Epidermal growth factor receptor
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 | 链 D； UniProt 695–1022 | 未记录 | UEJ N-(3-{5-[2-(acetylamino)pyridin-4-yl]-2-(methylsulfanyl)-1H-imidazol-4-yl}phenyl)-2-[(1,3-dioxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)methyl]-6-fluoro-3-hydroxybenzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 M BisTris, 25% PEG-3350 | 分辨率 1.76 Å R-free 0.235 |
| 2 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 | 链 A； UniProt 695–1022 | 未记录 | 无其他共同聚合物 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 M BisTris, 25% PEG-3350 | 分辨率 1.76 Å R-free 0.235 |
| 3 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 | 链 B； UniProt 695–1022 | 未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 M BisTris, 25% PEG-3350 | 分辨率 1.76 Å R-free 0.235 |
| 4 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 | 链 C； UniProt 695–1022 | 未记录 | UEJ N-(3-{5-[2-(acetylamino)pyridin-4-yl]-2-(methylsulfanyl)-1H-imidazol-4-yl}phenyl)-2-[(1,3-dioxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)methyl]-6-fluoro-3-hydroxybenzamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 M BisTris, 25% PEG-3350 | 分辨率 1.76 Å R-free 0.235 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 6WXN | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1IVO Crystal Structure of the Complex of Human Epidermal Growth Factor and Receptor Extracellular Domains. 提交 2002-03-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
25–646（622 aa）
片段：extracellular domains I, II, II and IV
链 B
25–646（622 aa）
片段：extracellular domains I, II, II and IV
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；293 K；PEG4000, PEG6000, sodium acetate, sodium chloride, TRIS, pH 8.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.326 |
| 1M14 Tyrosine Kinase Domain from Epidermal Growth Factor Receptor 提交 2002-06-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：tyrosine kinase domain (residues 671-998)
|
突变：E666G, P667S, L668H, T669M, P670A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；tartrate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.286 |
| 1M17 Epidermal Growth Factor Receptor tyrosine kinase domain with 4-anilinoquinazoline inhibitor erlotinib 提交 2002-06-17 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：tyrosine kinase domain (residues 671-998)
|
未记录 | AQ4 [6,7-BIS(2-METHOXY-ETHOXY)QUINAZOLINE-4-YL]-(3-ETHYNYLPHENYL)AMINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；tartrate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.295 |
| 1MOX Crystal Structure of Human Epidermal Growth Factor Receptor (residues 1-501) in complex with TGF-alpha 提交 2002-09-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
25–525（501 aa）
片段：Extracellular Fragment
链 B
25–525（501 aa）
片段：Extracellular Fragment
|
未记录 | PT PLATINUM (II) ION × 7 CD CADMIUM ION × 11 CL CHLORIDE ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；7% PEG 3350, 20% Trehalose, 10mM CdCl2, 100mM HEPES, di-mu-iodobis(ethylenediamine)diplatinum nitrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.289 |
| 1XKK EGFR kinase domain complexed with a quinazoline inhibitor- GW572016 提交 2004-09-29 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：EGFR kinase domain
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 FMM N-{3-CHLORO-4-[(3-FLUOROBENZYL)OXY]PHENYL}-6-[5-({[2-(METHYLSULFONYL)ETHYL]AMINO}METHYL)-2-FURYL]-4-QUINAZOLINAMINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；100 mM CAPS, 200 mM LiSO4, 2M NaKPO4, pH 9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.255 |
| 1YY9 Structure of the extracellular domain of the epidermal growth factor receptor in complex with the Fab fragment of cetuximab/Erbitux/IMC-C225 提交 2005-02-24 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
25–642（618 aa）
片段：UNP residues 25-642
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；300 K；PEG 3450, Ammonium sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.289 |
| 1Z9I A Structural Model for the Membrane-Bound Form of the Juxtamembrane Domain of the Epidermal Growth Factor Receptor 提交 2005-04-02 | 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
669–721（53 aa）
片段：sequence database residues 669-721
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5；308 K；压力 1
NMR样品组成
1.5 mM JX EGFR in 90 mM DPC 15N,13C, 90% H20, 10% D20 | 90% H20, 10% D20
NMR样品组成
1.5 mM JX EGFR in 90 mM DPC 15N in dry acrylamide gel then compress in the NMR tube, 90% H20, 10% D20 | 90% H20, 10% D20
|
分辨率未提供 |
| 2EB2 Crystal structure of mutated EGFR kinase domain (G719S) 提交 2007-02-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain, UNP residues 695-1022
|
突变：G719S | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1M MES, 1.1M Na/K tartrate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.253 |
| 2EB3 Crystal structure of mutated EGFR kinase domain (L858R) in complex with AMPPNP 提交 2007-02-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain, UNP residues 695-1022
|
突变：L858R | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.7；293 K；0.1M Tris-HCl, 28% PEG 3000, pH 8.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.84 Å R-free 0.236 |
| 2GS2 Crystal Structure of the active EGFR kinase domain 提交 2006-04-25 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：kinase domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；1M NaMalonate, 100 mM HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.250 |
| 2GS7 Crystal Structure of the inactive EGFR kinase domain in complex with AMP-PNP 提交 2006-04-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：kinase domain, residues 696-1022
链 B
696–1022（327 aa）
片段：kinase domain, residues 696-1022
|
突变：V924R 突变：V924R | MG MAGNESIUM ION × 2 IOD IODIDE ION × 11 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；20% PEG3350, 0.2 M NaI, 100 mM Bis-Tris Propane, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.298 |
| 2ITN Crystal structure of EGFR kinase domain G719S mutation in complex with AMP-PNP 提交 2006-05-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1019（324 aa）
片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 696-1022
|
突变：YES | MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；1.2M KNA TARTRATE, 0.1M HEPES 7.5
|
分辨率 2.47 Å R-free 0.267 |
| 2ITO Crystal structure of EGFR kinase domain G719S mutation in complex with Iressa 提交 2006-05-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 696-1022
|
突变：YES | IRE Gefitinib × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；1.2M KNA TARTRATE, 0.1M HEPES 7.5
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.266 |
| 2ITP Crystal structure of EGFR kinase domain G719S mutation in complex with AEE788 提交 2006-05-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 696-1022
|
突变：YES | AEE 6-{4-[(4-ETHYLPIPERAZIN-1-YL)METHYL]PHENYL}-N-[(1R)-1-PHENYLETHYL]-7H-PYRROLO[2,3-D]PYRIMIDIN-4-AMINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；1.2M KNA TARTRATE, 0.1M HEPES 7.5
|
分辨率 2.74 Å R-free 0.255 |
| 2ITQ Crystal structure of EGFR kinase domain G719S mutation in complex with AFN941 提交 2006-05-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 696-1022
|
突变：YES | ITQ 1,2,3,4-Tetrahydrogen Staurosporine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；1.2M KNA TARTRATE, 0.1M HEPES 7.5
|
分辨率 2.68 Å R-free 0.263 |
| 2ITT Crystal structure of EGFR kinase domain L858R mutation in complex with AEE788 提交 2006-05-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 696-1022
|
突变：YES | AEE 6-{4-[(4-ETHYLPIPERAZIN-1-YL)METHYL]PHENYL}-N-[(1R)-1-PHENYLETHYL]-7H-PYRROLO[2,3-D]PYRIMIDIN-4-AMINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；40% PEG400, 0.15M NACL, 0.1M HEPES 8.0, pH 7.5
|
分辨率 2.73 Å R-free 0.262 |
| 2ITU Crystal structure of EGFR kinase domain L858R mutation in complex with AFN941 提交 2006-05-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 696-1022
|
突变：YES | ITQ 1,2,3,4-Tetrahydrogen Staurosporine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；40% PEG400, 0.15M NACL, 0.1M HEPES 8.0, pH 7.50
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.258 |
| 2ITV Crystal structure of EGFR kinase domain L858R mutation in complex with AMP-PNP 提交 2006-05-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 696-1022
|
突变：YES | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；40% PEG400, 0.15M NACL, 0.1M HEPES 7.5, pH 7.50
|
分辨率 2.47 Å R-free 0.242 |
| 2ITW Crystal structure of EGFR kinase domain in complex with AFN941 提交 2006-05-25 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 696-1022
|
未记录 | ITQ 1,2,3,4-Tetrahydrogen Staurosporine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；1.2M KNA TARTRATE, 0.1M HEPES 7.5, pH 7.50
|
分辨率 2.88 Å R-free 0.256 |
| 2ITX Crystal structure of EGFR kinase domain in complex with AMP-PNP 提交 2006-05-25 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：KINASE DOMAIN RESIDUES 696-1022
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；1.2M KNA TARTRATE, 0.1M HEPES 7.5, pH 7.50
|
分辨率 2.98 Å R-free 0.261 |
| 2ITY Crystal structure of EGFR kinase domain in complex with Iressa 提交 2006-05-25 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 696-1022
|
未记录 | IRE Gefitinib × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；1.2M KNA TARTRATE, 0.1M HEPES 7.5, pH 7.50
|
分辨率 3.42 Å R-free 0.260 |
| 2ITZ Crystal structure of EGFR kinase domain L858R mutation in complex with Iressa 提交 2006-05-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 696-1022
|
突变：YES | CL CHLORIDE ION × 1 IRE Gefitinib × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；40% PEG400, 0.15M NACL, 0.1M HEPES PH7.5, pH 7.50
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.255 |
| 2J5E Crystal structure of EGFR kinase domain in complex with an irreversible inhibitor 13-jab 提交 2006-09-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 696-1022
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；1.2M NAK TARTRATE, 0.1M HEPES PH 7.5
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.255 |
| 2J5F Crystal structure of EGFR kinase domain in complex with an irreversible inhibitor 34-jab 提交 2006-09-14 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 696-1022
|
未记录 | DJK N-[4-(3-BROMO-PHENYLAMINO)-QUINAZOLIN-6-YL]-ACRYLAMIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；1.2M NAK TARTRATE, 0.1M HEPES PH 7.5
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.246 |
| 2J6M Crystal structure of EGFR kinase domain in complex with AEE788 提交 2006-09-29 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 696-1022
|
未记录 | AEE 6-{4-[(4-ETHYLPIPERAZIN-1-YL)METHYL]PHENYL}-N-[(1R)-1-PHENYLETHYL]-7H-PYRROLO[2,3-D]PYRIMIDIN-4-AMINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；1.2M NAK TARTRATE, 0.1M HEPES 7.5, pH 7.50
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.249 |
| 2JIT Crystal structure of EGFR kinase domain T790M mutation 提交 2007-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 696-1022
|
突变：YES | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；0.1M HEPES 7.5, 0.3M NACL, 21% PEG6K, 5MM TCEP
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.249 |
| 2JIT Crystal structure of EGFR kinase domain T790M mutation 提交 2007-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
696–1022（327 aa）
片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 696-1022
|
突变：YES | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；0.1M HEPES 7.5, 0.3M NACL, 21% PEG6K, 5MM TCEP
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.249 |
| 2JIU Crystal structure of EGFR kinase domain T790M mutation in complex with AEE788 提交 2007-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 695-1022
|
突变：YES | AEE 6-{4-[(4-ETHYLPIPERAZIN-1-YL)METHYL]PHENYL}-N-[(1R)-1-PHENYLETHYL]-7H-PYRROLO[2,3-D]PYRIMIDIN-4-AMINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；0.1M HEPES 7.5, 0.3M NACL, 21% PEG6K, 5MM TCEP
|
分辨率 3.05 Å R-free 0.277 |
| 2JIU Crystal structure of EGFR kinase domain T790M mutation in complex with AEE788 提交 2007-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 695-1022
|
突变：YES | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；0.1M HEPES 7.5, 0.3M NACL, 21% PEG6K, 5MM TCEP
|
分辨率 3.05 Å R-free 0.277 |
| 2JIV Crystal structure of EGFR kinase domain T790M mutation in compex with HKI-272 提交 2007-07-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 695-1022
|
突变：YES | HKI N-(4-{[3-chloro-4-(pyridin-2-ylmethoxy)phenyl]amino}-3-cyano-7-ethoxyquinolin-6-yl)-4-(dimethylamino)butanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；0.1M HEPES PH7.0, 0.2M LI2SO4, 28% PEG3350, 5MM TCEP, pH 7.5
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.284 |
| 2JIV Crystal structure of EGFR kinase domain T790M mutation in compex with HKI-272 提交 2007-07-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 695-1022
|
突变：YES | HKI N-(4-{[3-chloro-4-(pyridin-2-ylmethoxy)phenyl]amino}-3-cyano-7-ethoxyquinolin-6-yl)-4-(dimethylamino)butanamide × 1 CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；0.1M HEPES PH7.0, 0.2M LI2SO4, 28% PEG3350, 5MM TCEP, pH 7.5
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.284 |
| 2KS1 Heterodimeric association of Transmembrane domains of ErbB1 and ErbB2 receptors Enabling Kinase Activation 提交 2009-12-24 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
634–677（44 aa）
片段：ErbB1TM domain, UNP residues 634-677
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 4.5；313 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-100% 15N] ErbB1TM-1, 1 mM [U-100% 15N] ErbB2TM-2, 12 mM DMPC-3, 48 mM DHPC-4, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] ErbB1TM-5, 1 mM ErbB2TM-6, 12 mM [U-2H] DMPC-7, 48 mM [U-2H] DHPC-8, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
1 mM ErbB1TM-9, 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] ErbB2TM-10, 12 mM [U-2H] DMPC-11, 48 mM [U-2H] DHPC-12, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] ErbB1TM-13, 1 mM ErbB2TM-14, 12 mM [U-2H] DMPC-15, 48 mM [U-2H] DHPC-16, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2M0B Homodimeric transmembrane domain of the human receptor tyrosine kinase ErbB1 (EGFR, HER1) in micelles 提交 2012-10-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
634–677（44 aa）
片段：Transmembrane region residues 634-677
链 B
634–677（44 aa）
片段：Transmembrane region residues 634-677
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5；313 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient
NMR样品组成
0.75 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] ErbB1tm, 0.75 mM ErbB1tm, 90 mM [U-99% 2H] DPC, 0.3 mM sodium azide, 6 mM TCEP, 10 mM citric acid, 20 mM Na2HPO4, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.75 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] ErbB1tm, 0.75 mM ErbB1tm, 90 mM [U-99% 2H] DPC, 0.3 mM sodium azide, 6 mM TCEP, 10 mM citric acid, 20 mM Na2HPO4, 99.9% D2O | 99.9% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2M20 EGFR transmembrane - juxtamembrane (TM-JM) segment in bicelles: MD guided NMR refined structure. 提交 2012-12-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
642–697（56 aa）
片段：EGFR Transmembrane-Juxtamembrane segment, UNP residues 642-697
链 B
642–697（56 aa）
片段：EGFR Transmembrane-Juxtamembrane segment, UNP residues 642-697
|
突变：M9L (M650 in UNP P00533), M27I (M668 in UNP P00533) 突变：M9L (M650 in UNP P00533), M27I (M668 in UNP P00533) | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.2；312 K；离子强度（mmCIF原始值）0.05；压力 ambient
NMR样品组成
0.300 mM [U-100% 13C; U-100% 15N; U-80% 2H] EGFR TM-JM, 50 mM MES, 5 mM TCEP, 1 mM EDTA, 0.05 mM AMESF, 10 % [U-2H] D2O, 0.02 % sodium azide, 9.4 mM [U-99% 2H] DMPC (D54), 37.98 mM [U-99% 2H] DHPC (D22), 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.300 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] EGFR TM-JM, 50 mM MES, 5 mM TCEP, 1 mM EDTA, 0.05 mM AMESF, 10 % [U-2H] D2O, 0.02 % sodium azide, 9.4 mM [U-99% 2H] DMPC (D54), 37.98 mM [U-99% 2H] DHPC (D22), 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.300 mM EGFR TM-JM, 50 mM MES, 5 mM TCEP, 1 mM EDTA, 0.05 mM AMESF, 10 % [U-2H] D2O, 0.02 % sodium azide, 18.8 mM [U-99% 2H] DMPC (D54), 77.86 mM [U-99% 2H] DHPC (D22), 0.300 mM EGFR TM-JM, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2N5S Spatial structure of EGFR transmembrane and juxtamembrane domains in DPC micelles 提交 2015-07-27 | 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
642–690（49 aa）
片段：residues 642-690
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5.8；314 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 ambient
NMR样品组成
0.3 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] EGFR, 2 mM TCEP, 20 mM sodium phosphate, 1 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2RF9 Crystal structure of the complex between the EGFR kinase domain and a Mig6 peptide 提交 2007-09-28 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：Protein kinase domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；20% PEG3350, 300 mM KAC, 10% Glycerol and 100 mM NaAc, pH 5.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.329 |
| 2RF9 Crystal structure of the complex between the EGFR kinase domain and a Mig6 peptide 提交 2007-09-28 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
696–1022（327 aa）
片段：Protein kinase domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；20% PEG3350, 300 mM KAC, 10% Glycerol and 100 mM NaAc, pH 5.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.329 |
| 2RFD Crystal structure of the complex between the EGFR kinase domain and a Mig6 peptide 提交 2007-09-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
702–1022（321 aa）
片段：Protein kinase domain
|
突变：K799E | SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG3350, 200 mM Na2SO4, 100 mM Bis-Tris propane, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.278 |
| 2RFD Crystal structure of the complex between the EGFR kinase domain and a Mig6 peptide 提交 2007-09-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
702–1022（321 aa）
片段：Protein kinase domain
|
突变：K799E | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG3350, 200 mM Na2SO4, 100 mM Bis-Tris propane, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.278 |
| 2RFE Crystal structure of the complex between the EGFR kinase domain and a Mig6 peptide 提交 2007-09-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
702–1022（321 aa）
片段：Protein kinase domain
|
突变：K799E | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；19% PEG3350, 100 mM NaNO3, 100 mM Bis-Tris propane, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.271 |
| 2RFE Crystal structure of the complex between the EGFR kinase domain and a Mig6 peptide 提交 2007-09-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
702–1022（321 aa）
片段：Protein kinase domain
|
突变：K799E | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；19% PEG3350, 100 mM NaNO3, 100 mM Bis-Tris propane, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.271 |
| 2RFE Crystal structure of the complex between the EGFR kinase domain and a Mig6 peptide 提交 2007-09-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
702–1022（321 aa）
片段：Protein kinase domain
|
突变：K799E | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；19% PEG3350, 100 mM NaNO3, 100 mM Bis-Tris propane, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.271 |
| 2RFE Crystal structure of the complex between the EGFR kinase domain and a Mig6 peptide 提交 2007-09-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
702–1022（321 aa）
片段：Protein kinase domain
|
突变：K799E | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；19% PEG3350, 100 mM NaNO3, 100 mM Bis-Tris propane, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.271 |
| 2RGP Structure of EGFR in complex with hydrazone, a potent dual inhibitor 提交 2007-10-04 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
702–1016（315 aa）
片段：Residues 702-1016
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 HYZ N-[1-(3-fluorobenzyl)-1H-indazol-5-yl]-5-[(piperidin-1-ylamino)methyl]pyrimidine-4,6-diamine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；295 K；2M Na/K3PO4, 0.1M Caps pH 9.0 and 0.2M Li2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.268 |
| 3B2U Crystal structure of isolated domain III of the extracellular region of the epidermal growth factor receptor in complex with the Fab fragment of IMC-11F8 提交 2007-10-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
335–538（204 aa）
片段：sequence database residues 335-538
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5；298 K；12 % PEG 3350, 0.25 M ammonium acetate, 50 mM sodium acetate, pH 5.0, vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 2.58 Å R-free 0.291 |
| 3B2U Crystal structure of isolated domain III of the extracellular region of the epidermal growth factor receptor in complex with the Fab fragment of IMC-11F8 提交 2007-10-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
335–538（204 aa）
片段：sequence database residues 335-538
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5；298 K；12 % PEG 3350, 0.25 M ammonium acetate, 50 mM sodium acetate, pH 5.0, vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 2.58 Å R-free 0.291 |
| 3B2U Crystal structure of isolated domain III of the extracellular region of the epidermal growth factor receptor in complex with the Fab fragment of IMC-11F8 提交 2007-10-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 E
335–538（204 aa）
片段：sequence database residues 335-538
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5；298 K；12 % PEG 3350, 0.25 M ammonium acetate, 50 mM sodium acetate, pH 5.0, vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 2.58 Å R-free 0.291 |
| 3B2U Crystal structure of isolated domain III of the extracellular region of the epidermal growth factor receptor in complex with the Fab fragment of IMC-11F8 提交 2007-10-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 I
335–538（204 aa）
片段：sequence database residues 335-538
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5；298 K；12 % PEG 3350, 0.25 M ammonium acetate, 50 mM sodium acetate, pH 5.0, vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 2.58 Å R-free 0.291 |
| 3B2U Crystal structure of isolated domain III of the extracellular region of the epidermal growth factor receptor in complex with the Fab fragment of IMC-11F8 提交 2007-10-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 M
335–538（204 aa）
片段：sequence database residues 335-538
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5；298 K；12 % PEG 3350, 0.25 M ammonium acetate, 50 mM sodium acetate, pH 5.0, vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 2.58 Å R-free 0.291 |
| 3B2U Crystal structure of isolated domain III of the extracellular region of the epidermal growth factor receptor in complex with the Fab fragment of IMC-11F8 提交 2007-10-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 P
335–538（204 aa）
片段：sequence database residues 335-538
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5；298 K；12 % PEG 3350, 0.25 M ammonium acetate, 50 mM sodium acetate, pH 5.0, vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 2.58 Å R-free 0.291 |
| 3B2U Crystal structure of isolated domain III of the extracellular region of the epidermal growth factor receptor in complex with the Fab fragment of IMC-11F8 提交 2007-10-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 7 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 S
335–538（204 aa）
片段：sequence database residues 335-538
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5；298 K；12 % PEG 3350, 0.25 M ammonium acetate, 50 mM sodium acetate, pH 5.0, vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 2.58 Å R-free 0.291 |
| 3B2U Crystal structure of isolated domain III of the extracellular region of the epidermal growth factor receptor in complex with the Fab fragment of IMC-11F8 提交 2007-10-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 8 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 V
335–538（204 aa）
片段：sequence database residues 335-538
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5；298 K；12 % PEG 3350, 0.25 M ammonium acetate, 50 mM sodium acetate, pH 5.0, vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 2.58 Å R-free 0.291 |
| 3B2V Crystal structure of the extracellular region of the epidermal growth factor receptor in complex with the Fab fragment of IMC-11F8 提交 2007-10-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
25–642（618 aa）
片段：Extracellular domain
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；298 K；12 % PEG 3350, IM NaCl, 50 mM MES, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.367 |
| 3BEL X-ray structure of EGFR in complex with oxime inhibitor 提交 2007-11-19 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
702–1016（315 aa）
片段：Residues 702-1016
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 POX 4-amino-6-{[1-(3-fluorobenzyl)-1H-indazol-5-yl]amino}pyrimidine-5-carbaldehyde O-(2-methoxyethyl)oxime × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；295 K；2M Na/K3PO4, 0.1M Caps pH 9.0 and 0.2M Li2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.281 |
| 3BUO Crystal structure of c-Cbl-TKB domain complexed with its binding motif in EGF receptor' 提交 2008-01-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1063–1075（13 aa）
片段：UNP residues 1063-1075, pTyr-1069 phosphopeptide
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.25M Na formate, 20% PEG 3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.278 |
| 3BUO Crystal structure of c-Cbl-TKB domain complexed with its binding motif in EGF receptor' 提交 2008-01-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
1063–1075（13 aa）
片段：UNP residues 1063-1075, pTyr-1069 phosphopeptide
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.25M Na formate, 20% PEG 3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.278 |
| 3C09 Crystal structure the Fab fragment of matuzumab (Fab72000) in complex with domain III of the extracellular region of EGFR 提交 2008-01-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 D
336–538（203 aa）
片段：sEGFR domain III
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 BMA beta-D-mannopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；298 K；16% PEG 3350, 1M NaCl, pH 6.0, vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.299 |
| 3C09 Crystal structure the Fab fragment of matuzumab (Fab72000) in complex with domain III of the extracellular region of EGFR 提交 2008-01-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
336–538（203 aa）
片段：sEGFR domain III
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 BMA beta-D-mannopyranose × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；298 K；16% PEG 3350, 1M NaCl, pH 6.0, vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.299 |
| 3GOP Crystal structure of the EGF receptor juxtamembrane and kinase domains 提交 2009-03-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
669–1022（354 aa）
片段：sequence database residues 669-1018
|
突变：K721M | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；294 K；10% PEG3350, 0.1M KCl, 0.1M Tris pH8.5, vapor diffusion, temperature 294K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.259 |
| 3GOP Crystal structure of the EGF receptor juxtamembrane and kinase domains 提交 2009-03-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
669–1022（354 aa）
片段：sequence database residues 669-1018
|
突变：K721M | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；294 K；10% PEG3350, 0.1M KCl, 0.1M Tris pH8.5, vapor diffusion, temperature 294K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.259 |
| 3GT8 Crystal structure of the inactive EGFR kinase domain in complex with AMP-PNP 提交 2009-03-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
696–1022（327 aa）
片段：inactive protein kinase (UNP residues 651-977)
链 C
696–1022（327 aa）
片段：inactive protein kinase (UNP residues 651-977)
|
突变：V924R 突变：V924R | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；protein at 6mg/ml, 5mM AMP-PNP, 2mM MgCl2, 0.1M Bis-Tris pH5.5, 0.1M ammonium acetate, 17% w/v PEG 10000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.96 Å R-free 0.275 |
| 3GT8 Crystal structure of the inactive EGFR kinase domain in complex with AMP-PNP 提交 2009-03-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：inactive protein kinase (UNP residues 651-977)
链 D
696–1022（327 aa）
片段：inactive protein kinase (UNP residues 651-977)
|
突变：V924R 突变：V924R | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；protein at 6mg/ml, 5mM AMP-PNP, 2mM MgCl2, 0.1M Bis-Tris pH5.5, 0.1M ammonium acetate, 17% w/v PEG 10000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.96 Å R-free 0.275 |
| 3IKA Crystal Structure of EGFR 696-1022 T790M Mutant Covalently Binding to WZ4002 提交 2009-08-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
694–1022（329 aa）
片段：694-1022
|
突变：T790M | 0UN N-{3-[(5-chloro-2-{[2-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)oxy]phenyl}prop-2-enamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；0.1M Hepes 7.4, 22% PEG6000, 0.3M NaCl, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.257 |
| 3IKA Crystal Structure of EGFR 696-1022 T790M Mutant Covalently Binding to WZ4002 提交 2009-08-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
694–1022（329 aa）
片段：694-1022
|
突变：T790M | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；0.1M Hepes 7.4, 22% PEG6000, 0.3M NaCl, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.257 |
| 3IKA Crystal Structure of EGFR 696-1022 T790M Mutant Covalently Binding to WZ4002 提交 2009-08-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
694–1022（329 aa）
片段：694-1022
链 B
694–1022（329 aa）
片段：694-1022
|
突变：T790M 突变：T790M | 0UN N-{3-[(5-chloro-2-{[2-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)oxy]phenyl}prop-2-enamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；0.1M Hepes 7.4, 22% PEG6000, 0.3M NaCl, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.257 |
| 3LZB EGFR kinase domain complexed with an imidazo[2,1-b]thiazole inhibitor 提交 2010-03-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：UNP residues 696-1022
|
突变：V924R | ITI N-[3-(5-{2-[(4-morpholin-4-ylphenyl)amino]pyrimidin-4-yl}imidazo[2,1-b][1,3]thiazol-6-yl)phenyl]-2-phenylacetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；290 K；0.15M cesium chloride, 15% w/v polyethylene glycol 3350, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.257 |
| 3LZB EGFR kinase domain complexed with an imidazo[2,1-b]thiazole inhibitor 提交 2010-03-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
696–1022（327 aa）
片段：UNP residues 696-1022
|
突变：V924R | ITI N-[3-(5-{2-[(4-morpholin-4-ylphenyl)amino]pyrimidin-4-yl}imidazo[2,1-b][1,3]thiazol-6-yl)phenyl]-2-phenylacetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；290 K；0.15M cesium chloride, 15% w/v polyethylene glycol 3350, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.257 |
| 3LZB EGFR kinase domain complexed with an imidazo[2,1-b]thiazole inhibitor 提交 2010-03-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
696–1022（327 aa）
片段：UNP residues 696-1022
|
突变：V924R | ITI N-[3-(5-{2-[(4-morpholin-4-ylphenyl)amino]pyrimidin-4-yl}imidazo[2,1-b][1,3]thiazol-6-yl)phenyl]-2-phenylacetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；290 K；0.15M cesium chloride, 15% w/v polyethylene glycol 3350, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.257 |
| 3LZB EGFR kinase domain complexed with an imidazo[2,1-b]thiazole inhibitor 提交 2010-03-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
696–1022（327 aa）
片段：UNP residues 696-1022
|
突变：V924R | ITI N-[3-(5-{2-[(4-morpholin-4-ylphenyl)amino]pyrimidin-4-yl}imidazo[2,1-b][1,3]thiazol-6-yl)phenyl]-2-phenylacetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；290 K；0.15M cesium chloride, 15% w/v polyethylene glycol 3350, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.257 |
| 3LZB EGFR kinase domain complexed with an imidazo[2,1-b]thiazole inhibitor 提交 2010-03-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 E
696–1022（327 aa）
片段：UNP residues 696-1022
|
突变：V924R | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；290 K；0.15M cesium chloride, 15% w/v polyethylene glycol 3350, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.257 |
| 3LZB EGFR kinase domain complexed with an imidazo[2,1-b]thiazole inhibitor 提交 2010-03-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 F
696–1022（327 aa）
片段：UNP residues 696-1022
|
突变：V924R | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；290 K；0.15M cesium chloride, 15% w/v polyethylene glycol 3350, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.257 |
| 3LZB EGFR kinase domain complexed with an imidazo[2,1-b]thiazole inhibitor 提交 2010-03-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 G
696–1022（327 aa）
片段：UNP residues 696-1022
|
突变：V924R | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；290 K；0.15M cesium chloride, 15% w/v polyethylene glycol 3350, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.257 |
| 3LZB EGFR kinase domain complexed with an imidazo[2,1-b]thiazole inhibitor 提交 2010-03-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 H
696–1022（327 aa）
片段：UNP residues 696-1022
|
突变：V924R | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；290 K；0.15M cesium chloride, 15% w/v polyethylene glycol 3350, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.257 |
| 3NJP The Extracellular and Transmembrane Domain Interfaces in Epidermal Growth Factor Receptor Signaling 提交 2010-06-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
25–638（614 aa）
链 B
25–638（614 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 2PE NONAETHYLENE GLYCOL × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；293 K；15% PEG4000, 1% PEG6000, 75 mM
Tris-HCl, 75 mM soidum acetate, and 200 mM NaCl, pH 8.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.298 |
| 3NJP The Extracellular and Transmembrane Domain Interfaces in Epidermal Growth Factor Receptor Signaling 提交 2010-06-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
25–638（614 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；293 K；15% PEG4000, 1% PEG6000, 75 mM
Tris-HCl, 75 mM soidum acetate, and 200 mM NaCl, pH 8.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.298 |
| 3NJP The Extracellular and Transmembrane Domain Interfaces in Epidermal Growth Factor Receptor Signaling 提交 2010-06-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
25–638（614 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 2PE NONAETHYLENE GLYCOL × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；293 K；15% PEG4000, 1% PEG6000, 75 mM
Tris-HCl, 75 mM soidum acetate, and 200 mM NaCl, pH 8.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.298 |
| 3OB2 Crystal structure of c-Cbl TKB domain in complex with double phosphorylated EGFR peptide 提交 2010-08-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1063–1074（12 aa）
片段：residues 1063-1074
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；298 K；20% (w/v) PEG 3350, 150mM NaK tartrate, 0.1 M Bis-Tris propane pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.217 |
| 3OP0 Crystal structure of Cbl-c (Cbl-3) TKB domain in complex with EGFR pY1069 peptide 提交 2010-08-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
1066–1076（11 aa）
片段：EGFR, UNP residues 1066-1076
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；277.15 K；20% Jeffamine M-600, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 2.52 Å R-free 0.266 |
| 3OP0 Crystal structure of Cbl-c (Cbl-3) TKB domain in complex with EGFR pY1069 peptide 提交 2010-08-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
1066–1076（11 aa）
片段：EGFR, UNP residues 1066-1076
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；277.15 K；20% Jeffamine M-600, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 2.52 Å R-free 0.266 |
| 3OP0 Crystal structure of Cbl-c (Cbl-3) TKB domain in complex with EGFR pY1069 peptide 提交 2010-08-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 C
1066–1076（11 aa）
片段：EGFR, UNP residues 1066-1076
链 D
1066–1076（11 aa）
片段：EGFR, UNP residues 1066-1076
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 2 NI NICKEL (II) ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；277.15 K；20% Jeffamine M-600, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 2.52 Å R-free 0.266 |
| 3P0Y anti-EGFR/HER3 Fab DL11 in complex with domain III of EGFR extracellular region 提交 2010-09-29 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
334–538（205 aa）
片段：domain III, UNP residues 334-540
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；286 K；potassium phosphate/PEG3350/sodium dextran sulfate, pH 8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 286K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.215 |
| 3PFV Crystal structure of Cbl-b TKB domain in complex with EGFR pY1069 peptide 提交 2010-10-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
1066–1076（11 aa）
片段：UNP residues 1066-1076
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；30% PEG 3350, 0.3M Ammonium sulfate, 0.1M Bis-Tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 2.27 Å R-free 0.262 |
| 3PFV Crystal structure of Cbl-b TKB domain in complex with EGFR pY1069 peptide 提交 2010-10-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
1066–1076（11 aa）
片段：UNP residues 1066-1076
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；30% PEG 3350, 0.3M Ammonium sulfate, 0.1M Bis-Tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 2.27 Å R-free 0.262 |
| 3POZ EGFR Kinase domain complexed with tak-285 提交 2010-11-23 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：Residues 606-1022
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 03P N-{2-[4-({3-chloro-4-[3-(trifluoromethyl)phenoxy]phenyl}amino)-5H-pyrrolo[3,2-d]pyrimidin-5-yl]ethyl}-3-hydroxy-3-methylbutanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5；293 K；pH 6.5, hanging drop vapor diffusion, temperature 20K, temperature 293K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.243 |
| 3QWQ Crystal structure of the extracellular domain of the epidermal growth factor receptor in complex with an adnectin 提交 2011-02-28 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–642（642 aa）
片段：ECTODOMAIN
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7；293 K；60% Tacsimate, pH 7.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.246 |
| 3UG1 Crystal structure of the mutated EGFR kinase domain (G719S/T790M) in the apo form 提交 2011-11-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：KINASE DOMAIN, UNP residues 695-1022
|
突变：G719S, T790M | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
COUNTER-DIFFUSION；pH 7.1；293 K；COUNTER DIFFUSION IN MICROGRAVITY CONDITIONS; COUNTER-DIFFUSION METHOD USING JAXA CRYSTALLISATION BOX (JCB). 40mm X 0.5mm CAPILLARIES WERE FILLED WITH 8.1mg/ml PROTEIN SOLUTION AND INSTALLED INTO JCB SYRINGE CASE FILLED WITH MOTHER LIQUOUR (1.7M Sodium CITRATE, 0.1M MES, 7.1). CRYSTALS WERE IN ORBIT FOR 2.5 MONTHS IN THE PROTEIN CRYSTALLISATION RESEARCH FACILITY ON THE JAPANESE EXPERIMENT MODULE OF THE INTERNATIONAL SPACE STATION., Counter Diffusion, temperature 293K
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.243 |
| 3UG2 Crystal structure of the mutated EGFR kinase domain (G719S/T790M) in complex with gefitinib 提交 2011-11-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：KINASE DOMAIN, UNP residues 695-1022
|
突变：G719S, T790M | IRE Gefitinib × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；293 K；1.1M Sodium citrate, 0.1M MES PH 7.1, 5mg/ml protein, incubated overnight at 4deg with final concentration of 0.5mM gefitinib and 1% DMSO , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.249 |
| 3VJN Crystal structure of the mutated EGFR kinase domain (G719S/T790M) in complex with AMPPNP. 提交 2011-10-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain (UNP RESIDUES 695-1022)
|
突变：G719S, T790M | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1M Tris-HCl(pH 7.0), 0.2M NaCl, 1M Sodium citrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.244 |
| 3VJO Crystal structure of the wild-type EGFR kinase domain in complex with AMPPNP. 提交 2011-10-27 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain (UNP RESIDUES 695-1022)
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1M Tris-HCl(pH 7.0), 0.2M NaCl, 1M Sodium citrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.64 Å R-free 0.228 |
| 3VRP Crystal structure of the tyrosine kinase binding domain of Cbl-c in complex with phospho-EGFR peptide 提交 2012-04-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
1062–1074（13 aa）
片段：phospho-EGFR peptide, UNP residues residues 1062-1074
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；10% PEG3350, 0.1M ammonium formate, 0.2M NDSB-201, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.210 |
| 3VRR Crystal structure of the tyrosine kinase binding domain of Cbl-c (PL mutant) in complex with phospho-EGFR peptide 提交 2012-04-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
1062–1074（13 aa）
片段：phospho-EGFR peptide, UNP residues 1062-1074
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；288 K；16% PEG3350, 0.1M sodium fluoride, 0.6M NDSB-201, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.234 |
| 3W2O EGFR Kinase domain T790M/L858R Mutant with TAK-285 提交 2012-12-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
698–1022（325 aa）
片段：Kinase domain, UNP residues 698-1022
|
突变：T790M/L858R | 03P N-{2-[4-({3-chloro-4-[3-(trifluoromethyl)phenoxy]phenyl}amino)-5H-pyrrolo[3,2-d]pyrimidin-5-yl]ethyl}-3-hydroxy-3-methylbutanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-tris propane pH 6.5, 35% Tacsimate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.216 |
| 3W2P EGFR Kinase domain T790M/L858R mutant with compound 2 提交 2012-12-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
698–1022（325 aa）
片段：Kinase domain, UNP residues 698-1022
|
突变：T790M/L858R | W2P N-{2-[4-({3-chloro-4-[3-(trifluoromethyl)phenoxy]phenyl}amino)-5H-pyrrolo[3,2-d]pyrimidin-5-yl]ethyl}-4-(dimethylamino)butanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-tris propane pH 6.5, 35% Tacsimate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.206 |
| 3W2Q EGFR kinase domain T790M/L858R mutant with HKI-272 提交 2012-12-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
698–1022（325 aa）
片段：Kinase domain, UNP residues 698-1022
|
突变：T790M/L858R | HKI N-(4-{[3-chloro-4-(pyridin-2-ylmethoxy)phenyl]amino}-3-cyano-7-ethoxyquinolin-6-yl)-4-(dimethylamino)butanamide × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-tris propane pH 6.5, 35% Tacsimate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.200 |
| 3W2R EGFR Kinase domain T790M/L858R mutant with compound 4 提交 2012-12-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
698–1022（325 aa）
片段：Kinase domain, UNP residues 698-1022
|
突变：T790M/L858R | W2R 1-{3-[2-chloro-4-({5-[2-(2-hydroxyethoxy)ethyl]-5H-pyrrolo[3,2-d]pyrimidin-4-yl}amino)phenoxy]phenyl}-3-cyclohexylurea × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M Mes pH 5.5, 24% PEG 3350 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.275 |
| 3W2S EGFR kinase domain with compound4 提交 2012-12-03 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：Kinase domain, UNP residues 696-1022
|
未记录 | W2R 1-{3-[2-chloro-4-({5-[2-(2-hydroxyethoxy)ethyl]-5H-pyrrolo[3,2-d]pyrimidin-4-yl}amino)phenoxy]phenyl}-3-cyclohexylurea × 1 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-tris pH 6.5, 0.2M lithium sulfate, 24% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.258 |
| 3W32 EGFR kinase domain complexed with compound 20a 提交 2012-12-07 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：Kinase domain, UNP residues 696-1022
|
未记录 | W32 4-({3-chloro-4-[3-(trifluoromethyl)phenoxy]phenyl}amino)-N-[2-(methylsulfonyl)ethyl]-8,9-dihydro-7H-pyrimido[4,5-b]azepine-6-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；0.1M MES, 0.2M lithium sulfate, 25% PEG 3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.236 |
| 3W33 EGFR kinase domain complexed with compound 19b 提交 2012-12-07 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：Kinase domain, UNP residues 696-1022
|
未记录 | W19 4-{[4-(1-benzothiophen-4-yloxy)-3-chlorophenyl]amino}-N-(2-hydroxyethyl)-8,9-dihydro-7H-pyrimido[4,5-b]azepine-6-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；0.1M MES, 0.2M lithium sulfate, 25% PEG 3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.233 |
| 4G5J Crystal structure of EGFR kinase in complex with BIBW2992 提交 2012-07-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1025（330 aa）
片段：Kinase dimain, UNP residues 696-1022
|
未记录 | 0WN N-{4-[(3-chloro-4-fluorophenyl)amino]-7-[(3S)-tetrahydrofuran-3-yloxy]quinazolin-6-yl}-4-(dimethylamino)butanamide × 1 0WM (2E)-N-{4-[(3-chloro-4-fluorophenyl)amino]-7-[(3S)-tetrahydrofuran-3-yloxy]quinazolin-6-yl}-4-(dimethylamino)but-2-enamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.80 Å R-free 0.259 |
| 4G5J Crystal structure of EGFR kinase in complex with BIBW2992 提交 2012-07-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
696–1025（330 aa）
片段：Kinase dimain, UNP residues 696-1022
|
未记录 | 0WN N-{4-[(3-chloro-4-fluorophenyl)amino]-7-[(3S)-tetrahydrofuran-3-yloxy]quinazolin-6-yl}-4-(dimethylamino)butanamide × 2 0WM (2E)-N-{4-[(3-chloro-4-fluorophenyl)amino]-7-[(3S)-tetrahydrofuran-3-yloxy]quinazolin-6-yl}-4-(dimethylamino)but-2-enamide × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.80 Å R-free 0.259 |
| 4G5P Crystal structure of EGFR kinase T790M in complex with BIBW2992 提交 2012-07-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：Kinase domain, UNP residues 696-1022
|
未记录 | 0WN N-{4-[(3-chloro-4-fluorophenyl)amino]-7-[(3S)-tetrahydrofuran-3-yloxy]quinazolin-6-yl}-4-(dimethylamino)butanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.17 Å R-free 0.323 |
| 4G5P Crystal structure of EGFR kinase T790M in complex with BIBW2992 提交 2012-07-18 | 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
696–1022（327 aa）
片段：Kinase domain, UNP residues 696-1022
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.17 Å R-free 0.323 |
| 4G5P Crystal structure of EGFR kinase T790M in complex with BIBW2992 提交 2012-07-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：Kinase domain, UNP residues 696-1022
链 B
696–1022（327 aa）
片段：Kinase domain, UNP residues 696-1022
|
未记录 | 0WN N-{4-[(3-chloro-4-fluorophenyl)amino]-7-[(3S)-tetrahydrofuran-3-yloxy]quinazolin-6-yl}-4-(dimethylamino)butanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.17 Å R-free 0.323 |
| 4HJO Crystal structure of the inactive EGFR tyrosine kinase domain with erlotinib 提交 2012-10-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：tyrosine kinase domain (UNP residues 696-1022)
|
突变：V924R | AQ4 [6,7-BIS(2-METHOXY-ETHOXY)QUINAZOLINE-4-YL]-(3-ETHYNYLPHENYL)AMINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；294.15 K；0.25 M sodium thiocyanate, 27% w/v PEG3350, 10 mM taurine, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294.15K
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.253 |
| 4I1Z Crystal structure of the monomeric (V948R) form of the gefitinib/erlotinib resistant EGFR kinase domain L858R+T790M 提交 2012-11-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：UNP residues 695-1022, Kinase domain
|
突变：T790M, L858R, V948R | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；2.5-2.8M K Acetate, 0.1M ADA pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.227 |
| 4I20 Crystal structure of monomeric (V948R) primary oncogenic mutant L858R EGFR kinase domain 提交 2012-11-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：UNP residues 695-1022, Kinase domain
|
突变：L858R, V948R | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；2.8M Sodium acetate trihydrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.34 Å R-free 0.242 |
| 4I21 Crystal structure of L858R + T790M EGFR kinase domain in complex with MIG6 peptide 提交 2012-11-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：UNP residues 695-1022, EGFR kinase domain
|
突变：L858R, T790M | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；14.5% PEG 8,000, 0.1M Na Acetate trihydrate pH 4.8-5.5, 0.2-0.38 M K acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.37 Å R-free 0.279 |
| 4I21 Crystal structure of L858R + T790M EGFR kinase domain in complex with MIG6 peptide 提交 2012-11-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
695–1022（328 aa）
片段：UNP residues 695-1022, EGFR kinase domain
|
突变：L858R, T790M | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；14.5% PEG 8,000, 0.1M Na Acetate trihydrate pH 4.8-5.5, 0.2-0.38 M K acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.37 Å R-free 0.279 |
| 4I22 Structure of the monomeric (V948R)gefitinib/erlotinib resistant double mutant (L858R+T790M) EGFR kinase domain co-crystallized with gefitinib 提交 2012-11-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：UNP residues 695-1022, EGFR kinase domain
|
突变：T790M, L858R, V948R | IRE Gefitinib × 1 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；294 K；25.0% PEG 3350, 0.2 M Li Sulfate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.224 |
| 4I22 Structure of the monomeric (V948R)gefitinib/erlotinib resistant double mutant (L858R+T790M) EGFR kinase domain co-crystallized with gefitinib 提交 2012-11-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：UNP residues 695-1022, EGFR kinase domain
|
突变：T790M, L858R, V948R | IRE Gefitinib × 2 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；294 K；25.0% PEG 3350, 0.2 M Li Sulfate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.224 |
| 4I23 Crystal structure of the wild-type EGFR kinase domain in complex with dacomitinib (soaked) 提交 2012-11-21 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：UNP residues 695-1022, EGFR kinase domain
|
未记录 | 1C9 (2E)-N-{4-[(3-chloro-4-fluorophenyl)amino]-7-methoxyquinazolin-6-yl}-4-(piperidin-1-yl)but-2-enamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；1.2-1.4 M Na-K Tartrate 0.1 M MES, pH 6.9-7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.279 |
| 4I24 Structure of T790M EGFR kinase domain co-crystallized with dacomitinib 提交 2012-11-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：UNP residues 695-1022, EGFR kinase domain
|
突变：T790M | 1C9 (2E)-N-{4-[(3-chloro-4-fluorophenyl)amino]-7-methoxyquinazolin-6-yl}-4-(piperidin-1-yl)but-2-enamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.12-0.14 M ammonium acetate, 12-14% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.239 |
| 4I24 Structure of T790M EGFR kinase domain co-crystallized with dacomitinib 提交 2012-11-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
片段：UNP residues 695-1022, EGFR kinase domain
|
突变：T790M | 1C9 (2E)-N-{4-[(3-chloro-4-fluorophenyl)amino]-7-methoxyquinazolin-6-yl}-4-(piperidin-1-yl)but-2-enamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.12-0.14 M ammonium acetate, 12-14% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.239 |
| 4I24 Structure of T790M EGFR kinase domain co-crystallized with dacomitinib 提交 2012-11-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：UNP residues 695-1022, EGFR kinase domain
链 B
695–1022（328 aa）
片段：UNP residues 695-1022, EGFR kinase domain
|
突变：T790M 突变：T790M | 1C9 (2E)-N-{4-[(3-chloro-4-fluorophenyl)amino]-7-methoxyquinazolin-6-yl}-4-(piperidin-1-yl)but-2-enamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.12-0.14 M ammonium acetate, 12-14% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.239 |
| 4JQ7 Crystal structure of EGFR kinase domain in complex with compound 2a 提交 2013-03-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
696–1021（326 aa）
片段：tyrosine kinase domain, UNP residues 696-1021
|
未记录 | KJQ (2S)-2-[(5,6-diphenylfuro[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-2-phenylethanol × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；1.0M Ammonium citrate tribase, 0.1M Bis-Tris propane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.73 Å R-free 0.237 |
| 4JQ8 Crystal structure of EGFR kinase domain in complex with compound 4b 提交 2013-03-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
696–1021（326 aa）
片段：tyrosine kinase domain, UNP residues 696-1021
|
未记录 | KJ8 N-[3-(4-{[(1S)-2-hydroxy-1-phenylethyl]amino}-6-phenylfuro[2,3-d]pyrimidin-5-yl)phenyl]-N~3~,N~3~-dimethyl-beta-alaninamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；1.0M Ammonium citrate tribase, 0.1M Bis-Tris propane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.83 Å R-free 0.232 |
| 4JR3 Crystal structure of EGFR kinase domain in complex with compound 3g 提交 2013-03-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
696–1021（326 aa）
片段：EGFR kinase domain, UNP residues 696-1021
|
未记录 | KJR N-[3-(4-{[(1S)-2-hydroxy-1-phenylethyl]amino}-6-phenylfuro[2,3-d]pyrimidin-5-yl)phenyl]acetamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；1.0M Ammonium citrate tribase, 0.1M Bis-Tris propane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.248 |
| 4JRV Crystal structure of EGFR kinase domain in complex with compound 4c 提交 2013-03-22 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
696–1021（326 aa）
片段：EGFR kinase domain, UNP residues 696-1021
|
未记录 | KJV 4-(dimethylamino)-N-[3-(4-{[(1S)-2-hydroxy-1-phenylethyl]amino}-6-phenylfuro[2,3-d]pyrimidin-5-yl)phenyl]butanamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；1.0M Ammonium citrate tribase, 0.1M Bis-Tris propane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.227 |
| 4KRL Nanobody/VHH domain 7D12 in complex with domain III of the extracellular region of EGFR, pH 6.0 提交 2013-05-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
335–538（204 aa）
片段：extracellular region domain III (UNP residues 335-538)
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 IOD IODIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；22.5% PEG3350, 50 mM potassium iodide, 0.1 M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.268 |
| 4KRM Nanobody/VHH domain 7D12 in complex with domain III of the extracellular region of EGFR, pH 3.5 提交 2013-05-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
335–538（204 aa）
片段：extracellular region domain III (UNP residues 335-538)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.5；293 K；22.5% PEG3350, 0.1 M sodium citrate, pH 3.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.244 |
| 4KRM Nanobody/VHH domain 7D12 in complex with domain III of the extracellular region of EGFR, pH 3.5 提交 2013-05-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
335–538（204 aa）
片段：extracellular region domain III (UNP residues 335-538)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.5；293 K；22.5% PEG3350, 0.1 M sodium citrate, pH 3.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.244 |
| 4KRM Nanobody/VHH domain 7D12 in complex with domain III of the extracellular region of EGFR, pH 3.5 提交 2013-05-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 E
335–538（204 aa）
片段：extracellular region domain III (UNP residues 335-538)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.5；293 K；22.5% PEG3350, 0.1 M sodium citrate, pH 3.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.244 |
| 4KRM Nanobody/VHH domain 7D12 in complex with domain III of the extracellular region of EGFR, pH 3.5 提交 2013-05-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 G
335–538（204 aa）
片段：extracellular region domain III (UNP residues 335-538)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.5；293 K；22.5% PEG3350, 0.1 M sodium citrate, pH 3.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.244 |
| 4KRM Nanobody/VHH domain 7D12 in complex with domain III of the extracellular region of EGFR, pH 3.5 提交 2013-05-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 I
335–538（204 aa）
片段：extracellular region domain III (UNP residues 335-538)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.5；293 K；22.5% PEG3350, 0.1 M sodium citrate, pH 3.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.244 |
| 4KRM Nanobody/VHH domain 7D12 in complex with domain III of the extracellular region of EGFR, pH 3.5 提交 2013-05-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 K
335–538（204 aa）
片段：extracellular region domain III (UNP residues 335-538)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.5；293 K；22.5% PEG3350, 0.1 M sodium citrate, pH 3.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.244 |
| 4KRO Nanobody/VHH domain EgA1 in complex with the extracellular region of EGFR 提交 2013-05-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
25–642（618 aa）
片段：Extracellular region (UNP residues 25-642)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；17.5% PEG3350, 1.5 M sodium chloride, 5% glycerol, 0.1 M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.05 Å R-free 0.280 |
| 4KRP Nanobody/VHH domain 9G8 in complex with the extracellular region of EGFR 提交 2013-05-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
25–642（618 aa）
片段：Extracellular region (UNP residues 25-642)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；10% PEG3350, 0.1 M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.82 Å R-free 0.263 |
| 4LI5 EGFR-K IN COMPLEX WITH N-[3-[[5-chloro-4-(1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino]-4-methoxy-phenyl] Prop-2-enamide 提交 2013-07-02 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1020（325 aa）
片段：KINASE DOMAIN
|
未记录 | 1WY N-(3-{[5-chloro-4-(1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}-4-methoxyphenyl)propanamide × 1 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；293 K；The protein at 6 mg/ml was crystallized from 0.2 M NH4Cl, 1.2 M Na-K-tartrate buffered with 10mM acetate at pH 4.6 and 0.15M Hepes pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.64 Å R-free 0.203 |
| 4LI5 EGFR-K IN COMPLEX WITH N-[3-[[5-chloro-4-(1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino]-4-methoxy-phenyl] Prop-2-enamide 提交 2013-07-02 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
696–1020（325 aa）
片段：KINASE DOMAIN
|
未记录 | 1WY N-(3-{[5-chloro-4-(1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}-4-methoxyphenyl)propanamide × 2 NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；293 K；The protein at 6 mg/ml was crystallized from 0.2 M NH4Cl, 1.2 M Na-K-tartrate buffered with 10mM acetate at pH 4.6 and 0.15M Hepes pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.64 Å R-free 0.203 |
| 4LL0 EGFR L858R/T790M in complex with PD168393 提交 2013-07-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
694–1022（329 aa）
片段：EGFR (unp residues 694-1022)
链 B
694–1022（329 aa）
片段：EGFR (unp residues 694-1022)
|
突变：L858R, T790M 突变：L858R, T790M | YUN N-{4-[(3-bromophenyl)amino]quinazolin-6-yl}propanamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；0.1M Bicine, 0.5M NaCl, 18% PEG4000, 5mM TCEP, pH 9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 4.00 Å R-free 0.257 |
| 4LL0 EGFR L858R/T790M in complex with PD168393 提交 2013-07-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
694–1022（329 aa）
片段：EGFR (unp residues 694-1022)
|
突变：L858R, T790M | YUN N-{4-[(3-bromophenyl)amino]quinazolin-6-yl}propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；0.1M Bicine, 0.5M NaCl, 18% PEG4000, 5mM TCEP, pH 9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 4.00 Å R-free 0.257 |
| 4LL0 EGFR L858R/T790M in complex with PD168393 提交 2013-07-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
694–1022（329 aa）
片段：EGFR (unp residues 694-1022)
|
突变：L858R, T790M | YUN N-{4-[(3-bromophenyl)amino]quinazolin-6-yl}propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；0.1M Bicine, 0.5M NaCl, 18% PEG4000, 5mM TCEP, pH 9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 4.00 Å R-free 0.257 |
| 4LQM EGFR L858R in complex with PD168393 提交 2013-07-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
694–1022（329 aa）
片段：Epidermal Growth Factor Receptor 694-1022
|
突变：L858R | DJK N-[4-(3-BROMO-PHENYLAMINO)-QUINAZOLIN-6-YL]-ACRYLAMIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；40% PEG400, 0.15M NACL, 0.1M HEPES 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.228 |
| 4LRM EGFR D770_N771insNPG in complex with PD168393 提交 2013-07-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
694–1022（329 aa）
片段：Epidermal Growth Factor Receptor (unp residues 694-1022)
|
未记录 | YUN N-{4-[(3-bromophenyl)amino]quinazolin-6-yl}propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Tris, 2% PEG400, 5mM tris(2-carboxyethyl)-phosphine (TCEP), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.53 Å R-free 0.264 |
| 4LRM EGFR D770_N771insNPG in complex with PD168393 提交 2013-07-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
694–1022（329 aa）
片段：Epidermal Growth Factor Receptor (unp residues 694-1022)
|
未记录 | YUN N-{4-[(3-bromophenyl)amino]quinazolin-6-yl}propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Tris, 2% PEG400, 5mM tris(2-carboxyethyl)-phosphine (TCEP), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.53 Å R-free 0.264 |
| 4LRM EGFR D770_N771insNPG in complex with PD168393 提交 2013-07-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
694–1022（329 aa）
片段：Epidermal Growth Factor Receptor (unp residues 694-1022)
|
未记录 | YUN N-{4-[(3-bromophenyl)amino]quinazolin-6-yl}propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Tris, 2% PEG400, 5mM tris(2-carboxyethyl)-phosphine (TCEP), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.53 Å R-free 0.264 |
| 4LRM EGFR D770_N771insNPG in complex with PD168393 提交 2013-07-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
694–1022（329 aa）
片段：Epidermal Growth Factor Receptor (unp residues 694-1022)
|
未记录 | YUN N-{4-[(3-bromophenyl)amino]quinazolin-6-yl}propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Tris, 2% PEG400, 5mM tris(2-carboxyethyl)-phosphine (TCEP), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.53 Å R-free 0.264 |
| 4LRM EGFR D770_N771insNPG in complex with PD168393 提交 2013-07-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 E
694–1022（329 aa）
片段：Epidermal Growth Factor Receptor (unp residues 694-1022)
|
未记录 | YUN N-{4-[(3-bromophenyl)amino]quinazolin-6-yl}propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Tris, 2% PEG400, 5mM tris(2-carboxyethyl)-phosphine (TCEP), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.53 Å R-free 0.264 |
| 4R3P Crystal structures of EGFR in complex with Mig6 提交 2014-08-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
696–1018（323 aa）
片段：Kinase domain (UNP residues 696-1018)
|
突变：L858R | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；40% PEG400, 0.15M Sodium chloride, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.240 |
| 4R3R Crystal structures of EGFR in complex with Mig6 提交 2014-08-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
696–1018（323 aa）
片段：Kinase domain (UNP residues 696-1018)
|
突变：L858R | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；40% PEG400, 0.15M SODIUM CHLORIDE, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.247 |
| 4R5S Crystal structure of EGFR 696-1022 L858R in complex with FIIN-3 提交 2014-08-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
|
突变：L858R | FI3 N-[4-({[(2,6-dichloro-3,5-dimethoxyphenyl)carbamoyl](6-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)amino}methyl)phenyl]propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；40% PEG 400, 150mM NaCl, 0.1M HEPES (pH 8.0), 5mM TCEP, 0.1M NDSB-211, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.239 |
| 4RIW Crystal structure of an EGFR/HER3 kinase domain heterodimer 提交 2014-10-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
682–1022（341 aa）
片段：KINASE DOMAIN, UNP residues 682-1022
|
突变：V924R, F973A, L977A | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；7 mg/mL protein, 0.1M HEPES pH 7.5, 14% PEG-6000, 0.2M magnesium chloride, 2mM AMP-PNP, 1mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.287 |
| 4RIW Crystal structure of an EGFR/HER3 kinase domain heterodimer 提交 2014-10-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
682–1022（341 aa）
片段：KINASE DOMAIN, UNP residues 682-1022
|
突变：V924R, F973A, L977A | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；7 mg/mL protein, 0.1M HEPES pH 7.5, 14% PEG-6000, 0.2M magnesium chloride, 2mM AMP-PNP, 1mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.287 |
| 4RIX Crystal structure of an EGFR/HER3 kinase domain heterodimer containing the cancer-associated HER3-Q790R mutation 提交 2014-10-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
682–1022（341 aa）
片段：KINASE DOMAIN, UNP residues 682-1022
|
突变：V924R, F973A, L977A | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；10 mg/mL protein, 0.1M HEPES pH 7.5, 15% PEG-5000 MME, 5mM magnesium chloride, 0.5M ammonium acetate, 2mM AMP-PNP, 1mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.258 |
| 4RIX Crystal structure of an EGFR/HER3 kinase domain heterodimer containing the cancer-associated HER3-Q790R mutation 提交 2014-10-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
682–1022（341 aa）
片段：KINASE DOMAIN, UNP residues 682-1022
|
突变：V924R, F973A, L977A | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；10 mg/mL protein, 0.1M HEPES pH 7.5, 15% PEG-5000 MME, 5mM magnesium chloride, 0.5M ammonium acetate, 2mM AMP-PNP, 1mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.258 |
| 4RIY Crystal structure of an EGFR/HER3 kinase domain heterodimer containing the cancer-associated HER3-E909G mutation 提交 2014-10-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
682–1022（341 aa）
片段：KINASE DOMAIN, UNP residues 682-1022
|
突变：V924R, F973A, L977A | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；10 mg/mL protein, 0.1M HEPES pH 7.5, 15% PEG-5000 MME, 5mM magnesium chloride, 0.5M ammonium acetate, 2mM AMP-PNP, 1mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.98 Å R-free 0.267 |
| 4RIY Crystal structure of an EGFR/HER3 kinase domain heterodimer containing the cancer-associated HER3-E909G mutation 提交 2014-10-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
682–1022（341 aa）
片段：KINASE DOMAIN, UNP residues 682-1022
|
突变：V924R, F973A, L977A | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；10 mg/mL protein, 0.1M HEPES pH 7.5, 15% PEG-5000 MME, 5mM magnesium chloride, 0.5M ammonium acetate, 2mM AMP-PNP, 1mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.98 Å R-free 0.267 |
| 4RJ4 EGFR kinase (T790M/L858R) with inhibitor compound 6 提交 2014-10-08 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, L858R, E865A, E866A, K867A | 3QW N-[2-(4-methoxypiperidin-1-yl)pyrimidin-4-yl]-1-(propan-2-yl)-2-(1H-pyrazol-4-yl)-1H-pyrrolo[3,2-c]pyridin-6-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；PEG 10,000, ethyene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.78 Å R-free 0.226 |
| 4RJ5 EGFR kinase (T790M/L858R) with inhibitor compound 5 提交 2014-10-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain (UNP residues 695-1022)
|
突变：T790M, L858R, E865A, E866A, K867A | 3QY N-[2-(4-methoxypiperidin-1-yl)pyrimidin-4-yl]-2-(1H-pyrazol-4-yl)-1H-pyrrolo[3,2-c]pyridin-6-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；PEG 10,000, ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.229 |
| 4RJ6 EGFR kinase (T790M/L858R) with inhibitor compound 4 提交 2014-10-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain (UNP residues 695-1022)
|
突变：T790M, L858R, E865A, E866A, K867A | SO4 SULFATE ION × 1 3R0 N-[2-(4-methoxypiperidin-1-yl)pyrimidin-4-yl]-2-(1H-pyrazol-4-yl)-3H-imidazo[4,5-c]pyridin-6-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；PEG 10,000, ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.245 |
| 4RJ7 EGFR kinase (T790M/L858R) with inhibitor compound 1 提交 2014-10-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain (UNP residues 695-1022)
|
突变：T790M, L858R, E865A, E866A, K867A | SO4 SULFATE ION × 1 3R1 2,6-dichloro-N-{2-[(2-{[(2S)-1-hydroxypropan-2-yl]amino}-6-methylpyrimidin-4-yl)amino]pyridin-4-yl}benzamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；PEG 10,000, ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.234 |
| 4RJ8 EGFR kinase (T790M/L858R) with inhibitor compound 8 提交 2014-10-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain (UNP residues 695-1022)
|
突变：T790M, L858R, E865A, E866A, K867A | SO4 SULFATE ION × 1 3QS 1-cyclopentyl-N-[2-(4-methoxypiperidin-1-yl)pyrimidin-4-yl]-1H-pyrrolo[3,2-c]pyridin-6-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；PEG 10,000, ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.226 |
| 4TKS Native-SAD phasing for human EGFR kinase domain. 提交 2014-05-27 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.0 M sodium/potassium tartrate, 100 mM MES, pH 7.0
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.209 |
| 4UIP The complex structure of extracellular domain of EGFR with Repebody (rAC1). 提交 2015-03-31 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
26–637（612 aa）
片段：RESIDUES 26-637
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.95 Å R-free 0.297 |
| 4UV7 The complex structure of extracellular domain of EGFR and GC1118A 提交 2014-08-05 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
25–645（621 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN, UNP RESIDUES 25-645
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.10 Å R-free 0.248 |
| 4WD5 Crystal structure of EGFR 696-1022 T790M in complex with QL-X138 提交 2014-09-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
694–1022（329 aa）
片段：UNP residues 694-1022
|
突变：T790M | 3LH N-{2-methyl-5-[2-oxo-9-(1H-pyrazol-4-yl)benzo[h][1,6]naphthyridin-1(2H)-yl]phenyl}propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Hepes (pH 7.5), 21% PEG6000, 0.3 M NaCl, and 5 mM tris(2-carboxyethyl)-
phosphine (TCEP)
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.239 |
| 4WD5 Crystal structure of EGFR 696-1022 T790M in complex with QL-X138 提交 2014-09-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
694–1022（329 aa）
片段：UNP residues 694-1022
|
突变：T790M | CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Hepes (pH 7.5), 21% PEG6000, 0.3 M NaCl, and 5 mM tris(2-carboxyethyl)-
phosphine (TCEP)
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.239 |
| 4WD5 Crystal structure of EGFR 696-1022 T790M in complex with QL-X138 提交 2014-09-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
694–1022（329 aa）
片段：UNP residues 694-1022
链 B
694–1022（329 aa）
片段：UNP residues 694-1022
|
突变：T790M 突变：T790M | 3LH N-{2-methyl-5-[2-oxo-9-(1H-pyrazol-4-yl)benzo[h][1,6]naphthyridin-1(2H)-yl]phenyl}propanamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Hepes (pH 7.5), 21% PEG6000, 0.3 M NaCl, and 5 mM tris(2-carboxyethyl)-
phosphine (TCEP)
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.239 |
| 4WKQ 1.85 angstrom structure of EGFR kinase domain with gefitinib 提交 2014-10-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：unp residues 696-1022
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | IRE Gefitinib × 1 NA SODIUM ION × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1 M MES, pH 7.0, 1 M sodium citrate
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.225 |
| 4WRG 1.9 angstrom structure of EGFR kinase domain 提交 2014-10-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1 M MES, 1 M sodium citrate
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.212 |
| 4ZAU AZD9291 complex with wild type EGFR 提交 2015-04-14 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：unp residues 696-1022
|
未记录 | YY3 N-(2-{[2-(dimethylamino)ethyl](methyl)amino}-4-methoxy-5-{[4-(1-methyl-1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}phenyl)prop-2-enamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1 M MES, 1 M sodium citrate
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.244 |
| 4ZJV crystal structure of EGFR kinase domain in complex with Mitogen-inducible gene 6 protein 提交 2015-04-29 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：Kinase domain (UNP residues 695-1022)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 M Bis-Tris
0.2 M Ammonium acetate
25% PEG3350
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.232 |
| 4ZJV crystal structure of EGFR kinase domain in complex with Mitogen-inducible gene 6 protein 提交 2015-04-29 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
695–1022（328 aa）
片段：Kinase domain (UNP residues 695-1022)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 M Bis-Tris
0.2 M Ammonium acetate
25% PEG3350
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.232 |
| 4ZSE Crystal structure of EGFR 696-1022 T790M/V948R, crystal form II 提交 2015-05-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：UNP RESIDUES 695-1022
链 D
695–1022（328 aa）
片段：UNP RESIDUES 695-1022
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；25% PEG 3350, 100mM Bis-Tris pH 6.0
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.213 |
| 4ZSE Crystal structure of EGFR 696-1022 T790M/V948R, crystal form II 提交 2015-05-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
695–1022（328 aa）
片段：UNP RESIDUES 695-1022
链 C
695–1022（328 aa）
片段：UNP RESIDUES 695-1022
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；25% PEG 3350, 100mM Bis-Tris pH 6.0
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.213 |
| 5C8K EGFR kinase domain mutant "TMLR" with compound 1 提交 2015-06-25 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, L858R, E865A, E866A, K867A | 4YV 1-cyclopentyl-N-[2-(4-methoxypiperidin-1-yl)pyrimidin-4-yl]-1H-imidazo[4,5-c]pyridin-6-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；PEG 10000, ethylene glycol
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.251 |
| 5C8M EGFR kinase domain mutant "TMLR" with compound 17 提交 2015-06-25 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M,L858R,E865A,E866A,K867A | 4YW 2-methyl-N-{2-[4-(methylsulfonyl)piperidin-1-yl]pyrimidin-4-yl}-1-(propan-2-yl)-1H-imidazo[4,5-c]pyridin-6-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；PEG 10000, ethylene glycol
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.252 |
| 5C8N EGFR kinase domain mutant "TMLR" with compound 23 提交 2015-06-25 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, L858R, E865A, E866A, K867A | SO4 SULFATE ION × 1 4YX N-{2-[4-(2-aminoethyl)-4-methoxypiperidin-1-yl]pyrimidin-4-yl}-2-methyl-1-(propan-2-yl)-1H-imidazo[4,5-c]pyridin-6-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；PEG 10000, ethylene glycol
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.258 |
| 5CAL EGFR kinase domain mutant "TMLR" with compound 24 提交 2015-06-29 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, L858R, E865A, E866A, K867A | 4Z8 2,2-dimethyl-3-[(4-{[2-methyl-1-(propan-2-yl)-1H-imidazo[4,5-c]pyridin-6-yl]amino}pyrimidin-2-yl)amino]propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；PEG 10000, ethylene glycol
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.227 |
| 5CAN EGFR kinase domain mutant "TMLR" with compound 27 提交 2015-06-29 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M,L858R,E865A,E866A,K867A | SO4 SULFATE ION × 1 4ZB (3R)-3-methyl-1-(4-{[2-methyl-1-(propan-2-yl)-1H-imidazo[4,5-c]pyridin-6-yl]amino}pyrimidin-2-yl)pyrrolidine-3-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；PEG 10000, ethylene glycol
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.232 |
| 5CAO EGFR kinase domain mutant "TMLR" with compound 29 提交 2015-06-29 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, L858R, E865A, E866A, K867A | 4ZG N~2~-[2-methyl-2-(methylsulfonyl)propyl]-N~4~-[2-methyl-1-(propan-2-yl)-1H-imidazo[4,5-c]pyridin-6-yl]pyrimidine-2,4-diamine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；PEG 10000, ethlyene glycol
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.231 |
| 5CAP EGFR kinase domain mutant "TMLR" with compound 30 提交 2015-06-29 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, L858R, E865A, E866A, K867A | SO4 SULFATE ION × 2 4ZH 2-methyl-N-[2-(2-methyl-2-methylsulfonyl-propoxy)pyrimidin-4-yl]-1-propan-2-yl-imidazo[4,5-c]pyridin-6-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；PEG 10000, ethylene glycol
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.213 |
| 5CAQ EGFR kinase domain mutant "TMLR" with compound 33 提交 2015-06-29 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, L858R, E865A, E866A, K867A | SO4 SULFATE ION × 1 4ZJ N-[2-[(3R,4S)-3-fluoranyl-4-methoxy-piperidin-1-yl]pyrimidin-4-yl]-2-methyl-1-propan-2-yl-imidazo[4,5-c]pyridin-6-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；PEG 10000, erthylene glycol
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.224 |
| 5CAS EGFR kinase domain mutant "TMLR" with compound 41a 提交 2015-06-29 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, L858R, E865A, E866A, K867A | SO4 SULFATE ION × 1 4ZQ (1R)-1-{6-({2-[(3R,4S)-3-fluoro-4-methoxypiperidin-1-yl]pyrimidin-4-yl}amino)-1-[(2S)-1,1,1-trifluoropropan-2-yl]-1H-imidazo[4,5-c]pyridin-2-yl}ethanol × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；PEG 10000, ethylene glycol
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.209 |
| 5CAU EGFR kinase domain mutant "TMLR" with compound 41b 提交 2015-06-29 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, L858R, E865A, E866A, K867A | SO4 SULFATE ION × 1 4ZR (1R)-1-{6-({2-[(3S,4R)-3-fluoro-4-methoxypiperidin-1-yl]pyrimidin-4-yl}amino)-1-[(2S)-1,1,1-trifluoropropan-2-yl]-1H-imidazo[4,5-c]pyridin-2-yl}ethanol × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；PEG 10000, ethylene glycol
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.211 |
| 5CAV EGFR kinase domain with compound 41a 提交 2015-06-30 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | 4ZQ (1R)-1-{6-({2-[(3R,4S)-3-fluoro-4-methoxypiperidin-1-yl]pyrimidin-4-yl}amino)-1-[(2S)-1,1,1-trifluoropropan-2-yl]-1H-imidazo[4,5-c]pyridin-2-yl}ethanol × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；sodium/potassium tartrate
|
分辨率 2.73 Å R-free 0.231 |
| 5CNN Crystal structure of the EGFR kinase domain mutant I682Q 提交 2015-07-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1042（347 aa）
片段：kinase domain (UNP residues 696-1042)
|
突变：I682Q | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；PEG 6000, morpholineethanesulfonic acid, ammonium chloride
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.211 |
| 5CNN Crystal structure of the EGFR kinase domain mutant I682Q 提交 2015-07-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
696–1042（347 aa）
片段：kinase domain (UNP residues 696-1042)
|
突变：I682Q | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；PEG 6000, morpholineethanesulfonic acid, ammonium chloride
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.211 |
| 5CNO Crystal structure of the EGFR kinase domain mutant V924R 提交 2015-07-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：kinase domain (UNP residues 696-1022)
|
突变：V924R | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；ammonium nitrate, PEG 3350
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.203 |
| 5CNO Crystal structure of the EGFR kinase domain mutant V924R 提交 2015-07-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
696–1022（327 aa）
片段：kinase domain (UNP residues 696-1022)
|
突变：V924R | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；ammonium nitrate, PEG 3350
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.203 |
| 5CNO Crystal structure of the EGFR kinase domain mutant V924R 提交 2015-07-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 X
696–1022（327 aa）
片段：kinase domain (UNP residues 696-1022)
|
突变：V924R | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；ammonium nitrate, PEG 3350
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.203 |
| 5CZH EGFR L858R MUTANT IN COMPLEX WITH AN OPTIMAL PEPTIDE SUBSTRATE 提交 2015-07-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
694–1022（329 aa）
片段：EGFR UNP RESIDUES 694-1022
|
突变：L858R | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；293 K；0.1M HEPES 7.6, 0.15M NACL, 40%
PEG400, 5MM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.220 |
| 5CZI EGFR L858R MUTANT IN COMPLEX WITH A SHC PEPTIDE SUBSTRATE 提交 2015-07-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
694–1022（329 aa）
片段：EGFR UNP RESIDUES 694-1022
|
突变：YES | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；293 K；0.1M HEPES 7.6, 0.15M NACL, 40%
PEG400, 5MM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.225 |
| 5D41 EGFR kinase domain in complex with mutant selective allosteric inhibitor 提交 2015-08-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
693–1022（330 aa）
链 B
693–1022（330 aa）
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 57N (2R)-2-(1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)-2-phenyl-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；Bis-Tris, PEG3350
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.207 |
| 5EDP EGFR kinase (T790M/L858R) apo 提交 2015-10-21 | 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, L858R, E865A, E866A, K867A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；PEG 10K, ethylene glycol
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.244 |
| 5EDQ EGFR kinase (T790M/L858R) with inhibitor compound 15: ~{N}-(7-chloranyl-1~{H}-indazol-3-yl)-7,7-dimethyl-2-(1~{H}-pyrazol-4-yl)-5~{H}-furo[3,4-d]pyrimidin-4-amine 提交 2015-10-21 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, L858R, E865A, E866A, K867A | 5N3 ~{N}-(7-chloranyl-1~{H}-indazol-3-yl)-7,7-dimethyl-2-(1~{H}-pyrazol-4-yl)-5~{H}-furo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；PEG 10K, ethylene glycol
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.241 |
| 5EDR EGFR kinase (T790M/L858R) with inhibitor compound 27: ~{N}-(1~{H}-indazol-3-yl)-7,7-dimethyl-2-(2-methylpyrazol-3-yl)-5~{H}-furo[3,4-d]pyrimidin-4-amine 提交 2015-10-21 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, L858R, E865A, E866A, K867A | 5N4 ~{N}-(1~{H}-indazol-3-yl)-7,7-dimethyl-2-(2-methylpyrazol-3-yl)-5~{H}-furo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；PEG 10K, ethylene glycol
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.215 |
| 5EM5 EGFR kinase domain mutant "TMLR" with pyridone compound 2: 4-[2-(4-chlorophenyl)ethylamino]-~{N}-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-2-oxidanylidene-1~{H}-pyridine-3-carboxamide 提交 2015-11-05 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, L858R, E865A, E866A, K867A | 5Q2 4-[2-(4-chlorophenyl)ethylamino]-~{N}-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-2-oxidanylidene-1~{H}-pyridine-3-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；PEG 10K, ethylene glycol
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.223 |
| 5EM6 EGFR kinase domain mutant "TMLR" with pyridone compound 19: 4-[(2-azanylpyrimidin-4-yl)amino]-~{N}-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-2-oxidanylidene-1~{H}-pyridine-3-carboxamide 提交 2015-11-05 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M,L858R,E865A,E866A,K867A | SO4 SULFATE ION × 1 5Q3 4-[(2-azanylpyrimidin-4-yl)amino]-~{N}-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-2-oxidanylidene-1~{H}-pyridine-3-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；PEG 10K, ethylene glycol
|
分辨率 2.78 Å R-free 0.229 |
| 5EM7 EGFR kinase domain mutant "TMLR" with pyridone compound 13: 4-[(2-methoxyphenyl)amino]-~{N}-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-2-oxidanylidene-1~{H}-pyridine-3-carboxamide 提交 2015-11-05 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M,L858R,E865A,E866A,K867A | SO4 SULFATE ION × 1 5Q4 4-[(2-methoxyphenyl)amino]-~{N}-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-2-oxidanylidene-1~{H}-pyridine-3-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；PEG 10K, ethylene glycol
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.216 |
| 5EM8 EGFR kinase domain with pyridone compound 13: 4-[(2-methoxyphenyl)amino]-~{N}-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-2-oxidanylidene-1~{H}-pyridine-3-carboxamide 提交 2015-11-05 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | 5Q4 4-[(2-methoxyphenyl)amino]-~{N}-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-2-oxidanylidene-1~{H}-pyridine-3-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；sodium/potassium tartrate
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.229 |
| 5FED EGFR kinase domain in complex with a covalent aminobenzimidazole inhibitor. 提交 2015-12-16 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
未记录 | 5X4 ~{N}-[7-methyl-1-[(3~{R})-1-propanoylazepan-3-yl]benzimidazol-2-yl]-3-(trifluoromethyl)benzamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.9；293 K；1.35M potassium sodium tartrate, 0.1M HEPES pH 7.9
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.217 |
| 5FEE EGFR kinase domain T790M mutant in complex with a covalent aminobenzimidazole inhibitor. 提交 2015-12-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
突变：T790M | 5X4 ~{N}-[7-methyl-1-[(3~{R})-1-propanoylazepan-3-yl]benzimidazol-2-yl]-3-(trifluoromethyl)benzamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；294 K；1.2M potassium sodium tartrate, 0.1M HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.229 |
| 5FEQ EGFR KINASE DOMAIN IN COMPLEX WITH A COVALENT AMINOBENZIMIDAZOLE 提交 2015-12-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
突变：T790M | 5XH ~{N}-[1-[(3~{R})-1-[4-(dimethylamino)but-2-enoyl]azepan-3-yl]-7-methyl-benzimidazol-2-yl]-2-methyl-pyridine-4-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.25；294 K；100mM HEPES pH 7.25, 0.20M Lithium Sulphate, 32% PEG-3350
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.222 |
| 5GMP Crystal structure of EGFR 696-1022 T790M in complex with XTF-262 提交 2016-07-14 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
|
未记录 | F62 N-[3-[2-[[2-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino]-5-methyl-7-oxidanylidene-pyrido[2,3-d]pyrimidin-8-yl]phenyl]prop-2-enamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；150mM KCl, 0.1M HEPES (pH 8.0), 38% PEG 300, 50mM Glycyl-glycyl-glycine, 10mM Co-enzyme A (pH 8.0), 2mM TCEP
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.241 |
| 5GNK Crystal structure of EGFR 696-988 T790M in complex with LXX-6-34 提交 2016-07-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–988（293 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-988
|
突变：T790M | 80U 1-[(3R)-3-[4-azanyl-3-[3-chloranyl-4-[(1-methylimidazol-2-yl)methoxy]phenyl]pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl]piperidin-1-yl]prop-2-en-1-one × 1 NO3 NITRATE ION × 11 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 19 CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；4.8M NaNO3 ,0.1M B-Tris propone pH 6.5, 5mM TCEP
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.177 |
| 5GTY Crystal structure of EGFR 696-1022 T790M in complex with LXX-6-26 提交 2016-08-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
链 C
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
链 E
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
链 H
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
|
未记录 | 816 1-[(3R)-3-[4-azanyl-3-[3-chloranyl-4-[(6-methylpyridin-2-yl)methoxy]phenyl]pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl]piperidin-1-yl]prop-2-en-1-one × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；0.05M CaCl2, 0.1M B-Tris pH 6.2, 24% PEG 550MME, 5mM TCEP
|
分辨率 3.14 Å R-free 0.280 |
| 5GTY Crystal structure of EGFR 696-1022 T790M in complex with LXX-6-26 提交 2016-08-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
链 D
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
链 F
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
链 G
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
|
未记录 | 816 1-[(3R)-3-[4-azanyl-3-[3-chloranyl-4-[(6-methylpyridin-2-yl)methoxy]phenyl]pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl]piperidin-1-yl]prop-2-en-1-one × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；0.05M CaCl2, 0.1M B-Tris pH 6.2, 24% PEG 550MME, 5mM TCEP
|
分辨率 3.14 Å R-free 0.280 |
| 5GTZ Crystal structure of EGFR 696-1022 T790M in complex with JTS-1-39 提交 2016-08-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
|
未记录 | 81C N-[5-[[5-chloranyl-4-[(2-propan-2-ylsulfonylphenyl)amino]pyrimidin-2-yl]amino]-2-(4-ethylpiperazin-1-yl)-4-methoxy-phenyl]prop-2-enamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 CL CHLORIDE ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；150 mM KCl, 0.1 M HEPES pH 8.0, 38% PEG 300, 50mM Glycyl-glycyl-glycine, 10 mM Co-enzyme A (pH 8.0), 2 mM TCEP
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.230 |
| 5HCX EGFR kinase domain mutant "TMLR" with azabenzimidazole compound 7 提交 2016-01-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
突变：T790M,L858R,A865E, A866E, A867K | SO4 SULFATE ION × 1 60B ~{N}-[2-(1-cyclopropylsulfonylpyrazol-4-yl)pyrimidin-4-yl]-2-methyl-1-propan-2-yl-imidazo[4,5-c]pyridin-6-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；PEG 10K, ethylene glycol
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.223 |
| 5HCY EGFR kinase domain mutant "TMLR" with 3-carboxamide azaindole compound 13 提交 2016-01-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
突变：T790M,L858R,E865A,E866A,K867A | SO4 SULFATE ION × 1 60D 6-[[2-(1-cyclopropylsulfonylpyrazol-4-yl)pyrimidin-4-yl]amino]-~{N}-(oxan-4-yl)-1-propan-2-yl-pyrrolo[3,2-c]pyridine-3-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；PEG 10K, ethylene glycol
|
分辨率 2.46 Å R-free 0.221 |
| 5HCZ EGFR kinase domain mutant "TMLR" with 3-azetidinyl azaindazole compound 21 提交 2016-01-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
突变：T790M,L858R,E865A,E866A,K867A | SO4 SULFATE ION × 1 60E 2-[1-[1-[(2~{S})-butan-2-yl]-6-[[2-(1-cyclopropylsulfonylpyrazol-4-yl)pyrimidin-4-yl]amino]pyrazolo[4,3-c]pyridin-3-yl]azetidin-3-yl]propan-2-ol × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；PEG 10K, ethylene glycol
|
分辨率 2.62 Å R-free 0.227 |
| 5HG5 EGFR (L858R, T790M, V948R) in complex with N-{3-[(2-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)oxy]phenyl}prop-2-enamide 提交 2016-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：UNP residues 695-1022
|
突变：L858R, T790M, V948R | 633 N-{3-[(2-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)oxy]phenyl}propanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；286 K；0.1 M (5.0 uL of stock 1.0 M) Sodium acetate trihydrate (pH 7.50), 20.0 %w/v (20.0 uL of stock 50.0 %w/v) PEG 8000, 10.0 %v/v (5.0 uL of stock 100.0 %v/v) iso-propanol, 0.2 M (2.8571428571 uL of stock 3.5 M) Ammonium sulfate
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.224 |
| 5HG7 EGFR (L858R, T790M, V948R) in complex with 1-{(3R,4R)-3-[5-Chloro-2-(1-methyl-1H-pyrazol-4-ylamino)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yloxymethyl]-4-methoxy-pyrrolidin-1-yl}propenone (PF-06459988) 提交 2016-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：UNP residues 695-1022
|
突变：L858R, T790M, V948R | 630 1-{(3R,4R)-3-[({5-chloro-2-[(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)amino]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl}oxy)methyl]-4-methoxypyrrolidin-1-yl}propan-1-one × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；286 K；0.1 M (5.0 uL of stock 1.0 M) HEPES (pH 7.50), 0.2 M (2.5 uL of stock 4.0 M) Ammonium sulfate, 10.0 %v/v (5.0 uL of stock 100.0 %v/v) iso-propanol, 20.0 %w/v (20.0 uL of stock 50.0 %w/v) PEG 8000
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.246 |
| 5HG8 EGFR (L858R, T790M, V948R) in complex with N-[3-({2-[(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)amino]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl}oxy)phenyl]prop-2-enamide 提交 2016-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：UNP residues 695-1022
|
突变：L858R, T790M, V948R | 634 N-[3-({2-[(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)amino]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl}oxy)phenyl]propanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；286 K；0.1 M (5.0 uL of stock 1.0 M) HEPES (pH 7.50), 0.2 M (2.8571428571 uL of stock 3.5 M) Ammonium sulfate, 20.0 %w/v (20.0 uL of stock 50.0 %w/v) PEG 8000, 10.0 %v/v (5.0 uL of stock 100.0 %v/v) iso-propanol
|
分辨率 1.42 Å R-free 0.213 |
| 5HG9 EGFR (L858R, T790M, V948R) in complex with 1-[(3R,4R)-3-[({2-[(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)amino]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl}oxy)methyl]-4-(trifluoromethyl)pyrrolidin-1-yl]prop-2-en-1-one 提交 2016-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：UNP residues 695-1022
|
突变：L858R, T790M, V948R | 63A 1-[(3R,4R)-3-[({2-[(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)amino]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl}oxy)methyl]-4-(trifluoromethyl)pyrr olidin-1-yl]propan-1-one × 1 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；286 K；0.2 M (2.5 uL of stock 4.0 M) Ammonium sulfate, 20.0 %w/v (20.0 uL of stock 50.0 %w/v) PEG 8000, 0.1 M (5.0 uL of stock 1.0 M) HEPES (pH 7.50), 10.4545454545 %v/v (5.2272727272 uL of stock 100.0 %v/v) iso-propanol
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.241 |
| 5HIB EGFR kinase domain mutant "TMLR" with a pyrazolopyrimidine inhibitor 提交 2016-01-11 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M,L858R,E865A,E866A,K867A | 63M N-tert-butyl-5-{[(1-methyl-1H-pyrazol-5-yl)sulfonyl]amino}pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；PEG 10K, ethylene glycol
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.239 |
| 5HIC EGFR kinase domain mutant "TMLR" with a imidazopyridinyl-aminopyrimidine inhibitor 提交 2016-01-11 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M,L858R,E865A,E866A,K867A | SO4 SULFATE ION × 1 63N N-{2-[1-(cyclopropylsulfonyl)-1H-pyrazol-4-yl]pyrimidin-4-yl}-1-(propan-2-yl)-1H-imidazo[4,5-c]pyridin-6-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；PEG 10K, ethylene glycol
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.233 |
| 5J9Y EGFR-T790M in complex with pyrazolopyrimidine inhibitor 1b 提交 2016-04-11 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
697–1019（323 aa）
|
未记录 | 6HL (R)-1-(3-(4-amino-3-(naphthalen-1-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl)piperidin-1-yl)prop-2-en-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM MES,
900 mM - 1100 mM Na/K-tartrate
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.237 |
| 5J9Z EGFR-T790M in complex with pyrazolopyrimidine inhibitor 1a 提交 2016-04-11 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1020（325 aa）
|
未记录 | 6HJ (R)-1-(3-(4-amino-3-(1-methyl-1H-indol-3-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl)piperidin-1-yl)prop-2-en-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM MES,
900 mM - 1100 mM Na/K-tartrate
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.239 |
| 5JEB Crystal structure of EGFR tyrosine kinase domain with novel inhibitor of active state of HER2 提交 2016-04-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：UNP residues 696-1022
|
突变：V924R | SO4 SULFATE ION × 2 6JS 3-(furan-2-yl)-N-[5-(furan-2-yl)-2-methoxyphenyl]-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；294.15 K；1.34M Ammonium sulfate, 1.34% (v/v) PEG 400, and 0.1M sodium acetate/acetic acid
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.270 |
| 5LV6 N-terminal motif dimerization of EGFR transmembrane domain in bicellar environment 提交 2016-09-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
634–677（44 aa）
链 B
634–677（44 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5.8；313 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 AMBIENT
NMR样品组成
0.01 % sodium azide, 50 mM phosphate buffer pH 5.8, 5 mM TCEP, 30 mM U-2H DHPC, 10 mM U-2H DMPC, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 5SX4 Crystal Structure of panitumumab in complex with epidermal growth factor receptor domain 3. 提交 2016-08-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 M
335–525（191 aa）
片段：UNP residues 335-525
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.0 M AmSO4, 100 mM MES 6.5 and 5% peg 400
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.266 |
| 5SX4 Crystal Structure of panitumumab in complex with epidermal growth factor receptor domain 3. 提交 2016-08-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 N
335–525（191 aa）
片段：UNP residues 335-525
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.0 M AmSO4, 100 mM MES 6.5 and 5% peg 400
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.266 |
| 5SX5 Crystal Structure of panitumumab in complex with epidermal growth factor receptor domain 3 mutant S468R. 提交 2016-08-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 M
335–525（191 aa）
片段：UNP residues 335-528
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.0 M AmSO4, 100 mM MES 6.5 and 5% peg 400
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.250 |
| 5SX5 Crystal Structure of panitumumab in complex with epidermal growth factor receptor domain 3 mutant S468R. 提交 2016-08-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 N
335–525（191 aa）
片段：UNP residues 335-528
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 9 GOL GLYCEROL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.0 M AmSO4, 100 mM MES 6.5 and 5% peg 400
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.250 |
| 5U8L Crystal structure of EGFR kinase domain in complex with a sulfonyl fluoride probe XO44 提交 2016-12-14 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：UNP residues 695-1022
|
未记录 | O44 4-[(4-{4-[(3-cyclopropyl-1H-pyrazol-5-yl)amino]-6-[(prop-2-yn-1-yl)carbamoyl]pyrimidin-2-yl}piperazin-1-yl)methyl]benzene-1-sulfonyl fluoride × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Salt: 0.2 M Ammonium sulfate
Buffer: 0.1 M HEPES (pH 7.50)
Precipitant: 20.0 %w/v PEG 8000
Precipitant: 5.7 %v/v iso-propanol
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.202 |
| 5UG8 Crystal structure of the EGFR kinase domain (L858R, T790M, V948R) in complex with a covalent inhibitor N-[(3R,4R)-4-fluoro-1-{6-[(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)amino]-9-(propan-2-yl)-9H-purin-2-yl}pyrrolidin-3-yl]propanamide 提交 2017-01-07 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：UNP residues 695-1022
|
未记录 | 8BP N-[(3R,4R)-4-fluoro-1-{6-[(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)amino]-9-(propan-2-yl)-9H-purin-2-yl}pyrrolidin-3-yl]propanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；286 K；Salt: 0.2 M Ammonium sulfate
Precipitant: 11.4 %w/v PEG 8000
Buffer: 0.1 M HEPES (pH 7.50)
Precipitant: 10.0 %v/v iso-propanol
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.207 |
| 5UG9 Crystal structure of the EGFR kinase domain (L858R, T790M, V948R) in complex with a covalent inhibitor N-[(3R,4R)-4-fluoro-1-{6-[(3-methoxy-1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)amino]-9-(propan-2-yl)-9H-purin-2-yl}pyrrolidin-3-yl]propanamide 提交 2017-01-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：UNP residues 695-1022
|
突变：L858R, T790M, V948R | 8AM N-[(3R,4R)-4-fluoro-1-{6-[(3-methoxy-1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)amino]-9-(propan-2-yl)-9H-purin-2-yl}pyrrolidin-3-yl]propanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；Salt: 0.2 M Ammonium sulfate
Precipitant: 14.1 %w/v PEG 8000
Buffer: 0.1 M HEPES (pH 7.50)
Precipitant: 10.0 %v/v iso-propanol
|
分辨率 1.33 Å R-free 0.205 |
| 5UGA Crystal structure of the EGFR kinase domain (L858R, T790M, V948R) in complex with 4-(4-{[2-{[(3S)-1-acetylpyrrolidin-3-yl]amino}-9-(propan-2-yl)-9H-purin-6-yl]amino}phenyl)-1-methylpiperazin-1-ium 提交 2017-01-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：UNP residues 695-1022
|
突变：L858R, T790M, V948R | 8BM 4-(4-{[2-{[(3S)-1-acetylpyrrolidin-3-yl]amino}-9-(propan-2-yl)-9H-purin-6-yl]amino}phenyl)-1-methylpiperazin-1-ium × 1 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；Salt: 0.2 M Ammonium sulfate
Precipitant: 20.0 %w/v PEG 8000
Buffer: 0.1 M HEPES (pH 7.50)
Precipitant: 13.6 %v/v iso-propanol
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.264 |
| 5UGB Crystal structure of the EGFR kinase domain in complex with 4-(4-{[2-{[(3S)-1-acetylpyrrolidin-3-yl]amino}-9-(propan-2-yl)-9H-purin-6-yl]amino}phenyl)-1-methylpiperazin-1-ium 提交 2017-01-07 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：UNP residues 695-1022
|
未记录 | 8BM 4-(4-{[2-{[(3S)-1-acetylpyrrolidin-3-yl]amino}-9-(propan-2-yl)-9H-purin-6-yl]amino}phenyl)-1-methylpiperazin-1-ium × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；Buffer: 0.1 M MES (pH 6.90)
Salt: 1.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate
|
分辨率 2.53 Å R-free 0.251 |
| 5UGC Crystal structure of the EGFR kinase domain (L858R, T790M, V948R) in complex with a covalent inhibitor N-[(3R,4R)-4-fluoro-1-{6-[(3-methoxy-1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)amino]-9-methyl-9H-purin-2-yl}pyrrolidin-3-yl]propanamide 提交 2017-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：UNP residues 695-1022
|
突变：L858R, T790M, V948R | 8BS N-[(3R,4R)-4-fluoro-1-{6-[(3-methoxy-1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)amino]-9-methyl-9H-purin-2-yl}pyrrolidin-3-yl]propanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；Salt: 0.2 M Ammonium sulfate
Precipitant: 19.5 %w/v PEG 8000
Buffer: 0.1 M HEPES (pH 7.50)
Precipitant: 10.0 %v/v iso-propanol
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.223 |
| 5UWD Crystal structure of EGFR kinase domain (L858R, T790M, V948R) in complex with the covalent inhibitor CO-1686 提交 2017-02-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：UNP residues 695-1022
|
突变：L858R, T790M, V948R | 8OV N-(3-{[2-{[4-(4-acetylpiperazin-1-yl)-2-methoxyphenyl]amino}-5-(trifluoromethyl)pyrimidin-4-yl]amino}phenyl)propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；286 K；0.1 M Tris (pH 8.50), 0.1 M potassium sulfate, 22.7 %w/v PEG 4000
|
分辨率 3.06 Å R-free 0.280 |
| 5WB7 Crystal structure of the epidermal growth factor receptor extracellular region in complex with epiregulin 提交 2017-06-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
25–525（501 aa）
链 D
25–525（501 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；294 K；0.03 M citric acid, 0.07 M Bis-Tris propane, 16% PEG3350
|
分辨率 2.94 Å R-free 0.268 |
| 5WB7 Crystal structure of the epidermal growth factor receptor extracellular region in complex with epiregulin 提交 2017-06-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
25–525（501 aa）
链 C
25–525（501 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；294 K；0.03 M citric acid, 0.07 M Bis-Tris propane, 16% PEG3350
|
分辨率 2.94 Å R-free 0.268 |
| 5WB8 Crystal structure of the epidermal growth factor receptor extracellular region in complex with epigen 提交 2017-06-28 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
25–525（501 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；0.1 magnesium formate, 15% PEG3350
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.312 |
| 5WB8 Crystal structure of the epidermal growth factor receptor extracellular region in complex with epigen 提交 2017-06-28 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
25–525（501 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；0.1 magnesium formate, 15% PEG3350
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.312 |
| 5X26 Crystal structure of EGFR 696-1022 L858R in complex with SKLB(3) 提交 2017-01-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
|
突变：L858R | 7XO N2-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-N8-phenyl-9-propan-2-yl-purine-2,8-diamine × 1 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Hepes pH7.8, 40% PEG400, 0.15M NaCl, 5mM tris(2-carboxyethyl)-phosphine (TCEP)
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.222 |
| 5X27 Crystal structure of EGFR 696-1022 L858R in complex with SKLB(5) 提交 2017-01-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
|
突变：L858R | 7XR 9-cyclopentyl-N2-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-N8-phenyl-purine-2,8-diamine × 1 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；0.1M Hepes pH 7.8, 40% PEG 400, 0.15M NaCl, 5mM tris(2-carboxyethyl)-phosphine (TCEP)
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.238 |
| 5X28 Crystal structure of EGFR 696-1022 L858R in complex with SKLB(6) 提交 2017-01-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
|
突变：L858R | 7XU 9-cyclohexyl-N2-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-N8-phenyl-purine-2,8-diamine × 1 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Hepes pH7.8, 40% PEG400, 0.15M NaCl, 5mM tris(2-carboxyethyl)-phosphine (TCEP)
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.250 |
| 5X2A Crystal structure of EGFR 696-1022 T790M/V948R in complex with SKLB(3) 提交 2017-01-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
链 D
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | CL CHLORIDE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 7XO N2-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-N8-phenyl-9-propan-2-yl-purine-2,8-diamine × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Bis-Tris 5.0, 22.5% PEG 3350, 5mM TCEP
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.219 |
| 5X2A Crystal structure of EGFR 696-1022 T790M/V948R in complex with SKLB(3) 提交 2017-01-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
链 C
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 7XO N2-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-N8-phenyl-9-propan-2-yl-purine-2,8-diamine × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Bis-Tris 5.0, 22.5% PEG 3350, 5mM TCEP
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.219 |
| 5X2C Crystal structure of EGFR 696-1022 T790M/V948R in complex with SKLB(5) 提交 2017-01-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
|
突变：T790M, V948R | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 7XR 9-cyclopentyl-N2-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-N8-phenyl-purine-2,8-diamine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Bis-Tris 5.0, 22.5% PEG 3350, 5mM TCEP
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.202 |
| 5X2C Crystal structure of EGFR 696-1022 T790M/V948R in complex with SKLB(5) 提交 2017-01-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
|
突变：T790M, V948R | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 7XR 9-cyclopentyl-N2-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-N8-phenyl-purine-2,8-diamine × 1 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Bis-Tris 5.0, 22.5% PEG 3350, 5mM TCEP
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.202 |
| 5X2F Crystal structure of EGFR 696-1022 T790M/V948R in complex with SKLB(6) 提交 2017-01-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
链 D
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | 7XU 9-cyclohexyl-N2-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-N8-phenyl-purine-2,8-diamine × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Bis-Tris 5.0, 22.5% PEG 3350, 5mM TCEP
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.240 |
| 5X2F Crystal structure of EGFR 696-1022 T790M/V948R in complex with SKLB(6) 提交 2017-01-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
链 C
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | 7XU 9-cyclohexyl-N2-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-N8-phenyl-purine-2,8-diamine × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Bis-Tris 5.0, 22.5% PEG 3350, 5mM TCEP
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.240 |
| 5X2K Crystal structure of EGFR 696-1022 T790M in complex with WZ4003 提交 2017-02-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
|
突变：T790M | 0UN N-{3-[(5-chloro-2-{[2-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)oxy]phenyl}prop-2-enamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M Glycine pH 8.0, 38% PEG 300, 0.1M NaCl, 5mM tris(2-carboxyethyl)-phosphine (TCEP)
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.244 |
| 5XDK Crystal structure of EGFR 696-1022 T790M in complex with CO-1686 提交 2017-03-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
|
突变：T790M | 8JC N-[3-[[2-[[4-(4-ethanoylpiperazin-1-yl)-2-methoxy-phenyl]amino]-5-(trifluoromethyl)pyrimidin-4-yl]amino]phenyl]prop-2-enamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.07 M HEPES pH7.5, 0.9 M tri-sodium citrate, 5 mM TCEP.
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.248 |
| 5XDL Crystal structure of EGFR 696-1022 L858R in complex with CO-1686 提交 2017-03-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
|
突变：L858R | 8JC N-[3-[[2-[[4-(4-ethanoylpiperazin-1-yl)-2-methoxy-phenyl]amino]-5-(trifluoromethyl)pyrimidin-4-yl]amino]phenyl]prop-2-enamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；0.1 M HEPES pH 7.8, 40% PEG 400, 0.15 M NaCl, 5 mM tris(2-carboxyethyl)-phosphine (TCEP)
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.256 |
| 5XGM Crystal structure of EGFR 696-1022 T790M in complex with Go6976 提交 2017-04-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
|
突变：T790M | 85X 12-(2-Cyanoethyl)-6,7,12,13-tetrahydro-13-methyl-5-oxo-5H-indolo[2,3-a]pyrrolo[3,4-c]carbazole × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；0.1M NaCl,0.05M Glycine pH 9.5, 39% PEG 300
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.232 |
| 5XGN Crystal structure of EGFR 696-1022 T790M/C797S in complex with Go6976 提交 2017-04-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
链 B
696–1022（327 aa）
片段：UNP RESIDUES 696-1022
|
突变：T790M, C797S 突变：T790M, C797S | 85X 12-(2-Cyanoethyl)-6,7,12,13-tetrahydro-13-methyl-5-oxo-5H-indolo[2,3-a]pyrrolo[3,4-c]carbazole × 1 CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2M NaCl, 0.1M Hepes pH7.5, 22% PEG 4000
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.251 |
| 5XWD Crystal structure of the complex of 059-152-Fv and EGFR-ECD 提交 2017-06-29 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–643（643 aa）
片段：UNP residues 1-643
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ZN ZINC ION × 20 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；MES buffer (pH 6.0), zinc acetate, PEG8000
|
分辨率 2.89 Å R-free 0.331 |
| 5Y25 EGFR kinase domain mutant (T790M/L858R) with covalent ligand NS-062 提交 2017-07-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
698–1022（325 aa）
片段：Kinase domain, UNP residues 698-1022
|
突变：T790M, L858R | 8LU (2R)-N-[4-[(3-chloranyl-4-fluoranyl-phenyl)amino]-7-(3-morpholin-4-ylpropoxy)quinazolin-6-yl]-1-(2-fluoranylethanoyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；100mM HEPES pH7.5, 10% PEG 10000, 8% ethylene glycol
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.246 |
| 5Y9T Crystal Structure of EGFR T790M mutant in complex with naquotinib 提交 2017-08-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：UNP residues 695-1022
|
突变：T790M | 8RC 6-ethyl-3-[[4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidin-1-yl]phenyl]amino]-5-[(3R)-1-prop-2-enoylpyrrolidin-3-yl]oxy-pyrazin e-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Hepes-Na 7.0-7.5, 1.3-1.5M potassium sodium tartrate
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.240 |
| 5YU9 Crystal structure of EGFR 696-1022 T790M in complex with Ibrutinib 提交 2017-11-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
突变：T790M | 1E8 1-{(3R)-3-[4-amino-3-(4-phenoxyphenyl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl]piperidin-1-yl}prop-2-en-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；0.1 M sodium citrate (pH 5.0), 12% PEG 10000, 3% dioxane, 5 mM TCEP
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.222 |
| 5YU9 Crystal structure of EGFR 696-1022 T790M in complex with Ibrutinib 提交 2017-11-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
696–1022（327 aa）
|
突变：T790M | 1E8 1-{(3R)-3-[4-amino-3-(4-phenoxyphenyl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl]piperidin-1-yl}prop-2-en-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；0.1 M sodium citrate (pH 5.0), 12% PEG 10000, 3% dioxane, 5 mM TCEP
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.222 |
| 5YU9 Crystal structure of EGFR 696-1022 T790M in complex with Ibrutinib 提交 2017-11-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
696–1022（327 aa）
|
突变：T790M | 1E8 1-{(3R)-3-[4-amino-3-(4-phenoxyphenyl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl]piperidin-1-yl}prop-2-en-1-one × 1 CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；0.1 M sodium citrate (pH 5.0), 12% PEG 10000, 3% dioxane, 5 mM TCEP
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.222 |
| 5YU9 Crystal structure of EGFR 696-1022 T790M in complex with Ibrutinib 提交 2017-11-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
696–1022（327 aa）
|
突变：T790M | 1E8 1-{(3R)-3-[4-amino-3-(4-phenoxyphenyl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl]piperidin-1-yl}prop-2-en-1-one × 1 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；0.1 M sodium citrate (pH 5.0), 12% PEG 10000, 3% dioxane, 5 mM TCEP
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.222 |
| 5ZTO Crystal structure of EGFR 696-1022 T790M/C797S in complex with D3003 提交 2018-05-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
突变：T790M, C797S | 9JO N-{trans-4-[3-(2-chlorophenyl)-7-{[3-methyl-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}-2-oxo-3,4-dihydropyrimido[4,5-d]pyrimidin-1(2H)-yl]cyclohexyl}propanamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.05M HEPES pH 8.0, 0.2M ZnSO4, 25% PEG 600
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.272 |
| 5ZWJ Crystal structure of EGFR 675-1022 T790M/C797S/V948R in complex with EAI045 提交 2018-05-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
675–1022（348 aa）
|
突变：T790M, C797S, V948R | 9LL (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-(1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；26% PEG 4000, 0.1 M KCl, 0.05 M Tris pH 7.5-8.0
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.272 |
| 6ARU Structure of Cetuximab Fab mutant in complex with EGFR extracellular domain 提交 2017-08-23 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
25–640（616 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；150 mM ammonium sulfate, 16.5% PEG3350, 10 mM cadmium chloride, 100 mM imidazole, 5% glycerol
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.267 |
| 6B3S Crystal structure of the Fab fragment of necitumumab (Fab11F8) in complex with domain III from a cetuximab resistant variant of EGFR (sEGFRd3-S468R) 提交 2017-09-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
335–538（204 aa）
|
突变：S468R | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；50 mM sodium acetate, 200 mM potassium citrate, 15-20% PEG3350
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.245 |
| 6B3S Crystal structure of the Fab fragment of necitumumab (Fab11F8) in complex with domain III from a cetuximab resistant variant of EGFR (sEGFRd3-S468R) 提交 2017-09-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
335–538（204 aa）
|
突变：S468R | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；50 mM sodium acetate, 200 mM potassium citrate, 15-20% PEG3350
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.245 |
| 6B3S Crystal structure of the Fab fragment of necitumumab (Fab11F8) in complex with domain III from a cetuximab resistant variant of EGFR (sEGFRd3-S468R) 提交 2017-09-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 E
335–538（204 aa）
|
突变：S468R | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；50 mM sodium acetate, 200 mM potassium citrate, 15-20% PEG3350
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.245 |
| 6B3S Crystal structure of the Fab fragment of necitumumab (Fab11F8) in complex with domain III from a cetuximab resistant variant of EGFR (sEGFRd3-S468R) 提交 2017-09-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 I
335–538（204 aa）
|
突变：S468R | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；50 mM sodium acetate, 200 mM potassium citrate, 15-20% PEG3350
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.245 |
| 6D8E Discovery of a Highly Potent and Broadly Effective EGFR and HER2 Exon 20 Insertion Mutant Inhibitor 提交 2018-04-26 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
未记录 | FZP (4-fluorophenyl)methyl {2-[(1-methyl-1H-pyrazol-3-yl)amino]pyrimidin-4-yl}[3-(propanoylamino)phenyl]carbamate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M MES(pH 6.5),
1.0 M sodium citrate
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.243 |
| 6DUK EGFR with an allosteric inhibitor 提交 2018-06-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
695–1022（328 aa）
链 B
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 JBJ (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-{1-oxo-6-[4-(piperazin-1-yl)phenyl]-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl}-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Bis-Tris, 22% PEG3350, 150 mM NaCl
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.223 |
| 6DUK EGFR with an allosteric inhibitor 提交 2018-06-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
695–1022（328 aa）
链 D
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 JBJ (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-{1-oxo-6-[4-(piperazin-1-yl)phenyl]-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl}-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Bis-Tris, 22% PEG3350, 150 mM NaCl
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.223 |
| 6DUK EGFR with an allosteric inhibitor 提交 2018-06-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 E
695–1022（328 aa）
链 F
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 JBJ (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-{1-oxo-6-[4-(piperazin-1-yl)phenyl]-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl}-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Bis-Tris, 22% PEG3350, 150 mM NaCl
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.223 |
| 6JRJ The structure of co-crystals of 8r-B-EGFR T790M/C797S complex 提交 2019-04-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
突变：T790M,C797S, E865A, E866A, K867A | C6O 6-(2-chloranyl-3-fluoranyl-phenyl)-5-methyl-2-[[3-methyl-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino]-8-[(3S)-1-propanoylpiperidin-3-yl]pyrido[2,3-d]pyrimidin-7-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；0.1 M HEPES pH 8.5, 40% PEG 400, 0.15 M NaCl, 5 mM tris(2-carboxyethyl)-phosphine (TCEP)
|
分辨率 2.94 Å R-free 0.246 |
| 6JRK The structure of co-crystals of 8r-B-EGFR WT complex 提交 2019-04-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
突变：E865A, E,866A, K867A | C6O 6-(2-chloranyl-3-fluoranyl-phenyl)-5-methyl-2-[[3-methyl-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino]-8-[(3S)-1-propanoylpiperidin-3-yl]pyrido[2,3-d]pyrimidin-7-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；38% PEG 300, 150 mM KCl, 0.1 M HEPES (pH 8.0), 50 mM Gly3, 5 mM Co-enzyme A (pH 8.0), 2 mM TCEP
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.236 |
| 6JRX EGFR T790M/C797S in complex with compound 6i 提交 2019-04-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
突变：T790M, C797S | 9JO N-{trans-4-[3-(2-chlorophenyl)-7-{[3-methyl-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}-2-oxo-3,4-dihydropyrimido[4,5-d]pyrimidin-1(2H)-yl]cyclohexyl}propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M HEPES pH8.5, 40% PEG400, 0.15 M NaCl, 5 mM tris(2-carboxyethyl)-phosphine (TCEP)
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.239 |
| 6JWL Crystal structure of EGFR 696-1022 L858R in complex with AZD9291 提交 2019-04-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
突变：L858R | YY3 N-(2-{[2-(dimethylamino)ethyl](methyl)amino}-4-methoxy-5-{[4-(1-methyl-1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}phenyl)prop-2-enamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；0.1M HEPES pH 7.8, 40% PEG 400, 0.15M NaCl, 5mM TCEP
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.242 |
| 6JX0 Crystal structure of EGFR 696-1022 T790M in complex with AZD9291 prepared by co-crystallization 提交 2019-04-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
突变：T790M | YY3 N-(2-{[2-(dimethylamino)ethyl](methyl)amino}-4-methoxy-5-{[4-(1-methyl-1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}phenyl)prop-2-enamide × 3 CL CHLORIDE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1.3 M Ammonium tartrate dibasic, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.0
|
分辨率 2.53 Å R-free 0.222 |
| 6JX4 Crystal structure of EGFR 696-1022 T790M in complex with AZD9291 prepared by soaking 提交 2019-04-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
突变：T790M | YY3 N-(2-{[2-(dimethylamino)ethyl](methyl)amino}-4-methoxy-5-{[4-(1-methyl-1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}phenyl)prop-2-enamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；38% PEG 300, 150 mM KCl, 0.1 M HEPES (pH 8.0), 50mM Glycyl-glycyl-glycine, 5 mM Co-enzyme A (pH 8.0), 2 mM TCEP.
|
分辨率 2.53 Å R-free 0.245 |
| 6JXT Crystal structure of EGFR 696-1022 WT in complex with AZD9291 prepared by cocrystallization 提交 2019-04-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
突变：E865A, E866A, K867A | YY3 N-(2-{[2-(dimethylamino)ethyl](methyl)amino}-4-methoxy-5-{[4-(1-methyl-1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}phenyl)prop-2-enamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.239 |
| 6JZ0 Crystal structure of EGFR kinase domain in complex with compound 78 提交 2019-04-30 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1021（326 aa）
片段：UNP residues 696-1021
|
未记录 | CKO E-4-(dimethylamino)-N-[3-[4-[[(1S)-2-oxidanyl-1-phenyl-ethyl]amino]-6-phenyl-furo[2,3-d]pyrimidin-5-yl]phenyl]but-2-enamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；1.0M Ammonium citrate tribase, 0.1M Bis-Tris propane, pH7.0
|
分辨率 2.86 Å R-free 0.248 |
| 6LUB Crystal Structure of EGFR(L858R/T790M/C797S) in complex with CH7233163 提交 2020-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：L858R, T790M, C797S, E865A, E866A, K867A | EUX N-[2-(1-cyclopropylsulfonylpyrazol-4-yl)pyrimidin-4-yl]-7-(4-methylpiperazin-1-yl)-5-propan-2-yl-9-[2,2,2-tris(fluoranyl)ethoxy]pyrido[4,3-b]indol-3-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；294 K；1.0 M Succinic Acid, 1.0 %(w/v) Polyethylene glycol monomethyl ether 2000, 0.1 M HEPES
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.226 |
| 6LUD Crystal Structure of EGFR(L858R/T790M/C797S) in complex with Osimertinib 提交 2020-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：L858R, T790M, C797S, E865A, E866A, K867A | YY3 N-(2-{[2-(dimethylamino)ethyl](methyl)amino}-4-methoxy-5-{[4-(1-methyl-1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}phenyl)prop-2-enamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.7；294 K；0.96 M Succinic Acid, 1.0 %(w/v) Polyethylene glycol monomethyl ether 2000, 0.1 M HEPES
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.222 |
| 6P1D Crystal structure of EGFR with mutant-selective dihydrodibenzodiazepinone allosteric inhibitor 提交 2019-05-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
696–1022（327 aa）
链 D
696–1022（327 aa）
|
未记录 | NQ1 10-benzyl-8-fluoro-5,10-dihydro-11H-dibenzo[b,e][1,4]diazepin-11-one × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 M Bis-Tris, 29% PEG 3350, 5.0 mM TCEP
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.213 |
| 6P1D Crystal structure of EGFR with mutant-selective dihydrodibenzodiazepinone allosteric inhibitor 提交 2019-05-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
696–1022（327 aa）
链 C
696–1022（327 aa）
|
未记录 | NQ1 10-benzyl-8-fluoro-5,10-dihydro-11H-dibenzo[b,e][1,4]diazepin-11-one × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 M Bis-Tris, 29% PEG 3350, 5.0 mM TCEP
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.213 |
| 6P1L Crystal structure of EGFR in complex with EAI045 提交 2019-05-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
696–1022（327 aa）
链 C
696–1022（327 aa）
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 9LL (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-(1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 M Bis-Tris ,26% PEG 8000
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.237 |
| 6P1L Crystal structure of EGFR in complex with EAI045 提交 2019-05-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
696–1022（327 aa）
链 D
696–1022（327 aa）
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 9LL (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-(1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 M Bis-Tris ,26% PEG 8000
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.237 |
| 6P8Q EGFR in complex with a dihydrodibenzodiazepinone allosteric inhibitor. 提交 2019-06-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
696–1022（327 aa）
链 B
696–1022（327 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 O57 10-benzyl-2-fluoro-5,10-dihydro-11H-dibenzo[b,e][1,4]diazepin-11-one × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；PEG 3350, Bis-Tris
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.195 |
| 6P8Q EGFR in complex with a dihydrodibenzodiazepinone allosteric inhibitor. 提交 2019-06-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
696–1022（327 aa）
链 D
696–1022（327 aa）
|
未记录 | O57 10-benzyl-2-fluoro-5,10-dihydro-11H-dibenzo[b,e][1,4]diazepin-11-one × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；PEG 3350, Bis-Tris
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.195 |
| 6S89 Crystal Structure of EGFR-T790M/C797S in Complex with Covalent Pyrrolopyrimidine 19g 提交 2019-07-09 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, C797S, E865A, E866A, K867A | L0Q ~{N}-[3-[6-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-4-propan-2-yloxy-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl]phenyl]propanamide × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.35 K-Na-tartrate, 100 mM Na-MES (pH 6.5), 2 % 1,3-Propanediol, 5.5 mg/ml EGFR T790M/C797 (in 100 mM NaCl, 25mM Tris-HCl, 10 % Glycerol, 1mM TCEP, pH 8.0), 1 ul reservoir + 1 ul protein solution
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.234 |
| 6S8A Crystal Structure of EGFR-T790M/C797S in Complex with Covalent Pyrrolopyrimidine 19h 提交 2019-07-09 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, C797S, E865A, E866A, K867A | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 L0N ~{N}-[3-[6-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-4-(2-methylpropoxy)-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl]phenyl]propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.15 K-Na-tartrate, 100 mM Na-MES (pH 6.5), 2 % 1,3-Propanediol, 5.3 mg/ml EGFR T790M/C797 (in 100 mM NaCl, 25mM Tris-HCl, 10 % Glycerol, 1mM TCEP, pH 8.0), 1 ul reservoir + 1 ul protein solution
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.207 |
| 6S9B EGFR-KINASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 1 提交 2019-07-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
697–1022（326 aa）
片段：KINASE DOMAIN MUTANT
|
突变：T790M, L858R, E865A, E866A, K867A | L1H 3-fluoranyl-~{N}-[1-(2-methyl-2-oxidanyl-propyl)benzimidazol-2-yl]-5-pyridin-3-yl-benzamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 10000
8% Ethylene glycol
0.1 M HEPES
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.232 |
| 6S9C EGFR-KINASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 5 提交 2019-07-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：KINASE DOMAIN MUTANT
|
突变：T790M, L858R, E865A, E866A, K867A | L1K ~{N}-[1-(2-methyl-2-oxidanyl-propyl)benzimidazol-2-yl]-2-phenyl-pyridine-4-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；10 % PEG 10000
8 % ethylene glycol
0.1 M HEPES
|
分辨率 2.73 Å R-free 0.225 |
| 6S9D EGFR-KINASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 6 提交 2019-07-12 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：KINASE DOMAIN MUTANT
|
未记录 | L3Z 8-oxa-14,21,23,28-tetraazapentacyclo[23.3.1.02,7.014,22.015,20]nonacosa-1(28),2(7),3,5,15,17,19,21,25(29),26-decaen-24-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；10 % PEG 10000
8 % ethylene glycol
0.1 M HEPES
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.224 |
| 6TFU Crystal Structure of EGFR T790M/V948R in Complex with Covalent Pyrrolopyrimidine 14d 提交 2019-11-14 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | N7K ~{N}-[3-[4-[[1-(phenylmethyl)indazol-5-yl]amino]-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl]phenyl]propanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；32.5 % PEG3350, 100 mM MgSO4, 3 % ethylen glycole 7.2 mg/mL EGFR T790M/V948R (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul protein solution)
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.233 |
| 6TFU Crystal Structure of EGFR T790M/V948R in Complex with Covalent Pyrrolopyrimidine 14d 提交 2019-11-14 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | N7K ~{N}-[3-[4-[[1-(phenylmethyl)indazol-5-yl]amino]-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl]phenyl]propanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；32.5 % PEG3350, 100 mM MgSO4, 3 % ethylen glycole 7.2 mg/mL EGFR T790M/V948R (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul protein solution)
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.233 |
| 6TFV Crystal Structure of EGFR T790M/V948R in Complex with Covalent Pyrrolopyrimidine 18b 提交 2019-11-14 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | N7Q ~{N}-[5-[4-[[3-chloranyl-4-(pyridin-2-ylmethoxy)phenyl]amino]-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl]-2-(2-hydroxyethyloxy)phenyl]propanamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；27.5 % PEG3350, 100 mM MgSO4, 4 % ethylen glycole 7.0 mg/mL EGFR T790M/V948R (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul protein solution)
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.203 |
| 6TFV Crystal Structure of EGFR T790M/V948R in Complex with Covalent Pyrrolopyrimidine 18b 提交 2019-11-14 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | N7Q ~{N}-[5-[4-[[3-chloranyl-4-(pyridin-2-ylmethoxy)phenyl]amino]-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl]-2-(2-hydroxyethyloxy)phenyl]propanamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；27.5 % PEG3350, 100 mM MgSO4, 4 % ethylen glycole 7.0 mg/mL EGFR T790M/V948R (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul protein solution)
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.203 |
| 6TFW Crystal Structure of EGFR T790M/V948R in Complex with Covalent Pyrrolopyrimidine 18d 提交 2019-11-14 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | N7W ~{N}-[5-[4-[[3-chloranyl-4-(pyridin-2-ylmethoxy)phenyl]amino]-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl]-2-[2-(dimethylamino)ethoxy]phenyl]propanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；30 % PEG3350, 100 mM MgSO4, 4 % ethylen glycole 7.0 mg/mL EGFR T790M/V948R (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul protein solution)
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.245 |
| 6TFW Crystal Structure of EGFR T790M/V948R in Complex with Covalent Pyrrolopyrimidine 18d 提交 2019-11-14 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | N7W ~{N}-[5-[4-[[3-chloranyl-4-(pyridin-2-ylmethoxy)phenyl]amino]-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl]-2-[2-(dimethylamino)ethoxy]phenyl]propanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；30 % PEG3350, 100 mM MgSO4, 4 % ethylen glycole 7.0 mg/mL EGFR T790M/V948R (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul protein solution)
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.245 |
| 6TFY Crystal Structure of EGFR T790M/V948R in Complex with Covalent Pyrrolopyrimidine 18c 提交 2019-11-14 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | N7Z ~{N}-[5-[4-[[3-chloranyl-4-(pyridin-2-ylmethoxy)phenyl]amino]-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl]-2-(3-oxidanylpropoxy)phenyl]propanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；30 % PEG3350, 100 mM MgSO4, 3 % ethylen glycole 7.0 mg/mL EGFR T790M/V948R (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul protein solution)
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.212 |
| 6TFY Crystal Structure of EGFR T790M/V948R in Complex with Covalent Pyrrolopyrimidine 18c 提交 2019-11-14 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | N7Z ~{N}-[5-[4-[[3-chloranyl-4-(pyridin-2-ylmethoxy)phenyl]amino]-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl]-2-(3-oxidanylpropoxy)phenyl]propanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；30 % PEG3350, 100 mM MgSO4, 3 % ethylen glycole 7.0 mg/mL EGFR T790M/V948R (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul protein solution)
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.212 |
| 6TFZ Crystal Structure of EGFR T790M/V948R in Complex with Covalent Pyrrolopyrimidine 19 提交 2019-11-14 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | N7B ~{N}-[2-(2-hydroxyethyloxy)-5-[4-[[1-(phenylmethyl)indazol-5-yl]amino]-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl]phenyl]propanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；30 % PEG3350, 100 mM MgSO4, 4 % ethylen glycole 7.5 mg/mL EGFR T790M/V948R (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul protein solution)
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.206 |
| 6TFZ Crystal Structure of EGFR T790M/V948R in Complex with Covalent Pyrrolopyrimidine 19 提交 2019-11-14 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | N7B ~{N}-[2-(2-hydroxyethyloxy)-5-[4-[[1-(phenylmethyl)indazol-5-yl]amino]-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl]phenyl]propanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；30 % PEG3350, 100 mM MgSO4, 4 % ethylen glycole 7.5 mg/mL EGFR T790M/V948R (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul protein solution)
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.206 |
| 6TG0 Crystal Structure of EGFR T790M/V948R in Complex with Covalent Pyrrolopyrimidine 21a 提交 2019-11-14 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | N78 ~{N}-[5-[4-[[4-[[1,3-bis(oxidanylidene)isoindol-2-yl]methyl]phenyl]amino]-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl]-2-(2-hydroxyethyloxy)phenyl]propanamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；27.5 % PEG3350, 100 mM MgSO4, 3 % ethylen glycole 7.0 mg/mL EGFR T790M/V948R (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul protein solution)
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.188 |
| 6TG0 Crystal Structure of EGFR T790M/V948R in Complex with Covalent Pyrrolopyrimidine 21a 提交 2019-11-14 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | N78 ~{N}-[5-[4-[[4-[[1,3-bis(oxidanylidene)isoindol-2-yl]methyl]phenyl]amino]-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl]-2-(2-hydroxyethyloxy)phenyl]propanamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；27.5 % PEG3350, 100 mM MgSO4, 3 % ethylen glycole 7.0 mg/mL EGFR T790M/V948R (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul protein solution)
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.188 |
| 6TG1 Crystal Structure of EGFR T790M/V948R in Complex with Covalent Pyrrolopyrimidine 21b 提交 2019-11-14 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | N82 ~{N}-[5-[4-[[4-[[1,3-bis(oxidanylidene)isoindol-2-yl]methyl]phenyl]amino]-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl]-2-[2-(dimethylamino)ethoxy]phenyl]propanamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；27.5 % PEG3350, 100 mM MgSO4, 2 % ethylen glycole 7.0 mg/mL EGFR T790M/V948R (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul protein solution)
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.198 |
| 6TG1 Crystal Structure of EGFR T790M/V948R in Complex with Covalent Pyrrolopyrimidine 21b 提交 2019-11-14 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | N82 ~{N}-[5-[4-[[4-[[1,3-bis(oxidanylidene)isoindol-2-yl]methyl]phenyl]amino]-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl]-2-[2-(dimethylamino)ethoxy]phenyl]propanamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 4 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；27.5 % PEG3350, 100 mM MgSO4, 2 % ethylen glycole 7.0 mg/mL EGFR T790M/V948R (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul protein solution)
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.198 |
| 6V5N EGFR(T790M/V948R) in complex with LN2084 提交 2019-12-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
695–1022（328 aa）
链 D
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M,V948R 突变：T790M,V948R | QP7 3-[4-(4-fluorophenyl)-5-(2-phenyl-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yl)-1H-imidazol-2-yl]propan-1-ol × 2 CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 M Bis-Tris, 25% PEG3350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.243 |
| 6V5N EGFR(T790M/V948R) in complex with LN2084 提交 2019-12-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
695–1022（328 aa）
链 B
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M,V948R 突变：T790M,V948R | QP7 3-[4-(4-fluorophenyl)-5-(2-phenyl-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yl)-1H-imidazol-2-yl]propan-1-ol × 2 CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 M Bis-Tris, 25% PEG3350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.243 |
| 6V5P EGFR(T790M/V948R) in complex with LN2725 提交 2019-12-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
695–1022（328 aa）
链 B
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M,V948R 突变：T790M,V948R | QP4 4-[4-(4-fluorophenyl)-2-(3-methoxypropyl)-1H-imidazol-5-yl]-2-phenyl-3H-pyrrolo[2,3-b]pyridine × 2 CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 M Bis-Tris, 25% PEG3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.194 |
| 6V5P EGFR(T790M/V948R) in complex with LN2725 提交 2019-12-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
695–1022（328 aa）
链 D
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M,V948R 突变：T790M,V948R | QP4 4-[4-(4-fluorophenyl)-2-(3-methoxypropyl)-1H-imidazol-5-yl]-2-phenyl-3H-pyrrolo[2,3-b]pyridine × 2 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 M Bis-Tris, 25% PEG3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.194 |
| 6V66 EGFR(T790M/V948R) in complex with LN2899 提交 2019-12-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
696–1022（327 aa）
链 D
696–1022（327 aa）
|
突变：T790M,V948R 突变：T790M,V948R | CL CHLORIDE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 QP1 N-{3-[(4-{4-(4-fluorophenyl)-2-[(2-methoxyethyl)sulfanyl]-1H-imidazol-5-yl}pyridin-2-yl)amino]-4-methoxyphenyl}propanamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 M Bis-Tris, 25% PEG3350
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.226 |
| 6V66 EGFR(T790M/V948R) in complex with LN2899 提交 2019-12-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
696–1022（327 aa）
链 C
696–1022（327 aa）
|
突变：T790M,V948R 突变：T790M,V948R | CL CHLORIDE ION × 2 QP1 N-{3-[(4-{4-(4-fluorophenyl)-2-[(2-methoxyethyl)sulfanyl]-1H-imidazol-5-yl}pyridin-2-yl)amino]-4-methoxyphenyl}propanamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 M Bis-Tris, 25% PEG3350
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.226 |
| 6V6K EGFR(T790M/V948R) in complex with LN2057 提交 2019-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
696–1022（327 aa）
链 D
696–1022（327 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 QQJ N-[3-({4-[4-(4-fluorophenyl)-2-(methylsulfanyl)-1H-imidazol-5-yl]pyridin-2-yl}amino)-4-methoxyphenyl]propanamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 M Bis-Tris, 25% PEG3350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.239 |
| 6V6K EGFR(T790M/V948R) in complex with LN2057 提交 2019-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
696–1022（327 aa）
链 H
696–1022（327 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 QQJ N-[3-({4-[4-(4-fluorophenyl)-2-(methylsulfanyl)-1H-imidazol-5-yl]pyridin-2-yl}amino)-4-methoxyphenyl]propanamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 M Bis-Tris, 25% PEG3350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.239 |
| 6V6K EGFR(T790M/V948R) in complex with LN2057 提交 2019-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
696–1022（327 aa）
链 G
696–1022（327 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 QQJ N-[3-({4-[4-(4-fluorophenyl)-2-(methylsulfanyl)-1H-imidazol-5-yl]pyridin-2-yl}amino)-4-methoxyphenyl]propanamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 M Bis-Tris, 25% PEG3350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.239 |
| 6V6K EGFR(T790M/V948R) in complex with LN2057 提交 2019-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 E
696–1022（327 aa）
链 F
696–1022（327 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 QQJ N-[3-({4-[4-(4-fluorophenyl)-2-(methylsulfanyl)-1H-imidazol-5-yl]pyridin-2-yl}amino)-4-methoxyphenyl]propanamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 M Bis-Tris, 25% PEG3350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.239 |
| 6V6O EGFR(T790M/V948R) in complex with LN2380 提交 2019-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
696–1022（327 aa）
链 E
696–1022（327 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 QQM N-[3-({4-[4-(4-fluorophenyl)-2-(3-hydroxypropyl)-1H-imidazol-5-yl]pyridin-2-yl}amino)-4-methoxyphenyl]propanamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 M Bis-Tris, 25% PEG3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.221 |
| 6V6O EGFR(T790M/V948R) in complex with LN2380 提交 2019-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
696–1022（327 aa）
链 F
696–1022（327 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 QQM N-[3-({4-[4-(4-fluorophenyl)-2-(3-hydroxypropyl)-1H-imidazol-5-yl]pyridin-2-yl}amino)-4-methoxyphenyl]propanamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 M Bis-Tris, 25% PEG3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.221 |
| 6V6O EGFR(T790M/V948R) in complex with LN2380 提交 2019-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
696–1022（327 aa）
链 H
696–1022（327 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 QQM N-[3-({4-[4-(4-fluorophenyl)-2-(3-hydroxypropyl)-1H-imidazol-5-yl]pyridin-2-yl}amino)-4-methoxyphenyl]propanamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 M Bis-Tris, 25% PEG3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.221 |
| 6V6O EGFR(T790M/V948R) in complex with LN2380 提交 2019-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
696–1022（327 aa）
链 G
696–1022（327 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 QQM N-[3-({4-[4-(4-fluorophenyl)-2-(3-hydroxypropyl)-1H-imidazol-5-yl]pyridin-2-yl}amino)-4-methoxyphenyl]propanamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 M Bis-Tris, 25% PEG3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.221 |
| 6VH4 Wild type EGFR in complex with LN2380 提交 2020-01-09 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
未记录 | QQM N-[3-({4-[4-(4-fluorophenyl)-2-(3-hydroxypropyl)-1H-imidazol-5-yl]pyridin-2-yl}amino)-4-methoxyphenyl]propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；1.4 M Sodium Citrate, 0.1 M MES
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.230 |
| 6VHN Wild type EGFR in complex with LN2057 提交 2020-01-10 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
未记录 | QQJ N-[3-({4-[4-(4-fluorophenyl)-2-(methylsulfanyl)-1H-imidazol-5-yl]pyridin-2-yl}amino)-4-methoxyphenyl]propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；1.4M Sodium Citrate, 0.1 M MES
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.200 |
| 6VHP Wild type EGFR in complex with LN2899 提交 2020-01-10 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
未记录 | QP1 N-{3-[(4-{4-(4-fluorophenyl)-2-[(2-methoxyethyl)sulfanyl]-1H-imidazol-5-yl}pyridin-2-yl)amino]-4-methoxyphenyl}propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；1.4M Sodium Citrate, 0.1 M MES
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.218 |
| 6WA2 Crystal structure of EGFR(T790M/V948R) in complex with LN3753 提交 2020-03-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
695–1022（328 aa）
链 D
695–1022（328 aa）
|
未记录 | TOV N-(3-{5-[2-(acetylamino)pyridin-4-yl]-2-(methylsulfanyl)-1H-imidazol-4-yl}phenyl)-2-fluoro-5-hydroxybenzamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；25% PEG-3350 0.1 M BisTris
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.258 |
| 6WA2 Crystal structure of EGFR(T790M/V948R) in complex with LN3753 提交 2020-03-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
695–1022（328 aa）
链 C
695–1022（328 aa）
|
未记录 | TOV N-(3-{5-[2-(acetylamino)pyridin-4-yl]-2-(methylsulfanyl)-1H-imidazol-4-yl}phenyl)-2-fluoro-5-hydroxybenzamide × 2 CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；25% PEG-3350 0.1 M BisTris
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.258 |
| 6WAK A crystal structure of EGFR(T790M/V948R) in complex with LN3754 提交 2020-03-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
695–1022（328 aa）
链 D
695–1022（328 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；25% PEG-3350, 0.1 M BisTris
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.230 |
| 6WAK A crystal structure of EGFR(T790M/V948R) in complex with LN3754 提交 2020-03-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
695–1022（328 aa）
链 C
695–1022（328 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 TQA N-(3-{5-[2-(acetylamino)pyridin-4-yl]-2-(methylsulfanyl)-1H-imidazol-4-yl}phenyl)-2-[(1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)methyl]benzamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；25% PEG-3350, 0.1 M BisTris
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.230 |
| 6XL4 EGFR(T790M/V948R) in complex with AZD9291 and DDC4002 提交 2020-06-28 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | Q6K ~{N}-[2-[2-(dimethylamino)ethyl-methyl-amino]-4-methoxy-5-[[4-(1-methylindol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino]phenyl]propanamide × 1 NQ1 10-benzyl-8-fluoro-5,10-dihydro-11H-dibenzo[b,e][1,4]diazepin-11-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；25% PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.252 |
| 6XL4 EGFR(T790M/V948R) in complex with AZD9291 and DDC4002 提交 2020-06-28 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
|
未记录 | Q6K ~{N}-[2-[2-(dimethylamino)ethyl-methyl-amino]-4-methoxy-5-[[4-(1-methylindol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino]phenyl]propanamide × 1 NQ1 10-benzyl-8-fluoro-5,10-dihydro-11H-dibenzo[b,e][1,4]diazepin-11-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；25% PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.252 |
| 6XL4 EGFR(T790M/V948R) in complex with AZD9291 and DDC4002 提交 2020-06-28 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
695–1022（328 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；25% PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.252 |
| 6XL4 EGFR(T790M/V948R) in complex with AZD9291 and DDC4002 提交 2020-06-28 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
695–1022（328 aa）
|
未记录 | NQ1 10-benzyl-8-fluoro-5,10-dihydro-11H-dibenzo[b,e][1,4]diazepin-11-one × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；25% PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.252 |
| 6Z4B Crystal Structure of EGFR-T790M/V948R in Complex with Osimertinib and EAI045 提交 2020-05-25 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | Q6K ~{N}-[2-[2-(dimethylamino)ethyl-methyl-amino]-4-methoxy-5-[[4-(1-methylindol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino]phenyl]propanamide × 1 9LL (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-(1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 1 SO4 SULFATE ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；27.5 % PEG3350, 100 mM MgSO4, 4 % ethylen glycole, 4.7 mg/mL EGFR-T790M/V948R (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul protein solution)
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.251 |
| 6Z4B Crystal Structure of EGFR-T790M/V948R in Complex with Osimertinib and EAI045 提交 2020-05-25 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | Q6K ~{N}-[2-[2-(dimethylamino)ethyl-methyl-amino]-4-methoxy-5-[[4-(1-methylindol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino]phenyl]propanamide × 1 9LL (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-(1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 1 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；27.5 % PEG3350, 100 mM MgSO4, 4 % ethylen glycole, 4.7 mg/mL EGFR-T790M/V948R (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul protein solution)
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.251 |
| 6Z4D Crystal Structure of EGFR-T790M/V948R in Complex with Mavelertinib and EAI001 提交 2020-05-25 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | 8BS N-[(3R,4R)-4-fluoro-1-{6-[(3-methoxy-1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)amino]-9-methyl-9H-purin-2-yl}pyrrolidin-3-yl]propanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；27.5 % PEG3350, 100 mM MgSO4, 2 % ethylen glycole, 5.0 mg/mL EGFR-T790M/V948R (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul protein solution)
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.221 |
| 6Z4D Crystal Structure of EGFR-T790M/V948R in Complex with Mavelertinib and EAI001 提交 2020-05-25 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | 8BS N-[(3R,4R)-4-fluoro-1-{6-[(3-methoxy-1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)amino]-9-methyl-9H-purin-2-yl}pyrrolidin-3-yl]propanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 3 57N (2R)-2-(1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)-2-phenyl-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；27.5 % PEG3350, 100 mM MgSO4, 2 % ethylen glycole, 5.0 mg/mL EGFR-T790M/V948R (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul protein solution)
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.221 |
| 7A2A Crystal Structure of EGFR-T790M/V948R in Complex with Spebrutinib and EAI001 提交 2020-08-17 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | 57N (2R)-2-(1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)-2-phenyl-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 1 7G9 ~{N}-[3-[[5-fluoranyl-2-[[4-(2-methoxyethoxy)phenyl]amino]pyrimidin-4-yl]amino]phenyl]propanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25 % PEG3350, 100 mM MgSO4, 4 % ethylen glycole, 5.0 mg/mL EGFR-T790M/V948R (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul protein solution)
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.217 |
| 7A2A Crystal Structure of EGFR-T790M/V948R in Complex with Spebrutinib and EAI001 提交 2020-08-17 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | 57N (2R)-2-(1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)-2-phenyl-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 1 7G9 ~{N}-[3-[[5-fluoranyl-2-[[4-(2-methoxyethoxy)phenyl]amino]pyrimidin-4-yl]amino]phenyl]propanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25 % PEG3350, 100 mM MgSO4, 4 % ethylen glycole, 5.0 mg/mL EGFR-T790M/V948R (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul protein solution)
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.217 |
| 7A6I Crystal Structure of EGFR-T790M/V948R in Complex with LDC8201 提交 2020-08-25 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | SO4 SULFATE ION × 4 R1W ~{N}-[5-[4-chloranyl-2-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-1~{H}-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl]-2-methyl-phenyl]propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；27.5 % PEG3350, 200 mM MgSO4, 4 % ethylen glycole, 7.5 mg/mL EGFR-T790M/V948R (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul protein solution)
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.239 |
| 7A6J Crystal Structure of EGFR-T790M/V948R in Complex with Poziotinib 提交 2020-08-25 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | R2E 1-[4-[4-[[3,4-bis(chloranyl)-2-fluoranyl-phenyl]amino]-7-methoxy-quinazolin-6-yl]oxypiperidin-1-yl]propan-1-one × 1 SO4 SULFATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20.0 % PEG3350, 100 mM MgSO4, 4 % ethylen glycole, 7.5 mg/mL EGFR-T790M/V948R (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul protein solution)
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.216 |
| 7A6J Crystal Structure of EGFR-T790M/V948R in Complex with Poziotinib 提交 2020-08-25 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | R2E 1-[4-[4-[[3,4-bis(chloranyl)-2-fluoranyl-phenyl]amino]-7-methoxy-quinazolin-6-yl]oxypiperidin-1-yl]propan-1-one × 1 SO4 SULFATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20.0 % PEG3350, 100 mM MgSO4, 4 % ethylen glycole, 7.5 mg/mL EGFR-T790M/V948R (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul protein solution)
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.216 |
| 7A6K Crystal Structure of EGFR-T790M/V948R in Complex with TAK-788 提交 2020-08-25 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | R28 propan-2-yl 2-[[4-[2-(dimethylamino)ethyl-methyl-amino]-2-methoxy-5-(propanoylamino)phenyl]amino]-4-(1-methylindol-3-yl)pyrimidine-5-carboxylate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25.0 % PEG3350, 100 mM MgSO4, 4 % ethylen glycole, 6.8 mg/mL EGFR-T790M/V948R (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul protein solution)
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.220 |
| 7A6K Crystal Structure of EGFR-T790M/V948R in Complex with TAK-788 提交 2020-08-25 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | R28 propan-2-yl 2-[[4-[2-(dimethylamino)ethyl-methyl-amino]-2-methoxy-5-(propanoylamino)phenyl]amino]-4-(1-methylindol-3-yl)pyrimidine-5-carboxylate × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25.0 % PEG3350, 100 mM MgSO4, 4 % ethylen glycole, 6.8 mg/mL EGFR-T790M/V948R (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul protein solution)
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.220 |
| 7A6K Crystal Structure of EGFR-T790M/V948R in Complex with TAK-788 提交 2020-08-25 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | R28 propan-2-yl 2-[[4-[2-(dimethylamino)ethyl-methyl-amino]-2-methoxy-5-(propanoylamino)phenyl]amino]-4-(1-methylindol-3-yl)pyrimidine-5-carboxylate × 1 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25.0 % PEG3350, 100 mM MgSO4, 4 % ethylen glycole, 6.8 mg/mL EGFR-T790M/V948R (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul protein solution)
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.220 |
| 7A6K Crystal Structure of EGFR-T790M/V948R in Complex with TAK-788 提交 2020-08-25 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | R28 propan-2-yl 2-[[4-[2-(dimethylamino)ethyl-methyl-amino]-2-methoxy-5-(propanoylamino)phenyl]amino]-4-(1-methylindol-3-yl)pyrimidine-5-carboxylate × 1 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25.0 % PEG3350, 100 mM MgSO4, 4 % ethylen glycole, 6.8 mg/mL EGFR-T790M/V948R (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul protein solution)
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.220 |
| 7AEI Studies Towards a Reversible EGFR C797S Triple Mutant Inhibitor Series 提交 2020-09-17 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | R85 5-chloranyl-~{N}2-[4-[4-(dimethylamino)piperidin-1-yl]-2-methoxy-5-(1-methylpyrazol-4-yl)phenyl]-~{N}4-(2-dimethylphosphorylphenyl)pyrimidine-2,4-diamine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；Trisodium citrate 0.68M
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.234 |
| 7AEM Studies Towards a Reversible EGFR C797S Triple Mutant Inhibitor Series 提交 2020-09-17 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | 6GY 5-chloro-N~4~-[2-(dimethylphosphoryl)phenyl]-N~2~-{2-methoxy-4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidin-1-yl]phenyl}pyrimidine-2,4-diamine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；Tris sodium citrate 0.68M
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.221 |
| 7B85 Crystal Structure of EGFR-WT in Complex with TAK-788 提交 2020-12-12 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | R28 propan-2-yl 2-[[4-[2-(dimethylamino)ethyl-methyl-amino]-2-methoxy-5-(propanoylamino)phenyl]amino]-4-(1-methylindol-3-yl)pyrimidine-5-carboxylate × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.6 K-Na-tartrate, 100 mM Na-MES (pH 7.0),
6.2 mg/mL EGFR-WT (im 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0, 1 ul reservoir + 1 ul solution
Soaking-Experiment
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.244 |
| 7ER2 Crystal structure of EGFR 696-1022 T790M/C797S in complex with LS_2_40 提交 2021-05-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
突变：T790M, C797S | JAU 5-chloranyl-N2-[3-chloranyl-4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidin-1-yl]phenyl]-N4-(2-dimethylphosphorylphenyl)pyrimidine-2,4-diamine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；38% PEG 300, 150 mM KCl, 0.1 M HEPES (pH 8.0)
|
分辨率 2.66 Å R-free 0.242 |
| 7JXI EGFR kinase (T790M/V948R) in complex with PF-06747775 提交 2020-08-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
链 D
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | 8BS N-[(3R,4R)-4-fluoro-1-{6-[(3-methoxy-1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)amino]-9-methyl-9H-purin-2-yl}pyrrolidin-3-yl]propanamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 28% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.312 |
| 7JXI EGFR kinase (T790M/V948R) in complex with PF-06747775 提交 2020-08-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
链 B
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | 8BS N-[(3R,4R)-4-fluoro-1-{6-[(3-methoxy-1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)amino]-9-methyl-9H-purin-2-yl}pyrrolidin-3-yl]propanamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 28% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.312 |
| 7JXK EGFR kinase (T790M/V948R) in complex with PF-06747775 and JBJ-04-125-02 提交 2020-08-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
链 D
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 JBJ (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-{1-oxo-6-[4-(piperazin-1-yl)phenyl]-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl}-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 2 8BS N-[(3R,4R)-4-fluoro-1-{6-[(3-methoxy-1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)amino]-9-methyl-9H-purin-2-yl}pyrrolidin-3-yl]propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.261 |
| 7JXK EGFR kinase (T790M/V948R) in complex with PF-06747775 and JBJ-04-125-02 提交 2020-08-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
链 C
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 JBJ (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-{1-oxo-6-[4-(piperazin-1-yl)phenyl]-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl}-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 1 8BS N-[(3R,4R)-4-fluoro-1-{6-[(3-methoxy-1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)amino]-9-methyl-9H-purin-2-yl}pyrrolidin-3-yl]propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.261 |
| 7JXK EGFR kinase (T790M/V948R) in complex with PF-06747775 and JBJ-04-125-02 提交 2020-08-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 E
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
链 F
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | JBJ (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-{1-oxo-6-[4-(piperazin-1-yl)phenyl]-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl}-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 2 8BS N-[(3R,4R)-4-fluoro-1-{6-[(3-methoxy-1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)amino]-9-methyl-9H-purin-2-yl}pyrrolidin-3-yl]propanamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.261 |
| 7JXL EGFR kinase (T790M/V948R) in complex with AZ5104 提交 2020-08-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
链 D
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | VO7 N-(2-{[2-(dimethylamino)ethyl](methyl)amino}-5-{[4-(1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}-4-methoxyphenyl)propanamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 28% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.239 |
| 7JXL EGFR kinase (T790M/V948R) in complex with AZ5104 提交 2020-08-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
链 C
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | VO7 N-(2-{[2-(dimethylamino)ethyl](methyl)amino}-5-{[4-(1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}-4-methoxyphenyl)propanamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 28% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.239 |
| 7JXM EGFR kinase (T790M/V948R) in complex with osimertinib and EAI045 提交 2020-08-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
链 D
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 9LL (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-(1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 28% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.271 |
| 7JXM EGFR kinase (T790M/V948R) in complex with osimertinib and EAI045 提交 2020-08-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
链 B
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 9LL (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-(1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 1 YY3 N-(2-{[2-(dimethylamino)ethyl](methyl)amino}-4-methoxy-5-{[4-(1-methyl-1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}phenyl)prop-2-enamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 28% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.271 |
| 7JXP EGFR kinase (T790M/V948R) in complex with osimertinib and JBJ-04-125-02 提交 2020-08-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
链 F
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 JBJ (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-{1-oxo-6-[4-(piperazin-1-yl)phenyl]-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl}-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 28% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.16 Å R-free 0.247 |
| 7JXP EGFR kinase (T790M/V948R) in complex with osimertinib and JBJ-04-125-02 提交 2020-08-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
链 E
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 JBJ (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-{1-oxo-6-[4-(piperazin-1-yl)phenyl]-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl}-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 2 YY3 N-(2-{[2-(dimethylamino)ethyl](methyl)amino}-4-methoxy-5-{[4-(1-methyl-1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}phenyl)prop-2-enamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 28% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.16 Å R-free 0.247 |
| 7JXP EGFR kinase (T790M/V948R) in complex with osimertinib and JBJ-04-125-02 提交 2020-08-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
链 C
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 JBJ (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-{1-oxo-6-[4-(piperazin-1-yl)phenyl]-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl}-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 2 YY3 N-(2-{[2-(dimethylamino)ethyl](methyl)amino}-4-methoxy-5-{[4-(1-methyl-1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}phenyl)prop-2-enamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 28% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.16 Å R-free 0.247 |
| 7JXQ EGFR kinase (T790M/V948R) in complex with allosteric inhibitor JBJ-09-063 提交 2020-08-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
链 D
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 VNS (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-{6-[4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]-1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl}-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.7, 28% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.218 |
| 7JXQ EGFR kinase (T790M/V948R) in complex with allosteric inhibitor JBJ-09-063 提交 2020-08-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
链 C
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 VNS (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-{6-[4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]-1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl}-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.7, 28% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.218 |
| 7JXW EGFR kinase (T790M/V948R) in complex with osimertinib and JBJ-09-063 提交 2020-08-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
链 D
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | YY3 N-(2-{[2-(dimethylamino)ethyl](methyl)amino}-4-methoxy-5-{[4-(1-methyl-1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}phenyl)prop-2-enamide × 2 VNS (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-{6-[4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]-1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl}-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.7, 28% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.319 |
| 7JXW EGFR kinase (T790M/V948R) in complex with osimertinib and JBJ-09-063 提交 2020-08-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
链 C
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | YY3 N-(2-{[2-(dimethylamino)ethyl](methyl)amino}-4-methoxy-5-{[4-(1-methyl-1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}phenyl)prop-2-enamide × 2 VNS (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-{6-[4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]-1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl}-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.7, 28% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.319 |
| 7K1H EGFR L858R/V948R in complex with osimertinib and allosteric inhibitor JBJ-09-063 提交 2020-09-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
链 B
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：L858R, V948R 突变：L858R, V948R | VNS (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-{6-[4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]-1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl}-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 2 YY3 N-(2-{[2-(dimethylamino)ethyl](methyl)amino}-4-methoxy-5-{[4-(1-methyl-1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}phenyl)prop-2-enamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.275 |
| 7K1H EGFR L858R/V948R in complex with osimertinib and allosteric inhibitor JBJ-09-063 提交 2020-09-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
链 F
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：L858R, V948R 突变：L858R, V948R | VNS (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-{6-[4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]-1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl}-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 2 YY3 N-(2-{[2-(dimethylamino)ethyl](methyl)amino}-4-methoxy-5-{[4-(1-methyl-1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}phenyl)prop-2-enamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.275 |
| 7K1H EGFR L858R/V948R in complex with osimertinib and allosteric inhibitor JBJ-09-063 提交 2020-09-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
链 E
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：L858R, V948R 突变：L858R, V948R | VNS (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-{6-[4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]-1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl}-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 2 YY3 N-(2-{[2-(dimethylamino)ethyl](methyl)amino}-4-methoxy-5-{[4-(1-methyl-1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}phenyl)prop-2-enamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.275 |
| 7K1I EGFR kinase (L858R/V948R) in complex with allosteric inhibitor JBJ-09-063 提交 2020-09-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：L858R, V948R | MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 VNS (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-{6-[4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]-1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl}-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 28% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.311 |
| 7KXZ Active conformation of EGFR kinase in complex with BI-4020 提交 2020-12-06 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 XA4 (20R)-10,15,20-trimethyl-2-[(4-methylpiperazin-1-yl)methyl]-18,19,20,21-tetrahydro-15H,17H-12,8-(metheno)pyrazolo[3',4':2,3][1,5,10,12]oxatriazacycloheptadecino[12,11-a]benzimidazol-7(6H)-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES pH 6.5, 0.8 M sodium citrate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.219 |
| 7KY0 Inactive conformation of EGFR (T790M/V948R) kinase in complex with BI-4020 提交 2020-12-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R | XA4 (20R)-10,15,20-trimethyl-2-[(4-methylpiperazin-1-yl)methyl]-18,19,20,21-tetrahydro-15H,17H-12,8-(metheno)pyrazolo[3',4':2,3][1,5,10,12]oxatriazacycloheptadecino[12,11-a]benzimidazol-7(6H)-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.7, 28% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.292 |
| 7KY0 Inactive conformation of EGFR (T790M/V948R) kinase in complex with BI-4020 提交 2020-12-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R | XA4 (20R)-10,15,20-trimethyl-2-[(4-methylpiperazin-1-yl)methyl]-18,19,20,21-tetrahydro-15H,17H-12,8-(metheno)pyrazolo[3',4':2,3][1,5,10,12]oxatriazacycloheptadecino[12,11-a]benzimidazol-7(6H)-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.7, 28% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.292 |
| 7KY0 Inactive conformation of EGFR (T790M/V948R) kinase in complex with BI-4020 提交 2020-12-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R | XA4 (20R)-10,15,20-trimethyl-2-[(4-methylpiperazin-1-yl)methyl]-18,19,20,21-tetrahydro-15H,17H-12,8-(metheno)pyrazolo[3',4':2,3][1,5,10,12]oxatriazacycloheptadecino[12,11-a]benzimidazol-7(6H)-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.7, 28% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.292 |
| 7KY0 Inactive conformation of EGFR (T790M/V948R) kinase in complex with BI-4020 提交 2020-12-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R | XA4 (20R)-10,15,20-trimethyl-2-[(4-methylpiperazin-1-yl)methyl]-18,19,20,21-tetrahydro-15H,17H-12,8-(metheno)pyrazolo[3',4':2,3][1,5,10,12]oxatriazacycloheptadecino[12,11-a]benzimidazol-7(6H)-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.7, 28% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.292 |
| 7LEN Crystal structure of the epidermal growth factor receptor extracellular region with R84K mutation in complex with epiregulin crystallized with trehalose 提交 2021-01-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
25–525（501 aa）
|
突变：R84K | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293.15 K；8 mg/ml protein, 100 mM HEPES (pH 7.5), 12% PEG3350, with 3% (w/v) D-(+)-trehalose dihydrate
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.295 |
| 7LEN Crystal structure of the epidermal growth factor receptor extracellular region with R84K mutation in complex with epiregulin crystallized with trehalose 提交 2021-01-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
25–525（501 aa）
|
突变：R84K | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293.15 K；8 mg/ml protein, 100 mM HEPES (pH 7.5), 12% PEG3350, with 3% (w/v) D-(+)-trehalose dihydrate
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.295 |
| 7LFR Crystal structure of the epidermal growth factor receptor extracellular region with R84K mutation in complex with epiregulin crystallized with spermine 提交 2021-01-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
25–525（501 aa）
链 B
25–525（501 aa）
|
突变：R84K 突变：R84K | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 MAN alpha-D-mannopyranose × 2 BMA beta-D-mannopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293.15 K；8 mg/ml protein, 100 mM HEPES (pH 7.5), 12% PEG3350, 10 mM spermine tetrahydrochloride
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.303 |
| 7LFR Crystal structure of the epidermal growth factor receptor extracellular region with R84K mutation in complex with epiregulin crystallized with spermine 提交 2021-01-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
25–525（501 aa）
|
突变：R84K | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293.15 K；8 mg/ml protein, 100 mM HEPES (pH 7.5), 12% PEG3350, 10 mM spermine tetrahydrochloride
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.303 |
| 7LFR Crystal structure of the epidermal growth factor receptor extracellular region with R84K mutation in complex with epiregulin crystallized with spermine 提交 2021-01-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
25–525（501 aa）
|
突变：R84K | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 BMA beta-D-mannopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293.15 K；8 mg/ml protein, 100 mM HEPES (pH 7.5), 12% PEG3350, 10 mM spermine tetrahydrochloride
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.303 |
| 7LFS Crystal structure of the epidermal growth factor receptor extracellular region with A265V mutation in complex with epiregulin 提交 2021-01-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
25–525（501 aa）
|
突变：A265V | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；8 mg/ml protein, 1% w/v tryptone, 1 mM sodium azide, 50 mM HEPES (pH 7.0), 20% PEG3350
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.315 |
| 7LFS Crystal structure of the epidermal growth factor receptor extracellular region with A265V mutation in complex with epiregulin 提交 2021-01-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
25–525（501 aa）
|
突变：A265V | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；8 mg/ml protein, 1% w/v tryptone, 1 mM sodium azide, 50 mM HEPES (pH 7.0), 20% PEG3350
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.315 |
| 7LFS Crystal structure of the epidermal growth factor receptor extracellular region with A265V mutation in complex with epiregulin 提交 2021-01-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
25–525（501 aa）
|
突变：A265V | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；8 mg/ml protein, 1% w/v tryptone, 1 mM sodium azide, 50 mM HEPES (pH 7.0), 20% PEG3350
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.315 |
| 7LFS Crystal structure of the epidermal growth factor receptor extracellular region with A265V mutation in complex with epiregulin 提交 2021-01-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
25–525（501 aa）
|
突变：A265V | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；8 mg/ml protein, 1% w/v tryptone, 1 mM sodium azide, 50 mM HEPES (pH 7.0), 20% PEG3350
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.315 |
| 7LG8 EGFR (T79M/V948R) in complex with naquotinib and an allosteric inhibitor 提交 2021-01-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R | VNS (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-{6-[4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]-1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl}-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 1 8RC 6-ethyl-3-[[4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidin-1-yl]phenyl]amino]-5-[(3R)-1-prop-2-enoylpyrrolidin-3-yl]oxy-pyrazin e-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.93 Å R-free 0.270 |
| 7LG8 EGFR (T79M/V948R) in complex with naquotinib and an allosteric inhibitor 提交 2021-01-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R | VNS (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-{6-[4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]-1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl}-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 1 8RC 6-ethyl-3-[[4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidin-1-yl]phenyl]amino]-5-[(3R)-1-prop-2-enoylpyrrolidin-3-yl]oxy-pyrazin e-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.93 Å R-free 0.270 |
| 7LG8 EGFR (T79M/V948R) in complex with naquotinib and an allosteric inhibitor 提交 2021-01-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R | VNS (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-{6-[4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]-1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl}-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 1 8RC 6-ethyl-3-[[4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidin-1-yl]phenyl]amino]-5-[(3R)-1-prop-2-enoylpyrrolidin-3-yl]oxy-pyrazin e-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.93 Å R-free 0.270 |
| 7LG8 EGFR (T79M/V948R) in complex with naquotinib and an allosteric inhibitor 提交 2021-01-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R | VNS (2R)-2-(5-fluoro-2-hydroxyphenyl)-2-{6-[4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]-1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl}-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 1 8RC 6-ethyl-3-[[4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidin-1-yl]phenyl]amino]-5-[(3R)-1-prop-2-enoylpyrrolidin-3-yl]oxy-pyrazin e-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.93 Å R-free 0.270 |
| 7LGS Structure of EGFR_D770_N771insNPG/V948R in complex with covalent inhibitor Osimertinib. 提交 2021-01-21 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
未记录 | Q6K ~{N}-[2-[2-(dimethylamino)ethyl-methyl-amino]-4-methoxy-5-[[4-(1-methylindol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino]phenyl]propanamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG 8000, 200mM Ammonium Citrate, 100mM MES pH 6.5
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.305 |
| 7LGS Structure of EGFR_D770_N771insNPG/V948R in complex with covalent inhibitor Osimertinib. 提交 2021-01-21 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
696–1022（327 aa）
|
未记录 | Q6K ~{N}-[2-[2-(dimethylamino)ethyl-methyl-amino]-4-methoxy-5-[[4-(1-methylindol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino]phenyl]propanamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 CIT CITRIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG 8000, 200mM Ammonium Citrate, 100mM MES pH 6.5
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.305 |
| 7LGS Structure of EGFR_D770_N771insNPG/V948R in complex with covalent inhibitor Osimertinib. 提交 2021-01-21 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
696–1022（327 aa）
|
未记录 | Q6K ~{N}-[2-[2-(dimethylamino)ethyl-methyl-amino]-4-methoxy-5-[[4-(1-methylindol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino]phenyl]propanamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG 8000, 200mM Ammonium Citrate, 100mM MES pH 6.5
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.305 |
| 7LGS Structure of EGFR_D770_N771insNPG/V948R in complex with covalent inhibitor Osimertinib. 提交 2021-01-21 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
696–1022（327 aa）
|
未记录 | Q6K ~{N}-[2-[2-(dimethylamino)ethyl-methyl-amino]-4-methoxy-5-[[4-(1-methylindol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino]phenyl]propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG 8000, 200mM Ammonium Citrate, 100mM MES pH 6.5
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.305 |
| 7LTX EGFR (T790M/V948R) in complex with quinazolinone allosteric inhibitor 提交 2021-02-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 YFA (2R)-2-{5-fluoro-6-[4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]-4-oxoquinazolin-3(4H)-yl}-2-phenyl-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.216 |
| 7LTX EGFR (T790M/V948R) in complex with quinazolinone allosteric inhibitor 提交 2021-02-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 YFA (2R)-2-{5-fluoro-6-[4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]-4-oxoquinazolin-3(4H)-yl}-2-phenyl-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.216 |
| 7LTX EGFR (T790M/V948R) in complex with quinazolinone allosteric inhibitor 提交 2021-02-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 YFA (2R)-2-{5-fluoro-6-[4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]-4-oxoquinazolin-3(4H)-yl}-2-phenyl-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.216 |
| 7LTX EGFR (T790M/V948R) in complex with quinazolinone allosteric inhibitor 提交 2021-02-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 YFA (2R)-2-{5-fluoro-6-[4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]-4-oxoquinazolin-3(4H)-yl}-2-phenyl-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.216 |
| 7OM4 Nanobody EgB4 bound to the full extracellular EGFR-EGF complex 提交 2021-05-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
25–645（621 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 14 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M LiSO4, 0.1 M glycine pH 10.5, 1.1 M sodium dihydrogen phosphate and 0.72 M dipotassium hydrogen phosphate
|
分辨率 6.05 Å R-free 0.327 |
| 7OXB Crystal structure of EGFR double mutant (T790M/L858R) in complex with compound 6. 提交 2021-06-22 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
696–1020（325 aa）
片段：KINASE DOMAIN
|
未记录 | 35Z 2-[2-(3-methoxyphenyl)pyrimidin-4-yl]-1'-prop-2-enoyl-spiro[5,6-dihydro-1~{H}-pyrrolo[3,2-c]pyridine-7,4'-piperidine]-4-one × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；Unknown
|
分辨率 2.56 Å R-free 0.227 |
| 7SI1 Crystal structure of apo EGFR kinase domain 提交 2021-10-12 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；292 K；0.1 M MES pH 7.0, 1M Na/K Tartrate
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.215 |
| 7SYD Cryo-EM structure of the extracellular module of the full-length EGFR bound to EGF "tips-juxtaposed" conformation 提交 2021-11-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–1210（1210 aa）
链 B
1–1210（1210 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7SYE Cryo-EM structure of the extracellular module of the full-length EGFR bound to EGF. "tips-separated" conformation 提交 2021-11-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–1210（1210 aa）
链 B
1–1210（1210 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7SZ0 Cryo-EM structure of the extracellular module of the full-length EGFR L834R bound to EGF. "tips-juxtaposed" conformation 提交 2021-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–1210（1210 aa）
链 B
1–1210（1210 aa）
|
突变：L834R 突变：L834R | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7SZ1 Cryo-EM structure of the extracellular module of the full-length EGFR L834R bound to EGF. "tips-separated" conformation 提交 2021-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–1210（1210 aa）
链 B
1–1210（1210 aa）
|
突变：L834R 突变：L834R | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7SZ5 Cryo-EM structure of the extracellular module of the full-length EGFR bound to TGF-alpha "tips-separated" conformation 提交 2021-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–1210（1210 aa）
链 B
1–1210（1210 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7SZ7 Cryo-EM structure of the extracellular module of the full-length EGFR bound to TGF-alpha. "tips-juxtaposed" conformation 提交 2021-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–1210（1210 aa）
链 B
1–1210（1210 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7T4I Crystal Structure of wild type EGFR in complex with TAK-788 提交 2021-12-10 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
未记录 | R28 propan-2-yl 2-[[4-[2-(dimethylamino)ethyl-methyl-amino]-2-methoxy-5-(propanoylamino)phenyl]amino]-4-(1-methylindol-3-yl)pyrimidine-5-carboxylate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Bis-tris pH 6.5, 0.2M lithium sulfate, 24% PEG 3350
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.238 |
| 7T4J Crystal Structure of EGFR_D770_N771insNPG/V948R in complex with TAK-788 提交 2021-12-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
696–1022（327 aa）
链 B
696–1022（327 aa）
|
突变：V948R 突变：V948R | R28 propan-2-yl 2-[[4-[2-(dimethylamino)ethyl-methyl-amino]-2-methoxy-5-(propanoylamino)phenyl]amino]-4-(1-methylindol-3-yl)pyrimidine-5-carboxylate × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CIT CITRIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG 8000, 200mM Ammonium Citrate, 100mM MES pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.278 |
| 7TVD Crystal structure of the kinase domain of EGFR exon-19 (del-747-749) mutant 提交 2022-02-04 | 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289.15 K；28% PEG 400, 0.1 M Na Hepes pH 7.5, 0.2 M Calcium Chloride
|
分辨率 2.96 Å R-free 0.277 |
| 7U98 EGFR(T790M/V948R) in complex with a macrocyclic inhibitor 提交 2022-03-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain, residues 695-1022
|
突变：T790M, V948R | M1O 19-chloro-18-fluoro-22-methoxy-8,9,11,12,14,15-hexahydro-21H-4,6-ethenopyrimido[5,4-m][1,4,7,10,15]benzotetraoxazacycloheptadecine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 3.42 Å R-free 0.244 |
| 7U98 EGFR(T790M/V948R) in complex with a macrocyclic inhibitor 提交 2022-03-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain, residues 695-1022
|
突变：T790M, V948R | M1O 19-chloro-18-fluoro-22-methoxy-8,9,11,12,14,15-hexahydro-21H-4,6-ethenopyrimido[5,4-m][1,4,7,10,15]benzotetraoxazacycloheptadecine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 3.42 Å R-free 0.244 |
| 7U98 EGFR(T790M/V948R) in complex with a macrocyclic inhibitor 提交 2022-03-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain, residues 695-1022
|
突变：T790M, V948R | M1O 19-chloro-18-fluoro-22-methoxy-8,9,11,12,14,15-hexahydro-21H-4,6-ethenopyrimido[5,4-m][1,4,7,10,15]benzotetraoxazacycloheptadecine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 3.42 Å R-free 0.244 |
| 7U98 EGFR(T790M/V948R) in complex with a macrocyclic inhibitor 提交 2022-03-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain, residues 695-1022
|
突变：T790M, V948R | M1O 19-chloro-18-fluoro-22-methoxy-8,9,11,12,14,15-hexahydro-21H-4,6-ethenopyrimido[5,4-m][1,4,7,10,15]benzotetraoxazacycloheptadecine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 3.42 Å R-free 0.244 |
| 7U99 EGFR kinase in complex with a macrocyclic inhibitor 提交 2022-03-10 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain, residues 695-1022
|
未记录 | M0R 19-chloro-22-methoxy-8,9,11,12,14,15-hexahydro-21H-4,6-ethenopyrimido[5,4-m][1,4,7,10,15]benzotetraoxazacycloheptadecine × 1 FLC CITRATE ANION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES pH 6.5, 1.1 M Sodium Citrate
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.214 |
| 7U9A EGFR in complex with a macrocyclic inhibitor 提交 2022-03-10 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain, residues 695-1022
|
未记录 | M19 4-(5-chloro-4-fluoro-2-hydroxyanilino)-7-methoxyquinazolin-6-ol × 1 FLC CITRATE ANION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES pH 6.5, 1.1 M Sodium Citrate
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.226 |
| 7UKV Wild type EGFR in complex with Lazertinib (YH25448) 提交 2022-04-02 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
未记录 | ZRT N-[5-{[(4P)-4-{4-[(dimethylamino)methyl]-3-phenyl-1H-pyrazol-1-yl}pyrimidin-2-yl]amino}-4-methoxy-2-(morpholin-4-yl)phenyl]propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；1.0 M Sodium Citrate, 0.1 M MES pH 6.0
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.243 |
| 7UKW EGFR(T790M/V948R) in complex with Lazertinib (YH25448) 提交 2022-04-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
695–1022（328 aa）
链 D
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | ZRT N-[5-{[(4P)-4-{4-[(dimethylamino)methyl]-3-phenyl-1H-pyrazol-1-yl}pyrimidin-2-yl]amino}-4-methoxy-2-(morpholin-4-yl)phenyl]propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；25% PEG-3350, 0.1 M Bis-Tris
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.250 |
| 7UKW EGFR(T790M/V948R) in complex with Lazertinib (YH25448) 提交 2022-04-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
695–1022（328 aa）
链 C
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | ZRT N-[5-{[(4P)-4-{4-[(dimethylamino)methyl]-3-phenyl-1H-pyrazol-1-yl}pyrimidin-2-yl]amino}-4-methoxy-2-(morpholin-4-yl)phenyl]propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；25% PEG-3350, 0.1 M Bis-Tris
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.250 |
| 7VRA The crystal structure of EGFR T790M/C797S with the inhibitor HC5476 提交 2021-10-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
突变：T790M, C797S | I0A 25-chloro-11-(ethylsulfonyl)-44-morpholino-11H-5,12-dioxa-3-aza-1(3,6)-indola-2(4,2)-pyrimidina-4(1,3)-benzenacyclododecaphane × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；0.05M CaCl2, 0.1M B-Tris pH 6.2, 24% PEG 550MME, 5mM TCEP
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.245 |
| 7VRE The crystal structure of EGFR T790M/C797S with the inhibitor HCD2892 提交 2021-10-22 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
未记录 | 7VH 5-chloranyl-N-[5-chloranyl-2-methoxy-4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidin-1-yl]phenyl]-4-(1-ethylsulfonylindol-3-yl)pyrimidin-2-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M HEPES pH 8.5, 40% PEG 400, 0.15 M NaCl, 5 mM tris(2-carboxyethyl)-phosphine (TCEP)
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.242 |
| 7ZYM Crystal Structure of EGFR-T790M/C797S in Complex with Brigatinib 提交 2022-05-25 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | 6GY 5-chloro-N~4~-[2-(dimethylphosphoryl)phenyl]-N~2~-{2-methoxy-4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidin-1-yl]phenyl}pyrimidine-2,4-diamine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.4 K-Na-tartrate, 100 mM Na-MES (pH 6.5),
3.5 mg/mL EGFR-WT (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP) pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul solution
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.224 |
| 7ZYN Crystal Structure of EGFR-T790M/C797S in Complex with WZ4002 提交 2022-05-25 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | 0UN N-{3-[(5-chloro-2-{[2-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)oxy]phenyl}prop-2-enamide × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.5 K-Na-tartrate, 100 mM Na-MES (pH 6.0),
3.9 mg/mL EGFR-WT (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP) pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul solution
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.223 |
| 7ZYP Crystal Structure of EGFR-T790M/C797S in Complex with Reversible Aminopyrimidine 9 提交 2022-05-25 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | R25 propan-2-yl 2-[[4-(4-azanylpiperidin-1-yl)-2-methoxy-phenyl]amino]-4-(1-methylindol-3-yl)pyrimidine-5-carboxylate × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.5 K-Na-tartrate, 100 mM Na-MES (pH 7.5),
5.5 mg/mL EGFR-WT (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP) pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul solution
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.228 |
| 7ZYQ Crystal Structure of EGFR-T790M/V948R in Complex with Reversible Aminopyrimidine 13 提交 2022-05-25 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | V58 phenyl 2-[[4-[4-(dimethylamino)piperidin-1-yl]-2-methoxy-phenyl]amino]-4-(1H-indol-3-yl)pyrimidine-5-carboxylate × 1 SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；27.5 % PEG3350, 100 mM MgSO4, 2 % ethylen glycole, 6.4 mg/mL EGFR-T790M/V948R (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul protein solution)
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.223 |
| 7ZYQ Crystal Structure of EGFR-T790M/V948R in Complex with Reversible Aminopyrimidine 13 提交 2022-05-25 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
|
未记录 | V58 phenyl 2-[[4-[4-(dimethylamino)piperidin-1-yl]-2-methoxy-phenyl]amino]-4-(1H-indol-3-yl)pyrimidine-5-carboxylate × 1 SO4 SULFATE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；27.5 % PEG3350, 100 mM MgSO4, 2 % ethylen glycole, 6.4 mg/mL EGFR-T790M/V948R (in 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0) 1 ul reservoir + 1 ul protein solution)
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.223 |
| 8A27 EGFR kinase domain in complex with 2-(6,7-dihydro-5H-pyrrolo[1,2-c]imidazol-1-yl)-2-[6-[2-[4-[[4-(hydroxymethyl)-1-piperidyl]methyl]phenyl]ethynyl]-1-oxo-4-(trifluoromethyl)isoindolin-2-yl]-N-thiazol-2-yl-acetamide 提交 2022-06-02 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
700–1022（323 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 KY9 (2R)-2-(6,7-dihydro-5H-pyrrolo[1,2-c]imidazol-1-yl)-2-[5-[2-[4-[[4-(hydroxymethyl)piperidin-1-yl]methyl]phenyl]ethynyl]-3-oxidanylidene-7-(trifluoromethyl)-1H-isoindol-2-yl]-N-(1,3-thiazol-2-yl)ethanamide × 1 NO3 NITRATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；20% PEG Smear Medium, 0.1M MES, 0.15 ammonium nitrate, 5% ethylene glycol
|
分辨率 1.07 Å R-free 0.160 |
| 8A2A EGFR kinase domain in complex with 2-(6,7-dihydro-5H-pyrrolo[1,2-c]imidazol-1-yl)-2-[6-[2-[4-[[4-(hydroxymethyl)-1-piperidyl]methyl]phenyl]ethynyl]-1-oxo-4-(trifluoromethyl)isoindolin-2-yl]-N-thiazol-2-yl-acetamide (form 2) 提交 2022-06-03 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
700–1022（323 aa）
|
未记录 | KY9 (2R)-2-(6,7-dihydro-5H-pyrrolo[1,2-c]imidazol-1-yl)-2-[5-[2-[4-[[4-(hydroxymethyl)piperidin-1-yl]methyl]phenyl]ethynyl]-3-oxidanylidene-7-(trifluoromethyl)-1H-isoindol-2-yl]-N-(1,3-thiazol-2-yl)ethanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；25% PEG Smear Medium, 0.1 M sodium cacodylate, 0.2 M ammonium sulfate
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.223 |
| 8A2B EGFR kinase domain (L858R/V948R) in complex with 2-(6,7-dihydro-5H-pyrrolo[1,2-c]imidazol-1-yl)-2-[6-[2-[4-[[4-(hydroxymethyl)-1-piperidyl]methyl]phenyl]ethynyl]-1-oxo-4-(trifluoromethyl)isoindolin-2-yl]-N-thiazol-2-yl-acetamide 提交 2022-06-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
700–1022（323 aa）
|
突变：L858R, V948R | KY9 (2R)-2-(6,7-dihydro-5H-pyrrolo[1,2-c]imidazol-1-yl)-2-[5-[2-[4-[[4-(hydroxymethyl)piperidin-1-yl]methyl]phenyl]ethynyl]-3-oxidanylidene-7-(trifluoromethyl)-1H-isoindol-2-yl]-N-(1,3-thiazol-2-yl)ethanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；25% PEG Smear High, 0.1M Tris, 0.2M magnesium chloride, 10% glycerole
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.258 |
| 8A2D EGFR kinase domain (L858R/V948R) in complex with 2-[4-(difluoromethyl)-6-[2-[4-[[4-(hydroxymethyl)-1-piperidyl]methyl]phenyl]ethynyl]-7-methyl-indazol-2-yl]-2-spiro[6,7-dihydropyrrolo[1,2-c]imidazole-5,1'-cyclopropane]-1-yl-N-thiazol-2-yl-acetamide 提交 2022-06-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
700–1022（323 aa）
|
突变：L858R, V948R | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 KXY (2R)-2-[4-[bis(fluoranyl)methyl]-6-[2-[4-[[4-(hydroxymethyl)piperidin-1-yl]methyl]phenyl]ethynyl]-7-methyl-indazol-2-yl]-2-spiro[6,7-dihydropyrrolo[1,2-c]imidazole-5,1'-cyclopropane]-1-yl-N-(1,3-thiazol-2-yl)ethanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；20% PEG Smear High, 0.1M MES
|
分辨率 1.11 Å R-free 0.179 |
| 8D73 Crystal Structure of EGFR LRTM with compound 7 提交 2022-06-07 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, L858R, V948R | GOL GLYCEROL × 1 QCR (3S,4R)-3-fluoro-1-(4-{[4-(methylamino)-1-(propan-2-yl)pyrido[3,4-d]pyridazin-7-yl]amino}pyrimidin-2-yl)piperidin-4-ol × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；285 K；0.10 M sodium acetate, pH 5.8, 0.30 M potassium acetate, 15% glycerol, 9% PEG 8000
|
分辨率 2.17 Å R-free 0.285 |
| 8D73 Crystal Structure of EGFR LRTM with compound 7 提交 2022-06-07 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, L858R, V948R | GOL GLYCEROL × 1 QCR (3S,4R)-3-fluoro-1-(4-{[4-(methylamino)-1-(propan-2-yl)pyrido[3,4-d]pyridazin-7-yl]amino}pyrimidin-2-yl)piperidin-4-ol × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；285 K；0.10 M sodium acetate, pH 5.8, 0.30 M potassium acetate, 15% glycerol, 9% PEG 8000
|
分辨率 2.17 Å R-free 0.285 |
| 8D76 Crystal Structure of EGFR LRTM with compound 24 提交 2022-06-07 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 QFO (3S,4R)-3-fluoro-1-(4-{[8-{3-[(methanesulfonyl)methyl]azetidin-1-yl}-5-(propan-2-yl)-2,7-naphthyridin-3-yl]amino}pyrimidin-2-yl)-3-methylpiperidin-4-ol × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；285 K；0.1 M sodium acetate pH 5.3, 0.2 M potassium acetate, 3% PEG 8000.
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.260 |
| 8D76 Crystal Structure of EGFR LRTM with compound 24 提交 2022-06-07 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 QFO (3S,4R)-3-fluoro-1-(4-{[8-{3-[(methanesulfonyl)methyl]azetidin-1-yl}-5-(propan-2-yl)-2,7-naphthyridin-3-yl]amino}pyrimidin-2-yl)-3-methylpiperidin-4-ol × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；285 K；0.1 M sodium acetate pH 5.3, 0.2 M potassium acetate, 3% PEG 8000.
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.260 |
| 8DSW Crystal structure of EGFR kinase domain, Exon20 Insertion FQEA mutant 提交 2022-07-23 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
未记录 | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2M potassium fluoride
20 % PEG 3350
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.246 |
| 8EME EGFR(T790M/V948R) in complex with ZNL-0056 提交 2022-09-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：Kinase domain, residues 695-1022
链 B
695–1022（328 aa）
片段：Kinase domain, residues 695-1022
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | ZNL N-{7-methyl-1-[(3S)-1-(prop-2-enoyl)azepan-3-yl]-1H-benzimidazol-2-yl}-5-(prop-2-enamido)thiophene-3-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.7, 25-30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 3.32 Å R-free 0.318 |
| 8F1H EGFR kinase in complex with TAS6417 (CLN-081) 提交 2022-11-05 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
未记录 | X9H N-[(5P,8S,10R)-4-amino-6-methyl-5-(quinolin-3-yl)-8,9-dihydropyrimido[5,4-b]indolizin-8-yl]prop-2-enamide × 1 CIT CITRIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES pH=6.5, 1.1 M Sodium Citrate
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.212 |
| 8F1W EGFR(T790M/V948R) kinase in complex with poziotinib 提交 2022-11-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R | R2E 1-[4-[4-[[3,4-bis(chloranyl)-2-fluoranyl-phenyl]amino]-7-methoxy-quinazolin-6-yl]oxypiperidin-1-yl]propan-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.7, 25-30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.274 |
| 8F1W EGFR(T790M/V948R) kinase in complex with poziotinib 提交 2022-11-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R | R2E 1-[4-[4-[[3,4-bis(chloranyl)-2-fluoranyl-phenyl]amino]-7-methoxy-quinazolin-6-yl]oxypiperidin-1-yl]propan-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.7, 25-30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.274 |
| 8F1W EGFR(T790M/V948R) kinase in complex with poziotinib 提交 2022-11-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R | R2E 1-[4-[4-[[3,4-bis(chloranyl)-2-fluoranyl-phenyl]amino]-7-methoxy-quinazolin-6-yl]oxypiperidin-1-yl]propan-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.7, 25-30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.274 |
| 8F1W EGFR(T790M/V948R) kinase in complex with poziotinib 提交 2022-11-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R | R2E 1-[4-[4-[[3,4-bis(chloranyl)-2-fluoranyl-phenyl]amino]-7-methoxy-quinazolin-6-yl]oxypiperidin-1-yl]propan-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.7, 25-30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.274 |
| 8F1X EGFR kinase in complex with mobocertinib (TAK-788) 提交 2022-11-06 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
未记录 | R28 propan-2-yl 2-[[4-[2-(dimethylamino)ethyl-methyl-amino]-2-methoxy-5-(propanoylamino)phenyl]amino]-4-(1-methylindol-3-yl)pyrimidine-5-carboxylate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES pH=6.5, 1.1 M Sodium Citrate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.226 |
| 8F1Y EGFR kinase in complex with poziotinib 提交 2022-11-06 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
未记录 | R2E 1-[4-[4-[[3,4-bis(chloranyl)-2-fluoranyl-phenyl]amino]-7-methoxy-quinazolin-6-yl]oxypiperidin-1-yl]propan-1-one × 1 CIT CITRIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES pH=6.5, 1.1 M Sodium Citrate
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.228 |
| 8F1Z EGFR kinase in complex with Bayer #33 提交 2022-11-06 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
未记录 | X9B (2P)-3-(3-chloro-2-methoxyanilino)-2-[3-(2-methoxy-2-methylpropoxy)pyridin-4-yl]-1,5,6,7-tetrahydro-4H-pyrrolo[3,2-c]pyridin-4-one × 1 CIT CITRIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES pH 6.5, 1.1 M Sodium Citrate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.212 |
| 8FV3 EGFR(T790M/V948R) in complex with compound 1 (LN4503) 提交 2023-01-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
695–1022（328 aa）
链 D
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；Bis-Tris (100mM) at pH 5.5, 25% PEG3350, Water and TCEP (5mM)
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.226 |
| 8FV3 EGFR(T790M/V948R) in complex with compound 1 (LN4503) 提交 2023-01-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
695–1022（328 aa）
链 C
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 YA6 N-{(4P)-4-[(4P)-5-{3-[(8-fluoro-11-oxo-5,11-dihydro-10H-dibenzo[b,e][1,4]diazepin-10-yl)methyl]phenyl}-2-(methylsulfanyl)-1H-imidazol-4-yl]pyridin-2-yl}acetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；Bis-Tris (100mM) at pH 5.5, 25% PEG3350, Water and TCEP (5mM)
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.226 |
| 8FV4 EGFR(T790M/V948R) in complex with compound 2 (LN5993) 提交 2023-01-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
695–1022（328 aa）
链 D
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | YAA N-{(3P)-3-[(4P)-4-(2-acetamidopyridin-4-yl)-2-(methylsulfanyl)-1H-imidazol-5-yl]phenyl}-11-oxo-10,11-dihydro-5H-dibenzo[b,e][1,4]diazepine-9-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；298 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.7, 30% PEG 3350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.261 |
| 8FV4 EGFR(T790M/V948R) in complex with compound 2 (LN5993) 提交 2023-01-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
695–1022（328 aa）
链 C
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R 突变：T790M, V948R | MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；298 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.7, 30% PEG 3350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.261 |
| 8G63 Ralimetinib (LY2228820) in complex with wild type EGFR 提交 2023-02-14 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：kinase domain
|
未记录 | YXT ralimetinib × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；1.4 M Sodium Citrate, 0.1 M MES
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.257 |
| 8GB4 EGFR(T790M/V948R) kinase in complex with benzimidazole allosteric inhibitor 提交 2023-02-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R | MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 YW5 2-[(R)-(1H-benzimidazol-2-yl)(3-fluorophenyl)methyl]-6-[4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]-2,3-dihydro-1H-isoindol-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.254 |
| 8GB4 EGFR(T790M/V948R) kinase in complex with benzimidazole allosteric inhibitor 提交 2023-02-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R | MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 YW5 2-[(R)-(1H-benzimidazol-2-yl)(3-fluorophenyl)methyl]-6-[4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]-2,3-dihydro-1H-isoindol-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.254 |
| 8GB4 EGFR(T790M/V948R) kinase in complex with benzimidazole allosteric inhibitor 提交 2023-02-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R | MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 YW5 2-[(R)-(1H-benzimidazol-2-yl)(3-fluorophenyl)methyl]-6-[4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]-2,3-dihydro-1H-isoindol-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.254 |
| 8GB4 EGFR(T790M/V948R) kinase in complex with benzimidazole allosteric inhibitor 提交 2023-02-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R | MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 YW5 2-[(R)-(1H-benzimidazol-2-yl)(3-fluorophenyl)methyl]-6-[4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]-2,3-dihydro-1H-isoindol-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.254 |
| 8GK5 EGFR(T790M/V948R) kinase in complex with osimertinib and benzimidazole allosteric inhibitor 提交 2023-03-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R | Q6K ~{N}-[2-[2-(dimethylamino)ethyl-methyl-amino]-4-methoxy-5-[[4-(1-methylindol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino]phenyl]propanamide × 1 YW5 2-[(R)-(1H-benzimidazol-2-yl)(3-fluorophenyl)methyl]-6-[4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]-2,3-dihydro-1H-isoindol-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.7, 30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.252 |
| 8GK5 EGFR(T790M/V948R) kinase in complex with osimertinib and benzimidazole allosteric inhibitor 提交 2023-03-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R | Q6K ~{N}-[2-[2-(dimethylamino)ethyl-methyl-amino]-4-methoxy-5-[[4-(1-methylindol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino]phenyl]propanamide × 1 YW5 2-[(R)-(1H-benzimidazol-2-yl)(3-fluorophenyl)methyl]-6-[4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]-2,3-dihydro-1H-isoindol-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.7, 30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.252 |
| 8GK5 EGFR(T790M/V948R) kinase in complex with osimertinib and benzimidazole allosteric inhibitor 提交 2023-03-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R | Q6K ~{N}-[2-[2-(dimethylamino)ethyl-methyl-amino]-4-methoxy-5-[[4-(1-methylindol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino]phenyl]propanamide × 1 YW5 2-[(R)-(1H-benzimidazol-2-yl)(3-fluorophenyl)methyl]-6-[4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]-2,3-dihydro-1H-isoindol-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.7, 30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.252 |
| 8GK5 EGFR(T790M/V948R) kinase in complex with osimertinib and benzimidazole allosteric inhibitor 提交 2023-03-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, V948R | Q6K ~{N}-[2-[2-(dimethylamino)ethyl-methyl-amino]-4-methoxy-5-[[4-(1-methylindol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino]phenyl]propanamide × 1 YW5 2-[(R)-(1H-benzimidazol-2-yl)(3-fluorophenyl)methyl]-6-[4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]-2,3-dihydro-1H-isoindol-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.7, 30% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.252 |
| 8H7X Crystal structure of EGFR T790M/C797S mutant in complex with brigatinib 提交 2022-10-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
696–1022（327 aa）
链 B
696–1022（327 aa）
|
突变：T790M, C797S 突变：T790M, C797S | 6GY 5-chloro-N~4~-[2-(dimethylphosphoryl)phenyl]-N~2~-{2-methoxy-4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidin-1-yl]phenyl}pyrimidine-2,4-diamine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.2M sodium tartrate dibasic dihydrate, 22% PEG 3350
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.256 |
| 8HGO The EGF-bound EGFR/HER2 ectodomain complex 提交 2022-11-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–683（683 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；25mM Hepes, 150mM NaCl, 0.02%DDM-0.002%CHS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.31 Å |
| 8HGP The EREG-bound EGFR/HER2 ectodomain complex 提交 2022-11-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–683（683 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.53 Å |
| 8HGS The EGF-bound EGFR ectodomain homodimer 提交 2022-11-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–683（683 aa）
链 B
1–683（683 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.81 Å |
| 8HV1 Crystal structure of EGFR_DMX in complex with covalently bound fragment 1 提交 2022-12-26 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, L858R, E865A, E866A, K867A | PE5 3,6,9,12,15,18,21,24-OCTAOXAHEXACOSAN-1-OL × 1 N6N 3-(3-bromophenyl)-1,4-dihydro-1,2,4-triazole-5-thione × 1 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；0.1M TRIS pH 8.5, 0.15M Sodium citrate, 25%PEG400
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.219 |
| 8HV2 Crystal structure of EGFR_wt in complex with covalently bound fragment 4 提交 2022-12-26 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
694–1022（329 aa）
|
未记录 | MWU ~{N}-pyridin-2-ylprop-2-enamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；0.1M TRIS pH 7.0, 1.2M Sodium citrate
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.216 |
| 8HV3 Crystal structure of EGFR_DMX in complex with covalently bound fragment 4 提交 2022-12-26 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, L858R, E865A, E866A, K867A | PE5 3,6,9,12,15,18,21,24-OCTAOXAHEXACOSAN-1-OL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 MWU ~{N}-pyridin-2-ylprop-2-enamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；0.1M TRIS pH 8.5, 0.15M Sodium citrate, 25%PEG400
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.250 |
| 8HV4 Crystal structure of EGFR_TMX in complex with covalently bound fragment 4 提交 2022-12-26 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, C797S, L858R, E865A, E866A, K867A | PE5 3,6,9,12,15,18,21,24-OCTAOXAHEXACOSAN-1-OL × 1 MWU ~{N}-pyridin-2-ylprop-2-enamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；0.1M TRIS pH 8.5, 0.15M Sodium citrate, 25%PEG400
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.275 |
| 8HV5 Crystal structure of EGFR_DMX in complex with compound 7 提交 2022-12-26 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, L858R, E865A, E866A, K867A | PE5 3,6,9,12,15,18,21,24-OCTAOXAHEXACOSAN-1-OL × 1 N7C ~{N}-(1-methylbenzimidazol-4-yl)prop-2-enamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；0.1M TRIS pH 8.5, 0.15M Sodium citrate, 25%PEG400
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.224 |
| 8HV6 Crystal structure of EGFR_TMX in complex with covalently bound fragment 8 提交 2022-12-26 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, C797S, L858R, E865A, E866A, K867A | PE5 3,6,9,12,15,18,21,24-OCTAOXAHEXACOSAN-1-OL × 1 N86 ~{N}-quinolin-7-ylprop-2-enamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；0.1M TRIS pH 8.5, 0.15M Sodium citrate, 25%PEG400
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.296 |
| 8HV7 Crystal structure of EGFR_TMX in complex with covalently bound fragment 9 提交 2022-12-26 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, C797S, L858R, E865A, E866A, K867A | PE5 3,6,9,12,15,18,21,24-OCTAOXAHEXACOSAN-1-OL × 1 N8O ~{N}-[7-(dimethylamino)-2-methyl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]prop-2-enamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；0.1M TRIS pH 8.5, 0.15M Sodium citrate, 25%PEG400
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.290 |
| 8HV8 Crystal structure of EGFR_TMX in complex with covalently bound fragment 10 提交 2022-12-26 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, C797S, L858R, E865A, E866A, K867A | PE5 3,6,9,12,15,18,21,24-OCTAOXAHEXACOSAN-1-OL × 1 N99 ~{N}-pyrazolo[1,5-a]pyridin-2-ylprop-2-enamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；0.1M TRIS pH 8.5, 0.15M Sodium citrate, 25%PEG400
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.283 |
| 8HV9 Crystal structure of EGFR_TMX in complex with covalently bound fragment 12 提交 2022-12-26 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, C797S, L858R, E865A, E866A, K867A | PE5 3,6,9,12,15,18,21,24-OCTAOXAHEXACOSAN-1-OL × 1 N9L ~{N}-(4-phenylpyridin-2-yl)prop-2-enamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；0.1M TRIS pH 8.5, 0.15M Sodium citrate, 25%PEG400
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.274 |
| 8HVA Crystal structure of EGFR_TMX in complex with covalently bound compound 14 提交 2022-12-26 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | N9R ~{N}-[6-(1-methylindol-3-yl)pyrimidin-4-yl]prop-2-enamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1M TRIS pH 8.5, 0.15M Sodium citrate, 25%PEG400
|
分辨率 2.77 Å R-free 0.251 |
| 8HY7 EGFR kinase domain mutant "TMLR" with compound 28f 提交 2023-01-06 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：E865A,E866A,K867A | NSO ~{N}-[3-[[6-fluoranyl-2-[[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino]quinazolin-4-yl]amino]phenyl]prop-2-enamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES, pH 7.0, 10% (W/V) PEG 10000, 10%(V/V) Ethylene glycol
|
分辨率 2.91 Å R-free 0.251 |
| 8KFQ The crystal structure of EGFR(T797M/L858R) with small molecule inhibitor B6 提交 2023-08-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
697–1018（322 aa）
|
突变：T797M,L858R | SO4 SULFATE ION × 1 VUZ ~{N}-[3-[[6-chloranyl-2-[(1-ethylpyrazol-4-yl)amino]quinazolin-4-yl]amino]phenyl]prop-2-enamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M HEPES, pH 7.0, 10% (W/V) PEG10000, 10%(V/V) Ethylene glycol
|
分辨率 3.22 Å R-free 0.260 |
| 8PNZ Discovery and Optimisation of Potent, Efficacious and Selective Inhibitors Targeting EGFR Exon20 Insertion Mutations. Compound 16 bound to EGFR 提交 2023-07-03 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | 2I0 1-[(3~{S})-3-[4-(6,7-dimethoxyquinazolin-4-yl)-3-(3-methoxyphenyl)pyrazol-1-yl]pyrrolidin-1-yl]propan-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.68M Na3Cit pHed to pH 7.5 using conc HCl
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.284 |
| 8PO0 Discovery and Optimisation of Potent, Efficacious and Selective Inhibitors Targeting EGFR Exon20 Insertion Mutations. Compound 12 bound to EGFRinsNPG 提交 2023-07-03 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | 2I6 1-[3-[7-methoxy-4-[3-(3-methoxyphenyl)-1~{H}-pyrazol-4-yl]quinazolin-6-yl]oxyazetidin-1-yl]propan-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；Sodium Citrate
|
分辨率 2.52 Å R-free 0.376 |
| 8PO1 Discovery and Optimisation of Potent, Efficacious and Selective Inhibitors Targeting EGFR Exon20 Insertion Mutations. Compound 22 bound to EGFRinsNPG [V948R] 提交 2023-07-03 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | 2EI 2-methyl-5-[[3-[1-[(3~{S},5~{R})-5-methyl-1-propanoyl-pyrrolidin-3-yl]-4-pyridin-4-yl-pyrazol-3-yl]phenoxy]methyl]-3~{H}-isoindol-1-one × 1 IOD IODIDE ION × 20 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；PEG 8K 10%w/v pH 0, NH4I 0.2M pH 0, PCPT 0.1M pH 7.5
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.275 |
| 8PO2 Discovery and Optimisation of Potent, Efficacious and Selective Inhibitors Targeting EGFR Exon20 Insertion Mutations. Compound 33 bound to EGFRinsNPG [V948R] 提交 2023-07-03 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | 26X 1-cyclopropyl-~{N}-[3-[1-(1-propanoylazetidin-3-yl)-4-pyridin-4-yl-pyrazol-3-yl]phenyl]imidazole-4-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；PEG 8K 15%w/v pH 0, PCPT 0.1M pH 8.5
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.246 |
| 8PO2 Discovery and Optimisation of Potent, Efficacious and Selective Inhibitors Targeting EGFR Exon20 Insertion Mutations. Compound 33 bound to EGFRinsNPG [V948R] 提交 2023-07-03 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
|
未记录 | 26X 1-cyclopropyl-~{N}-[3-[1-(1-propanoylazetidin-3-yl)-4-pyridin-4-yl-pyrazol-3-yl]phenyl]imidazole-4-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；PEG 8K 15%w/v pH 0, PCPT 0.1M pH 8.5
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.246 |
| 8PO2 Discovery and Optimisation of Potent, Efficacious and Selective Inhibitors Targeting EGFR Exon20 Insertion Mutations. Compound 33 bound to EGFRinsNPG [V948R] 提交 2023-07-03 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
695–1022（328 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；PEG 8K 15%w/v pH 0, PCPT 0.1M pH 8.5
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.246 |
| 8PO3 Discovery and Optimisation of Potent, Efficacious and Selective Inhibitors Targeting EGFR Exon20 Insertion Mutations. Compound 18 bound to EGFR[V948R] 提交 2023-07-03 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | 2II 2-methyl-5-[[3-[1-[(3~{S})-1-propanoylpyrrolidin-3-yl]-4-pyridin-4-yl-pyrazol-3-yl]phenoxy]methyl]-3~{H}-isoindol-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；PEG 8K 12%w/v pH 0, PCPT 0.1M pH 5.5
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.269 |
| 8PO4 Discovery and Optimisation of Potent, Efficacious and Selective Inhibitors Targeting EGFR Exon20 Insertion Mutations. Compound 33 bound to EGFR[V948R] 提交 2023-07-03 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | 26X 1-cyclopropyl-~{N}-[3-[1-(1-propanoylazetidin-3-yl)-4-pyridin-4-yl-pyrazol-3-yl]phenyl]imidazole-4-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；PEG8k
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.243 |
| 8PO4 Discovery and Optimisation of Potent, Efficacious and Selective Inhibitors Targeting EGFR Exon20 Insertion Mutations. Compound 33 bound to EGFR[V948R] 提交 2023-07-03 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；PEG8k
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.243 |
| 8S1M Crystal structure of human GABARAP fused to EGFR (1076-1099) 提交 2024-02-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1076–1099（24 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.17 M ammonium acetate
0.085 M sodium citrate
25.5% PEG 4000
15% Glycerol
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.230 |
| 8SC7 Structure of EGFR in complex with MTX-531 提交 2023-04-05 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 D0D N-[(5P)-2-chloro-5-(4-{[(1R)-1-phenylethyl]amino}quinazolin-6-yl)pyridin-3-yl]methanesulfonamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；285 K；1.05 M Sodium Succinate pH 7.0, 0.1 M HEPES-NaOH pH 6.7
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.216 |
| 8TJL EGFR kinase in complex with pyrazolopyrimidine covalent inhibitor 提交 2023-07-22 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
片段：kinase domain
|
未记录 | HZ6 1-{3-[(4-amino-1-tert-butyl-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-yl)oxy]azetidin-1-yl}propan-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES pH 6.5, 0.8 M sodium citrate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.232 |
| 8TO3 EGFR(T790M/V948R) in complex with LN5461 提交 2023-08-02 | 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；Bis-Tris (100mM), 25% PEG-3350 and TCEP (5mM)
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.269 |
| 8TO3 EGFR(T790M/V948R) in complex with LN5461 提交 2023-08-02 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | IXC 3-hydroxy-N-{(3P)-3-[(4P)-2-(methylsulfanyl)-5-{2-[4-(piperazin-1-yl)anilino]pyridin-4-yl}-1H-imidazol-4-yl]phenyl}-2-[(1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)methyl]benzamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；Bis-Tris (100mM), 25% PEG-3350 and TCEP (5mM)
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.269 |
| 8TO3 EGFR(T790M/V948R) in complex with LN5461 提交 2023-08-02 | 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；Bis-Tris (100mM), 25% PEG-3350 and TCEP (5mM)
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.269 |
| 8TO3 EGFR(T790M/V948R) in complex with LN5461 提交 2023-08-02 | 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
695–1022（328 aa）
|
突变：T790M, V948R | MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；Bis-Tris (100mM), 25% PEG-3350 and TCEP (5mM)
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.269 |
| 8TO4 EGFR(T790M/V948R) in complex with the allosteric inhibitor FRF-06-057 提交 2023-08-02 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
695–1022（328 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 IXR (2R)-2-(1,3-dioxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)-2-phenyl-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；25% PEG-3350, Bis-Tris 0.1 M
|
分辨率 2.99 Å R-free 0.231 |
| 8TO4 EGFR(T790M/V948R) in complex with the allosteric inhibitor FRF-06-057 提交 2023-08-02 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；25% PEG-3350, Bis-Tris 0.1 M
|
分辨率 2.99 Å R-free 0.231 |
| 8TO4 EGFR(T790M/V948R) in complex with the allosteric inhibitor FRF-06-057 提交 2023-08-02 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；25% PEG-3350, Bis-Tris 0.1 M
|
分辨率 2.99 Å R-free 0.231 |
| 8TO4 EGFR(T790M/V948R) in complex with the allosteric inhibitor FRF-06-057 提交 2023-08-02 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
695–1022（328 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 IXR (2R)-2-(1,3-dioxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)-2-phenyl-N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；25% PEG-3350, Bis-Tris 0.1 M
|
分辨率 2.99 Å R-free 0.231 |
| 8UKV Crystal structure of nanobody/VHH domain of 34E5 in complex with the extracellular region of the epidermal growth factor variant III (EGFRvIII) 提交 2023-10-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
25–30（6 aa）
链 A
298–642（345 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；70-90 micromolar protein, 15-20% PEG 3350, 100 mM ammonium phosphate, pH 7.4, +20% PEG400 for cryo
|
分辨率 2.94 Å R-free 0.252 |
| 8UKV Crystal structure of nanobody/VHH domain of 34E5 in complex with the extracellular region of the epidermal growth factor variant III (EGFRvIII) 提交 2023-10-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
25–30（6 aa）
链 B
298–642（345 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；70-90 micromolar protein, 15-20% PEG 3350, 100 mM ammonium phosphate, pH 7.4, +20% PEG400 for cryo
|
分辨率 2.94 Å R-free 0.252 |
| 8UKW Crystal structure the extracellular region of the epidermal growth factor receptor variant III (EGFRvIII) at pH 5.0 提交 2023-10-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
25–30（6 aa）
链 A
298–642（345 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；7 mg/ml protein, 27.5% PEG 3350, 50 mM Na Citrate pH 5.0
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.244 |
| 8UKW Crystal structure the extracellular region of the epidermal growth factor receptor variant III (EGFRvIII) at pH 5.0 提交 2023-10-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
25–30（6 aa）
链 B
298–642（345 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；7 mg/ml protein, 27.5% PEG 3350, 50 mM Na Citrate pH 5.0
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.244 |
| 8UKX Crystal structure the extracellular region of the epidermal growth factor receptor variant III (EGFRvIII) at pH 7.0 提交 2023-10-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
25–30（6 aa）
链 A
298–642（345 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；7mg/ml protein, 27.5% PEG 3350, 5% glycerol, 100 mM HEPES, pH 7.0, +5% glycerol for cryo
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.320 |
| 8WD4 EGFR(L858R/T790/C797S) in complex with compound 5j 提交 2023-09-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
突变：L858R,T790M,C797S | W7W ~{N}-[3,3-bis(fluoranyl)propyl]-4-[[(2~{S})-butan-2-yl]amino]-6-[[2-(1-cyclopropylsulfonylpyrazol-4-yl)pyrimidin-4-yl]amino]pyridine-3-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；297 K；0.46 M Trisodium citrate, pH 7.0
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.230 |
| 9BY4 Co-crystal structure of the kinase domain of EGFR with non-covalent osimertinib 提交 2024-05-23 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
未记录 | PDO 1,3-PROPANDIOL × 3 Q6K ~{N}-[2-[2-(dimethylamino)ethyl-methyl-amino]-4-methoxy-5-[[4-(1-methylindol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino]phenyl]propanamide × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；289.15 K；100 mM MES, pH 6.0, 0.8 M sodium citrate
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.220 |
| 9BY6 Crystal structure of the kinase domain of EGFR soaked with non-covalent osimertinib 提交 2024-05-23 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
未记录 | PDO 1,3-PROPANDIOL × 1 Q6K ~{N}-[2-[2-(dimethylamino)ethyl-methyl-amino]-4-methoxy-5-[[4-(1-methylindol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino]phenyl]propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；285.15 K；100 mM HEPES, pH 7.0, 0.6-0.9 Na-K tartrate
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.245 |
| 9D3V CRYSTAL STRUCTURE OF EGFR(L858R/T790M/C797S) IN COMPLEX WITH AUR-3418 提交 2024-08-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, C797S, L858R, E865A, E866A, K867A | A1A5V (4S)-N-[2-(4-methoxypiperidin-1-yl)pyrimidin-4-yl]-2-methyl-1-(propan-2-yl)-1H-imidazo[1,2-b]pyrazol-6-amine × 1 CL CHLORIDE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.7；294 K；0.96 M SUCCINIC ACID, 1.0 %(W/V) POLYETHYLENE GLYCOL MONOMETHYL ETHER 2000, 0.1 M HEPES
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.329 |
| 9D3W CRYSTAL STRUCTURE OF EGFR(L858R/T790M/C797S) IN COMPLEX WITH AUR-8250 提交 2024-08-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：kinase domain
|
突变：T790M, C797S, L858R, E865A, E866A, K867A | A1A5L (4S)-1-(1,4-dioxaspiro[4.5]decan-8-yl)-N-{2-[(3S,4R)-3-fluoro-4-methoxypiperidin-1-yl]pyrimidin-4-yl}-2-methyl-1H-imidazo[1,2-b]pyrazol-6-amine × 1 CL CHLORIDE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.7；294 K；0.96 M SUCCINIC ACID, 1.0 %(W/V) POLYETHYLENE GLYCOL MONOMETHYL ETHER 2000, 0.1 M HEPES
|
分辨率 2.53 Å R-free 0.310 |
| 9DF2 EGFR Exon20 insertion mutant ASV bound with (S)-3-((3-chloro-2-methoxyphenyl)amino)-2-(3-((tetrahydrofuran-2-yl)methoxy)pyridin-4-yl)-1,5,6,7-tetrahydro-4H-pyrrolo[3,2-c]pyridin-4-one 提交 2024-08-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
突变：V951R | A1IMS 3-[(3-chloranyl-2-methoxy-phenyl)amino]-2-[3-[[(2S)-oxolan-2-yl]methoxy]pyridin-4-yl]-1,5,6,7-tetrahydropyrrolo[3,2-c]pyridin-4-one × 1 CL CHLORIDE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 GOL GLYCEROL × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；0.8 microliters 5 mg/mL ASV protein mixed 1:1 with 100mM MES pH 6.4, 200 mM MgCl2, 14% w/v PEG 4000. 0.2 microliters of 1M sodium fluoride then added to drop
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.245 |
| 9DF3 EGFR Exon20 insertion mutant SVD bound with (S)-3-((3-chloro-2-methoxyphenyl)amino)-2-(3-((tetrahydrofuran-2-yl)methoxy)pyridin-4-yl)-1,5,6,7-tetrahydro-4H-pyrrolo[3,2-c]pyridin-4-one 提交 2024-08-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
突变：V951R | A1IMS 3-[(3-chloranyl-2-methoxy-phenyl)amino]-2-[3-[[(2S)-oxolan-2-yl]methoxy]pyridin-4-yl]-1,5,6,7-tetrahydropyrrolo[3,2-c]pyridin-4-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 GOL GLYCEROL × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；291 K；0.8 microliters 7.7 mg/mL protein mixed 1:1 with 100mM MES pH 6.2, 600 mM NaCl, 14% w/v PEG 4000. 0.2 microliters of 100 mM spermidine added to drop
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.200 |
| 9DF4 EGFR Exon20 insertion mutant SVD bound with STX-721 提交 2024-08-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
突变：V951R | A1A4E (2P)-3-(3-chloro-2-methoxyanilino)-2-[3-({(2R)-1-[(2E)-4-(dimethylamino)but-2-enoyl]-2-methylpyrrolidin-2-yl}ethynyl)pyridin-4-yl]-1,5,6,7-tetrahydro-4H-pyrrolo[3,2-c]pyridin-4-one × 1 CL CHLORIDE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 GOL GLYCEROL × 10 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；291 K；0.8 microliters of 5.9 mg/mL was mixed 1:1 with 600 mM NaCl, 100 mM MES pH 6.2, and 16%W/V PEG4000. 0.2 microliters of a 10 mM Taurine solution was then added to the drop
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.198 |
| 9DM8 EGFR wildtype in complex with BI-8128 提交 2024-09-12 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：kinase domain
|
未记录 | A1A6K (6M)-1-{2-[4-(2-methoxyethyl)piperazin-1-yl]-1-methyl-4-[(1S,4R)-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptan-5-yl]-1H-imidazo[4,5-c]pyridin-6-yl}-6-(4-methoxypyridin-3-yl)-4-methyl-1H-pyrazolo[4,3-c]pyridine × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M MES, pH 6.5, 1.0 M sodium citrate, 5.0 mM TCEP
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.214 |
| 9EWS Optimisation of Potent, Efficacious, Selective and Blood-Brain Barrier Penetrating Inhibitors Targeting EGFR Exon20 Insertion Mutations 提交 2024-04-04 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | A1H7N 1-[3-pyridin-4-yl-2-[3-(2-pyrimidin-2-ylethynyl)phenyl]-4,6-dihydropyrrolo[3,4-d]imidazol-5-yl]propan-1-one × 1 IOD IODIDE ION × 15 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；17 % PEG8000, 0.2 M NH4I, 0.1 M PCTP pH 7.5
|
分辨率 2.44 Å R-free 0.326 |
| 9EWT Optimisation of Potent, Efficacious, Selective and Blood-Brain Barrier Penetrating Inhibitors Targeting EGFR Exon20 Insertion Mutations 提交 2024-04-04 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | A1H7O 1-[2-[3-[(E)-2-(5-cyclopropyl-1,3-oxazol-2-yl)ethenyl]phenyl]-3-pyridin-4-yl-4,6-dihydropyrrolo[3,4-d]imidazol-5-yl]propan-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 8K 20%w/v, MPD 5%v/v, PCPT 0.1M pH 7.5
|
分辨率 3.02 Å R-free 0.342 |
| 9EWT Optimisation of Potent, Efficacious, Selective and Blood-Brain Barrier Penetrating Inhibitors Targeting EGFR Exon20 Insertion Mutations 提交 2024-04-04 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
|
未记录 | A1H7O 1-[2-[3-[(E)-2-(5-cyclopropyl-1,3-oxazol-2-yl)ethenyl]phenyl]-3-pyridin-4-yl-4,6-dihydropyrrolo[3,4-d]imidazol-5-yl]propan-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 8K 20%w/v, MPD 5%v/v, PCPT 0.1M pH 7.5
|
分辨率 3.02 Å R-free 0.342 |
| 9FQP EGFR Exon20 insertion mutant NPG bound with Compound 23 提交 2024-06-17 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：V948R D770_N771insNPG | A1IEZ (7~{S})-3-[(3-chloranyl-2-methoxy-phenyl)amino]-2-(3-fluoranylpyridin-4-yl)-7-(2-methoxyethyl)-1,5,6,7-tetrahydropyrrolo[3,2-c]pyridin-4-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.9；293 K；0.3 M Sodium Chloride, 50 mM TRIS-HCl pH 7.9, 9% v/v PEG 400
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.275 |
| 9FQS EGFR Exon20 insertion mutant NPG bound with Compound 39 提交 2024-06-17 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：V948R D770_N771insNPG | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 A1IE0 3-[(3-fluoranyl-2-methoxy-phenyl)amino]-2-[3-[2-[(2R)-1-propanoylpyrrolidin-2-yl]ethynyl]pyridin-4-yl]-1,5,6,7-tetrahydropyrrolo[3,2-c]pyridin-4-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 100 mM HEPES-NaOH pH 6.8, 20% v/v PEG 5000 MME
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.237 |
| 9FRD Wildtype EGFR bound with Compound 23 提交 2024-06-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
未记录 | DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1 A1IEZ (7~{S})-3-[(3-chloranyl-2-methoxy-phenyl)amino]-2-(3-fluoranylpyridin-4-yl)-7-(2-methoxyethyl)-1,5,6,7-tetrahydropyrrolo[3,2-c]pyridin-4-one × 1 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；sodium tartrate,
sodium acetate,
ammonium chloride
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.197 |
| 9FZR Wild-type EGFR in covalent complex with Poziotinib analogue 提交 2024-07-05 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
未记录 | A1IHC 1-[(3~{S})-3-[4-[(3-chloranyl-4-fluoranyl-phenyl)amino]-7-methoxy-quinazolin-6-yl]oxypyrrolidin-1-yl]propan-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；25mM TRIS-HCL pH8.0, 150mM NaCl, 5% Glycerol, 1mM TCEP, 100mM HEPES pH 7.4, 40% PEG400
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.233 |
| 9FZS Wild-type EGFR in complex with non-covalent poziotinib analogue 提交 2024-07-05 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
未记录 | A1IHD 1-[(3~{R})-3-[4-[(3-chloranyl-4-fluoranyl-phenyl)amino]-7-methoxy-quinazolin-6-yl]oxypyrrolidin-1-yl]prop-2-en-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；25mM TRIS-HCL pH8.0, 150mM NaCl, 5% Glycerol, 1mM TCEP, 100mM HEPES pH 7.4, 40% PEG400
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.237 |
| 9GC4 Highly optimized CNS penetrant inhibitors of EGFR Exon20 Insertion Mutations 提交 2024-08-01 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | A1IZ7 1-[2-[3-(3-chloranyl-6-fluoranyl-pyridin-2-yl)oxyphenyl]-3-pyrimidin-4-yl-4,6-dihydropyrrolo[3,4-d]imidazol-5-yl]propan-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；alcohols 10%, MB1 0.1M pH 6.5, EDO_P8K 30%w/v (morpheus screen D2)
|
分辨率 2.42 Å R-free 0.248 |
| 9GC4 Highly optimized CNS penetrant inhibitors of EGFR Exon20 Insertion Mutations 提交 2024-08-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
695–1022（328 aa）
链 D
695–1022（328 aa）
|
未记录 | A1IZ7 1-[2-[3-(3-chloranyl-6-fluoranyl-pyridin-2-yl)oxyphenyl]-3-pyrimidin-4-yl-4,6-dihydropyrrolo[3,4-d]imidazol-5-yl]propan-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；alcohols 10%, MB1 0.1M pH 6.5, EDO_P8K 30%w/v (morpheus screen D2)
|
分辨率 2.42 Å R-free 0.248 |
| 9GC5 Highly optimized CNS penetrant inhibitors of EGFR Exon20 Insertion Mutations 提交 2024-08-01 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | A1IZ8 1-[2-[5-(1,3-benzoxazol-4-yl)-2,4-bis(fluoranyl)phenyl]-3-pyrimidin-4-yl-4,6-dihydropyrrolo[3,4-d]imidazol-5-yl]propan-1-one × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 8K 12%w/v, LiSO4 0.5M
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.261 |
| 9GC5 Highly optimized CNS penetrant inhibitors of EGFR Exon20 Insertion Mutations 提交 2024-08-01 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
|
未记录 | A1IZ8 1-[2-[5-(1,3-benzoxazol-4-yl)-2,4-bis(fluoranyl)phenyl]-3-pyrimidin-4-yl-4,6-dihydropyrrolo[3,4-d]imidazol-5-yl]propan-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 8K 12%w/v, LiSO4 0.5M
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.261 |
| 9GC6 Highly optimized CNS penetrant inhibitors of EGFR Exon20 Insertion Mutations 提交 2024-08-01 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | A1IZ9 1-[2-[5-fluoranyl-4-(2-fluorophenyl)pyridin-2-yl]-3-pyrimidin-4-yl-4,6-dihydropyrrolo[3,4-d]imidazol-5-yl]propan-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Peg 8K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.323 |
| 9GC6 Highly optimized CNS penetrant inhibitors of EGFR Exon20 Insertion Mutations 提交 2024-08-01 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
|
未记录 | A1IZ9 1-[2-[5-fluoranyl-4-(2-fluorophenyl)pyridin-2-yl]-3-pyrimidin-4-yl-4,6-dihydropyrrolo[3,4-d]imidazol-5-yl]propan-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Peg 8K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.323 |
| 9GDV Highly optimized CNS penetrant inhibitors of EGFR Exon20 Insertion Mutations 提交 2024-08-06 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | Q6K ~{N}-[2-[2-(dimethylamino)ethyl-methyl-amino]-4-methoxy-5-[[4-(1-methylindol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino]phenyl]propanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；PEG 4K 25%w/v, (NH4)2SO4 0.2M, Na Acet 0.1M pH 4.6 TEV protease carboxypeptidase
|
分辨率 2.22 Å R-free 0.293 |
| 9GDV Highly optimized CNS penetrant inhibitors of EGFR Exon20 Insertion Mutations 提交 2024-08-06 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
|
未记录 | Q6K ~{N}-[2-[2-(dimethylamino)ethyl-methyl-amino]-4-methoxy-5-[[4-(1-methylindol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino]phenyl]propanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；PEG 4K 25%w/v, (NH4)2SO4 0.2M, Na Acet 0.1M pH 4.6 TEV protease carboxypeptidase
|
分辨率 2.22 Å R-free 0.293 |
| 9GHR Crystal Structure of EGFR-WT in Complex with Covalent Compound 10n 提交 2024-08-16 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | A1ILN (~{N}~{E})-2-isoquinolin-4-yl-~{N}-[3-[(3~{R})-1-propanoylazepan-3-yl]-1~{H}-benzimidazol-2-ylidene]pyridine-4-carboxamide × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.4 K-Na-tartrate, 100 mM Na-MES (pH 7.0),
5.7 mg/mL EGFR-WT (im 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0, 1 ul reservoir + 1 ul solution)
Soaking-Experiment
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.202 |
| 9GHS Crystal Structure of EGFR-WT in Complex with Covalent Compound 10a 提交 2024-08-16 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | A1ILJ (~{N}~{E})-2-(1-methylpyrazol-4-yl)-~{N}-[3-[(3~{R})-1-propanoylazepan-3-yl]-1~{H}-benzimidazol-2-ylidene]pyridine-4-carboxamide × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.6 K-Na-tartrate, 100 mM Na-MES (pH 6.5),
5.5 mg/mL EGFR-WT (im 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0, 1 ul reservoir + 1 ul solution)
Soaking-Experiment
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.208 |
| 9GHT Crystal Structure of EGFR-WT in Complex with BI-4020 提交 2024-08-16 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | XA4 (20R)-10,15,20-trimethyl-2-[(4-methylpiperazin-1-yl)methyl]-18,19,20,21-tetrahydro-15H,17H-12,8-(metheno)pyrazolo[3',4':2,3][1,5,10,12]oxatriazacycloheptadecino[12,11-a]benzimidazol-7(6H)-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.5 K-Na-tartrate, 100 mM Na-MES (pH 7.0),
4.3 mg/mL EGFR-WT (im 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0, 1 ul reservoir + 1 ul solution)
Soaking-Experiment
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.237 |
| 9GHU Crystal Structure of EGFR-WT in Complex with Covalent Compound 10f 提交 2024-08-16 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | A1ILK (~{N}~{E})-2-(1,3-dimethylpyrazol-4-yl)-~{N}-[3-[(3~{R})-1-propanoylazepan-3-yl]-1~{H}-benzimidazol-2-ylidene]pyridine-4-carboxamide × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.4 K-Na-tartrate, 100 mM Na-MES (pH 7.0),
4.5 mg/mL EGFR-WT (im 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0, 1 ul reservoir + 1 ul solution)
Soaking-Experiment
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.218 |
| 9GHV Crystal Structure of EGFR-WT in Complex with Covalent Compound 13 提交 2024-08-16 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
未记录 | A1ILI 2-[[2-(1-methylpyrazol-4-yl)pyridin-4-yl]carbonylamino]-1-[(3~{R})-1-propanoylazepan-3-yl]-~{N}-prop-2-ynyl-benzimidazole-5-carboxamide × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.3 K-Na-tartrate, 100 mM Na-MES (pH 7.5),
5.6 mg/mL EGFR-WT (im 100 mM NaCl, 25 mM Tris-HCl, 10 % glycerol, 1 mM TCEP, pH 8.0, 1 ul reservoir + 1 ul solution)
Soaking-Experiment
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.213 |
| 9GI9 Wildtype EGFR bound with (R)-3-((3-chloro-2-methoxyphenyl)amino)-2-(3-((tetrahydrofuran-2-yl)methoxy)pyridin-4-yl)-1,5,6,7-tetrahydro-4H-pyrrolo[3,2-c]pyridin-4-one 提交 2024-08-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：>#FRAGMENT#<
|
未记录 | A1ILZ 3-[(3-chloranyl-2-methoxy-phenyl)amino]-2-[3-[[(2~{R})-oxolan-2-yl]methoxy]pyridin-4-yl]-1,5,6,7-tetrahydropyrrolo[3,2-c]pyridin-4-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；sodium tartrate,
sodium acetate,
ammonium chloride
|
分辨率 3.12 Å R-free 0.248 |
| 9GL7 EGFR Exon20 insertion mutant NPG bound with (S)-3-((3-chloro-2-methoxyphenyl)amino)-2-(3-((tetrahydrofuran-2-yl)methoxy)pyridin-4-yl)-1,5,6,7-tetrahydro-4H-pyrrolo[3,2-c]pyridin-4-one 提交 2024-08-27 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：V948R | A1IMS 3-[(3-chloranyl-2-methoxy-phenyl)amino]-2-[3-[[(2S)-oxolan-2-yl]methoxy]pyridin-4-yl]-1,5,6,7-tetrahydropyrrolo[3,2-c]pyridin-4-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M Magnesium Chloride, 0.1 M TRIS-HCl pH 8.5, 20% w/v PEG 4000
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.287 |
| 9GL8 EGFR Exon20 insertion mutant NPG bound with STX-721 提交 2024-08-27 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：V948R | NA SODIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 A1IMT (2R,3S)-3-[(3-chloranyl-2-methoxy-phenyl)amino]-2-[3-[2-[(2R)-1-[(E)-4-(dimethylamino)but-2-enoyl]-2-methyl-pyrrolidin-2-yl]ethynyl]pyridin-4-yl]-1,2,3,5,6,7-hexahydropyrrolo[3,2-c]pyridin-4-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M Potassium Chloride, 0.1 Magnesium Acetate, 0.05 M MES-NaOH pH 6.5, 10% w/v PEG 8000
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.224 |
| 9GL9 Wild-type EGFR bound with STX-721 提交 2024-08-27 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 A1IMT (2R,3S)-3-[(3-chloranyl-2-methoxy-phenyl)amino]-2-[3-[2-[(2R)-1-[(E)-4-(dimethylamino)but-2-enoyl]-2-methyl-pyrrolidin-2-yl]ethynyl]pyridin-4-yl]-1,2,3,5,6,7-hexahydropyrrolo[3,2-c]pyridin-4-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M HEPES-NaOH pH 6.9, 0.98 M Sodium Succinate pH 7.0, 5 mM TCEP
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.213 |
| 9H42 EGFR wild type incomplex with 26007 提交 2024-10-17 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
未记录 | A1IR8 2-[[4-[2-(dimethylamino)ethyl-methyl-amino]phenyl]amino]-5-ethyl-8-phenyl-pyrido[2,3-d]pyrimidin-7-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；293 K；25 mM HEPES pH 8, 150 mM NaCl, 10 % glycerol, 1 mM DTT 85mM Tris pH 7.6, 140 mM acetate, 23.5 % Polyethylene glycol 4,000, 18% glycerol
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.245 |
| 9H46 EGFR wild type in complex with 25328 提交 2024-10-17 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
未记录 | A1ISA 5-ethyl-2-[(2-methoxyphenyl)amino]-8-phenyl-pyrido[2,3-d]pyrimidin-7-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；293 K；25 mM HEPES pH 8, 150 mM NaCl, 10 % glycerol, 1 mM DTT 85mM Tris pH 7.6, 140 mM acetate, 23.5 % Polyethylene glycol 4,000, 18% glycerol
|
分辨率 3.16 Å R-free 0.256 |
| 9H47 EGFR wild type in complex with 26313 提交 2024-10-17 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
未记录 | A1IR9 2-[[4-[2-(dimethylamino)ethyl-methyl-amino]phenyl]amino]-8-phenyl-pyrido[2,3-d]pyrimidin-7-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；273 K；25 mM HEPES pH 8, 150 mM NaCl, 10 % glycerol, 1 mM DTT 85mM Tris pH 7.6, 140 mM acetate, 23.5 % Polyethylene glycol 4,000, 18% glycerol
|
分辨率 2.99 Å R-free 0.244 |
| 9HBO Highly optimized CNS penetrant inhibitors of EGFR Exon20 Insertion Mutations. Compound 51 bound to EGFRinsNPG [V948R] 提交 2024-11-07 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
695–1022（328 aa）
|
突变：V948R | A1IUK 1-[2-[5-[1-[bis(fluoranyl)methyl]-5-methyl-pyrazol-4-yl]-2,4-bis(fluoranyl)phenyl]-3-pyrimidin-4-yl-4,6-dihydropyrrolo[3,4-d]imidazol-5-yl]propan-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；PEG 8K 15%w/v , PCPT 0.1M pH 6.5
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.255 |
| 9HBO Highly optimized CNS penetrant inhibitors of EGFR Exon20 Insertion Mutations. Compound 51 bound to EGFRinsNPG [V948R] 提交 2024-11-07 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
695–1022（328 aa）
|
突变：V948R | A1IUK 1-[2-[5-[1-[bis(fluoranyl)methyl]-5-methyl-pyrazol-4-yl]-2,4-bis(fluoranyl)phenyl]-3-pyrimidin-4-yl-4,6-dihydropyrrolo[3,4-d]imidazol-5-yl]propan-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；PEG 8K 15%w/v , PCPT 0.1M pH 6.5
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.255 |
| 9IP7 Local refinement structure of sEGFR and 528 Fv (from HL-type bispecific diabody Ex3) complex 提交 2024-07-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
25–645（621 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.21 Å |
| 9IP8 Poly-alanine model for HL-type bispecific diabody Ex3 composed of 528 and OKT3 Fvs in ternary complex with sEGFR and CD3gamma-epsilon (closed conformation) 提交 2024-07-10 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
25–645（621 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.91 Å |
| 9IP9 Poly-alanine model for HL-type bispecific diabody Ex3 composed of 528 and OKT3 Fvs in ternary complex with sEGFR and CD3gamma-epsilon (middle conformation) 提交 2024-07-10 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
25–645（621 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.64 Å |
| 9IPA Poly-alanine model for HL-type bispecific diabody Ex3 composed of 528 and OKT3 Fvs in ternary complex with sEGFR and CD3gamma-epsilon (open conformation) 提交 2024-07-10 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
25–645（621 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.85 Å |
| 9IPB Local refinement structure of sEGFR and 528 Fv (from LH-type bispecific diabody Ex3) complex 提交 2024-07-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
25–645（621 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.93 Å |
| 9IPC Poly-alanine model for LH-type bispecific diabody Ex3 composed of 528 and OKT3 Fvs in ternary complex with sEGFR and CD3gamma-epsilon (closed conformation) 提交 2024-07-10 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
25–645（621 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9IPD Poly-alanine model for LH-type bispecific diabody Ex3 composed of 528 and OKT3 Fvs in ternary complex with sEGFR and CD3gamma-epsilon (middle conformation) 提交 2024-07-10 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
25–645（621 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.29 Å |
| 9IPE Poly-alanine model for LH-type bispecific diabody Ex3 composed of 528 and OKT3 Fvs in ternary complex with sEGFR and CD3gamma-epsilon (open conformation) 提交 2024-07-10 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
25–645（621 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.31 Å |
| 9JQ1 Crystal structure of EGFR T790M/C797S/L858R mutant in complex with 2,2-dichloro-N-(5-((5-chloro-4-((2-(dimethylphosphoryl)phenyl)amino)pyrimidin-2-yl)amino)-4-methoxy-2-(4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidin-1-yl)phenyl)acetamide 提交 2024-09-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
694–1020（327 aa）
|
突变：T790M/C797S/L858R | A1ECU 2,2-bis(chloranyl)-~{N}-[5-[[5-chloranyl-4-[(2-dimethylphosphorylphenyl)amino]pyrimidin-2-yl]amino]-4-methoxy-2-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidin-1-yl]phenyl]ethanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；289 K；1.35 M sodium citrate, 0.1 M CHES, pH 9.0
|
分辨率 3.02 Å R-free 0.274 |
| 9KL4 Crystal structure of EGFR complexed with N-[4-[4-amino-6-ethynyl-5-(3-quinolyl)pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl]norbornan-1-yl]pyrimidine-5-carboxamide 提交 2024-11-14 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
未记录 | A1L53 N-[4-[4-amino-6-ethynyl-5-(3-quinolyl)pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl]norbornan-1-yl]pyrimidine-5-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；1.2 M K/Na-tartrate, 0.1 M HEPES pH 7.0
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.238 |
| 9KLW Crystal structure of EGFR T790M, L858R mutant complexed with N-[4-[4-amino-6-ethynyl-5-(3-quinolyl)pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl]norbornan-1-yl]pyrimidine-5-carboxamide 提交 2024-11-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
突变：T790M, L858R | A1L53 N-[4-[4-amino-6-ethynyl-5-(3-quinolyl)pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl]norbornan-1-yl]pyrimidine-5-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.25；293 K；8.0% v/v ethylene glycol; 0.1 M HEPES pH 7.25; 10% w/v PEG 10K
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.257 |
| 9MSR BDTX-1535 in complex with WT EGFR 提交 2025-01-10 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：kinase domain
|
未记录 | A1BRC N-[4-(3-chloro-2-fluoroanilino)-7-{[(1S,5R)-3-methyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexan-1-yl]ethynyl}quinazolin-6-yl]-4-(morpholin-4-yl)butanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；1.0 M sodium citrate, 0.1 M MES, 5.0 mM TCEP
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.231 |
| 9MSS Limertinib in complex with WT EGFR 提交 2025-01-10 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：kinase domain (UNP residues 696-1022)
|
未记录 | A1BYO Limertinib. bound form × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；1.0 M sodium citrate, 0.1 MES, 5.0 mM TCEP
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.237 |
| 9MST Befotertinib in complex with WT EGFR 提交 2025-01-10 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：kinase domain (UNP residues 696-1022)
|
未记录 | A1BYN Befotertinib, bound form × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；1.0 M sodium citrate, 0.1 M MES, 5 mM TCEP
|
分辨率 2.57 Å R-free 0.258 |
| 9NGP EGFR wildtype in complex with BI-4732 提交 2025-02-22 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：kinase domain
|
未记录 | A1BX7 (6M)-1-{2-[(5S,8aR)-hexahydropyrrolo[1,2-a]pyrazin-2(1H)-yl]-1-methyl-4-[(1R,4R)-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptan-5-yl]-1H-imidazo[4,5-c]pyridin-6-yl}-6-(4-methoxypyridin-3-yl)-4-methyl-1H-pyrazolo[4,3-c]pyridine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 MES, 1.0 M sodium citrate, 0.5 mM TCEP
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.238 |
| 9NHW Oritinib in complex with WT EGFR 提交 2025-02-25 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：kinase domain (UNP residues 696-1022)
|
未记录 | A1BYD Oritinib, bound form × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 MES, 1.0 sodium citrate, 0.5 mM TCEP
|
分辨率 2.73 Å R-free 0.268 |
| 9NIS Alflutinib in complex with WT EGFR 提交 2025-02-26 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：kinase domain (UNP residues 696-1022)
|
未记录 | A1BYK Alflutinib, bound form × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M MES, 1.0 M sodium citrate, 0.5 mM TCEP
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.262 |
| 9NJ7 Almonertinib in complex with WT EGFR 提交 2025-02-26 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：kinase domain (UNP residues 696-1022)
|
未记录 | A1BYL Almonertinib, bound form × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 mM MES, 1.0 M sodium citrate, 5 mM TCEP
|
分辨率 2.53 Å R-free 0.281 |
| 9NJN YK-029a in complex with WT EGFR 提交 2025-02-27 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：kinase domain (UNP residues 696-1022)
|
未记录 | A1BYS N-[2-{[2-(dimethylamino)ethyl](methyl)amino}-4-methoxy-5-({(4M)-4-[(4S)-8-methylimidazo[1,2-a]pyridin-3-yl]pyrimidin-2-yl}amino)phenyl]propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 mM MES, 1.0 M sodium citrate, 0.5 mM TCEP
|
分辨率 2.24 Å R-free 0.275 |
| 9NM0 AZ5104 (metabolite of AZD9291) in complex with WT EGFR 提交 2025-03-03 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：kinase domain (UNP residues 696-1022)
|
未记录 | VO7 N-(2-{[2-(dimethylamino)ethyl](methyl)amino}-5-{[4-(1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}-4-methoxyphenyl)propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M MES, 1.0 M sodium citrate, 0.5 mM TCEP
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.247 |
| 9OLB Identification of ligands for E3 ligases using fragment-based methods 提交 2025-05-12 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
1198–1207（10 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-15% PEG 3350, 0.1 M Bis-TRIS pH 6.5
|
分辨率 2.62 Å R-free 0.276 |
| 9OS6 Canertinib (CI-1033) in complex with wild-type EGFR 提交 2025-05-23 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：kinase domain
|
未记录 | A1CEA Canertinib × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M MES, 1 M sodium citrate, 5 mM TCEP
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.255 |
| 9OU9 AZD3759 in complex with wild-type EGFR 提交 2025-05-28 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：kinase domain
|
未记录 | A1CEL 4-(3-chloro-2-fluoroanilino)-7-methoxyquinazolin-6-yl (2R)-2,4-dimethylpiperazine-1-carboxylate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M MES, 1 M sodium citrate, 5 mM TCEP
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.237 |
| 9P9U EGFR-KDD with compound2 提交 2025-06-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1038（343 aa）
链 A
688–1022（335 aa）
|
未记录 | 6JS 3-(furan-2-yl)-N-[5-(furan-2-yl)-2-methoxyphenyl]-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.27 Å |
| 9PMZ Icotinib in complex with wild-type EGFR 提交 2025-07-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：kinase domain
|
未记录 | A1CI6 Icotinib × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M MES, 1 M sodium citrate, 5 mM TCEP
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.234 |
| 9Q0S JCN037 in complex with wild-type EGFR 提交 2025-08-13 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
片段：kinase domain
|
未记录 | A1CNG N-(3-bromo-2-fluorophenyl)-7,8-dihydro[1,4]dioxino[2,3-g]quinazolin-4-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M MES, 1 M sodium citrate, 5 mM TCEP
|
分辨率 2.46 Å R-free 0.241 |
| 9QXN Crystal Structure of wild-type EGFR in complex with the reversible inhibitor Sevabertinib (BAY 2927088) 提交 2025-04-16 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 AAA
696–1022（327 aa）
|
未记录 | SIN SUCCINIC ACID × 2 CL CHLORIDE ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 A1JBI 3-[(3-chloranyl-2-methoxy-phenyl)amino]-2-[3-[[(2~{S})-1,4-dioxan-2-yl]methoxy]pyridin-4-yl]-1,5,6,7-tetrahydropyrrolo[3,2-c]pyridin-4-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；285 K；HEPES, sodium succinate
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.210 |
| 9S3X EGFR (T790M,L858R) in complex with NCL-26007 提交 2025-07-25 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1019（324 aa）
|
未记录 | A1JLU 2-[[4-[2-(dimethylamino)ethyl-methyl-amino]phenyl]amino]-5-ethenyl-8-phenyl-pyrido[2,3-d]pyrimidin-7-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15M Sodium Citrate, 0.1M TRIS pH8.5, 25% PEG400
|
分辨率 2.42 Å R-free 0.246 |
| 9U8C Crystal structure of EGFR exon20 insertion mutant in complex with enozertinib (ORIC-114) 提交 2025-03-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–1022（327 aa）
|
突变：D770_N771insNPG | A1L8T ~{N}-[5-[[6-[(3~{R})-3-[3,5-bis(fluoranyl)phenyl]-1,2-oxazolidin-2-yl]pyrimidin-4-yl]amino]-2-[4-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)piperidin-1-yl]-4-methoxy-phenyl]propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293.15 K；0.8M magnesium sulfate, 0.1M Tris pH8.5
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.300 |
| 9U8C Crystal structure of EGFR exon20 insertion mutant in complex with enozertinib (ORIC-114) 提交 2025-03-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
696–1022（327 aa）
|
突变：D770_N771insNPG | A1L8T ~{N}-[5-[[6-[(3~{R})-3-[3,5-bis(fluoranyl)phenyl]-1,2-oxazolidin-2-yl]pyrimidin-4-yl]amino]-2-[4-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)piperidin-1-yl]-4-methoxy-phenyl]propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293.15 K；0.8M magnesium sulfate, 0.1M Tris pH8.5
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.300 |
| 9U8C Crystal structure of EGFR exon20 insertion mutant in complex with enozertinib (ORIC-114) 提交 2025-03-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
696–1022（327 aa）
|
突变：D770_N771insNPG | A1L8T ~{N}-[5-[[6-[(3~{R})-3-[3,5-bis(fluoranyl)phenyl]-1,2-oxazolidin-2-yl]pyrimidin-4-yl]amino]-2-[4-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)piperidin-1-yl]-4-methoxy-phenyl]propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293.15 K；0.8M magnesium sulfate, 0.1M Tris pH8.5
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.300 |
| 9U8C Crystal structure of EGFR exon20 insertion mutant in complex with enozertinib (ORIC-114) 提交 2025-03-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
696–1022（327 aa）
|
突变：D770_N771insNPG | A1L8T ~{N}-[5-[[6-[(3~{R})-3-[3,5-bis(fluoranyl)phenyl]-1,2-oxazolidin-2-yl]pyrimidin-4-yl]amino]-2-[4-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)piperidin-1-yl]-4-methoxy-phenyl]propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293.15 K；0.8M magnesium sulfate, 0.1M Tris pH8.5
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.300 |
| 9U8C Crystal structure of EGFR exon20 insertion mutant in complex with enozertinib (ORIC-114) 提交 2025-03-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 E
696–1022（327 aa）
|
突变：D770_N771insNPG | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293.15 K；0.8M magnesium sulfate, 0.1M Tris pH8.5
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.300 |
| 9U91 Complex of compound 31r and EGFR Del19/T790M/C797S/V948R 提交 2025-03-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
675–1022（348 aa）
|
突变：T790M/C797S/V948R | A1EOG N-[6-[[2-[[5-ethyl-2-methoxy-4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidin-1-yl]phenyl]amino]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino]quinoxalin-5-yl]-N-methyl-methanesulfonamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M calcium chloride
0.1M MES 6.5
33% PEG400
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.274 |
| 9VV1 Crystal structure of EGFR kinase (C797S) in complex with LN-B72 提交 2025-07-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
694–1022（329 aa）
|
突变：C797S | A1ETY (4-fluorophenyl)-[4-[[4-(hydroxymethyl)cyclohexyl]amino]-2-[[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino]-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl]methanone × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；1M Succinic acid Ph7.0, 1% PEG2000 MME, 0.1M hepes pH 7.0
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.281 |
| 9XU9 Crystal structure of EGFR T790M/C797S/L858R mutant in complex with (2-((5-chloro-2-((2-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)-5-nitrophenyl)amino)pyrimidin-4-yl)amino)phenyl)dimethylphosphine oxide 提交 2025-11-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
694–1022（329 aa）
|
突变：T790M,C797S,L858R | A1E1C 5-chloranyl-~{N}4-(2-dimethylphosphorylphenyl)-~{N}2-[2-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)-5-nitro-phenyl]pyrimidine-2,4-diamine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；1M sodium citrate, 0.1M CHES ph 9.0
|
分辨率 2.84 Å R-free 0.294 |
| 9Z2H Crystal structure of A10 Fab in complex with the EGFR peptide 提交 2025-11-05 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
310–327（18 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.8M NaH2PO4, 1.2M KH2PO4, 0.1M Na Acetate, pH 4.5
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.223 |
| 9Z2H Crystal structure of A10 Fab in complex with the EGFR peptide 提交 2025-11-05 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 E
310–327（18 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.8M NaH2PO4, 1.2M KH2PO4, 0.1M Na Acetate, pH 4.5
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.223 |
| 9Z9E Structure of FabS1CE2_ER-3c in complex with the extracellular region of EGFR 提交 2025-11-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
25–645（621 aa）
|
突变：residues 25-645 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.40 Å R-free 0.243 |
| 9Z9F Structure of FabS1CE2_ER-2a in complex with the extracellular region of EGFR 提交 2025-11-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 K
25–645（621 aa）
|
突变：residue 25-645 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.06 Å R-free 0.249 |
| 9Z9F Structure of FabS1CE2_ER-2a in complex with the extracellular region of EGFR 提交 2025-11-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 G
25–645（621 aa）
|
突变：residue 25-645 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.06 Å R-free 0.249 |
共 383 个其他 PDB 条目、562 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
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| UniProt名称 | EGFR_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–328； UniProt 695–1022 作者链 B； PDB构建体 1–328； UniProt 695–1022 作者链 C； PDB构建体 1–328； UniProt 695–1022 作者链 D； PDB构建体 1–328； UniProt 695–1022 |
