6k3i

Salmonella hook in curved state - 66 subunit models

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 296.2 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Flagellar hook protein FlgE

物种未注明

UniProt P0A1J1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 66 PDB 声明:66-meric(66) 与蛋白拷贝数一致 链 AA; UniProt 2–403 链 AB; UniProt 2–403 链 AC; UniProt 2–403 链 AD; UniProt 2–403 链 AE; UniProt 2–403 链 AF; UniProt 2–403 链 AG; UniProt 2–403 链 AH; UniProt 2–403 链 AI; UniProt 2–403 链 AJ; UniProt 2–403 链 AK; UniProt 2–403 链 BA; UniProt 2–403 链 BB; UniProt 2–403 链 BC; UniProt 2–403 链 BD; UniProt 2–403 链 BE; UniProt 2–403 链 BF; UniProt 2–403 链 BG; UniProt 2–403 链 BH; UniProt 2–403 链 BI; UniProt 2–403 链 BJ; UniProt 2–403 链 BK; UniProt 2–403 链 CA; UniProt 2–403 链 CB; UniProt 2–403 链 CC; UniProt 2–403 链 CD; UniProt 2–403 链 CE; UniProt 2–403 链 CF; UniProt 2–403 链 CG; UniProt 2–403 链 CH; UniProt 2–403 链 CI; UniProt 2–403 链 CJ; UniProt 2–403 链 CK; UniProt 2–403 链 DA; UniProt 2–403 链 DB; UniProt 2–403 链 DC; UniProt 2–403 链 DD; UniProt 2–403 链 DE; UniProt 2–403 链 DF; UniProt 2–403 链 DG; UniProt 2–403 链 DH; UniProt 2–403 链 DI; UniProt 2–403 链 DJ; UniProt 2–403 链 DK; UniProt 2–403 链 EA; UniProt 2–403 链 EB; UniProt 2–403 链 EC; UniProt 2–403 链 ED; UniProt 2–403 链 EE; UniProt 2–403 链 EF; UniProt 2–403 链 EG; UniProt 2–403 链 EH; UniProt 2–403 链 EI; UniProt 2–403 链 EJ; UniProt 2–403 链 EK; UniProt 2–403 链 FA; UniProt 2–403 链 FB; UniProt 2–403 链 FC; UniProt 2–403 链 FD; UniProt 2–403 链 FE; UniProt 2–403 链 FF; UniProt 2–403 链 FG; UniProt 2–403 链 FH; UniProt 2–403 链 FI; UniProt 2–403 链 FJ; UniProt 2–403 链 FK; UniProt 2–403 未记录 无其他共同聚合物 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 3.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;3 second blot, 4.0uL 分辨率 2.86 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 20 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 FLGE_SALTY
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 AA; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 AB; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 AC; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 AD; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 AE; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 AF; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 AG; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 AH; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 AI; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 AJ; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 AK; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 BA; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 BB; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 BC; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 BD; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 BE; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 BF; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 BG; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 BH; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 BI; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 BJ; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 BK; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 CA; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 CB; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 CC; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 CD; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 CE; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 CF; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 CG; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 CH; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 CI; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 CJ; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 CK; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 DA; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 DB; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 DC; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 DD; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 DE; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 DF; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 DG; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 DH; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 DI; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 DJ; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 DK; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 EA; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 EB; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 EC; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 ED; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 EE; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 EF; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 EG; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 EH; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 EI; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 EJ; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 EK; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 FA; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 FB; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 FC; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 FD; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 FE; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 FF; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 FG; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 FH; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 FI; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 FJ; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403 作者链 FK; PDB构建体 1–402; UniProt 2–403

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6k3i

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6k3i
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6k3i
沉积日期 deposition_date2019-05-19
结构标题 titleSalmonella hook in curved state - 66 subunit models
关键词 keywordsbacterial, hook, flexible joint, flagella, MOTOR PROTEIN; MOTOR PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier
回转半径 Rg (电子) rg_electron103.90
零角强度 I(0) i0116225000000.00
分子量 molecular_weight2776700.0 kDa
排除体积 excluded_volume3417000 ų
包络体积 envelope_volume5757400 ų
水化壳体积 shell_volume441790 ų
包络直径 envelope_diameter420.6
壳层 Rg shell_rg109.20
包络 Rg envelope_rg104.60
形状 Rg shape_rg103.90
总 Rg total_rg103.90
总原子数 total_atoms195294
残基数 n_residues26532
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax296.2
Rg (实空间) rg_real99.17
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.10
I(0) (实空间) i0_real1.1130e+11
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.5140e+09
Rg (倒空间) rg_reciprocal100.60
I(0) (倒空间) i0_reciprocal115100000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8991
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary118.5
偏度 Skewness skewness0.427
峰度 Kurtosis kurtosis-0.280
角度范围 angular_range— – 0.0750 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.8109
最高正则化参数 α highest_alpha32230000000.0000
实空间数据点数 n_real_points16
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.941; Stabil: 0.976; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.926; Smooth: 0.013

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)