAGRAVLVAGPPSTGKTALAMGVSQSLGKDVPFTAIAGSEIFSLELSKTEALTQAFRKSIGIKIKEETELIEGEVVEIQIDRSITGGHKQGKLTIKTTDMETIYELGNKMIDGLTKEKVLAGDVISIDKASGKITKLGRSFARSRDYDAMGADTRFVQCPEGELQKRKTVVHTVSLHEIDVINSRTQGFLALFTGDTGEIRSEVRDQINTKVAEWKEEGKAEIVPGVLFIDEVHMLDIECFSFINRALEDEFAPIVMMATNRGVSKTRGTNYKSPHGLPLDLLDRSIIITTKSYNEQEIKTILSIRAQEEEVELSSDALDLLTKTGVETSLRYSSNLISVAQQIAMKRKNNTVEVEDVKRAYLLFLDSARSVKYVQENESQYIDDQGNVQISIAKSADPDAMDTTE

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 13 Entity 13 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION
分子量 formula_weight	66.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 16 Entity 16 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 13 domains

CATH v4.4 (13 domains)

结构域编号 domain_id	6genA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	20 — Histone, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Histone, subunit A

结构域编号 domain_id	6genB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	20 — Histone, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Histone, subunit A

结构域编号 domain_id	6genC00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	20 — Histone, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Histone, subunit A

结构域编号 domain_id	6genD00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	20 — Histone, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Histone, subunit A

结构域编号 domain_id	6genE00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	20 — Histone, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Histone, subunit A

结构域编号 domain_id	6genF00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	20 — Histone, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Histone, subunit A

结构域编号 domain_id	6genG00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	20 — Histone, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Histone, subunit A

结构域编号 domain_id	6genH00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	20 — Histone, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Histone, subunit A

结构域编号 domain_id	6genR01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	6genU01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	360 — RuvBL1 DNA/RNA binding domain

结构域编号 domain_id	6genW01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	360 — RuvBL1 DNA/RNA binding domain

结构域编号 domain_id	6genY01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	360 — RuvBL1 DNA/RNA binding domain

结构域编号 domain_id	6genY02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	8 — Helicase, Ruva Protein; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 —

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.60 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	98529

Chromatin remodeller-nucleosome complex at 4.5 A resolution.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone H3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H2A.1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H2B.1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Helicase SWR1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Actin-like protein ARP6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Vacuolar protein sorting-associated protein 71

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RuvB-like protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RuvB-like protein 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6gen__assembly_1__model_1

6gen__assembly_1__model_1 | I(q)

6gen__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment