6sc2

Structure of the dynein-2 complex; IFT-train bound model

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,DYNC2H1 variant protein,O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,Cytoplasmic dynein 2 heavy chain 1,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein ;

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 14	WD repeat-containing protein 60 × 1 （Q8WVS4） WD repeat-containing protein 34 × 1 （Q96EX3） Cytoplasmic dynein 2 light intermediate chain 1 × 2 （Q8TCX1） Dynein light chain roadblock-type 1 × 2 （Q9NP97） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （P63167） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MAGNESIUM ION × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B0I1S0_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1, 2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 208–1226； UniProt 2–1020 作者链 A； PDB构建体 1483–4513； UniProt 1277–4307 作者链 B； PDB构建体 208–1130； UniProt 2–924 作者链 B； PDB构建体 1483–4513； UniProt 1277–4307

;O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,DYNC2H1 variant protein,O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,Cytoplasmic dynein 2 heavy chain 1,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein ;

Homo sapiens

UniProt E5BBQ0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 14	WD repeat-containing protein 60 × 1 （Q8WVS4） WD repeat-containing protein 34 × 1 （Q96EX3） Cytoplasmic dynein 2 light intermediate chain 1 × 2 （Q8TCX1） Dynein light chain roadblock-type 1 × 2 （Q9NP97） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （P63167） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MAGNESIUM ION × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	E5BBQ0_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1, 2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–178； UniProt 5–181 作者链 B； PDB构建体 2–178； UniProt 5–181

WD repeat-containing protein 60

Homo sapiens

UniProt Q8WVS4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 14	;O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,DYNC2H1 variant protein,O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,Cytoplasmic dynein 2 heavy chain 1,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein ; × 1 （B0I1S0,E5BBQ0） ;O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,DYNC2H1 variant protein,O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,Cytoplasmic dynein 2 heavy chain 1,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein ; × 1 （B0I1S0,E5BBQ0） WD repeat-containing protein 34 × 1 （Q96EX3） Cytoplasmic dynein 2 light intermediate chain 1 × 2 （Q8TCX1） Dynein light chain roadblock-type 1 × 2 （Q9NP97） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （P63167） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MAGNESIUM ION × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	WDR60_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–1066； UniProt 1–1066

WD repeat-containing protein 34

Homo sapiens

UniProt Q96EX3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 14	;O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,DYNC2H1 variant protein,O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,Cytoplasmic dynein 2 heavy chain 1,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein ; × 1 （B0I1S0,E5BBQ0） ;O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,DYNC2H1 variant protein,O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,Cytoplasmic dynein 2 heavy chain 1,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein ; × 1 （B0I1S0,E5BBQ0） WD repeat-containing protein 60 × 1 （Q8WVS4） Cytoplasmic dynein 2 light intermediate chain 1 × 2 （Q8TCX1） Dynein light chain roadblock-type 1 × 2 （Q9NP97） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （P63167） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MAGNESIUM ION × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	WDR34_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–536； UniProt 1–536

Cytoplasmic dynein 2 light intermediate chain 1

Homo sapiens

UniProt Q8TCX1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 14	;O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,DYNC2H1 variant protein,O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,Cytoplasmic dynein 2 heavy chain 1,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein ; × 1 （B0I1S0,E5BBQ0） ;O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,DYNC2H1 variant protein,O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,Cytoplasmic dynein 2 heavy chain 1,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein ; × 1 （B0I1S0,E5BBQ0） WD repeat-containing protein 60 × 1 （Q8WVS4） WD repeat-containing protein 34 × 1 （Q96EX3） Dynein light chain roadblock-type 1 × 2 （Q9NP97） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （P63167） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MAGNESIUM ION × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	DC2L1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351 作者链 F； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351

Dynein light chain roadblock-type 1

Homo sapiens

UniProt Q9NP97

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 14	;O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,DYNC2H1 variant protein,O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,Cytoplasmic dynein 2 heavy chain 1,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein ; × 1 （B0I1S0,E5BBQ0） ;O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,DYNC2H1 variant protein,O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,Cytoplasmic dynein 2 heavy chain 1,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein ; × 1 （B0I1S0,E5BBQ0） WD repeat-containing protein 60 × 1 （Q8WVS4） WD repeat-containing protein 34 × 1 （Q96EX3） Cytoplasmic dynein 2 light intermediate chain 1 × 2 （Q8TCX1） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （P63167） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MAGNESIUM ION × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	DLRB1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–96； UniProt 1–96 作者链 H； PDB构建体 1–96； UniProt 1–96

Dynein light chain 1, cytoplasmic

Homo sapiens

UniProt P63167

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 14	;O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,DYNC2H1 variant protein,O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,Cytoplasmic dynein 2 heavy chain 1,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein ; × 1 （B0I1S0,E5BBQ0） ;O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,DYNC2H1 variant protein,O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,Cytoplasmic dynein 2 heavy chain 1,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein ; × 1 （B0I1S0,E5BBQ0） WD repeat-containing protein 60 × 1 （Q8WVS4） WD repeat-containing protein 34 × 1 （Q96EX3） Cytoplasmic dynein 2 light intermediate chain 1 × 2 （Q8TCX1） Dynein light chain roadblock-type 1 × 2 （Q9NP97） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MAGNESIUM ION × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	DYL1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–89； UniProt 1–89 作者链 J； PDB构建体 1–89； UniProt 1–89 作者链 K； PDB构建体 1–89； UniProt 1–89 作者链 L； PDB构建体 1–89； UniProt 1–89 作者链 M； PDB构建体 1–89； UniProt 1–89 作者链 N； PDB构建体 1–89； UniProt 1–89

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6sc2
沉积日期 deposition_date	2019-07-23
结构标题 title	Structure of the dynein-2 complex; IFT-train bound model
关键词 keywords	dynein, cilia, intraflagellar transport, complex, motor protein; MOTOR PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6sc2__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6sc2__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6sc2__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	132.80 Å
总 Rg	132.50 Å
原子数	50276
残基数	10108
排除体积	809820 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6sc2__assembly_1__model_1`	tetradecameric （14）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (10)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	;O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,DYNC2H1 variant protein,O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,Cytoplasmic dynein 2 heavy chain 1,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein ;
分子量 formula_weight	507610.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	50276

GDKDCEMKRTTLDSPLGKLELSGCEQGLHRIIFLGKGTSAADAVEVPAPAAVLGGPEPLMQATAWLNAYFHQPEAIEEFPVPALHHPVFQQESFTRQVLWKLLKVVKFGEVISYSHLAALAGNPAATAAVKTALSGNPVPILIPCHRVVQGDLDVGGYEGGLAVKEWLLAHEGHRLGKPGLGGSLEVLFQGPDYDIPTTLEVLFQGPANGTADVRKLFIFTTTQNYFGLMSELWDQPLLCNCLEINNFLDDGNQMLLRVQRSDAGISFSNTIEFGDTKDKVLVFFKLRPEVITDENLHDNILVSSMLESPISSLYQAVRQVFAPMLLKDQEWSRNFDPKLQNLLSELEAGLGIVLRRSDTNLTKLKFKEDDTRGILTPSDEFQFWIEQAHRGNKQISKERANYFKELFETIAREFYNLDSLSLLEVVDLVETTQDVVDDVWRQTEHDHYPESRMLHLLDIIGGSFGRFVQKKLGTLNLWEDPYYLVKESLKAGISICEQWVIVCNHLTGQVWQRYVPHPWKNEKYFPETLDKLGKRLEEVLAIRTIHEKFLYFLPASEEKIICLTRVFEPFTGLNPVQYNPYTEPLWKAAVSQYEKIIAPAEQKIAGKLKNYISEIQDSPQQLLQAFLKYKELVKRPTISKELMLERETLLARLVDSIKDFRLDFENRCRGIPGDASGPLSGKNLSEVVNSIVWVRQLELKVDDTIKIAEALLSDLPGFRCFHQSAKDLLDQLKLYEQEQFDDWSRDIQSGLSDSRSGLCIEASSRIMELDSNDGLLKVHYSDRLVILLREVRQLSALGFVIPAKIQQVANIAQKFCKQAIILKQVAHFYNSIDQQMIQSQRPMMLQSALAFEQIIKNSKAGSGGKSQITWDNPKELEGYIQKLQNAAERLATENRKLRKWHTTFCEKVVVLMNIDLLRQQQRWKDGLQELRTGLATVEAQGFQASDMHAWKQHWNHQLYKALEHQYQMGLEALNENLPEINIDLTYKQGRLQFRPPFEEIRAKYYREMKRFIGIPNQFKGVGEAGDESIFSIMIDRNASGFLTIFSKAEDLFRRLSAVLHQHKEWIVIGQVDMEALVEKHLFTVHDWEKNFKALKIKGKEVERLPSAVKVDCLNINCNPVKTVIDDLIQKLFDLLVLSLKKSIQAHLHEIDTFVTEAMEVLTIMPQSVEEIGDANLQYSKLQERKPEILPLFQEAEDKNRLLRTVAGGGLETISNLKAKWDKFELXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXKPGDDVIETGQHXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXHHFRLEEPNFSLAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTLIDYEDSQSRTMKLIKDWKDIVNQVGDNRCLLQSLKDSPYYKGFEDKVSIWERKLAELDEYLQNLNHIQRKWVYLEPIFGRGALPKEQTRFNRVDEDFRSIMTDIKKDNRVTTLTTHAGIRNSLLTILDQLQRCQRSLNEFLEEKRSAFPRFYFIGDDDLLEILGQSTNPSVIQSHLKKLFAGINSVCFDEKSKHITAMKSLEGEVVPFKNKVPLSNNVETWLNDLALEMKKTLEQLLKECVTTGRSSQGAVDPSLFPSQILCLAEQIKFTEDVENAIKDHSLHQIETQLVNKLEQYTNIDTSSEDPGNTESGILELKLKALILDIIHNIDVVKQLNQIQVHTTEDWAWKKQLRFYMKSDHTCCVQMVDSEFQYTYEYQGNASKLVYTPLTDKCYLTLTQAMKMGLGGNPYGPAGTGKTESVKALGGLLGRQVLVFNCDEGIDVKSMGRIFVGLVKCGAWGCFDEFNRLEESVLSAVSMQIQTIQDALKNHRTVCELLGKEVEVNSNSGIFITMNPAGKGYGGRQKLPDNLKQLFRPVAMSHPDNELIAEVILYSEGFKDAKVLSRKLVAIFNLSRELLTPQQHYDWGLRALKTVLRGSGNLLRQLNKSGTTQNANESHIVVQALRLNTMSKFTFTDCTRFDALIKDVFPGIELKEVEYDELSAALKQVFEEANYEIIPNQIKKALELYEQLCQRMGVVIVGPSGAGKSTLWRMLRAALCKTGKVVKQYTMNPKAMPRYQLLGHIDMDTREWSDGVLTNSARQVVREPQDVSSWIICDGDIDPEWIESLNSVLDDNRLLTMPSGERIQFGPNVNFVFETHDLSCASPATISRMGMIFLSDEETDLNSLIKSWLRNQPAEYRNNLENWIGDYFEKALQWVLKQNDYVVETSLVGTVMNGLSHLHGCRDHDEFIINLIRGLGGNLNMKSRLEFTKEVFHWARESPPDFHKPMDTYYDSTRGRLATYVLKKPEDLTADDFSNGLTLPVIQTPDMQRGLDYFKPWLSSDTKQPFILVGPEGCGKGMLLRYAFSQLRSTQIATVHCSAQTTSRHLLQKLSQTCMVISTNTGRVYRPKDCERLVLYLKDINLPKLDKWGTSTLVAFLQQVLTYQGFYDENLEWVGLENIQIVASMSAGGRLGRHKLTTRFTSIVRLCSIDYPEREQLQTIYGAYLEPVLHKNLKNHSIWGSSSKIYLLAGSMVQVYEQVRAKFTVDDYSHYFFTPCILTQWVLGLFRYDLEGGSSNHPLDYVLEIVAYEARRLFRDKIVGAKELHLFDIILTSVFQGDWGSDILDNMSDSFYVTWGARHNSGARAAPGQPLPPHGKPLGKLNSTDLKDVIKKGLIHYGRDNQNLDILLFHEVLEYMSRIDRVLSFPGGSLLLAGRSGVGRRTITSLVSHMHGAVLFSPKISRGYELKQFKNDLKHVLQLAGIEAQQVVLLLEDYQFVHPTFLEMINSLLSSGEVPGLYTLEELEPLLLPLKDQASQDGFFGPVFNYFTYRIQQNLHIVLIMDSANSNFMINCESNPALHKKCQVLWMEGWSNSSMKKIPEMLFSETGGGEKYNDKKRKEEKKKNSVDPDFLKSFLLIHESCKAYGATPSQYMTFLHVYSAISSSKKKELLKRQSHLQAGVSKLNEAKALVDELNRKAGEQSVLLKTKQDEADAALQMITVSMQDASEQKTELERLKHRIAEEVVKIEERKNKIDDELKEVQPLVNEAKLAVGNIKPESLSEIRSLRMPPDVIRDILEGVLRLMGIFDTSWVSMKSFLAKRGVREDIATFDARNISKEIRESVEELLFKNKGSFDPKNAKRASTAAAPLAAWVKANIQYSHVLERIHPLETEQAGLESNLKKTEDRKRKLEELLNSVGQKVSELKEKFQSRTSEAAKLEAEVSKAQETIKAAEVLINQLDREHKRWNAQVVEITEELATLPKRAQLAAAFITYLSAAPESLRKTCLEEWTKSAGLEKFDLRRFLCTESEQLIWKSEGLPSDDLSIENALVILQSRVCPFLIDPSSQATEWLKTHLKDSRLEVINQQDSNFITALELAVRFGKTLIIQEMDGVEPVLYPLLRRDLVAQGPRYVVQIGDKIIDYNEEFRLFLSTRNPNPFIPPDAASIVTEVNFTTTRSGLRGQLLALTIQHEKPDLEEQKTKLLQQEEDKKIQLAKLEESLLETLATSQGNILENKDLIESLNQTKASSALIQESLKESYKLQISLDQERDAYLPLAESASKMYFIISDLSKINNMYRFSLAAFLRLFQRALQNKQDSENTEQRIQSLISSLQHMVYEYICRCLFKADQLMFALHFVRGMHPELFQENEWDTFTGVVVGDMLRKADSQQKIRDQLPSWIDQERSWAVATLKIALPSLYQTLCFEDAALWRTYYNNSMCEQEFPSILAKKVSLFQQILVVQVLRPDRLQSAMALFACKTLGLKEVSPLPLNLKRLYKETLEIEPILIIISPGADPSQELQELANAERSGECYHQVAMGQGQADLAIQMLKECARNGDWLCLKNLHLVVSWLPVLEKELNTLQPKDTFRLWLTAEVHPNFTPILLQSSLKITYESPPGLKKNLMRTYESWTPEQISKKDNTHRAHALFSLAWFHAACQERRNYIPQGWTKFYEFSLSDLRAGYNIIDRLFDGAKDVQWEFVHGLLENAIYGGRIDNYFDLRVLQSYLKQFFNSSVIDVFNQRNKKSIFPYSVSLPQSCSILDYRAVIEKIPEDDKPSFFGLPANIARSSQRMISSQVISQLRILGRSITAGSKFDREIWSNELSPVLNLWKKLNQNSNLIHQKVPPPNDRQGSPILSFIILEQFNAIRLVQSVHQSLAALSKVIRGTTLLSSEVQKLASALLNQKCPLAWQSKWEGPEDPLQYLRGLVARALAIQNWVDKAEKQALLSETLDLSELFHPDTFLNALRQETARAVGRSVDSLKFVASWKGRLQEAKLQIKISGLLLEGCSFDGNQLSENQLDSPSVSSVLPCFMGWIPQDACGPYSPDECISLPVYTSAERDRVVTNIDVPCGGNQDQWIQCGAALFLKNQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	;O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,DYNC2H1 variant protein,O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,Cytoplasmic dynein 2 heavy chain 1,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein ;
分子量 formula_weight	504891.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

GDKDCEMKRTTLDSPLGKLELSGCEQGLHRIIFLGKGTSAADAVEVPAPAAVLGGPEPLMQATAWLNAYFHQPEAIEEFPVPALHHPVFQQESFTRQVLWKLLKVVKFGEVISYSHLAALAGNPAATAAVKTALSGNPVPILIPCHRVVQGDLDVGGYEGGLAVKEWLLAHEGHRLGKPGLGGSLEVLFQGPDYDIPTTLEVLFQGPANGTADVRKLFIFTTTQNYFGLMSELWDQPLLCNCLEINNFLDDGNQMLLRVQRSDAGISFSNTIEFGDTKDKVLVFFKLRPEVITDENLHDNILVSSMLESPISSLYQAVRQVFAPMLLKDQEWSRNFDPKLQNLLSELEAGLGIVLRRSDTNLTKLKFKEDDTRGILTPSDEFQFWIEQAHRGNKQISKERANYFKELFETIAREFYNLDSLSLLEVVDLVETTQDVVDDVWRQTEHDHYPESRMLHLLDIIGGSFGRFVQKKLGTLNLWEDPYYLVKESLKAGISICEQWVIVCNHLTGQVWQRYVPHPWKNEKYFPETLDKLGKRLEEVLAIRTIHEKFLYFLPASEEKIICLTRVFEPFTGLNPVQYNPYTEPLWKAAVSQYEKIIAPAEQKIAGKLKNYISEIQDSPQQLLQAFLKYKELVKRPTISKELMLERETLLARLVDSIKDFRLDFENRCRGIPGDASGPLSGKNLSEVVNSIVWVRQLELKVDDTIKIAEALLSDLPGFRCFHQSAKDLLDQLKLYEQEQFDDWSRDIQSGLSDSRSGLCIEASSRIMELDSNDGLLKVHYSDRLVILLREVRQLSALGFVIPAKIQQVANIAQKFCKQAIILKQVAHFYNSIDQQMIQSQRPMMLQSALAFEQIIKNSKAGSGGKSQITWDNPKELEGYIQKLQNAAERLATENRKLRKWHTTFCEKVVVLMNIDLLRQQQRWKDGLQELRTGLATVEAQGFQASDMHAWKQHWNHQLYKALEHQYQMGLEALNENLPEINIDLTYKQGRLQFRPPFEEIRAKYYREMKRFIGIPNQFKGVGEAGDESIFSIMIDRNASGFLTIFSKAEDLFRRLSAVLHQHKEWIVIGQVDMEALVEKHLFTVHDWEKNFKALKIKGKEVERLPSAVKVDCLNINCNPVKTVIDDLIQKXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXLKPGDDVIETGQHXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXHHFRLEEPNFSLAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTLIDYEDSQSRTMKLIKDWKDIVNQVGDNRCLLQSLKDSPYYKGFEDKVSIWERKLAELDEYLQNLNHIQRKWVYLEPIFGRGALPKEQTRFNRVDEDFRSIMTDIKKDNRVTTLTTHAGIRNSLLTILDQLQRCQRSLNEFLEEKRSAFPRFYFIGDDDLLEILGQSTNPSVIQSHLKKLFAGINSVCFDEKSKHITAMKSLEGEVVPFKNKVPLSNNVETWLNDLALEMKKTLEQLLKECVTTGRSSQGAVDPSLFPSQILCLAEQIKFTEDVENAIKDHSLHQIETQLVNKLEQYTNIDTSSEDPGNTESGILELKLKALILDIIHNIDVVKQLNQIQVHTTEDWAWKKQLRFYMKSDHTCCVQMVDSEFQYTYEYQGNASKLVYTPLTDKCYLTLTQAMKMGLGGNPYGPAGTGKTESVKALGGLLGRQVLVFNCDEGIDVKSMGRIFVGLVKCGAWGCFDEFNRLEESVLSAVSMQIQTIQDALKNHRTVCELLGKEVEVNSNSGIFITMNPAGKGYGGRQKLPDNLKQLFRPVAMSHPDNELIAEVILYSEGFKDAKVLSRKLVAIFNLSRELLTPQQHYDWGLRALKTVLRGSGNLLRQLNKSGTTQNANESHIVVQALRLNTMSKFTFTDCTRFDALIKDVFPGIELKEVEYDELSAALKQVFEEANYEIIPNQIKKALELYEQLCQRMGVVIVGPSGAGKSTLWRMLRAALCKTGKVVKQYTMNPKAMPRYQLLGHIDMDTREWSDGVLTNSARQVVREPQDVSSWIICDGDIDPEWIESLNSVLDDNRLLTMPSGERIQFGPNVNFVFETHDLSCASPATISRMGMIFLSDEETDLNSLIKSWLRNQPAEYRNNLENWIGDYFEKALQWVLKQNDYVVETSLVGTVMNGLSHLHGCRDHDEFIINLIRGLGGNLNMKSRLEFTKEVFHWARESPPDFHKPMDTYYDSTRGRLATYVLKKPEDLTADDFSNGLTLPVIQTPDMQRGLDYFKPWLSSDTKQPFILVGPEGCGKGMLLRYAFSQLRSTQIATVHCSAQTTSRHLLQKLSQTCMVISTNTGRVYRPKDCERLVLYLKDINLPKLDKWGTSTLVAFLQQVLTYQGFYDENLEWVGLENIQIVASMSAGGRLGRHKLTTRFTSIVRLCSIDYPEREQLQTIYGAYLEPVLHKNLKNHSIWGSSSKIYLLAGSMVQVYEQVRAKFTVDDYSHYFFTPCILTQWVLGLFRYDLEGGSSNHPLDYVLEIVAYEARRLFRDKIVGAKELHLFDIILTSVFQGDWGSDILDNMSDSFYVTWGARHNSGARAAPGQPLPPHGKPLGKLNSTDLKDVIKKGLIHYGRDNQNLDILLFHEVLEYMSRIDRVLSFPGGSLLLAGRSGVGRRTITSLVSHMHGAVLFSPKISRGYELKQFKNDLKHVLQLAGIEAQQVVLLLEDYQFVHPTFLEMINSLLSSGEVPGLYTLEELEPLLLPLKDQASQDGFFGPVFNYFTYRIQQNLHIVLIMDSANSNFMINCESNPALHKKCQVLWMEGWSNSSMKKIPEMLFSETGGGEKYNDKKRKEEKKKNSVDPDFLKSFLLIHESCKAYGATPSQYMTFLHVYSAISSSKKKELLKRQSHLQAGVSKLNEAKALVDELNRKAGEQSVLLKTKQDEADAALQMITVSMQDASEQKTELERLKHRIAEEVVKIEERKNKIDDELKEVQPLVNEAKLAVGNIKPESLSEIRSLRMPPDVIRDILEGVLRLMGIFDTSWVSMKSFLAKRGVREDIATFDARNISKEIRESVEELLFKNKGSFDPKNAKRASTAAAPLAAWVKANIQYSHVLERIHPLETEQAGLESNLKKTEDRKRKLEELLNSVGQKVSELKEKFQSRTSEAAKLEAEVSKAQETIKAAEVLINQLDREHKRWNAQVVEITEELATLPKRAQLAAAFITYLSAAPESLRKTCLEEWTKSAGLEKFDLRRFLCTESEQLIWKSEGLPSDDLSIENALVILQSRVCPFLIDPSSQATEWLKTHLKDSRLEVINQQDSNFITALELAVRFGKTLIIQEMDGVEPVLYPLLRRDLVAQGPRYVVQIGDKIIDYNEEFRLFLSTRNPNPFIPPDAASIVTEVNFTTTRSGLRGQLLALTIQHEKPDLEEQKTKLLQQEEDKKIQLAKLEESLLETLATSQGNILENKDLIESLNQTKASSALIQESLKESYKLQISLDQERDAYLPLAESASKMYFIISDLSKINNMYRFSLAAFLRLFQRALQNKQDSENTEQRIQSLISSLQHMVYEYICRCLFKADQLMFALHFVRGMHPELFQENEWDTFTGVVVGDMLRKADSQQKIRDQLPSWIDQERSWAVATLKIALPSLYQTLCFEDAALWRTYYNNSMCEQEFPSILAKKVSLFQQILVVQVLRPDRLQSAMALFACKTLGLKEVSPLPLNLKRLYKETLEIEPILIIISPGADPSQELQELANAERSGECYHQVAMGQGQADLAIQMLKECARNGDWLCLKNLHLVVSWLPVLEKELNTLQPKDTFRLWLTAEVHPNFTPILLQSSLKITYESPPGLKKNLMRTYESWTPEQISKKDNTHRAHALFSLAWFHAACQERRNYIPQGWTKFYEFSLSDLRAGYNIIDRLFDGAKDVQWEFVHGLLENAIYGGRIDNYFDLRVLQSYLKQFFNSSVIDVFNQRNKKSIFPYSVSLPQSCSILDYRAVIEKIPEDDKPSFFGLPANIARSSQRMISSQVISQLRILGRSITAGSKFDREIWSNELSPVLNLWKKLNQNSNLIHQKVPPPNDRQGSPILSFIILEQFNAIRLVQSVHQSLAALSKVIRGTTLLSSEVQKLASALLNQKCPLAWQSKWEGPEDPLQYLRGLVARALAIQNWVDKAEKQALLSETLDLSELFHPDTFLNALRQETARAVGRSVDSLKFVASWKGRLQEAKLQIKISGLLLEGCSFDGNQLSENQLDSPSVSSVLPCFMGWIPQDACGPYSPDECISLPVYTSAERDRVVTNIDVPCGGNQDQWIQCGAALFLKNQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	WD repeat-containing protein 60
分子量 formula_weight	122865.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MEPGKRRTKDDTWKADDLRKHLWAIQSGGSKEERKHREKKLRKESEMDLPEHKEPRCRDPDQDARSRDRVAEVHTAKESPRGERDRDRQRERRRDAKDREKEKLKEKHREAEKSHSRGKDREKEKDRRARKEELRQTVAHHNLLGQETRDRQLLERAERKGRSVSKVRSEEKDEDSERGDEDRERRYRERKLQYGDSKDNPLKYWLYKEEGERRHRKPREPDRDKKHREKSSTREKREKYSKEKSNSFSDKGEERHKEKRHKEGFHFDDERHQSNVDRKEKSAKDEPRKREFQNGEHRNRGASSKRDGTSSQHAENLVRNHGKDKDSRRKHGHEEGSSVWWKLDQRPGGEETVEIEKEETDLENARADAYTASCEDDFEDYEDDFEVCDGDDDESSNEPESREKLEELPLAQKKEIQEIQRAINAENERIGELSLKLFQKRGRTEFEKEPRTDTNSSPSRASVCGIFVDFASASHRQKSRTQALKQKMRSTKLLRLIDLDFSFTFSLLDLPPVNEYDMYIRNFGKKNTKQAYVQCNEDNVERDIQTEEIETREVWTQHPGESTVVSGGSEQRDTSDAVVMPKIDTPRLCSFLRAACQVMAVLLEEDRLAAEPSWNLRAQDRALYFSDSSSQLNTSLPFLQNRKVSSLHTSRVQRQMVVSVHDLPEKSFVPLLDSKYVLCVWDIWQPSGPQKVLICESQVTCCCLSPLKAFLLFAGTAHGSVVVWDLREDSRLHYSVTLSDGFWTFRTATFSTDGILTSVNHRSPLQAVEPISTSVHKKQSFVLSPFSTQEEMSGLSFHIASLDESGVLNVWVVVELPKADIAGSISDLGLMPGGRVKLVHSALIQLGDSLSHKGNEFWGTTQTLNVKFLPSDPNHFIIGTDMGLISHGTRQDLRVAPKLFKPQQHGIRPVKVNVIDFSPFGEPIFLAGCSDGSIRLHQLSSAFPLLQWDSSTDSHAVTGLQWSPTRPAVFLVQDDTSNIYIWDLLQSDLGPVAKQQVSPNRLVAMAAVGEPEKAGGSFLALVLARASGSIDIQHLKRRWAAPEVDECNRLRLLLQEALWPEGKLHK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	WD repeat-containing protein 34
分子量 formula_weight	60768.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MATRAQPGPLSQAGSAGVAALATVGVASGPGPGRPGPLQDETLGVASVPSQWRAVQGIRWETKSCQTASIATASASAQARNHVDAQVQTEAPVPVSVQPPSQYDIPRLAAFLRRVEAMVIRELNKNWQSHAFDGFEVNWTEQQQMVSCLYTLGYPPAQAQGLHVTSISWNSTGSVVACAYGRLDHGDWSTLKSFVCAWNLDRRDLRPQQPSAVVEVPSAVLCLAFHPTQPSHVAGGLYSGEVLVWDLSRLEDPLLWRTGLTDDTHTDPVSQVVWLPEPGHSHRFQVLSVATDGKVLLWQGIGVGQLQLTEGFALVMQQLPRSTKLKKHPRGETEVGATAVAFSSFDPRLFILGTEGGFPLKCSLAAGEAALTRMPSSVPLRAPAQFTFSPHGGPIYSVSCSPFHRNLFLSAGTDGHVHLYSMLQAPPLTSLQLSLKYLFAVRWSPVRPLVFAAASGKGDVQLFDLQKSSQKPTVLIKQTQDESPVYCLEFNSQQTQLLAAGDAQGTVKVWQLSTEFTEQGPREAEDLDCLAAEVAAWSHPQFEKGSAGSAAGSGAGWSHPQFEK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Cytoplasmic dynein 2 light intermediate chain 1
分子量 formula_weight	39681.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F

MPSETLWEIAKAEVEKRGINGSEGDGAEIAEKFVFFIGSKNGGKTTIILRCLDRDEPPKPTLALEYTYGRRAKGHNTPKDIAHFWELGGGTSLLDLISIPITGDTLRTFSLVLVLDLSKPNDLWPTMENLLQATKSHVDKVIMKLGKTNAKAVSEMRQKIWNNMPKDHPDHELIDPFPVPLVIIGSKYDVFQDFESEKRKVICKTLRFVAHYYGASLMFTSKSEALLLKIRGVINQLAFGIDKSKSICVDQNKPLFITAGLDSFGQIGSPPVPENDIGKLHAHSPMELWKKVYEKLFPPKSINTLKDIKDPARDPQYAENEVDEMRIQKDLELEQYKRSSSKSWKQIELDS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Dynein light chain roadblock-type 1
分子量 formula_weight	10934.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,H

MAEVEETLKRLQSQKGVQGIIVVNTEGIPIKSTMDNPTTTQYASLMHSFILKARSTVRDIDPQNDLTFLRIRSKKNEIMVAPDKDYFLIVIQNPTE

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Dynein light chain 1, cytoplasmic
分子量 formula_weight	10381.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,J,K,L,M,N

MCDRKAVIKNADMSEEMQQDSVECATQALEKYNIEKDIAAHIKKEFDKKYNPTWHCIVGRNFGSYVTHETKHFIYFYLGQVAILLFKSG

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 9 Entity 9 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	507.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 10 Entity 10 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	6sc2G00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	450 — Beta-Lactamase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Dynein light chain 2a, cytoplasmic

结构域编号 domain_id	6sc2H00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	450 — Beta-Lactamase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Dynein light chain 2a, cytoplasmic

结构域编号 domain_id	6sc2I00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	740 — Protein Inhibitor Of Neuronal Nitric Oxide Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Protein Inhibitor Of Neuronal Nitric Oxide Synthase;

结构域编号 domain_id	6sc2J00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	740 — Protein Inhibitor Of Neuronal Nitric Oxide Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Protein Inhibitor Of Neuronal Nitric Oxide Synthase;

结构域编号 domain_id	6sc2K00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	740 — Protein Inhibitor Of Neuronal Nitric Oxide Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Protein Inhibitor Of Neuronal Nitric Oxide Synthase;

结构域编号 domain_id	6sc2L00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	740 — Protein Inhibitor Of Neuronal Nitric Oxide Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Protein Inhibitor Of Neuronal Nitric Oxide Synthase;

结构域编号 domain_id	6sc2M00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	740 — Protein Inhibitor Of Neuronal Nitric Oxide Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Protein Inhibitor Of Neuronal Nitric Oxide Synthase;

结构域编号 domain_id	6sc2N00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	740 — Protein Inhibitor Of Neuronal Nitric Oxide Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Protein Inhibitor Of Neuronal Nitric Oxide Synthase;

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.90 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	57265

Structure of the dynein-2 complex; IFT-train bound model

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,DYNC2H1 variant protein,O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,Cytoplasmic dynein 2 heavy chain 1,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

;O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,DYNC2H1 variant protein,O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase mutant,Cytoplasmic dynein 2 heavy chain 1,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein,DYNC2H1 variant protein ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

WD repeat-containing protein 60

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

WD repeat-containing protein 34

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytoplasmic dynein 2 light intermediate chain 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Dynein light chain roadblock-type 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Dynein light chain 1, cytoplasmic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6sc2__assembly_1__model_1

6sc2__assembly_1__model_1 | I(q)

6sc2__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (10)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source